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Sequences
The following sequences are available for this feature:
Legend: polypeptideexonCDSthree_prime_UTR Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.ATGGATAATTCCGAAATGTACAAATTTAAACACAAAAATGTACATTATTCACCTTTAGAAAAAGTAAATTCAGATGACGAGAAGAGCATGGAAAATTAGGGCGGCTAGAGTACATTGAACACCCCTTATAGGACACGACTTAACTGTTTGCAGTATTCACTCATGGAAGGCCCGATGCCTGACCCGGTCCGACCCGACCCGACCCAATATGAAAAAAGCACGGCCCGACACAGGCCCAACAAAAGCGGGGCACAAGCACAAAGTCGTGGACCGGACCTGAGCCGTAAGCATGACAATGCACGACACGACTCGACCCGACACAACAAAACACGCTAAATTTAGTAAAAGTAGGTTTGGTGTAAGAATCCAACCTTCCTTGCCTTGTACTTTTCTTATATTTCCTTGTATTTTTCTTATCTAAGCTTTCTAGGATTTTTCTTTTAAGTTTATAGGCTTTAGATAAGATTATTATGTTTCTGTCATTCCAGTGTTCACTGGCAGTTTTTAGCTAATTCAAAATAAACCTCTATGAAGGGTATGATTGTATGAACCAATACCTCTCACCAGAAGTTGTCTTTGCTTAATCACTAGCGTTGTTGTAAGATTTTATATAAATATTGTGTTTCCGCTAGTTTAAAAACTTCCTTGCCTCAACAAAGTCTCCATAACAAATACACTCGCGTCATCGGCCCCACTGGTGACTGTTGTGCGCACTCAAGTGTCCGATCGGCTTCCACATCCTATTCTTGTCACCAATAAACAAGAGCGCTCCTTTTCAGAAACCTTGCTCGATCGTTCGTGCTTCACATGCCCCTTTGAATTCATTCTGCACAAGGCTTGCACGGTTGTGCCCCTACCGCCTAATAGGTAGGAGCACGCTGCACAATCCGGTGCCCAAAACATTCGGACCGTGATAGTTAGTATCAGATCCAAGGCTCAAACCGAGAGACCTGAGGAAGCACATCAAGATGGAATCGATCCTAGAAAGACTTGCCTGGATGGAAGGAAAGTCAGAATCATGGACCCATATTGAAGAGATTGTCATCAAGCAAGGTAAGCGGATCGACGATCTCGAGGCTGACGTCGAAGAACTGAAAACAGAAAAAGACTCATTACGCGAGAACCTTAACTATGCATAAGGGATGGTTGATGACTCACGGGACAAGTGCGCTACTCTGATGCGTGCTAATAGAGACATTGGTGGTTGTGGTACAAGCCGAATCAAGCCACCCAAGCCTCGTATCTTATGCAGTGCGAAGGACTCCAAAGAGGTCGATAACTTCATCCTCGACATGGAACAATACTTCAGGATTTGCCAACTGAAGGACAATCTGATTGTGGACACTACAACAATGTATTTGGCAGATGATTCTAATCTCCACTGGCGTTGTAAGTACGTCGACATCCAAGCCAAGAAGATGGTGATTGATACATGGGAAGAGTTCAAGGCAGATCTCATATCCCAATTTACCCTAAAAATACAGAATTCATTGCTCGGACGAAGATAACAACCTTGCAACATAAGGACTCCATTTGATAGTACGTGAAAGAGTACTCCGCGCATGCTCGACATTAAGGACATGGCCGAGAAGGATCAGTTGTTAAACTTCGTGAAGGGATTGAAGGAGTGGGATCAGCGTGAGATATGGCTCTCAAAAGTAGACACCTTATCAGGTGCCATTGCGGCGGCAGAAAGACTGATGGATTACTCATCCGATAGAGCTCCAATTCAGAAGAAGGGGAACAATAACTCAATGACAAGTACTCCTAAAAATTCAGGGAATGTCTCCCAATCTAGTTTCAACAGTGTAAGGAACAAGTACCGAAGTGGGGTAGAAGACTCACAGAAGAACGGTGGCTCATCCTCTTCCGATAAGGAAGGAGCTCATTCAAGATCTTCGTCGCGGAACAAAATCCTCACTTGTATATTGTGTCGTGGACCACACAAATGGTTTGAATGCAAGCATAAGGAATAAATTGATAGTTTGCGGAAGAAATTGTCCGCTATGTCTACTTCAGAGCCGACTCAAGAGGATGACAGACACTAAATCCTCAATACCTGAGTGATTTGAGATTACTTGTTTGGGAACTGGTTGCTTTGACGTTGACCAACCGTCGCACCGTAAAAGGAGGCTATAAAGGCAACGCTCAGGTAATCACCTATCAAACGAAGTCTAATCTCAAGATCGCAAGATTGGGATTGTCCTCCCATAAATCGGGATGAGATGCTTAAAAGTTGTACAAGGCCACTCGGAGAGCTAGAAACTGTGAAATGCATGGCCGTGCTCGGATGAATCATAGGCTATGATTATCTGTTTATTTGATCAGTTGAACTCTGAAACCGAGGAACACCTCTGGACGTAATAAGGATGACAACTCTTACCTTATGTTCAAGAGCAAGCATCGAGCGACAAAGGAATTAGGAAATGCACACTTGTCCCTAAGGACAAGTGGGAGACTGAAGGAAATAATGCCCTTGGTCCAAGTATGCATTCTATGTTAAGTCTAATAAATGCGGTTCAGTATTAATTAACAAGTTAATAATTCAGTGAGATCAAGTGAGCTGAATGCCTAGCTAGAGGCCGCTTCAGTTCAAGTGGAATTAATGATATTAATCCACAGCTTACTCTTGACTGAACCCGTAGGGTCACACAAATAGTACGTAAACGGATCAAGTATTTAATGGCATTAAATACTCCATCTATGAATATTCGGAACCGACGGATCTTGGTTTCAGTGGGAGCTAAGATCGTCACAGGCAAGAAATGAATACTCCGGAAACGATGATATTGCCGGAAACGGAAATATGGATCGTATCGGAAATATAAATATTATCCAAGTCGTAGATGTTGCCGGAAACGGAAACATGGTACGTATCGGAAAATATTATCGGAAATGGAAATATTACCAGAATCGGAAATATTGCCGGAAACGGAAATATTGTCAGAATCGGAAATATTACCGGAATCGGAAAATAATTCCGGAAACGGAAATATTAAATATTTGTTCGAAACGGAAATTAATTCCGGAATCGGAAATATTAAATATTGTTCGTATCGGAAATGAATTCCGGAATCGGAAAATTTAATCGGAAGCGCATCGTACGAATAAGCATCGGACGAGGCCTGCCGGACGAGGCCCAGCACGAAGCCAGGCCATCGCCCAGCAAGCCAAGCGCGCCGCACAAACAGCCACGCCAGGCCCAGCGCAAGGCCAGGCCCAGCAGGCTGCGCGCAGCGCGCAGCGCGCACAGCGCGCACAGCACGCGCAGCGCGCAGCGCGCGCGGGCGCTGAGTGGGCTGCTGCTCGCGCGCACGCATGAGGCCCATCGTGGCTGTCGTGCGTGTGTGTGCAAGTGTTTGTGTTCGTGCACGTTTCCTAAAACATGCAGAGTTCGGTTAATGATTAAATTCCTAATTCTATTTGATAAATTAATTAAATTAGAGTTCTTGTAGGATTCTAGGTTTGATTAATTTGTATCTGAATAGGATTTCGATTCCCTTTCCATACCGCTATAAATATGAGGCTAGGGCTCACAATTTATAACACAAGTTTCAAAGTATTCAAAGTGAGTTTTTGAGAGAAAAATTCAGTCACACATTTGCCTATAAAGTGCCGAAAATAATAGTACCTTAAGGGCGATTCTAGTTGGTCAATCTTAAGGCGGATCCGGACGTGCTGTGGACTATCTACGGAGGGACGACACTTGGAGTCCTAAAGACTTGTTCTTGTTCGGTTCGGGCGCAGCTAGGGAAGGCACGCAACAAAGAGTATGCATCTAAACTATGCTAAATGATTATGTGTAAATAATATGTTTTCCTGGCTTTATGGTTTTTCCGCATGATTTATGAATTGTCATATGAATCATAACCTAACAGTGGTATCACGAGCCCCTTATTATTTTCATAATCTAAATTGCATGAACATGGTTAAATATTACAAATTTGCAAGAATTAAAAGGGGTGATTAATTTTCGTAATTGTTAATTAATTGCAAATTGCGTTTATTTAATTATACGTACGCAGTTTTTCGGCAGTTTCTTCGTTACTCATCCAAATCGAGTGATTTTTGTGTCAATTCCGCATGTAAAAGGCATTCTAAAATTTTGACAAAAATAGTATTTTTCGGCCGAACCCAGAATTCTCAAATTCGAAGCCTAACTATGACTTTTCGGAGGTTTTAGTTTTTCGAATGCAAAATTTCGTAAATTTAAGATGTTAAATTAAATATTTGCGATTCTTGTTGATAAATCTTGAATTTTTGATTGACCTACTGTATATGTTTAACAAGTTTGAATGCCTAGCCTTGTTAATTATGCAATCTAATTTGTAATTATGATTAATTTGTTGAAAATTGGAATAATTTAGAATTAATTTGATTTTCATAATTAATTATAATTTAATTAGATACCTATGATTAAAAACCACCATAAAAATTGTAAATTTATGTTAAATTTTAAATTTTTATGACCTAGACTTGAATCCATGTTAATCGGAAATCAATTGAATAATAAATTTTCGATTTTTCGCCCTAAAATTATGAAATTAATATTATTTATTAATTTGTCATTAATTTTGAATATAAATTTTAAATTTTTATGCGATTCGCTCATATAACTTGCACGCACAAAGCAATGGACGCTACGTGTTACCCTTAAGGGGTGTTGTATAGTGCGGGCATGTGACGACGAGCAAGGGAGCTCGTCGCCCATGCGGTACGAATGCAATGAGCAAGGCCATGGTGCACGAGCACAAGGCAGCAGCCCTGCCTTGTGTCGTGGGCTGTGTGCAATGGGCGAATGGGCGAGGGCGAGAGCAAGGCACGAGCAGTCGCGTGTGGGCAGCAAGCGAGCTGCGCCACAGCGCGCACTGCCTCGCGCAAGCGTGCGGAGCCTCGCGCGCAGCGAGCGCAAGCTCGCGTGCCACGAGTGCTACGCCCAGCATCGATCGCTCGCGCGCAGCGAGCGCTATTGTGCGTGCGACGAGCGCTGCGCC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ATGGATAATTCCGAAATGTACAAATTTAAACACAAAAATGTACATTATTCACCTTTAGAAAAAAAGAGCAAGAGTGCAAGAAGGCGACAAAAGAAAGTGAAAGCATATGACCTATCCCACCTACATGAGTTCTTGCCTGAGCTGAAAGAACAACAGCAACCTGCTCTTCCACCTAAAGAAGTGAACTGCAAATCCAGACATAAATTATTATTGAAGGAGGCAAAACAAATGACAACAGTCCTAAGTCACCCAGTTTTCCAATTAGATCCACTTGCTGCCATACACCAGCACCTGCAGAACACCCAACCAGCTCCTGAAATAAAACCTGTAAAGAAGTCTAAAGACGATGCAAAGAAAAAAAGAAAGAAGAAAACAAAAAAGTCTTCAGAACCACAGTCCATGGAGATGTGAAATGTCAAATTTGGGTCCGTCAGTATCAATCCCTCTGAAGGCAGGCGTTGTTGAGAGATCAATCTTCGCGGGTACTATGATCAGTAAGATGAGTGGTTCTGTCATTATCTGATATAATATTTGCTTACTTGACTTATTTGGTAGTTTAATCATCTTATATGTCGAATGCCGATGAGGATATAGGGCAATATAACTCAACCACACCAATTTTTTTTTGTTTATTACCTATTTTAAGTGGGTAGATATTGAAATGTCCTTATTTCATAAGGATTGCGATTAATGTATGACTGAAATTTTGTATGTAGATCCCAATTAAAGATGTTTTATTCAAAAACAAATCTGGAATATAAATTAGTTGACAGTTTGACATTAAAGGATGAGAAATAATGATAATAATCCATAAGAAAATAGAGTTAGAATCTATTATCA ATGGATAATTCCGAAATGTACAAATTTAAACACAAAAATGTACATTATTCACCTTTAGAAAAAAAGAGCAAGAGTGCAAGAAGGCGACAAAAGAAAGTGAAAGCATATGACCTATCCCACCTACATGAGTTCTTGCCTGAGCTGAAAGAACAACAGCAACCTGCTCTTCCACCTAAAGAAGTGAACTGCAAATCCAGACATAAATTATTATTGAAGGAGGCAAAACAAATGACAACAGTCCTAAGTCACCCAGTTTTCCAATTAGATCCACTTGCTGCCATACACCAGCACCTGCAGAACACCCAACCAGCTCCTGAAATAAAACCTGTAAAGAAGTCTAAAGACGATGCAAAGAAAAAAAGAAAGAAGAAAACAAAAAAGTCTTCAGAACCACAGTCCATGGAGATGTGA MDNSEMYKFKHKNVHYSPLEKKSKSARRRQKKVKAYDLSHLHEFLPELKEQQQPALPPKEVNCKSRHKLLLKEAKQMTTVLSHPVFQLDPLAAIHQHLQNTQPAPEIKPVKKSKDDAKKKRKKKTKKSSEPQSMEM Relationships
The following mRNA feature(s) are a part of this gene:
Homology
BLAST of Spo07384.1 vs. NCBI nr
Match: gi|902143729|gb|KNA04869.1| (hypothetical protein SOVF_195740 [Spinacia oleracea]) HSP 1 Score: 219.5 bits (558), Expect = 3.500e-54 Identity = 117/118 (99.15%), Postives = 118/118 (100.00%), Query Frame = 1
BLAST of Spo07384.1 vs. NCBI nr
Match: gi|731360245|ref|XP_010691706.1| (PREDICTED: putative ribosome biogenesis protein slx9-like [Beta vulgaris subsp. vulgaris]) HSP 1 Score: 177.6 bits (449), Expect = 1.500e-41 Identity = 97/119 (81.51%), Postives = 107/119 (89.92%), Query Frame = 1
BLAST of Spo07384.1 vs. NCBI nr
Match: gi|658008313|ref|XP_008339347.1| (PREDICTED: uncharacterized protein LOC103402381 isoform X1 [Malus domestica]) HSP 1 Score: 125.2 bits (313), Expect = 8.900e-26 Identity = 69/116 (59.48%), Postives = 91/116 (78.45%), Query Frame = 1
BLAST of Spo07384.1 vs. NCBI nr
Match: gi|658008315|ref|XP_008339349.1| (PREDICTED: uncharacterized protein LOC103402381 isoform X2 [Malus domestica]) HSP 1 Score: 123.6 bits (309), Expect = 2.600e-25 Identity = 68/114 (59.65%), Postives = 90/114 (78.95%), Query Frame = 1
BLAST of Spo07384.1 vs. NCBI nr
