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Sequences
The following sequences are available for this feature:
Legend: polypeptideCDSexonthree_prime_UTR Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.ATGGACGTAAAATCAATGGCCAAATCGAAGAGATCTCACACACAACACCACCAACCGAGAAAACCCAAAACTTCTTCAAATTCTGCAGCAACCAAAGACGGCAAGGACAAAAATAAAGCTACTCAACCACCCCCACCTTCATTGCCTTCAAATTGGGGTCGATATGAAGATGAAATTGATGAACAAATTGCAGAAATACAAATCGACTCGGGTTCTGATGAACCGAGTCAACTCGACAATTCCAAGTCGAAAATGGGCAGTGATATTGATGGGGTTATACCCAAGAGTAAAGGTGCTGATTTCAGTGAATTGATTGCTCAAGCTAAAGAGTCTCGCACCTATTACTCCCCTTCTTTTGGTGATAGATTGCCTGGTAATTTCTCAATTTTTGATTCTATATGTTACAAATTGAATGCATTTTGTTTTGTTTTTGTAGATAAATGAATTGGGCTTTTTACACCTTTCATGAACTGCTGAGTAGTACCGACTGTGTTCAATTCTCACATTGTATATTATTGACATTAGGGTTGTCATTGGGTCCAATAGAAATTTTGATTTGGGTAGAAAAGGCAAATTACTTAGAAAATAATGTTCTGTTGGATGCTTGAAGAGGAGATTATGTTGGTGAAAATAGATTACTTGCACTGTGGATATTTGACTAAATGTGAGAGATGTTGAAGGATTTTATCCCGGATTGGTTCTAATGGTTTATGAGGATTACATGTTTGATGTTTATGGCATGTTCATTCTCTTAAGATTGCAGCCCATGTAGGCCTTAACTTAGTTCATGGAAGGAGATGATTCTTGTACTGGCTTCTACTTTTGGGGAATTTACATGACCATTCCGCTTGTTATAAACGATTCAGTGACATTGGTAGGTCCGAAGGTTTTGACACCGGATCGTGCTGCGCGCTCTTGCCTATGGGGCGGCAAGGGCGCAAGCCTTGTGCGGAAAGTGAATCTCAAGGCTCGGGGCACGAGCGGGTGATTGCTTCAGAATGGGCACTCTTGCCTATTGGCGACAAGAGCGAGGGTCGAGGGTCGAATCGGGGTGCTTGTGTCAGGCACAAGCGGGACCGACGACAAGAATGTATCTGTTTGAGGGAGACTTTCTCGAGTATTGGAAAGCTTAAAAACATGCGACAACACAATATAACAACGCAAGTGATTAAGCAAAGACAAATTCTGATGAGAGGTATTGGTTCATACCCCTCATAGAGGGTTATTTTGAATTAGCTAAAAACTACGGGTAATAATTCTCTTCAAAACCTAGATAACTATTAGAAAGATCCTAGAAAGCAATAGAAAAGAGAAATACAAGTAAAAGAAGGTTGGATTCTAACACTGGTAGTACTTGCAAATTGTTGGAGACATAGTTTTTCTTTGTATCTTTGAGGTGTTGATGCCTTGAATTCTTTCGTAAATAATCATAACTAGACAATTAAGGTTCATTGTTGCCAAAAAGCTAGTATTAACACTTGCTTCCTTAAGAACATTTCTAATAGCCTACAAATTTCGACAACTAAAAGTTTTCCTAAACAAATGATATTCCACTTGATAGAAGAAGAGTCTTCAGATTTTTGACATATTAGCTAGGCTGCAGGCTCTTAGAATCCGAATGCTCATTATTTTCTCTAGACAACAACCACTTTAGAAGGTAAAGAACTGCCAATGCTTCTCTTCGAAATGGAGAGTTACACTGGACCAGTCTGCTAACAGAACTTACAATTTCAAAATCAGATTCTAGCAAAATGGAGAGTTACACGGGACCAGTCATCAGATCTTTTGGTTCTTATTAGTGTACAACCTGCATATTTTGTTATTTGCCTATGAATAATTTCTTATTTTTACTTGTTGAAGCATAAGGCAAGGAATGGAAATCTGAAGTATGTAGTGTTATTTGTTAGTTTGAGAGAATGTCTACCTTTTTGGGACACTTCCGTCTTTGGATAGCTTTTAAGGACATTTTATTAAGTTTTGAGCTATATTTGGATGCTAGATCGGTTTTCTAATGTCGAGCTCGTTCTTTTAGCTCTAGGGGGCAATCCTCTGGGAGTTGATTCTTTCGAAAATTTCTTAAATATAAAATGGGTATAAGAAGGTATAATTTCCCAGGATTGTACTTATTGGATCTTTTCTATCAAGCATATACTTGCACTAACCCTCTTTGTTTAAGGTCTTTGTGACTATTGGATCTTTTCTATCAAGCATATACTTGCACTAACCATCTTTGTGACTATTTCACATACAATTGAGAAAATGATGCGATATTTTTGCGGTCTTGAGTAGGAGAGGTAAAAAAGGATTGTCTTGCTAGTTGGGGTTTAGTGTATTGACCGAAGGTTGAGGGACCTGTTGGGCTTGAGAAGGTGATTTCAAAAATCTTTCTATGATAGGTAAATGGCGATGGGGGTCTCTTCTTGTACTTGAGCTCCTTTGGTATAATGTCATCAACAGCAAGTGTGACTTATGTCCAAAGTCTGAAGGTGGTATGCTGGAAGGGTAACACACAACTACTCTAGAAATTTATTTCGCGGGTCTCTTCATATTTCAATCCTTTAGTGATGTTCAAATTAGGGGATGGAAAGGAAATCTTCTTTTGGGAGAATGTTTTGTTAAGACGACAACCTTTTGCTAAACATCACAAGTTACCTTTCGACCAACCACTACTGGTCAATTCCACTTTGGGGCCCATGGCTTCGCTCTTTCCCAAGAATAAAGGGCGAAATTCTTGAATTTCATATAATACAATAGTGGAAACTATAGCTATAGTTCCTCCGATTATTGATGATGTAGAGAAGTTACGAGTGATGATTGGGTCAATTTAGGAAGTTCGACCAATGTTAGATGGAACGCGGGGCGTTTTGGAACGTGGTACGGGAACGGGAATGCGAACGCGGAACGCCGCCTCTAAAGTTCCCGGGACGTTGGTCATTTTTAATATAAAAACTTTAGCGAAGTTAATAGTATGATTTTTATTAAAAGTTATTGTAAAATGGTAGAGGGTACATTCAAATAAAAAAAACGTAGCTGGTAAAATAAGTAAAGTGGGGATCCAAAAAAAAAAAAGAAAAGAGTAAAGTTGAAATTGAAAAGTCAGTTGTCAGTTTCCCAGAATAATAAAGTAATCACGTGGAAAGAGGAATTGAAAAAGTAAACTTGTTAGTTTCCAAGATATGGAAAATTGAGGACCCTTCATCTTCTTCGTTTTTTGATTGAAGAAACCCCATTTTTTCTGTACTTCTACTGCGAGTCTTCGACTGAAAATTGCGGCCTGGTCGGAGGTGATCGTGGGAGACGACAATGTTCACTCCGCTAGACTCGCCTTAAGCGCGCGAGCAAAATGCCCATGACCGAGAATTGGAGGAGATGGTTTCTATAACCACTAAGTTTTTTAAACTAAAGAATGTGACTGATTCTAGGATATGAACGGGAATCATGGGAGACTCTTCCTGGGTTTTTTCATGCAAATGTTTTATGTATTGCTTGAATAAAACTCCTAAATACCCCAGGCCCAGCCTTTCCATTAGGAAATTTCATTTTGAAGACCCTGGTTCCTCTTCATTTGAGAGCTCCCATTTGAGACACTAAATTAACGAGGGATCACTAGTTCAATACCAATGATCTCCTACAAAAATGAAGGTTGGATAGGCTATCTCACTATGGAAGGAAAGTATCATGAAAGCACCAGAATTTCATGAGAGCTATGCCCTTAGGCATAATTATTAAAAGCACCAGAATTTTGTTTGCTTTGCCGAGCGAGAATTGTATCTTGCTCACATAGTCACATGTTTTCCTTCACAACGGGTTGGCATGTCATCCATAGAGGAGAACTCTGTGGTGCATGAAGAGGGGTGTGTTAGTCCTTCGAATATTAAAATTGGTTACAAGTTCATTTTGACGGGTATTGGCTGAAGGAGAAAAGGTTGTTGTGATGGTTATCTTCTGGACCATTTAGCTGCAACAGAATGGTAGAACTTTTAACAGAGTTGCTTCTTCTTGTGATAGTTTATGGGATAAACCAACTTTGTTAGTCTCATTATGGGCTAACTGGCTAAGGCAGCCCGGGGTTTAGTCTGTATACAATTGTGGAGATACGATGGCATTGGGATAACTTGTATTTTCTTTATGGCGTTTCTCCCTAGATTACACCTTGTCTTCTTGCTGTTTCCCTCTGTGTTGATAAACTGCTCCTCTTATAAAAAGGTTATGTTTATGTTTGAGAAATCATAATTGATCGTATTTAGAGTTTTGATTAGAGATGTTCTCTGTTGTTAATCCAATTCTTATATTTAACTGCCTTGTTGGTGAAGTCTTTAACAATTGACTTGTATTCTTTCTAGAGTTATATCAGGGAGTGGCACCTATGCTTGCAGTTAGGGGAGAAAAGATCATTTTACAGAACAGGGATGATGATTTTCTCATGGAGGATGAAGCAATTGGCTTACAAGAGGTATCAAATAAATGCTTCTGCAATCGATTTTTTAGAGCTATATTTCTTTTTGCTTGTATTATATTCAAGTGTATGATATCTCAACAAATCAAGCAGGTCATGATTCATGCCCATGTTTGGTATCAACTTGTGTGATTTCTCCCTTTACTGACAGTTTACTTTTTACTTCCAGTATGATCATTGGCCAGTATCGATATGCTTTTGTTGAAGTTGTTTTCACAATTTTGCTTGTTACTTGCACCATTTTAAGTCTCAATTGGAGCTTTTTGTATATAAAATCCCCTCGATTACAAGAGTAGTATATGCCAATCTCATCCCAATCTCTGAAGTAAATTTATGGTGCATTTCCATCTAAAAAGTTGAACTTAATTCATCATCTTGTATATATGCTCATATTAGTGCTAGCACATTGGATTGACCAGTATTTTTTGTGTGACCTTCTGTCAAAGTTGAGGTGTAGCAAACTGCTTTGAAATTCTGAATGAGCTTTTATGGAATCATTTGAAATGTGAACCATGTTTTGGCATTTTTATGCACTGGT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ATGGACGTAAAATCAATGGCCAAATCGAAGAGATCTCACACACAACACCACCAACCGAGAAAACCCAAAACTTCTTCAAATTCTGCAGCAACCAAAGACGGCAAGGACAAAAATAAAGCTACTCAACCACCCCCACCTTCATTGCCTTCAAATTGGGGTCGATATGAAGATGAAATTGATGAACAAATTGCAGAAATACAAATCGACTCGGGTTCTGATGAACCGAGTCAACTCGACAATTCCAAGTCGAAAATGGGCAGTGATATTGATGGGGTTATACCCAAGAGTAAAGGTGCTGATTTCAGTGAATTGATTGCTCAAGCTAAAGAGTCTCGCACCTATTACTCCCCTTCTTTTGGTGATAGATTGCCTGAGTTATATCAGGGAGTGGCACCTATGCTTGCAGTTAGGGGAGAAAAGATCATTTTACAGAACAGGGATGATGATTTTCTCATGGAGGATGAAGCAATTGGCTTACAAGAGGCACCTTTTTTGACCTTAGATCTAAAAGATCTTGCTGAGCGGCTGTCAAAAGTAGATTTAGCTGAAAGACTCTTCATTGAACCCGATCTATTCCCTCCAGAGATGCATGCCGAGGATGCAAGTGAGGCTGATAATCAGGCGTCTTGTCGGACATCTGAGACACGGAAGATTGAAAGAATTGATAGTTTCGGTGAGTTACTTGCTCTTTATTTGGAAGAGGAACAAATGGCTAAGAGACAAGATGATCTAGATAAAGATGGTATGTCGTGTTCCTCAAATGTTAGTAGCCGGCATAGTCCATATAAACCAGAATCAGAATCAGAATCTAAAGCATATTTAGGGGTAAGGAAATCAGATGACATGGAATTTCTTGACTGTAGAGAAAGAGCATATGTTGATTGTGGTAGCAAGGAAGTTGCAAAGAGCGAATTAGATGATGTAGGACGGGTTAGTCATGTTACAAAGCAGGTTGCAAAGAACAAATTGGAATTTCTGGATGAGATAGAGAAGCCTGAGTCTGGTGTCGTCACAGAGCAAAATACAAGACCATTGTCCAGATTTGAAGCAACTTCTGCAGAAGCAGAGCTTGACATGCTTCTTGGATCATTTAACGAGACGGAGCTTTTTGATAATCCAGTGAATCAACCAGGAACTTGTGCATCTTATATGACCGGAAAAATTGCAACTCATGGAGTTCCAACACAACATTTATTGGGTCGATCTGCACCTGCATTTCCCATCACCACCAGCCTTGATGATGAGCTTGATGACCTGCTTGCAGAAACATCTAACCCAAAAAATACAGATGGTATTTTCCAATCCACCCAGGTGCCTTCATCATCTTTATCTGAAACCACTTCCAAATCCAAGATTCAGGAAGATTTTGATTCGTGGATGGATACTATATGATCGTAATTTCTCTCTGTAACTCCTTTGGATTGCCTCCTAAATATAGATGGCTAAGTCAAAGTTATAATTAGGTAAAATAAAAAATAAATAGAAAAACAGGGGCAGTTCGATATTGAGTTGTTTAGAGAATCAGAGCCACAAGGCCCCTGCATCTTTAAGAAGAGGAGTCAACTCGCCGGTTATATGTATTACGTGCGGCCACCAATAAATACCGTCGGAAAGCTCATAAAGAAGTCAGTGCCACGTTTAGAGCCCACTTTGTTGAGTTCATCTATGACAAATTCCACCTCTTCCTCATCAACGTCATGAACGTACCGCAGGGTTAACACCAAGACCATGGAGCAAACGTCGTACAACAAGGCTCATGCAACATCCACATCGCCCAAATATTATTACTGCATTTTCTTCAACCAGGCTCTTAATGTTGTTGTTCTCCCCCCATTTCATCACCGAAAGATTCGACGACGACGACGACGACGTGTTTCGAAGGTCGTTCAAGGGTAATAAGTTAGTTGTGTGCCATGCCTTGTAGGGAAGTGCTTGGTACATTATTCTTGCTTAATTTAAGAGAGAGAGAGAGATAGAGATAGAGATACAGATAGAGATAGAGAGGAGGGAGTTTGTGTTGTTGGGTATATAGATTGAAACTCCACTATAGAATTCCAGTACTTATAAAGAAGAGTTTTTTGTCAACGGCAGTTAAGCATATTATCTGTATTACGGACTACGTGCTACATTACGTCATTATGTAATTGCTGGTGTCATATTACGTCACTCTTTTTTGTCACCGTTTTTCTTGTTTTAAATAATGACAATTGCCTTCAGTAATTTATAGTTTGGCCGGTTTGCTCATAATAATTCCGAA ATGGACGTAAAATCAATGGCCAAATCGAAGAGATCTCACACACAACACCACCAACCGAGAAAACCCAAAACTTCTTCAAATTCTGCAGCAACCAAAGACGGCAAGGACAAAAATAAAGCTACTCAACCACCCCCACCTTCATTGCCTTCAAATTGGGGTCGATATGAAGATGAAATTGATGAACAAATTGCAGAAATACAAATCGACTCGGGTTCTGATGAACCGAGTCAACTCGACAATTCCAAGTCGAAAATGGGCAGTGATATTGATGGGGTTATACCCAAGAGTAAAGGTGCTGATTTCAGTGAATTGATTGCTCAAGCTAAAGAGTCTCGCACCTATTACTCCCCTTCTTTTGGTGATAGATTGCCTGAGTTATATCAGGGAGTGGCACCTATGCTTGCAGTTAGGGGAGAAAAGATCATTTTACAGAACAGGGATGATGATTTTCTCATGGAGGATGAAGCAATTGGCTTACAAGAGGCACCTTTTTTGACCTTAGATCTAAAAGATCTTGCTGAGCGGCTGTCAAAAGTAGATTTAGCTGAAAGACTCTTCATTGAACCCGATCTATTCCCTCCAGAGATGCATGCCGAGGATGCAAGTGAGGCTGATAATCAGGCGTCTTGTCGGACATCTGAGACACGGAAGATTGAAAGAATTGATAGTTTCGGTGAGTTACTTGCTCTTTATTTGGAAGAGGAACAAATGGCTAAGAGACAAGATGATCTAGATAAAGATGGTATGTCGTGTTCCTCAAATGTTAGTAGCCGGCATAGTCCATATAAACCAGAATCAGAATCAGAATCTAAAGCATATTTAGGGGTAAGGAAATCAGATGACATGGAATTTCTTGACTGTAGAGAAAGAGCATATGTTGATTGTGGTAGCAAGGAAGTTGCAAAGAGCGAATTAGATGATGTAGGACGGGTTAGTCATGTTACAAAGCAGGTTGCAAAGAACAAATTGGAATTTCTGGATGAGATAGAGAAGCCTGAGTCTGGTGTCGTCACAGAGCAAAATACAAGACCATTGTCCAGATTTGAAGCAACTTCTGCAGAAGCAGAGCTTGACATGCTTCTTGGATCATTTAACGAGACGGAGCTTTTTGATAATCCAGTGAATCAACCAGGAACTTGTGCATCTTATATGACCGGAAAAATTGCAACTCATGGAGTTCCAACACAACATTTATTGGGTCGATCTGCACCTGCATTTCCCATCACCACCAGCCTTGATGATGAGCTTGATGACCTGCTTGCAGAAACATCTAACCCAAAAAATACAGATGGTATTTTCCAATCCACCCAGGTGCCTTCATCATCTTTATCTGAAACCACTTCCAAATCCAAGATTCAGGAAGATTTTGATTCGTGGATGGATACTATATGA