Overview
Sequences
The following sequences are available for this feature:
Legend: polypeptideCDSexonthree_prime_UTR Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.ATGGGCGCTGCACTCGTGCACGCGGCCCACGTGTGCTGCACTCGTGCACGTGGCCCATGGGCGCTGCCACTACAAGGCCTCGACGAGGCATGGGCGCAAGCCTATGGCTTTGTCTTGGCCCGTTGGTTCGTTTTAATTTTTCGGTTGAAAACGATTTTAATTCAATTTAATTTCGTAATTTAATTTTGAATAATTTAATTATTATAAATTTATTTATACTAATTATTTTACTAAAATTAAAACCTTGATAAAATTTAGATTAATTAATTTTAATCAAATGAAAATAAAAATAAAGGATTTAAATAATATTTTATATGAGCTTTAAATTTTAATTAAATTTGTAAGTTTCCGGTTGGACTAGGAAATACAATTTTATGTTTAAAATTTGTAAAGCATGTAAATTTCTTGGTTTTAGTGGGAGCATTTTAGTCATAAACTCTTGATTAGGTCTACATTCCTTTAAGGTTAAAACAACTCGATTAGAATTAATAAGGATTGAATAATTTGTAGATTATTGGAACCCTTGATTAATTGTTGCAAATATTTATGTGATGCATAATATGTTATACTAACTTGCTATGTGGGCCATTCATTGATAAATTAATGGGTGAATGGTATATTGTAAATGTACTGTTTTGCAGGTTATGGAAAGTGACTAATATGGCCCAAATAGGATAGAAAATATGGTCCGCATACCATTAATTTGAATGTAAAATTGGTCTAATGCACCAAAGTTTTTAATTTTAAATATGGTCTGCGTACCATCAAATAGTTGTAATTACTTTCAATTATAGCTTATCCTATTTGATGAAAATGGCGCCTCCCATGGTGAAATTCAAGACGGAGTTTCCAATCCATTTTCAAGACGGAGTTTGAAGTTGAAGCTTCAAGATGAAGTCGGACCATACTAGATCACTTTCAATACATGTTAGTTTTGGTGAAACTCAACGATATAAGTAAGGAGTCATTTTATGTCGTGGCAAAACAGATAGGTTTACTTAATAAATCCTTAGACGTACCTATCAACCAAGAGTAGTTTCTAGACTATTAGCAAATGATTTGCTTACCTAAAATATTTTAGAATTGAGTCTAAATACATAATGTGCTTAATTCTTCAATGATTTAAGGATCTTGGAATCATTTTATTCACAACTGCCGAAACAATAAATTCGAATAAAATGTCAATGACTTGTTTAAATTGCATGATTGCTTTAATTTTCAAGTTATTACTCTTGATAAGTGTTTAGACTTTGCATGTTTCAATGTATGTTTTAATTATTATTTATAATTAAATGTCTTGCACTGCAATAAATCCTTTGAGAAGGGTAAAAGTAAATTTCCTCGATTGGTAGTGAATCCAAGAACGATTTACGGAAATGAGAGAAAGTGAGCAATTTAAAATGTACGTTTCTTTTAGCGACTTTTATGATTGTTTTCGAGTAAGTTTAAACGGTGAGCTTTATCAATGATCAACAACTTAAAATCATTGTCCATTGAAGGAAAGTTGCGGCTTCGAGGTGTTACGATACTGCAATCTAAAGGAAAAAAAACAATATTCCAACTCGCAGTTGCTCTTGTCTCCTTCCTCGCGCCTCCTCTTCAACTCCTCTTAAACCCTCCAACAAAACCACCACATCTTGTAGTTGTACCACCACCGCTGGTCGGCGGCGCCTCTGCCAACCATCTCTCATTCTCTACCATTGCTATTCTAAGTATGTACCGTCTTTGATTATCTATTTTGTACCTTTTTTTTGGAATTTTTGTTGATTTTATTCGTACTTAAAGATCGGATAAGTGTTCAGTCTCATGTGGGGATGATAGTTTTTTTCCTGATATGATGGTTTCAAATTGTAAGTTAAATTGTACCCACTTCATGATTCTACTTGAAAAAAAATTCATATTATCCCTTTCTCCCTGGCCCCTGGACAGGAGCCCCTCCTTCCCCACGCTCAGCGATGTGTCTGGTTTTATTAGGGTTTTGTTTTCATGTTTGTAGGGATTTGTTGGAAGTCCGTGCAACTATTTTGTTATATTTAAAAAAATATTTGAATTGATTTTTTATTTCCTGTACTGCATTTGAGGAAATGCTGTTTGATTATGGCTAAGTTTAATTTATTTCGATTTATATCAAGTTGCCACTGCTCGTGACTAGCTAATTTTACACGAATATTAGTTAAAAACGAATTTCTCCTTAAAATTGTTAGCTAGTTTCACTGAACTTTTCTAATAGAATTAGCTAGGAACATTTCAGTTTTCTGTTGCTACTTTTCGAGTCTAAGCAACTCTTCACCTGGCTAAACATAGTCTTCAATTCCTTAAGATGTGACATTAATGAGTACGGATAGGATTTAAGATTTTCTTAATGGTGTATCTATACGATTATATAAACTAGCAAATTGGTTTGCGGTAATTATTGGTGATAATGGTAGTGCTGTACGTGTATGTAATATTGTAAGGAAAGTTGTTTATCAATTTCCAATCCCAAATATGTGTTTTACTTCATAATTTTGCATCATTACTCATTTACTCAATGAGACCTACAAAGTTGTGATGGAAATTATGAAAAGAAACACATATGGGTTGATCAAGCATAACCGTGGACATTGACGCGAGAGACTTTCCGTACAAAATTGATATTAGGCAGCATGACTTGGTTTATAGTATCCCATTTTAATGACCATTGGTTTGGCACTGTGATGTAGTGATCCTTTTTTGCTTACTATGATCACACATTCAAGAATAAATTTTTGTTATTACTTGTGGAAAGTAAAAGCCTGCTATTATTTAACTTAACTATGTTCTTAATTGATTCTCAAAGTACCATGTGTTTTGTTTTTGGGTTGTCAACAGACATGAATGTTTGTTTTTTCTCTTCTTTGAGTTTTCTTACTTGATAATATCTAGATGTATAACTGTTATACGTAACCTAGCGGCTATCTTACCCTACTAAAACACAGGGCACTCTAATAATTTTTTTTTTCCTTCTAAAATTCTACATTTATTTATGGCAAACTAAGTAAGAGTTTCTTTAACATCCCTTATATTATGTATGTAAGAATGACCATATTTAGTGACAAGGAGTTATATTTGGGCTAGATTGTGAAATATAGATAGTGGAATCAAAAGATCCTTTGCCAGACTTAGATAGTGGATCAATGCACGGTAAGATCTTTTGGGATCAATGGTATATTATATTATAGATCATTCGGTTATTAATTCTAAACTTGACTTTTTTATATAAAATTTCTTATTGCATGGTATATAATATTGTATTATGGTACATATTGCACGGTATTTAGGATTAATATTGCATATCCAATCAAGAAACACCGGTGATATTACAACTAGCTAGGATTTTTTTATGGTATCTATATTAAGTAATATATATATATATATATATAAGATCTTTCTTCGGGGATAATACGAGCTAAAATGTGATTAAAAGTTATTATTATCTTAAATATGTATGTAATTTAGATTACGAGTATTTACTATTACACTACTAGAAGAGTAATTTGATTTAGTAATTTAAATTAGTTCGGCAATAATATTATTATGTTCCACATTTTGAATAAAAACCATGTGTAGATTCTTGAACAAGAGGAAATGTTACATAACTAGGATTCTAAATAAACTATATACTATATATATTCGCACACATCATCATTAATATAGTGAACGGTAAAGTATGTGAATATGATTATTTCTAGCTAAGATTCTCTTTACAATAAGCGGGTTTGCCTGATTTTATTTGGAGATGATACCAAGCTAATTAAGAAGATATAACAGACAAAAGCATACTCAAGGGTTGGAAAAAATAGCGCCAAAGACTTTGGAGGAGAACTAAAAATTATACAGTAGAAAATTAAGAAGAAACACATTAACACAGTTAAGAACATATACATAAATATATGATTAGCCCTATTTGAGTACTCATGTAAAAGAATCTAGCTAAGAGATAAAACATGCATGAATTGTTAATACGAGCTCGAATCGAGTCGAGTATGGTCATGGTTGGTGATTTTCCTTTACAATAAGGGGATGTTGGCGATGGTCTCGATGGATGGGGTTAGGGATAAAAAAATTAGATTAACTATTTAACTATGGTAAAGAGGGTGGTACAACATTTAAGGGGGTAAGAATAGACACTCTCTAACTCAAGCTGCTAACGGTGATGTAAAACACTAGCTAGGTTCCAATAAAAACAATCAATGGTATTCTAAAAAAAAATAAAAATTATTTAGATGCTATATTGTGATTTTTATTTAGCATACAAACCTATAGTAGACAAAAGAAGTGGGTGGTGAAGCGAAGATAATTTTGGATTTTATACTCGGGCACGTCGATGGACGGGGATAAGATTATATATTCTTACTTTACTAACACAATTTATTCATTTTTTAAATTTTTATGTAAAATAATCAAATGTTGATTGATAAGACATTATGTGGGATAATATTTATCCTTTGTATAGTTTGTTTTCTGATAATCGATGTTATATTATATTAGCTCAGTTGTCATGAGTTCTATTCATTTAGTGTAGCAATAGAAACCAAGAAAAACTCAAAATTGACAGCGTGTGGGTACTTTTACATGTAGTAGGAGAGAGATAGAGAGTAAAAGAATTATTAAATATAATTGAGTCTCACAAAGTTGGATGAAAGATGATAAAATATACTCCATTTTTTAAATATATTCATGTGGTATCTTGTTAGATTCGTTTCGAAATATACTTTCAAATTATCAAATTTTTATAATTTTTTCAAATGTATAATGAGAGATATTAGTGGTTAAAATAGTGTATTGACAAGCGTGAAATCTAAGATGGTGCAATTAAAAAAAAAGGAAGTATATAAAAAGTTGAAATAAATGGAATAAAGTAAAACTGAGTAAAACTTGGAAAAACACATCAAAACCGAAAGTGAGTATAACTTACAAAAACACAGAGGGAATAAAAAATTAATGATTAATCTATTACCGTAAGGGACTCTATC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ATGGGCGCTGCACTCGTGCACGCGGCCCACGTGTGCTGCACTCGTGCACGTGGCCCATGGGCGCTGCCACTACAAGGCCTCGACGAGGCATGGGCGCAAGCCTATGGCTTTGTCTTGGCCCGTTGTTGCTCTTGTCTCCTTCCTCGCGCCTCCTCTTCAACTCCTCTTAAACCCTCCAACAAAACCACCACATCTTGTAGTTGTACCACCACCGCTGGTCGGCGGCGCCTCTGCCAACCATCTCTCATTCTCTACCATTGCTATTCTAACAGGATGGCCCTGCAGACAGCAGATCCTCCTGTGGCACCTAGTGCGCAGGTTGTTGCTAATGCTTTTGTTGAGCAGTACTACCACATTCTCCATCATTCTCCAGAGCTGGTTTATAGATTTTACCAGGACTCAAGTGTACTTAGCCGCCAGGAAGAAAATGGCGAGATGACATCTGTGACGACAATGAAAGGTATCAATGCGAAGATTATTTCATTAGACTACAAAAATTATAAGGCAGAGATAAAGACCGCTGATGCTCAGGATTCTTACAAAGATGGGGTGATTGTTTTGGTGACTGGATGTTTAACGGGAAAGAACAACATAAGAAGAAATTTTGCACAATCATTTTTTCTTGCTCCTCAATCCAAAGGGTTTTTTGTCTTGAATGATGTTTTTAGATATGTTGATGAAAGTGAACCGTTAGAGACAAATGTGGTAACTATTGCTAAAGTTGGTGAATCTGTATCTGTTCCAGTAGTCTCAGAAATAGAGCCCCTTCATACTCCTGATGCTTCTACCACGAAGATGGCGACGTCACATGAAGATAGTCAAATTAATATTGAAAAACCCACTCAAACATTTGAAAAGGAAAGACAGGTAGTTAGGGAGGAGGTCGTCCCTACTATTTCTCAATCAACTGAGCACCACCTTTCTGCAGTTGCTAAATCAAGTCAGATTTCTCCCCAAGATGATGGTGCGAAGAACTCATATGCATCCATTGTGAAGAAGGCAAAGGGTAGTCCTGGGCCTACTAAAGTATACGTGCCTACTAATACTGTAAGATCCGCTCCCAGTGGCACTCAAGGGCAAGTTTCTGGATCAGTGCCGACAGCTTCGGCTATTGAACCATCAGTAGAGAGGAAAGTCCTCGAGGAAGCTAATGATGAAGAAGAAGGTGCTGCAATTGAAGGTCATTCCGTTTATGTTCGCAATTTGCCAATGAACGTGACAGTTACTCAGCTAGAGCAGGAATTTAAGAGATTTGGTCAAATTAAACAAGAAGGTGTACAAGTCAGAAGTAATAGGCAACAGGGATCTTGTTATGGATTTGTCGAATTTCTTTCTTCCAGTTCAGTGGAAAATGCAGTGCAGGCTGCTCCAATTATTATCGGAGGCCGACAAGCATTCGCTGAAATAAAAAGGAGTGGTACTCGAGTTGATGGTGGGAGGGATAGGCTCCCTTTTGGAAGAGGAGGATATCGTGGTGATAGTTTCAGGGGCCATGGAGGTTATGGTGGTGGTCGTGGTTTTGGTGGTGGTCGAGGAGAATATTCTAGTCGAGGAAGAGGACAGGCAGGCCGTGGTGCTGATGGCTATCAACGAGGCAGGGGAAGGTCTGGTCGTCAAAGTGGGGTCAATCGATCTAACATTGCTCCGTGA