Match: gi|657974029|ref|XP_008378833.1| (PREDICTED: uncharacterized protein LOC103441895 isoform X1 [Malus domestica]) HSP 1 Score: 117.9 bits (294), Expect = 1.400e-23 Identity = 65/116 (56.03%), Postives = 89/116 (76.72%), Query Frame = 1
BLAST of Spo07384.1 vs. UniProtKB/TrEMBL
Match: A0A0K9QC60_SPIOL (Uncharacterized protein OS=Spinacia oleracea GN=SOVF_195740 PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 219.5 bits (558), Expect = 2.400e-54 Identity = 117/118 (99.15%), Postives = 118/118 (100.00%), Query Frame = 1
BLAST of Spo07384.1 vs. UniProtKB/TrEMBL
Match: A0A0J8BJI4_BETVU (Uncharacterized protein OS=Beta vulgaris subsp. vulgaris GN=BVRB_9g224080 PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 177.6 bits (449), Expect = 1.100e-41 Identity = 97/119 (81.51%), Postives = 107/119 (89.92%), Query Frame = 1
BLAST of Spo07384.1 vs. UniProtKB/TrEMBL
Match: M5XTD5_PRUPE (Uncharacterized protein OS=Prunus persica GN=PRUPE_ppa012713mg PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 114.4 bits (285), Expect = 1.100e-22 Identity = 68/116 (58.62%), Postives = 84/116 (72.41%), Query Frame = 1
BLAST of Spo07384.1 vs. UniProtKB/TrEMBL
Match: A0A067LQC7_JATCU (Uncharacterized protein OS=Jatropha curcas GN=JCGZ_22136 PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 112.8 bits (281), Expect = 3.200e-22 Identity = 71/117 (60.68%), Postives = 85/117 (72.65%), Query Frame = 1
BLAST of Spo07384.1 vs. UniProtKB/TrEMBL
Match: D7UC07_VITVI (Putative uncharacterized protein OS=Vitis vinifera GN=VIT_03s0180g00100 PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 112.5 bits (280), Expect = 4.200e-22 Identity = 68/116 (58.62%), Postives = 85/116 (73.28%), Query Frame = 1
BLAST of Spo07384.1 vs. TAIR (Arabidopsis)
Match: AT2G01640.1 (unknown protein) HSP 1 Score: 94.0 bits (232), Expect = 7.800e-20 Identity = 56/109 (51.38%), Postives = 71/109 (65.14%), Query Frame = 1
The following BLAST results are available for this feature:
BLAST of Spo07384.1 vs. NCBI nr
Analysis Date: 2018-06-29 (blastp Spinacia oleracea peptides vs. NCBI nr) Total hits: 5
BLAST of Spo07384.1 vs. UniProtKB/TrEMBL
Analysis Date: 2018-06-29 (blastp Spinacia oleracea peptides vs. UniprotKB/TrEMBL) Total hits: 5
BLAST of Spo07384.1 vs. ExPASy Swiss-Prot
Analysis Date: 2018-06-29 (blastp Spinacia oleracea peptides vs. ExPASy SwissProt) Total hits: 0
BLAST of Spo07384.1 vs. TAIR (Arabidopsis)
Analysis Date: 2018-06-29 (blastp Spinacia oleracea peptides vs. TAIR) Total hits: 1
InterPro
Analysis Name: InterPro Annotations of S. oleracea
Date Performed: 2018-06-29
GO Annotation
GO Assignments
This gene is annotated with the following GO terms.
RNA-Seq Expression
Co-expression
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