MDVKSMAKSKRSHTQHHQPRKPKTSSNSAATKDGKDKNKATQPPPPSLPSNWGRYEDEIDEQIAEIQIDSGSDEPSQLDNSKSKMGSDIDGVIPKSKGADFSELIAQAKESRTYYSPSFGDRLPELYQGVAPMLAVRGEKIILQNRDDDFLMEDEAIGLQEAPFLTLDLKDLAERLSKVDLAERLFIEPDLFPPEMHAEDASEADNQASCRTSETRKIERIDSFGELLALYLEEEQMAKRQDDLDKDGMSCSSNVSSRHSPYKPESESESKAYLGVRKSDDMEFLDCRERAYVDCGSKEVAKSELDDVGRVSHVTKQVAKNKLEFLDEIEKPESGVVTEQNTRPLSRFEATSAEAELDMLLGSFNETELFDNPVNQPGTCASYMTGKIATHGVPTQHLLGRSAPAFPITTSLDDELDDLLAETSNPKNTDGIFQSTQVPSSSLSETTSKSKIQEDFDSWMDTI Relationships
The following mRNA feature(s) are a part of this gene:
Homology
BLAST of Spo04879.1 vs. NCBI nr
Match: gi|902138793|gb|KNA04525.1| (hypothetical protein SOVF_198910 [Spinacia oleracea]) HSP 1 Score: 897.1 bits (2317), Expect = 1.300e-257 Identity = 463/463 (100.00%), Postives = 463/463 (100.00%), Query Frame = 1
BLAST of Spo04879.1 vs. NCBI nr
Match: gi|731356631|ref|XP_010689778.1| (PREDICTED: uncharacterized protein LOC104903441 [Beta vulgaris subsp. vulgaris]) HSP 1 Score: 503.8 bits (1296), Expect = 3.100e-139 Identity = 281/478 (58.79%), Postives = 356/478 (74.48%), Query Frame = 1
BLAST of Spo04879.1 vs. NCBI nr
Match: gi|356515126|ref|XP_003526252.1| (PREDICTED: uncharacterized protein LOC100790093 [Glycine max]) HSP 1 Score: 189.9 bits (481), Expect = 1.000e-44 Identity = 171/495 (34.55%), Postives = 245/495 (49.49%), Query Frame = 1
BLAST of Spo04879.1 vs. NCBI nr
Match: gi|567908799|ref|XP_006446713.1| (hypothetical protein CICLE_v10015198mg [Citrus clementina]) HSP 1 Score: 187.6 bits (475), Expect = 5.000e-44 Identity = 172/507 (33.93%), Postives = 250/507 (49.31%), Query Frame = 1
BLAST of Spo04879.1 vs. NCBI nr
Match: gi|641830481|gb|KDO49568.1| (hypothetical protein CISIN_1g012781mg [Citrus sinensis]) HSP 1 Score: 184.9 bits (468), Expect = 3.200e-43 Identity = 171/490 (34.90%), Postives = 241/490 (49.18%), Query Frame = 1
BLAST of Spo04879.1 vs. UniProtKB/TrEMBL
Match: A0A0K9QB88_SPIOL (Uncharacterized protein OS=Spinacia oleracea GN=SOVF_198910 PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 897.1 bits (2317), Expect = 8.900e-258 Identity = 463/463 (100.00%), Postives = 463/463 (100.00%), Query Frame = 1
