Spo09756 (gene)

Overview
NameSpo09756
Typegene
OrganismSpinacia oleracea (Spinach)
DescriptionUnknown protein
Locationchr6 : 42700362 .. 42714005 (+)
Sequences
The following sequences are available for this feature:

Gene sequence (with intron)

Legend: polypeptideexonCDS
Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.
ATGAAGAAGGTGTTGACGGAGAAGAAATTCACGCTCGTCCACACCGTCGCAACCGCCGGCATCTTCTCCGCCGTATCCTTCTGGTATTTTCTCCCTCTTTCTCTCTCCTGTTCTTCGCATGATAATTCATCCATGGCTGCCGGTTAATTTTTCAATCAATTTTTGATAGAAATAGAAAAATTGAATTAATTTGATATTTTATTTTTATTTTTATTTTTAACGAGGTATGGGTTCATGTTTGGAAGAGAATCATCTCGCAAGGAGCTTGGTGATCTCATCGACGACCTTCGCCGCTCCAATTCCGATTCCAATCCTACTCCTCCTCCTCACACTTGATTTTGTACTTTCTCTCTTCTCTTCCTAGTTCTTTTTTCTGTAAAACTGAATTGATTTCAGCTTTTCAGCTTCTAATTAATTGAGAAATTGCTACTGATTTTCAATCCAAGCGCTGAATTTAATTTGTGGTTGTTGCTTCCGGTTATCGCAATTTCAATTACACTTGTTCACTCATTGTATTTGATTGTGTATGTTTATTTCTAGATTTTTTAATATTGAATTGCATTGTATTGGTTTTGATATTTAACGGGGTTTTAATTTAATGATGCAACACTTGTTGACTTCACATACTTGAATGATGAAAAATTTATGGGTATTGGTTATATATCGAAGTTGAAATATTGCCAATGTATTTACCATTGGGAACTCGTTGTGATGGCGTACATTTTGCGTGATGGGTCAGTGCCTCAGCGGGTGAATGGGATGAGCTATATATGTCATTAGGTTTGTTGGCTTCAGAGAGGTGGAATTGTTTAGTTAGTCCTATTTGTCACGAAATGCTTGATTTAACCATAATTAGGTTGGAGGACCTCTTTGTTGGATAATGATGTCCTTTTATCTCGAATATTTTTGGTTGGCTTTTACGATTCTGCTTCATGTTATGATGATCGGGTCAGCTTTTGAGTCATAATGATATAGATCTTTAGAATTGTTCACGTAGTTAGTTGGGGGCTAATCAGATATGGTAGTTGATGCACAACTTTGCAGATGGATCTTTATTGAGGACTGCAGATTGGTTCTTCTGCGACCCTGTAGCTGTTTTATGTCTAGAAAGTAGAATTTATCAAAGGAGAAAACATATCACGCTTTCTCTTCGTGTTAATGTTGGCTTAGTTGTCATTTTTGTTTAGGGTACTTCATGAATTGGTGAAAGTAGACCTTTTTCTGTTTGTGGACAAGCTTGTCTGCTTTGATTTAGATGAAATGCTTTAAAACATGCTATTGAGCTTGCATGTCATGTGAAGTTAATACTTTTACATTGTTCGTATACTGCAAAAGGTTGAATCTGGACTTGTATTGTGGACCTTATGGTGATGGTGCTATGTGGAAAATCAAGGATGATTGCCTTTTAGCCTAATTGGCCGAGGAATAGGATAATGGCTTTATTGAAATTCCATTCGCATATGTTTGTAGTTGCCTAAGCCGCTTGAAATCACTTTACCTTCCTTCTTAATCGCGGCTGTAGATCATGTCTTGACATTATAATTTCCTTCGTCCCTGTGCTTCTGGTACTTGAACCACTTCTTTCTTGAGTACTGTTACTACTGTACATCTCCAAGCTAAGAAACTCCAGTTAGCATTGCATGTACCCGTCTCCCTAGAAATTAGGCCCTTCACTTGAAGAGGAATTTACTGTACATCACTTTATTGGGAGGTAGTGGTGGTAGATGCATTTCAGAACCTTGCCTGTGAGCTTGATTGCAGTCGCAGAAAGAAATAAACATTTGTAAAGGAAATTATACTGTTGGGGTAAAGCATAGTATTAGATATTCATATGGTGGTCAATGTTTGACAAATTCAGTTGCTTGGCTTGTGAGGTGCTTTTTGTTGGGACAAATTTTTTTATGTTATATGGAGATTCTGGGAGGGGACTTCGTCCTGATGGATCAATATAGTAAAGATCTGGACTATTAGTTTTTAAAAAATTAGGTAACAGGGGAGCTCCATAAGCTCAATTTTCCAGTGTAGAGGGCCAAGTGCTCTTTTATTATCCATCATTCCAGCTGCCTGCTTATACTCAGGGTATAAATTATGTGGAGTAAAGGTCCTATATGAATATATGCTTTTCCAGTATCTCCTTATCAAGCATCATTGAAATAATTTGTTACAAAATAATTGACCTTGGAGTCTTCCTTTTCATTTTATTTGAGAGTACATTGTAGCTTGTCGGTTGAGTTGTGAACTTGTGATGCTATGAATAGTTGCTTACAGGTTTGGGGGTTGTTACTCCTGTTTTCAATTCCAGCTGTTCTTGATTACCAATTCCGGGGGTTGTCTAAACGCGTTTCACTGGGAAGGCGATTGCACTCTAGTAAGCAATCAGGTTCCTTCGTTTAAAATGACTATGAGCCTGAAACCAAGGTCGTTAATCCCATACTCCACTGGGTTGACATATTTCAATCAATTGCTAATACAAGAAGCGATTGCAATTTATTCTTGTGATTGGTGTTTAAGAGGGTATAGAAAATAAGGAAGGCATACCCGATTATAAGATCTAGCTTTCTTTTCGCGGAATAATGTCCTAGTATAAATGGATATTGGTCTGTTGGAAGTCTTGGAAGTTAGAACATTGTAAATTTGCAAGGCTGCTGCCTTTGGCAGGCAGTGGTTCACATTGAAGAACAGGACCCTCCATGGTCTTCTTAGATTTTATATAGTTGGATAAGTTTTGAAGTGATGAGTTTTTCTCTTTTCTTGATTTTGTCAATTATGGAATTGTCCTGACTAAGGGTTGAGCATAGTATTTTTTTTTTTTGGTGAAAAATGGTTGAAAATAGTTTGACATTTCCTTGGTGGTTATCATTAATAATTTCAGGCTTCCAATTTTGTTGGCTAGCCTGAACCATGGGGGAATTAAAAGTGCTGTATGGAAGCCTGATCTTAGGAGCAACCCCTTAAATGTTTAAGCAGTTTGATAAACATAAAAGCAATTACATTTTGCTGGTTGTAAATTGGCTCGAGTAGGGAGATTAGTGATGAGGTTTTCCTCCTACCACAACCTATTCAGGAGGACCTTCTAGGTACTTTAGGTTACAAGCCATGATTGGGGTTAAGGCTGTGTTCTATTCACCTGATTTTCACTTATTTTTTCTGAACTTATCTTATCTGAACTTATCTGAACTTATCTGAACTTAAGTGAACTTATCTGAACTTATCTGAACTTATTAGAACTTATCAAAACTTATTTTAGTTATAAATTGTACTTGGTCAACCCTTATTTTTCCTGAACTTATCTTATCTGAACTTATCTGAACTTAACTGAACTTATCTGAACTTATTTTCCTGAAATAAGTGGAAATAAGGTGAACAAAACAGGGCCTAAGTCTCTCAAAAAAGATGGGTTTTTGTTAGTCTATTCTGATATATGAGTGCATAGTTTAACAATGGTATTTTTGATAGCCATGATATGCAATGAAGGCTCTAGGTCATTGTTTATATTTTAAGGACATCTTAGCTTAGTCTTGTTTTTTCGTTGTTGAATAAAAACTTCTTTTGTTAACTAAGAAAGCTAGAATTGATTAAGGAATGTGTCTTAACACTTATTTATCTCGAGGCTGCCTTAAAATAGGCATGTATACATTGTTAACTCATGCTCTATACTATTTGATTTTGTATTTACCCTTTCATAGTATAAGAGTGTGCTAGTTTGTACCAAATACACAGCAGTGCTTACATTTTATACAAGAACGTGCTCATTCTTCTGAATGCTCTTCTCTTTTAAGAATCCTACATATAGGTCCGTCCTGCTTGAGTCACTCGATGAGAGTCTTTGGTTTTGACCATCTTCAGACATGCTCTTTACAAACTCTACCAAATGCCTCCAATTATCTTCTTCAAACAACCTTTTATTCATCCTTAAATATGTAAAAGCACTCAATTCACTTCCTGAGTGTGACTTGCTGGTTGCTAAAACCTGTCCAAACGCACTTGCATCATATCTCTCCAAAGCGTTTTCTCCAGCAAGTTCTATTCCAGCTTTTTGGGTTGCAGATTTTACTTGCTTCACTAGACCTTCAGGAGAGCAGTTTGCATGATCTGGTTGCTCCCCATCCTTCATTTCCATGCATGTAAAGTTTAGAACGACGTCATGTTTAGCGAACATTCTAGCTATTGGTAGGTAGCCGTTTCGATCTCTTGTATTGTAATATCCTGCTGTTAATTCAGCTGCATGAGATCTGGTTTTGTAATGCCAATGAATTCCTGCTACTTTCCCGGACAGTTTGACCCCAGTATCCTTGAACACTCCATGAGCAGCTGCAAGAATGTTCTCGCCATGCTCAATTAGTTTAGCGCTGTACCACTCTAGGAAGAACTGTCCATATGCTGTACTCCATGTTCCGTCTCTGCGGAAGAATCCCGTGTCTTCTGGATACTGTTGGTAATGGCCTGAATCATGTGGGCCACTTTTTCCCCATTCTTGCTCTCCAAATGCCTCAGCTGCTGCTTGTAATGATGCTTTCATATACTGTTTTCAATGGAAGAAAAAGGAAGATGAGTCCATGTCTGATGATTTCAATTGGCTAGTTAATTGTGTTTGTATAATATCCTTTACTATCTCTTAAGTATGAGAGGCTCATGGACAAACACAATTACACAAATCTAACATATTACAATAGGTCTAGCAGTCTAGGGCTTGGTCTAAGCTTTTACCTTGTCATAGCACTGAAATTCTCCAATCCCTGGAAATCTCCAGGTGCCATTGCTTTCTGGGTAAGATGGATATCTTAGCTCCCCACATGGTCCCATTCCTACTTGAATTTCCTGCAATAGGAATTAGAAATTGAATAAGTAATAGTTAGCAGAAGATATTTCCTAATTATTAGCAAGATGTATTGTTTTCACATTGTAATATGTGACATTCAATTATTTTTGGGCTTAGGACGCATCTTGCAGCCCAGCCCTCCTTCTCTCCTCGTAACTATATCTATTGTCACATATTTTCT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mRNA sequence

