Overview
Sequences
The following sequences are available for this feature:
Legend: polypeptideCDSexonthree_prime_UTR Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.ATGATTAACGTTGCGATTGTGGTGCTAATTTTGGGAACATTTGGAACAGGGGTTAATTCCCAGAATTTAATAAGTTGGAACAAACTGAAGATGTTTGTTGATGAACTTCCTGATATACCCAAATTATATGGGTATAAAGTTGTTGGTGGAAAAGCTGTTCCGACTTATTTGAAAATTGGCATGTTCCAAAAGAATTGGGTTAGTTCTTCATCTCTTCTGCTTCTTTTTCTTTAAATAAAATTCTAATTTTGGGATATTAATTAAACTAAAATGTTAAGTTGTTTATTTGTTCCTGTTCTTTCGGCCTCCCCTGTTTCTAGTGAATCAGAATTCGTTGAATAAATTATACTCATGATTTTCAAAAAAATAAAGGCACAAGGAATCGAAATTGAAAAGAATGGGCAGTCTTAGAAATTCTAAGAATGATTGTAAGCAGGTGTCAAAAAGTGATTGGCGCTTTAAGATATATTTCATAGGGTGATGATCATTTTCGTATTTCATAATTTGATGGTTATTATCAACATGGATGTAATTAAGTGCTCACGGGCTTTCCCTTGTTATTTGAACTCTAGTAGTCAGTGATTGATTTTGTTCATTTTATCAATTTATTATGTCCTTTAGCTAAAATGATAAAGTGTACAGTATTTTGTTTATGAGGGAATTAATTGTTTCATTTCTTGGTCATATCGATTATATATTTGTTAAGAGTTCTTCCCAAATATAATTGGTACAAAATTGACATATACTTTTAATTGGATGAAAAAATATTACTCATGTTAGTAAGTAGTAGTAGAATCGTAGATATCATAGTTGATCGGATTACAAACAAATAAAACAAAATGTGTCCCACTAATTAAAGCTAGACTTGATGATAGGAGTAATATCTTTGAAAATACAAGGCAAGTTTGTGAAAACTAAAAAGTCCTTGCGGACCATGCAGAAGACGACAGTGTCACATTGTCTGCCAAAGATCAAAGTTTCACATTCGTAAACATGTTGCTCACTATACAAAATTATTAACGACTTTAACTTTGAAAATTTTGTGCAGTGGGAAAAGAGATCGAATTACTTCATCATAAATAGTATTATATCTTTATAAAGTACTGTATTTGATTAGGTGTGTTTCAATCATTTTTCATTGTTTGGTATTATATGACGAGGGGTACAAAATAATTTTCCAATAACTCGATCTCTCAAGGGTGAAAAATGTTTCATTACAAATAAAAGGAAACCATTTTACAAAATGATAAAGTTCGCAACTTGCGACAAATTATTTGTGTGATGTATCACATATTACAATTGCAAACTAAAGATTTTTTAACATAAATACAATATCATTATAATTATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATAAAATGGGTAGGCAATATTTATATCCTTATTTAGCAAAATATTATTTTTATTTTATTCTTTAAAATTTTGAATAACTTGTAAATTAAGGAATTAAAAAAAAAAACAATCACATATTATTATTACTAGATTTTAGCCTGTGTAATGCACAAATTATATTAAATTGTTAAGTTAAAATAAAAATCCTATATATAGCAACTGCTATATTTTATATATTAGATTAGATTAGGTTTTTTTTATTTTGGATTGAATTTCGGTTTAGATTTATTTTTTAACTATTAAAATGTTTGGTTTTGGATGAAGTTGTATATGCGTAATATTAGTAACTAGATTTTAGCGCGTGCGATGCACTGATTCTATTAGATTGTTAGTTTAAAATAAAACTCATATGTATACCAACTGCTATATTTATATATTAGGTTATATTAGTTTTTGATTTGGATTGAATTTCATTTTAATTTATTTTTTTAATTATTAGAGTGTTTGATTTTGGATGAAATTGTATGTGCACAATATTAATCATTAATTAATTAAAATATCTATGTGGCACCTAATTAATTATCTACGTGGCACTCGATTTTTTATTTCAAAAATAAATTAGAAATCTTGTTTATCATTGGCCGAAACAATAAGATATCCTATGTGGCGCTCTAGTAATTCGGCAAATATATATATATTAGATTATTTTTAAAAGAAAATATACGTGACACCTAATTATTTATCTACGTGGCATTCAAGTTTTTTAATTCAAAAATAATGTCGAAATCTTATTTTTTATTGGCCGGAACCATTTAGATTTCCTACGTGGCGCTTTAATATTTGATTATTGTTTGCTTTTGGATTGAATATTTTTTAGATTAGTGTCTGATTTTGGATGAATTTTAATTTAGATTTTCTTTTTAATTATTAGAGTGTTTGATTTTGGATGGAGTTGAATATATTAGTAATTAATTAATTAAAATATCTACGTGACATTTGATTTTTTTTCATTGGCCGAAACTATTAGATTTCCTACGTGGCGCTCTAATAGCTTAGTAAATATGCCTCCTTAATAAAAAAAAAGCACGCACACTCACTCTGAAAATTATCAAAATTGAAAACTAAAGATTTTTTTATCATAAATACAATATCATTAGAATCTTTTTATTCACTATATTATTTATTTTATTCTATAAATTTTTTGAATAACTTGTAAATTAAGGAACTATTTAAAAAATAAACACTCACATATTATTATTTTAAAAAAACATGCACACTCACTCAGCTCATTCATAATAAACAATACGGAGTAGTTATAAATCATTATTGCCTCTTTTTTATTATTATAATAGTTATACTATTAGATTAATTTATTTTTTAATTACTATTGATATCCAAGATAAAAGGAAACATATATTTATCATGACATTATTTTAAATTTATTTCCTTTATTTTGATTTCCTATATTATTCATATTCCTATAATATATTTGTCATAGTAAAATATTAGTTTGTTAGTAAAAATAATTTGATTCTCATGTCAAAAAAAAAAAAATTGATGACTCAAATTCTTATGTGGCACTAATAAGTAATAATGAGTGACACATCATTCAGAGACAATATTTTATTGTCACAATTGTGACTTATATCATCAAACCAAACATATCCTAAATTAAGACGGAGGTAAAAGTATATGGGACAGTCTAAAATTTAAAAATGGTAATATTCATGTAAAAATAATTAATAATTGACCCGGACGGCGGAACCATAAATATTAGTCCGCTATTAATCAAAGTTTATTGTGACTTATGCATAGAAAAAATTAAGCACAATGTGNTATTAGTCCGCTATTAATCAAAGTTTATTGTGACTTATGCATAGAAAAAATTAAGCACAATGTGAAATTGTTACACATGCAAGTAGAAAATTACGCACACATGTTACATGTATGATGTATGATGTATTGTGAAATCCTAATTTTCAATATTGTTGCATGATTATAGAAATTTCATAGAGACCTTCCAGCAACACCGGTATTTGCCTATGGTACATCAAAGAAGAAGGCAACAGTTCCAGGGCCAACAATTGAGGCACTAAATGGTGTAGACACCTACATAAGATGGGAAAATAATCTTCCTAAGAAGCACATCCTTCCGTGGGACCCAACCATACCTACGGCGATCCCACGGGGTCAAGACGGGGTCCCCACGGTGGTGCACCTTCACGGTGGGATAGACGAGCCTGAAAGTGATGGTCATGGACATGCTTGGTTTACTAATGGTTTTAAAGATAGAGGAGCTCGTTGGAGTAAGAAAACATACCATTATCATAATCAACAACAACCAGGAAACATGTGGTACCATGATCATGCAATGGGGTTGACTAGGGCTAATCTTTTGGCTGGATTGATTGGTTCTTATATTATTCGACAACCACAAGTTGAGGATGCTCTTAAATTGCCTTCCGGTGACAGTTTTGATAAGGTTATGGTTGTTTGTGATAGGGATTTCTATAGGAATGGATCTCTTTTCATNAATATTTTTTAGATTAGTGTCTGATTTTGGATGAATTTTAATTTAGATTTTCTTTTTAATTATTAGAGTGTTTGATTTTGGATGGAGTTGAATATATTAGTAATTAATTAATTAAAATATCTACTTGGTACCTAATTAATTATCTACGTGACACTCGATTTTTTTCATTGGCCGAAACTATTAGATTTCCTACGTGGCGCTCTAATAGCTTAGTAAATATGCCTCCTTAGTAAATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATTTTTAAAAAAAAGCACGCACACTCACTCTGAAAATTATCAAAATTGAAAACTAAAGATTTTTTTATCATAAATACAATATCATTAGAATCTTTTTATCCTTACTTGCAATATATTATTTATTTTATTCTTTAAATTTTTTGAATAACTTGTAAATTAAGGAACTATTTAAAAAATAAACACTCACATATTATTATTTTAAAAAANAAATTTTTTGAATAACTTGTAAATTAAGGAACTATTTAAAAAATAAACACTCACATATTATTATTTTAAAAAAAACATGCACACTCACTCAACTCATTCATAATAAACAATACGGAGTAGTTATAAATTATTATTGCCTCTTTTTTATTATTATAATAGTTATACTATTAGATTAATTTATTTTTTAATTACTATTGATATCCAAGATAAAAGGAAACATATATTTATCATGACATTATTTTAAATTTATTTCCTTTATTTTGATTTCCTATATTATTCACATTCCTATAATATATTTGTCATAGTAAAAATAATTTGATTCTCATGTCAAAAAAAAAAAAAATTGATGACTCAAATTCTTATGTGCCACTAATAAATAATAATGAGTGACACATCATCCAGAGACAATATTTTATTGTCACAGTTGTGACTTATATCATCAAACCAAACGTATCCTAAATTAAGACGGAGGTAAAAGTATATGGGACAGTCTAAAATTTAAAAATGGTAATATTCATGTAAAAAAAAATTAATAATTGACCCGGACGGCGGAACCATAGATATTAGTCCGCTATTAATCAAAGTTTATTGTGACTTATGC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ATGATTAACGTTGCGATTGTGGTGCTAATTTTGGGAACATTTGGAACAGGGGTTAATTCCCAGAATTTAATAAGTTGGAACAAACTGAAGATGTTTGTTGATGAACTTCCTGATATACCCAAATTATATGGGTATAAAGTTGTTGGTGGAAAAGCTGTTCCGACTTATTTGAAAATTGGCATGTTCCAAAAGAATTGGAAATTTCATAGAGACCTTCCAGCAACACCGGTATTTGCCTATGGTACATCAAAGAAGAAGGCAACAGTTCCAGGGCCAACAATTGAGGCACTAAATGGTGTAGACACCTACATAAGATGGGAAAATAATCTTCCTAAGAAGCACATCCTTCCGTGGGACCCAACCATACCTACGGCGATCCCACGGGGTCAAGACGGGGTCCCCACGGTGGTGCACCTTCACGGTGGGATAGACGAGCCTGAAAGTGATGGTCATGGACATGCTTGGTTTACTAATGGTTTTAAAGATAGAGGAGCTCGTTGGAGTAAGAAAACATACCATTATCATAATCAACAACAACCAGGAAACATGTGGTACCATGATCATGCAATGGGGTTGACTAGGGCTAATCTTTTGGCTGGATTGATTGGTTCTTATATTATTCGACAACCACAAGTTGAGGATGCTCTTAAATTGCCTTCCGGTGACAGTTTTGATAAGAAATTTCATAGAGACCTTCCAGCAACACCGGTATTTGCCTATGGTACATCAAAGAAGAAGGCAACAGTTCCAGGGCCAACAATTGAGGCACTAAATGGTGTAGACACCTACATAAGATGGGAAAATAATCTTCCTAAGAAGCACATCCTTCCGTGGGACCCAACCATACCTACGGCGATCCCACGGGGTCAAGACGGGGTCCCCACGGTGGTGCACCTTCACAGTGGGATAGTCGAGCCTGAAAGTGATGGTCATGGACATGCTTGGTTTACTAATGGTTTTAAAGATAGAGGAGCTCGTTGGAGTAAGAAAACATACCATTATCATAATCAACAACAACCAGGAAACATGTGTTTTGATAAGGTTATGGTTGTTTGTGATAGGGATTTCTACAGGAATGGATCTCTTTTCATGAATAGCACTGGGGACCCGGTAAATGATGCAAACAGCAAGGTGATGAAGTTCATAATAAAGAAACAACGTGTGGATGACCCGGCCCATATACCAAAATGGCTAATAAAATATTCATCACCAAACTTATCCACTGCTTCACGGACTCGTTACATTTCCATGTACGAGTACACAAGTCCATCCAACGAACCCACCCATTTGTTTATAAACGGACTATCATTCGACGCTCCAGTAACCGAGTTCCCTAAGGTGGGGTCCAGTGAGATATGGTATGTGATTAATCTAACAGAGGATAATCACCCGCTTCATGTACATCTAGGATTGTTTAAGGTATTGGAGCAAACAAAATTGCTGGATTTTGATAAGTTTAAGGATTGTATGGCCAACAAAAACAACGCAGAGAGGTGTAATGTACACAAACATGCACGGGGTAAAAAATTAGATGTAACAAAGCATGAAAGAGGGTGGAAGAATGTGTTCAAAATGTGGCCAGATTATGCAACAAAGATATATGTGAGATTCTCTTACATTCATACCAACGCTTCCTACCCTTTTGATGCTACTAAGGACCCTGGTTATGTCTACCATTGCCACGATTTGGAGGACGACCTGAGATCTCATGCATGTTATTATCACCAAGCTAAAGGTAAAAGGCGATTATGCAAAAGCAGAAGAGTATTGTGGAAGAGCAATACTTGCAAATCCCGGGGATTGAAATGTTTTATCCCTCTATGCAGATTTGACCTGGCAAACTCAGAAAGTTTAAGAGCTGAAAGTTATTTTGATCAGGCAGTCAGAGCAGCTCCTGATGACTGCATCAACAAGAACTTTTGTCTTGAGAAAGAATGA MINVAIVVLILGTFGTGVNSQNLISWNKLKMFVDELPDIPKLYGYKVVGGKAVPTYLKIGMFQKNWKFHRDLPATPVFAYGTSKKKATVPGPTIEALNGVDTYIRWENNLPKKHILPWDPTIPTAIPRGQDGVPTVVHLHGGIDEPESDGHGHAWFTNGFKDRGARWSKKTYHYHNQQQPGNMWYHDHAMGLTRANLLAGLIGSYIIRQPQVEDALKLPSGDSFDKKFHRDLPATPVFAYGTSKKKATVPGPTIEALNGVDTYIRWENNLPKKHILPWDPTIPTAIPRGQDGVPTVVHLHSGIVEPESDGHGHAWFTNGFKDRGARWSKKTYHYHNQQQPGNMCFDKVMVVCDRDFYRNGSLFMNSTGDPVNDANSKVMKFIIKKQRVDDPAHIPKWLIKYSSPNLSTASRTRYISMYEYTSPSNEPTHLFINGLSFDAPVTEFPKVGSSEIWYVINLTEDNHPLHVHLGLFKVLEQTKLLDFDKFKDCMANKNNAERCNVHKHARGKKLDVTKHERGWKNVFKMWPDYATKIYVRFSYIHTNASYPFDATKDPGYVYHCHDLEDDLRSHACYYHQAKGKRRLCKSRRVLWKSNTCKSRGLKCFIPLCRFDLANSESLRAESYFDQAVRAAPDDCINKNFCLEKE Relationships
The following mRNA feature(s) are a part of this gene:
Homology
BLAST of Spo03208.1 vs. NCBI nr
Match: gi|743889203|ref|XP_011038672.1| (PREDICTED: multicopper oxidase LPR2 [Populus euphratica]) HSP 1 Score: 569.7 bits (1467), Expect = 6.500e-159 Identity = 285/556 (51.26%), Postives = 362/556 (65.11%), Query Frame = 1
BLAST of Spo03208.1 vs. NCBI nr
Match: gi|1021028693|gb|KZM86478.1| (hypothetical protein DCAR_023612 [Daucus carota subsp. sativus]) HSP 1 Score: 569.3 bits (1466), Expect = 8.500e-159 Identity = 296/582 (50.86%), Postives = 381/582 (65.46%), Query Frame = 1
BLAST of Spo03208.1 vs. NCBI nr
Match: gi|902118579|gb|KNA03955.1| (hypothetical protein SOVF_204250, partial [Spinacia oleracea]) HSP 1 Score: 411.8 bits (1057), Expect = 2.300e-111 Identity = 193/198 (97.47%), Postives = 195/198 (98.48%), Query Frame = 1
BLAST of Spo03208.1 vs. NCBI nr
Match: gi|731378136|ref|XP_010668080.1| (PREDICTED: multicopper oxidase LPR2-like [Beta vulgaris subsp. vulgaris]) HSP 1 Score: 390.2 bits (1001), Expect = 7.000e-105 Identity = 178/226 (78.76%), Postives = 203/226 (89.82%), Query Frame = 1
BLAST of Spo03208.1 vs. NCBI nr
Match: gi|870840790|gb|KMS94912.1| (hypothetical protein BVRB_014180 [Beta vulgaris subsp. vulgaris]) HSP 1 Score: 390.2 bits (1001), Expect = 7.000e-105 Identity = 178/226 (78.76%), Postives = 203/226 (89.82%), Query Frame = 1
BLAST of Spo03208.1 vs. UniProtKB/TrEMBL
Match: A0A164SQG0_DAUCA (Uncharacterized protein OS=Daucus carota subsp. sativus GN=DCAR_023612 PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 569.3 bits (1466), Expect = 5.900e-159 Identity = 296/582 (50.86%), Postives = 381/582 (65.46%), Query Frame = 1
BLAST of Spo03208.1 vs. UniProtKB/TrEMBL
Match: A0A0K9Q9K2_SPIOL (Uncharacterized protein (Fragment) OS=Spinacia oleracea GN=SOVF_204250 PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 411.8 bits (1057), Expect = 1.600e-111 Identity = 193/198 (97.47%), Postives = 195/198 (98.48%), Query Frame = 1
BLAST of Spo03208.1 vs. UniProtKB/TrEMBL
Match: A0A0J8B4Z9_BETVU (Uncharacterized protein OS=Beta vulgaris subsp. vulgaris GN=BVRB_014180 PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 390.2 bits (1001), Expect = 4.900e-105 Identity = 178/226 (78.76%), Postives = 203/226 (89.82%), Query Frame = 1
BLAST of Spo03208.1 vs. UniProtKB/TrEMBL
Match: A0A067FNI2_CITSI (Uncharacterized protein OS=Citrus sinensis GN=CISIN_1g008071mg PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 327.0 bits (837), Expect = 5.100e-86 Identity = 144/207 (69.57%), Postives = 174/207 (84.06%), Query Frame = 1
BLAST of Spo03208.1 vs. UniProtKB/TrEMBL