MGAALVHAAHVCCTRARGPWALPLQGLDEAWAQAYGFVLARCCSCLLPRASSSTPLKPSNKTTTSCSCTTTAGRRRLCQPSLILYHCYSNRMALQTADPPVAPSAQVVANAFVEQYYHILHHSPELVYRFYQDSSVLSRQEENGEMTSVTTMKGINAKIISLDYKNYKAEIKTADAQDSYKDGVIVLVTGCLTGKNNIRRNFAQSFFLAPQSKGFFVLNDVFRYVDESEPLETNVVTIAKVGESVSVPVVSEIEPLHTPDASTTKMATSHEDSQINIEKPTQTFEKERQVVREEVVPTISQSTEHHLSAVAKSSQISPQDDGAKNSYASIVKKAKGSPGPTKVYVPTNTVRSAPSGTQGQVSGSVPTASAIEPSVERKVLEEANDEEEGAAIEGHSVYVRNLPMNVTVTQLEQEFKRFGQIKQEGVQVRSNRQQGSCYGFVEFLSSSSVENAVQAAPIIIGGRQAFAEIKRSGTRVDGGRDRLPFGRGGYRGDSFRGHGGYGGGRGFGGGRGEYSSRGRGQAGRGADGYQRGRGRSGRQSGVNRSNIAP Relationships
The following mRNA feature(s) are a part of this gene:
Homology
BLAST of Spo07400.1 vs. NCBI nr
Match: gi|902213051|gb|KNA17161.1| (hypothetical protein SOVF_082610 [Spinacia oleracea]) HSP 1 Score: 859.8 bits (2220), Expect = 2.700e-246 Identity = 458/458 (100.00%), Postives = 458/458 (100.00%), Query Frame = 1
BLAST of Spo07400.1 vs. NCBI nr
Match: gi|703073796|ref|XP_010089638.1| (Putative G3BP-like protein [Morus notabilis]) HSP 1 Score: 465.7 bits (1197), Expect = 1.100e-127 Identity = 278/461 (60.30%), Postives = 322/461 (69.85%), Query Frame = 1
BLAST of Spo07400.1 vs. NCBI nr
Match: gi|595931540|ref|XP_007215342.1| (hypothetical protein PRUPE_ppa005348mg [Prunus persica]) HSP 1 Score: 454.1 bits (1167), Expect = 3.400e-124 Identity = 269/465 (57.85%), Postives = 327/465 (70.32%), Query Frame = 1
BLAST of Spo07400.1 vs. NCBI nr
Match: gi|645249752|ref|XP_008230886.1| (PREDICTED: ras GTPase-activating protein-binding protein 2-like [Prunus mume]) HSP 1 Score: 453.4 bits (1165), Expect = 5.800e-124 Identity = 268/465 (57.63%), Postives = 327/465 (70.32%), Query Frame = 1
BLAST of Spo07400.1 vs. NCBI nr
Match: gi|720006598|ref|XP_010258034.1| (PREDICTED: putative G3BP-like protein [Nelumbo nucifera]) HSP 1 Score: 450.7 bits (1158), Expect = 3.700e-123 Identity = 270/478 (56.49%), Postives = 326/478 (68.20%), Query Frame = 1
BLAST of Spo07400.1 vs. UniProtKB/TrEMBL
Match: A0A0K9RCD4_SPIOL (Uncharacterized protein OS=Spinacia oleracea GN=SOVF_082610 PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 859.8 bits (2220), Expect = 1.900e-246 Identity = 458/458 (100.00%), Postives = 458/458 (100.00%), Query Frame = 1
BLAST of Spo07400.1 vs. UniProtKB/TrEMBL
Match: W9QR06_9ROSA (Putative G3BP-like protein OS=Morus notabilis GN=L484_021031 PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 465.7 bits (1197), Expect = 7.800e-128 Identity = 278/461 (60.30%), Postives = 322/461 (69.85%), Query Frame = 1