ATGAAGAAGGTGTTGACGGAGAAGAAATTCACGCTCGTCCACACCGTCGCAACCGCCGGCATCTTCTCCGCCGTATCCTTCTGGTATTTTCTCCCTCTTTCTCTCTCCTGTTCTTCGCATGATAATTCATCCATGGCTGCCGGTATGGGTTCATGTTTGGAAGAGAATCATCTCGCAAGGAGCTTGGTGATCTCATCGACGACCTTCGCCGCTCCAATTCCGATTCCAATCCTACTCCTCCTCCTCACACTTGATTTTATTTTACTTGCTTCACTAGACCTTCAGGAGAGCAGTTTGCATGATCTGGTTGCTCCCCATCCTTCATTTCCATGCATTCTAGGGCTTGGTCTAAGCTTTTACCTTGTCATAGCACTGAAATTCTCCAATCCCTGGAAATCTCCAGGTGCCATTGCTTTCTGGATACCGTGTCTAAAGGAAGCATCACGAACACCGGCACCTTCCTATTATTCGATTGAGGATGACCTGTCAATTCATGGAGTTTCTCCCATTTCTCATTGCTTTTTTCTAACCCTAAGCTTGACATCTTCTCAGATATTTTATAAGTTAAGAAAAAGTTAA

Coding sequence (CDS)

ATGAAGAAGGTGTTGACGGAGAAGAAATTCACGCTCGTCCACACCGTCGCAACCGCCGGCATCTTCTCCGCCGTATCCTTCTGGTATTTTCTCCCTCTTTCTCTCTCCTGTTCTTCGCATGATAATTCATCCATGGCTGCCGGTATGGGTTCATGTTTGGAAGAGAATCATCTCGCAAGGAGCTTGGTGATCTCATCGACGACCTTCGCCGCTCCAATTCCGATTCCAATCCTACTCCTCCTCCTCACACTTGATTTTATTTTACTTGCTTCACTAGACCTTCAGGAGAGCAGTTTGCATGATCTGGTTGCTCCCCATCCTTCATTTCCATGCATTCTAGGGCTTGGTCTAAGCTTTTACCTTGTCATAGCACTGAAATTCTCCAATCCCTGGAAATCTCCAGGTGCCATTGCTTTCTGGATACCGTGTCTAAAGGAAGCATCACGAACACCGGCACCTTCCTATTATTCGATTGAGGATGACCTGTCAATTCATGGAGTTTCTCCCATTTCTCATTGCTTTTTTCTAACCCTAAGCTTGACATCTTCTCAGATATTTTATAAGTTAAGAAAAAGTTAA

Protein sequence

MKKVLTEKKFTLVHTVATAGIFSAVSFWYFLPLSLSCSSHDNSSMAAGMGSCLEENHLARSLVISSTTFAAPIPIPILLLLLTLDFILLASLDLQESSLHDLVAPHPSFPCILGLGLSFYLVIALKFSNPWKSPGAIAFWIPCLKEASRTPAPSYYSIEDDLSIHGVSPISHCFFLTLSLTSSQIFYKLRKS
Relationships

