Spo04471 (gene)

Overview
NameSpo04471
Typegene
OrganismSpinacia oleracea (Spinach)
DescriptionUnknown protein
Locationchr3 : 3212294 .. 3215461 (-)
Sequences
The following sequences are available for this feature:

Gene sequence (with intron)

Legend: polypeptideCDSexonthree_prime_UTR
Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.
ATGTGGCCATTGTCGTTAGGATGGCTAGGCTCAAGAATAAGCAAGGCCGTTTGTATGATATTTATCAAACTTGGTTTTTCTTTGCTATTGTACACCAAATATGCTACCTTTGTATTTTCTTTTTTCTGTATTAATGAAGTATATTTTACGGGGATGCAGCACTCCGATATAAATAGCTGCGAAATTCTCTTCTTTTAAAACCTAATTAAATTGTACTTCCTCTGTTCTCTGTTACGCTGTGGTGGTTCCAGTTGCTTATGAGCTATTTCTAACTGGCAGGGACCATAAGCGATTGAAGTGGAATCTTCTTTGTCAGAGGTTAGACAACTACGAATATAGAGGTTAGATAGCAACATGCCGTTGGATCCCTTTTGTTCACTCCGCTCTGGCGCTCTTGCATGCTACTGCTGCCAGGTGCCAACTACGTCAGTCTTTAGTGTAATTTTTTGTCAATTATAATTTGATTACTTCCATCTCTGTTCAATTGATTGAATCATCTTATCATCATATCTTATAGTACCAAGTATTCATGATACACCTTATGGTATAATCCTTCTCTGGTTGGTGATATCAAAGAGTTTTCCCTCCGGAATCTGGTTTGAAAATATTTTATGTCAGAGTGCTTTCACACAGTTGATGGGTTTATTACTGAATCTACTCAAAGAAAATGAATATCAGGGTGTTTGTGCTTCTGCATTCACTTCTTTGCAGCGACATTTTCAGTTTTGGTAAGGCCTTGTACTCTTTTATGATCTTTTTTTATGTGCAAAATTTATAGGTTAGTTTCCCGAGTAAGTTGTGGGATAACTTTTGTACAGGTGAGGTTGCCTTTGCTCAAGGATTTCTGGCTGTGGTTTCTTAATTTACTTTGCAGCTTAAACATTATAAAACAAGTGTAACTTAAAGAGGCCAACTACTGTCATTTATCAGTATCTTTGAGCTTCAGCTGCTATAATATTTTGTTTAGTACTTGGTTTTCCTTTCTACAGACATCATGTTAATTAGAATTTCTGGTTTTCCTTCGTTTCCACTAGTGAAAATAGTGGATGTCACGATTAAAAACATGAAGTTAAATTTTGGATATCAGGCCGAACTTTGTTAAAGTATTCAGTCTTAGCTTTCAGGATATAATTTTGGTGTAAGTTGATTTATAGGTTTCTTTCTACTAACATAAATCTCAAATTTTTCAGGACAAAAGGTGTTTCCTCACTACCAGAATGTATGCTGCATGGATGAACTCTTCAATCTGCAATATTGACCTCATTGTACAAAGGTATGCTACTTGCAGTTTTTCAAGTAGGTTGTGCCTTGGATGTCTTTCTTACAGAGATTATCGGTACATTTGGTACGAGTCTGCAACACCATTCTTGCTCTCACGCAATGACACTATCCTCGTGACAGTTCAGTGAATTTATCTTAACTTAACTGAACCGGTGAAAGTAAAAGTTAATTGAACTTAACTTTTTTTTTTCTGAAATAATAAGTAAAAGTAAATCAAGCAGAACATATCCTGATATCCTTACTTTTGCTGGAAAAAGAAAAAGAATATATTTGTGTATTAAATTGTTTTAAAAAACTTATTTTTGCTGTAAATAATTGAAACAAATATATCTTTAGAGAACGGTAAAAATATGGAAAAAATATTCATTTTAAATAACAACACCCAAAAAATAAGTATTAAGTCTAAGTTTAGATAAGTTACAAAACAATCACGTTTTAATCAAGTCTATAAATTAATTTAGTAAAGTAACAATCAATTAAGTCCGATCGGTTCAATAACTTTCAAATTTTCAATCAGGGCTAATAAAAGACAAGACCAAGAATCTACATATACACACACGAACAAAAAACACAAAATATGTGTCAATTCTACATGTATTTGGGCATCAATTCTTGAACAAGTTGTAAACCATAATATGTGCCAAAAAAAATCACAAAGCGGTTAAAGGATAGAATCAAATTAAAAAAACCCAGATTGAAAGAATTTATACCAAAATAAAAAGCAAAAACTTTGAATATAAAATAAAATAAAATACACATCAACATAAACTTTAATTTTGCCAGTGCATATACCTCTTTTTCCCCACATTCGATCAAATCAAACCACAAATAAATGGAAGTTGAAACAATACAGAATAATAATAATAAATAATAATAATAATAATAATAATAATAATAATGATAATATTAGTAGTAGTAGTAGTATTCCAATTGAGTTGAAACCAAGTTGGAGAAGTCGTACTATGTCTTCCTTAAACTCTCCTCCTTTGCCATTAATTTCTTTGTTTGGTATCGTTGTATTTTACCTTTACTTGTCTACTTATTTCCCTTACAAAGAATCCCTTCATCGTGCTTTCTTTAGTTTGAAGCTAATCTTTTTTGTTCTTCCTGCTTTGATCTTCTTCGTCATGCGTACCAATTATAACCCGAACGACCCGTCTTCTTCGGCCCGGGGTTGGTATTGGGTTCGGATTCCTAAGCCCGAGCACGACTCGTTCCACCGTGTTGGGGGTTCTCCTTGGGGTGTTGCTTTGGTGTTGGTTTTGCTTCTACTCATGATCTCTTATCATTCTACTGTTGGTTCTCACTGGTTCCGACCCCTTTGGTATTCTCACTACTACTAGACAGACCTGATCAACTAGCCCGGCCCGTTGGTCCGACCCGGCCCGAAAATGCGCTGGTTTCATATTTTAGATCAAAATCCATGCTCGGATCGAAGCCTGATTCAGCCCGCAAAACCCGCACAAAATTTATGGGTTTGGACATGAATTTTTGTGTTGAAGCCCGACCCGGCCCGAATTTTGATCACATCTACCACTAGTGGATTCTAGTATGGTGATACCACAACAATAACATTGCTGATGTGGCGTTGAGTTACTTCTCTAGGCGTTCTCTATACTTATTATAGAATATCGCATAATTTTCGGTTCGTACGGTGCTCTTTGTTTTGTTCTTTGTATAACACTTGTTAGTTGTTAGAACTTAATGTTGTGCAGTAGGAAAATTAGAAGTGTCAATTTAATTATGTTAAAGAAATTATATTTGTTATTTTTGTGGTTGGGAAATTATTTATTTATTTGTGTATTGATTGGTTTCAGGGTTGATCAACCCTTTTTTATTCTCAAATTTAAATGAAAAGGTATTAATTGAAAATGAATTCATCCAAAA

