Spo06730 (gene)

Overview
NameSpo06730
Typegene
OrganismSpinacia oleracea (Spinach)
DescriptionUnknown protein
Locationchr5 : 50926472 .. 50932050 (-)
Sequences
The following sequences are available for this feature:

Gene sequence (with intron)

Legend: five_prime_UTRexonpolypeptideCDSthree_prime_UTR
Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.
GGATCGGATTTATTACCCATCAACATAATCTGTCCAATACGGGTATCTTTTTCGATGTGTCGTGGGTCAAGTTTTTCTAACACATCTCATTTCAACCCAACCCACAAAACCCAACCCCACCCAACCCACTTAACACTTGAACCTAACCCACATCATCCCCCATAACATGTCTAAACCCACTAGACATATCTGACCCATCATACGTCAAAACCTATACAAATCAACCAAACCCATCGGACCCTTCGCCCCGCACAACCCACCACGACCTATCACATATTGTGTCCATTTTTATCGACACAACCACGACCCTATCCAACATGACTTTCCCTATGTTGGTCGTGTGTCAACTAATACACAAATCATAACCCACCAAACTCATATGTGACCCGCCCAACCCACCTTGTGCCTATCTCTAAACATTAGAGCCCATAAATTCTTATTTAAAACTGATGTACGATAAATATTATACAATCCTACCCCTTTAAAAAGCAAGAACTCCCTTCTTAACTCTCCTTAAGAATAGTGGAATTACGTCCACGTCCTTAAATTCCTTCATTATTTACGTCCCTTCCATTACCAGCTGTCAGTTTTTCATTAACATAGATCCAGATGTCCCCTTCCCTGTCTTCGTCCTTCTACTTCCCCCTCTGCAATGGCGTTCTTCACCTTTCTCGGTTTTTTCTCTCCATCTTCCCATGTCTTCGTACAGCTCCTCTATTCCTCCTCTATCTTCTCTCTCCTTCGCCTATTTCCCATCAATACTCTGAATTAACAGTAAACCCTAAATCCCTAATTTTGGGATTTCAATGAACCAGAAGAATCACAAGATTCCAAGCAATGCCTTAAGGTGTCCACCCCTCTTTCTTTTTCTTCGTGCGGCTGATTTCCTTTCCTCGACATGCCGTAGGTGCCTCCACCCTCCTCTTCATCGCGGTGGCCCCTCCGCCATCTTCTCTCCTACCTTTCTTCTTCGATCTGCTGGTAAATGCGAGTATCCAACTTCTGGTGGGTATTCTCCATTCAATTGTTCAATTTTTTTATTCCACTCTTAATTATGGTTTATTTATTATAATATTTTTTTTTTTACAACTCTTGAAATTGAAAAGTTCAGGTTATTAAAGAAGCATGGTTGGATGGAAAGCACAGGTTTTGGTTATTTTCAAGAGGTTCATTTTCACTTGCACTCATCCAATTATTCTATTTTAGGGTTTTTTTTATTGTTGTCGAACACTTTTTTGATCTCTAACAATCACAAATTTATCATTGAAATTTGCAATTCAATTTAATTGATTCATAGTACAAGACGATGATTGAGTATTGCTTAATTCTGCAATATTGTTACTTTCATTTGGGTATTGCTCAATTTTATGTGTTTCTTATGTATTTGATTGTGGGGGTACTGCTATCAAATCATCATTTGATCTAGGTTTTGCTTAATTTGATTCTTGCTTAATTTGATTGTGGGTAGTGATTTACAGTCGCTAATTTATCTGGATCTCTAATTATGGGAATTTTCCAAACTTTATGGTTAAGTTATGGTTTGGTGTCCTTTTAATGTCGAAACAACATAATATCAGGAACCAAACTGAATATCCAATTCCACTTTTCTGGAGGGACGAAGTATGGTGGTTGCAAAGGTTATGTTTTGTGCCTCGGTGGCTTTTGTGATGGTTAACTATCACATTTTTTTTAAGCTCTTGACTTTCCTTTGGTACTTGGGGGGTTTTGTGTGTTTTTTCTGTGAGTGGTTGCTATTTTGGTACTTCTAGCTTCCGAGTTTAGCTATCCCTTCAAGTGAGTGGGTTCCTGTGCATAATGTATCCATTTGTAGGGGGTCAATTTGAATTCTATAAAGAGGGATATGACATGCCTGCTCAAAGTGCTTTCTACTGTTTGGTCACTTGGTGGCCTTTAAGTTCACTCATGTAACTCCACTTCAGTAACAACATTCTAGATTTATGGGAACAAAATAACTCTATATACGTTATATAGAAATAGCATTTGCTAGAAAGGGTCAAAGGGATAGGAGGGAAAACAAGCACATATCAATAAGTTCCTAACAATGTTGTACCCTTGTACAACTCTACTGCATGATAAGATGTTATTACTATATCAGGAACTTATTGAAGTTTGTCATCAGCCTTCTTCCCCATTCTTCGGGGAAAGTTTGTTATATATAAGGGAGCTAACTCATTTTTAACATCTGGAAGAGGAAGAAAAGTAAAAGGATGAGAGTGTTTGTGACTCCCTTGTTTACTTAGAAGTGAAAACAAAGAGGTAAAGGAGATGTTGAGATTAATACAATGTATTCATTTGAAAGGATTCTTTAGTGGCATAAGAAGAGACGGGACCTCTAATTTTTCCCTAGGTTTTTTGCATAACATTTCCATTGGGCATTTTGGGGTTGAGAAATGACGAGTGTCCAAGAGGGAGAGGTATCCTAAAGCTTGCAAAATTAGGATGTACCATGTCCTGCTGAAGTTTGGCTTATTAACATTTTTCAACTGGTCGAGAGCTTATGCAAGGGTGAAGCTTGAGCTACTGAAGTTAAGGCCTTATGTTACCTTCTTCTTCAAGAAATTAAATAAAGCTTTGCTTAATATATATATATTGTCAATATTATATGATTGAAAAATTTTATATGCTGTTAGTTGATATATGATATATCATTTCCCTAGGCTTATGGGTTATGTTTTTTCTGCATTGTTAGCTAAAGTATTTCCGATACCCATTTCTCAAAAGCGTATTGGTGTTTATAATGTATAAGATGTCCACATATATTACTTCCATTAAATCAATGAAGTCTGTTATGAAAGTTGAACACTGTTTTTGTCGTTATACTCCGAGCTCCATCTTGAATTTAATGGTGTTTTCATTAGAGTATTCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNCCCCCCCCCCCCCCTTAAAATGGCTTTCATGTATTAATGTACTACTGCTCGTTTTCTTATCATTTACTTTTTGTAGCAATTGATTTTATTTTAGTTAGGTTGGCATCTAATCATCTATGACCGTTTAGTTTTGCTTGAAGAAAGGGGGTTTTTTAGCACAATTTTTAGTTTGGACTTAGGGTCTTTTTTTTTTGAACATAATTGTAAAATTCATGTATAGTTTAAATAGCTTATGGCTTCTTTGTAAATCGACTTTAGGCATTAGACAAAATCATATTGTCATGTTGTTAAGTTTTTTTATTTCCACTTGCCTTGGACATTAGGGGAATGTTAAGTGAGATATTGTCGTCTTTGAGATTCCAAGGGGAAGCCACCTGGTGTAATATTGAGTTTCTGGTCTGCAAAGGCTATTACATTTCTTGATAATCATGACACTGGCTCAGCGCAGGTACTTTACTTACTGTATATTGATGCAATAATAAGTCAAATGCATATTCTAGAAAATTCTTGCATGCCGTAAGTTGGAATGTTGGACCATAGATGGAATAATATGTGGAAGGCAAACCACCGAAAGTAAATTGGACTATAAGTTTAGTTCAAGCAGTTTCTCCTTGATTTTTTTCATTTTTACTGTGTAATATACTTCGTATGTTTTTTCCTTCGTTATTTTTCACTTTTACTTCGTATATTTGACTACACGTAAGCAAACAATGTGAACATTAGTTTCTATTTGGAGAACAAAGATAATTTGACTGTGGAGGTTAGACTTGGTAAAGAGGTTGAGTTAAATGAACGTGCTTGGAAAAGTCCGTATGAACAACCTTTAATGTAGCTAGGTCTGCAACAAGCCACCAAGGTTACTTGTGCACTACTTCCAGCATATTGAGTATTTGGGTCAGAGAATGGGAGTAATTTTGGAACATATTCATGGTTTGGATTATTGGAGAGTAGTCTTGGGAATTTGGGTAGACGACCCGTCTCCTACCCTTATATGAGTATCAAATTTGATTTATGCTAGAAGTTGAATAGTGCCTTCATGACTAAATCATGTTCACTATGTTTCTTTTTGTGGTCTGTAAATCTGTAATTAACTCTATGTTAGTGAAATACAAAATATTCATCCATTTGTAGAAGCTTCTTTTGTCCTTAAAAATTATGACTTTATCAGTAATAATTCTTGTGGGAGAAAGAGTGAAAACAGAGAAGACAGGGTTATAGATAGAGGGATAAAAAGTAAGTTGTACCTAAAGATGACAGTTAGAGAGAGAAGGGGAGAGGGAGAGGGAGTGAAGAAGATATATATGGATAGACACTAGAATTTAGAGACAAGATTCTTAAACAATTGTGTTTTATCAGTAATAATACTATCTTTAGTTTTTTTACTTTGTTCCGATTTTGGTAGCATATCATTTATGAACACCCTGATGCAATGTTATTCATGCAAAATACAGAGTATAGTGTTTTGGGGCAATATTATGAGTACACTACACATGGTTTATGTCTTTTCGAGTTTCCTACCTAAAACTTTCTTGCCTTTTCTGCATCAAATGCTACTTATCTGGTTGCCTTTGTGTTCTTGTTCACTTTGATGTTGCTATATTGATCTGTCGTAGTTGGATGAGGTGGTTGTGGTTTATGATACATAACCGATCAGCTTTTTCTGTTGGCTAACGTGTTTGTGTAATCGATTCTTGTATAGGTCTCTTTGATTTGAAAGGTAGAAACTTACAGAGATCAGACTTGATTGAACTGAACTAATTTTGCATTGCAAAGAACAGACACATGTCGTCATCAAGGCTTCAGTGGTCCAACAATTGCGATGCTCTTCTAGGTCTATGGATATATATACTGTAAGTTGTTCACTTAACTTTCTGCAATATATCTAACTAGAAGGAGATTGATTTATATTGTGCATTAATGATTTAATGGGTTCAGGTTCCAAGTACCTTTTTGCAACAGAGATCAAGCATCTTTTCTGCATTAACCTTCATGCACATTGTGAAAAA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mRNA sequence

