Overview
Sequences
The following sequences are available for this feature:
Legend: exonfive_prime_UTRpolypeptideCDS Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.TCTTAACCACATACTTTCGGTAAGCTCCTCAAGCGAAAGGGACAACAGCAACACTCACTTCCACTTTCCAGCAATACCGAACCCCGACCCCACACCCGGCCCCACCTTACCCCCTTCCAAAAAATTGCAAGCGTACATCATCATCCCCTACTGTCTCCGCCATATTCTTTGCCACCTTTTCCTCTCTCAAACTCTCCANCATCCCCTACTGTCTCCGCCATATTCTTTGCCACCTTTTCCTCTCTCAAACTCTCCATTTTTCTCCTCCCCAAAAAAAAGAAAAACCCAAAAATGGCAACCCACGCAGAAAAAAAATCCGAGATCACTAGAGAGAGAAAACCCGAACCAAGTCGTCAAAACCGGCCTACAACCACCACCACCGCCACCACCCGACCAAGACAAAAACCACCACAGCCCACCACAACCCGGCCCACCAATCGAGTCCCACTCAAAAAGCTACTAAAAGTAACTTCAGTAGCAGGCGGAATTCAGTTTGGGTGGGCCCTACAGCTTTCACTCCTCACTCCCTACGTTCAAGAGCTGGGTATCCCTCACGCCTTTGCCAGCATCATATGGTTATGTGGTCCCGTCTCCGGCTTTTTCGTGCAGCCGCTGGTTGGTCACCTCAGCGACCGCTCAACCAGCCGGTTCGGCCGCCGCCGCCCCTACATCCTCATAGGGGCGGTGATGATCATTGTTGCCGTTTTAATTGTTGGATTTTCCGCCGATATTGGGTATTTGATGGGTGATAAAGTTGATTTAGGAGAGAGAAAACGGCCGATGGCAATCGTCGCGTTCGTCATCGGGTTTTGGTTGCTTGATGTGGCTAACAATACTACCCAAGGTCCTTGTAGAGCGCTGCTTGCTGATCTTACTGGTATGTTACACAAATTTTGATTTTTCCTTTGTTAATTTTTTTCGATTACATTTCTAGTATTTTGTTTTTAATTTTAATTTTTAATTTTGAATTTTTAAATAGAAAGGCAGAAAAAAGAACTGGAAAGTATGAGTGAGACGAATGTTGTTTTTTGCTGGTTTGAGTGTCAGCGTATCAAAGGAGAGGGAGGTGGCGGAGAACACTGCTTTTTTCCTCCTTTAGCAATTTGCTTCTTCGTTTATGTTATAAAAATAAACACCTTTATTCTGGAATCTTTATTACTAAAATACTTGATAATTTAAATATATGTAGGCCATTGATATTTAGCATTAAATTAAGGCCAATCATTTATTTGACTAAAAAATATAAAAATAAAAAGATATTTTTATTTCTTTTCGATTTCGGGTTCGAGTAGTTTGGTGGAGAGACATAAGGTTTTTGATACTAGCCGTTGTGTATAAATGTACCAACTTAAGAATTGCGCAGCAGAGTAGTGAACCAGAGACTAGAATATTACGGAGTAGTATCATTGTCAAAAAAAATTCTTTGGGTGTACGGTGTACAAAAGATTGTCTTAACGATTCAATTTGTTCTAATAGTCAGAAAGATAACTTTACCCCCTTCAAGATCATTTATAAATTGTTTGTCCATTGTCACTGTCTCTTTGATGCTGACATTCTACCAATAATTTTGTTATTTTTTTGAATTGTTTTAATCAGTTAGTTTTATGTTATCTTTGACATGGGGCTACTAGAGCTAAACCGACAATTCTAATTTCAAAACCTCTTTTTTATATTTAGATAAGCTATTGCATAGTGTCCTAGAGGATGTCACGAGTGTGGCAAATATATTTATTTTATAGTATTCCTTAGTTGGGAAACAAAGGAATTATTATTTGATTTTTATTTCATGGGCAAATGCATTTTGTTGAATCAGTGTTCATCACTTTGTCATTTAAAATTATCAGATCAGATTGTGTAGATTTGTAGATATTAAACTAATGTTATATTTTCGAGATGTTTAGCCTTTCAAAATGGTAGTGTTTTTTTTTGGGTGAGATGTTTCTATTTTTGAAATGTTCGATATAAAAGTTGGTCTATAAAAAAGTTGGTCTTTACTCTCTTCTCTTTACATTCTTTTCACATGTTTCTAAAACATAGGTTAGTAAAAATTAAATTTAGGGTTGATTAAGTTCAGATAAATACCTTTCCGAAAAAAGTTCAAGTAGATGAAGTTAAGTGCAATTAAAGGTACAAAGTTCAGTTCATAACTAAACAATTCACAATTACTTTCTATTTTTCTAATAATAGTTACACTTCTTTTTCTGATGAATTTCCACATTTTTTCTAAGGAGCATAGTGAATGACATGTATGCTATATTTCTGAGTTAGTTTGGAAGGGTCATTTCTCTTTACATGGTATAGAGTTTCTCCTCTCTTCTGCTTACTATCCTAAAACTGATGACCAAACAAAAGTGGTGAATAGGTGTTTAGAAACTTATTTGAGGTGCATGTGTAGTGAAAAACCCAAGGAGTGGTCTATGTGGCTACCTTTAACAACACCCACTTTTATTCAGGATTGGAGTTCACACCTTATGAAGTGGCTTACAATCAACCACCACCCTTACATTTTCCCTATCTACCAAGAGAGTCATCAATAGAGGCTCTTGGTGAAATTAAATTTCATATAACAAGAGCTCAGTCAAGAATGCAATCACAAATAAACATAGACCAGATGCTAATAGTAGGCTCAATATTATGGTCCATGGTCCGATTTCAGGTTCGTTCAAAGGTTGGGAAGGTAGCCTACAAATTGACACACATCACAGAGATAAGACACGATTTTTCCAAGTATCTGAGTTAGAAGAAGTTTCTAAGAACACTTCCTGTGGTTGCTCATATTCCAGTTTGGTTGCAAGGCAAACATGATGATGCAATTATTAGACCTGAAACAAATCTTGCAAGGCTTAGTTCGATGGGAAGGTTGCCCAAGTCATAAAGCTAGTAGAGAAAGTGATTAGACCTGAATAGTTTCAGAACAAGGCTCATATCTAGTAGTAAGATGCTGGAGATTATGAGCACAAACTTCCTGATTTTGAATGTATTCCAAAGACTTGAGACAAGTCTTTTTTTGAGGAGGAGGATATCATACGGGTTAATTTAGATAAAGGGTTGGTTTAAATATTGGACAAAGTTGACTTGTGTTGACTTTTGTAATTGAGCATTTTGGTCGGAAAATTTGTTACTTTGTTTCTAACATTAGTAGGGATTGTTGTATAAATAGGATCAACAATACATTGCAATGATCATCTAAGAAATCAGTAACCACGATTCGTTCTTATCTCATATTCTATTCATCTCTCTATCTCTTTCTCTCTCCACTGTTTTGGTCCTTTTGGATCAGGATCAGAATTCCCAGAATAATGTGTTTCTATCTTTGAATTACAAGAGAGGTTGCCTCTCCTGTAACATGCGCTGGTTAAAAGGTTAGAAGGGTGACAAACGGATGGAATTGTAAGGGGTAGGGAAGAAGACCAAAACGAACATGGAAGAGGGTGATAGAGAGTGATATGAGTTTATTATTGGGAATTAAGAAAATATGGTGTTATATACGGCGGAGTGGAGGGAGATAATATACACCCATGACTCTACATCACTTATTTTTTTCTCTTTTTTTTTTAAATTTTTTTCTCTGTTATATATTTTCCTTTGCAAACTTCTCTCATTTTCTATTTTAAGTTTTATTATTTTCAAAATATATTTGTCCCTCTTCTTTGAACCAATCTATTTTTTTCTTTGTTCCCAATTTTTCGTGCCTCGTTACCCTCACTTTCACTTTCCCATTTTTGCGTGTTTACTCTCTTTATCTTTTACTTTTCTTACTTCACGTTCTGCACACGGTTCCCTACTTCGGTTTATGTTAGCCGACCTCAATCCATTTGGGACTAAGGCTTGTGATTGTTGTGTTTTCTAAAGCAGGATTGAGTTCTCGATATCCTTGTATTGCACAAAATTTGTGTTTATGCACACGATGCATGAGTGACCTTTTATATGAAAATTGTAAGTTTATAAAGCAAAGGCCATGAACTTTTTATGCTTAGGTAAATGGAAAGATTCTAATTTTTATTAAAGGGGTGGAAAGATACTTTTGGTTTAAAATGATATTTTTTCTAGAAATGGATAATTTTTTTTTATTATAACAAAATTAATACGTTAATAAGGGTATAGATATTTCAGGGAGAAACACCAAAAAGTTAAGCATCTCAAACACCCACTTATATAATAGAGATGTGTTTCCAACTTGCCATAGAGAGATAGGGGATGCACATAAAGTAACATTATTATTGTTAGATCACTGCCACTAGTTGCTCCTTTAGTTTCTGTGATACTAATCTTGTTGTGGAATATATATAAAAATGTGAGCTCAATTTAGGAGTACAGATTCACAAGTCCTAGAGACATGGCTAGCCATATTTTACCCATATTACAAAAGACCACTTTTTAGGATAAGATATTTACCCACAAATTTATGCAGAAACTTAGTGGATATTGTTCTCTTACTTTCTAATGTAAAGGAGAGACATATTCTACGGTGAACTAACACTTCTAATGCGATTTCATCCCCACCGAAAAAGAGCCTTCAGTGTAATACACCTTTTAGTTAATGCTTTTTCTTACGCGGTGTTTTAAACTGCAATTGGTCCACTGGTAATGAGTTTGCTATGAAATTTGCTTGTAAAGAGTGAATCGTCCCTTTTGGATGGACAAAAAATGGATGGAGGGATGGAAAAGGGTAAATTACCAAGCGGACAAGCTGGAGGATCAAAACTTTTCCAAATAGGTTTCCACTAATGGTAATGTTTTCGTGTTATTCGTGTCTCAGAGGAAAATACTTCGTCCGTCCTATCCCTCCCTTCCATAATAGCTTGTCTCTTTCTTTTGACACATGGTTTTAGCCTTTTAGGTGATAAGTTATATTGTTGTTCTCAATTGTTATTTTAATGGAAATGTGGATGTGATGGGAGATAGTGGGGTATTATTTTATTTGAATGAGGAAGGATATGAAACCCTAACTTTTTACTAGTGGGAAGAAAGAACTCTTAAGAAAATATAGTGGT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MATHAEKKSEITRERKPEPSRQNRPTTTTTATTRPRQKPPQPTTTRPTNRVPLKKLLKVTSVAGGIQFGWALQLSLLTPYVQELGIPHAFASIIWLCGPVSGFFVQPLVGHLSDRSTSRFGRRRPYILIGAVMIIVAVLIVGFSADIGYLMGDKVDLGERKRPMAIVAFVIGFWLLDVANNTTQGPCRALLADLTGKDHRRNRVANAYYSLFMAIGNILGFATGSFNSWYTILPFTLTHACKESCANLKSAFLIDIIFIVITTYISITASHEVPLSSRNEVTNISEGSQPSSNDQEAFFWELFGTFRFLPGAVWLILSVTALTWIGWFPFLLFDTDWMGREVYGGNPDEGKIYHQGVSTGALGLMLQSVILGITSVLMEKLCRKLGSGILWGISNIIMSLCFVAMLVISFVVSKTESFGSGRPPNGAVIAAVVVFTILGMPLAVTYSVPYALISSRIESLGLGQGLSMGVLNLAIVIPQLCQKRNSYLLFRWSWLERLSEEDQLEAAEVALDGDTLLWFQYENERHPLRSWDEMKSMLLCRFRLNAAGSLHE Relationships
The following mRNA feature(s) are a part of this gene:
Homology
BLAST of Spo07941.1 vs. NCBI nr
Match: gi|902219126|gb|KNA18233.1| (hypothetical protein SOVF_072810 [Spinacia oleracea]) HSP 1 Score: 926.0 bits (2392), Expect = 3.100e-266 Identity = 476/480 (99.17%), Postives = 477/480 (99.38%), Query Frame = 1
BLAST of Spo07941.1 vs. NCBI nr
Match: gi|731367123|ref|XP_010695439.1| (PREDICTED: sucrose transport protein SUC4 [Beta vulgaris subsp. vulgaris]) HSP 1 Score: 789.6 bits (2038), Expect = 3.400e-225 Identity = 405/481 (84.20%), Postives = 437/481 (90.85%), Query Frame = 1
BLAST of Spo07941.1 vs. NCBI nr
Match: gi|731427663|ref|XP_010664062.1| (PREDICTED: sucrose transporter-like isoform X1 [Vitis vinifera]) HSP 1 Score: 633.3 bits (1632), Expect = 4.100e-178 Identity = 319/447 (71.36%), Postives = 374/447 (83.67%), Query Frame = 1
BLAST of Spo07941.1 vs. NCBI nr
Match: gi|398363589|gb|AFO84089.1| (sucrose transport protein [Actinidia deliciosa]) HSP 1 Score: 632.9 bits (1631), Expect = 5.300e-178 Identity = 318/446 (71.30%), Postives = 375/446 (84.08%), Query Frame = 1
BLAST of Spo07941.1 vs. NCBI nr
Match: gi|568836705|ref|XP_006472375.1| (PREDICTED: sucrose transport protein SUC4 [Citrus sinensis]) HSP 1 Score: 632.1 bits (1629), Expect = 9.100e-178 Identity = 319/463 (68.90%), Postives = 375/463 (80.99%), Query Frame = 1
