Overview
Sequences
The following sequences are available for this feature:
Legend: exonfive_prime_UTRpolypeptideCDSthree_prime_UTR Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.AGAAAAAAATCCAAACAATAATTTCATACCCATGCTTCATGATTGAAAGTCATGAAAAGTTTCCACCTCACATTTGCACATAGGAATTGATAGGATAAAGAACACACACATGACACATCACTTAAATAATTTCCATGTCCAAATAATTGCAAAATACTTTAATAATTCTACAAACTTTGAATCAAAAGAATATACGAATACTCAAAAAGTAAGAATCACCAACAACAAACATTCTATTGGATTAACCAAAAAAATGGGAGGTTCATCGAAAACGGTGAGGAAGTTAGAGGTGGCGACACCGGTACCGGCGGACATTGACATAGCAAATGCGGTGGAGCCGCTTCATATCGCTGATATTGCCGCCGATCTCAATCTCTCTCCTCGTCACTACGACCTTTATGGCAAATACAAGGCCAAGGTTTTTTCTTTTCTCTCACTCTCCTTTGACTTTTTAATTGACTCGCTTATCCACTTCACTTTACTGTCACTTTGAGTATCGAAAATGATTGAATTATTGATCCTTATTTGATTGATTGATTATGCTGAGGAATTTGATTAATTGATTGCAAATTTTTAAGGGTTCATTTCGCTTTTCCCCCAAGAGTTTTGGTATTAAATTACTATAAATTAGTATTTATTTGTATTTTGTGCTTTGATTCTTGATTAATGTGTGTCTAATTTAGTACTAATTCAATTTTTTGTCATGTTGAGATTCGGACTTTAGGGTAGTGTGACTTGCTACTTTTTTTTCAATTCAATGGTTAAAGTGGTATTTTCCTTGATTCCCTTAACTGCATACATGTTGCACTTTTGGGTGGCAATTTGCAATTTTGCTCAATCAACTCAACTATCTTTGTTTATGCATTATTCTTTTCCAGGTTTAGTAATCTTTCCCATTAAAGATACTATAGGCTTTTAGTTTTGGTTCCTGATTCGCTTCCAGTTATAGCAATGTTTTTATTTGATGTGGGTGTTGTTGTTAGTTTGTTACTTTTGGATGGCAATTTGCAATTTTTCTCAATGAACCTCATCTTAATTTATGCATGTTCCTTTCCAAGTTTAATAACCTTTCTCATTTGAGATACTATAGGCTTTCAGTCTCGGTTCCTGATTCGCTTCCACTTATATCAATGTTTTTATTTGATGTGGCTGTTGTTTGTTACTTATCGATGGCAATTTGCAATTTTAATCAATCACCCCATCTTAATTTATGCATTGTTCTTTTCCAAGTTTTGTAATCTTTCTCATTAAAGATACTTTAGACTTTTAGTTTTGGTTGTTGATTCACGTCCACTTATAGCAAGGGTTTTATTTGATGTGGGTGTTGTTGCTTTTTTGGACACCTTAATTAGTTGATTGTATGCGATATAGGTTTTGCTGTCTGTGTTGGATGAAGTTCAAGAAACCCAGGATGGATATTACGTCGTGGTTGGTGGAATTACTCCTACTCCTCTCGGGGAAGGCAAATCTACCACCACTGTTGGTCTTTGTCAAGCCTTGGGAGCTTTCCTTGATAAGAAGGTAACTAAGTTTGTTTTAAGTTAAAAGTGATGTTTTATATACTCAAGTTGTATGTAACATTATTTCTTGTTTTATTTCGGTAAGAAATGATATTTAGCTAGTTTATTACTCCCTCTATAGGCGGAAACAAGGGGGCTGGGTGTGGGTGGCCGCCCCCCAACTATTTAAAAACAAACTTATATATAGTATTAAATACCAAAATATATCACTAAGTACTCCTTTATACTACAATATATCAATGCCCTTTTTTTTTTCTCGCCCCCAAACATTAAATTCCTAGCTCCGCCATTGATTCCTCCCATTCCTATATACACGTGTTTTTTGAGGTTATGCTCACAAAATTTAAGGAGTATTTATTTGTGGCATTGGTATACAAAACCGTCAAGTTATTTTGCATGATTAGTTAAAATTGTCAAGTAAAAGTGTATTGCTACTTTTTGAAATATGGAATAGAGAAGGTTAATTAAGTAGTCAAATATTATGGTATGGAGGGGGTATTACTTTGGTGTTTTGTAGTCTTATGCATTGTGTGTGTTGTAATGTTCTTGTAACTCCTCTGATGTACTCCATAACTAAAATATTTGAATATACCGGTTAGGTCAAGTCCTTATTTCACGAGCATACGCCATGGCTTAGTTGTCTGGTGCTTGCAAGTTTGGCTATTATATGGTCGGTAGAAAATAATGGGTACATTAAGGGGATTGGCAAGTATGTAAAGTTTGAACATGAGATGAAAAGGATACGAAAGTTTATTCGTCTCTACATTTCAATATTTCTGTAATTAGATGCTGTTAGTCATCAGAAACTTCACAAAACTATTAGTATTATGAGATTGAACTTTCCTCTAGACACTTGCTGTGTGGATTTAATGGAATACTGATTCACGAGGGTGGTAAAATATTCATTTTAGTAAAATGACGCAAAGTAAAATAAGTTGTTTATTGAGCCAACAAATATTCCTGTTTTATTGGATTAGTAAGTGGACTTTACCTCTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTCCGATAGCAATGCAAATAACAAACTAAACAACCAGCCCTCGTCGAACTTTAGAGGCAAGATCATGGGCAGGTTTAACAGTTAACCTACTAGCTTTAATACAAACAACATAGTCAAATGTGATTGCGTATTGCGGTATTCCGAATTTCCTTGACAATGTGCGAGATTCTGAAATCAGCCTTGGATTCCCAATTGCTAGAATTGCTTCATGACAATCTGATTTGATGATGATATTGGGAGACACCCCCATCGCTTCCTTTAGACCATGGAGAATGGCCAAGCCTTTCACCCGAAGAGGAGTCTCTGCAAATTCTTCTACCCCGTTCTATGCAATCATTCTCTGCCCGCTCTCCTTTCCAAGCCATGACAACACTCTATTCCTTTGAGATTCTCTTTTCGAATTGCTTCCAAGCTGCATCTACCACAATCGAAACAAAATCCAAAGAGTTCGGCCTTCAAAAACACAACCCATATAACCTTTTATTTTCACAGCGACACATGGTCGTGTGTGATCCTCTACTTGGTGGTCTGCCATACACCCGAAGCAACGTTCCTGCCATTTGTTGTCAACAACATGATTCAACTGGCGAACAACTTTTTTTTCCTAAATACCACTTTGTTCCTATATAAACAAGGAGCCCACAAAGTCGAGATAAGCTCAAGTGCTCTCACATCTTCCTTTTCTTATCTTGATTAAACAAGAGAAATAGGAAATTTATAACCCATGTACCAATAATGACTTAATGAGCATTAACATAGAAGTAATCACAATAGCAAGCCCTCACGGCCTCTAAGTATGTGAACTAATTGAGCCGTCCCTAACGATGTGCTCGGCCGATTCTTGCACATTATTACACAACAAACACACATTCTCCATGCACCTTCTTAAATTGCATCTAGTGGAAGAGCGTATTTAATGATTTTCCAACAGAATAATTTCCACTTCAGGAAATATTTCTTCTTATAAAATTGCTTCCGAAAATTCGGGATAACAATCGGAACCCAATGTGGCTAATTAAGATGCCAATAAGCAAACTGTCCAACGTATTCAACGGTTATATAAGGAATTTTGGGACCATAAAACCCAATAGTTGGACAATTAAAGGCTCGGAATTACCTTGATTCATCAAAATGAGTTTTGAATGAAATCAACTAATATGTCATTTAAGAGCCAAAGTAGATGGTTCTAACCACCTAATATGTCTCTCGGAGCCCCGTGAGGTATATGGGAAACATCTGGACCTCTAACCTTTCGGGGTCCGAAAAAGTGCAAATTGTCTAAAAGTAATGGATAATCCATCGTTTTTGACCAAATTTGGAGTTTCCAGGACCCGGTTTCCGAAACTCGCAAGATTTTGGGGAATGTATCAAGCGGTTATATGAGGAATTTTGGGACCATAATACAAAATAGTTGGATATTTAAAAGATTGAAATTACCTCGATTCATCAAAATGGGTTTTGTGAGAAATCAACCAAATATCATTTAAGAGCCAAAGTAGATGGTTCTAACCACCTAATATGTCTCTCGGGACCTCGTGGGGTATATGAGAAGCATCTAGATTCTAGACTGAGATGAACTCAGTACCTACCTACACACACTACAGCAAACACAACAACACACACAAATAGAGGAAGGATGATTGTTGATTGATATAAAGCAAAAAAATAGAGAACGTTCAAGAGGTTCTCTTCTCTCAAAGA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AGAAAAAAATCCAAACAATAATTTCATACCCATGCTTCATGATTGAAAGTCATGAAAAGTTTCCACCTCACATTTGCACATAGGAATTGATAGGATAAAGAACACACACATGACACATCACTTAAATAATTTCCATGTCCAAATAATTGCAAAATACTTTAATAATTCTACAAACTTTGAATCAAAAGAATATACGAATACTCAAAAAGTAAGAATCACCAACAACAAACATTCTATTGGATTAACCAAAAAAATGGGAGGTTCATCGAAAACGGTGAGGAAGTTAGAGGTGGCGACACCGGTACCGGCGGACATTGACATAGCAAATGCGGTGGAGCCGCTTCATATCGCTGATATTGCCGCCGATCTCAATCTCTCTCCTCGTCACTACGACCTTTATGGCAAATACAAGGCCAAGGTTTTGCTGTCTGTGTTGGATGAAGTTCAAGAAACCCAGGATGGATATTACGTCGTGGTTGGTGGAATTACTCCTACTCCTCTCGGGGAAGGCAAATCTACCACCACTGTTGGTCTTTGTCAAGCCTTGGGAGCTTTCCTTGATAAGAAGGTTGTCACTTGCCTTCGTCAACCATCACAAGGGCCAACTTTTGGAATAAAAGGTGGTGCAGCTGGTGGTGGTTATAGTCAAGTGATTCCAATGGATGAGTTCAACCTTCACTTAACTGGGGATATACATGCTATAACAGCTTCAAACAATCTTCTCGCTGCTGCCATAGACACCAGAATGTTCCATGAGTCCACCCAGTCAGATAAAGCTCTCTTTAACCGTTTGTGCCCCCCTAACAAAGAAGGTAAAAGAACCTTTTGTAACATTATGCACAGGCGTTTGAAAAAGCTTGGTATTGATAAGACTAATCCAGACGACCTTACACCGGAAGAGGTCACAAAATTTGCTAGGCTTGATATTGACCCCGATTCCATTACATGGAGAAGAGTTATGGATGTGAATGACCGGTTTTTGAGGAAAATTAGTGTTGGTCAGGGGCCTGATGAGAAGGGGATGGTAAGAGAAACTGGATTTGATATTTCCGTTGCTAGTGAGATAATGGCAGTTCTGGCTCTAACAACTTCTCTGGCTGATATGAGGGAGAGACTTGGGAAAATGGTGATTGGAAATAGCAAGGCTGGAGAACCGATTACTGCTGATGATCTTGGCTTAGGTGGTGCTTTGACTGTATTAATGAAGGATGCAATCAACCCCACGCTGATGCAGACTCTGGAAGGAACACCTGTGCTTGTTCATGCTGGTCCTTTTGCAAATATTGCTCATGGTAATTCCTCTATTGTTGCTGACAAGATTGCCCTGAAGCTGGTTGGACCTGGTGGGTTTGTGGTTACTGAAGCAGGGTTTGGTTCTGATATCGGAACTGAGAAGTTCATGAACATAAAGTGCCGATATAGTGGTTTGACTCCACAGTGTGCTATTGTTGTTGCGACAGTGAGGGCTTTGAAAATGCATGGTGGTGGACCACAAGTAGTGGCTGGCAAGCCTCTTGATCGTGCATACTTAACAGAGAATGTGGGTCTTGTTGAGGCTGGCTGTGTTAATCTTGCCAGGCATATTATAAATACGAAGGCCTATGGTTCAAATGTCGTGGTTGCCATCAACATGTTTTCTTCTGACACAGAAGCAGAGCTGAATGCTGTTAAAAAAGCAGCAATGGATGCTGGAGCGTTTGACGCAGTTATTTGTACCCATCACGCCCATGGTGGAAAAGGAGCGGTGGATCTTGGCATAGCTGTTCAGAAAGCATGTGAGAACGTAACGCAGCCTTTGAGGTTCTTATATCCTCTGGATATTAGCATCAAAGAGAAAATAGAGGCAATTGCAAAGTCTTATGGTGCTGCTGGCGTCGAATACTCAGAACAGGCTGAGAAAAAGATTGAGATGTACAGCAAGCAAGGGTTCTCCAATCTTCCAATATGCATGGCAAAAACGCAATATTCATTTTCCCACAATGCTGCTGAAAAGGGAGCTCCAAGCGGATTTATCTTGCCTATTCGGGATGTTAGAGGTAGCATCGGAGCTGGATTCATTTACCCGTTGGTAGGAACCATGAGTACAATGCCTGGGCTCCCAACAAGGCCGTGCTTCTTTGATATTGATCTCGACACTACAACAGGGAAGGATTACAACTGTTCTGTGGAGTTCTTTAGGTCCCCATTCTTGGTTCGAGAATGGGAAATTCCTGACAAAAATGGGTCGAAGAAGGAGACATTGAGGCTTGATTTAGTTGAGAGGGCATCTGATAGATACAAGGATGCAGAATTTCTGATCTTCAACACTGGACATTGGTGGAGTCATGAGAAAACTTCGAGAGGGGAGGGTTACTATCAAGAAGGTACCCATGTCTACAGTCAATTAGAGGTTAATGAGGCTTTTCGACGAGCACTTACAACTTGGGGAAGATGGCTGGAGGCTAATGTTGATCCCATGAAAACACAAGTTTTCTTCAGGGGATATTCGAATTCTCACTTTGGAGGTGGGAGATGGGATTCTGGTGGAACATGTGATAAGGAAACTGAGCCGATCAAGAACATGACAGATTTACCAGAACAACCCCCGATGATCAAAGTAGTGGAGAATGTGATTAAGTGGACTAAAGTACCGGTTTTCTATCTTAACATCACAACACTGACTGACTACCGAAAAGACGCCCACCCTGCTGCTTATAGGACAGAGGAGGAGAGGCGTTTACGGTTAAGATACCAAGACTGTGCACATTGGTGCCTTCCTGGTGTTCCTGATACATGGAACGAGCTAGTGTATTCTCAAATCTTGATTAGAAATTACCAAAAACAACAAATGAAGAAGCAACAAGAGCAGCGCCATTAAAGGATATGGCTGAAGAAATCTGCAGTTTGCAAGAGAGCTCACAAGGATGCTAAAATTCAGCAATATTGGTAAGTCTTTTCCATTAAATGTATACTATCTATGGAGTTTCTGGTAAAGATTTTATACCTAAGCAAGATAAAAGACGGGATACAGACTGTCTGAAGTCAGAAAAACTTCAACAACCCCCAGCCTTTCCTCGGCCCTCATTGTCTGCTTTTATTTATTTTTAGCCAATGTTTCTTGGGCATGATGGTTATAGAGTTATAGCTCTTTCCAGATATTGTTGTTGGGACTATATCATGTACCTAAATGAACATTATCTTGTACATGGCC ATGACACATCACTTAAATAATTTCCATGTCCAAATAATTGCAAAATACTTTAATAATTCTACAAACTTTGAATCAAAAGAATATACGAATACTCAAAAAGTAAGAATCACCAACAACAAACATTCTATTGGATTAACCAAAAAAATGGGAGGTTCATCGAAAACGGTGAGGAAGTTAGAGGTGGCGACACCGGTACCGGCGGACATTGACATAGCAAATGCGGTGGAGCCGCTTCATATCGCTGATATTGCCGCCGATCTCAATCTCTCTCCTCGTCACTACGACCTTTATGGCAAATACAAGGCCAAGGTTTTGCTGTCTGTGTTGGATGAAGTTCAAGAAACCCAGGATGGATATTACGTCGTGGTTGGTGGAATTACTCCTACTCCTCTCGGGGAAGGCAAATCTACCACCACTGTTGGTCTTTGTCAAGCCTTGGGAGCTTTCCTTGATAAGAAGGTTGTCACTTGCCTTCGTCAACCATCACAAGGGCCAACTTTTGGAATAAAAGGTGGTGCAGCTGGTGGTGGTTATAGTCAAGTGATTCCAATGGATGAGTTCAACCTTCACTTAACTGGGGATATACATGCTATAACAGCTTCAAACAATCTTCTCGCTGCTGCCATAGACACCAGAATGTTCCATGAGTCCACCCAGTCAGATAAAGCTCTCTTTAACCGTTTGTGCCCCCCTAACAAAGAAGGTAAAAGAACCTTTTGTAACATTATGCACAGGCGTTTGAAAAAGCTTGGTATTGATAAGACTAATCCAGACGACCTTACACCGGAAGAGGTCACAAAATTTGCTAGGCTTGATATTGACCCCGATTCCATTACATGGAGAAGAGTTATGGATGTGAATGACCGGTTTTTGAGGAAAATTAGTGTTGGTCAGGGGCCTGATGAGAAGGGGATGGTAAGAGAAACTGGATTTGATATTTCCGTTGCTAGTGAGATAATGGCAGTTCTGGCTCTAACAACTTCTCTGGCTGATATGAGGGAGAGACTTGGGAAAATGGTGATTGGAAATAGCAAGGCTGGAGAACCGATTACTGCTGATGATCTTGGCTTAGGTGGTGCTTTGACTGTATTAATGAAGGATGCAATCAACCCCACGCTGATGCAGACTCTGGAAGGAACACCTGTGCTTGTTCATGCTGGTCCTTTTGCAAATATTGCTCATGGTAATTCCTCTATTGTTGCTGACAAGATTGCCCTGAAGCTGGTTGGACCTGGTGGGTTTGTGGTTACTGAAGCAGGGTTTGGTTCTGATATCGGAACTGAGAAGTTCATGAACATAAAGTGCCGATATAGTGGTTTGACTCCACAGTGTGCTATTGTTGTTGCGACAGTGAGGGCTTTGAAAATGCATGGTGGTGGACCACAAGTAGTGGCTGGCAAGCCTCTTGATCGTGCATACTTAACAGAGAATGTGGGTCTTGTTGAGGCTGGCTGTGTTAATCTTGCCAGGCATATTATAAATACGAAGGCCTATGGTTCAAATGTCGTGGTTGCCATCAACATGTTTTCTTCTGACACAGAAGCAGAGCTGAATGCTGTTAAAAAAGCAGCAATGGATGCTGGAGCGTTTGACGCAGTTATTTGTACCCATCACGCCCATGGTGGAAAAGGAGCGGTGGATCTTGGCATAGCTGTTCAGAAAGCATGTGAGAACGTAACGCAGCCTTTGAGGTTCTTATATCCTCTGGATATTAGCATCAAAGAGAAAATAGAGGCAATTGCAAAGTCTTATGGTGCTGCTGGCGTCGAATACTCAGAACAGGCTGAGAAAAAGATTGAGATGTACAGCAAGCAAGGGTTCTCCAATCTTCCAATATGCATGGCAAAAACGCAATATTCATTTTCCCACAATGCTGCTGAAAAGGGAGCTCCAAGCGGATTTATCTTGCCTATTCGGGATGTTAGAGGTAGCATCGGAGCTGGATTCATTTACCCGTTGGTAGGAACCATGAGTACAATGCCTGGGCTCCCAACAAGGCCGTGCTTCTTTGATATTGATCTCGACACTACAACAGGGAAGGATTACAACTGTTCTGTGGAGTTCTTTAGGTCCCCATTCTTGGTTCGAGAATGGGAAATTCCTGACAAAAATGGGTCGAAGAAGGAGACATTGAGGCTTGATTTAGTTGAGAGGGCATCTGATAGATACAAGGATGCAGAATTTCTGATCTTCAACACTGGACATTGGTGGAGTCATGAGAAAACTTCGAGAGGGGAGGGTTACTATCAAGAAGGTACCCATGTCTACAGTCAATTAGAGGTTAATGAGGCTTTTCGACGAGCACTTACAACTTGGGGAAGATGGCTGGAGGCTAATGTTGATCCCATGAAAACACAAGTTTTCTTCAGGGGATATTCGAATTCTCACTTTGGAGGTGGGAGATGGGATTCTGGTGGAACATGTGATAAGGAAACTGAGCCGATCAAGAACATGACAGATTTACCAGAACAACCCCCGATGATCAAAGTAGTGGAGAATGTGATTAAGTGGACTAAAGTACCGGTTTTCTATCTTAACATCACAACACTGACTGACTACCGAAAAGACGCCCACCCTGCTGCTTATAGGACAGAGGAGGAGAGGCGTTTACGGTTAAGATACCAAGACTGTGCACATTGGTGCCTTCCTGGTGTTCCTGATACATGGAACGAGCTAGTGTATTCTCAAATCTTGATTAGAAATTACCAAAAACAACAAATGAAGAAGCAACAAGAGCAGCGCCATTAA MTHHLNNFHVQIIAKYFNNSTNFESKEYTNTQKVRITNNKHSIGLTKKMGGSSKTVRKLEVATPVPADIDIANAVEPLHIADIAADLNLSPRHYDLYGKYKAKVLLSVLDEVQETQDGYYVVVGGITPTPLGEGKSTTTVGLCQALGAFLDKKVVTCLRQPSQGPTFGIKGGAAGGGYSQVIPMDEFNLHLTGDIHAITASNNLLAAAIDTRMFHESTQSDKALFNRLCPPNKEGKRTFCNIMHRRLKKLGIDKTNPDDLTPEEVTKFARLDIDPDSITWRRVMDVNDRFLRKISVGQGPDEKGMVRETGFDISVASEIMAVLALTTSLADMRERLGKMVIGNSKAGEPITADDLGLGGALTVLMKDAINPTLMQTLEGTPVLVHAGPFANIAHGNSSIVADKIALKLVGPGGFVVTEAGFGSDIGTEKFMNIKCRYSGLTPQCAIVVATVRALKMHGGGPQVVAGKPLDRAYLTENVGLVEAGCVNLARHIINTKAYGSNVVVAINMFSSDTEAELNAVKKAAMDAGAFDAVICTHHAHGGKGAVDLGIAVQKACENVTQPLRFLYPLDISIKEKIEAIAKSYGAAGVEYSEQAEKKIEMYSKQGFSNLPICMAKTQYSFSHNAAEKGAPSGFILPIRDVRGSIGAGFIYPLVGTMSTMPGLPTRPCFFDIDLDTTTGKDYNCSVEFFRSPFLVREWEIPDKNGSKKETLRLDLVERASDRYKDAEFLIFNTGHWWSHEKTSRGEGYYQEGTHVYSQLEVNEAFRRALTTWGRWLEANVDPMKTQVFFRGYSNSHFGGGRWDSGGTCDKETEPIKNMTDLPEQPPMIKVVENVIKWTKVPVFYLNITTLTDYRKDAHPAAYRTEEERRLRLRYQDCAHWCLPGVPDTWNELVYSQILIRNYQKQQMKKQQEQRH Relationships
The following mRNA feature(s) are a part of this gene:
Homology
BLAST of Spo00672.1 vs. NCBI nr
Match: gi|2507455|sp|P28723.3|FTHS_SPIOL (RecName: Full=Formate--tetrahydrofolate ligase; AltName: Full=10-formyletrahydrofolate synthetase; Short=FHS; Short=FTHFS; AltName: Full=Formyltetrahydrofolate synthetase) HSP 1 Score: 1258.8 bits (3256), Expect = 0.000e+0 Identity = 632/632 (100.00%), Postives = 632/632 (100.00%), Query Frame = 1
BLAST of Spo00672.1 vs. NCBI nr
Match: gi|731325461|ref|XP_010673528.1| (PREDICTED: formate--tetrahydrofolate ligase [Beta vulgaris subsp. vulgaris]) HSP 1 Score: 1198.3 bits (3099), Expect = 0.000e+0 Identity = 598/629 (95.07%), Postives = 617/629 (98.09%), Query Frame = 1
BLAST of Spo00672.1 vs. NCBI nr
Match: gi|593587323|ref|XP_007142666.1| (hypothetical protein PHAVU_007G006400g [Phaseolus vulgaris]) HSP 1 Score: 1158.3 bits (2995), Expect = 0.000e+0 Identity = 568/629 (90.30%), Postives = 607/629 (96.50%), Query Frame = 1
BLAST of Spo00672.1 vs. NCBI nr
Match: gi|951027843|ref|XP_014514272.1| (PREDICTED: formate--tetrahydrofolate ligase [Vigna radiata var. radiata]) HSP 1 Score: 1153.7 bits (2983), Expect = 0.000e+0 Identity = 568/629 (90.30%), Postives = 606/629 (96.34%), Query Frame = 1
BLAST of Spo00672.1 vs. NCBI nr
Match: gi|920693336|gb|KOM36561.1| (hypothetical protein LR48_Vigan02g271100 [Vigna angularis]) HSP 1 Score: 1152.5 bits (2980), Expect = 0.000e+0 Identity = 567/629 (90.14%), Postives = 606/629 (96.34%), Query Frame = 1
BLAST of Spo00672.1 vs. UniProtKB/TrEMBL
Match: A0A0J8CQT1_BETVU (Uncharacterized protein OS=Beta vulgaris subsp. vulgaris GN=BVRB_4g071540 PE=3 SV=1) HSP 1 Score: 1198.3 bits (3099), Expect = 0.000e+0 Identity = 598/629 (95.07%), Postives = 617/629 (98.09%), Query Frame = 1
BLAST of Spo00672.1 vs. UniProtKB/TrEMBL