GGATCGGATTTATTACCCATCAACATAATCTGTCCAATACGGGTATCTTTTTCGATGTGTCGTGGGTCAAGTTTTTCTAACACATCTCATTTCAACCCAACCCACAAAACCCAACCCCACCCAACCCACTTAACACTTGAACCTAACCCACATCATCCCCCATAACATGTCTAAACCCACTAGACATATCTGACCCATCATACGTCAAAACCTATACAAATCAACCAAACCCATCGGACCCTTCGCCCCGCACAACCCACCACGACCTATCACATATTGTGTCCATTTTTATCGACACAACCACGACCCTATCCAACATGACTTTCCCTATGTTGGTCGTGTGTCAACTAATACACAAATCATAACCCACCAAACTCATATGTGACCCGCCCAACCCACCTTGTGCCTATCTCTAAACATTAGAGCCCATAAATTCTTATTTAAAACTGATGTACGATAAATATTATACAATCCTACCCCTTTAAAAAGCAAGAACTCCCTTCTTAACTCTCCTTAAGAATAGTGGAATTACGTCCACGTCCTTAAATTCCTTCATTATTTACGTCCCTTCCATTACCAGCTGTCAGTTTTTCATTAACATAGATCCAGATGTCCCCTTCCCTGTCTTCGTCCTTCTACTTCCCCCTCTGCAATGGCGTTCTTCACCTTTCTCGGTTTTTTCTCTCCATCTTCCCATGTCTTCGTACAGCTCCTCTATTCCTCCTCTATCTTCTCTCTCCTTCGCCTATTTCCCATCAATACTCTGAATTAACAGTAAACCCTAAATCCCTAATTTTGGGATTTCAATGAACCAGAAGAATCACAAGATTCCAAGCAATGCCTTAAGGTGTCCACCCCTCTTTCTTTTTCTTCGTGCGGCTGATTTCCTTTCCTCGACATGCCGTAGGTGCCTCCACCCTCCTCTTCATCGCGGTGGCCCCTCCGCCATCTTCTCTCCTACCTTTCTTCTTCGATCTGCTGGTAAATGCGAGTATCCAACTTCTGTTCAGGTTATTAAAGAAGCATGGTTGGATGGAAAGCACAGGTTTTGGTTATTTTCAAGAGGGGAATGTTAAGTGAGATATTGTCGTCTTTGAGATTCCAAGGGGAAGCCACCTGGTGTAATATTGAGTTTCTGACACATGTCGTCATCAAGGCTTCAGTGGTCCAACAATTGCGATGCTCTTCTAGGTCTATGGATATATATACTATACTCCAGCAGAAATGGGCACATCTAGAAAGAGGTCGATGGATCTTAGAGGATACAAATGACCTGCGCTGATGTCCAAGTGCACCATTACCGCCATAATGTTGTGGAAGTTGTTCAAAATTATTGATTTATAGATGTTATTGTTGCCTCTAGAGTTGATGTACAAGTCCGATACAAATAAGTCGTTTTAGCCTTTTAAGTTGGGTCAAGTTTTACCGCTAAATCTAGCTTGTCAGCATAACAATAATGGTTATCCAACACTTTGTAAAGGATATGATTGACTAGAATGAAAACTTCTATTGAGCCATACAGAGTATTATTGTAATTATAGCTTAAAATTATTATATGATATGATGTATAATTTTATTTATTTTTGAATAATGTATTTCAAAAAGAATATGCAGCCTTCAATGAAGTTCTCATATTCTTCTATATTTTTAGTAAACATCACAACTATATTACAGGGACATTTTATATAACTAACTAGATTAGCCCC

