Overview
Sequences
The following sequences are available for this feature:
Legend: exonfive_prime_UTRpolypeptideCDSthree_prime_UTR Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.GCCGTATATCCCACGTCCTTGCTTAGCATGTGCACGTTGGGTTATTCCGTTCGCGAAATAGTCGCACATCAGGCCATCAGGGTACCTGGCCAAGAAAACAACCGTGAACCGGCAATCAAACCGGTCTCGAAAAACTGCCTACAGTTTGAAAAAAAACAATGGCATACAATCAGTAGAGAGAGAAAACTTTTAAAATTCCCGAATTACCCCTTCCCGAAATCGCCACTCCAATCTATTATTTCTTGCTGTCCAAAATCGCTCAGTCTCTCTCTTCTTCTTTTTCGTCGCTTGGCTGCAGCAATGGGGTCTAAGGAGTGGCAAGGGAAGGAAAATTCGACGGACAGGAAAGGGCAAAAACGGAAATTAGACCAACAACAAGAGGAGAGAGAATCCACCGCCATTGTTTCCGGCGATGCTCTCCGCCGTGAGGTGGCTGCTCAGGTCGATATTCTCGCCGCCAATTTCTCGTGGACTGAGTCCGATAGAGCGTCTGCTAAGCGTGCTACTCATCTACTTGCGGAATTGGCGAAAAATGGTATGACTTTAACCTTATTTGTTCAGTAATTTGAGATTTTGTGCTTCATTAGGGCTTTTGTTTGGTATGATCAACGATCAATCACTGAATTAGTGAAGCTTGTTGGCTTTTGTATTATTGTAGAGGATGTAGTGAGTATAATCGTGGAAGGTGGAGCGGTTCCTATATTGGTGAAGCATCTTCAGGCGCCGCCGTCGCCGGTGGAGGACGATGGCGTAAAGCCATATGAGCATGAGGTTGAGAAAGCTAGTGCTTTTGCTCTTGGACTTCTTGCAGTAAAGGTCAGTGAGCTTCTTTATTGTCTTTTTTTTTTGTTAAATGCCAAACTAGAACAGTATGGATTTATCATTTATTTGATAAGGTATTGAAGTATACACAATTCATTAGTGAATGATACGATGCATGTTTTATAATTGAAAGGGATAGGAAAACGAGTATTTTGCTGTTATCAAGGGTTTTGTTTATTGAGTTCTAAACTAAATTGGATCATTTCAATACAAGGTTAATTGCGTTGTTTAAATCACTAGAACAATGCGGATTCTACTACCAGTTGGATTTGGTGAGGTACAGATGTTTGCAGCTTAATTGTCGCAAGCAAAGAGGTGGTAAGAATGTATGATATTCATGGACGATAGCGAGATTTTGTAAGGATGTTTCTAGGAGGAAACTGGTGTCTGCTGTAGTGCTGTTCCATAATATGGCGCATCACTTGCAGAAGGAAACTTTTCCTGTTTTTGTTTCTCATACGTTTGTTTAATGTACATTGTTCAACTTGCATTTGGACTGTAAAGTTCGTCGCAGGAGTTGGCATATTGGTGACATTGATGTGATATCAATTTAAGATTCAGTAGGTGGTAGTCAAAATGTAATTTGCATATATCCGAAGACCTAAATTGAGTGGTAGGATATGCTTTGGTTTGGTCGATGTTGATTTAACATGATGATTTGTTACTTCTTTGGCATCTCTTCTTCTGTCATATTCTGCTGCGATGGTGTATTACTTTAATGTTTATGTGTGGTTAGTTGGTTACCATCGTGTGACTTGTATGGCACCTCATACCTCATATTCTACACCATCAACAACAACAACAACAAAACCTTCTTCTTATGTATGAACCAATAATTTATTTTTTGTGGTCGTTTCATACCTCATACTCTCTACTTCTCTAGCTTTTAATGCCTATACATCTATTTTTCTTCAGTTGGCTGGTGGGAGGCTGACTGTTTAGTTGGTTACCATCGTGTGACTTGGATGACACCTCATACCGTATTCTTTTTTTTGTTTATGCTTACAGAGCCTTGTTTATGTTTTTCTGTTTGCAGCCAGAGCATCAACAACTCATTGTTGATGCAGGTGCCTTACCTCTCTTCGTAGATCTTTTAAAAAGGCACAAGTGTGGCTTGAATTCTCGGGCTGTCAATGGTGTCATTAGGAGAGCTGCTGATGCAGTAACTAACCTTGCTCACGAGAATAGCAGCATCAAAACGCGTGTCAGGTTTGGTTTAGATTAGCTGGGACGTGCCTGAACTGGAAATTTGATAATATTTTCTTGTCTGATTGTGGCTCCTGGACTGTATCCAGGACGGAAGGTGGTATTCCACCTCTTGTTGAACTACTTGAATTTAATGATGCAAAGGTACAGAGGGCAGTGGCCGGGGCACTGCGCACTCTCGCTTTTAAAAATGATGAAAATAAGAAGCAGGTGATGGACCTTTCGGGAGCCAATTTATCAATTATTGATACTGTCTTTAATAACAATTCTATAAGTTATCCGAGTCTTCTTTTAACAAGTTCAAGTTTATGACAATACAGATTGTTGAATGCAATGCTCTTCCTTCTTTGATTCTGATGCTTAGATCTGAGGATTCTGCTATACATTATGAAGCGGTAATCTTAACTTGAGTACATCATGCTGTGGTTTTTTGTATGGAGGGGTGTCAAACCCCCTATTATCCCACTTATATTGACACATACGAGGTTTTTGAACATTTTAAAATCATGATATCATTTTGTCTGCATTAATATCTTTCAGGTTGGTGTGCTTGGAAATTTGGTTCATTCGTCGCCCAACATAAAAAAAGATGTCCTGCTTGCTGGAGCTTTACAACCTGTTATTCGGTTACTCAGGTAATCGCACACAATCGTTTTCCATCTGTTTGACAGTTATATATTTGATGGTACCTGTATATAACCTTCTTCTTGTTTTTTTTTAATATATTTTTTTGTTTTTTATATCATTAGGACATTGGAATTTTTGTTCTTGCCATGCGGGTTTTAGAAATTTGTTTTTTGTCCATTTTTTGTGCTATAATTAGGAACACCTTCTCCTATTCCAAGACGTCATAAAGAAAATAAAAAGAGAACTAATTTAACTAATTTCGGCCTACAAAAATCACGAAGTGTTATAGCTATTATTAAGTGCTTGCTCTGATTCACATTATTTCACATATTTCTTATTAGGATTATTATCCATAGTCACTCGGTCATCTGTAAAACTCACTATGTATATAGCTTCCCGAGCGTACTTTGATGGTGATTGTATGTGACCCCCGTCCCCCTTCTTGTTCTAAATCCTCAATATGTTTAAGATTTAGCAAGGAATGCTTTTACTGCCTTTTGAACTACTGATTCTACTGTCTTTGCAGAAAATATGCATATGATATTTTAGAATAACTTTTACATCATCTTATTCTATGTGTCATTTTTGTGATTCTTGTGAATGTAAACTATTTTTAGATTGGACTTTGGAGGGAAAAAGTTGTTTTTCTATCAATTACAGATGTTAAATGTTTGCTGATATTGATGCATTTTTTAATCCTTCATTTTGTTCGTAATTATGCTTGTACTGAGTGAATATTCTGGGTAAACAGTTCATGCTGCTCTGAGAGCCAGAGGGAGGCAGCTTTATTACTTGGACAATTTGCTGCAACCGATTCAGATTGCAAGGTCTTTAACAGAGCTATGTTCTTTATTATTTGTTTATAATTTTGGAACAAAAACAAATCATATCTGCTTCAATTTCTTGTTTTTTTTTTTGTTTTTATGATAAGGAAAGAAAGCTAGGTGGATTACCTAGTTCACCCTTTCGGATGAAATACATAGACTCCGAGCAAATAAGATGTAAAACAGAGAGTACAATGAAACTAACACTCTAACCTCATACTACCCATGCCCCGGTTCCAAGTAAACTTGGTGAATAGACTTAAAAGATAGACGATTAGCCGAACGTTAAATGATGACGCCCCATCCTCTAGAAGAGAGTAAGCCTGAAACCTGACACTAGAACAAACTACATTGTAAAATCAAAGTAAAGCTAATCTAACCTAAACTACAAACGACTAAAAATCAAATTTACAATTTATTCAAAGATAATTACACGATAATTACAACCAAATCAAAAATCAGACATATATCTCAATAATGGCTAATTCGCGACGGAGAAATAGATCAGATCGCTCCAGATGCTATGAGCGACGGCGGCGAGAGATTAGAGGTTGGGTGCTGTGATTAGATCTGCTATGACTAAATGTTTACAATCCGGTTGTCCCAGGAGTAACACCACCGAAAGGGGGGGGGGGGGATTAGACTGGAAAATATTTTACGATAGCGGCGAAGTTGCAAACTCAAAGCTGGGCTCTAGCTTGAGGGAAGATACAGGGCCTTCATCACGGCCGACTGAGGACTTAAGTGATGAAGGATATAAGTTTCTACTGAAATCAAAGTTACTGTTGCTCATGGGGAATTTGAGATTGTTGTATATCTGACTTAAAGGAGTTTTAGTAATGGAAAATGGATGAACATTTGGTTAATGAGTTGGCTAGATCTGCATATGTTTTTTTGGCCGACGAGGGTGGCGGCTTAACCTCGGGGTAGGGTTTTCTAAGTGTTCTTTTCTATTGAGAGAAGCAGAGCCTCTCTCACTAAAATATCCTCTATAGCTCTACTCCCAAGTGAATACTTGCTTCAATTACTTGTTGATAGAATCGAACTATCGAAGGAAGATATATTTATTTCTTAATTAAGTTGTTCCTTGTAATTTTCTTGGGGGTGTTTACCTAATACCCATAGTGAGTATATTAATATAGTTATATGAACTCCTTTATACTATAGGATGTAACCTTATCGCTTCATTATTGTCCGCATCAACCTTTGTTTCTACACTAGAAAGACTAGTGGAAACCTACCAGCTGTAGTTTGGTTTTGGAATTAGATAGTTGCACACTTGTGATATAGGATGCGGTAGGTAAATTGTTGGCAAATTTGAGAACTTCTAGAATATAGAATAAAAAAGTAATAGTTACTGATGGTTCTGCTGTCATATCCATCACATTTGGAGAGCTAAAAGTGTCATTTAAAACAAAATAGTTTAGCTATTTTTATAGGAAAAATCACAGTGATATGGCATGAGTTTTGGGCTATTTGACACTTAGCCACTTAGGTGACTTCACATTTTGATAA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ATGTGCACGTTGGGTTATTCCGTTCGCGAAATAGTCGCACATCAGGCCATCAGGGTACCTGGCCAAGAAAACAACCGTGAACCGGCAATCAAACCGGTCTCGAAAAACTGCCTACAGTTTGAAAAAAAACAATGGCATACAATCAGTAGAGAGAGAAAACTTTTAAAATTCCCGAATTACCCCTTCCCGAAATCGCCACTCCAATCTATTATTTCTTGCTGTCCAAAATCGCTCAGTCTCTCTCTTCTTCTTTTTCGTCGCTTGGCTGCAGCAATGGGGTCTAAGGAGTGGCAAGGGAAGGAAAATTCGACGGACAGGAAAGGGCAAAAACGGAAATTAGACCAACAACAAGAGGAGAGAGAATCCACCGCCATTGTTTCCGGCGATGCTCTCCGCCGTGAGGTGGCTGCTCAGGTCGATATTCTCGCCGCCAATTTCTCGTGGACTGAGTCCGATAGAGCGTCTGCTAAGCGTGCTACTCATCTACTTGCGGAATTGGCGAAAAATGAGGATGTAGTGAGTATAATCGTGGAAGGTGGAGCGGTTCCTATATTGGTGAAGCATCTTCAGGCGCCGCCGTCGCCGGTGGAGGACGATGGCGTAAAGCCATATGAGCATGAGGTTGAGAAAGCTAGTGCTTTTGCTCTTGGACTTCTTGCAGTAAAGCCAGAGCATCAACAACTCATTGTTGATGCAGGTGCCTTACCTCTCTTCGTAGATCTTTTAAAAAGGCACAAGTGTGGCTTGAATTCTCGGGCTGTCAATGGTGTCATTAGGAGAGCTGCTGATGCAGTAACTAACCTTGCTCACGAGAATAGCAGCATCAAAACGCGTGTCAGGACGGAAGGTGGTATTCCACCTCTTGTTGAACTACTTGAATTTAATGATGCAAAGGTACAGAGGGCAGTGGCCGGGGCACTGCGCACTCTCGCTTTTAAAAATGATGAAAATAAGAAGCAGATTGTTGAATGCAATGCTCTTCCTTCTTTGATTCTGATGCTTAGATCTGAGGATTCTGCTATACATTATGAAGCGGTTGGTGTGCTTGGAAATTTGGTTCATTCGTCGCCCAACATAAAAAAAGATGTCCTGCTTGCTGGAGCTTTACAACCTGTTATTCGGTTACTCAGTTCATGCTGCTCTGAGAGCCAGAGGGAGGCAGCTTTATTACTTGGACAATTTGCTGCAACCGATTCAGATTGCAAGGTTCATATTGTTCAGAGAGGTGCTGTTCCGCCTTTGATTGAAATGCTCCAGTCCCCAGATTTACAGCTGAGGGAAATGTCAGCTTTTGCTTTGGGGAGGCTAGCACAGGAGTCACATAATCAAGCCGGGATTTCTCATAGTGGTGGTTTGGTGCCACTATTAAAGCTTCTTGATGCAAAAAATGGGTCTCTTCAACATAATGCTGCTTTTGCTCTCTATGGTCTTGCAGATAATGAGGATAATGTTGCTGATTTTGTAAAAGTGGGTGGTCTTCAGAAGTTGCAGGAAGGAGAGTTTATTGTTCAGGCAACCAAAGACTGTGTAGCGAAGACCCTTAAACGATTAGAAGAGAAGATTCATGGCCGGGTTTTGACCCACTTGATGTACCTCATGCGTGTTGGGGAAAAATTAGTTCAAAGACAAGTCGCTTTGGCTCTTGCTCATCTATGTTCTCCGGAGGACCAGAGATCAATTTTCATTGATAGCAATGGACTGGAATTACTTCTTGGGCTTCTCAAATCCACTAGTACTAAGCAACAACATGATGGTGCTGTGGCCCTCTGTAAATTGGCCAGCAAAGCTATGACCCTTTCCCCTGTTGATGCAGCTCCTCCTTCTCCCATATCACAGGTTTACTTAGGCGAACAGTATGTAAATAGTGCAACACTGTCTGATGTTACTTTTCTTGTTCAAGGTAAACGGTTCTTTGCTCATCGAATCTGCCTTCTTGCATCATCTGATGCCTTCCGTGCAATGTTTGATGGTGGTTATCGGGAAAAGGATGCCAGAGATATAGAGATTCCTAACATCAGATGGGAGATTTTTGAATTGATGATGAGATTTATATATACTGGATCAGTAGACATAAAACCAGACATAGCACAAGATCTCCTTAGGGCTGCAGATCAGTATCTTTTAGAGGGGCTAAAACGCCTTTGTGAATATACCATAGCCCAGGACATATCCCTGGAGAATGTGTCAAGCATGTATGAGCTTTCTGAGGCATTTCATGCTGTGTCATTGAGGCAGGCTAGCATCCTTTTCATCTTAGAGCAGCATGATAAATTGAGTGCTAGACCAGGGCATTCATCTCTTATGCAGCATATTTTGCCAGAAATTAGAAATTACTTTCTCAGAATACTCACCAAACCGAATGCTCTGAATTAG