Overview
Sequences
The following sequences are available for this feature:
Legend: polypeptideCDSexonthree_prime_UTR Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.ATGGCCATATCCACTCCGTTATGGTTAAGTTTGACCATTTGGTGCAGAGTTGATGCTACTCCTACCAAGTCATGGAGCCATGGGTGTCCAAGTAGGAGGTTAAAAGTGGATTTGATGTCCACTATTTGAAATTATGTAGTTCGTGCTACAGGTCAAGTTTGAATGGTAAGATCAATTTTGCCAAGCACTGGTTTTCAGGAGTTATCTTACGCTTGTATACGTTGGGCAGAAGGCTGAAAATCATTGCTATATAGTCTCAGGTATTGAGCGTTTCGTAATGGACAAACATTAACGGCCGAATCGTTGTCTACGAGTGGGATGTTCTAACCTTTGCATCCAACCACTAGGTAGAGTGACTTATTGTGGGAGCTTCCTTCTTTGGGTAAGTCTTTTGCAGTAAAGACCATTGCCCGTTCTTCTATGTCGCCGGTTACCTGGTTCACCAACGAATCTGGTGAGATGTCTGTGGTAACCGAAATGTTACTTCTACTTTTGACCAACGAATTTTTCATGATATTTCTAGTTCTTCTACATTTGACGAGGGACAGTGATAACAATTTTTGGAAATTTCATTTTAGGAGGACCCCCTCTCGTGGTAGTCGGGGAATTGTAATTGAGAAGTGTGGTTGAATGATTCCTTGGGGTCCTTTACTTGTCCTTCATTCGATTATTGCTTGTGAAAAATCCAAATTCTCATCATCCTTCTTTTTCTAGTCCATTCCCTTTGTTCTAGATACGTTTTTACATCCTTTTTCATTTGTCCTTGGGTTAGTTTTAATACTTCTATTTTAGGGAAGACCCTACTATTATTTTAATATACTCCTCTATCCACTACCAAAAACTTGGAGTCCCCACTCTCACATTCAGTTAAAAAAAAAAACCCCATTGTCTCATATCACATTTACTTTTTAAATAGAATAATACTCCACTAGCTCTTTTTTCACATCTATTTTTCCAGTAAAGAAAAATTTGATAACCAAACAACACATCACCTAAAACTATGTGCCATGTAATCAAAACTAATATGGGATGGATGAAGTTTATGACGACAAGACCACAAAGTAGGTAAATCCGTTGATTTGCATTACTGTTGGGGAAACTCATACTTGTGATAGCCTGCATTATATGTACATTATTGTATCGATTGGAATAAGATCATAACCGTCATTTTTCTATCTTATTGTCTGTCACTTTCTCTCTATTTTCATAACAAATATTTGTTATTTAAATCTTAATTATGAAAAATCAAATCAAATCAGTTCAGATAGATCATCATATCATATCAGTTCAGATCATATCAAATCAGCAAAAATAAGCTCAGATAAAATAAGCTCGGATTATTGGATGAATCGGGAAAAAAACTGCTATTTTCGAAATGTATTGGATTTTTTGATTTTTCCAAGCCTAAATCGATTAGAATCAATGGTCTAAGTTGAACTCATGAGATTATATTTGCGAAATTCAGCCCCGAAGTATGATTTTTTGGGCGTTTTTCGTGTTCAATGAATTAAAACGTGAAATTTCACGACTTTAAAAATTAATCATAATATATACTCGACTTTGTGATGCGTGTCTTCCCTAGCTGCTCCCAAACCGAACAAGAACAAGTTAGAACGCCAACTAGGATATAATATAAGGTTTATGATTTCGGGATCTCACTTTTAGGTGATAGGCAAAGTTTTAGAAATTTACCGAAACCAAAAACCCTAAAACCCTAGGTGTTGGCCGACTGCTTGCAAGGCAAGCAAACCGACCAGCCTTGATGCACAAGCAAGGCCTCGATGCTTGCTTTCTGCGCTGGCCCAAACAACAACGCTGGCCTAGCTCCAGCTGCGCGTGCGCGCTGGGCTACTGGGCCTGGCGTGCTGCTTTGTGCGTTGCCCTTGTGGCTTGGCGTGCATTGCTACGCGCAGGGACTTGTTGCCTAGCGTGTTGCGATGCACTTGCGGGTTGGCTCGTCTAGCGATGGGCTGACCCATGCGCTGGACCGTCGCTCGTCGAGCTTCCGATTTGTTTTTCTGATTCCGGAATTTATTTCTGATTCGAACAATATTTACGTTTCCGATAGAATTTCCGATTTCAATAATATTTCCGCTTCTGATAATATTTCCGATTCCGACAATATTTCAATTTCCGATAATATTTCCGATACGAACCATATTTCCGTTTCCGGCAATATTTTCGACTTCGATAATATTTATATTTCGGTTATGAACCATATTTTCGTTTCCGGTAATATCTTCATTCCGGCAAATATTCTTTCTTTGCCTTTTGACAGTTTGTTTAGCTCCCACTGAAACCAACATCCATCATTTCTGAATATCCATAAATAGAGTATTCATTGAATATAATATTGAACTAAATACTTGATCCGTTCACGTACTATTTGTGTGACCCTACGGGTCCAGTCAAGAGTAATTTGTGGCATTAATAACATTAATTCCACTTGACACTACTACAAAAATGGGAATATAGAGCTGTTAAAATAGACTTTATAAAGCGCCTGAGAGGCGCTCTCTTGCTCAACGCTTTATAAAGTTTATAAAGCTGTTGGAAGAGGCGTTTTATATGTATGATCATATATGACGGTGGTCTGAGAAGAGCGCTCTATATACCCTTCCTAAAATCAATAAATGAAGAAGGAATATAGAGCAGTTATCATAGTTAACCGTTAAATAAGCGCTAAAATATGTAACAGTTGTTGTAGATAGGCGCTTTATATGCTACCCCATTTTAATTAGAATAGAGAGCGCCTGTTATATTGTCCTTACATTGAGTTTTATTTTATGATCCAAAAGAACCATAAATTACATTATTAGTTATATTATACCTTAAGTTGGACAGTGATATTATTATTAATCGTGTATTGCCATGAAAGTATGACTAGAGAAATTTTGATCAACATTGGTGATTGCTACTATTTATGACCCCTAGTAGAAGGTTTGTATATGTCCAATATGTAAGGATACATTTTGTAATATTGTGTATGAGAAAATGTATTTATCTCAGGTGAAGATTTGTTGATCTATAGAGGTATTACTTTCAAAAGATTGGTGACATAAATATTCATCTCATCTGTTCAAGTGGAGAATTGAAGATTCAAGTCAAATTTTGGAGAAATTTCAAGGAGTTTCCTGTTGGTACATTTGAAAAGTTATTCAACAATATTAGATTCATTGCATTAGAAGATCTCAATCGATGTATTTATCAGGGGGAAAAATACGCGTTGCACTTTTTTCCCCTTAACCATGATTTTGTCCCACTGGGTTTTACTGGTAAGGTTTTTAACGAGGCATCATCTCAAGCTTATTATGACGAGTGTTGTACTCTTTTCCTTCACTGAGTTTTTATTCTACAGGGTTTTCCTAGTAAGGTTTTTAATGAGCCATCATCTCGTGTACATTATAGGACCATTGTATTGTTTTAGATAATGGACATCCAAGGAGGAGTGTTATAAATATATTGTATTGTGGATGCCCGTTATACCCTTGACATCCTTATCCTACATAATATATGTATATGTACATTATTGTATCGATTGGAATAAGATCATAACCGTCAGTTTTCTATCTTATTGTCTGTCACTTTCTCTCTATTTTCATAACAAATATTTGTTATTTAAATCTTAATTATGAAAAATCAAATCAAATCAGTTCAGATAGATCATCATATCAGATCAGTTAAGATCATATCAAATCAGCAAAAATAAGCTCAGATAAAATCAAATCAGAAAAATTCAGTTCAGATCGGATCAGTTCAGATTGGATCGATTTAGATCGGATCAGTTCAGATCAAATAAATAAGGTGAACTAAATGGTGCCTAAAATACAGAAGATGAATTATAAGTTTTTTTTTATAAAAAATTTCATCAAAGAAAAATAAAGAAAAATAACCGAATGAATTTTCTCTCCTCAAACTCCAACTCGCTCCAGCTGCTCTGCATCGCTTCCTCCTCTTAGAACCCTACCTACTTTCCTCCACGAAACCACCATCTTGTAGTTGTATCACCACCTCTGGTCGGCGGCGTCTCTGCCAACCATCTCTCCGTCACTGCCGCTGCTATTATTTGGTGTGTACTTTCTTCTTTTATCTATTTTCTATCAATTTTTTTTTGGATTTTTTTTTGTATTTTTTTTTATTCAAAAAGTGTTTGATTCATTGTATGGCCTGATATGATGGTTTCAAATGGTAAATAACTTATGTTGTCTGCTTTGTTTTGGTGTTATTTTATGTGTAATTAGTCTATACCCACTTCATAATTGTACTTGGAGTTCATGTTATCCTTTACTCTCTCCTGCCCTGGCTCAGGGACATGGGCAAGGCCAATCACGGGCATGGAAAAACGGGGAAGAAAGAAAAGCGAATAAAGATAATGCAACTGAAGTATGTTTCTGGGTAGTTGTACAATAGTGAGAAATAAGGACTCTTATGTTATTTGGTGAATTCTAATCGGTAAAGAATTCTCAAGTGTTAGTCCTCTTTAGAATCTCGACACTATTCACAGTTGAAAATAATCTTTTAGTTTCTTTCCCATAAGTATTTCAAAATATTTTCGGTTAGATCTTATTTTATTTGTGTCAACGTGATATTTACGTTTAAATGTTGAGTTGAAACGGGTGAGAAAGTCAAAAGGAGACTAATATTTAAGAACGAAGGGAGTAGTCGCTTATCAAGGTGCAATTTTTTTTTTATTTTTTTTGATAACGAAAGAAAACTAGGTGGACTACCTAGCTCACCCTTTCGAGTAGAAAACTACACTCTAACATTAAACTCCCCAGCCAGCCCCGGTCCTGACATTTTGGGGCCCTGGGCGAAATAAAGGTTTGGGGCCCCTTCCAATATGATGTGTAGATAATTGAAATATATCGTTTCACTATGAAAAGAAAGACGCATCAAAAATTTCGTCCAATTCACTACACATTCAAATTCAAATCAACAAAAAATTTACTTGATTACTAGATAGTCAATATGCATATATACGTTTATTATTTGAT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ATGGCCATATCCACTCCGTTATGGTTAAGTTTGACCATTTGGTGCAGAGTTGATGCTACTCCTACCAAGTCATGGAGCCATGGGTGTCCAACTGCTCTGCATCGCTTCCTCCTCTTAGAACCCTACCTACTTTCCTCCACGAAACCACCATCTTGTAGTTGTATCACCACCTCTGGTCGGCGGCGTCTCTGCCAACCATCTCTCCGTCACTGCCGCTGCTATTATTTGATAACTGCTGATTGGGCCTTCCGTCTCAACATGTCTCTTTCTTTAACACCTGCAAAGAGACAACATAGTCGAAGCCATGAGAACTCAAATGGCAAAAAATTTCAAAAGTCTGCAAGTCTTAATTCTACAAAACAACCTAGGAAAACCTCATCTGGAGGTGGTGTATTCCGTGTGCTCTGCCCATCTTCTAGAATTGAAAGTGTGATTGGAAAGGAGAACAATATCCTATCACAAATACATCAAGAAACTGGTGCTAAGGTAAGAATTGATGATTCTATTCCTGGATGTGATGAGAAGTTAATCTTTATTATGGGTCTGGATAAGGAAGCTGAGAGCAGCGGTCAACATAACAAGAATGACAATGAGGACACGAAGTCATCCAAAGAGCAAGGCAGTTCCGAAGATCACAATGTAAATGATGCTGACAAGGAGACTCCTACAAATGCTGAAGATCTATTGTCCAAGAAAGGAAATTCGTCTGTGCAGAATGCTTTGTTACTTGTGTTTCAAAATTTTTATGAAGGGGAGAGGGAGACAGAAGAACCTAATGAAGAAAGCAATGAATCTGCTGCAGTCACTTTCAGGTTACTTGTGCTTGCCGATCAGGTGGGATGCCTTTTGGGAAAGGGTGGCTCTATCATCAAGCAAATGTCTGCTGAGAGTGGTGCTCAGATTCGTGTTCTCCCCAGGGACAAACTCCCTCAATGTGCCTCTTCTACCGATGAAGTAGTTCAGATCACAGGATTAGCTGATGCTGTGAAGAAAGCAATCAGAACAGTGTCCAATCAGATTCTGGAAAATGCACTACATGATAACGATTCTTTTCCTTCTAATACCCCTGGACGCACATCTCAATCACACAGCAATCATGTTCCTAGGCCTGAATCCTATTTCCTTCATTCGCTGCCTTCTCATGGGCCATCGGGTGGTGGCTTTCGTGATAGTGCTGATTTTCATTCAGGTGTTCCCTCATTGTTTCCCAAGTTCCATGAAAACTTTATGCCAGGGAGAATGGATGTTCCTGACATTGTAACCTTTCGATTACTATGCCCTGACGAGAGGGTAGGAGGTGTGATTGGAAAGGGTGGAGCAATTATTAGGACTCTTCAGCATGAAACAGGGTGTGAGATCAAAGTTCTTGAAGGCCCTTCTGATGGAGAGGAACGAATGATTATTGTATCTGGTCCAGCGCACCCAGACGATAGAATATCTGCTGTTCAGGATGCAGTTCTCCGTGTGCAGAATCGTGTAGCCAAAGCTGTACCTGATAGCAAAGAGAAGGGTGTAATGGCAAAGCTTCTTGTACCTTCTAATCAAATTGGCTGCCTTCTAGGTAAAGGTGGCTCAATCATTGGTGAGATGCGGAAAGTCACTGGGGCTTATATTCGCATCTTAGGGAAAGATCAAATGCCTAAGAGTGCCTCTGAGAATGAAGAAGTAGTTCAGATTAACGGAGAACCGGAGGTAGTTCAAGATGCCCTTTTGCAGATAACTACGAGACTTCAGCATCATTTCTTCCGAGACGCATTTCCTTCCGTTAATCATCCTTCAAATCTTGCATTCTCAGATCGAGCACCACCTTTTCCTTCATTTATGGGACGAGAAGAAGTTTCTCCTCGAGGAATGTTTCCAAAATTAGGCCCTTCATTTAGAAACACTGATTACATTGGTTTGCCTCCTTTGCATGGTGGTTTTCATCCTCATGATGAACATCCGCCGTTTCTGCACGATATTCACCGGCATGGAGCTCCAAATCTTTCTGAAAGATCCTGGCATCCCCAGAATCTAATTGAAGGTGGTCCTATGGGCTTGTTGGATCATGGTGGACCCCCGCATAGACGGATGTCTGGATTTGGAGGGGGAAGCCAGCTAGCTGTAATCACAAATACCACTGTGGATGTAGTAGTTCCCAGTTCTATTGTACCTATTATATATGGAGAAGATGGTGGATGCTTGAGACAAATTCGTCAGATTTCTGATGCCAAGATTACCATCACTGATCCCAAACAAGGTGCGCCTGAAACTGTCATCATAATTTCTGGAACTCCTGAACAAACTCATGCTGCACAAAGTCTTATTCAAGCGTTTGTAATGCTTGAGAATGAATCGGGTTGAAAAAGCTCGTGGCTGCTTTCATGCTCACATTTAAGGAGTAATCATTTTTTTGCTATCTACAAAATGTAACTCTAGACCTTGCGCGTTATTTTCAACATATTCATGACATTAATACGGAGTACTTCGTATAGATTTTAATATATTTTGGGGAATACTCTTCATTCTAGAGGGAGTATTCCATACCAATATCTGTGTCAATACATCTCCTTTACAATTGTATTTTTTCACGATGACAAATAAATAGTTAGAAGAGAAAATACAGTAGCGTGAATGATGAAATGCAACTCGTTTTCCATTACAAATTCATTAGTATTCATCTATCAAAGTTTTCATGGGGTGATGCTGAATTTGATACTAAGCCCACCAATTGTGTACACAATGTAATGTCTGTTGGGTGTCGGTTCATTCCCATATGCCCACCAATTGTGTACTTGTTTGTTCATGAATTACATATAAACATTTGATTACCAGATTGTTTTGGCCCTATAATAAAATAAAATAGGAAAATTGACATAAATAATCTCAACTTTCA ATGGCCATATCCACTCCGTTATGGTTAAGTTTGACCATTTGGTGCAGAGTTGATGCTACTCCTACCAAGTCATGGAGCCATGGGTGTCCAACTGCTCTGCATCGCTTCCTCCTCTTAGAACCCTACCTACTTTCCTCCACGAAACCACCATCTTGTAGTTGTATCACCACCTCTGGTCGGCGGCGTCTCTGCCAACCATCTCTCCGTCACTGCCGCTGCTATTATTTGATAACTGCTGATTGGGCCTTCCGTCTCAACATGTCTCTTTCTTTAACACCTGCAAAGAGACAACATAGTCGAAGCCATGAGAACTCAAATGGCAAAAAATTTCAAAAGTCTGCAAGTCTTAATTCTACAAAACAACCTAGGAAAACCTCATCTGGAGGTGGTGTATTCCGTGTGCTCTGCCCATCTTCTAGAATTGAAAGTGTGATTGGAAAGGAGAACAATATCCTATCACAAATACATCAAGAAACTGGTGCTAAGGTAAGAATTGATGATTCTATTCCTGGATGTGATGAGAAGTTAATCTTTATTATGGGTCTGGATAAGGAAGCTGAGAGCAGCGGTCAACATAACAAGAATGACAATGAGGACACGAAGTCATCCAAAGAGCAAGGCAGTTCCGAAGATCACAATGTAAATGATGCTGACAAGGAGACTCCTACAAATGCTGAAGATCTATTGTCCAAGAAAGGAAATTCGTCTGTGCAGAATGCTTTGTTACTTGTGTTTCAAAATTTTTATGAAGGGGAGAGGGAGACAGAAGAACCTAATGAAGAAAGCAATGAATCTGCTGCAGTCACTTTCAGGTTACTTGTGCTTGCCGATCAGGTGGGATGCCTTTTGGGAAAGGGTGGCTCTATCATCAAGCAAATGTCTGCTGAGAGTGGTGCTCAGATTCGTGTTCTCCCCAGGGACAAACTCCCTCAATGTGCCTCTTCTACCGATGAAGTAGTTCAGATCACAGGATTAGCTGATGCTGTGAAGAAAGCAATCAGAACAGTGTCCAATCAGATTCTGGAAAATGCACTACATGATAACGATTCTTTTCCTTCTAATACCCCTGGACGCACATCTCAATCACACAGCAATCATGTTCCTAGGCCTGAATCCTATTTCCTTCATTCGCTGCCTTCTCATGGGCCATCGGGTGGTGGCTTTCGTGATAGTGCTGATTTTCATTCAGGTGTTCCCTCATTGTTTCCCAAGTTCCATGAAAACTTTATGCCAGGGAGAATGGATGTTCCTGACATTGTAACCTTTCGATTACTATGCCCTGACGAGAGGGTAGGAGGTGTGATTGGAAAGGGTGGAGCAATTATTAGGACTCTTCAGCATGAAACAGGGTGTGAGATCAAAGTTCTTGAAGGCCCTTCTGATGGAGAGGAACGAATGATTATTGTATCTGGTCCAGCGCACCCAGACGATAGAATATCTGCTGTTCAGGATGCAGTTCTCCGTGTGCAGAATCGTGTAGCCAAAGCTGTACCTGATAGCAAAGAGAAGGGTGTAATGGCAAAGCTTCTTGTACCTTCTAATCAAATTGGCTGCCTTCTAGGTAAAGGTGGCTCAATCATTGGTGAGATGCGGAAAGTCACTGGGGCTTATATTCGCATCTTAGGGAAAGATCAAATGCCTAAGAGTGCCTCTGAGAATGAAGAAGTAGTTCAGATTAACGGAGAACCGGAGGTAGTTCAAGATGCCCTTTTGCAGATAACTACGAGACTTCAGCATCATTTCTTCCGAGACGCATTTCCTTCCGTTAATCATCCTTCAAATCTTGCATTCTCAGATCGAGCACCACCTTTTCCTTCATTTATGGGACGAGAAGAAGTTTCTCCTCGAGGAATGTTTCCAAAATTAGGCCCTTCATTTAGAAACACTGATTACATTGGTTTGCCTCCTTTGCATGGTGGTTTTCATCCTCATGATGAACATCCGCCGTTTCTGCACGATATTCACCGGCATGGAGCTCCAAATCTTTCTGAAAGATCCTGGCATCCCCAGAATCTAATTGAAGGTGGTCCTATGGGCTTGTTGGATCATGGTGGACCCCCGCATAGACGGATGTCTGGATTTGGAGGGGGAAGCCAGCTAGCTGTAATCACAAATACCACTGTGGATGTAGTAGTTCCCAGTTCTATTGTACCTATTATATATGGAGAAGATGGTGGATGCTTGAGACAAATTCGTCAGATTTCTGATGCCAAGATTACCATCACTGATCCCAAACAAGGTGCGCCTGAAACTGTCATCATAATTTCTGGAACTCCTGAACAAACTCATGCTGCACAAAGTCTTATTCAAGCGTTTGTAATGCTTGAGAATGAATCGGGTTGA MAISTPLWLSLTIWCRVDATPTKSWSHGCPTALHRFLLLEPYLLSSTKPPSCSCITTSGRRRLCQPSLRHCRCYYLITADWAFRLNMSLSLTPAKRQHSRSHENSNGKKFQKSASLNSTKQPRKTSSGGGVFRVLCPSSRIESVIGKENNILSQIHQETGAKVRIDDSIPGCDEKLIFIMGLDKEAESSGQHNKNDNEDTKSSKEQGSSEDHNVNDADKETPTNAEDLLSKKGNSSVQNALLLVFQNFYEGERETEEPNEESNESAAVTFRLLVLADQVGCLLGKGGSIIKQMSAESGAQIRVLPRDKLPQCASSTDEVVQITGLADAVKKAIRTVSNQILENALHDNDSFPSNTPGRTSQSHSNHVPRPESYFLHSLPSHGPSGGGFRDSADFHSGVPSLFPKFHENFMPGRMDVPDIVTFRLLCPDERVGGVIGKGGAIIRTLQHETGCEIKVLEGPSDGEERMIIVSGPAHPDDRISAVQDAVLRVQNRVAKAVPDSKEKGVMAKLLVPSNQIGCLLGKGGSIIGEMRKVTGAYIRILGKDQMPKSASENEEVVQINGEPEVVQDALLQITTRLQHHFFRDAFPSVNHPSNLAFSDRAPPFPSFMGREEVSPRGMFPKLGPSFRNTDYIGLPPLHGGFHPHDEHPPFLHDIHRHGAPNLSERSWHPQNLIEGGPMGLLDHGGPPHRRMSGFGGGSQLAVITNTTVDVVVPSSIVPIIYGEDGGCLRQIRQISDAKITITDPKQGAPETVIIISGTPEQTHAAQSLIQAFVMLENESG Relationships
