Overview
Sequences
The following sequences are available for this feature:
Legend: polypeptideexonCDSthree_prime_UTR Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.ATGGATGTAGGTCAGTGATGCTCAAAAAATTCTCAAAGGATTGGGTGGCTCTGGCATGAAAAAATTATCATAGGTGCAAGTTTGATCAAGAGTTCAGCTTTAATTTGATTTCATTATGCAGATGATTATGAATTATGGCTACCATGTAGTACAATGGTGCTTCTTCTTCAATTAGTCTAGCTGCCACATATTGTCTTTTGGTATCCTTGATGTATTTTGAGTTTTACTACTATTCTTGTTGGATTACTTTGGCCCCCTTTCCTTTCTACTAACTATTTCCAAAGTCTCTGTTTGTAAATGTTTGACAATATTTGTATAGCCTAGGTAGGACTTGAACCTACATCTTTGTGTGTTTATTGTCACACAATGCTCTACCATATTGAGCTAATAGGCTATAAAAAAGTAGGTGATTTTTGACTTACTGTAATATGTTGAGCCAAAAATATCAAAGAGACACCATAATCCATAAAAAAATCCACTAGCTTTACATAGTTTACAGTAAAGAAATGCATAGCAAGCTGAGCTTTTACTTACTCTCAGTGTCCCAATCATGAAGCATATAAAGCAAACCCATTTAAAGAGTTGAACATTAGTGCAATAGCAATCAAACGACTCACGAAATAATGAAAATCCAAGCTTAAATACACTACCAGCAAAACCACGATTCAAGTTAATCAATTTAATCTCTCTTAATTCATCAATACCAAACGAAAATTAACTAAAATAAAAATTGGGCAACACAAATCAACCCACTAATCACAAGAAATGCCCAAATAATCCATTAGTTGATCACACACCAAACCAACAACAACCATCAGACTCAATCAATTGATAACTGAAGTACATGAATTCACTTTCAATTACACGAAAATAAAATATAAATAAACAAAAATCAAAATCCCATAAATTATACGAAGTACCTGTTATAGAATCAAATAATTTTCGAATCTGACGGTAGATCTCGGGAATACGGGAATCGGCATAAATGGATGGGGATTAGTGACGGCCGGCGATTACTGGTGGTCGGGAATCGACATTTTACATTTCTTCATCAAGAGCGTCAATTTATTTTTTTTCCTGAGAGGAGAGAGAATACAAGGTGGAAGTTTGGTGGGAAGTACGGAAAATTTTATATTTTTTTATATTTTGCCTTTTTTTAAATATTGAAGGTCATTAAGCCGTTGATTTGCTTCAAGGGTTGAGATTTACTCAACTCTACATGGTAGAGTTTCTCCTAAATCCAGAGGATTTGGACGCAAAAATGTCATTCTTATTTATACGTAGGATTTTGTTTTTAAACTTTTTTTTTGGTTTTAGGGAAAAAATCGACTCCTATACCCCAAGTAACTCAATTTTCTCTTGGAGACAGCCTCCACCTGCGTTATATTGCTCATCCCCTCTCTATTCCGACGCTTCCGGCGGCCGAAGACGGTGGCAGCATTTATTCATTGTTCATCCCGCGCATAGCCGTCTGACTACTTCACTCGCACCTCTACACACGAAAGGAGCTCCTATATCGCATAGCCGAAGTTCAAAAACGTCGCAAAAGCTGCGTTACAGGCACGCAAATACCCAGGAGTGCGCGCGTCTTGCTGCTTCACGCTAACCGGCCTTGACCATCAATGGCGGAACCTAAAATCAAATACGATCGTCAACTTCGGTACTATTTCTTCTGAATTTCGTTGAATTAACTGATAACTTAGTCTTAATTAACTCATGCTTAATTGATTTGGGCTTAGTGGTTCGAGATTAACGCTGCGTGTTGTTAGTGTTGAATTATTTTATTTTCGTAGAATTTTGTGTTTGGTTTTATGACAATCACAGGTTTAGTTTTTGGTGTTATAAATTGTTGAATTTCTTACATTTTTTGGGTTTACTTTTTGAAGCTTCGATAGGTGTGTTGGAAGGCTGAAAATTTCGATGCTTGATTGTGTTTGTTTTGTTGAATAATCTGTAATTAAGCTCAATTACCCTTAAATTCTCTGGATTATTTAAAATTTTTGTAATTTTATTTGCTAGCATAAGAGACTTCTAGTAGAAACGTTAAGAGGTTGGTTAATTCACGTTTAAGGTAAACTGTTTCACCTCTATTTTTTTTTAAATTTTTTTTTGACTCGTGCTATAGGTGATTTTCACATTTGAAATATAGCTTTAGATTAACTTTTCTTACTTAATTAAGTTCGACAACATGAGTAATCGTTTTGCTAGTGCATGTTTACATTAAATATGCTGAAAATTAAACACGGTATGTGGTACTCTGAGATTTTGCCAAGAATTAATAGGAATCGCTGGCTGCAGGATTTGGGGTGAGCAAGGACAAGCAGCATTGGAAAAAGCAAGTGTTTGCTTGCTGAATTGTGGACCTACTGGGTCTGAGACTTTGAAGAATTTGGTTCTTGGTGGGATTGGCAGTATCACTGTTGTTGATGGGTCAAAGGTTGAAGTGGGTGATCTTGGAAATAACTTCATGGGTATTATTCTTCTTTCCTTTTGAACTGTTTATTCTGCTTCTCTCCCTGCCGTATGCCACCTGCTTTTGGGTAGCTGCTGTTTTAATTAACTGCGTCCTTGAATGCAACTATGTGATAAATCTGATAGCGTTTCCATGCTTTCATCGTTGAAGGTTAATACAATAGTTGGATTTGTTGAGTCAAACAATACCTAATTTATTCGATGTTACTCTACTATGCAAGCTTTCTCCTAAAGGCTGAGTTTCTTTATATCTTTTGAACCTCCATTTCTTTTATGTTATTAACACATACCCCAAACTATGAATTTATCTTAGATTTTGTATAACCTTTGATCTATAGCTTTCCCCTTGTCATGCTTGATGTTTCCTTTGCCCAGGTTTTAATTGAACAATTCTCCAAATACTAGTACTTGGGCAAGCTAGCTTTCAGAAGGCACCATATCAATTGTTTAGGGCTCCTTCTAGTTGTTCTTTGTTGTAATGCACTATACCTCTACATTTTGTTACTATTTATTTCTCGGGTTCTGGGTTGTATGACTAATTTGTTTATATGAATGTAAAATCTGTTGCGTCAACTTTTCCTTGGCTTGTGGTGGTTAATCAGTTCATGGGCCTCATGGCTATTGCTTCTCTTTATATAAGTGACTGCTGGCTTACCCATCTTCCAAGTATCTGTTCCTCCTTTTCTCTTTTACCTTATTTACTGTGCCTTACTAAATGTGGGTGGGGGTTGTCTAGTGGATGAAACAAGTCTTGGTGAGTCAAAGGCGAAATGTGTCTGCGCATTCTTGCAAGAGCTTAATGATGCTGTGAAGGCAACTTTTATTGAAGAATTCCCAGAGAAACTAATTGAGTCAAATCCATCATTCTTTTCACAATTTACCTTAGTGATAGCTACTCAGGTACGCATTCTCATCAAGCTCTGATTGTGCTTTCTTCTCTTCAATTCATCAACTTTTGAAAAATGCTTTAAGGTGTCTCTTGAGATGTCAACTAATGTATTTGGCAATGCTTTTATAACATTCTTGTTATGGATTTCCATTTTATGTTTTCTGCATATTTTTTCGTAAGCGCATGTTTTGTGGCTGTCTTTATATAAAAGGTGTATTAAAGGTTTTATTTGGTGATATGATATCTACACTCGATTTGTTCAGCCAAATCACCAAAAGAGCAAAACCTAGTGAAAAAGGCATCCATGGAAGGGGAAAACAAAATATAAGAAACAAGGGGCAAAAAGAACAAGTACGCCTAAGTGCATAGAAAATGAATAGGAGGAGAAAGAGGGTAAAAAACATTTAACATTCAATATATCTATAAATTGAATAATTGATTAAATGAATGAAGGTAAGCATGATAGGATGGGATAATCTCATCCATATCATGTGATAGACTTATTGATACTGTATTGTGTTCGAGACCATACCATTTCTTGAATACCATGAACGACTTTGTATCTTTTGTTCTAATGCCGTTTTTCTTCATTTCTCTATCGTGATACCAAGGAAAAATCATGAAAATGCCCCTTTGTCAAGGTGGCACTTTTTATACTTTGATCATTGGAGAAGAAGACTGTGGCTTTGTCGAAGGGTTATTACTTGTTTAATTGTGTATGCAACAAACTAACAATAGAATAATAATGAAAATTATTATTATGGGTATATTGATCTTAGGCTAATGATAAAAGTCCTGAATGTTTTTACCCAAAATCGCATATTCAACTTGGTCTTGGGGCCTATTTATGCATAATGTGATTTTCAAATGAATGGACTTATTCATGCATAATGTGATTTGTGACGACCGATGCATTTATTTTGGGACGGCCGAATAAGGCTAAAGGATGATCTTATGTAGGAACATAATGTGCTATAACCGGTGAATGAAAAAGCGCGCCTAAGGCGATGTAGCGCTAGGCGATAAAGGGGTGCGCTTTTTTAGTTCTAGGCAAAGTGCATTCAAAGAAGCGCACTGACATTTTCTCCCTTTTCCCTTTTCCCATTCCTTGTATTGGGTTTGGCTGAAATTTTCCATTCTTTTTCATAGACTCTTTCGGATTTGAATTTCCCTTCTTTGGATTTTGAACGTCTCCACAGCAGCATCACCACCACCTCTACAGTGAGGCTATTATGTTTCTGTTCTAAGCTTTGTTGGCTCATATAGACTTCGTATCTGTCAGATATATCCCAGCTGGTACACGTCATATCAGCAGACAGTTAAAACCACGACCGGGAACCTTGTTCCTCCCCACCAAAGTGAACTCTATTTTTTCCATGCTCCTATGCCCCGTAACTTCCCAAATCCCCTTCTCCGCACTTCACTCGTCCAAAATCATTTGTGTAGTTTGAGTGTTGTGTGCAAATTACAATGCAACTATATATGAGAAACACGAATCATAAGTAGTTTGGATTACCAAGGAGTCGGGAATATTCATTCATTCAATCCAAGCCTGGGCTTTATCCATATGCTAAGAAGTAAATAACCAATTGTTGGCCTTGTGGCCCAAAGTGGGGGTGTCAATGTGGTGTAT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MDVGIAGCRIWGEQGQAALEKASVCLLNCGPTGSETLKNLVLGGIGSITVVDGSKVEVGDLGNNFMVDETSLGESKAKCVCAFLQELNDAVKATFIEEFPEKLIESNPSFFSQFTLVIATQLVEDKMLKLDRICREANVMIVFARSYGLTGLVRVSVKEHTVIESKPDHFLDDHRLNNPWPELKRFVESIDVNVPDPVAHKHIPYVVILVKMAEEWAQSHGGTLPSTREEKNELKDLLTSRMIGLDEDNYKEAVDAYYKLFSSRGISSDLMQILNDNCAEIDSNSSDFWVMVAALKEFVALEGGGEVPLEGSIPDMTSSTEQYVNLQKVYQAKAEADFLAMEKHVQNSLKKIGRDPNSISKMTIKVFCKNTRKLKVCRYRMIQEEFNSPSLSVLQNYLTDEKYSMAAGFYILLRAVDRFAANYNSFPGQFDGEIDEDISRLKTLAVSLLTDLGCNGSILSEDLIKEICRFGAAELHAVSALIGGIASQEVIKLITKQFTPMIGTFIFNGIDQKSKLMLL Relationships
The following mRNA feature(s) are a part of this gene:
Homology
BLAST of Spo00049.1 vs. NCBI nr
Match: gi|731351819|ref|XP_010687227.1| (PREDICTED: NEDD8-activating enzyme E1 regulatory subunit-like [Beta vulgaris subsp. vulgaris]) HSP 1 Score: 887.1 bits (2291), Expect = 1.500e-254 Identity = 445/511 (87.08%), Postives = 473/511 (92.56%), Query Frame = 1
BLAST of Spo00049.1 vs. NCBI nr
Match: gi|1009170681|ref|XP_015866327.1| (PREDICTED: NEDD8-activating enzyme E1 regulatory subunit-like [Ziziphus jujuba]) HSP 1 Score: 856.3 bits (2211), Expect = 2.800e-245 Identity = 416/511 (81.41%), Postives = 466/511 (91.19%), Query Frame = 1
BLAST of Spo00049.1 vs. NCBI nr
Match: gi|802615292|ref|XP_012075110.1| (PREDICTED: NEDD8-activating enzyme E1 regulatory subunit-like [Jatropha curcas]) HSP 1 Score: 850.1 bits (2195), Expect = 2.000e-243 Identity = 410/511 (80.23%), Postives = 465/511 (91.00%), Query Frame = 1
BLAST of Spo00049.1 vs. NCBI nr
Match: gi|590698175|ref|XP_007045644.1| (NAD(P)-binding Rossmann-fold superfamily protein isoform 1 [Theobroma cacao]) HSP 1 Score: 850.1 bits (2195), Expect = 2.000e-243 Identity = 411/511 (80.43%), Postives = 465/511 (91.00%), Query Frame = 1
BLAST of Spo00049.1 vs. NCBI nr
Match: gi|702241339|ref|XP_010046470.1| (PREDICTED: NEDD8-activating enzyme E1 regulatory subunit isoform X1 [Eucalyptus grandis]) HSP 1 Score: 835.9 bits (2158), Expect = 3.900e-239 Identity = 408/511 (79.84%), Postives = 457/511 (89.43%), Query Frame = 1
BLAST of Spo00049.1 vs. UniProtKB/TrEMBL