BLAST of Spo07941.1 vs. UniProtKB/TrEMBL
Match: A0A0K9RFG9_SPIOL (Uncharacterized protein OS=Spinacia oleracea GN=SOVF_072810 PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 926.0 bits (2392), Expect = 2.100e-266 Identity = 476/480 (99.17%), Postives = 477/480 (99.38%), Query Frame = 1
BLAST of Spo07941.1 vs. UniProtKB/TrEMBL
Match: A0A0J8BC86_BETVU (Uncharacterized protein OS=Beta vulgaris subsp. vulgaris GN=BVRB_5g124860 PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 789.6 bits (2038), Expect = 2.400e-225 Identity = 405/481 (84.20%), Postives = 437/481 (90.85%), Query Frame = 1
BLAST of Spo07941.1 vs. UniProtKB/TrEMBL
Match: A5BZF7_VITVI (Sucrose transporter OS=Vitis vinifera GN=SUC11 PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 633.3 bits (1632), Expect = 2.800e-178 Identity = 319/447 (71.36%), Postives = 374/447 (83.67%), Query Frame = 1
BLAST of Spo07941.1 vs. UniProtKB/TrEMBL
Match: S4SKB7_ACTDE (Sucrose transport protein OS=Actinidia deliciosa GN=SUC4 PE=2 SV=1) HSP 1 Score: 632.9 bits (1631), Expect = 3.700e-178 Identity = 318/446 (71.30%), Postives = 375/446 (84.08%), Query Frame = 1
BLAST of Spo07941.1 vs. UniProtKB/TrEMBL
Match: A0A067H0V1_CITSI (Uncharacterized protein OS=Citrus sinensis GN=CISIN_1g010639mg PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 631.7 bits (1628), Expect = 8.300e-178 Identity = 319/463 (68.90%), Postives = 375/463 (80.99%), Query Frame = 1
BLAST of Spo07941.1 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: SUC4_ARATH (Sucrose transport protein SUC4 OS=Arabidopsis thaliana GN=SUC4 PE=1 SV=2) HSP 1 Score: 589.0 bits (1517), Expect = 5.500e-167 Identity = 298/463 (64.36%), Postives = 361/463 (77.97%), Query Frame = 1
BLAST of Spo07941.1 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: SUT2_ORYSI (Sucrose transport protein SUT2 OS=Oryza sativa subsp. indica GN=SUT2 PE=2 SV=2) HSP 1 Score: 560.5 bits (1443), Expect = 2.100e-158 Identity = 279/437 (63.84%), Postives = 347/437 (79.41%), Query Frame = 1
BLAST of Spo07941.1 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: SUT2_ORYSJ (Sucrose transport protein SUT2 OS=Oryza sativa subsp. japonica GN=SUT2 PE=2 SV=2) HSP 1 Score: 560.5 bits (1443), Expect = 2.100e-158 Identity = 279/437 (63.84%), Postives = 347/437 (79.41%), Query Frame = 1
