Overview
Sequences
The following sequences are available for this feature:
Legend: polypeptideCDSexon Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.ATGCGGATGCTCTCTATCACTACACTCCTAACAATGGCGAGTGAGCTTTTCTTACTCACTGCACTCCTTCCGAATCTCCTCACTTCACTTCATCTTGTTTCTCCCTGGTATGATTCTCTTTTCTCCGGTTTTGTTAAATTAGGGTTCTTTTTTTTGCTTGTAATTGTTGAATTAGGGTGAATTTTAATTGAATTGGCAAATTGATCGATTTGTCGATTTTGTTGTATGAATTTGTTAATTTATGACTGAATCGGATCATTTTAATTTGAATAGGTTGCGTTAATGGAGAGATTAGTGCAACAAAATTACTTTGCTCATAGGTGGAAAGAGGAGGGTCAAATGAATGAATATTTGGATTCCTTTATGTTTAAAGACTGATCTATGAAATTTTCTTTTTAAAAAATGGAGTCGAATTCTTCAGCAACTCACCAACTACTCCTCGTTGGAAATCAAACACCTGATTTCCCCAGGTTTGCCTAATTTCTCACAATTTTCTTCAATTTTCTTCATCTTTAATTTTCAATTGCCTGTTCTATTTTTCATTTTAGTTGTTAATTTCCGTCGGATGGGTAGGAGATGGATAATCTTGCAATTCTGAAACCAACGGTTTTTCCATGTATTGCTTCGGTTACTACTCTTCATTTTTTTTTCCGAATTTTAAGTTTGTTGTGACATTTCAATTCTAGAATTTGTAACCTGAGAAATTTTATTTGGATTATATCTTTAATTTTGTTTTCATTTTATTTTGTTTCTCTGAATGTATACAGTCCTGAAGTGAAAAGTAATTGGATGTTACCATGCTCATGCTTTTGTTCAGGTTTACGTCGGATTTCTGATATGGGTTTTGTTTTTGAGGTCTAGCTTGAATGTTCGAGTTTTGTTTGACATATCATAGAAAGTTAGAAACCACAAGACATGTCTAGGATTCTAAACTGGATTTTCTATAATGATATGCTATGAAATATTAACCTTTCTATAGTGATATGCTTTGTAATATGGGATCAATAACGGAGGCTAGGTTATTATAGAGGAATTGTAGGTGTGGTATGCAAGATATGCGTGTTTGGCGAGGTTTTATATCATTCCAGTAAGAAGGTAATGCGATTCTTGGTGTTTTGGAAGTTATGTAATGCTTACTACCTTTATTGGTTTGTAAAATTTTGGAAGCTATATAAAGAGTTAAGAAATTCTAATTTTCTTAGATTCTTTGTCATTAATATTGGGTAAAAGCATACGTAAGAAAACACAAAATACGAAAAACAAAGCAACTTCTAAGGTGGCCCTTTTAACGTTTCAATTGTTTTCATTGACGTTATTAATATGGCTTTGAAGAAGTGTTGTTTATTCTAAAATGTAATACGCACAGACCTTTTCACTGCAAACATGAGTTCATCTAATTTGTCCTTAGGATTCTTTAGGCCTTTCAGATGGACTTATTCCTATTTTCACAAGCAGTTGAAGGGTTCGAAAGGAAATTAGTTGCTCTAGGTTTGATAGAAAACGTTTGTGTTAGCAGTACTTGTGTGTGAGTTAGAATGTGATCCAGATTCATAAAGAAGGCTTACTCTGTTTTGTTAATCAGTAAAATCATTGGAATGGACGTGATATGGAATCTAATCGAACCCTGAGCAGTTTGAGTACACGTTAAATTTCCCTTAACCCTTCAAATCTCCCCAATCTCCCTGTTTTGTTTATTGGTTCTCATTCGAATTTCAAGCAATCTTAGTGATCTTATGATTTGTGTTTGATTCCTATATTTTCTCATTCATATGACCGATCAATTCTTGCACTTCAAGAGGGAACACTATAGGGTATCATTAAATGATATGTAGGTTTCTTGGAGCTTGCAAGACAATATAACTACGGAATTATGTTTTAAATCTTATGATAAGTCGTTAGAGAAACAACTACCTATATTCCATGTGGTTAGAGAGAGACAAAGAGGTATGATACAGTTTGAGTTTCTCAAAGAACCCTAGCGACTTGCTACTTTCTCAAATGATACAGTTCATGTGCATTGATTATGGTCAGAAACAGTTGGATGGAAAAACTATGTTTCTCGACCAATAGATCTTATTGCGTTGAACTGAACTATTAACAGTGGGATATGTTTTATATTTTGCAAAAACATTCAAGGTTGCAAATAAGAACTTCATATTTCAATTTGGATTTACTGAATAAATCTGAGAAATAAGATATATTTACAGCAAAAGTTTGCTTCTTTTTTAGTATAGTTTGTTGTTAGTTCAGATTTCTAAATGTGATCAAGTCCTACATTTTTTTTATATATATTTTCTCCTTATTTATTAATTCATTGGTTGCCGATAAAGTAGAACTGATTTTATTGTTGGAGTTTTGTCCAGGGGAAAATATGTCTTTATTAAACTGACATTTAGGGTGTGTTGTTGATCAGTTCCCAATCTAAAAAAAAATATGATCTTACAAATTTGGTTATTTTTCGTATGGTTAGATACTTAGATGCATATGTATTTGTAGCTATCATCATTTACTTGTGTATAGTTGCTTATAAAGGGTTTTTGGGAGTATCTTGTTGGGTAATGTGATCTGTTATCTTCTAATCTTGTTATGCTGTGGGATTTTTATGCAGTGATTTTCAAAGGAAAGAAAAGTTAAGAATGCGAGACGAGGTGAGAGCGTGAGAGCCATATTACATCTATGAAAAAAGGCAAATGAAGGAGTTATTACGCGCATGAAGGAAGAAAAATGAAGGCGCCCATTTCAATTTAGAAGACATCTGATAATCTCAAGAGGTACCCCTTTTCATTATGAGATCTCTACGTCCCTTTTTTTAATCTAATTTCTCAACCTTAGTTTTTTGTTTTTGGTTGAAATTGGTACAAAGCTTCATGTATTGGTTTTTGCTGTTGTTGTTTTTACTTTTATAGTTAGTTTGTGTTTGATTGTTACTGGGCTTGTATTTCAGAGTATGAAGATGGTGGAAGGCAAGTGGTCCCTCGTACTATCAGGCTTGCAATGAAGAAAGTCGACAATGCAATCATACTAAGCCATATTCTTTCTCCTCGTCGAGTGAAAACAGACAAGAAGCAACGTCAATGACCACTGCTGTTGTATATAGTCAGAAGGGGTTAGTTTTTCATGCTTCTATATAAAAAAAATCGTTTGAGATGCTCCGGTTATTTGGTTTTCGTAATTTCTCTAAACTTTGATCTTGCTCCATTAAACTAGCGCGAAAAGTTAAGTTTTGTGTATTCTGAGTGAGGTTTTATAATTTTATGTCCTTAGTCAGAATTGTTAAGTATCTTCATAAAATGTATGAATTATAAATGGCAAAAGAGGTTAGGACAGGGATATGGAGTTGGAGAGGAAGTGGGAGGTGAGGGAGAAATGAGAGGTAGGCGGGTAGCTATAGAAACAATTTATCGTTACGTTTTCCTAATTTGTGTAAGCATGAACGTTTGAAAACTCGGAGAAATTAGAGTATTTAGAAAGATCTCAAGAAAATCAGAAACCATGAATTCCAAAGATTATTGAAAGGGGATTCACAGGTTCATGCTTACTAGCATGTGGAATTCATATGTTTGCAAGTTGTTGGAGCAAGTATGTGGACGAAATAAAGGAAATTCGAAAACATGCAAACAAAGAGGGGGGGGGGAGGAGCAGTAAACAAGACAGTACAATGAAGAGTCCGGGAAAATGTGGGGCAGAGCTGGGGAACAGATTAAAACAATCTCAGGTGCAATTGTCGTTCCTACTTTATCAGTCATAATGATAAGCTAATCATCTATGAGGTGGAATTTATTTTGTTTTGTCTCGACACTGTATTCATATTTTACATTATACGTGAGTGGAAGGAGAATTTTTAACAATGCAAATAAAAAATTCAAATTTTTTTTAACAATGCCTGACTGGTTTTAACAATGCAAAGTGAATTTTTTGATTTTCCTTTCTTCTCCTGGAATCTGATAGAATTTGAGTAGGTGTTATTGTGTTTTAATTATTCCTGCTTTTTCCAATAACTTTTGTTCAATTTACACTGTTCCTACTGTAAATGTCAGTCTTGATGATGATTTGATTCTATTGAACTTCAGTGAATTCATTGATAATGATTTTACTGAACATTATTGAATTTAGGGAGTCTGATGAAGTGATGATGTTCTTTGATTAGTGGAGTAGTTCATTCTTATTTCTTACAATTGAATTTCTTGTTAGTTGATTTGAATAGTTGATTTGGAAATTTCTATAATTGTTCTAAGAATTCGTAACTTCATTCTTTTAATGAATTGCAGCAGATATCGATGGTGTTTCCTCCTCATACCATCTGCTCGTCCCAATCGATGTTGGCGAGGTTAGATTTTGATTATATCAGTATTAAATTCTTGAATATCATTTTCCAGTTTTTCTTCTTCTTCTTCTTCTTCTTCTTCTTCTTCTTCTTCTTCTTCTATTTCTATTGCTCTGCTCTAATGCAACTTCCTGCCTGAATATTGAAATATGTATTATTCAAACTCATACAGATTTCTCTTCCCGAACCACAAGAAAACAAAGTAATCAGGTTGGTATATATGAATATTTATATTTAAGAGGAGATATTCTAATGAATTAATTATACATTTACTAAACTCATATGATCTTAGGTCTTAATTTGTATAGTACGAGCATAACCAAAGTATAATTAGTCCTTGATGTGGTAAATGCTCTTAGACTCTGTTGTATGGATTACTGTGTGTTATCGAGAAATAACTCCAGGTTCATCTCCTTTTCCTTCTTTCTTTTTGCAGGTTATGAGAGCCAATGCAGATAGAGTAAACTTTGAGTCTTGATGGTTGCGCATGTGCATGAGATTATAGGTGATAATTTGTTGTCTAACAACTAACCTCAATTCTTAATATGATTTATTTTGTTATACATTAGCTTGTTAGTTAGGTACAACTTACAGATGTCAGGACCCATTGCCGCATAGAAAGAAATTGACTCTTATTCTATTCAAATAATAGTGGTCTCCTTCCACTCAC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CTATTATTCGATTGATGAAAACAAATTTGCCCAAAGGTATTTGTTCATTGTTTGCCCTGTCTGCCTTTTTAAAATTTTGTTTTTGGTTATCTTGCACAGATACTTCTGGAATTACAAATTTATGGGTTGTCAGATTCTCCAAGTCCAGGGATGGGAAGAGAGACAAGTTCTCCGAGATGGCTAATGTTGCAGGTTCCTCTTCCAGTGCATCCACGACAATGAATGGTAGTACTGGAAATAGTTACTGTTTCCCTAGGACTAATTCTTTAACTTTTAGTAGTAGCCCAGTCGAATCAGGTTCTCCGGGCTTGAGTGGATTGCAAAGTCTCGGAAATACATGTTTTATGAACAGTGTGCTTTAGTGCTTAAAACACACTCCTAAACTTGTTGACTATTTTCATGGAGTTTACAATAAAGAACGTTTGCACTACCCTGATGAACTTGTATTTGAGGGATTTATATATATATGTAACCTACATCAAGTAATTAGTTGCGTTTCTTATCATCTACGGAATAATGTATTCATGCTTATGATTAATTAGGCTTGTGATTTGCATAGAGTTTCGGGAGATAATTTTTTATATCTTGGGGGAACGTGCGCGCTAGCGCACGTTCCAACAACTAGTTTCAGCTAAAAGGTCAAGTTTTGGGGCTTCGATTTCTACGTGCGTCCCGTTGGAAAAAAGAAAGAGGACGTGCTCTCTTTGTAATGCTGAAGGATTATATGCTCTGTTTTATTAACATACAGTTTTAGGTTGAGAGGAGTGTTTTTGTGTTTTTTCAACTAATAAACATACAAGCAAACAATGGAAAGTTAGACAAGGGGAGTATTATAACCAACGCGTGTCATGAACGATTATGTACAAATCCTACAAATGAAATGTAAAAAAAATAACAAAAACAATAATAAATGATACAAGTGTTTGTGAGGAATTTATATTTCTTCTCCTCAAATAATATCATATCGTATTATTAAGTTCATGCAAAATAATACAATAACGCCTCAATTGATGATTACTCTCACCAATGTATTTTCACTCTTATTTTCTAGCTAGGCCTTAACCCCCTTTTATAGGTTAAACTAGAAACCTTCATCTACTAGAATTATACTTGCTTCCCAAGACGTAATAATTTTAGAGATTGTTACATACCAAAACATATCTAATTTCCTAATTACAATATACGTTAAACTAGGAAACCAAAATAATTAACAAAATAAACAATATGTCAAACCCAAAAGAATTCGCAATTTAGATGGTGGACCGTACTTGTCGGCATCCGGAGGATCAACATACTCCTTGTTTATGTCTTCCAACAAACCATGATCCACAATTACAATACTTTTGCCCATTTCCTTTTATGTAATCTTCCTTTTTTTTCCATTACCATATTTTTAAGCAACACATCATCGTCATCTCCATTACACCTGTGTTCCAAATCAAAAGAACAATTAATTAAAATCATTATTCAAATTAAAGAAATTGGTATCTCAAAATACTATGTAGTCTATCAAGTAACAATTAATTCATTATCAAGTGTTTGTCCTTGAATGATTATCCCCTAATATCAAGTAACATAATGATAGACTACATACGGTAATTTTAAAGACACAAAATTCCTTTATTTTGAGTCTTAACGCACTTCTCTAAGGGGACTAGTAGAAAAAATGTCAATTGCAACACCGCATTCACAACCCTTATGATGAGTCAACGCTGCAAAAACAATTAGTCAACGCAGGTCAATGATTTAATGAATTATTTGCACCGTTGTTTAGCCATAAAGGCTGCTAATTGGCTGGAAAAAAAATAGAAAACGTATTACTAGCGCGTACAGTGCATGAAAGCTGCGAATTAGGTGTTTATCACAACTTAGCTCTCGATCTACACGCTGCGATAAAACTCTCCAGATCTGAAATGTAAACCTAGCTTTCATCCTTTTCTTTCTCGAACTCTCCGCTCAGTTTCACATTTTCTCCCTCAAACCCTAGAATTATTTCATCGATCTCTCTCTCTCTCTCTCCTTTAGATCAATTCTTTCTCCCCATGAAGTGTAAGTTTCCCACTGATTTCATGGGAGATTTGGCAAGTTCCGACGCCAAATGCTGCTTTCTCGACATTTCCCCCGAAGAATGAGGGAATTTGGGACCGACAGTTGACTCTTTATTCCCGAATATTGTAGAAACTCCTCCATATCTGCCGGACTTCGAAGGAACACCGACGTTATTACCAAAGATGAACAGATGCAGAGAAAATCAATCTGGTAGTGTGCTAAATTTCATCCACCACACACATTTTTACTTCTCATTCTCCGACGGTGGCATTAGTGGCCTGCTCATCGGCTTATTCCAGAAGGTTGAAGGTATTCGTGATTTTAAATAAATTCATTGGATTGGTCTATGATTTTGCCCAAAATTTAAATTTTAGGGTTCTTAATTGTAAATTGGAATTTTAATTAAAACATTTGATATTATTTGGAAGTGTTTAATGGGCTTAATATTTGATATTATTTGAAGGTTCAAAGCAGAATTCAAACCTACGAGTAGATCAACAAAGATGA 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ATGCGGATGCTCTCTATCACTACACTCCTAACAATGGCGAGTGAGCTTTTCTTACTCACTGCACTCCTTCCGAATCTCCTCACTTCACTTCATCTTGTTTCTCCCTGTGATTTTCAAAGGAAAGAAAAGTTAAGAATGCGAGACGAGCAGATATCGATGGTGTTTCCTCCTCATACCATCTGCTCGTCCCAATCGATGTTGGCGAGAGACATAGTCTTTGCATACTTACTGATGCGTTTGTTCAGATACTATATCTCGGGAGACCAGGACATTTGCTTATCAAGCAATTGGAATTCTTGCGCAGCGTATGCCTACGTTTTTCAGATACTACTGGATGTCGTTCATGTATTCAACGAAGTCTCTTCTCTTGCTCAGAAAAAAGCAGTCCATAAAAGTAACTCAGAACGGAATCGAGATACTTCTGGAATTACAAATTTATGGGTTGTCAGATTCTCCAAGTCCAGGGATGGGAAGAGAGACAAGTTCTCCGAGATGGCTAATGTTGCAGGTTCCTCTTCCAGTGCATCCACGACAATGAATGGTAGTACTGGAAATAGTTACTGTTTCCCTAGGACTAATTCTTTAACTTTTAGTAGTAGCCCAGTCGAATCAGGTTCTCCGGGCTTGAGTGGATTGCAAAGTCTCGGAAATACATGTTTTATGAACAGTGTGCTTTATTTCACATTTTCTCCCTCAAACCCTAGAATTATTTCATCGATCTCTCTCTCTCTCTCTCCTTTAGATCAATTCTTTCTCCCCATGAAGTGTAAGTTTCCCACTGATTTCATGGGAGATTTGGCAAGGAATTTGGGACCGACAGTTGACTCTTTATTCCCGAATATTGTAGAAACTCCTCCATATCTGCCGGACTTCGAAGGAACACCGACGTTATTACCAAAGATGAACAGATGCAGAGAAAATCAATCTGGTAGTGTGCTAAATTTCATCCACCACACACATTTTTACTTCTCATTCTCCGACGGTGGCATTAGTGGCCTGCTCATCGGCTTATTCCAGAAGGTTGAAGGTTCAAAGCAGAATTCAAACCTACGAGTAGATCAACAAAGATGA