Match: A0A0J8BR83_BETVU (NEDD8-activating enzyme E1 regulatory subunit OS=Beta vulgaris subsp. vulgaris GN=BVRB_8g188530 PE=3 SV=1) HSP 1 Score: 887.1 bits (2291), Expect = 1.000e-254 Identity = 445/511 (87.08%), Postives = 473/511 (92.56%), Query Frame = 1
BLAST of Spo00049.1 vs. UniProtKB/TrEMBL
Match: A0A067KGX0_JATCU (NEDD8-activating enzyme E1 regulatory subunit OS=Jatropha curcas GN=JCGZ_10346 PE=3 SV=1) HSP 1 Score: 850.1 bits (2195), Expect = 1.400e-243 Identity = 410/511 (80.23%), Postives = 465/511 (91.00%), Query Frame = 1
BLAST of Spo00049.1 vs. UniProtKB/TrEMBL
Match: A0A061E937_THECC (NEDD8-activating enzyme E1 regulatory subunit OS=Theobroma cacao GN=TCM_011349 PE=3 SV=1) HSP 1 Score: 850.1 bits (2195), Expect = 1.400e-243 Identity = 411/511 (80.43%), Postives = 465/511 (91.00%), Query Frame = 1
BLAST of Spo00049.1 vs. UniProtKB/TrEMBL
Match: V4TK29_9ROSI (NEDD8-activating enzyme E1 regulatory subunit OS=Citrus clementina GN=CICLE_v10014908mg PE=3 SV=1) HSP 1 Score: 835.1 bits (2156), Expect = 4.600e-239 Identity = 401/511 (78.47%), Postives = 462/511 (90.41%), Query Frame = 1
BLAST of Spo00049.1 vs. UniProtKB/TrEMBL
Match: B9SDW7_RICCO (NEDD8-activating enzyme E1 regulatory subunit OS=Ricinus communis GN=RCOM_0487930 PE=3 SV=1) HSP 1 Score: 834.3 bits (2154), Expect = 7.900e-239 Identity = 405/511 (79.26%), Postives = 461/511 (90.22%), Query Frame = 1
BLAST of Spo00049.1 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: AXR1_ARATH (NEDD8-activating enzyme E1 regulatory subunit AXR1 OS=Arabidopsis thaliana GN=AXR1 PE=1 SV=1) HSP 1 Score: 800.0 bits (2065), Expect = 1.500e-230 Identity = 388/512 (75.78%), Postives = 448/512 (87.50%), Query Frame = 1
BLAST of Spo00049.1 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: AXL1_ARATH (NEDD8-activating enzyme E1 regulatory subunit AXL OS=Arabidopsis thaliana GN=AXL1 PE=1 SV=1) HSP 1 Score: 765.0 bits (1974), Expect = 5.300e-220 Identity = 371/511 (72.60%), Postives = 435/511 (85.13%), Query Frame = 1
BLAST of Spo00049.1 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: ULA1_DICDI (NEDD8-activating enzyme E1 regulatory subunit OS=Dictyostelium discoideum GN=nae1 PE=3 SV=1) HSP 1 Score: 435.3 bits (1118), Expect = 9.600e-121 Identity = 221/503 (43.94%), Postives = 313/503 (62.23%), Query Frame = 1