mRNA sequence

ATGTGGCCATTGTCGTTAGGATGGCTAGGCTCAAGAATAAGCAAGGCCGTTTTTGCTTATGAGCTATTTCTAACTGGCAGGGACCATAAGCGATTGAAGTGGAATCTTCTTTGTCAGAGGTTAGACAACTACGAATATAGAGCGACATTTTCAGTTTTGGACAAAAGGTGTTTCCTCACTACCAGAATGTATGCTGCATGGATGAACTCTTCAATCTGCAATATTGACCTCATTGTACAAAGGTATGCTACTTGCAGTTTTTCAAGTAGGTTGTGCCTTGGATGTCTTTCTTACAGAGATTATCGGTACATTTGGTACGAGTCTGCAACACCATTCTTGCTCTCACGCAATGACACTATCCTCGTGACAGTTCAGTGAATTTATCTTAACTTAACTGAACCGGTGAAAGTAAAAGTTAATTGAACTTAACTTTTTTTTTTCTGAAATAATAAGTAAAAGTAAATCAAGCAGAACATATCCTGATATCCTTACTTTTGCTGGAAAAAGAAAAAGAATATATTTGTGTATTAAATTGTTTTAAAAAACTTATTTTTGCTGTAAATAATTGAAACAAATATATCTTTAGAGAACGGTAAAAATATGGAAAAAATATTCATTTTAAATAACAACACCCAAAAAATAAGTATTAAGTCTAAGTTTAGATAAGTTACAAAACAATCACGTTTTAATCAAGTCTATAAATTAATTTAGTAAAGTAACAATCAATTAAGTCCGATCGGTTCAATAACTTTCAAATTTTCAATCAGGGCTAATAAAAGACAAGACCAAGAATCTACATATACACACACGAACAAAAAACACAAAATATGTGTCAATTCTACATGTATTTGGGCATCAATTCTTGAACAAGTTGTAAACCATAATATGTGCCAAAAAAAATCACAAAGCGGTTAAAGGATAGAATCAAATTAAAAAAACCCAGATTGAAAGAATTTATACCAAAATAAAAAGCAAAAACTTTGAATATAAAATAAAATAAAATACACATCAACATAAACTTTAATTTTGCCAGTGCATATACCTCTTTTTCCCCACATTCGATCAAATCAAACCACAAATAAATGGAAGTTGAAACAATACAGAATAATAATAATAAATAATAATAATAATAATAATAATAATAATAATGATAATATTAGTAGTAGTAGTAGTATTCCAATTGAGTTGAAACCAAGTTGGAGAAGTCGTACTATGTCTTCCTTAAACTCTCCTCCTTTGCCATTAATTTCTTTGTTTGGTATCGTTGTATTTTACCTTTACTTGTCTACTTATTTCCCTTACAAAGAATCCCTTCATCGTGCTTTCTTTAGTTTGAAGCTAATCTTTTTTGTTCTTCCTGCTTTGATCTTCTTCGTCATGCGTACCAATTATAACCCGAACGACCCGTCTTCTTCGGCCCGGGGTTGGTATTGGGTTCGGATTCCTAAGCCCGAGCACGACTCGTTCCACCGTGTTGGGGGTTCTCCTTGGGGTGTTGCTTTGGTGTTGGTTTTGCTTCTACTCATGATCTCTTATCATTCTACTGTTGGTTCTCACTGGTTCCGACCCCTTTGGTATTCTCACTACTACTAGACAGACCTGATCAACTAGCCCGGCCCGTTGGTCCGACCCGGCCCGAAAATGCGCTGGTTTCATATTTTAGATCAAAATCCATGCTCGGATCGAAGCCTGATTCAGCCCGCAAAACCCGCACAAAATTTATGGGTTTGGACATGAATTTTTGTGTTGAAGCCCGACCCGGCCCGAATTTTGATCACATCTACCACTAGTGGATTCTAGTATGGTGATACCACAACAATAACATTGCTGATGTGGCGTTGAGTTACTTCTCTAGGCGTTCTCTATACTTATTATAGAATATCGCATAATTTTCGGTTCGTACGGTGCTCTTTGTTTTGTTCTTTGTATAACACTTGTTAGTTGTTAGAACTTAATGTTGTGCAGTAGGAAAATTAGAAGTGTCAATTTAATTATGTTAAAGAAATTATATTTGTTATTTTTGTGGTTGGGAAATTATTTATTTATTTGTGTATTGATTGGTTTCAGGGTTGATCAACCCTTTTTTATTCTCAAATTTAAATGAAAAGGTATTAATTGAAAATGAATTCATCCAAAA

