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Overview
Sequences
The following sequences are available for this feature:
Legend: exonfive_prime_UTRpolypeptideCDS Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.CGTAATAGTTGTGAAGGAAAAATAAAAATAATTATAAAAACAAATTGGTCGTCGTTATTTCCTATTTCTGCAGGGCCATAGGTTTGAATTTACAAAGGCCACCTTCTTAAAATTTCAACCTAAAACCCAAATTTGCGATTCATACTCTCTTTCTCCCTCTCTGTCTCTCTCTCTCCTACTTCCGCGATCCCCTTTCGAAATGGGTTGTAGCAATCAATTTAGCATTTTGGTTAAATTTTTTGGTATGGTCAAACTCTGATATGGCTGTCAAATTCTTGAATTGCAGTAACCTAATTCTGGTAAATTCCTTAATTTTCTCGATTTATATAACTAATTTCAAACGTTATTGTGAATTGAACTATAGTATCTTTTGTTGTTGTTGTTGCGGCCTGAATTGTTTAATTTATTGTTATTCAAGGGGAAATCTTCTAATCGCAGGTCAATCTCCAAATTCTAGTTTGTAAACCCTCAAATTTATAATTTCCTCGTGATATTTTCATATGGGTTTGTGGTATTTCACTCCTTTGAATGGTCTTAATAAAATGGGTATCTCAATTTCACCAAAACCTCGATAAATAGAAGATTTTCTCAAACGGGTAATTGAATTTCTATGTTTTATTTTGTTAATTTTTTTGGCATGCTTGCTATGTTTATGGATTATTGATTTCTCCGTTAATTTTTTCCTCGTTTTTGGACTGATGAATAAAACATAGCTCCTAATCAATTCGAAATCTGAAGCCTTCAAGATTGAAGTTATGATTCCTTGTAGGAACGACAATATGAAGTATTTGAAGGTCATAATCCTAAATGGGATTAGTTCGTTAACTAAGAAGATCAAAGATAGCATTTTGTGTTGAATAAGGTAAATTCGGATTTTTATCATCGCAAATTTAACTTTTCTACTTATCTGAGTTGTAATTTGAAGAGAATAGGTCCTGAAAGGGAAATGAATAAGGTACCTAAGAAGGCAGAAGATAGAATTTTGTTAAGGTAAATTCAAGTCTTTATCATCGGAAATTTACTTTTTTTACTTTTATGAGTTGTAATTTAAAGCTAATAGGTTCTGAAAGGGAAATAAAGGGCAACATTAATTCAGGTAATACTTTTATCTACGTGTTTATATAATTGAAGTCGTGCCCTCTCTTTTCCTCAAGAAGAAATATTTAGCATAGTTTCTACAATTCCTTTTGGCAATATCGAATCTGGCTTAAAGAAAGGAAATAGATTCACTGTTGTAAAAGATGGTAGGTCAAGATTCCATCTAAGTATTGCCTCGGAACTTATCATGTATATGCTTCTTCTGCAATCTGCATACCAACAATAGTTTTCAAACAAAGAATTGACCATTTATTTTAATTTATGTAAGGTGTGATGCTCACGCATTTGTCTACCCCTGAACAAGTCACTAAAAGAAGTATTTATCACCTTAATGCCAAGTTAGCATATGGATGGTTTAGTTAAGACGATATGCTCACGACTCATTGACTTGTATGATTATGGTGTTAGAGAATTGCTATTGCAACCCTTTCCGATCAATTTTTGAATCTAAATATATAGAAATGTTGTTCTTATTTTAAGCATGCTGTTTTTCCCTAGGCAAGTTGTTTGATAAAATATACACTTCTCTGAGTTGTTATTTGAAAAATATTGATAGAATTTGGAACAAAATTCCCCTTCAGGACCTATTTCTAAGGCTAGTTATGGAACAAAATTGTTCCTTTAGTTTGTAGTTCACTCTTAGAATTAGAATCTTCTCATACTACCCAACACAAACTGTGTGTAGGGAATTATAGATTGTGTCTTTTGTATAGTATCGCTTTGACTAGAATTGCAGTTACTAGAATATTATTACCATCTTTTGATTGAAAGTTGACTCTTTGCCTCTCTTGTTGTTGCTTTGTAGATACTAGGTGTGGATAATGTACACTCAATATACGTTAATGCATTACCAAATGGTGAAAAAGGTGATTAAAAGTTTTTTTGTGGTTTTTAAGATATTGTGGATAGAAAAGTATTTGACTATTGGTGTTTTGTTGTTTTATGGAAGGGAGAAAATAAGGGGAATATCCAACTTTGGTTGATGTATTCTGCGCGACTCTCAAGGAGGGCACTAGCCTCCCTAATGCAGAAACGACACAAAATAAGTATGTCCTTTCTCACCTATATCAGCTTTTGCTGAAATAACTATGGATTTTCAGTTATATAAACTGATAAACTTACAAGTAGTTGTAGCCAATATGCAATGTTGTCAAGATATCAGTTCTTAGTTGGTGCGATAAGGTGATATTCCCCTTCTGTAAATGTAAGTTTTTGTGATTTTGGACTCTAGAAACTCATGACAGATCTAAATCATGTTTTTTACATACAAGTTCTCATTGTGAGATGATTTCAGTTACTGAAGTGCAAATGCTGTCAGTTTTTCAGCTAATATGTATAGCCATTTTTTGTGCCTGTGTAGTGTTGCGCCCGTGGTGAGAATGCCTAAGATCATCAATATTCAATACTGGCTTATATATTAATTAAGAATACTTCCATGGTTTTCAAGACTCATTTTGCAATTCCTAAGGTTAAGTAGTCATTACTTTGGCTTATTAAATTAGTGTGTCTGTTTGTAAATTAGTGTGGTTTTTTATACATTAAGAATACTTCCATGGTCTTCAAGACTCATTTTGCAATTACTAAGGTTAAGTTGTCATTATTGTGGCTATTAAATCATGATGATGCTGCTATTAAATTAGTGTGGTTGTTTGTAAATTTTTAAACTGATGCTGCTGCCGTTTACTTTCTTATTTTTTATAGGTAGCACAAAAATACGTATGTCCTTTCTCACCTATGTTAGCTTATGGTGAAATAAACTACGACTTTCAATTCAATAAACTGGAATATAACAAATTATCCTCCACCATTTTTCCCATAATTCCTTTAGAGACTCTGATACTATGAGAATATATTAGTGGCTGTTATGGTGAAATTACTGAATTTAATAACCAAATGTTGCATGCTAAAATGCAAGCTTACCTAGCATTAAGCGGTATCAGAGTTTGGTTTCCACTTTCCTACAGTTAGCTTCTCCAAACAAATACCTACATGTTTGGAATAAACTTCATGGACTTCCTTGAATGGTAAAGTGGGTAAAGAATAATGAAGAGAGGACCGACCCCATGTAGTGTTCGTACGTGAATGTTTTCAGAGCATTCTGGTAAGATGGGTGCTTGTTTATCTTGACATAATTTAAATTATTATGTCTATTTATTATAATAAATGAGTGAGTAGTAGTGATCTTGATTGTCGAAAGGTGGGGTTTTCTCAATTCTGCCTAAGTTTTTAGATTTGTTTGTGACCTAAAAAGCCAAACACAAATTGCAGCTCTTGATGCCTGAATCTTTATTCACTTAAATAACTTGCAACAGAAAATTAGTTTTCAGCAGCTCTTGATGTCTAGATTCTGATTACTAGGAGTTTATTCGAGTGAGATGGGTTTAGATTATGTTCTCAAATTAGTTTTCAGAATTTAACCTCTTGATGTCTGAATCCTGATTACTAGGAGTACATCGGACTCAATCCACTAAAAGCTCTTAAATATTTGTCTTTTTGACTCGACAGTCATTTCTTTAAGTTTAACAACATAATACCTAACAAGAACTTGGGAAAATCTCTAGGAATCCCCAACTTCCCTTCAACCCTAATCAATGCATCCTGAGTAAATTCAGTTTTTAGAATAAACTTCATGGACTTTTAGAATATTAGTTTTCAGAATAAACATGCAGCAGAAAATACCTACATGTTTGGAGTAAACTTCACGGACTTCCTTGAATGGTGAAGTGGGTATAGAATAATGACGAGTGGACCGGATTATGTTCCGCGGAAAGGGAAATGGGTTCAGGTTCTGTTCTTACAGATTGCCAAAACAGAATATGTGTCAAAACAGAATATTGTTGCATCTTGAAAGTTAACTAGGAAATTAGAACTTTAACAATTGGCCTTAATTAGAGCCACCCGTGTATGATACTAATTGTGATGGTTATATATGTTGCAGGAGGAAATTCAAATGGAAGAAGAACCAACACTTTCCCATATACATACACAGGAGGAAATTCTTCATTTATATCTTTTTTTTTAATTTTATTTTCACTTTCCCATGCCATGATATTTAACTTTTTTGCCTCTTTATACAGGTAGCACAAAAGTTGTTAAAGTTGAAGTCTCGTGATCGGGTTTTTGGTTTTGGAGGAGGAATTACACTTGAAGAAATGTCAGGACCACAACCTAGTAGGGTGGAACTTCAATCTAAGAAACTCACGTTCTTACCAATCGCGTGGATGCGGTACAAGAAGAAAACATTGCACTCCAAGATTAGCTTAATGAGATTAAAGCATTTAAAGAAGTGTTCTTACAACGCTTTTCAAGAGATGGCACTCCAAGAGAAAACTTCAACTAGTCAGGCGTTTATTGTTCTTTTAGATTGAACAAAAATTAATTATCCTTTAGCTCTTTTAGAATTTAAAGACAAGGGGATGTGAGTTTTGATTTCACATAACTTGAAATTCTATTGTAAAAAATCTTTTGAGTAATGAAATTTTCATTTGTTTTAATTGATTGATTTATAGTTATCTATATTGTTTCACATGGAACAATAGGTGCTTCGAACAACGCAAATAATGTTATTATGATTGCAATATTAATACAAGGGATTTTCTAGTCGTTATCCTTAATTGTTCATCATGAATAAGTATTTAACGACAGATTACCGTTTCATCGTTAGCAACTAACGAGGAATTATGGTTTCGTCGTTAACTTTTAACGATGAAATTGTAACTTCGTCGCCAATAATTAACGACGAATTATGATTTTGTCGCTAATTGTTAACGACAAACCATAATCCGTCGTTAATGCTTAACGACGAAATCATAATTCGTCGTTAATAAACGTTAATTATTAACGAGGAACATCGAACCTGTTACAACGAACATCACGACCGTCGTTAAAAGTTTTAACGACGAAAATTGAGGCTTTTAACGACAAAATTGTTCGTCGTTAAATGTCCTTTTTCTAGTAGTAATTATATGTGTCTAATTTTCATTTTTAGACACGTAAGCTTTACCATTATGCCCCTTAACTTACCAACAATTACATCATATACCCATTTGTCCTAAATATTTGTGCCGAAAATATAATAAAATAATGAAAAAAAAGAATTATATGTTTTTTAAATGGAAAGTCAGACGTTGGGAGTTTGGGATTTATGGGGAACCATGATTGTCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNTTTTTCCCCCCCCCCCCCCCCATTCTCATCCGTATCTCTCTATCTCCTTCATTCTTTCACCTTCCTTCTCCCATTTCTTCCCCTGTTTCTCTCTTTTCTCTCCGTTTCTCCCTTTAAATTCTGTAAAATCTCTCCAAATTCTTGGTTTCTAAGATTAAACCCTAGAAAAACATAAAATCCCCTTTTAATTTGTGTTTTACTCGCTTAGATCTTTCTAATATCTCTTTGTATGTTCGTTTTTTGGGTTTAAACTTTTCGTTTTCTTGAGTTTTGTTGTGGTTCTAGGTTTTCTGGGTTTTATGGGTTGAAGATCCTGGCTTTCTGGGTTATCTTGGTTATCTGGGTTTTCTGGGTTATCTTGGTTTTCTAGGTTGATCTTGGTTTTCTAGGTTGATCTTGGTTTTTTGGGTTGAAGATATTTCTTTTCTGGGCTTTCTGAGTGTTTTGGGTGGAAGATCTTGGGTTCCTGGGTTGAAGATCTTGGTTTCTGGGTTGATGGGTTCAAAGAAAATCGAAAGTTTTCATGGGTTTTCCTCTTCCGATGATAACGTCGCAAAGAAGGAGACGTTCGAGTACGAGTTCACTGACGAGCATTGTGATCTTGGCGAGTATTGTGAAGGCGAGCACAGCTACAACCGTGAATGTCTTCGGTATTTACGCCGGAGAAATGACTCTTTCTGTGCTTCTCCTTCTACCAGATCTGAAAAAACGGTGGAAGAAAAACCACCACCGCCTCCTCTATCCCCAGGTAGAGGGTCGAAAACCCTAATTCCTAATGCTGAGGTTGATCAACCACCAACAAAGTCCCGTGGTGGTGGTTTTGAAGGCGTTCATGTGGGGGATCTGAAAGTCTAG