The following mRNA feature(s) are a part of this gene:
Homology
BLAST of Spo02084.1 vs. NCBI nr
Match: gi|902233306|gb|KNA22988.1| (hypothetical protein SOVF_028900 [Spinacia oleracea]) HSP 1 Score: 1375.5 bits (3559), Expect = 0.000e+0 Identity = 694/694 (100.00%), Postives = 694/694 (100.00%), Query Frame = 1
BLAST of Spo02084.1 vs. NCBI nr
Match: gi|731376101|ref|XP_010667457.1| (PREDICTED: KH domain-containing protein At4g18375-like [Beta vulgaris subsp. vulgaris]) HSP 1 Score: 1132.9 bits (2929), Expect = 0.000e+0 Identity = 579/694 (83.43%), Postives = 621/694 (89.48%), Query Frame = 1
BLAST of Spo02084.1 vs. NCBI nr
Match: gi|225458964|ref|XP_002283591.1| (PREDICTED: KH domain-containing protein At4g18375-like [Vitis vinifera]) HSP 1 Score: 801.6 bits (2069), Expect = 1.200e-228 Identity = 436/704 (61.93%), Postives = 528/704 (75.00%), Query Frame = 1
BLAST of Spo02084.1 vs. NCBI nr
Match: gi|302142130|emb|CBI19333.3| (unnamed protein product [Vitis vinifera]) HSP 1 Score: 775.8 bits (2002), Expect = 7.200e-221 Identity = 424/704 (60.23%), Postives = 510/704 (72.44%), Query Frame = 1
BLAST of Spo02084.1 vs. NCBI nr
Match: gi|802570329|ref|XP_012068119.1| (PREDICTED: KH domain-containing protein At4g18375-like [Jatropha curcas]) HSP 1 Score: 775.4 bits (2001), Expect = 9.400e-221 Identity = 423/704 (60.09%), Postives = 530/704 (75.28%), Query Frame = 1
BLAST of Spo02084.1 vs. UniProtKB/TrEMBL
Match: A0A0K9RU51_SPIOL (Uncharacterized protein OS=Spinacia oleracea GN=SOVF_028900 PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 1375.5 bits (3559), Expect = 0.000e+0 Identity = 694/694 (100.00%), Postives = 694/694 (100.00%), Query Frame = 1
BLAST of Spo02084.1 vs. UniProtKB/TrEMBL
Match: A0A0J8B2M4_BETVU (Uncharacterized protein OS=Beta vulgaris subsp. vulgaris GN=BVRB_008920 PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 1132.9 bits (2929), Expect = 0.000e+0 Identity = 579/694 (83.43%), Postives = 621/694 (89.48%), Query Frame = 1
