Spo10012 (gene)

Overview
NameSpo10012
Typegene
OrganismSpinacia oleracea (Spinach)
DescriptionWound-responsive family protein
Locationchr1 : 44395622 .. 44403426 (-)
Sequences
The following sequences are available for this feature:

Gene sequence (with intron)

Legend: polypeptideCDSexon
Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.
ATGTCAAATTCAAGGTAATATTATGGACCAATAAGTAATAACAGAAGAAGACAGTCAAATTTATAAGACTTGTCACAAAATCCTTTTGCTGTGCCTTTTCTTTTCATCACCCTCCTTCCTATCAGACTAATGAGTAACGAAATCAGATAGTTTATCAGCATTGACATGGAGTAAAAGCTGACAAACATATAAACCATTCAACATGTTTCTAATGTTTCTAAACTAAGAATCCAACTAAACCATTGAACATGTTTCTAAACTAGGAATCCAACTAAACAGTACAGTGGATGATCATATTCATAGTAGTAATAGTACGATCATATTCATAGCAATGGTAAAAATCAAAAAAAGGTGACTTCATAAATACTCCGTACTTCCGTAGTAAAAAGACGCAAAGGAAGAACTCAGCAGAATCATAATTCATGAAAAGAAGCCTCTTATAGGTTTATTTTTCCATAAACAAACACTTCCATCCCTTAAAAACAAAAAGTGGTATTCAAAGAAAAAGACATAACCTTTGAACCTTTTTTGATTTTATTCTAAGTCTGCCACAAGTCAAGCTAGCCAACCTACCACCTTTGTTGCACAGTTCAAAAAAAAAAGAGAAATCTCAGAACCCCATAAACAAAATCTTCACCAGAGAATTAAATGCAGAATAAATTATCAAATTACACAACAACTTAACAATTTGGTAAAACCAATGATTTATTTTTACTCATACACTAATGAACTCAAAAAATATGCAAAAACTATATAATCACGAAATTCTTAACGCAGAATTTGATATTTTGATCAATAACAATACCAAAAATTTAGCATTAATGATCAAGAACATGTCAATTGAGATTATAATGAGCGAAAATTACATATACATTAAACTAATTTACTCCATACCTGCGGAAAGGGTTGAGAATTTGAGATTGGTGGCGAAGAACAATTAAGCGAATTAGGAAGGGAAAAAAAAGATGGAAGGTGGCAAAGGGTAGAAAGAGAGAGAAAGAAGAAGTTGTTGATGGTCGATCATGCAATCTACCACCTTCCTCCCTCTTTGCTTTCAAAAGAGTTGTTAATTTTCACCTTGTTTTCCGGGTAATGCTCTGTTCAAGGGGAGGGAAAAGGTGGTGGTTTGGCAGGTGGTGGGTGGTGGTTGAAGGTGGTTGAAAGGGCGGAGAGAAAAAGAGGAGGCGCACACAAACAATATGTGTGGGATTGGGAGTGAGGTGGGACTCTTATTTTTAGGGGAGGGAGAAGGAGAACGTATGCTTCTACAAATCTATCTTTTTGTATTTTTGAGCTAATTTAATTTAAATGACGCTTTTGCCCTTGAAATCTTTTTAAATTCCCATTATGGAAGGTTTTGAGGACCAATGGGTTTATTTTTGGTATATTGCCATGCAATTTATTGCGCCCATCACTTTTTTCACTATTGTTATCTTGGAAGATTTGTGTATTAAAGGACTTACCAAATCTACCATGGAATAATAATGGGAAAGATGGGATTCATAGAGCAAATTTTGTGGTATACATAATACTAATTTTTGGTTCAGTTTATCATGCATTTGAATTTGAAAACGGTGATGAGTTTGTAGTTTTCTAACTCCAACAAGCAATTAACCAAATCACTTAATCATGATCAATGCAATATCTTAGGTGAGAGACTATATTTTTGGTTGAAAACTTTTCTTTTATTTATGGAAACTAGATTTTTTAAGTCTAATTAAGAATTTAAGATAGTGGATGTTATTGTCAAAAAAAAAAAATCTACTTTTGAGGAATAATTTACATGACAGATTGTCTTTTTCTAAACAAAAAAAAGTGGAGAAAATAAAAGAAAATCACTTGTAAATGACAACTTATATATTCACTACAAAATAATTGTTTTATAGACACGAGAAATTTCGTCTCTATATGGTCCAAATCCGTCTCTAAAATGATGTTTAGAGACGGATTTGAGACGAAAGTAGGGCGTCTCTATAGAGGGCGTCTCAAAAAAATTCGAGACGGAATTCTTGCAAATCCGTTACAAATTTGAGACGAAAATTTTGAAACTCCATATACGATTCCATCTCAATTTTAATTTAGATCACGAAATTTTAGTAATCTGTCTCAAATTTGAGACGTTTATTGTATCCGTCTCAAAATCCATCTCAAATTGATGCATAATTTTGTAGTGATTGCTCATTTTTCCGTCAAACTGGCGAGTTCACTTGGTTGTTTTGAGTGACTATTTGTATTGACATTTTTATTTTATTTCTTATGGGATATAAAAATTGTCATTTCTTAAAACAATAAAAACATGTTTGGTAAAATTGGTTGTTGAATACTACATACTTCGTATTATTTACAAGTTCAAAAGCCCTACTTGAAGCAACTTTTCTTTTTTTGCTTAAAAGTCAACTTGTCAACTGACTGAAAAAGTCGTTTACCAAACACACTTTTTTTGTTATTTTTCACACGGAGATTGGTATGGTTGTTTCTTGTCCAACCCAATCCTTTTCTTTGGTCAAACCGATTTTCTACACCCTAACCATTACCAAACCGAACGCACACCTCTTCATAAGATGCTTAGCCTTGACTTAAATCGTACTTTGTAATTGTTTATTTCTCTATGTCCAATATAAAATTACTATGCTATAGTCGTGTCTATTGGTTAAGCACTGAAGGCTTGTATATAATAAGTCACAAGATTGAATCACCCCCTCCCCAATTGTAATGTATTGCGCTTTGTCTTTTTCCCCTCCCCAATTGTAATGTATTGGGCTTTGTTTTTTTTTCTTCCCCAATTGTAACGTATTCCGATTTTTGTTTTTTTCTCCCCTCCCTAAATGTAATGTATCCCGTTTTGTTTTTTCACCCCTCGTATCACGATTTTCCAACGTGCTTGCTTCTCATTAAATGAATGGGATGCATGTATGTTCGTAGACTCCTGTCAAGCCACAGACAACCCGTTTTCCAAACCAACCACCACCACTTTTTCATTCTCTGGCCAAAATTCTCATCCACTTCCAACATTAGTTTCTTGGACTCCCCTCCAATGGGTTTCCATAAATTTAATTTTGACGGCTCCCGCAAAAACAACTATTTGTCAGCAGAGATCATCATCAGAGACTCCAACGGCGAACCCACCATAACTAAAACTTTCAACCTCGACGACTCATCGATCTACCTAGCATAAGCAATATATAACACTACAAAAAGGAATTCAGGAGGCATCACCTACATTCATCTGGAAGGGGATAACTTATTGGTTGTCAACAATACAAAAGGAAAATGGAAGACACCGTGGAAGCTCCAAACAATCATAGACGATATCCACAATCTCCTTCGATCGACATTTCAGTCACTAGGAGATTAATCACATCTACCGAGAAGGGATGGCAGCTGACTGGATAGCTAATGTAGGACATTTAATTAAAAATGCTATGTACTTTGATTTTTCTTGTAGTCTGCATCTCCTCTCGATTATACATTGAGACAAATTAGGTTTACCCCTCCTCTTGTAATCTGCACCTCCTCTCATTTATTTATAGAGACAAATTAGATTTACCTCTCAAGAGAAGGGCATCATAATTGTATTGGAAATACTTAGGGTAGGTGATTCTTGCAAAAAAAATCATCATTTTCTCAAGGACAAATTTCCTTTTGCAAGACACAATTAGTTATATAATGAAGTCCACTTTGTACAATGTACGGGTAATAACATAAGCTCGTTGTAGTACATAAATTTAAATTGGATACTTCGATTAGTGACAAGATCTTAAAAATGGAGTAAGTTTTGTGTAAGACCGAGTTATATTCATAAGAGCATATTTGTTACTCCAACATAAGTCATAACATTAGCACAAACCATATAATTTTTTGTATGAATGTGGCACAACTGCACAAGGGCAATAAAAGTTACAAATGAGGTAGAGGGAATCGAACATGACCTATTTTACACAGGTCCACAGTCTTAACCCTTAAGCCAAGACCTCATCGGTAAGAAACCTATAACTTAACATTACTCTTTCACAATAAGAGTGTAACTTTCAATTTGTATAAGCATTTGATAACAAAGTGTGTAATAATAATTAGTATAATTATTACATACTCATAAGACGATCTTATTTAAACTACTAGTTTTATAAGTAAGCGATGCGTGTGAAGATACAAAACACAAAATTATGTTATGTAAGAAAAATTATTCGCAAACTTTCTCTACAGAAAAGTAGATATCATAATTATTAGGTGATGTATTTTCATCAAAATTATTCGTTTCATTGAATTTTGTTAAAAAAATATGCATGATTTATTTGCGACAATATAAAAATGAGGTATATTAAAATATTTGAAAGGGAAAAATAAATTATGTGCGACAACTTTTGTGTAAGCGTGTCTTACCGAAAAGACCGCTTTGATGTCTTAATTAACTAATTGGTTGCTTTGCTTAACCAATTGGTTCCAATGCTTAATTAATTAATTCCATTGTTTAACTAATTGCTTCCACTATTTAACTAATTGGTTTCGTTGCTTAACTTATATGACACCAATCCTTATAGAAAAGCTTGTAAATTATGTGATTATTAAGGAGCATATTTGGTTGTGATTAAGTGTTTGATTACGATTTTTTTTTTCTAATTTTTTTTTTGACTTTTTGTTTGTTGTGTCTAAATCTGATTGACTAATTAACTATTTATCTTTTATGCCTTTAAATTTTATTTTACAATTAATGTCAATATAATTATTAAGTAATATTAAACATGATCGGCTCATTTCATTTTATGTCTTTTTAAAGATTGCATGATTCAATCCATGATTTGCATTAGACTTTCTTAATTTGTGATTTTCATTAAATAATCGATTTTTAAAATTAATTAAATTCAATGTCATAAAACAATCATCTTTTTCAATTAACTCAATTTAATGTTGAAGTTATGGAGGATATTTTAGACTATTTTATAGAGGGACACCAAAAATGCATTTACAAAAATAATCTCATTAGTTTTCTTATAGAATAGGGA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mRNA sequence