Coding sequence (CDS)

ATGTGGCCATTGTCGTTAGGATGGCTAGGCTCAAGAATAAGCAAGGCCGTTTTTGCTTATGAGCTATTTCTAACTGGCAGGGACCATAAGCGATTGAAGTGGAATCTTCTTTGTCAGAGGTTAGACAACTACGAATATAGAGCGACATTTTCAGTTTTGGACAAAAGGTGTTTCCTCACTACCAGAATGTATGCTGCATGGATGAACTCTTCAATCTGCAATATTGACCTCATTGTACAAAGGTATGCTACTTGCAGTTTTTCAAGTAGGTTGTGCCTTGGATGTCTTTCTTACAGAGATTATCGGTACATTTGGTACGAGTCTGCAACACCATTCTTGCTCTCACGCAATGACACTATCCTCGTGACAGTTCAGTGA

Protein sequence

MWPLSLGWLGSRISKAVFAYELFLTGRDHKRLKWNLLCQRLDNYEYRATFSVLDKRCFLTTRMYAAWMNSSICNIDLIVQRYATCSFSSRLCLGCLSYRDYRYIWYESATPFLLSRNDTILVTVQ
Relationships

The following mRNA feature(s) are a part of this gene:

Feature NameUnique NameType
Spo04471.1Spo04471.1mRNA


Homology
The following BLAST results are available for this feature:
BLAST of Spo04471.1 vs. NCBI nr
Analysis Date: 2018-06-29 (blastp Spinacia oleracea peptides vs. NCBI nr)
Total hits: 0
Match NameE-valueIdentityDescription
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BLAST of Spo04471.1 vs. UniProtKB/TrEMBL
Analysis Date: 2018-06-29 (blastp Spinacia oleracea peptides vs. UniprotKB/TrEMBL)
Total hits: 0
Match NameE-valueIdentityDescription
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BLAST of Spo04471.1 vs. ExPASy Swiss-Prot
Analysis Date: 2018-06-29 (blastp Spinacia oleracea peptides vs. ExPASy SwissProt)
Total hits: 0
Match NameE-valueIdentityDescription
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BLAST of Spo04471.1 vs. TAIR (Arabidopsis)
Analysis Date: 2018-06-29 (blastp Spinacia oleracea peptides vs. TAIR)
Total hits: 0
Match NameE-valueIdentityDescription
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GO Annotation
GO Assignments
This gene is annotated with the following GO terms.
Category Term Accession Term Name
molecular_function GO:0005515 protein binding
RNA-Seq Expression
   



Co-expression
Gener valueExpression
Spo172260.67Barchart | Table
Spo264860.67Barchart | Table
Spo267030.67Barchart | Table
Spo025560.66Barchart | Table
Spo257960.65Barchart | Table