BLAST of Spo00049.1 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: ULA1_MOUSE (NEDD8-activating enzyme E1 regulatory subunit OS=Mus musculus GN=Nae1 PE=1 SV=1) HSP 1 Score: 414.8 bits (1065), Expect = 1.300e-114 Identity = 204/513 (39.77%), Postives = 325/513 (63.35%), Query Frame = 1
BLAST of Spo00049.1 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: ULA1_XENLA (NEDD8-activating enzyme E1 regulatory subunit OS=Xenopus laevis GN=nae1 PE=2 SV=1) HSP 1 Score: 412.9 bits (1060), Expect = 5.100e-114 Identity = 205/513 (39.96%), Postives = 326/513 (63.55%), Query Frame = 1
BLAST of Spo00049.1 vs. TAIR (Arabidopsis)
Match: AT1G05180.1 (NAD(P)-binding Rossmann-fold superfamily protein) HSP 1 Score: 800.0 bits (2065), Expect = 8.400e-232 Identity = 388/512 (75.78%), Postives = 448/512 (87.50%), Query Frame = 1
BLAST of Spo00049.1 vs. TAIR (Arabidopsis)
Match: AT2G32410.1 (AXR1-like) HSP 1 Score: 765.0 bits (1974), Expect = 3.000e-221 Identity = 371/511 (72.60%), Postives = 435/511 (85.13%), Query Frame = 1
BLAST of Spo00049.1 vs. TAIR (Arabidopsis)
Match: AT3G25880.1 (NAD(P)-binding Rossmann-fold superfamily protein) HSP 1 Score: 76.3 bits (186), Expect = 6.400e-14 Identity = 34/50 (68.00%), Postives = 41/50 (82.00%), Query Frame = 1
BLAST of Spo00049.1 vs. TAIR (Arabidopsis)
Match: AT2G21470.2 (SUMO-activating enzyme 2) HSP 1 Score: 63.2 bits (152), Expect = 5.600e-10 Identity = 46/153 (30.07%), Postives = 73/153 (47.71%), Query Frame = 1
BLAST of Spo00049.1 vs. TAIR (Arabidopsis)
Match: AT2G30110.1 (ubiquitin-activating enzyme 1) HSP 1 Score: 62.0 bits (149), Expect = 1.200e-9 Identity = 40/146 (27.40%), Postives = 73/146 (50.00%), Query Frame = 1
The following BLAST results are available for this feature:
BLAST of Spo00049.1 vs. NCBI nr
Analysis Date: 2018-06-29 (blastp Spinacia oleracea peptides vs. NCBI nr) Total hits: 5
BLAST of Spo00049.1 vs. UniProtKB/TrEMBL
Analysis Date: 2018-06-29 (blastp Spinacia oleracea peptides vs. UniprotKB/TrEMBL) Total hits: 5
BLAST of Spo00049.1 vs. ExPASy Swiss-Prot
Analysis Date: 2018-06-29 (blastp Spinacia oleracea peptides vs. ExPASy SwissProt) Total hits: 5
BLAST of Spo00049.1 vs. TAIR (Arabidopsis)
Analysis Date: 2018-06-29 (blastp Spinacia oleracea peptides vs. TAIR) Total hits: 5
InterPro
Analysis Name: InterPro Annotations of S. oleracea
Date Performed: 2018-06-29
GO Annotation
GO Assignments
This gene is annotated with the following GO terms.
RNA-Seq Expression
Co-expression
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