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Sequences
The following sequences are available for this feature:
Legend: polypeptideCDSexon Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.ATGTTGATGGTGCTGCAGAAATCGTCCTGTTTGTTAACCTTAGAAGTTTGGCATAAGATGCTTTTGGGCCCTATCGGATTTTCCAGGTAGAGGTAAGTGGTTTGGCTAAGTCAAACTATACTTGACTTCAATAATTAGTGTTTCGGTAAACTGATGTTAACTTTTGTATTCTAGTTTTGGATTGGTTTTTTTTTTTTTTTTGTCATAAGAAGTTACCTTTTTTACTGATATTTTCATTGATCAATATTGATTTGAACTAAATAAAAACTAACTTTACTAATAAAAAATTAATAATAATACTTTTTATGTTTAAGTTGGGCATTTAAAAATGATTTAAAAAAAATATTAAATGAAGTATATTTCCATATTAGGATTTTTTTAATGTTTCTATATTAGATGATCTCTTTCTTCTACTACAAATAACAATCTCTTTCCTTTCATAAAATATAAAAAATGACAATTTCTTTCCCATGTTTTGTTTGTAAAAACAATAATTTCTTTCCTTTTATAAAAATAGGGTCATTTTTATAAAAAATAATGATCTCGTTCCATATAAATGCTGCAACATAATCATGCCCATATCAATTTAGATAAATTTCCATAAGTTACATGGATTTCAACAATTAAATCTAAAAATGTTATATAATGACATCGCTCGGATCACTCACTAGACAATAAGGATAAAATGCGAAGTTGTACCCCTTTGCATGATCCATCTCGTTTAAGGACAATGACAAATGTAAGAGCTATTTCAACAAAGGACTTCGCGCTCTTCTTCAGATCTTCTTACACATAAAAACGTCTCATTACTTTTTTCCTCACTCCCCCAAAATTCTGCGTACCAAATTACTCTATTTTTTTTGTTGTCCCAAATTCCGAAGCACCCTTCACTAACTTGTCTCTTTCAGTTGTGTCTCTTCTACTACTACCCCACTTCACTCAACCACCCTTCTTCATTAATCAAATTTCTTTTTTGCTGTTACAATATTACTCAGAAGAGTGATTTTATGGCCTAATTCAAGCAATTTTGCTTCTGTGAAACGGTCAAGAATCATTCCTTTTCTTCATTTTGCTGAAACTTTGAAGATTTCAGCACCCAATTATCCATTTTTTAACAAAGTTCTTCGATTTGGCCATTTGGGGTGTTTTGTTCTGGTATAACATGTTAGACCCAGATTTTGTTTTGCTTATTTTGATGTGTTCTTTCAGAATTCTGTGTAAACTGTTTTTTATCTTTCTTTTTTAATTTATTTATAATTTTTTAAGTTTTTATAATTTTTTTTGGAATATTTTGCTGAAAGCTAGGAAATTTCATTGCCCAATTAACTTTTTTTTTATAAAGTTCTTTGATTTGGGCATTTGGGTTGTTTTGTTTGGCACCCAGAATAAATTTTGCCTAATTCTGTTGATTTTGATGTGCTCCCATTTTGCTGATATAATGGTAGAACCCTAGTTTTATGTGTTGTTTTGGATCAATTTTGATGTTTTTGGGTGAATTTTGATGTTAATTGTGTCTGCATTTTAGTGTGTTGGTGTGATGCTTGGGATGGATGCATCAGTGGAAATGGGTCCTACTGAGGGTGCTGTTCTGGCTTTACTGGACTTTCTGGTTGATCCTTTGCTGCCCGCCAGATCATCTTCAAGGGAGGCTATCACTCCTGCTCAAGAAGAATTGGTTGCTAAACAGGTTGATCATCCTGATGTTTATTTTATTTTATTTGCAGTTCTGGGTGTGATTGCTGCTAATGCATGGTAATTTTGCTTTGTTCATCCTTAGAATTAGCATTAGAGAAACAATTTAGTCAATTTTTTTGAGGGGTTGGATTATCTTAGTTGTAAAGGGTCTGTTGATGAATGGAAATTTTGCAATTCTTTTCTATACTCTTAAAAAGGTGTATTAGGTAGGCAATCGCCTTCGGATGGAGGGTTTATAGGAACGTTCCTCTTTGTAGTTGGAGTAAATTGCCTTCTAAGGAAGGGTCTAGGCACATGACTACTAGTATTATGTCCCTCGTTGGAAGGATTTACCCCATTTGGGTAATGGCATATGCTGGTCTTGTTGTGGTTCTACCTGGAGTAAATTCAAGGTTGAATTGTCTGAAGGGGAAGAAGGAACTCTTGAGAAAAATGTGGATAAAGTAAGAGACAGTAAGTGGAAAGGTGTAAATGTTGGGGTATGAGGATAAGGTATTAAAGGTATTTGCCAAATAAAGAACAAAGTTGAAGTGGTAGAAACAAAAAACTCAAAATGGAAAGTGAGTGGAACCAGAAAAAGGAGGGAGTACAATTAACATTATTCATTGAAAGTGATGTATGTGTATGTCTATCCTACACAATATAGCTATTTCAAGTACATATACAGACGACTACAGCATCAAGGCATTACCTTAATTTATTGAAAATCTGAATAGAATTATGGCCCTAATTTTAAGACCTAAGCATTCAGTTCATAGAAGAGGTAAATTGGACATAACATTTTTCTTCGCTTATGCAAAGAAATTATAAGCTTATGTCGTCATTTTCATTTAGTAAATAACTCATGGATTAACCATAGCAATTTCTCTGTCCCCAGGGAATTGACATTGGATATAGGAGTCTTAGCATTAAGATTCCTACTATATTTTGATCTATTCATGGATCGTCGGTTGCTTAAATGATCAATTTATTCCCTTTTCTAGTGGCAGAGACCGTAGGGTTATGAACGCAGTCATTAGTTTGCAGCTTAAAACATACATTTTAGTTATATATGGGTAGTCTAATATAGACATGCATATGACTTTCAGTACTAAATTCTTATATGGTATCTGTTTCTGTCAATTGACATCTTCAATACTGACATAGGTGCATGCAGTAGTGTTGCTGTACAATTATTACCACAGGAAACAACATCTAGATCTGGATTTTTTGGATTTTCAGTCTTTCTGCAAGCTGGCTGTGGTTCTGAAACCAAGTCTGCAATCATACTGTACGCTCATGGAAAGGACAGACTATGCTGAGCTGGATGACCTAGACAAACATCTGTCATTGACTGAGAAAGCGATCATGAATGCTTGTGATACTGCCAGAAGTTTAGATGCATCAAACAACAAACCGGACATTGAAGGTTGGCCTGTTACTAAAGTTGCTGTTTTCTTATTTGATCCCAGAAGAGAAAACTGCTATTTGTTCCATGGTTCCATCACTAAGGGGGTATGGTCGGCAATTGAAAAAGAGGTTAATGCTCCTAGTCAAGGGTCAGAAGCTGTAAATAAAAAGACTCGAGTCATTAAGAAGGCATCAAAAGAGAATCAAACTGCAGATGAAACTGTTCTTCGACAGCTTGCCTACATAGCTGTCAAGGAAACATGCGGTACGCTTATATGCTCACTTGGTAAAGCAATTCATTCCTTATATGATTGAATATTCTTGGTGTTGGACTGTTTTGTTTGGTGTTTCTTTGACTGATATTTGCATTAGGTACTACTTTCTATCTTGCTTTGATGTATATTCGCAATTGGCCCACCATCTACACTTCCTTTCCAAAGTTTTGGAATCTTTTGAAGGATGTATGCTAATTTGGTCAAGTGTACAAATCAGGGGTTAGGTTCTTCCTTTACATATTGCAGTTTACAAAATACACCATACTGGTTTTACTGTGCATTTTTTCTTCTTCTTACTATATGGGTCACCTACTCAACTAAAAGTGCATAATTTTTTCTCTTGACCTGGTTTTATACATGGGTTCCAGTTTTTCTGAGTCAAAATTGTTCTCCTTAATGTGTGTGAGATGTGATTTACAAAGTAGAACACTTCAACCTTACTTGCTATCAATACCGTTTATGGAATTTATAATGAGTCATTCACAACACCTATCATTTACCGTTCTTTATCCTCGCTCACGTGCACCTTTGATTTTTGGTAAGTCACGAAGGAATGTAAAACCTAGGTCTTGATTAGGAAACTTTATTGCTTTGAGTGGGGTGCTATTCTCACTGACATTTAGGTTTACAAAGTAAAGTTAAACATAATCTTCTCTCACGTCTTCTCACTTACTTTCTTTATCCCACTCAAGTGCACCTTTGATAGTTTTTGGCAAGTCACGACGGAAAGTGCAACCTTCGTCTTCATTAGGAAACTTTATTGCCCTGAGTGGGGTGCTATTCTCACTGACATTTTACAAAGTAAAGTTAAACATAACAAATTATTGTTCCATCTTCTCTCACATCTTGTCAATTAAGAGTTGTTAATGTTAATTTGTTAAGGGTAAACTAGAATTAGAAAGTCAAGTTTTATATTTTTGTTGACTTTTGTTGACTTTCGTATTTTTGACTTTTAAAAACAGATTGTTGAATCTGTTATAACCAACTTGCCACCTCAGCATTGTTAGTTGAGTTTGTTGAGCAAAGCTGGTATTAATACTTAGATTGATTGTATTTTGGAAATCATCATAATAATCAATCTTAATCTTCTCTCTAAATTATCTCTAATTCTCTTCTCTAATCTCTCTATTCTTCTCTATCTTCTTCTATTCTGTTTCTTTCTCTCGATTTTGTTCATATTATCTTGCAACCACCATTGTTAAGGTGAAGCAACAGCAGTGAGGTACACTCCTGCATCATAATTTAATATTAATATCCTATCAATTAACTTTAGTCAAATGCATTAATCATCACAGGGTAAACGTACTAGTCCCCAGGGATGTCTTGAGATGGATGTGTTAAGGGAGAACTTAGTTGATTAGCTGAATAATGTCAAAGTTGGTTTATTGTTGACTTTATTCCACTTGGCGCCAAATAACTGAATTTGAATTTTGTTGTAACAACTTTTGCTTAGTCAGCAATGTGTAAACTGATGTATTGAGCTTCAATATTGTATAAATATAGATAAACAAACGTGTATTAATACAAATTTCTTACGATTCTCTCAATTCTCTCCCAAAGCAGTCGAGGGTACTACCTGAGGATGAAAATAACAAGTCAACAATCATCACCGAACAACATGGTAATCGAGTCTAG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ATGTTGATGGTGCTGCAGAAATCGTCCTGTTTGTTAACCTTAGAAGTTTGGCATAAGATGCTTTTGGGCCCTATCGGATTTTCCAGAAGAGTGATTTTATGGCCTAATTCAAGCAATTTTGCTTCTGTGAAACGGTCAAGAATCATTCCTTTTCTTCATTTTGCTGAAACTTTGAAGATTTCAGCACCCAATTATCCATTTTTTAACAAAGTTCTTCGATTTGGCCATTTGGGGTGTTTTGTTCTGTGTGTTGGTGTGATGCTTGGGATGGATGCATCAGTGGAAATGGGTCCTACTGAGGGTGCTGTTCTGGCTTTACTGGACTTTCTGGTTGATCCTTTGCTGCCCGCCAGATCATCTTCAAGGGAGGCTATCACTCCTGCTCAAGAAGAATTGGTTGCTAAACAGGTGCATGCAGTAGTGTTGCTGTACAATTATTACCACAGGAAACAACATCTAGATCTGGATTTTTTGGATTTTCAGTCTTTCTGCAAGCTGGCTGTGGTTCTGAAACCAAGTCTGCAATCATACTGTACGCTCATGGAAAGGACAGACTATGCTGAGCTGGATGACCTAGACAAACATCTGTCATTGACTGAGAAAGCGATCATGAATGCTTGTGATACTGCCAGAAGTTTAGATGCATCAAACAACAAACCGGACATTGAAGGTTGGCCTGTTACTAAAGTTGCTGTTTTCTTATTTGATCCCAGAAGAGAAAACTGCTATTTGTTCCATGGTTCCATCACTAAGGGGGTATGGTCGGCAATTGAAAAAGAGGTTAATGCTCCTAGTCAAGGGTCAGAAGCTGTAAATAAAAAGACTCGAGTCATTAAGAAGGCATCAAAAGAGAATCAAACTGCAGATGAAACTGTTCTTCGACAGCTTGCCTACATAGCTGTCAAGGAAACATGCGGTATTAATTATTGTGATCTTAAAATTTTGGAGAACCACTTGGTGTATTCCACAAGCAAAGAAAAGACAGCTGTTCGCTTATATATAATGCAATGCAGGCAAACAAATCTGAACGTGGACCTGGTTCCAATAAATGATGTCATGGACAGCTTGCATGGACCATTGGTTAGAAAGGGTTCCTCCAGCTGGATCTTTACATCTGTTGTTGAATATTTTCACTTGCTTCCATTTTCCGATAAACTTTCAGATTGCCTGGCAAGGGAAATCCCCCTAGGTTCTCCACAACATTTCGAAGAGACAAAGGAGGATGGAAAACAACAATCAGATGCAGGAGCGGAATACGAATACTTCTCTGGCTTTCCTTCTTTGGAAGACCCGCTCCTGAACATTTCTGAATCTATGGAAGCAACAAAGGAGGTTCGAAATGGCAGAAGACATCACTTGAAAGAGGACGGTATTCAATATGTCTCACAAGGTTCTGAAGCACTGGATGTGTTTCCAAATGTCAGTAGCTTTAATATAAACAAGGAGCCCCCTCCATCCAATTCACAACACCCGGAAGCGGGACAGGTAGTGAAAAACGATAGTGGTTATCGACGAAGAGGGGATCATGTTGAGCCTGTAGTGTACAAGAAAAGAAATAAATCGATAAAGAACAACTCCAGTAAAAATCCAGGTGGCAAGACGACCAATGCTCCTACAGATTTTCCAAGGCAGTCAAATTATCAGTCAATTGTTGTGGCAGACTTTCCTATTACAAGTTCCAGGGAACATGATGTTGCAGGGACTTCATCTGGTAATGGGTTCGCTGATATTGTGATGCCACATCAAGATGGAAAACAAAACTGTGTTTCTTCTGAAGCCGACTTCAAGCATTTCCGCAAATTTCAGCTTGCTATTGCTTCAAAGGACAAATTGATATCGAATACTGCACTAAGTGTTCTGCTTAGGAAGAGAGAGCAACTGTCCCTGCAGGTTCGCAGTTTTGAAGATGAAATTGCCGTGTGTGATAGAAGCATCCAAACTATTTTAAGTGGTGGTGAAGATGATTTAGCTGTTAAAATAGACTCCATTTTGGACGGTTGTAACGAGAATTGTCTGAGAACTGTTGGTGCAGCTGGAGACAAAGCATCGCTGCATCTTGAAGATCAAGGCTTGGCTTCAATAGGGAAGAGGAGAAGACTTTCTGAGGCCAACATGTGTACACAGAGTCCTTGTCAGGAGTTGGATGGTTTATGCAATGCAAACTTTTGGTTTTTACCAACTTACTGTTTATCAACATCAGAAGGTGGCTTCCAGGCTACTGTTACTCTGAAGGGAATCGATTTTGAGTGTTCAAGTGAAGGAACCATACAAACAAACCCTTGTGAAGCGAGGAATTCAGCTGCATCAAACATTTTGGTTAAACTGCGGAGTAAGGAGAAGCGCCCTATCAGGTTTGAATCCTACAGGGTCAATCTAACCGATGTTAGCGGGCTAGATCCTTTTGGAGTTGAAGGTGGTGGGGTGGGGGGAACGGTAAGAGATTCTCACCCCCAAAGGCAAAGGACCGATTCTCACCCCCAAAGGCAAAGGACCCCTGGTGGGATTGAACCTACAACCTCAAGGTTGGAACTTGAAAGGTGGTCTTTAGTTATTTACCACTAG MLMVLQKSSCLLTLEVWHKMLLGPIGFSRRVILWPNSSNFASVKRSRIIPFLHFAETLKISAPNYPFFNKVLRFGHLGCFVLCVGVMLGMDASVEMGPTEGAVLALLDFLVDPLLPARSSSREAITPAQEELVAKQVHAVVLLYNYYHRKQHLDLDFLDFQSFCKLAVVLKPSLQSYCTLMERTDYAELDDLDKHLSLTEKAIMNACDTARSLDASNNKPDIEGWPVTKVAVFLFDPRRENCYLFHGSITKGVWSAIEKEVNAPSQGSEAVNKKTRVIKKASKENQTADETVLRQLAYIAVKETCGINYCDLKILENHLVYSTSKEKTAVRLYIMQCRQTNLNVDLVPINDVMDSLHGPLVRKGSSSWIFTSVVEYFHLLPFSDKLSDCLAREIPLGSPQHFEETKEDGKQQSDAGAEYEYFSGFPSLEDPLLNISESMEATKEVRNGRRHHLKEDGIQYVSQGSEALDVFPNVSSFNINKEPPPSNSQHPEAGQVVKNDSGYRRRGDHVEPVVYKKRNKSIKNNSSKNPGGKTTNAPTDFPRQSNYQSIVVADFPITSSREHDVAGTSSGNGFADIVMPHQDGKQNCVSSEADFKHFRKFQLAIASKDKLISNTALSVLLRKREQLSLQVRSFEDEIAVCDRSIQTILSGGEDDLAVKIDSILDGCNENCLRTVGAAGDKASLHLEDQGLASIGKRRRLSEANMCTQSPCQELDGLCNANFWFLPTYCLSTSEGGFQATVTLKGIDFECSSEGTIQTNPCEARNSAASNILVKLRSKEKRPIRFESYRVNLTDVSGLDPFGVEGGGVGGTVRDSHPQRQRTDSHPQRQRTPGGIEPTTSRLELERWSLVIYH Relationships