BLAST of Spo02084.1 vs. UniProtKB/TrEMBL
Match: F6H152_VITVI (Putative uncharacterized protein OS=Vitis vinifera GN=VIT_18s0001g08280 PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 801.6 bits (2069), Expect = 8.500e-229 Identity = 436/704 (61.93%), Postives = 528/704 (75.00%), Query Frame = 1
BLAST of Spo02084.1 vs. UniProtKB/TrEMBL
Match: A0A067KZE4_JATCU (Uncharacterized protein OS=Jatropha curcas GN=JCGZ_15959 PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 775.4 bits (2001), Expect = 6.600e-221 Identity = 423/704 (60.09%), Postives = 530/704 (75.28%), Query Frame = 1
BLAST of Spo02084.1 vs. UniProtKB/TrEMBL
Match: B9R6S1_RICCO (Poly(RC)-binding protein, putative OS=Ricinus communis GN=RCOM_1584760 PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 758.1 bits (1956), Expect = 1.100e-215 Identity = 423/711 (59.49%), Postives = 525/711 (73.84%), Query Frame = 1
BLAST of Spo02084.1 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: HEN4_ARATH (KH domain-containing protein HEN4 OS=Arabidopsis thaliana GN=HEN4 PE=1 SV=1) HSP 1 Score: 209.9 bits (533), Expect = 9.900e-53 Identity = 154/467 (32.98%), Postives = 232/467 (49.68%), Query Frame = 1
BLAST of Spo02084.1 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: FLK_ARATH (Flowering locus K homology domain OS=Arabidopsis thaliana GN=FLK PE=1 SV=1) HSP 1 Score: 136.0 bits (341), Expect = 1.800e-30 Identity = 105/373 (28.15%), Postives = 164/373 (43.97%), Query Frame = 1
BLAST of Spo02084.1 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: Y4837_ARATH (KH domain-containing protein At4g18375 OS=Arabidopsis thaliana GN=At4g18375 PE=2 SV=1) HSP 1 Score: 119.4 bits (298), Expect = 1.800e-25 Identity = 129/508 (25.39%), Postives = 227/508 (44.69%), Query Frame = 1
BLAST of Spo02084.1 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: PCBP3_HUMAN (Poly(rC)-binding protein 3 OS=Homo sapiens GN=PCBP3 PE=2 SV=2) HSP 1 Score: 105.5 bits (262), Expect = 2.600e-21 Identity = 99/386 (25.65%), Postives = 165/386 (42.75%), Query Frame = 1
BLAST of Spo02084.1 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: PCBP3_MOUSE (Poly(rC)-binding protein 3 OS=Mus musculus GN=Pcbp3 PE=1 SV=3) HSP 1 Score: 104.4 bits (259), Expect = 5.800e-21 Identity = 95/361 (26.32%), Postives = 158/361 (43.77%), Query Frame = 1