CGTAATAGTTGTGAAGGAAAAATAAAAATAATTATAAAAACAAATTGGTCGTCGTTATTTCCTATTTCTGCAGGGCCATAGGTTTGAATTTACAAAGGCCACCTTCTTAAAATTTCAACCTAAAACCCAAATTTGCGATTCATACTCTCTTTCTCCCTCTCTGTCTCTCTCTCTCCTACTTCCGCGATCCCCTTTCGAAATGGGTTGTAGCAATCAATTTAGCATTTTGGTTAAATTTTTTGGTATGGTCAAACTCTGATATGGCTGTCAAATTCTTGAATTGCAGTAACCTAATTCTGGAACGACAATATGAAGTATTTGAAGGTCATAATCCTAAATGGGATTAGTTCGTTAACTAAGAAGATCAAAGATAGCATTTTGTGTTGAATAAGATACTAGGTGTGGATAATGTACACTCAATATACGTTAATGCATTACCAAATGGTGAAAAAGGGAGAAAATAAGGGGAATATCCAACTTTGGTTGATGTATTCTGCGCGACTCTCAAGGAGGGCACTAGCCTCCCTAATGCAGAAACGACACAAAATAAAAACTCATGACAGATCTAAATCATGTTTTTTACATACAAGTTCTCATTGTGAGATGATTTCAGTTACTGAAGTGCAAATGCTGTCAGTTTTTCAGCTAATATGTATAGCCATTTTTTGTGCCTGTGTAGTGTTGCGCCCGTGGTTGATCTTGGTTTTTTGGGTTGAAGATATTTCTTTTCTGGGCTTTCTGAGTGTTTTGGGTGGAAGATCTTGGGTTCCTGGGTTGAAGATCTTGGTTTCTGGGTTGATGGGTTCAAAGAAAATCGAAAGTTTTCATGGGTTTTCCTCTTCCGATGATAACGTCGCAAAGAAGGAGACGTTCGAGTACGAGTTCACTGACGAGCATTGTGATCTTGGCGAGTATTGTGAAGGCGAGCACAGCTACAACCGTGAATGTCTTCGGTATTTACGCCGGAGAAATGACTCTTTCTGTGCTTCTCCTTCTACCAGATCTGAAAAAACGGTGGAAGAAAAACCACCACCGCCTCCTCTATCCCCAGGTAGAGGGTCGAAAACCCTAATTCCTAATGCTGAGGTTGATCAACCACCAACAAAGTCCCGTGGTGGTGGTTTTGAAGGCGTTCATGTGGGGGATCTGAAAGTCTAG ATGTACACTCAATATACGTTAATGCATTACCAAATGGTGAAAAAGGGAGAAAATAAGGGGAATATCCAACTTTGGTTGATGTATTCTGCGCGACTCTCAAGGAGGGCACTAGCCTCCCTAATGCAGAAACGACACAAAATAAAAACTCATGACAGATCTAAATCATGTTTTTTACATACAAGTTCTCATTGTGAGATGATTTCAGTTACTGAAGTGCAAATGCTGTCAGTTTTTCAGCTAATATGTATAGCCATTTTTTGTGCCTGTGTAGTGTTGCGCCCGTGGTTGATCTTGGTTTTTTGGGTTGAAGATATTTCTTTTCTGGGCTTTCTGAGTGTTTTGGGTGGAAGATCTTGGGTTCCTGGGTTGAAGATCTTGGTTTCTGGGTTGATGGGTTCAAAGAAAATCGAAAGTTTTCATGGGTTTTCCTCTTCCGATGATAACGTCGCAAAGAAGGAGACGTTCGAGTACGAGTTCACTGACGAGCATTGTGATCTTGGCGAGTATTGTGAAGGCGAGCACAGCTACAACCGTGAATGTCTTCGGTATTTACGCCGGAGAAATGACTCTTTCTGTGCTTCTCCTTCTACCAGATCTGAAAAAACGGTGGAAGAAAAACCACCACCGCCTCCTCTATCCCCAGGTAGAGGGTCGAAAACCCTAATTCCTAATGCTGAGGTTGATCAACCACCAACAAAGTCCCGTGGTGGTGGTTTTGAAGGCGTTCATGTGGGGGATCTGAAAGTCTAG MYTQYTLMHYQMVKKGENKGNIQLWLMYSARLSRRALASLMQKRHKIKTHDRSKSCFLHTSSHCEMISVTEVQMLSVFQLICIAIFCACVVLRPWLILVFWVEDISFLGFLSVLGGRSWVPGLKILVSGLMGSKKIESFHGFSSSDDNVAKKETFEYEFTDEHCDLGEYCEGEHSYNRECLRYLRRRNDSFCASPSTRSEKTVEEKPPPPPLSPGRGSKTLIPNAEVDQPPTKSRGGGFEGVHVGDLKV Relationships