The following mRNA feature(s) are a part of this gene:
Homology
BLAST of Spo10234.1 vs. NCBI nr
Match: gi|902132561|gb|KNA04324.1| (hypothetical protein SOVF_200720 isoform A [Spinacia oleracea]) HSP 1 Score: 1375.9 bits (3560), Expect = 0.000e+0 Identity = 691/693 (99.71%), Postives = 692/693 (99.86%), Query Frame = 1
BLAST of Spo10234.1 vs. NCBI nr
Match: gi|902132562|gb|KNA04325.1| (hypothetical protein SOVF_200720 isoform B [Spinacia oleracea]) HSP 1 Score: 1356.3 bits (3509), Expect = 0.000e+0 Identity = 691/733 (94.27%), Postives = 692/733 (94.41%), Query Frame = 1
BLAST of Spo10234.1 vs. NCBI nr
Match: gi|731390880|ref|XP_010650537.1| (PREDICTED: uncharacterized protein LOC104879453 isoform X1 [Vitis vinifera]) HSP 1 Score: 505.0 bits (1299), Expect = 2.600e-139 Identity = 312/708 (44.07%), Postives = 419/708 (59.18%), Query Frame = 1
BLAST of Spo10234.1 vs. NCBI nr
Match: gi|731390890|ref|XP_010650542.1| (PREDICTED: uncharacterized protein LOC104879453 isoform X2 [Vitis vinifera]) HSP 1 Score: 503.1 bits (1294), Expect = 9.900e-139 Identity = 314/712 (44.10%), Postives = 425/712 (59.69%), Query Frame = 1
BLAST of Spo10234.1 vs. NCBI nr
Match: gi|1000939731|ref|XP_015583222.1| (PREDICTED: uncharacterized protein LOC8266748 isoform X3 [Ricinus communis]) HSP 1 Score: 451.4 bits (1160), Expect = 3.400e-123 Identity = 300/709 (42.31%), Postives = 402/709 (56.70%), Query Frame = 1
BLAST of Spo10234.1 vs. UniProtKB/TrEMBL
Match: A0A0K9QAN5_SPIOL (Uncharacterized protein OS=Spinacia oleracea GN=SOVF_200720 PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 1375.9 bits (3560), Expect = 0.000e+0 Identity = 691/693 (99.71%), Postives = 692/693 (99.86%), Query Frame = 1
BLAST of Spo10234.1 vs. UniProtKB/TrEMBL