BLAST of Spo07400.1 vs. UniProtKB/TrEMBL
Match: M5WTJ2_PRUPE (Uncharacterized protein OS=Prunus persica GN=PRUPE_ppa005348mg PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 454.1 bits (1167), Expect = 2.400e-124 Identity = 269/465 (57.85%), Postives = 327/465 (70.32%), Query Frame = 1
BLAST of Spo07400.1 vs. UniProtKB/TrEMBL
Match: B9SNQ0_RICCO (Ras-GTPase-activating protein-binding protein, putative OS=Ricinus communis GN=RCOM_1025530 PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 440.7 bits (1132), Expect = 2.700e-120 Identity = 263/466 (56.44%), Postives = 325/466 (69.74%), Query Frame = 1
BLAST of Spo07400.1 vs. UniProtKB/TrEMBL
Match: A0A072TW25_MEDTR (Ras GTPase-activating binding-like protein OS=Medicago truncatula GN=MTR_7g013840 PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 431.8 bits (1109), Expect = 1.300e-117 Identity = 265/475 (55.79%), Postives = 328/475 (69.05%), Query Frame = 1
BLAST of Spo07400.1 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: G3BP1_MOUSE (Ras GTPase-activating protein-binding protein 1 OS=Mus musculus GN=G3bp1 PE=1 SV=1) HSP 1 Score: 90.5 bits (223), Expect = 6.100e-17 Identity = 134/465 (28.82%), Postives = 204/465 (43.87%), Query Frame = 1
BLAST of Spo07400.1 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: G3BP1_PONAB (Ras GTPase-activating protein-binding protein 1 OS=Pongo abelii GN=G3BP1 PE=2 SV=1) HSP 1 Score: 90.5 bits (223), Expect = 6.100e-17 Identity = 134/470 (28.51%), Postives = 208/470 (44.26%), Query Frame = 1
BLAST of Spo07400.1 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: G3BP1_BOVIN (Ras GTPase-activating protein-binding protein 1 OS=Bos taurus GN=G3BP PE=2 SV=1) HSP 1 Score: 90.1 bits (222), Expect = 8.000e-17 Identity = 129/467 (27.62%), Postives = 203/467 (43.47%), Query Frame = 1
BLAST of Spo07400.1 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: G3BP1_HUMAN (Ras GTPase-activating protein-binding protein 1 OS=Homo sapiens GN=G3BP1 PE=1 SV=1) HSP 1 Score: 89.7 bits (221), Expect = 1.000e-16 Identity = 135/467 (28.91%), Postives = 204/467 (43.68%), Query Frame = 1
BLAST of Spo07400.1 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: G3BP2_HUMAN (Ras GTPase-activating protein-binding protein 2 OS=Homo sapiens GN=G3BP2 PE=1 SV=2) HSP 1 Score: 83.2 bits (204), Expect = 9.800e-15 Identity = 134/483 (27.74%), Postives = 205/483 (42.44%), Query Frame = 1