Match: V7BAS7_PHAVU (Uncharacterized protein OS=Phaseolus vulgaris GN=PHAVU_007G006400g PE=3 SV=1) HSP 1 Score: 1158.3 bits (2995), Expect = 0.000e+0 Identity = 568/629 (90.30%), Postives = 607/629 (96.50%), Query Frame = 1
BLAST of Spo00672.1 vs. UniProtKB/TrEMBL
Match: A0A0S3SL25_PHAAN (Uncharacterized protein OS=Vigna angularis var. angularis GN=Vigan.08G007400 PE=3 SV=1) HSP 1 Score: 1152.5 bits (2980), Expect = 0.000e+0 Identity = 567/629 (90.14%), Postives = 606/629 (96.34%), Query Frame = 1
BLAST of Spo00672.1 vs. UniProtKB/TrEMBL
Match: A0A0L9U1B9_PHAAN (Uncharacterized protein OS=Phaseolus angularis GN=LR48_Vigan02g271100 PE=3 SV=1) HSP 1 Score: 1152.5 bits (2980), Expect = 0.000e+0 Identity = 567/629 (90.14%), Postives = 606/629 (96.34%), Query Frame = 1
BLAST of Spo00672.1 vs. UniProtKB/TrEMBL
Match: I1NJ85_SOYBN (Uncharacterized protein OS=Glycine max GN=GLYMA_20G243700 PE=3 SV=1) HSP 1 Score: 1148.7 bits (2970), Expect = 0.000e+0 Identity = 565/629 (89.83%), Postives = 605/629 (96.18%), Query Frame = 1
BLAST of Spo00672.1 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: FTHS_SPIOL (Formate--tetrahydrofolate ligase OS=Spinacia oleracea PE=1 SV=3) HSP 1 Score: 1258.8 bits (3256), Expect = 0.000e+0 Identity = 632/632 (100.00%), Postives = 632/632 (100.00%), Query Frame = 1
BLAST of Spo00672.1 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: FTHS_ARATH (Formate--tetrahydrofolate ligase OS=Arabidopsis thaliana GN=THFS PE=2 SV=1) HSP 1 Score: 1131.7 bits (2926), Expect = 0.000e+0 Identity = 550/628 (87.58%), Postives = 603/628 (96.02%), Query Frame = 1
BLAST of Spo00672.1 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: C1TC_HUMAN (C-1-tetrahydrofolate synthase, cytoplasmic OS=Homo sapiens GN=MTHFD1 PE=1 SV=3) HSP 1 Score: 827.4 bits (2136), Expect = 1.500e-238 Identity = 416/621 (66.99%), Postives = 494/621 (79.55%), Query Frame = 1
BLAST of Spo00672.1 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: C1TC_PONAB (C-1-tetrahydrofolate synthase, cytoplasmic OS=Pongo abelii GN=MTHFD1 PE=2 SV=3) HSP 1 Score: 820.8 bits (2119), Expect = 1.400e-236 Identity = 413/621 (66.51%), Postives = 490/621 (78.90%), Query Frame = 1