ATGTCAAATTCAAGGAAGGGAAAAAAAAGATGGAAGGTGGCAAAGGGTAGAAAGAGAGAGAAAGAAGAAGTTGTTGATGGTCGATCATGCAATCTACCACCTTCCTCCCTCTTTGCTTTCAAAAGAGTTGTTAATTTTCACCTTGTTTTCCGGGTAATGCTCTGTTCAAGGGGAGGGAAAAGGTGGTGGTTTGGCAGAGAAGAGAGAAAATCGCAGTCTAGGGTTTCCGAAGAACAGCTTAACAAACCGCACACAATGATTTACGACGTTAACTCACATCTCTTCCGTTCGTTCCTCAGCCAGAAGGGTGGAGCTGCTGAGAAGAGGTACCCCTCTCTCTCTCCTGATTGA

Coding sequence (CDS)

ATGTCAAATTCAAGGAAGGGAAAAAAAAGATGGAAGGTGGCAAAGGGTAGAAAGAGAGAGAAAGAAGAAGTTGTTGATGGTCGATCATGCAATCTACCACCTTCCTCCCTCTTTGCTTTCAAAAGAGTTGTTAATTTTCACCTTGTTTTCCGGGTAATGCTCTGTTCAAGGGGAGGGAAAAGGTGGTGGTTTGGCAGAGAAGAGAGAAAATCGCAGTCTAGGGTTTCCGAAGAACAGCTTAACAAACCGCACACAATGATTTACGACGTTAACTCACATCTCTTCCGTTCGTTCCTCAGCCAGAAGGGTGGAGCTGCTGAGAAGAGGTACCCCTCTCTCTCTCCTGATTGA

Protein sequence

MSNSRKGKKRWKVAKGRKREKEEVVDGRSCNLPPSSLFAFKRVVNFHLVFRVMLCSRGGKRWWFGREERKSQSRVSEEQLNKPHTMIYDVNSHLFRSFLSQKGGAAEKRYPSLSPD
Relationships

The following mRNA feature(s) are a part of this gene:

Feature NameUnique NameType
Spo10012.1Spo10012.1mRNA


Homology
The following BLAST results are available for this feature:
BLAST of Spo10012.1 vs. NCBI nr
Analysis Date: 2018-06-29 (blastp Spinacia oleracea peptides vs. NCBI nr)
Total hits: 0
Match NameE-valueIdentityDescription
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BLAST of Spo10012.1 vs. UniProtKB/TrEMBL
Analysis Date: 2018-06-29 (blastp Spinacia oleracea peptides vs. UniprotKB/TrEMBL)
Total hits: 0
Match NameE-valueIdentityDescription
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BLAST of Spo10012.1 vs. ExPASy Swiss-Prot
Analysis Date: 2018-06-29 (blastp Spinacia oleracea peptides vs. ExPASy SwissProt)
Total hits: 0
Match NameE-valueIdentityDescription
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BLAST of Spo10012.1 vs. TAIR (Arabidopsis)
Analysis Date: 2018-06-29 (blastp Spinacia oleracea peptides vs. TAIR)
Total hits: 0
Match NameE-valueIdentityDescription
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InterPro
Analysis Name: InterPro Annotations of S. oleracea
Date Performed: 2018-06-29
IPR TermIPR DescriptionSourceSource TermSource DescriptionAlignment
IPR012643Wound-inducible basicPFAMPF08186Wound_indcoord: 86..109
score: 5.

GO Annotation
GO Assignments
This gene is annotated with the following GO terms.
Category Term Accession Term Name
biological_process GO:0042254 ribosome biogenesis
biological_process GO:0006412 translation
cellular_component GO:0005840 ribosome
molecular_function GO:0003735 structural constituent of ribosome
RNA-Seq Expression