Spo04867 (gene)

Overview
NameSpo04867
Typegene
OrganismSpinacia oleracea (Spinach)
DescriptionUnknown protein
LocationSpoScf_02568 : 31935 .. 41111 (+)
Sequences
The following sequences are available for this feature:

Gene sequence (with intron)

Legend: exonfive_prime_UTRpolypeptideCDS
Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.
TTGGCCCAAATCCAAACCCAAAGAAAATAAGTCCATTTTGTTGTCATTTGAAATCCTCTCCCAAATGTAGTCATTTGAAATCCAAACCTGACTCCTCTCCCCCTTTCTCTCTCATCTGCTCCCCTATCTCTCGCCGCCATCGAAGAAATTCTTCCAACCTCAGATCTTGATTGGCTCTTTCATCTCAACCTCCATCAATCATCCCTCTTCTTCACCTTTGATCTATCTCTTCTTCACGGCTCCATTTACCTCTCCTGCCTAGCTTAAAATATCTCCCCTCCTCCATTGCCGCCGCCACCAACAGATGTGTAACCACCCATCATCAACACCGAAATTCTGAAATCCGCAGATTGCAGCCATGGAAACTTTCATTCGACCCGAAAATTTGAAAACCTGAACATGCAGCCATAAGATTTTATTGAAGGATATGAATTTCTTCATTAAAGGTGGTCTTGGTCAGGTTACCTTCACGGTGATATCAAATTTGGACTTTTTTTGTTAATTGAAATAAGTGTTTGGTGGATTTAATTTTAGGGTTTCATTTTTCATCTTTTTGGGTGAATAATGTCTACAAGACCCACTTTTCAGTGTGTGTTTTTAAGGGGTGATTCTTTAGTTAGGTATTGATTCCCTTCAAATTTGATCAGATATTAATGTTATTATTTAGTTACTCAGTATTCATTAATCAAATAATTTGATCCACTTCTGAAAATTTTAACCCGATTAAAATTTATAGTAACTTCTAAACATTGTGTAGAATTTGAAATTCCAAAACTGAAATTCTCATGTTTCCAAACACAATTTTTGGAATTGAATTCTAAGATTTCAAATTCAGAATTTGAATTCAACCATTTGAAATGAATTGCCGGTATCCAAACGCAACCTTATAAACTTTAACATGTTGCGCTGTTGGGGTGGAGGATTGGCTGAGAGACCCGAATTTTATCATTATAGTGTAGTGTATGGTCTGTTGGTAAGTTATATTTCTTAGTCTTTCAACCTTGGTTGTTTCTTTCTGAATGTTTGATCCGTGAAATGAATGATCTTGATTATATGCATTCCACTTTCTTAATCTTTCTTTGTGTTTGTCTTCCCTTCTATATTTTTATATGTCCCTCCTTGTGAATTGATTAGTCTTCCGTTGGAAAATTAGTGTTCTTTTGAATGTCCATTATAGAATATTCCCTTGAACTTTGGATGGAATTAGTATATCTGCTCGTCTTTTTTTTTTTTTTTTTGCTGTCTGGTATATCTGAAGTGAGCTCATTATTAAACAACATGAATCTTGTAAAACTGTTATATTACACATTCATGGTGGCTTATCTGTAGACTGAAACAATCCGATATGGAGTTTTTGATGTGAATGCTTGTCCTTTGAAAAGCAGCGAAAGGAGATAATTAATGCTTTGTTATGCATAGGTCATTTGATAAGGATTTCAACTTTCTGTTCTGCATAATTGTATCACAGGAATTTCCATACAAAAAGACTTAAGACCCATATTACTACGGTCATGATCTCTCTCTATAAAGCCTTTGAAATGCTGCCTCCACAACCCCCAATCCATTAATGAGCTGTGCTAAGGAGAGAGATTCAGTGGGAAAAAAAAAGACCAGGAGGAGGGAGCATCTGCCTGGTGGGGACTACAAAATAGAACTCATACATCTTCCAAAGCAACTTGTACTACGGAACATTATATTTATACCTTTTCTTTTCTTTAGTTGTTCTTTTTATATTTCTGTTTGGTTTTGCTCTAATAAATTACGTTATTTTTAATTTCTTGGTTTAGTTAAAACGGAGTAGTAACTTGTACTACGGAATATTATTTGTTCATTTCTTTGAGCAGATTGTTACGCAACAACGAAAAGGTAAGATTTTTTAATCATTTAACAATTATTTTTTAATTGATTTTGTGATAAGTGGAATTTTCCAAATAATCAAAAAATGCACCAAGAACCAAATTAAAAAATAATTAACAAGACAAAGAAACAAAATGAAACCCGTGCGAGTTCAAAACTAGTTAATAAAGAAAAGAGAGTTAGGTCATAGAAAACCTCTTGGCTTTGGACTACGATTTATAGAGCCAGGGATGTAATGTAGCAAACACCCTCATAATGCATATTTGGTACAAAGTATTGCCGTTTTATAAGCTCTAGTGTTGTGTTCGGACTAAATCTTATAACTACGTTGTTTACGATAAATAATGATGAATGAATCAAGCAATAGTGTCCGAAGTAAATACCCGGCCGAAAAATTTAGAAATGTAATTTTAATTTGGCAAATTTGTTAAAAAGGATCTTTTATAATCCAAATTTTGCGAGAAAGGACCTTATATAATTTTTTTTGTGAAATAACACCTTAATGTAAATTTTTTTGCGAGAAAGGACCTTATATAATGTAATTTATTTTTGCGAAAGACAACCAAAAGTAAATTTTCGGCATTGACTGAGCTTTTTCGGCCATTGACTTGCACGTGAGAAGCACGTGTGACTTTATTTTGATAATCATACCCAATTTTCCTCCAAAATTCTAAGCTTTAAAACCTAAAGTTGAAAAAAAAAAATCGAAATAAAATCAAGTTTGAAAATTCAAGACTCGGGAAAATCAATGTCTTTAGCCAACGTAAGCCACGCGTGCTGCTCACGTGCAAGTCAATGGTCGGAAAAGCTCAGTTAATGCTGGAAACTTCCCTTAGGTCCTTTCTCGCAAAAAAAATTACTTTAAGGTGTGTTTTCACAAAAAAAATTATATAAGGTCCTTTCTCGCAAAATTTGAGTTATAAAAGGTCCTTTTTGACAAATTTGCCTTTTAATTTTAAACCCCTAAACGTTGAGTTATGGGTGAATGAAATTTAATTAAAAGTTATCGATTTTCACAATTTCTACTAAGCTACAAAACTTTAAATTAACCCCAAATAATTGAAGTCATTAGTATACCAATTAAAGTTCTTTTTTTGGGTATAATGAATCCTCATTATTATAAATATTTAACTAATATTATTCAGATTTTTAAAATAAAAATAGATAAATAAGCACCCAATAAAAGATTTGCTAGAAATAAAAAAGATAAATAAGACTAAGTAAAAGATATACAATTATCTCCTTTTAAAAAAATAAGATAGAATTGGAAACAAAAAGAGTTAATTGAGGCCTAGATCTTTCTAAAGTATTTTATTTTAAAAAAACATTATAGTGGGAGTTGAACAAGATAGCGATAGATAGGAAATCCCTATTATTTCAATTATAAGAAGAACAATAAGTTTAACTCAATGGAATTGAAAAACTAAGAACTTTCATATAATTATAATAAAGCTAATTATAATAGAGTGCATCATTAATATTTTAATCAACAATCAATCATGCTAATACACCCACTATACCATAGTGTTTTCTTTTCGTCAAACTTCTAATCTCTTCTTAAAACCAAATTATTCCTTCTAAATTTCAATCAATTTATAATTAAACTTTTATAAAATTATAAATAAATTTACAAATAATCTTTTCGTCAAACTTCTAATCTCTTCTAAATAGATGGAGAGATAAAATGTATTTTTAGTTGTAATGAATAAAATTAATTAATTATTACATTAATAGTTCCTTTTATATTGAACGAAACTAAATACAAAACAAAGTAAATGGGATAAATACTAAGAATTTAATGCAATATATGAAAATGAAGCAATTTCTAAGGATGGACTTAGGCCCTGTTCTTTTTGGCTTAATTTCAGCTTCAGGACTTATTTGGCAGTTCATGTTCAGTTCAGTTCAGGAGCATTCAGTTCAGTTCAGTTCAATTTAGTTCAGTTCAGTTCAGTTCAGTTCAGGAGCATTAAATTCAGTTCAGTTTAATTCAGTTTAATTCAATTCAATTTAATTTAATTTAATTTAATTTAATTTAATAATAATAATTATTATTATAATATATTATTATTATTCATATTAATTATATTATTATTATTATTATTAATATTAATTATATTATTATTTATATTCATGTATTACTTATTATTTATATTATTATTATTATATTATTATATTACTAATTATTTATACTTATATTATTATATTACTTATTATTAATATTATTATTATTATTTATTACTAAATATTTATTAATAATTAATATAATTTATTATTATTTTTATTAATTAGTATTATTTATTATTTATTATTTATTATTTATTATTTATTATTTATTATTTATTATTTATTATTTATTATTTATTATTTATTATTTATTATTTATTATTTATTTCAGGAGCATTCAGTTCAGTTCAGTTCAGTTCAGGAGCATTCAGTTCAGTTCAGTTCAGTTCAGTTCAGTTCAGTTCAGTTCAGTTCAGTTCAGTTCAGTTCAGTTCAGTTCAGGTGCATTCAGTTCAGTTCAGTTCAGTTCAGTTCAATTCAGTTCAGTTCAGTTCAGTTCAGTTCAGTTCAGTTCAGTTCAGCTCTAAAGAACAGGGCCTTAATAGAATATGAGGCGAAAAACTAAGGACAGAGGGAGTTTATACTTATACAAAGTATATATAATTATTTTGTTGAGATCACATGAATAACTAACTCGGTTTTTCTATGAGTGCCTTATGCATAAACACTTTAAATACTAAGAATATACTTATACTCCAACTCGAAAATGGACCTATTTTAATTTTCTATTATAGGTATAATTTATAAAAACACCTATTTATATACGATAATATAATAACACAAAAATTGACAAACCCGTGCATCTCACGGGCTTCAATACTAGTATAAATTAATTACAACAAGAAACGAGCCAAACAAGTGGGGTAAAATGAAGGAGACGTGATCAATGTTTTTAGGACGGAAATAATGTAGGGTGTCAAAGATGGTAAGAGTAGTAGTTTTAAACTAATTTTCTCTTACTTTTACCTAGTTTTTTTGTAACTTTTAATATGTTTTGATTAACTTTTATGTTGTATAAAAAAGTTAATAGATAAACTTTTTAAAGGGTTAAATAATTTTGAAGAAACTTTTTATTA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mRNA sequence

TTGGCCCAAATCCAAACCCAAAGAAAATAAGTCCATTTTGTTGTCATTTGAAATCCTCTCCCAAATGTAGTCATTTGAAATCCAAACCTGACTCCTCTCCCCCTTTCTCTCTCATCTGCTCCCCTATCTCTCGCCGCCATCGAAGAAATTCTTCCAACCTCAGATCTTGATTGGCTCTTTCATCTCAACCTCCATCAATCATCCCTCTTCTTCACCTTTGATCTATCTCTTCTTCACGGCTCCATTTACCTCTCCTGCCTAGCTTAAAATATCTCCCCTCCTCCATTGCCGCCGCCACCAACAGATGTGTAACCACCCATCATCAACACCGAAATTCTGAAATCCGCAGATTGCAGCCATGGAAACTTTCATTCGACCCGAAAATTTGAAAACCTGAACATGCAGCCATAAGATTTTATTGAAGGATATGAATTTCTTCATTAAAGGTGGTCTTGGTCAGGAATTTCCATACAAAAAGACTTAAGACCCATATTACTACGGTCATGATCTCTCTCTATAAAGCCTTTGAAATGCTGCCTCCACAACCCCCAATCCATTAATGAGCTGTGCTAAGGAGAGAGATTCAGTGGGAAAAAAAAAGACCAGGAGGAGGGAGCATCTGCCTGGTGGGGACTACAAAATAGAACTCATACATCTTCCAAAGCAACTTGTACTACGGAACATTATATTTATACCTTTTCTTTTCTTTAGTTGTTCTTTTTATATTTCTGTTTGGTTTTGCTCTAATAAATTACGTTATTTTTAATTTCTTGGTTTAGTTAAAACGGAGTAGTAACTTGTACTACGGAATATTATTTGTTCATTTCTTTGAGCAGATTGTTACGCAACAACGAAAAGTATATTAATGTTCATTTTAAACAACACAAAACGACATCGTTTTGGATGGGGGTACAGCCAGCTTTGGCTGTACCCGGGTATAGCCAAAAATTTGCGGTGTGTCAGTGTGTATGTGGTGAGGATGAAAGCCGAAGTGATTACAGCTTGCTTGGGTGCCTCTCTGAGCCCAACTCCAGGAGGCCCAACTTTT