MCTLGYSVREIVAHQAIRVPGQENNREPAIKPVSKNCLQFEKKQWHTISRERKLLKFPNYPFPKSPLQSIISCCPKSLSLSLLLFRRLAAAMGSKEWQGKENSTDRKGQKRKLDQQQEERESTAIVSGDALRREVAAQVDILAANFSWTESDRASAKRATHLLAELAKNEDVVSIIVEGGAVPILVKHLQAPPSPVEDDGVKPYEHEVEKASAFALGLLAVKPEHQQLIVDAGALPLFVDLLKRHKCGLNSRAVNGVIRRAADAVTNLAHENSSIKTRVRTEGGIPPLVELLEFNDAKVQRAVAGALRTLAFKNDENKKQIVECNALPSLILMLRSEDSAIHYEAVGVLGNLVHSSPNIKKDVLLAGALQPVIRLLSSCCSESQREAALLLGQFAATDSDCKVHIVQRGAVPPLIEMLQSPDLQLREMSAFALGRLAQESHNQAGISHSGGLVPLLKLLDAKNGSLQHNAAFALYGLADNEDNVADFVKVGGLQKLQEGEFIVQATKDCVAKTLKRLEEKIHGRVLTHLMYLMRVGEKLVQRQVALALAHLCSPEDQRSIFIDSNGLELLLGLLKSTSTKQQHDGAVALCKLASKAMTLSPVDAAPPSPISQVYLGEQYVNSATLSDVTFLVQGKRFFAHRICLLASSDAFRAMFDGGYREKDARDIEIPNIRWEIFELMMRFIYTGSVDIKPDIAQDLLRAADQYLLEGLKRLCEYTIAQDISLENVSSMYELSEAFHAVSLRQASILFILEQHDKLSARPGHSSLMQHILPEIRNYFLRILTKPNALN Relationships
The following mRNA feature(s) are a part of this gene:
Homology
BLAST of Spo02867.1 vs. NCBI nr
Match: gi|902162248|gb|KNA06660.1| (hypothetical protein SOVF_178990 [Spinacia oleracea]) HSP 1 Score: 1347.4 bits (3486), Expect = 0.000e+0 Identity = 699/699 (100.00%), Postives = 699/699 (100.00%), Query Frame = 1
BLAST of Spo02867.1 vs. NCBI nr
Match: gi|731372100|ref|XP_010666244.1| (PREDICTED: ARM REPEAT PROTEIN INTERACTING WITH ABF2-like [Beta vulgaris subsp. vulgaris]) HSP 1 Score: 1269.6 bits (3284), Expect = 0.000e+0 Identity = 653/699 (93.42%), Postives = 680/699 (97.28%), Query Frame = 1
BLAST of Spo02867.1 vs. NCBI nr
Match: gi|802581193|ref|XP_012069582.1| (PREDICTED: ARM REPEAT PROTEIN INTERACTING WITH ABF2 isoform X1 [Jatropha curcas]) HSP 1 Score: 1113.2 bits (2878), Expect = 0.000e+0 Identity = 574/692 (82.95%), Postives = 630/692 (91.04%), Query Frame = 1
BLAST of Spo02867.1 vs. NCBI nr
Match: gi|1009141166|ref|XP_015888046.1| (PREDICTED: ARM REPEAT PROTEIN INTERACTING WITH ABF2 [Ziziphus jujuba]) HSP 1 Score: 1110.1 bits (2870), Expect = 0.000e+0 Identity = 575/693 (82.97%), Postives = 629/693 (90.76%), Query Frame = 1
BLAST of Spo02867.1 vs. NCBI nr
Match: gi|225432592|ref|XP_002281388.1| (PREDICTED: ARM REPEAT PROTEIN INTERACTING WITH ABF2 [Vitis vinifera]) HSP 1 Score: 1107.4 bits (2863), Expect = 0.000e+0 Identity = 577/694 (83.14%), Postives = 628/694 (90.49%), Query Frame = 1
BLAST of Spo02867.1 vs. UniProtKB/TrEMBL