Match: A0A0K9QAN6_SPIOL (Uncharacterized protein OS=Spinacia oleracea GN=SOVF_200720 PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 1356.3 bits (3509), Expect = 0.000e+0 Identity = 691/733 (94.27%), Postives = 692/733 (94.41%), Query Frame = 1
BLAST of Spo10234.1 vs. UniProtKB/TrEMBL
Match: A0A072VBT1_MEDTR (Aleurone layer morphogenesis protein OS=Medicago truncatula GN=MTR_2g098830 PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 441.0 bits (1133), Expect = 3.200e-120 Identity = 279/711 (39.24%), Postives = 394/711 (55.41%), Query Frame = 1
BLAST of Spo10234.1 vs. UniProtKB/TrEMBL
Match: G7IHU0_MEDTR (Aleurone layer morphogenesis protein OS=Medicago truncatula GN=MTR_2g098830 PE=4 SV=2) HSP 1 Score: 441.0 bits (1133), Expect = 3.200e-120 Identity = 279/711 (39.24%), Postives = 394/711 (55.41%), Query Frame = 1
BLAST of Spo10234.1 vs. UniProtKB/TrEMBL
Match: A0A067L325_JATCU (Uncharacterized protein OS=Jatropha curcas GN=JCGZ_23744 PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 436.8 bits (1122), Expect = 6.000e-119 Identity = 283/707 (40.03%), Postives = 391/707 (55.30%), Query Frame = 1
BLAST of Spo10234.1 vs. TAIR (Arabidopsis)
Match: AT1G05950.1 (unknown protein) HSP 1 Score: 223.0 bits (567), Expect = 6.900e-58 Identity = 134/346 (38.73%), Postives = 193/346 (55.78%), Query Frame = 1
The following BLAST results are available for this feature:
BLAST of Spo10234.1 vs. NCBI nr
Analysis Date: 2018-06-29 (blastp Spinacia oleracea peptides vs. NCBI nr) Total hits: 5
BLAST of Spo10234.1 vs. UniProtKB/TrEMBL
Analysis Date: 2018-06-29 (blastp Spinacia oleracea peptides vs. UniprotKB/TrEMBL) Total hits: 5
BLAST of Spo10234.1 vs. ExPASy Swiss-Prot
Analysis Date: 2018-06-29 (blastp Spinacia oleracea peptides vs. ExPASy SwissProt) Total hits: 0
BLAST of Spo10234.1 vs. TAIR (Arabidopsis)
Analysis Date: 2018-06-29 (blastp Spinacia oleracea peptides vs. TAIR) Total hits: 1
InterPro
Analysis Name: InterPro Annotations of S. oleracea
Date Performed: 2018-06-29
GO Annotation
GO Assignments
This gene is annotated with the following GO terms.
RNA-Seq Expression
Co-expression
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