MRMLSITTLLTMASELFLLTALLPNLLTSLHLVSPCDFQRKEKLRMRDEQISMVFPPHTICSSQSMLARDIVFAYLLMRLFRYYISGDQDICLSSNWNSCAAYAYVFQILLDVVHVFNEVSSLAQKKAVHKSNSERNRDTSGITNLWVVRFSKSRDGKRDKFSEMANVAGSSSSASTTMNGSTGNSYCFPRTNSLTFSSSPVESGSPGLSGLQSLGNTCFMNSVLYFTFSPSNPRIISSISLSLSPLDQFFLPMKCKFPTDFMGDLARNLGPTVDSLFPNIVETPPYLPDFEGTPTLLPKMNRCRENQSGSVLNFIHHTHFYFSFSDGGISGLLIGLFQKVEGSKQNSNLRVDQQR Relationships
The following mRNA feature(s) are a part of this gene:
Homology
BLAST of Spo05451.1 vs. NCBI nr
Match: gi|902155107|gb|KNA05877.1| (hypothetical protein SOVF_186300 [Spinacia oleracea]) HSP 1 Score: 122.9 bits (307), Expect = 1.200e-24 Identity = 65/73 (89.04%), Postives = 68/73 (93.15%), Query Frame = 1
BLAST of Spo05451.1 vs. NCBI nr
Match: gi|731348397|ref|XP_010685465.1| (PREDICTED: ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 8 [Beta vulgaris subsp. vulgaris]) HSP 1 Score: 109.8 bits (273), Expect = 1.000e-20 Identity = 70/127 (55.12%), Postives = 86/127 (67.72%), Query Frame = 1
BLAST of Spo05451.1 vs. NCBI nr
Match: gi|778716783|ref|XP_011657595.1| (PREDICTED: ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 8 isoform X2 [Cucumis sativus]) HSP 1 Score: 68.2 bits (165), Expect = 3.400e-8 Identity = 49/100 (49.00%), Postives = 64/100 (64.00%), Query Frame = 1
BLAST of Spo05451.1 vs. NCBI nr
Match: gi|449444827|ref|XP_004140175.1| (PREDICTED: ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 8 isoform X1 [Cucumis sativus]) HSP 1 Score: 68.2 bits (165), Expect = 3.400e-8 Identity = 49/100 (49.00%), Postives = 64/100 (64.00%), Query Frame = 1
BLAST of Spo05451.1 vs. NCBI nr
Match: gi|659097402|ref|XP_008449606.1| (PREDICTED: ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 8 isoform X1 [Cucumis melo]) HSP 1 Score: 67.8 bits (164), Expect = 4.400e-8 Identity = 49/100 (49.00%), Postives = 64/100 (64.00%), Query Frame = 1
BLAST of Spo05451.1 vs. UniProtKB/TrEMBL
Match: A0A0K9QF22_SPIOL (Uncharacterized protein OS=Spinacia oleracea GN=SOVF_186300 PE=3 SV=1) HSP 1 Score: 122.9 bits (307), Expect = 8.100e-25 Identity = 65/73 (89.04%), Postives = 68/73 (93.15%), Query Frame = 1