The following mRNA feature(s) are a part of this gene:
Homology
BLAST of Spo03442.1 vs. NCBI nr
Match: gi|902235897|gb|KNA24131.1| (hypothetical protein SOVF_018730 [Spinacia oleracea]) HSP 1 Score: 297.7 bits (761), Expect = 1.800e-77 Identity = 145/146 (99.32%), Postives = 146/146 (100.00%), Query Frame = 1
BLAST of Spo03442.1 vs. NCBI nr
Match: gi|902231311|gb|KNA22222.1| (hypothetical protein SOVF_036240 [Spinacia oleracea]) HSP 1 Score: 105.5 bits (262), Expect = 1.300e-19 Identity = 58/76 (76.32%), Postives = 60/76 (78.95%), Query Frame = 1
BLAST of Spo03442.1 vs. UniProtKB/TrEMBL
Match: A0A0K9RXB4_SPIOL (Uncharacterized protein OS=Spinacia oleracea GN=SOVF_018730 PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 297.7 bits (761), Expect = 1.300e-77 Identity = 145/146 (99.32%), Postives = 146/146 (100.00%), Query Frame = 1
BLAST of Spo03442.1 vs. UniProtKB/TrEMBL
Match: A0A0K9RTT7_SPIOL (Uncharacterized protein OS=Spinacia oleracea GN=SOVF_036240 PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 105.5 bits (262), Expect = 9.300e-20 Identity = 58/76 (76.32%), Postives = 60/76 (78.95%), Query Frame = 1
The following BLAST results are available for this feature:
BLAST of Spo03442.1 vs. NCBI nr
Analysis Date: 2018-06-29 (blastp Spinacia oleracea peptides vs. NCBI nr) Total hits: 2
BLAST of Spo03442.1 vs. UniProtKB/TrEMBL
Analysis Date: 2018-06-29 (blastp Spinacia oleracea peptides vs. UniprotKB/TrEMBL) Total hits: 2
BLAST of Spo03442.1 vs. ExPASy Swiss-Prot
Analysis Date: 2018-06-29 (blastp Spinacia oleracea peptides vs. ExPASy SwissProt) Total hits: 0
BLAST of Spo03442.1 vs. TAIR (Arabidopsis)
Analysis Date: 2018-06-29 (blastp Spinacia oleracea peptides vs. TAIR) Total hits: 0
GO Annotation
GO Assignments
This gene is annotated with the following GO terms.
RNA-Seq Expression
Co-expression
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