Coding sequence (CDS)

ATGGTTGGATGGAAAGCACAGGTTTTGGTTATTTTCAAGAGGGGAATGTTAAGTGAGATATTGTCGTCTTTGAGATTCCAAGGGGAAGCCACCTGGTGTAATATTGAGTTTCTGACACATGTCGTCATCAAGGCTTCAGTGGTCCAACAATTGCGATGCTCTTCTAGGTCTATGGATATATATACTATACTCCAGCAGAAATGGGCACATCTAGAAAGAGGTCGATGGATCTTAGAGGATACAAATGACCTGCGCTGA

Protein sequence

MVGWKAQVLVIFKRGMLSEILSSLRFQGEATWCNIEFLTHVVIKASVVQQLRCSSRSMDIYTILQQKWAHLERGRWILEDTNDLR
Relationships

The following mRNA feature(s) are a part of this gene:

Feature NameUnique NameType
Spo06730.1Spo06730.1mRNA


Homology
The following BLAST results are available for this feature:
BLAST of Spo06730.1 vs. NCBI nr
Analysis Date: 2018-06-29 (blastp Spinacia oleracea peptides vs. NCBI nr)
Total hits: 0
Match NameE-valueIdentityDescription
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BLAST of Spo06730.1 vs. UniProtKB/TrEMBL
Analysis Date: 2018-06-29 (blastp Spinacia oleracea peptides vs. UniprotKB/TrEMBL)
Total hits: 0
Match NameE-valueIdentityDescription
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BLAST of Spo06730.1 vs. ExPASy Swiss-Prot
Analysis Date: 2018-06-29 (blastp Spinacia oleracea peptides vs. ExPASy SwissProt)
Total hits: 0
Match NameE-valueIdentityDescription
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BLAST of Spo06730.1 vs. TAIR (Arabidopsis)
Analysis Date: 2018-06-29 (blastp Spinacia oleracea peptides vs. TAIR)
Total hits: 0
Match NameE-valueIdentityDescription
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GO Annotation
GO Assignments
This gene is annotated with the following GO terms.
Category Term Accession Term Name
biological_process GO:0005975 carbohydrate metabolic process
biological_process GO:0034645 cellular macromolecule biosynthetic process
biological_process GO:0009987 cellular process
cellular_component GO:0005794 Golgi apparatus
RNA-Seq Expression
   



Co-expression
Gener valueExpression
Spo031630.70Barchart | Table