Overview
Sequences
The following sequences are available for this feature:
Legend: exonfive_prime_UTRpolypeptideCDS Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.ATGCACTTAATCATTCAAATTTAGAGCCAGCGACGTTAATGAAATATCTACCTCCACCCGAAAGATTTATACCACCATACAAAGTGTACTTGTTGGTGTCTTTTGGTGATCTTCTAATGGTCTCCCGACACAAACGGTGTATTAATGATGAAATTGAGGATGATCCGGATGATTTTTCTTATCAAACAATAGACTTTGAGGTATACAAACTCAATTTAGGCACTAAAAATTGGAAGCGTGTTTATGAGTTAGATGATGTTGCATTATTTGTGGGGGACAATACTTCTATGTCCGTTCGTGCATCAAACTTTAGTAATTGCAAGAGCAATTGTATTTACTTCACCGATGATGAGTGGCAATTTTGGGATACGTCGGAGGTTAAGGGGGGGGCATGATATGGGACTTTTCAACATGACAAACAAGAAGATCGAAACTATTTACGAAGGTGATGACATGCGTTCTACTTTCTGTACTGCTTTATGGTTCATGCCTATGTTCTAGTGAAATGTATTGTATCATCAAACCTTTTTAGTTTTTAGGTAACTTTAATAATTTGCTTAATGTTTATGGGCTAAGTTTGTTCTTTCCCCTTTTTGGCGTGTATCATTAATACTTTTGTGCCCCTTCCATAATTTGCTTTATGATTTTTTATTTTTTTCGGTTTGAAGCAATGTATGTACGGAGTATGATTAAGACTTTTTGTGTAACTCATTCAAATAACATCCATTTTATTTTTATTTAAATTGTACTTGATGTATGACTATTGAATTCTATTAAGTATTAACATGCCTTATCTGGTTAGAGCATCCATAAATCATGTTCATGTATATACGAGTATGTACGAACACGATACAATTTATACATAACCAACATAGATATGAAAATTAGTTGTCTCCACTATAATATAATTGTATAATCTGTAATGGAATGACAATATAAGCTCGTAAATGAAAAGAAACCCAACAAACAAAAGATCTTGAATCTTTGGCTGAATAGAAGAATGTTAGATCGGCATTGATATCAAGAAAACTGAACAACTCATTTTTGTGATTGATGTTCAAAATAGAAAATCTTACAACCTTTAAAAGTGAGGAGTTGAATTTTACTATTCATCCAATAGTGTAGTGATGGAACTGCCCTCAACTTCCTTCACAATTTCGTTTTTGCCCTCCTCCTCATATATTTCGCCTGAGCAAGCTCCTCGTAGCTTGCCTTCATTCTGTACTATCTTGCACCTCTCTCCTGATATTCAGCTCTTTTCTCTCTCCTCATTTTCTCTGCCATTCAAGCTCTTCATTTTCTAGGGTTCTAAACTTCCATTCCCTTCTTCATAATTCACTCCATCGAATACCAAACCACTCTAACTCCTAACTATCAATTTCAAATCGAAACTCTAAATTCTTAATTACAGAGTGACCGACGAACGATTTTTGGAAAATTAGGGTTTATGTTCTTCAGAAAAGGTCAGATCTTCGCGTGTTTTGACCAATTTAATGCTATTTTCGCTATTTTTGCTGATTGTTGATGAGATTCTGTATGGCCATGTCCCATCGAAGGTGTGTTTTCTTTTGTCATTATTTATCCAGGACTATGGATTTCGTTTCATATGATATATAGGTGAGGCCTCATTCTTGTGTATATTCTGCAGATCTGCTTTCCTCCTTTGCTCCTTCCCACTCGCTCGAACCAAATCCAACACCAGGTATCATCAATATTTCTTCATCTTTACATCATCAAGTGATTTCTAAGTTGTTAATCTGATTTTATTTAAGTATTAAATTAGAGTAATGTGTGTTGCAGAGATGAAGATTATTGCCGCTTGCTTGTTGGTTGCTTTGGGCGGTAAAGCTTGCACTACTGCCGGTGATGTCAAGAAATTTTTTGGATCAGGTATTTTTTCTCGTCTTTTTTTCATAATGGAGCTTGATTGATGAAGATAATATGTAAAATATTTATGGAGCTTGAGTAAGGGGGGGCTTGATATGGGACTTTTCAACATGACAAAGAAGAAGATCGAAACTATTTATGAAGGTGATGACGTACGTTCTATTTTCTGCACTGCCTTGTGGTTTATGCCTATGTTTTAGTGGGTTATTATTTTCATTTTTTATTAAGTATTGTATCATCAAATGTAACTTTAATAATTTGCTTAATGTTGATGGGCTAAGTTTGTTTTTTCTGCGTGTATCATTAATACTTTTGTGCCCCTTCAATAATTCTCTTTATTATATTTTTTTGGTTTGAAGCAATGTAGGCACGGAATATGATTAAGACTTTTTGTGTAACTTATTCAAATAAGATCCATTTTTCTTTTATTTAAATTGTACTTGATGTATGACTATTGAATTCTATTAAGTATTTACATGCCTTATCTTGTTAGAGCATCCATAAATTATGTTCATGTTATCATGTATATACGAAATTACGAGTATGTACGAACACGATACAATTTATACATAACCAACATAGATATGAAAATTAGTTGTCTCCACTGCAATATAATTGTATAATCTGCAATGGAATGACAATATAAGCTCCTAAATGAAAAGAAACCAAGCAAACAAAAGACCTTGAATCTTTGGTTGAACGAAAGAATGTTATATCAACATTGATATCAAGAAAACTGGACAACTCATTTTTACTTTGTTAGCATATTCAATCCTTGTCATTCATTAAGGTAAATGTTGTTGTTATCTGACAACTTGTTACGCCATTGGTTGAAAATCGAATTCAATTTGTTACTAAGATATATCATACATGACCTTATATGACTTTTGGACACTTAGAAGGTTCGAACTACCTTGATTTGCTCTTATGAAGGTTTGCATTTGCTTATATAGTGGAGCAACTTTTGATATCTCTTGCATTTGTTCAAATGACATGGTTCTGTCTTTTTATCACTTCTGTCATACTTGCTTCTTTACTTTATCATCTATGTATATATTGGTTAGATCGTTGAAGAAAGTAATAGGCCCGTTAGCATGGTTGTTGACCAAAATTAAGGGGTTGTGTGTTTCGTGGGTTGTTCTTTGTTGATAAAATAATATGTCATGTTTTGAAAACATATCATATTAATTTTGCTGTTTCTGAGATGGGAAGAATTGTCAGTTGGCCTGTGGCACTAGGTTCTGGTAGATTGCCTTCTATGATATAATTTAGGAGCTATTGTGCAGCCTGTGAAAATCTGGTGCAAGATCATGCGCTAATACCTGTTGTGTTGTTCTTAAAACTATAATGTATGCAATATATTGTCTGCATCACTGTTGACAACCTATTAGTTCATATTTGTATATTTGCATTTTCTCTTTACTGGTTTGGTTATTTTTGCTTGAAAGAATCAAATATAAAAATTGAACTAATGAGAGTGATATAATTATAAGGAGGCAATGTGACTAGAATTAATGAGGCTAAGAATTATATCTCTTGATGTCTTTGAACTTCAGATTATTGAGCAGACTATGAATTGCATGCATTGCTATTATTGATGTCTGATTTTATAGTCGTTTTGGACTCCTGTCCTGATGACCGTCTTTTAGTTTATTTACTTTGTAAAACCTAGGAGTGTATGTGGCATAGATGTTCAGGAGTAAAAATTATCTAACTGTAAGGCATGACCTAAGACAATCAGTTTGGGACAGGCAATAAAGAGATTGAAGAGAGATGATACGCATACAATGGGTGTATGTGTTGGACCACATACAAAACAATCTCAGCCGTTAGATTTAGATCTGTCCAAAATTTTAGGCGGGGAAAAAGGGTGATAGAAGGCGGTAAAATTTTGGGATTTTCCCGGGTAATAGAAGAACGCAGCGGGAAGTTTTGGCATGGGCGCCAAACTTCTGCATAGAAAAATTGGAAGCGTGTTAATGAGTTAGATGATGTTGCATTATTTGTGGGGGACAATACTTCTATGTCTGTTCGTGCATCAAACTTTAGTAATTGCAAGAGCAATTGTATTTACTTCACCGATGATGAGTGGCAATTTTGGGATGCGTCGGAGGTTAAGGGGGGGCATGATATGGGACTTTTCAACATGACAAAAAAGAAGATCGAAACTATTTATGAAGGTGATGACATACGTTCTGTTTTCTGCACTGCTTTTTGGTTTATGCCCATGTTCTAGTGAAATGTATTGTATCATCAAACCTTTTTAGTTTTTAGGTAACTTTAATAATTTGCTTAATGTTTATGGGCTAAGTTTGTTTTTTCCCCTTTTTGGCGTGTATCATTAATACTTTTGTGCCCCTTTAATAATTCGCTTTATGATTTTTTATATTTTTTCGGTTTGAAGCAATGTATGTACGGAGTATGATTAAGACTTTTTGTGTAACTCATTCAAATAAGATCCATTTTATTTTTATTTAAATTGTACTTGATGTATGACTATTGAATTCTATTAAGTATTAACATGCCTTATCTTGTTAGAGCATCCATAAATCATGTTCATGTATATACGAGTATGTATGAACACGATACAATTTATACATAACCAACATAGATATGAAAATTAGTTTTCTCCACTATAATATAATTGTATAATCTGTAATGGAATGACAATATAAGCTCGTAAATGAAAAGAAACCGAGCAAACAAAAGACCTTGAATCTTTGGCTGAATGGAAGAATGTTAGATCGGCATTGATATCAAGAAAACTGGACAACTCATTTTTGTGATTGATGTTCAAAATAGAAAATATTAGAAATGTAAAAACAATAGATGTATGCGTGTTCTAAGCGACCGATCTACCTGAAAAGTAGATGCCACGCTGTATAGTACTTCGTATATAGTAAGAAGAAGTAGAAACTAGATTAGGACGAGATAGTCTATATTTTAATAATAATTACCCAAATCTAGCTGCACACCAAGCTTATTGACCCACTTGGCCCAATAACTCAAGCCACAAGTATTCAAAAAAGTTACAAGATCAAACAATTTCTATAGTCTTGATCCTGAAAAGATGTGTTAATTGGCCAGGTGACGTTGCTACGAAAATTGATCTTAGGAGGAAGAAGCAAAAAAATAAAGGAAGAAATGCTTATTTTTAAATATTAGGAGGCTAGAGATACTTCATTTAAGAAATAAAATGATCGACAAATAGTCAGATCTATAACCCTTATAAACGCAACAACTTGAAGTTTGGAACAGTAACTTTACATGAACTACCAATTTTACCCCTACTTCGTTACCTTTGCCAGTTGCGTTCTATTCTCCTCTCCCTCGGTAACGATGCCCAACCTCCTCTCCCTCAGTAATGGCGCCCAACCTTCTTTGCCATATGTGATCTTCTCCTCTCCCTCAATAATTGCACCCAGACAAACTCACCAGCCAAGCCGTCTCAACCTCAACCACCGTCTCCGTCACCTCCTTGCCGACGTTGATGCGCGTTCCTTCTCCTTCTGTAGACCGAATAATGGTGGCCGACGGGGTAGGGCAGTGAAGAGTAGAAGTTTGTTGTTCTCTCTTCTTTGATTTTTCGTGCTCATTTTATCTTGCGAAATTTTACTAATTGAAATTGATTTATGTTGCTGAAATTGGTAGAGTTTTTTAATTTTAATTTTGATTTAGGATTTTGATTTAGGTTTTTTATTTTAGGTTTTTGATTTAGGATTTTGATTAGGTTTTTTATTTTAGGATTTTGATTTAGGTTCTTTATTTTGCTTTTGATTTAGGATATCTGGTTATTGGTGATGATTCTTGA ATGCACTTAATCATTCAAATTTAGAGCCAGCGACGTTAATGAAATATCTACCTCCACCCGAAAGATTTATACCACCATACAAAGTGTACTTGTTGGTGTCTTTTGGTGATCTTCTAATGGTCTCCCGACACAAACGGTGTATTAATGATGAAATTGAGGATGATCCGGATGATTTTTCTTATCAAACAATAGACTTTGAGGTATACAAACTCAATTTAGGCACTAAAAATTGGAAGCGTGTTTATGAGTTAGATGATGTTGCATTATTTGTGGGGGACAATACTTCTATGTCCGTTCGTGCATCAAACTTTAGTAATTGCAAGAGCAATTGTATTTACTTCACCGATGATGAGTGGCAATTTTGGGATACGTCGGAGGTTAAGGGGGGGGCATGATATGGGACTTTTCAACATGACAAACAAGAAGATCGAAACTATTTACGAAGATCTGCTTTCCTCCTTTGCTCCTTCCCACTCGCTCGAACCAAATCCAACACCAGAGATGAAGATTATTGCCGCTTGCTTGTTGGTTGCTTTGGGCGGTAAAGCTTGCACTACTGCCGGTGATGTCAAGAAATTTTTTGGATCAGGATATCTGGTTATTGGTGATGATTCTTGA ATGATGTTGCATTATTTGTGGGGGACAATACTTCTATGTCCGTTCGTGCATCAAACTTTAGTAATTGCAAGAGCAATTGTATTTACTTCACCGATGATGAGTGGCAATTTTGGGATACGTCGGAGGTTAAGGGGGGGGCATGATATGGGACTTTTCAACATGACAAACAAGAAGATCGAAACTATTTACGAAGATCTGCTTTCCTCCTTTGCTCCTTCCCACTCGCTCGAACCAAATCCAACACCAGAGATGAAGATTATTGCCGCTTGCTTGTTGGTTGCTTTGGGCGGTAAAGCTTGCACTACTGCCGGTGATGTCAAGAAATTTTTTGGATCAGGATATCTGGTTATTGGTGATGATTCTTGA MMLHYLWGTILLCPFVHQTLVIARAIVFTSPMMSGNFGIRRRLRGGHDMGLFNMTNKKIETIYEDLLSSFAPSHSLEPNPTPEMKIIAACLLVALGGKACTTAGDVKKFFGSGYLVIGDDS Relationships