Match: A0A0J8B8K0_BETVU (Uncharacterized protein OS=Beta vulgaris subsp. vulgaris GN=BVRB_6g156330 PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 326.2 bits (835), Expect = 8.700e-86 Identity = 153/188 (81.38%), Postives = 168/188 (89.36%), Query Frame = 1
BLAST of Spo03208.1 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: LPR1_ARATH (Multicopper oxidase LPR1 OS=Arabidopsis thaliana GN=LPR1 PE=2 SV=1) HSP 1 Score: 303.5 bits (776), Expect = 5.400e-81 Identity = 140/225 (62.22%), Postives = 165/225 (73.33%), Query Frame = 1
BLAST of Spo03208.1 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: LPR2_ARATH (Multicopper oxidase LPR2 OS=Arabidopsis thaliana GN=LPR2 PE=2 SV=1) HSP 1 Score: 302.8 bits (774), Expect = 9.300e-81 Identity = 142/226 (62.83%), Postives = 169/226 (74.78%), Query Frame = 1
BLAST of Spo03208.1 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: COTA_BACSU (Spore coat protein A OS=Bacillus subtilis (strain 168) GN=cotA PE=1 SV=4) HSP 1 Score: 160.6 bits (405), Expect = 5.700e-38 Identity = 88/198 (44.44%), Postives = 117/198 (59.09%), Query Frame = 1
BLAST of Spo03208.1 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: PHSA_STRAT (O-aminophenol oxidase OS=Streptomyces antibioticus GN=phsA PE=1 SV=3) HSP 1 Score: 90.9 bits (224), Expect = 5.500e-17 Identity = 61/179 (34.08%), Postives = 78/179 (43.58%), Query Frame = 1
BLAST of Spo03208.1 vs. TAIR (Arabidopsis)
Match: AT1G23010.1 (Cupredoxin superfamily protein) HSP 1 Score: 303.5 bits (776), Expect = 3.100e-82 Identity = 140/225 (62.22%), Postives = 165/225 (73.33%), Query Frame = 1
BLAST of Spo03208.1 vs. TAIR (Arabidopsis)
Match: AT1G71040.1 (Cupredoxin superfamily protein) HSP 1 Score: 302.8 bits (774), Expect = 5.200e-82 Identity = 142/226 (62.83%), Postives = 169/226 (74.78%), Query Frame = 1
The following BLAST results are available for this feature:
BLAST of Spo03208.1 vs. NCBI nr
Analysis Date: 2018-06-29 (blastp Spinacia oleracea peptides vs. NCBI nr) Total hits: 5
BLAST of Spo03208.1 vs. UniProtKB/TrEMBL
Analysis Date: 2018-06-29 (blastp Spinacia oleracea peptides vs. UniprotKB/TrEMBL) Total hits: 5
BLAST of Spo03208.1 vs. ExPASy Swiss-Prot
Analysis Date: 2018-06-29 (blastp Spinacia oleracea peptides vs. ExPASy SwissProt) Total hits: 4
BLAST of Spo03208.1 vs. TAIR (Arabidopsis)
Analysis Date: 2018-06-29 (blastp Spinacia oleracea peptides vs. TAIR) Total hits: 2
InterPro
Analysis Name: InterPro Annotations of S. oleracea
Date Performed: 2018-06-29
GO Annotation
GO Assignments
This gene is annotated with the following GO terms.
RNA-Seq Expression
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