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Sequences
The following sequences are available for this feature:
Legend: polypeptideexonCDS Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.ATGTGCCCCATCATTGTCAGAGATATGATCGAGCAATTCATCAATTTTGTGATTCGACCTCCCAGGTACTAAGTCCATTTCTCTTTAATCAAGCTTGCGATCTTGTCAGCAGGCCATCGTTCATATGCATATTTGTTGTTGCTTAGTGCTGAATAGTTTAAATTTGTTAATGAGTTTATGTTATGTGCAAGCAGCTAATTTCATGTGATTAAAAAGTGTACGTATGAATTTGTTGGTGTTGTAAGGAGAATAATGATTTCAAATGAGTAGAGATCCAAGGAAAAGTAGAAATGAGAAAGAAAGAAGTAAAGAGTTGCTTTCCCTATCTACTCCTACAACCCTAGTCTCCACTAGAGATATGGTTTCAGATATGATGGCCTCTAATGATCCTAACTTAGAAAGCACGAGGAAAAAAAATGTTTGAATCAGCAAATCACATTTCAATGCACTTCATCAATGTTTTCTCTCCTTTGCTCTTGCATGTGCATATACGAAGTGCTTTGTACAGTCGAAGATTTGAAATTAAATTATAATTTCACATCTAGATGCTTTTCTCTAATAATGCCGCTCTAGGTACTTACTCCTTCCGATGATTAAAAGAACAACTTTCACGCTGTAGTCTGTAGCTATGATAAAACCTTAATTGATTAGTTAATCGATGTTAGAGATTAGTTGTAAATTCTGTTTTTGGCGGGAAAAATAGTTAAAGTGTTTGTTAGTTGGGGTAACTGAACTCAATTAGTTGATCAGCTGTAAGCTTTAAATAGCTTAATCCTATATTGTAATAGGCATCTTGAAATAAATAAACTCTAATTCCCATCTTCTACTATTTTCTCTCTCATCTTCTCTCATCTTCTCTAATTTCTATTATCTTTCTTATTATTCAGCATTGAGGTTGCCTCTTGCATCAAGTTAGCCAAGGTTTCTTTATAATCTTTTGTTTGCCACAAGAAAATGTGTGGCCTTGTAGAATGGAACCCAAGTTCATGAGGAAGATGATTTTCTCTTGAATGCCGCTTTAGGCACACCACTACACCATCCACTGTCCAAAAGAGCCAACCTTGACTTCGTAAGTTTGTTGCTAACTAAGACTTCAATTTTCTGTGATAAACCAACCTAGAGGATGGGTTCTACGGGGAATGCCAATATAAATCTGTTCAGAGTTATCTTGGGGAATAAGTTGAGTAGCTAGAGTAGAGAAAGGGAAGATAATATCTATATGGAGAGATCATCAGTGAGAAGATTGATAAATATAACATTTTCTTTTCATGCCACCAGTCCATTTTTTGGCCTTGTAGAACTGAAACCAACTAACCTACGTTTGTTTTCTTTGACATAAAGTAGAGTTTTCAGATAGTGGAAACATGCCTCATCGATGCTATAATTTTCGAGAAAGGAATAAATCGCATCTTTATTGTTTTCGTTGAGATTCCCGTCATGATTTGAGGATTGGAATGGCTTGTGTAGTATTATTATTATTATTTTATTTAGTATTGGAATGTAAACGGTAGTTTTATATTCTTTTTCTTGATAAGTAAATTCTTCGACCCTCTTCCTCTTATATAATCAAGTATACAAAATGTCATTTTATGTTCTTTTCTCGAAAGTAAATTCTTGTTATATAGAGAAATATTATTGCTTGGAGATTGTTTAAGTTTTTCCCTCTTATCCAGATACTCTGTATTTATATTTAGTAGTCTCTATACTACACTACTACTTCTCCCTTACCCTTATTTTTTCCTTATTCCTACTTGCTCCGACTTTTTAATCCCTGCACCACATGGAAATTCACGCATCTCAATTAATATCGTCCATTATGTACTACTCGGTTACTATAGTTACGTGGTTTAAGAAAATTTTGAAAAAATGAGTGGGTGTAAAAGTATGATGAAGTAAAAGAGGAAGTAAAAGGTGGGTGGATGTAAGAAAAATATGAATGAAGTTAGAGTGTGTGGAAATGTGTAATTATTGTGGGATAAGAGGGGTAAGATGGTAAAGAAAATCTGCCTAAAAGAGAATAAAGCAAAGTAGGTAGAACAAAAAAGAACGGATAAAGATGGAAAGTGGATAGAACAAAAAAGAACGGAGATAATATATGTTTTGAAAGTATGTACCAAGATGAATCTAATAAGACCCCACATGCTTATATTTTTGCTCATACATACATCACAAAAAATGGTCTAAAGATTAATGTCCATACTAATTAACATTAGTATTGTTGTGTGACTAGTGTACAAATCTAAATGGTGCAATTCTAAAAAAGTGGAGCAAGAATTATCCTTTACTCTATCTGTCTTCAAAAGATTAATAATCATAATAACATTAATATTGCTGTTTTTATTTTGGTAGCTATCATATACTCGTAATTGTTGTGTTCCGGTTGTTAGTTACTATGGTTGTGATTTTCCCCCCTATGTTTTTGTATGGGTGTATGTTTGCATGTATAGGGCTGTGTATGATCCAGATCAATACCTATGGGAGAAGAATTTTACACTTGCTGGTAGAGCATTCAGAAGAGAAGATTTGGAGGCAAGTATGGGAATCAGCACCTAGCCTTTTCAATTATTATTTTTTCCCGTATTTTTTATTTATTCATTTGTATGTTGTGTCATTTTGTTATTTGAGCTTGGTGCAATGCCTCCCTCTGAAAATTTTCAGCTTGGAAATGAAAGAGGCCAGACCTTGAAGTGTAGTCATTATGTGCCATCTCTTCAGCCAGAAGATTCCGCTCTTCCTTGTGTTGTATACTGTCATGGCAACAGGTCTGTCAACAAATTAGATAATTTTTATTTGATAAAGGAACAGTCTACGCGAATTCTCAAAAATCTGTTTGTGTTACTACTGCAGTGGATGCCGGGCTGATGCAAATGAGGCTGCTGTTGTACTTCTTCCTGCAAATATTACAGTCTTCACTCTGGACTTCTCTGGATCAGGCTTATCTGATGGTAACTATGTCAGCCTTGGATGGCATGAGGTTTGGTTATGTCAAGATAGCTGTAATTTTCTGTAACTAAATGCACGGTTGCATTATCATCAAGTTCATTAATTCTCCTTTTCTACGCGACAGAAAGACGACCTCAGAGTTGTGGTTTCTTATCTAAGAAGTAATAAATGTGTATCGCGAATAGGACTTTGGGGAAGATCTATGGGTGCTGTTACAAGGTATAAAAGCATGTTGCTGCCTTTACTTTTCAACTTTCTCCAGTTGGCAATCTTCAAACAAATTAGGGAAAAATTGACTTTTACCACCTATGAATATTGACATATTGTTTTTTACCATCTAAAAAATAGAAATTGTATTTTACCACCTAAAATTAAATAAAAATTGTTTTTAAGGCAAGATGGTCAGAAACGTCATGTGGAGCCCCTTTTGACGCAAATCAAACATAAATCATACCAATACAACTTGACTCTCCTTTGCAAATCTGAAAAGAATATTATGCCTGTCAATTTGAGAAATATTACCAAATTATGTGAATTAATGGGAAACAATGGCAAATGGTAGCTTATTATACATGGAAATCGTGGGAGTAGAGAAGGAAATTAGAAATATAGCCGTTGAAATAGGTCCCGCTTATCGTTTCTGTCTATCTTGCCGTTAAGAGGTGGTTAAAAAAATTATTTTATTTTAGGTGCCAAAATACAATTTCTATTTTTTAAGGTGGTAAAACGCAATTTAGTAATTTTTTTAGGTGGTAAAAGTCAATTATTCCAATGAATTATACTCCTTTTCTTTTTTATATGTTGTAGTGCAATTTCATGCAGAATATACTTGATGCTTTTGATTACACGTTCAGTATACAACTTTTGAGAATTTTCTTACTGTTTTTCATCCTTGTTTGGTGACATAATTGTTTTCAGCATAATTTCCAATAGGATTGTCAAAATTGCTAGAGCTGTTATCGACTTATTGTCAATATTATTCTTTCCTTGCTTTGTTGGGGTGGGGATGTGATGAAACGATGAATTCGTTTTAAACATCTTGCCGTTAAAGCTGAATTAGCCGTCTGTTCTTATGTTCTAGAGTAGTTACATGGTTTTTGTTACGGTTTGTAAATTGGTAATGTTTGAGTTTGGGTTTAAAATTCTGTTTAGAGTAGTTTAGTTATATTCACAGCCCTGTGTGAGCCTTTCGAGTGTTGTGAATACATGATTTATGACTTTGTGGTTTAATTAGCTTGAATCAAGGTGTATTTGAGAATTTACTGGTTTTGATATCTTGGCATTGCCGTTCTATGCAGCCTTCTATATGGATCAGAGGACCCTTCAATATCTGGGATGGTTATAGACAGTGCTTTCTCTAATTTATTTGATCTGATGATGGAACTTGTGGATGTCTACAAGATCCGCCTCCCAAAATTCACTGTATGTATCATTTACTTCGTATTTGTTAGACTGATGTAGATGCAGAGCTGCCAAATATAAATGAATTTCTATTAACTATGGAAGGGGGGGGGGGGGGNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGACAGATGGAAGATTCCTTCCCAAGGAAGACAAAGAGTCAAAATGTCAAAGTCTACTCTAGGGACTAGTCGATACTAGCTACTGTAGGGACTTACTACCTCTCTTAAAAAAAAAAGAGCTACTCACTGTACTACCATCTTCTCCATCTTTCTTCCAAAATTCTCTTTCCTCTTTTCTTGCTCTGAATTCTATCTTCTTCTCTTTATTTTTGGCTTGTTGTTCTTTCCCGACAATTAAAACGGTTAATCTGAAATATAACGCCATAGAAAGGTTCATAACGGCGTACCACCGCTATGTAACGGAAATGCGCTGAGTTTTGTGTGAGTTCCATGCCACCGTTATATAACGGTG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ATGTGCCCCATCATTGTCAGAGATATGATCGAGCAATTCATCAATTTTGTGATTCGACCTCCCAGGGCTGTGTATGATCCAGATCAATACCTATGGGAGAAGAATTTTACACTTGCTGGTAGAGCATTCAGAAGAGAAGATTTGGAGCTTGGAAATGAAAGAGGCCAGACCTTGAAGTGTAGTCATTATGTGCCATCTCTTCAGCCAGAAGATTCCGCTCTTCCTTGTGTTGTATACTGTCATGGCAACAGTGGATGCCGGGCTGATGCAAATGAGGCTGCTGTTGTACTTCTTCCTGCAAATATTACAGTCTTCACTCTGGACTTCTCTGGATCAGGCTTATCTGATGGTAACTATGTCAGCCTTGGATGGCATGAGAAAGACGACCTCAGAGTTGTGGTTTCTTATCTAAGAAGTAATAAATGTGTATCGCGAATAGGACTTTGGGGAAGATCTATGGGTGCTGTTACAAGCCTTCTATATGGATCAGAGGACCCTTCAATATCTGGGATGGTTATAGACAGTGCTTTCTCTAATTTATTTGATCTGATGATGGAACTTGTGGATGTCTACAAGATCCGCCTCCCAAAATTCACTGTGAAGATGGCAGTGCGGTACATGCGGCGGGTGATTAGGAGGAGGGCAAATTTTGATATCAAGGACCTCAATTCCTTGCAGGTTGCGAGTCAAACTTTCATTCCTGCTTTGTTGGGACATGCTAATGGGGATAAATTTATTCAACCACACCACTCTGATGTCATCTTTAAATTGTATGCGGGTGATAAAAACATCATAAAATTTGACGGTGATCATAACTCTTCTAGGCCACAGTTCTACTATGACTCGGTTTCCATATTTTTCTATAATACCCTACATCCACCGCAAGTTTCTTCCGTTTGGTCCAATAAGATTGAGGAATGTCATGGCGTGAAAGATCCCGGAGTGGGTGCTGGTATGAATGAGAGGCTGCTGTATGAGATAATATCTAATCTTCATATTGCGAGTACTGATGCTGCAAGCTCATCTTCTGCTCTGCCCAGCTTTTCAACTGCTAAATCTGTTGGAGATATGCTCTCTGAAATTGTACCAGTCTTGGGCACAAATGACGTGATGTCTAATAAAGACATATGTGCAGCTAATGGGTATCTCCAGGTTAGAGGAGGGAGAGAGCATAGAAGAATGAGTTTCCGCTTTTCTTTTGTTTTTCATTTTGTTCAAGGGCTACCCGATTCGCAATGGTTGGGTTTCGCGGTTTTTCTCCCGTACCATACTAATCTAAGGTGCAAGAGAATCACAATCAAAGCATCGAATCATCAATTAGGCTCACTAAGGCATCCAAAAGTCAAAAATTGTTCTCAAATGAATAAATATGATCACAACCACCTAAAATGCACATTCACTCCCCCAAACTTGACTTTTGCTAAGAGAATCTTGGATTGTAAGATTAAGGGACTTGAGTAA MCPIIVRDMIEQFINFVIRPPRAVYDPDQYLWEKNFTLAGRAFRREDLELGNERGQTLKCSHYVPSLQPEDSALPCVVYCHGNSGCRADANEAAVVLLPANITVFTLDFSGSGLSDGNYVSLGWHEKDDLRVVVSYLRSNKCVSRIGLWGRSMGAVTSLLYGSEDPSISGMVIDSAFSNLFDLMMELVDVYKIRLPKFTVKMAVRYMRRVIRRRANFDIKDLNSLQVASQTFIPALLGHANGDKFIQPHHSDVIFKLYAGDKNIIKFDGDHNSSRPQFYYDSVSIFFYNTLHPPQVSSVWSNKIEECHGVKDPGVGAGMNERLLYEIISNLHIASTDAASSSSALPSFSTAKSVGDMLSEIVPVLGTNDVMSNKDICAANGYLQVRGGREHRRMSFRFSFVFHFVQGLPDSQWLGFAVFLPYHTNLRCKRITIKASNHQLGSLRHPKVKNCSQMNKYDHNHLKCTFTPPNLTFAKRILDCKIKGLE Relationships
The following mRNA feature(s) are a part of this gene:
Homology
BLAST of Spo09787.1 vs. NCBI nr