The following mRNA feature(s) are a part of this gene:

Feature NameUnique NameType
Spo09756.1Spo09756.1mRNA


Homology
BLAST of Spo09756.1 vs. NCBI nr
Match: gi|902148709|gb|KNA05272.1| (hypothetical protein SOVF_191980 [Spinacia oleracea])

HSP 1 Score: 59.7 bits (143), Expect = 6.500e-6
Identity = 29/29 (100.00%), Postives = 29/29 (100.00%), Query Frame = 1

		  

Query: 1  MKKVLTEKKFTLVHTVATAGIFSAVSFWY 30
          MKKVLTEKKFTLVHTVATAGIFSAVSFWY
Sbjct: 1  MKKVLTEKKFTLVHTVATAGIFSAVSFWY 29

BLAST of Spo09756.1 vs. UniProtKB/TrEMBL
Match: A0A0K9QDC6_SPIOL (Uncharacterized protein OS=Spinacia oleracea GN=SOVF_191980 PE=4 SV=1)

HSP 1 Score: 59.7 bits (143), Expect = 4.500e-6
Identity = 29/29 (100.00%), Postives = 29/29 (100.00%), Query Frame = 1

		  

Query: 1  MKKVLTEKKFTLVHTVATAGIFSAVSFWY 30
          MKKVLTEKKFTLVHTVATAGIFSAVSFWY
Sbjct: 1  MKKVLTEKKFTLVHTVATAGIFSAVSFWY 29

The following BLAST results are available for this feature:
BLAST of Spo09756.1 vs. NCBI nr
Analysis Date: 2018-06-29 (blastp Spinacia oleracea peptides vs. NCBI nr)
Total hits: 1
Match NameE-valueIdentityDescription
gi|902148709|gb|KNA05272.1|6.5e-6100.hypothetical protein SOVF_1919... [more]
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BLAST of Spo09756.1 vs. UniProtKB/TrEMBL
Analysis Date: 2018-06-29 (blastp Spinacia oleracea peptides vs. UniprotKB/TrEMBL)
Total hits: 1
Match NameE-valueIdentityDescription
A0A0K9QDC6_SPIOL4.5e-6100.Uncharacterized protein OS=Spi... [more]
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BLAST of Spo09756.1 vs. ExPASy Swiss-Prot
Analysis Date: 2018-06-29 (blastp Spinacia oleracea peptides vs. ExPASy SwissProt)
Total hits: 0
Match NameE-valueIdentityDescription
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BLAST of Spo09756.1 vs. TAIR (Arabidopsis)
Analysis Date: 2018-06-29 (blastp Spinacia oleracea peptides vs. TAIR)
Total hits: 0
Match NameE-valueIdentityDescription
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GO Annotation
GO Assignments
This gene is annotated with the following GO terms.
Category Term Accession Term Name
biological_process GO:0007623 circadian rhythm
biological_process GO:0006857 oligopeptide transport
biological_process GO:0005985 sucrose metabolic process
biological_process GO:0005983 starch catabolic process
biological_process GO:0000024 maltose biosynthetic process
biological_process GO:0006096 glycolytic process
biological_process GO:0006094 gluconeogenesis
biological_process GO:0042732 D-xylose metabolic process
biological_process GO:0006508 proteolysis
biological_process GO:0009909 regulation of flower development
biological_process GO:0016310 phosphorylation
biological_process GO:0009741 response to brassinosteroid
biological_process GO:0006355 regulation of transcription, DNA-templated
biological_process GO:0042967 obsolete acyl-carrier-protein biosynthetic process
biological_process GO:0016573 histone acetylation
cellular_component GO:0005667 transcription factor complex
cellular_component GO:0009570 chloroplast stroma
cellular_component GO:0000123 histone acetyltransferase complex
cellular_component GO:0005834 heterotrimeric G-protein complex
cellular_component GO:0000785 chromatin
cellular_component GO:0005634 nucleus
cellular_component GO:0005829 cytosol
cellular_component GO:0048046 apoplast
molecular_function GO:0004402 histone acetyltransferase activity
molecular_function GO:0030246 carbohydrate binding
molecular_function GO:0004034 aldose 1-epimerase activity
molecular_function GO:0003677 DNA binding
molecular_function GO:0003682 chromatin binding
molecular_function GO:0005515 protein binding
molecular_function GO:0004190 aspartic-type endopeptidase activity
molecular_function GO:0003700 DNA-binding transcription factor activity
molecular_function GO:0000166 nucleotide binding
molecular_function GO:0016301 kinase activity
molecular_function GO:0008270 zinc ion binding
molecular_function GO:0003712 transcription coregulator activity
molecular_function GO:0016161 beta-amylase activity
RNA-Seq Expression