BLAST of Spo05451.1 vs. UniProtKB/TrEMBL
Match: A0A0J8BYC9_BETVU (Uncharacterized protein OS=Beta vulgaris subsp. vulgaris GN=BVRB_7g171320 PE=3 SV=1) HSP 1 Score: 109.8 bits (273), Expect = 7.100e-21 Identity = 70/127 (55.12%), Postives = 86/127 (67.72%), Query Frame = 1
BLAST of Spo05451.1 vs. UniProtKB/TrEMBL
Match: A0A0A0KEX1_CUCSA (Uncharacterized protein OS=Cucumis sativus GN=Csa_6G426930 PE=3 SV=1) HSP 1 Score: 68.2 bits (165), Expect = 2.400e-8 Identity = 49/100 (49.00%), Postives = 64/100 (64.00%), Query Frame = 1
BLAST of Spo05451.1 vs. UniProtKB/TrEMBL
Match: A0A0B2QDA6_GLYSO (Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 8 OS=Glycine soja GN=glysoja_035080 PE=3 SV=1) HSP 1 Score: 65.1 bits (157), Expect = 2.000e-7 Identity = 50/96 (52.08%), Postives = 59/96 (61.46%), Query Frame = 1
BLAST of Spo05451.1 vs. UniProtKB/TrEMBL
Match: V7BVG0_PHAVU (Uncharacterized protein OS=Phaseolus vulgaris GN=PHAVU_005G117700g PE=3 SV=1) HSP 1 Score: 65.1 bits (157), Expect = 2.000e-7 Identity = 50/96 (52.08%), Postives = 59/96 (61.46%), Query Frame = 1
BLAST of Spo05451.1 vs. TAIR (Arabidopsis)
Match: AT5G22030.2 (ubiquitin-specific protease 8) HSP 1 Score: 50.1 bits (118), Expect = 3.400e-6 Identity = 38/119 (31.93%), Postives = 58/119 (48.74%), Query Frame = 1
The following BLAST results are available for this feature:
BLAST of Spo05451.1 vs. NCBI nr
Analysis Date: 2018-06-29 (blastp Spinacia oleracea peptides vs. NCBI nr) Total hits: 5 Position : 0 Zoom : x 1
BLAST of Spo05451.1 vs. UniProtKB/TrEMBL
Analysis Date: 2018-06-29 (blastp Spinacia oleracea peptides vs. UniprotKB/TrEMBL) Total hits: 5 Position : 0 Zoom : x 1
BLAST of Spo05451.1 vs. ExPASy Swiss-Prot
Analysis Date: 2018-06-29 (blastp Spinacia oleracea peptides vs. ExPASy SwissProt) Total hits: 0 Position : 0 Zoom : x 1
BLAST of Spo05451.1 vs. TAIR (Arabidopsis)
Analysis Date: 2018-06-29 (blastp Spinacia oleracea peptides vs. TAIR) Total hits: 1 Position : 0 Zoom : x 1
GO Annotation
GO Assignments
This gene is annotated with the following GO terms.
RNA-Seq Expression
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