Coding sequence (CDS)

ATGTTCATTTTAAACAACACAAAACGACATCGTTTTGGATGGGGGTACAGCCAGCTTTGGCTGTACCCGGGTATAGCCAAAAATTTGCGGTGTGTCAGTGTGTATGTGGTGAGGATGAAAGCCGAAGTGATTACAGCTTGCTTGGGTGCCTCTCTGAGCCCAACTCCAGGAGGCCCAACTTTT

Protein sequence

MFILNNTKRHRFGWGYSQLWLYPGIAKNLRCVSVYVVRMKAEVITACLGASLSPTPGGPTF
Relationships

The following mRNA feature(s) are a part of this gene:

Feature NameUnique NameType
Spo04867.1Spo04867.1mRNA


Homology
The following BLAST results are available for this feature:
BLAST of Spo04867.1 vs. NCBI nr
Analysis Date: 2018-06-29 (blastp Spinacia oleracea peptides vs. NCBI nr)
Total hits: 0
Match NameE-valueIdentityDescription
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BLAST of Spo04867.1 vs. UniProtKB/TrEMBL
Analysis Date: 2018-06-29 (blastp Spinacia oleracea peptides vs. UniprotKB/TrEMBL)
Total hits: 0
Match NameE-valueIdentityDescription
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BLAST of Spo04867.1 vs. ExPASy Swiss-Prot
Analysis Date: 2018-06-29 (blastp Spinacia oleracea peptides vs. ExPASy SwissProt)
Total hits: 0
Match NameE-valueIdentityDescription
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BLAST of Spo04867.1 vs. TAIR (Arabidopsis)
Analysis Date: 2018-06-29 (blastp Spinacia oleracea peptides vs. TAIR)
Total hits: 0
Match NameE-valueIdentityDescription
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GO Annotation
GO Assignments
This gene is annotated with the following GO terms.
Category Term Accession Term Name
biological_process GO:0048102 autophagic cell death
biological_process GO:0006914 autophagy
biological_process GO:0044265 cellular macromolecule catabolic process
biological_process GO:0006635 fatty acid beta-oxidation
biological_process GO:0010150 leaf senescence
biological_process GO:0016558 protein import into peroxisome matrix
biological_process GO:0009414 response to water deprivation
cellular_component GO:0005829 cytosol
cellular_component GO:0005634 nucleus
cellular_component GO:0034045 phagophore assembly site membrane
cellular_component GO:0005774 vacuolar membrane
molecular_function GO:0005515 protein binding
RNA-Seq Expression
   



Co-expression
Gener valueExpression
Spo125380.67Barchart | Table
Spo009920.66Barchart | Table
Spo182230.66Barchart | Table