The following mRNA feature(s) are a part of this gene:
Homology
BLAST of Spo06574.1 vs. NCBI nr
Match: gi|902194110|gb|KNA12455.1| (hypothetical protein SOVF_125880 isoform A [Spinacia oleracea]) HSP 1 Score: 102.4 bits (254), Expect = 5.500e-19 Identity = 49/49 (100.00%), Postives = 49/49 (100.00%), Query Frame = 1
BLAST of Spo06574.1 vs. NCBI nr
Match: gi|902194111|gb|KNA12456.1| (hypothetical protein SOVF_125860 isoform B [Spinacia oleracea]) HSP 1 Score: 100.1 bits (248), Expect = 2.700e-18 Identity = 48/48 (100.00%), Postives = 48/48 (100.00%), Query Frame = 1
BLAST of Spo06574.1 vs. UniProtKB/TrEMBL
Match: A0A0K9QYW7_SPIOL (Uncharacterized protein OS=Spinacia oleracea GN=SOVF_125880 PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 102.4 bits (254), Expect = 3.800e-19 Identity = 49/49 (100.00%), Postives = 49/49 (100.00%), Query Frame = 1
BLAST of Spo06574.1 vs. UniProtKB/TrEMBL
Match: A0A0K9R0X0_SPIOL (Uncharacterized protein OS=Spinacia oleracea GN=SOVF_125860 PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 100.1 bits (248), Expect = 1.900e-18 Identity = 48/48 (100.00%), Postives = 48/48 (100.00%), Query Frame = 1
The following BLAST results are available for this feature:
BLAST of Spo06574.1 vs. NCBI nr
Analysis Date: 2018-06-29 (blastp Spinacia oleracea peptides vs. NCBI nr) Total hits: 2
BLAST of Spo06574.1 vs. UniProtKB/TrEMBL
Analysis Date: 2018-06-29 (blastp Spinacia oleracea peptides vs. UniprotKB/TrEMBL) Total hits: 2
BLAST of Spo06574.1 vs. ExPASy Swiss-Prot
Analysis Date: 2018-06-29 (blastp Spinacia oleracea peptides vs. ExPASy SwissProt) Total hits: 0
BLAST of Spo06574.1 vs. TAIR (Arabidopsis)
Analysis Date: 2018-06-29 (blastp Spinacia oleracea peptides vs. TAIR) Total hits: 0
GO Annotation
GO Assignments
This gene is annotated with the following GO terms.
RNA-Seq Expression
Co-expression
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