Overview
Sequences
The following sequences are available for this feature:
Legend: polypeptideexonCDSthree_prime_UTR Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.ATGTTACCTATTTCAAAAGTGTTACCGTAAATTGTTACCTATTTAAAAAGTGTTACCATAATGTGTTACCTATTTTAAAAACTGTTACCATAAAATGTTACCTATGTTAAAGGTGTTACCTTGAGTGTTACATTTTAAAAAAAATGTTACCAAAGTGTTACTTAATAATCTAGTTAACACCTTTATTAAGTAACACTTTGGTAACACTGTCGCCTCATTTTCATTTAAGGATGACCAGAAGTCCCAGATCGAGGTACTAGACATTTCATTTTCATTTAAGGATGACCAGAAGTCCCAGATCGAGGTACTAGACGCCTCATTTTCATTTAAGGATGATTAGAAGTCCCATATCGAGGTTACCAGATGCCTCATTTTCTTTTTAGGATGACCAGAAGTCCCAAATCGAGGTTACCAGACGCCTCACTTAAGGATGACCAGAAGTCCCAAATCGAGGTTACCAGACGCCTCATTTAAGGATGACCAGAAGTCCCAGATCAAGATACTAGACGCCTCATTTTCATTTAAGGATTACCAAAAGTCCCATATCGAGGTTACTAGATATCTCATTTTCATTGAAGGATTACCAGAAGTCACAGATCGAGGTTACCAGACCCCTCATTTTCATTTAAGGATAACTAGAGTCCCAGTTAGAGGTCACCAGATTTCTCATTTCCAGTTTAAAAGACCATCCAAAACTATAACTGTTAGAAATAGTAAAAGATCAGAAATGAAGACATGTAATGAAAAACGACCCTCAACTGACTAAAAAGACCATCCAAAACAGTAACTATTAAATATAGTAACTTCCATAAATAGAAAGCCTCCTAAAATAGACTGGATACATATTTAGTCGCATTTGCATCCCGGTACGGCTTAATATGTGGTTACATCGATAGAAAGATAGAATATCATTGTCCGCATCACAACACACCTATACATGCCACAATGTTCTAGTGCTTGCCTTCAGGCTCTAGAATAACATAGCTCAAACAAAAAGCACTTCTTAAACTCATACTTATTGGGCACAAGACATGTAAATGTTAACCCAATTCACTTAAAAATGCTTACGAGTGCCTAGAATACGTTGGTTAGCCCGTTTAGCAAGTGATACGTCCTTACAAAGTCAAAGTTATAAATTATGATTTGGTTCATGCATATCACATGATTTAATATGCCTTGGAATAAGATTTCCATATACATATCATAAGCCCAAATCCGATTAAAAACGAATAAGTTATAAGGCTTTTACTTGGGCTTCGCCAAAACGGACCGACCTCCACTCTTTTGGCCATAACACGATATTTACGAAGCCCATTAATGCAAAACTGGCGGCATTGGAAAGCTGGATTCAATACCTTTCCAACAAGATATTATTTTCAAGAATCCAAGTTGATATGAAGAAGTTATGAGCTGTTAGAGATCGAGTTTTCTGGAATTCCGCAGATCTGCATGCGCTGGAATTTTCTAGCGGTGGCATAGCATGCGTTGGAAAATTCCAGCGCTCTCAATTTCAATGCCTACTTTTCTAGCGCTACTATATGATTCTGACTAAAACTCAAACTCTTCAAATCCTACCGTATGCGCGCTAGAAATTTCCAGTGCTCCCATGTCGAGCGCTACTTTTTTCTGGCGCTCGAACTCTTCAAATATCTATCTTATTTCGACTACCTACACTATAAATACATCCCTTCTACACCCCGTTTTCAATCATCAATTCAGTCTCACTCCTCTGATATTCTGAATTCTCTCTTCCCCATCTGGTATACTAAAATTCTGTTGACGTCCCGCCCCGTTTTCGTAATAGTTCTCCCGTATTTACTCTTGTTTAGAAGAACTTGTTAGGGGGGAAAATACCCTCTTGGTGACATGTCCAAATGTGCCACCATGGAGCACACGTGGTTGCCAACATAGCAGGACGATACATCACTAGTACATAATTGAGTTTATGTAACACGCGTTGATAACACTTTTTGAAATGCAAAAATTCTAGATTTATAAGTAACACCTTGGTAACATTTTTTTTAGAATGTTACACTTAATGTAACACTTTTAACAAAGTAACATTATAAAGTAACACTTTTAAAATAGGTAACGTTTAAAGGTAACACTAAAAGGTGTTACCTTATTTTTAAGAAGAAATTAAATATTTACAATTAAAAAAAGTAAGCACTATCCCAAAAGTCTCAATTTTCCTTATTTGCCGTCAAAGAAAAAAAAATGAATTTGGGTTTAACTTTGTGAAATCTGTGAAACCGCCAAAGACCAAAAGAAAAAAAAAAGGAAAAAGTTAGAAAAAGTCGTATTACAAAACTTCCTTTTCCCAAATAGAGGCAACTATTCATCCTTAGGTTTAATTTATCAGAAAATCGTCGTCTCGATCCCAAGTTCTATCGAATGCGCACTTTCAAATTCAGGTTTCATCGAATTCGCGATTCCAATTTTCTGGTCTTAATCGTCGTCTCCATCGTGGTGTTGATCGGGATTTATCGAATTCACGGGCTTCCAATTGTAGGTATTTTCTGATTTAATTTGTGGTGGGTTTTCTTAATTTTTTTTTTTTGTTATTTTATCTTGATTTTCAAGATTTCTATGTATTGTTGCATTCTCTATTGTAGTGTTTTATTTGTTTTGATTGGATTCTGAACATTAATTATTTTGTGTTTGATGCAATGTTATTTTTTTTTTTTGATTTTTTGATTAGATATTTCGAATGTCTTCACCTTGAATTGGGTATTTCGAATTTCTTCACCTTGGATTGAGTATTCGAGATGGTATAATTTGTGGGTTCTTCTTCAAAATTACATTTCCTGGTATAATTTGAGGATGAGTATAGTTCGTGGGTTCACTTTTCCCGGTTGCTGACTGTGAGTCTGTGTTTTGGTATGTTCTGATTGATGAATGTGAGTCTGTGTGTTTGGTTTTGCAACTGCTATTTCAAGATTTTTAGGTTGATGTATGTATGATGTTCCTTCTCTATGCTTGGGGTTTTTTTTTCTGTTTCTTAAAAGATATATTTCAAAGATGAAGATATTGTCCGATGACAAGTGATCAATGGACTTGAAACATTGGGGATGTTCCAGGAAGAATAGTAGCGTATTTACCAGTAAGTGTATTTTCAGATGTACTTAGTTTTCTAAGATGCAATATGCATACTTTTTCTTACTGACTTATTGGTGGGTTTGAGGCAAAGACAATGGTAAATATCCCTACTAAAGGCACCCTGCACCTGTGTCTTTATCAACCACCACACCCTTATGTTATTCACGGTTGCCAACATAACAAACATTTTCTGAGAGAACTGTGAAGGGAAGCTCAATGTATTTTCTAAGAGAAACACAAACTGCTTGTATTAAATTATGTTAGCAAATGATTCTACTGATCATAAATTACCCTTCAAATTCCCGCTTAAATGGAAGGATCCCAAGTGGAAATTAAGCGATTTTGATTTCAGATGTCTTGAATTTAAAACTTAATTAATTTTGGTATTTCTAGATTAATGTGAAATTATGAACAAGGTATAGAATTTGTAGAGTTTTTAGTGTGTTGAATTGTGATGGAGAAGTTGTTAGGGTTTAAAATTGCGTGTTTGATAATCTTTTTAATTGATGAAAAGGCAGTTTGTTGGGTGGACAACAGATTGGTGGCGTAGTTTATAAGTAAGATAATGATAAACTTGATGAAAATATTGATGATGATTAACATCGATTTTGTTCGAAACTGCACTGTAATTGTGCTTTTAGCAACATTGAATTGGAGCTGCATAAACAAATACGTACGGAATTGAGATGAGGGATGTAAATGTTGCAAATTAGAGGAGTTTAGAGTTTGAATTGCTTTTTCTTAGGCCAAATGAACTGGGTCAGTGTAGAGTGCGCTCATACAGAGGTATTCACTTCATGTAGTTCTGGTGATATGCTATAGATATTGTTGGATGCATTCTTGTTTGGTGTGTTGTATAATTAGTTGGAATCCCTAAAATTTGGACATAAGGATGTGAAAATGCCTCCTAATTACACTTCTAATCAGCTTCACAAATGTGGTCATATTTGATAAACTATAGTGAGTAATAGTTCACGTTTTTATAGTAGTTTTCTATTATGTGATCTCATCCTTAGTTAAATGCACAAAGGACTTTCATCTGCTTCTTACAGACTTTCTTAAAGAGCATCATCTTGTTCTGACTTGGTGTTTTTACCTTACAATTTTAACCAAATGCATAACTTCCTCTTCGCTTTGTTGTTTCTGGGTACTACGCAGGAATGCGGCTTGTGGTTTGTTCACTGGATTGACTCGTGTTAGGAGATTCCAGCAGGTACCTTTTAACTATTCTGCTACTTTATGGTGTTAGGGTGAAGGAATTGAGTTCCCACTAAGTTGGGTGTTTCACAACTGAATGTTATGTTAAAGGCTGTCAAGTTTGCAAGATATAGGTTAGTATGCATATATAATAGAAATGCGTTCTCATTTCTTCGTGGTGGCTGGAAAAGGCATCCTAACACTTGTGAATGTTGCTTGTATTATAATATGCTTTAATTTCTTATCAATTTGTTTCTCGTGCGTTATTTTAGCACTTGTGTAGGATCCTTTGTATGATTATCAGCTCATGAATACATGAGCTGCTTTGAGCTCCGGTTGACTTCTGTTAATTTTCTGACTCAAAAGAACTATGCTGCTAGTTTGTTTATTTCAGTATGTGATTTATGTCAGTCATTGGTAGTCAAAATGACTGAAGATACGTTGTTTCTTATGTGAATGGCTGACTGATTTTGATGTTGACGTAAATAGCAGCTAGAGACCGGAGATAAAAGATATTTTGGTCGAAGGTTCTTTGGAAGATTGGGTAGTTTCAAATTGGGCTGACATATAGGTGTAAGAAACTAAGCATGCTTATGACATTGTCTTCTTACCTAGTTTGATGTTTACATGTTCTATAATAATAGATCGATGATTCATGAAGCAGAACACTGAAGGTTCGCTTTTACTTCTGAATCTGCTGCTCCTAGCTGTCTGAATGGTTATCAAGATGCGAAAATATCCTTTAGAGACAAAACCTTAAGGACAGAAATGGGTAACCAATGAAAGAAGTTTCAAGATGTTAAGGCATATGAATAATCTGTATATTTTCTTGAGTTGTCTTTGTTAATCTAACCTTATTGTTTTTGTTGTTATATATTCACAAATTTGATATAACCATAGACTACAGGTGACTAGACGGGACGATTTGTTGCCTTCTTTTCAGGGTTTATGCTCAACACTTACTCTAAGTTCCTGGACTAGATAAACAAACATGAAATAAACTACCTTTGTGACATTGATGACATTTGATAAATGTTGCTTATTTTAGATTTTGCTTGATATGTTGGTTTTTAATTTGTACCCAAGTATTGGTTGAAATTCATAAGAAGACCTATTGTTTACAGGAGCTTCTCAAATACCCAAGTGTTGGTTGAAAGTCATAAGAAGATCTATTTGTTCATTGTAGAGTTTTTTTACAAAATACTTTTGAAGTTGCAGGGTCTATTTTCTGGTTGTCGCTAATGTCGTGTTTATATTTTATACCATAATCTTCTTTGGTTTTCTCTACTTATTTTTTTTGTTTTATAGAAATATCTTTTATTCGACATGTTTTTTAATTAATTTTTTGTAGGAGTAAGGTCAAGGTGTCAGAGAATAGAAGACTTAACGCAAAAAAGGATATAAGATAATTACTCTTAAGAATTATATTTTTTTTGCTTTTCTTGATTATGGATATTAGATCTTACTAATTTTATACTTTTTATAGGATCAAGATGACGGATCAGATTTGATAGGAAATGAAGATTGAGTTGACATTGAGAATCATGCGCATATAAGGGAAAACAGATGAAGATGGAAACATAGAAGACATTGAGTTTTGGATTTACATTTTATTTTTATATACAACCAGTTGGTTTTATTTTGAACGAATGTAATTTTCATAGACCGTACATCAAATACATTAGAATGTTAGATTTACCATCAAAATGACATTGGCATATTCGTGTAACTAACAATTTCGGATTCCAATTATTATCACTATTCTTCTTTTATGGTTAATAAATTTTTTTCTTATAATA ATGTTACCTATTTCAAAAGTGTTACCAAAATCGTCGTCTCGATCCCAAGTTCTATCGAATGCGCACTTTCAAATTCAGGTTTCATCGAATTCGCGATTCCAATTTTCTGGTCTTAATCGTCGTCTCCATCGTGGTGTTGATCGGGATTTATCGAATTCACGGGCTTCCAATTGTAGGAATGCGGCTTGTGGTTTGTTCACTGGATTGACTCGTGTTAGGAGATTCCAGCAGGATCAAGATGACGGATCAGATTTGATAGGAAATGAAGATTGAGTTGACATTGAGAATCATGCGCATATAAGGGAAAACAGATGAAGATGGAAACATAGAAGACATTGAGTTTTGGATTTACATTTTATTTTTATATACAACCAGTTGGTTTTATTTTGAACGAATGTAATTTTCATAGACCGTACATCAAATACATTAGAATGTTAGATTTACCATCAAAATGACATTGGCATATTCGTGTAACTAACAATTTCGGATTCCAATTATTATCACTATTCTTCTTTTATGGTTAATAAATTTTTTTCTTATAATA ATGTTACCTATTTCAAAAGTGTTACCAAAATCGTCGTCTCGATCCCAAGTTCTATCGAATGCGCACTTTCAAATTCAGGTTTCATCGAATTCGCGATTCCAATTTTCTGGTCTTAATCGTCGTCTCCATCGTGGTGTTGATCGGGATTTATCGAATTCACGGGCTTCCAATTGTAGGAATGCGGCTTGTGGTTTGTTCACTGGATTGACTCGTGTTAGGAGATTCCAGCAGGATCAAGATGACGGATCAGATTTGATAGGAAATGAAGATTGA MLPISKVLPKSSSRSQVLSNAHFQIQVSSNSRFQFSGLNRRLHRGVDRDLSNSRASNCRNAACGLFTGLTRVRRFQQDQDDGSDLIGNED Relationships
The following mRNA feature(s) are a part of this gene:
Homology
BLAST of Spo03285.1 vs. NCBI nr
Match: gi|902212585|gb|KNA17021.1| (hypothetical protein SOVF_083470 isoform A, partial [Spinacia oleracea]) HSP 1 Score: 134.0 bits (336), Expect = 1.300e-28 Identity = 68/68 (100.00%), Postives = 68/68 (100.00%), Query Frame = 1
BLAST of Spo03285.1 vs. NCBI nr
Match: gi|902203089|gb|KNA14469.1| (hypothetical protein SOVF_107270 isoform A [Spinacia oleracea]) HSP 1 Score: 92.4 bits (228), Expect = 4.200e-16 Identity = 48/54 (88.89%), Postives = 49/54 (90.74%), Query Frame = 1
BLAST of Spo03285.1 vs. NCBI nr
Match: gi|902203090|gb|KNA14470.1| (hypothetical protein SOVF_107270 isoform B [Spinacia oleracea]) HSP 1 Score: 85.9 bits (211), Expect = 4.000e-14 Identity = 45/48 (93.75%), Postives = 46/48 (95.83%), Query Frame = 1
BLAST of Spo03285.1 vs. UniProtKB/TrEMBL
Match: A0A0K9RC02_SPIOL (Uncharacterized protein (Fragment) OS=Spinacia oleracea GN=SOVF_083470 PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 134.0 bits (336), Expect = 8.800e-29 Identity = 68/68 (100.00%), Postives = 68/68 (100.00%), Query Frame = 1
BLAST of Spo03285.1 vs. UniProtKB/TrEMBL
Match: A0A0K9R6A0_SPIOL (Uncharacterized protein OS=Spinacia oleracea GN=SOVF_107270 PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 92.4 bits (228), Expect = 3.000e-16 Identity = 48/54 (88.89%), Postives = 49/54 (90.74%), Query Frame = 1
BLAST of Spo03285.1 vs. UniProtKB/TrEMBL
Match: A0A0K9R4N8_SPIOL (Uncharacterized protein OS=Spinacia oleracea GN=SOVF_107270 PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 85.9 bits (211), Expect = 2.800e-14 Identity = 45/48 (93.75%), Postives = 46/48 (95.83%), Query Frame = 1
The following BLAST results are available for this feature:
BLAST of Spo03285.1 vs. NCBI nr
Analysis Date: 2018-06-29 (blastp Spinacia oleracea peptides vs. NCBI nr) Total hits: 3
BLAST of Spo03285.1 vs. UniProtKB/TrEMBL
Analysis Date: 2018-06-29 (blastp Spinacia oleracea peptides vs. UniprotKB/TrEMBL) Total hits: 3
BLAST of Spo03285.1 vs. ExPASy Swiss-Prot
Analysis Date: 2018-06-29 (blastp Spinacia oleracea peptides vs. ExPASy SwissProt) Total hits: 0
BLAST of Spo03285.1 vs. TAIR (Arabidopsis)
Analysis Date: 2018-06-29 (blastp Spinacia oleracea peptides vs. TAIR) Total hits: 0
GO Annotation
GO Assignments
This gene is annotated with the following GO terms.
RNA-Seq Expression
Co-expression
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