Match: gi|902154091|gb|KNA05783.1| (hypothetical protein SOVF_187260, partial [Spinacia oleracea]) HSP 1 Score: 726.5 bits (1874), Expect = 3.100e-206 Identity = 363/384 (94.53%), Postives = 365/384 (95.05%), Query Frame = 1
BLAST of Spo09787.1 vs. NCBI nr
Match: gi|731350611|ref|XP_010686591.1| (PREDICTED: uncharacterized protein LOC104900779 isoform X4 [Beta vulgaris subsp. vulgaris]) HSP 1 Score: 641.3 bits (1653), Expect = 1.300e-180 Identity = 320/396 (80.81%), Postives = 350/396 (88.38%), Query Frame = 1
BLAST of Spo09787.1 vs. NCBI nr
Match: gi|731350605|ref|XP_010686588.1| (PREDICTED: uncharacterized protein LOC104900779 isoform X1 [Beta vulgaris subsp. vulgaris]) HSP 1 Score: 637.1 bits (1642), Expect = 2.500e-179 Identity = 315/377 (83.55%), Postives = 340/377 (90.19%), Query Frame = 1
BLAST of Spo09787.1 vs. NCBI nr
Match: gi|731438503|ref|XP_010647089.1| (PREDICTED: uncharacterized protein LOC100242843 [Vitis vinifera]) HSP 1 Score: 588.6 bits (1516), Expect = 1.000e-164 Identity = 288/368 (78.26%), Postives = 328/368 (89.13%), Query Frame = 1
BLAST of Spo09787.1 vs. NCBI nr
Match: gi|731350609|ref|XP_010686590.1| (PREDICTED: uncharacterized protein LOC104900779 isoform X3 [Beta vulgaris subsp. vulgaris]) HSP 1 Score: 575.9 bits (1483), Expect = 6.800e-161 Identity = 281/340 (82.65%), Postives = 304/340 (89.41%), Query Frame = 1
BLAST of Spo09787.1 vs. UniProtKB/TrEMBL
Match: A0A0K9QGI3_SPIOL (Uncharacterized protein (Fragment) OS=Spinacia oleracea GN=SOVF_187260 PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 726.5 bits (1874), Expect = 2.200e-206 Identity = 363/384 (94.53%), Postives = 365/384 (95.05%), Query Frame = 1
BLAST of Spo09787.1 vs. UniProtKB/TrEMBL
Match: A0A0J8BWF4_BETVU (Uncharacterized protein OS=Beta vulgaris subsp. vulgaris GN=BVRB_8g184190 PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 637.1 bits (1642), Expect = 1.700e-179 Identity = 315/377 (83.55%), Postives = 340/377 (90.19%), Query Frame = 1
BLAST of Spo09787.1 vs. UniProtKB/TrEMBL
Match: A0A061GIU0_THECC (Alpha/beta-Hydrolases superfamily protein isoform 1 OS=Theobroma cacao GN=TCM_030483 PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 572.8 bits (1475), Expect = 4.000e-160 Identity = 275/364 (75.55%), Postives = 322/364 (88.46%), Query Frame = 1
BLAST of Spo09787.1 vs. UniProtKB/TrEMBL
Match: K7MJ87_SOYBN (Uncharacterized protein OS=Glycine max GN=GLYMA_17G003700 PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 566.6 bits (1459), Expect = 2.900e-158 Identity = 273/359 (76.04%), Postives = 318/359 (88.58%), Query Frame = 1