BLAST of Spo07941.1 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: SUT_SPIOL (Sucrose transport protein OS=Spinacia oleracea PE=2 SV=1) HSP 1 Score: 444.9 bits (1143), Expect = 1.300e-123 Identity = 236/450 (52.44%), Postives = 300/450 (66.67%), Query Frame = 1
BLAST of Spo07941.1 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: SUC8_ARATH (Sucrose transport protein SUC8 OS=Arabidopsis thaliana GN=SUC8 PE=1 SV=1) HSP 1 Score: 443.7 bits (1140), Expect = 2.900e-123 Identity = 226/439 (51.48%), Postives = 305/439 (69.48%), Query Frame = 1
BLAST of Spo07941.1 vs. TAIR (Arabidopsis)
Match: AT1G09960.1 (sucrose transporter 4) HSP 1 Score: 589.0 bits (1517), Expect = 3.100e-168 Identity = 298/463 (64.36%), Postives = 361/463 (77.97%), Query Frame = 1
BLAST of Spo07941.1 vs. TAIR (Arabidopsis)
Match: AT2G14670.1 (sucrose-proton symporter 8) HSP 1 Score: 443.7 bits (1140), Expect = 1.600e-124 Identity = 226/439 (51.48%), Postives = 305/439 (69.48%), Query Frame = 1
BLAST of Spo07941.1 vs. TAIR (Arabidopsis)
Match: AT1G22710.1 (sucrose-proton symporter 2) HSP 1 Score: 442.2 bits (1136), Expect = 4.700e-124 Identity = 222/438 (50.68%), Postives = 302/438 (68.95%), Query Frame = 1
BLAST of Spo07941.1 vs. TAIR (Arabidopsis)
Match: AT5G43610.1 (sucrose-proton symporter 6) HSP 1 Score: 438.3 bits (1126), Expect = 6.800e-123 Identity = 223/439 (50.80%), Postives = 302/439 (68.79%), Query Frame = 1
BLAST of Spo07941.1 vs. TAIR (Arabidopsis)
Match: AT5G06170.1 (sucrose-proton symporter 9) HSP 1 Score: 434.9 bits (1117), Expect = 7.500e-122 Identity = 222/453 (49.01%), Postives = 309/453 (68.21%), Query Frame = 1
The following BLAST results are available for this feature:
BLAST of Spo07941.1 vs. NCBI nr
Analysis Date: 2018-06-29 (blastp Spinacia oleracea peptides vs. NCBI nr) Total hits: 5
BLAST of Spo07941.1 vs. UniProtKB/TrEMBL
Analysis Date: 2018-06-29 (blastp Spinacia oleracea peptides vs. UniprotKB/TrEMBL) Total hits: 5
BLAST of Spo07941.1 vs. ExPASy Swiss-Prot
Analysis Date: 2018-06-29 (blastp Spinacia oleracea peptides vs. ExPASy SwissProt) Total hits: 5
BLAST of Spo07941.1 vs. TAIR (Arabidopsis)
Analysis Date: 2018-06-29 (blastp Spinacia oleracea peptides vs. TAIR) Total hits: 5
InterPro
Analysis Name: InterPro Annotations of S. oleracea
Date Performed: 2018-06-29
GO Annotation
GO Assignments
This gene is annotated with the following GO terms.
RNA-Seq Expression
Co-expression
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