BLAST of Spo07400.1 vs. TAIR (Arabidopsis)
Match: AT5G60980.2 (Nuclear transport factor 2 (NTF2) family protein with RNA binding (RRM-RBD-RNP motifs) domain) HSP 1 Score: 313.9 bits (803), Expect = 1.900e-85 Identity = 214/463 (46.22%), Postives = 285/463 (61.56%), Query Frame = 1
BLAST of Spo07400.1 vs. TAIR (Arabidopsis)
Match: AT3G25150.2 (Nuclear transport factor 2 (NTF2) family protein with RNA binding (RRM-RBD-RNP motifs) domain) HSP 1 Score: 223.4 bits (568), Expect = 3.400e-58 Identity = 173/475 (36.42%), Postives = 249/475 (52.42%), Query Frame = 1
BLAST of Spo07400.1 vs. TAIR (Arabidopsis)
Match: AT2G03640.3 (Nuclear transport factor 2 (NTF2) family protein with RNA binding (RRM-RBD-RNP motifs) domain) HSP 1 Score: 182.6 bits (462), Expect = 6.700e-46 Identity = 130/383 (33.94%), Postives = 205/383 (53.52%), Query Frame = 1
BLAST of Spo07400.1 vs. TAIR (Arabidopsis)
Match: AT1G13730.1 (Nuclear transport factor 2 (NTF2) family protein with RNA binding (RRM-RBD-RNP motifs) domain) HSP 1 Score: 181.8 bits (460), Expect = 1.100e-45 Identity = 159/458 (34.72%), Postives = 229/458 (50.00%), Query Frame = 1
BLAST of Spo07400.1 vs. TAIR (Arabidopsis)
Match: AT5G48650.1 (Nuclear transport factor 2 (NTF2) family protein with RNA binding (RRM-RBD-RNP motifs) domain) HSP 1 Score: 181.8 bits (460), Expect = 1.100e-45 Identity = 154/443 (34.76%), Postives = 217/443 (48.98%), Query Frame = 1
The following BLAST results are available for this feature:
BLAST of Spo07400.1 vs. NCBI nr
Analysis Date: 2018-06-29 (blastp Spinacia oleracea peptides vs. NCBI nr) Total hits: 5
BLAST of Spo07400.1 vs. UniProtKB/TrEMBL
Analysis Date: 2018-06-29 (blastp Spinacia oleracea peptides vs. UniprotKB/TrEMBL) Total hits: 5
BLAST of Spo07400.1 vs. ExPASy Swiss-Prot
Analysis Date: 2018-06-29 (blastp Spinacia oleracea peptides vs. ExPASy SwissProt) Total hits: 5
BLAST of Spo07400.1 vs. TAIR (Arabidopsis)
Analysis Date: 2018-06-29 (blastp Spinacia oleracea peptides vs. TAIR) Total hits: 5
InterPro
Analysis Name: InterPro Annotations of S. oleracea
Date Performed: 2018-06-29
GO Annotation
GO Assignments
This gene is annotated with the following GO terms.
RNA-Seq Expression
Co-expression
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