BLAST of Spo09787.1 vs. UniProtKB/TrEMBL
Match: K7L419_SOYBN (Uncharacterized protein OS=Glycine max GN=GLYMA_07G270200 PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 564.7 bits (1454), Expect = 1.100e-157 Identity = 275/378 (72.75%), Postives = 327/378 (86.51%), Query Frame = 1
BLAST of Spo09787.1 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: YQKD_BACSU (Uncharacterized protein YqkD OS=Bacillus subtilis (strain 168) GN=yqkD PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 67.0 bits (162), Expect = 6.400e-10 Identity = 62/225 (27.56%), Postives = 100/225 (44.44%), Query Frame = 1
BLAST of Spo09787.1 vs. TAIR (Arabidopsis)
Match: AT4G17150.1 (alpha/beta-Hydrolases superfamily protein) HSP 1 Score: 540.0 bits (1390), Expect = 1.500e-153 Identity = 259/363 (71.35%), Postives = 306/363 (84.30%), Query Frame = 1
BLAST of Spo09787.1 vs. TAIR (Arabidopsis)
Match: AT4G14290.1 (alpha/beta-Hydrolases superfamily protein) HSP 1 Score: 422.2 bits (1084), Expect = 4.400e-118 Identity = 193/287 (67.25%), Postives = 241/287 (83.97%), Query Frame = 1
BLAST of Spo09787.1 vs. TAIR (Arabidopsis)
Match: AT3G23540.1 (alpha/beta-Hydrolases superfamily protein) HSP 1 Score: 412.9 bits (1060), Expect = 2.700e-115 Identity = 187/287 (65.16%), Postives = 236/287 (82.23%), Query Frame = 1
BLAST of Spo09787.1 vs. TAIR (Arabidopsis)
Match: AT2G19550.1 (alpha/beta-Hydrolases superfamily protein) HSP 1 Score: 50.4 bits (119), Expect = 3.500e-6 Identity = 62/235 (26.38%), Postives = 97/235 (41.28%), Query Frame = 1
The following BLAST results are available for this feature:
BLAST of Spo09787.1 vs. NCBI nr
Analysis Date: 2018-06-29 (blastp Spinacia oleracea peptides vs. NCBI nr) Total hits: 5
BLAST of Spo09787.1 vs. UniProtKB/TrEMBL
Analysis Date: 2018-06-29 (blastp Spinacia oleracea peptides vs. UniprotKB/TrEMBL) Total hits: 5
BLAST of Spo09787.1 vs. ExPASy Swiss-Prot
Analysis Date: 2018-06-29 (blastp Spinacia oleracea peptides vs. ExPASy SwissProt) Total hits: 1
BLAST of Spo09787.1 vs. TAIR (Arabidopsis)
Analysis Date: 2018-06-29 (blastp Spinacia oleracea peptides vs. TAIR) Total hits: 4
InterPro
Analysis Name: InterPro Annotations of S. oleracea
Date Performed: 2018-06-29
GO Annotation
GO Assignments
This gene is annotated with the following GO terms.
RNA-Seq Expression
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