BLAST of Spo02084.1 vs. TAIR (Arabidopsis)
Match: AT1G51580.1 (RNA-binding KH domain-containing protein) HSP 1 Score: 304.3 bits (778), Expect = 2.200e-82 Identity = 218/671 (32.49%), Postives = 338/671 (50.37%), Query Frame = 1
BLAST of Spo02084.1 vs. TAIR (Arabidopsis)
Match: AT1G14170.3 (RNA-binding KH domain-containing protein) HSP 1 Score: 212.2 bits (539), Expect = 1.100e-54 Identity = 164/493 (33.27%), Postives = 247/493 (50.10%), Query Frame = 1
BLAST of Spo02084.1 vs. TAIR (Arabidopsis)
Match: AT5G64390.3 (RNA-binding KH domain-containing protein) HSP 1 Score: 206.5 bits (524), Expect = 6.200e-53 Identity = 154/476 (32.35%), Postives = 232/476 (48.74%), Query Frame = 1
BLAST of Spo02084.1 vs. TAIR (Arabidopsis)
Match: AT5G15270.2 (RNA-binding KH domain-containing protein) HSP 1 Score: 206.5 bits (524), Expect = 6.200e-53 Identity = 131/350 (37.43%), Postives = 206/350 (58.86%), Query Frame = 1
BLAST of Spo02084.1 vs. TAIR (Arabidopsis)
Match: AT5G46190.1 (RNA-binding KH domain-containing protein) HSP 1 Score: 206.5 bits (524), Expect = 6.200e-53 Identity = 199/714 (27.87%), Postives = 319/714 (44.68%), Query Frame = 1
The following BLAST results are available for this feature:
BLAST of Spo02084.1 vs. NCBI nr
Analysis Date: 2018-06-29 (blastp Spinacia oleracea peptides vs. NCBI nr) Total hits: 5 Position : 0 Zoom : x 1
BLAST of Spo02084.1 vs. UniProtKB/TrEMBL
Analysis Date: 2018-06-29 (blastp Spinacia oleracea peptides vs. UniprotKB/TrEMBL) Total hits: 5 Position : 0 Zoom : x 1
BLAST of Spo02084.1 vs. ExPASy Swiss-Prot
Analysis Date: 2018-06-29 (blastp Spinacia oleracea peptides vs. ExPASy SwissProt) Total hits: 5 Position : 0 Zoom : x 1
BLAST of Spo02084.1 vs. TAIR (Arabidopsis)
Analysis Date: 2018-06-29 (blastp Spinacia oleracea peptides vs. TAIR) Total hits: 5 Position : 0 Zoom : x 1
InterPro
Analysis Name: InterPro Annotations of S. oleracea
Date Performed: 2018-06-29 Position : 0 Zoom : x 1
GO Annotation
GO Assignments
This gene is annotated with the following GO terms.
RNA-Seq Expression
Co-expression
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