BLAST of Spo00672.1 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: C1TC_MOUSE (C-1-tetrahydrofolate synthase, cytoplasmic OS=Mus musculus GN=Mthfd1 PE=1 SV=4) HSP 1 Score: 819.3 bits (2115), Expect = 4.200e-236 Identity = 412/622 (66.24%), Postives = 495/622 (79.58%), Query Frame = 1
BLAST of Spo00672.1 vs. TAIR (Arabidopsis)
Match: AT1G50480.1 (10-formyltetrahydrofolate synthetase) HSP 1 Score: 1131.7 bits (2926), Expect = 0.000e+0 Identity = 550/628 (87.58%), Postives = 603/628 (96.02%), Query Frame = 1
BLAST of Spo00672.1 vs. TAIR (Arabidopsis)
Match: AT5G06700.1 (Plant protein of unknown function (DUF828)) HSP 1 Score: 330.5 bits (846), Expect = 3.300e-90 Identity = 147/235 (62.55%), Postives = 191/235 (81.28%), Query Frame = 1
BLAST of Spo00672.1 vs. TAIR (Arabidopsis)
Match: AT3G12060.1 (Plant protein of unknown function (DUF828)) HSP 1 Score: 321.2 bits (822), Expect = 2.000e-87 Identity = 146/242 (60.33%), Postives = 193/242 (79.75%), Query Frame = 1
BLAST of Spo00672.1 vs. TAIR (Arabidopsis)
Match: AT1G60790.1 (Plant protein of unknown function (DUF828)) HSP 1 Score: 273.9 bits (699), Expect = 3.700e-73 Identity = 121/224 (54.02%), Postives = 165/224 (73.66%), Query Frame = 1
BLAST of Spo00672.1 vs. TAIR (Arabidopsis)
Match: AT5G49340.1 (TRICHOME BIREFRINGENCE-LIKE 4) HSP 1 Score: 270.8 bits (691), Expect = 3.100e-72 Identity = 120/224 (53.57%), Postives = 165/224 (73.66%), Query Frame = 1
The following BLAST results are available for this feature:
BLAST of Spo00672.1 vs. NCBI nr
Analysis Date: 2018-06-29 (blastp Spinacia oleracea peptides vs. NCBI nr) Total hits: 5
BLAST of Spo00672.1 vs. UniProtKB/TrEMBL
Analysis Date: 2018-06-29 (blastp Spinacia oleracea peptides vs. UniprotKB/TrEMBL) Total hits: 5
BLAST of Spo00672.1 vs. ExPASy Swiss-Prot
Analysis Date: 2018-06-29 (blastp Spinacia oleracea peptides vs. ExPASy SwissProt) Total hits: 5
BLAST of Spo00672.1 vs. TAIR (Arabidopsis)
Analysis Date: 2018-06-29 (blastp Spinacia oleracea peptides vs. TAIR) Total hits: 5
InterPro
Analysis Name: InterPro Annotations of S. oleracea
Date Performed: 2018-06-29
GO Annotation
GO Assignments
This gene is annotated with the following GO terms.
RNA-Seq Expression
Co-expression
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