Match: A0A0K9QHE0_SPIOL (Uncharacterized protein OS=Spinacia oleracea GN=SOVF_178990 PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 1347.4 bits (3486), Expect = 0.000e+0 Identity = 699/699 (100.00%), Postives = 699/699 (100.00%), Query Frame = 1
BLAST of Spo02867.1 vs. UniProtKB/TrEMBL
Match: A0A0J8B8D3_BETVU (Uncharacterized protein OS=Beta vulgaris subsp. vulgaris GN=BVRB_000890 PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 1269.6 bits (3284), Expect = 0.000e+0 Identity = 653/699 (93.42%), Postives = 680/699 (97.28%), Query Frame = 1
BLAST of Spo02867.1 vs. UniProtKB/TrEMBL
Match: A0A067L6L9_JATCU (Uncharacterized protein OS=Jatropha curcas GN=JCGZ_02143 PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 1113.2 bits (2878), Expect = 0.000e+0 Identity = 574/692 (82.95%), Postives = 630/692 (91.04%), Query Frame = 1
BLAST of Spo02867.1 vs. UniProtKB/TrEMBL
Match: A0A061EML0_THECC (ARM repeat protein interacting with ABF2 isoform 1 OS=Theobroma cacao GN=TCM_020571 PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 1102.0 bits (2849), Expect = 0.000e+0 Identity = 567/689 (82.29%), Postives = 622/689 (90.28%), Query Frame = 1
BLAST of Spo02867.1 vs. UniProtKB/TrEMBL
Match: B9RTY8_RICCO (Protein binding protein, putative OS=Ricinus communis GN=RCOM_0913950 PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 1096.6 bits (2835), Expect = 0.000e+0 Identity = 572/702 (81.48%), Postives = 628/702 (89.46%), Query Frame = 1
BLAST of Spo02867.1 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: ARIA_ARATH (ARM REPEAT PROTEIN INTERACTING WITH ABF2 OS=Arabidopsis thaliana GN=ARIA PE=1 SV=2) HSP 1 Score: 1054.7 bits (2726), Expect = 5.100e-307 Identity = 543/686 (79.15%), Postives = 615/686 (89.65%), Query Frame = 1
BLAST of Spo02867.1 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: ABAP1_ARATH (ARMADILLO BTB ARABIDOPSIS PROTEIN 1 OS=Arabidopsis thaliana GN=ABAP1 PE=1 SV=1) HSP 1 Score: 775.4 bits (2001), Expect = 6.000e-223 Identity = 400/654 (61.16%), Postives = 514/654 (78.59%), Query Frame = 1
BLAST of Spo02867.1 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: VAC8_ASPOR (Vacuolar protein 8 OS=Aspergillus oryzae (strain ATCC 42149 / RIB 40) GN=vac8 PE=3 SV=1) HSP 1 Score: 121.3 bits (303), Expect = 4.700e-26 Identity = 111/392 (28.32%), Postives = 182/392 (46.43%), Query Frame = 1
BLAST of Spo02867.1 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: VAC8_ASPFU (Vacuolar protein 8 OS=Neosartorya fumigata (strain ATCC MYA-4609 / Af293 / CBS 101355 / FGSC A1100) GN=vac8 PE=3 SV=1) HSP 1 Score: 120.6 bits (301), Expect = 8.000e-26 Identity = 111/392 (28.32%), Postives = 181/392 (46.17%), Query Frame = 1
BLAST of Spo02867.1 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: VAC8_CRYNJ (Vacuolar protein 8 OS=Cryptococcus neoformans var. neoformans serotype D (strain JEC21 / ATCC MYA-565) GN=VAC8 PE=3 SV=1) HSP 1 Score: 119.8 bits (299), Expect = 1.400e-25 Identity = 92/297 (30.98%), Postives = 154/297 (51.85%), Query Frame = 1
BLAST of Spo02867.1 vs. TAIR (Arabidopsis)
Match: AT5G19330.1 (ARM repeat protein interacting with ABF2) HSP 1 Score: 1054.7 bits (2726), Expect = 2.900e-308 Identity = 543/686 (79.15%), Postives = 615/686 (89.65%), Query Frame = 1
BLAST of Spo02867.1 vs. TAIR (Arabidopsis)
Match: AT5G13060.1 (ARMADILLO BTB protein 1) HSP 1 Score: 775.4 bits (2001), Expect = 3.400e-224 Identity = 400/654 (61.16%), Postives = 514/654 (78.59%), Query Frame = 1
BLAST of Spo02867.1 vs. TAIR (Arabidopsis)
Match: AT3G60350.1 (ARABIDILLO-2) HSP 1 Score: 94.7 bits (234), Expect = 2.600e-19 Identity = 96/343 (27.99%), Postives = 150/343 (43.73%), Query Frame = 1
BLAST of Spo02867.1 vs. TAIR (Arabidopsis)
Match: AT3G06190.1 (BTB-POZ and MATH domain 2) HSP 1 Score: 89.4 bits (220), Expect = 1.100e-17 Identity = 63/194 (32.47%), Postives = 98/194 (50.52%), Query Frame = 1
BLAST of Spo02867.1 vs. TAIR (Arabidopsis)
Match: AT2G23140.1 (RING/U-box superfamily protein with ARM repeat domain) HSP 1 Score: 82.0 bits (201), Expect = 1.800e-15 Identity = 70/230 (30.43%), Postives = 112/230 (48.70%), Query Frame = 1
The following BLAST results are available for this feature:
BLAST of Spo02867.1 vs. NCBI nr
Analysis Date: 2018-06-29 (blastp Spinacia oleracea peptides vs. NCBI nr) Total hits: 5 Position : 0 Zoom : x 1
BLAST of Spo02867.1 vs. UniProtKB/TrEMBL
Analysis Date: 2018-06-29 (blastp Spinacia oleracea peptides vs. UniprotKB/TrEMBL) Total hits: 5 Position : 0 Zoom : x 1
BLAST of Spo02867.1 vs. ExPASy Swiss-Prot
Analysis Date: 2018-06-29 (blastp Spinacia oleracea peptides vs. ExPASy SwissProt) Total hits: 5 Position : 0 Zoom : x 1
BLAST of Spo02867.1 vs. TAIR (Arabidopsis)
Analysis Date: 2018-06-29 (blastp Spinacia oleracea peptides vs. TAIR) Total hits: 5 Position : 0 Zoom : x 1
InterPro
Analysis Name: InterPro Annotations of S. oleracea
Date Performed: 2018-06-29 Position : 0 Zoom : x 1
GO Annotation
GO Assignments
This gene is annotated with the following GO terms.
RNA-Seq Expression
Co-expression
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