BLAST of Spo04879.1 vs. UniProtKB/TrEMBL
Match: A0A0J8BKH7_BETVU (Uncharacterized protein OS=Beta vulgaris subsp. vulgaris GN=BVRB_9g209490 PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 503.8 bits (1296), Expect = 2.200e-139 Identity = 281/478 (58.79%), Postives = 356/478 (74.48%), Query Frame = 1
BLAST of Spo04879.1 vs. UniProtKB/TrEMBL
Match: K7KXZ5_SOYBN (Uncharacterized protein OS=Glycine max GN=GLYMA_06G287100 PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 189.9 bits (481), Expect = 7.000e-45 Identity = 171/495 (34.55%), Postives = 245/495 (49.49%), Query Frame = 1
BLAST of Spo04879.1 vs. UniProtKB/TrEMBL
Match: A0A0B2PJB3_GLYSO (Uncharacterized protein OS=Glycine soja GN=glysoja_033870 PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 189.9 bits (481), Expect = 7.000e-45 Identity = 171/495 (34.55%), Postives = 245/495 (49.49%), Query Frame = 1
BLAST of Spo04879.1 vs. UniProtKB/TrEMBL
Match: V4THQ8_9ROSI (Uncharacterized protein OS=Citrus clementina GN=CICLE_v10015198mg PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 187.6 bits (475), Expect = 3.500e-44 Identity = 172/507 (33.93%), Postives = 250/507 (49.31%), Query Frame = 1
BLAST of Spo04879.1 vs. TAIR (Arabidopsis)
Match: AT5G44150.1 (unknown protein) HSP 1 Score: 108.6 bits (270), Expect = 1.000e-23 Identity = 96/304 (31.58%), Postives = 147/304 (48.36%), Query Frame = 1
The following BLAST results are available for this feature:
BLAST of Spo04879.1 vs. NCBI nr
Analysis Date: 2018-06-29 (blastp Spinacia oleracea peptides vs. NCBI nr) Total hits: 5
BLAST of Spo04879.1 vs. UniProtKB/TrEMBL
Analysis Date: 2018-06-29 (blastp Spinacia oleracea peptides vs. UniprotKB/TrEMBL) Total hits: 5
BLAST of Spo04879.1 vs. ExPASy Swiss-Prot
Analysis Date: 2018-06-29 (blastp Spinacia oleracea peptides vs. ExPASy SwissProt) Total hits: 0
BLAST of Spo04879.1 vs. TAIR (Arabidopsis)
Analysis Date: 2018-06-29 (blastp Spinacia oleracea peptides vs. TAIR) Total hits: 1
InterPro
Analysis Name: InterPro Annotations of S. oleracea
Date Performed: 2018-06-29
RNA-Seq Expression
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