Overview
Sequences
The following sequences are available for this feature:
Legend: exonfive_prime_UTRpolypeptideCDSthree_prime_UTR Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.CGGAGGTAGGGAGACAGAGAAATTCATTACATACTACAGTGTTTTGGTCTGTGGACGAACATTTCATACATTCATGCGCCATACACATGCTCATAGCTCTACGCCATAGTTCCCGCCATTTTCCCCCAACTTCACCACCAAAATTTGTGCGACTCTGTGGTGGCATGTTCACCATTTCTTCTTCCTCTTTCTCTTGCTTCCTCAATCTTCTGTCACTCAACGCCACTGCCAGATTCTCCTCTTCTTTCTCTCTCCTCCCATACAATTCCCATTTCCCTGCAAATTTAAAGCTTCGAGCCATGTCTTCTCTACCTTCCGCTTTTGACAAACTAATGTCCGGCGCTCGTCAAAATGCCACTGCCAAGAAGAAATCCCAAACCCCCAGCAAAAGCAACGCCAATTCTTCGTCTTCACCAAGAAAACGAAAAACCTTAAACCCATCTCCCCCAATTTCGGAAAACCCTAAACCCACCTCGATTTCTGTCGAGAAACCCTTAGAAGCTGATTCGGGTGTAGAATCAGATACCCAGAAGAGTGAATTGAAAAGCCATGTTACCAAGAAAGCTAAGGAAGATCCTAACCCCGCTTCGGTTTCTGTGGAGAAACCCTTAAAATCTGATTCGGGGATAGAATTAGATACCAAAAAGAGTGAATTGAAAAACCCTTTTGCTAAGAAATCTAAGGTGGATGTTAATGTGGATAAATTTGTTGCCAATTTGAAGGAAAAACCGGCAAGTTTTAAACCTAATTCGGCGGCGTGGTGGGAGGATGGTGATAAGGTTCCATTTCTCTTTCTTGCCAGGGCGTTTGATTTGATTAAAGGAGAATCGGGTAGGATTGTGATTACTAATATTACTTGTAATGTGCTGAGGACTGTGATGGCGACGACTCCTGATGATCTTTTGGAGGTTGTTTATTTGTTGGCCAACAAGATTGCACCTGCCCATCAAGGGTTGGAACTCGGACTTGGTGATGCTTCGCTTATTAAGGCGCTTGCCGAGTCGTGTGGAGCCTCTGAAGCAGTTGTTAAGACTTCATATCGGGTAATGGCATTTGATTATCTGTTGGTTTATACATGTAATTCAATTAGCATTTGTTGTTTCATGTATTTATGTATGTTGACTTGCAATGTATGGATGTTTGATAATGTTGACTTGCAATGTATGGATGCAATGTATGGTGTTGTATGTATGTAGACTTGCAATGTATGAATGTGTGTTAGTTTGATTAAAAAGACTAGGTTTTTTCGACCAACATTTAACATTGCATGCATGAAAAATGTATGGTAAAGTTCTCTTAAGATGTTTTAGATTGTAAAATTGGCGGTTCTTGGTTGTTAAAACATCTGACTGTACTTGTTATCTGTTGCATTAACAGGATTTAGGTGATCTTGGTGATGTCGCCAAAGTACTCCGTTCTAAGCAAAGTATGATGTTTCAACCTCCACCGCTGACTATTGCTAAAGTTTTCAATACATTCCAACTCATTGCTCAGGTGTAGTGTTCAATCCTTATGTTTTAGCTACATTTTATATGCTCTTTTTCTTGGCATAATAGGTTGAGAGGGAATATGAACTTTCAATAGTTTTTCCATTGTCTAATTTCCTCAATTTTCTTCCTTGCTGTTCTGACTTTCGACATTGTTCACGAAAAAATGGTTAAACCAAGTCAAAGAAATTGATTAGAAGTTTAGAATTAAAGTGGATATGTATTTGTTCATTGATGATGTTTCCCTCTCACCTTTACTGTCATCTTATGTTGCTTTTGTTTGTCGTTTTTTCAGGCATCTGGAAAGGATAGTCAAGAAAGGAAAAAAAATTACATCATGTCACTTATTGTGGCTGCCAAAGATTGTGAACCTGTATATTTGATGCGGCTACTTCAGGTTTGGTTTGGATACAAGCGAATTTTGTTTTTATAATATTTTGTTTCCTTTTTACATCATTATGTTTATTTTACAGGCAAAATTGCGGATTAGTTTGGCAGAGAAAACTCTCCTTACTGCTCTGGGACAAGCTGCTGTGTATTCTGAAGAGCAGTCAAAGCCCCCTTCTGATATTCAACTAGAGGAGGTAAGTGTTGTCTGGATGATATCTTATATCAGCACTTCGTATGGTAGATCGGCATCAAGATTGTCCTCCTATTTTGTTGATTATTGTTGTGCTGTTGTATTCTTTGTTTACCCTCTGAGACTACTGAGATGATTAGCTGCTATTATCTGTTTGGAAACAAGTTTTTTTTTTTTACTGATGTGTAGAAAATGTATGATGATCTGTTCATCTGTTGCTGCCGTCCGAAGGTCATGCTCCACATAGTAGCTGAAAACACTGCCGCTTAACTATTAATACGTATATATGTATGACTAGATCTTGGCATTGTTAAGAAAAAAATTCGTATCTTATACGTCAGAGAGGCTGAGAGTATTTCTCGAATTTTAAATTATTGTAATTGGACTTAGCTTGACCGCTTTGTCTTTGTCTTTGTCATATAGATTTTATTTCTTATTATATTCTGTCTCCAATTTCACTCTGCTAATAAGGTCAATTATTAGGAGAGTAGGAGCTTCAGTTACAAGTCTAATAACTGCCCAAGAGAGAGATTTAATAAGTGCAGAGAACAAACATGGAAATTTGAATACTTCTGGTAAGCTTTCCAAGAGTATATTTATCGCGTTCAAGAGCTTCCATGGCATGATTTTGATAGGGGATGAAGGTTTCCCTACTGGCTGGTAGTTGAACTTTAACCTGTATGGGAAAATTACTGATACTTATATTAATAACTGAGTTCTGGTGCACTTCTTAAAGCTTTTAAAGTTTGACCAAGGAATAGTCAATATTGAAGGCTTCACTGTTGATTTAAGGCTTCATTATTAGCTCACGAGGCTTCAATAAAAAGTTTGTGATAAGTAGTGGCTGAGATCAAGCTTCTCCAGTCAAAGGATTCTTTTCCATAGCTCATCATCAGTTATGGATTCTTTTAGCTCATCTAAAAGTAAAATATTTGCAAGTCCTGTGGTTAGAAGATTATTAAACTTGTGAGCTTACAGTTTTGCACGCATCTAGAAAAGTTTGTCTCCTTTCGATTTATCTTCACAGCCTTCTTAATTTTGGATCAAGGACACTCTATTCTCATTTCCCAAAAAGAAACTTAAAGAAAAAGGAGGAGAAATATGTTAAACATCCTTTTATTTGGTTTGAAAATTTTCATAGGTTGAGAAAATTCAACTAGTAATCTTAAAACAACTATACTTTTAAGTTTTTAATTTACTAATTAGGTTCTAGTTGTAGACTAAGTGAGACTTTTATGAGGTAGAAATTATTGAAATTGGAGAAGGCTTGGGACGTTGTTTATGGATTCATAAATGCCTGCCAGAAACTCTGGATACCAAAGTTATTTTATTTCAATTTAAAAAGGATAGTGTTGAAATTAGTTTCTTCTGCTTATCAAACATAACTACACAAGAGTTTGTTTTTAGGGTTGTCCCCTTTGTCTGGATTTTGATGTCATTTTGACCTTTTTGTGATATTTGAAGACGCTTTTAATCATTTATAACTTATTAAATTTGTAAAAGTGATGTTGTTAAAACTTCTTTTTTGTTTAGTGTAAATGTAGAATTTGATTTTGTAAAAGCTACATGCTTTTTGCTTTTTCAAATAGCATAATCAAATCTAGAGGGATGGAGCGTAAACGAAAAATACAGTGGTAACAACTCAACGTTGAGAGTTTGAGACTATTGTGCCATTTTTCCAGTATGTGTAGTTCTAGAGAGATTCTTTTGATAAGTTTCATATTTTCTGTCACATTAAATGGGTTTCTACTCCCTCGTTATTTTCCCCTTTTCATGAATTTGTGATTTTCTTGAAGTTCATATTCACAGTTTACATTTCAATTGGCATCATATCCATTATAAAAATTGAGCAAAGCTAACCTGTTTTCCCTTAATCTTTGTCTTGATCTCTGTTCTATTGAGAATTTTGTAACAACTCAACGTTGAGAGTTTGAGACTATTGTGCCATTTTTCCAGTATGTGTAGTTCTAGAGAGATTCTTTTGATAAGTTTCATATTTTCTGTTGCATTAAATGGGTTTTCTACTCCCTCGTTATTTTCCCCTTTTCATGAATTTGTGATTTTCTTGAAGTTCATCTTTACAGTTTACATTTCAATTGGCATCATATCCATTATAAAAATTTAGCATAGCTAACCTGTTTTCCCTTAATCCTGTCTTGATCTCTGTTCTCTTGAGAAATTTGTCTAGACTGCTCAATTCACATTTGTGACATACCCTGGCGTGTTTGTTGATATGAGCAGTTATAGTTTTGAATATAGCTACATGATTTTCTTTTATAATACCTTAGGCCCCTTTCGGTATAGTTTTTTGTTTTTTTACAAAACTAAAAACCAAAATATGAAAACCACAAAAAGTAGTTTCCAGTTTTTTGTTGTCAGTTTTCAAAATCAACATGATTACTATATATTAATTTTTAGTTCATGATTCAATCTAAACCATATGACTTTCAAAACCAAAACTGGAAACTAGATTATGATTTTTTGCACAAGTCTCATAGACTTTGTTTTTGCAACTTATTTATGTTACGTCTTGCGTGCTTTTCATCTATGCTCACGATTTCTAATTTGTCTGTATCAGGCTGGAAAGATTGTCAAAGAAGTATATTCTGTGGTTCCCGTTTATGATAAAATAGTCCCTGCCCTTCTCCATGATGGTGTGTGGAATCTGTCGAAGACCTGTAACTTTACACCAGGTGTTCCTATAGGGCCTATGTTAGCAAAACCAGCAACTGGAGTTTCAGAAATTATAGATAAGTTTCAAGATATGGTGTTTACCTGCGAGTACAAGTACGATGGAGAACGTGCTCAAGTAATTTCCGTGTACCTTTTTCTCATTTCCCTGATTATTTTAGGTATGTTATGTTGTTGCCATCCTTTTCGGTGCCAAGGGTCTGAAAGGATTAGTTCTCTGCAGAGATGTTTTGTAC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CGGAGGTAGGGAGACAGAGAAATTCATTACATACTACAGTGTTTTGGTCTGTGGACGAACATTTCATACATTCATGCGCCATACACATGCTCATAGCTCTACGCCATAGTTCCCGCCATTTTCCCCCAACTTCACCACCAAAATTTGTGCGACTCTGTGGTGGCATGTTCACCATTTCTTCTTCCTCTTTCTCTTGCTTCCTCAATCTTCTGTCACTCAACGCCACTGCCAGATTCTCCTCTTCTTTCTCTCTCCTCCCATACAATTCCCATTTCCCTGCAAATTTAAAGCTTCGAGCCATGTCTTCTCTACCTTCCGCTTTTGACAAACTAATGTCCGGCGCTCGTCAAAATGCCACTGCCAAGAAGAAATCCCAAACCCCCAGCAAAAGCAACGCCAATTCTTCGTCTTCACCAAGAAAACGAAAAACCTTAAACCCATCTCCCCCAATTTCGGAAAACCCTAAACCCACCTCGATTTCTGTCGAGAAACCCTTAGAAGCTGATTCGGGTGTAGAATCAGATACCCAGAAGAGTGAATTGAAAAGCCATGTTACCAAGAAAGCTAAGGAAGATCCTAACCCCGCTTCGGTTTCTGTGGAGAAACCCTTAAAATCTGATTCGGGGATAGAATTAGATACCAAAAAGAGTGAATTGAAAAACCCTTTTGCTAAGAAATCTAAGGTGGATGTTAATGTGGATAAATTTGTTGCCAATTTGAAGGAAAAACCGGCAAGTTTTAAACCTAATTCGGCGGCGTGGTGGGAGGATGGTGATAAGGTTCCATTTCTCTTTCTTGCCAGGGCGTTTGATTTGATTAAAGGAGAATCGGGTAGGATTGTGATTACTAATATTACTTGTAATGTGCTGAGGACTGTGATGGCGACGACTCCTGATGATCTTTTGGAGGTTGTTTATTTGTTGGCCAACAAGATTGCACCTGCCCATCAAGGGTTGGAACTCGGACTTGGTGATGCTTCGCTTATTAAGGCGCTTGCCGAGTCGTGTGGAGCCTCTGAAGCAGTTGTTAAGACTTCATATCGGGATTTAGGTGATCTTGGTGATGTCGCCAAAGTACTCCGTTCTAAGCAAAGTATGATGTTTCAACCTCCACCGCTGACTATTGCTAAAGTTTTCAATACATTCCAACTCATTGCTCAGGCATCTGGAAAGGATAGTCAAGAAAGGAAAAAAAATTACATCATGTCACTTATTGTGGCTGCCAAAGATTGTGAACCTGTATATTTGATGCGGCTACTTCAGGCAAAATTGCGGATTAGTTTGGCAGAGAAAACTCTCCTTACTGCTCTGGGACAAGCTGCTGTGTATTCTGAAGAGCAGTCAAAGCCCCCTTCTGATATTCAACTAGAGGAGGCTGGAAAGATTGTCAAAGAAGTATATTCTGTGGTTCCCGTTTATGATAAAATAGTCCCTGCCCTTCTCCATGATGGTGTGTGGAATCTGTCGAAGACCTGTAACTTTACACCAGGTGTTCCTATAGGGCCTATGTTAGCAAAACCAGCAACTGGAGTTTCAGAAATTATAGATAAGTTTCAAGATATGGTGTTTACCTGCGAGTACAAGTACGATGGAGAACGTGCTCAAATCCATTTCATGGAAGATGGTTCTGTTGAGATATACAGCCGAAATGCTGAAAGGAACACGGGGAAGTTCCCTGATGTCGTTGCTGCACTTTCTAGGTTCAAGAAGCCATCTGTAAATTCTTTCATTTTAGATTGTGAAATTGTTGCTTATGATCGTGAGAAGCAGAAGATTCTTCCTTTTCAGATACTTAGCACCCGAGCTCGCAAAAATGTCAAAGAGAGTGACATAAAGGTTGATGTTTGTGTCTTTGCTTTCGACATATTGTATCTGAATGGAAAGCCACTTCTTCAGGAACAGCTTAATGTTCGTAGGAAGCATCTTTACGATTCATTTGAAGAAGATTCTGGGTATTTTCAGTTTGCTACAATACTCACGTCTAATGATCTTGAAGAAATACAGAAGTTTCTTGATGCGGCTATCAATGCTAGTTGTGAAGGATTGATTATCAAAACGTTAGAAAAAGAGGCTACCTACGAGCCTTCAAAGCGATCTAATAACTGGCTTAAATTGAAAAAGGATTACATGGACAGCTTTGGGGACTCTCTGGATCTGGTGCCAATTGGAGCATTCAATGGTCATGGGAAACGAAAAGGTGTATATGGTGCTTTTCTCCTTGCTTGTTATGACAGTAACAATGAAGAGTTCCAGAGCATATGTAAAATCGGTACTGGTTTTTCTGATGCAGTGCTTGAAGAACGTTCTTCCAGTCTTCGAACTAAAGTGATTTCAGATCCAAAGCCATACTTTCGATATGGAAATACCCTAAAACCAGATTGCTGGTTTGAGCCCTCTGAGGTTTGGGAGGTCAAAGCAGCTGATTTAACTATTAGTCCTGTTCACCGTGCTGCAGTTGGTGAAGTAGATTCTAACAAGGGAATTTCACTCCGGTTTCCGCGTTTGGTTCGTCTTAGAGAAGATAAAGCTCCAGAGGACGCAACATCATCTGTTCAGGTTGCAGAAATGTACAGAGCTCAAGCAAACAATCCACACAAAAAAAAGCAAGATGATCTGGAAGATGACGACTGATCGATACTGTGTCTCTAATTCCTATACTGGGGCAAGTCTTCTGTTTGAAATTCTTGTTGGGAGTCAATACTGATAAACAGGCATATACTTGAGGCTCATTTGGATCAAGATAAGATGCTCAGACGCAGAAATCGCATCCACGGCATTTGATCAGAGTTTGACAGATATCTGGTAATTCGTTACCAAAACTATGGATCAAAAAATACAACCGGATTCTTAGACATTTCTAGTTTTAGCAGTCATGTAATGTATACTTTGGTATCACCAACAAGCCTTTCTGTTTTCAATGGCGTTCTTGGTTACCGCTGTCTGTACCTGTAATAGTGTAATCAAGTCTCGTTCGTCAATGAGTTGTAATTTACCAGCCACTTATGTTGAATATCATTGGCATGGTCCTGTATTTGATTCATTTTTAAACCTTTTTCCGTGCTTCTATTTTATCATGTAATGCTAATGTTAACTCATTTTCGGTGCTTCATTGGCAATTTGGCATGGTTCCTGTATTCCACTTATGTTGAATATCATTGTCATTTATTAGCCA ATGCTCATAGCTCTACGCCATAGTTCCCGCCATTTTCCCCCAACTTCACCACCAAAATTTGTGCGACTCTGTGGTGGCATGTTCACCATTTCTTCTTCCTCTTTCTCTTGCTTCCTCAATCTTCTGTCACTCAACGCCACTGCCAGATTCTCCTCTTCTTTCTCTCTCCTCCCATACAATTCCCATTTCCCTGCAAATTTAAAGCTTCGAGCCATGTCTTCTCTACCTTCCGCTTTTGACAAACTAATGTCCGGCGCTCGTCAAAATGCCACTGCCAAGAAGAAATCCCAAACCCCCAGCAAAAGCAACGCCAATTCTTCGTCTTCACCAAGAAAACGAAAAACCTTAAACCCATCTCCCCCAATTTCGGAAAACCCTAAACCCACCTCGATTTCTGTCGAGAAACCCTTAGAAGCTGATTCGGGTGTAGAATCAGATACCCAGAAGAGTGAATTGAAAAGCCATGTTACCAAGAAAGCTAAGGAAGATCCTAACCCCGCTTCGGTTTCTGTGGAGAAACCCTTAAAATCTGATTCGGGGATAGAATTAGATACCAAAAAGAGTGAATTGAAAAACCCTTTTGCTAAGAAATCTAAGGTGGATGTTAATGTGGATAAATTTGTTGCCAATTTGAAGGAAAAACCGGCAAGTTTTAAACCTAATTCGGCGGCGTGGTGGGAGGATGGTGATAAGGTTCCATTTCTCTTTCTTGCCAGGGCGTTTGATTTGATTAAAGGAGAATCGGGTAGGATTGTGATTACTAATATTACTTGTAATGTGCTGAGGACTGTGATGGCGACGACTCCTGATGATCTTTTGGAGGTTGTTTATTTGTTGGCCAACAAGATTGCACCTGCCCATCAAGGGTTGGAACTCGGACTTGGTGATGCTTCGCTTATTAAGGCGCTTGCCGAGTCGTGTGGAGCCTCTGAAGCAGTTGTTAAGACTTCATATCGGGATTTAGGTGATCTTGGTGATGTCGCCAAAGTACTCCGTTCTAAGCAAAGTATGATGTTTCAACCTCCACCGCTGACTATTGCTAAAGTTTTCAATACATTCCAACTCATTGCTCAGGCATCTGGAAAGGATAGTCAAGAAAGGAAAAAAAATTACATCATGTCACTTATTGTGGCTGCCAAAGATTGTGAACCTGTATATTTGATGCGGCTACTTCAGGCAAAATTGCGGATTAGTTTGGCAGAGAAAACTCTCCTTACTGCTCTGGGACAAGCTGCTGTGTATTCTGAAGAGCAGTCAAAGCCCCCTTCTGATATTCAACTAGAGGAGGCTGGAAAGATTGTCAAAGAAGTATATTCTGTGGTTCCCGTTTATGATAAAATAGTCCCTGCCCTTCTCCATGATGGTGTGTGGAATCTGTCGAAGACCTGTAACTTTACACCAGGTGTTCCTATAGGGCCTATGTTAGCAAAACCAGCAACTGGAGTTTCAGAAATTATAGATAAGTTTCAAGATATGGTGTTTACCTGCGAGTACAAGTACGATGGAGAACGTGCTCAAATCCATTTCATGGAAGATGGTTCTGTTGAGATATACAGCCGAAATGCTGAAAGGAACACGGGGAAGTTCCCTGATGTCGTTGCTGCACTTTCTAGGTTCAAGAAGCCATCTGTAAATTCTTTCATTTTAGATTGTGAAATTGTTGCTTATGATCGTGAGAAGCAGAAGATTCTTCCTTTTCAGATACTTAGCACCCGAGCTCGCAAAAATGTCAAAGAGAGTGACATAAAGGTTGATGTTTGTGTCTTTGCTTTCGACATATTGTATCTGAATGGAAAGCCACTTCTTCAGGAACAGCTTAATGTTCGTAGGAAGCATCTTTACGATTCATTTGAAGAAGATTCTGGGTATTTTCAGTTTGCTACAATACTCACGTCTAATGATCTTGAAGAAATACAGAAGTTTCTTGATGCGGCTATCAATGCTAGTTGTGAAGGATTGATTATCAAAACGTTAGAAAAAGAGGCTACCTACGAGCCTTCAAAGCGATCTAATAACTGGCTTAAATTGAAAAAGGATTACATGGACAGCTTTGGGGACTCTCTGGATCTGGTGCCAATTGGAGCATTCAATGGTCATGGGAAACGAAAAGGTGTATATGGTGCTTTTCTCCTTGCTTGTTATGACAGTAACAATGAAGAGTTCCAGAGCATATGTAAAATCGGTACTGGTTTTTCTGATGCAGTGCTTGAAGAACGTTCTTCCAGTCTTCGAACTAAAGTGATTTCAGATCCAAAGCCATACTTTCGATATGGAAATACCCTAAAACCAGATTGCTGGTTTGAGCCCTCTGAGGTTTGGGAGGTCAAAGCAGCTGATTTAACTATTAGTCCTGTTCACCGTGCTGCAGTTGGTGAAGTAGATTCTAACAAGGGAATTTCACTCCGGTTTCCGCGTTTGGTTCGTCTTAGAGAAGATAAAGCTCCAGAGGACGCAACATCATCTGTTCAGGTTGCAGAAATGTACAGAGCTCAAGCAAACAATCCACACAAAAAAAAGCAAGATGATCTGGAAGATGACGACTGA MLIALRHSSRHFPPTSPPKFVRLCGGMFTISSSSFSCFLNLLSLNATARFSSSFSLLPYNSHFPANLKLRAMSSLPSAFDKLMSGARQNATAKKKSQTPSKSNANSSSSPRKRKTLNPSPPISENPKPTSISVEKPLEADSGVESDTQKSELKSHVTKKAKEDPNPASVSVEKPLKSDSGIELDTKKSELKNPFAKKSKVDVNVDKFVANLKEKPASFKPNSAAWWEDGDKVPFLFLARAFDLIKGESGRIVITNITCNVLRTVMATTPDDLLEVVYLLANKIAPAHQGLELGLGDASLIKALAESCGASEAVVKTSYRDLGDLGDVAKVLRSKQSMMFQPPPLTIAKVFNTFQLIAQASGKDSQERKKNYIMSLIVAAKDCEPVYLMRLLQAKLRISLAEKTLLTALGQAAVYSEEQSKPPSDIQLEEAGKIVKEVYSVVPVYDKIVPALLHDGVWNLSKTCNFTPGVPIGPMLAKPATGVSEIIDKFQDMVFTCEYKYDGERAQIHFMEDGSVEIYSRNAERNTGKFPDVVAALSRFKKPSVNSFILDCEIVAYDREKQKILPFQILSTRARKNVKESDIKVDVCVFAFDILYLNGKPLLQEQLNVRRKHLYDSFEEDSGYFQFATILTSNDLEEIQKFLDAAINASCEGLIIKTLEKEATYEPSKRSNNWLKLKKDYMDSFGDSLDLVPIGAFNGHGKRKGVYGAFLLACYDSNNEEFQSICKIGTGFSDAVLEERSSSLRTKVISDPKPYFRYGNTLKPDCWFEPSEVWEVKAADLTISPVHRAAVGEVDSNKGISLRFPRLVRLREDKAPEDATSSVQVAEMYRAQANNPHKKKQDDLEDDD Relationships
The following mRNA feature(s) are a part of this gene:
Homology
BLAST of Spo10932.1 vs. NCBI nr
Match: gi|902234638|gb|KNA23525.1| (hypothetical protein SOVF_024140 [Spinacia oleracea]) HSP 1 Score: 1590.9 bits (4118), Expect = 0.000e+0 Identity = 821/821 (100.00%), Postives = 821/821 (100.00%), Query Frame = 1
BLAST of Spo10932.1 vs. NCBI nr
Match: gi|731355459|ref|XP_010689152.1| (PREDICTED: DNA ligase 1-like [Beta vulgaris subsp. vulgaris]) HSP 1 Score: 1152.5 bits (2980), Expect = 0.000e+0 Identity = 606/794 (76.32%), Postives = 676/794 (85.14%), Query Frame = 1
BLAST of Spo10932.1 vs. NCBI nr
Match: gi|870850230|gb|KMT02360.1| (hypothetical protein BVRB_9g205840 [Beta vulgaris subsp. vulgaris]) HSP 1 Score: 1152.5 bits (2980), Expect = 0.000e+0 Identity = 606/794 (76.32%), Postives = 676/794 (85.14%), Query Frame = 1
BLAST of Spo10932.1 vs. NCBI nr
Match: gi|568869601|ref|XP_006488009.1| (PREDICTED: DNA ligase 1-like [Citrus sinensis]) HSP 1 Score: 1000.0 bits (2584), Expect = 2.600e-288 Identity = 536/834 (64.27%), Postives = 641/834 (76.86%), Query Frame = 1
BLAST of Spo10932.1 vs. NCBI nr
Match: gi|567863606|ref|XP_006424457.1| (hypothetical protein CICLE_v10027871mg [Citrus clementina]) HSP 1 Score: 997.3 bits (2577), Expect = 1.700e-287 Identity = 527/787 (66.96%), Postives = 623/787 (79.16%), Query Frame = 1
BLAST of Spo10932.1 vs. UniProtKB/TrEMBL
Match: A0A0K9RVH1_SPIOL (DNA ligase OS=Spinacia oleracea GN=SOVF_024140 PE=3 SV=1) HSP 1 Score: 1590.9 bits (4118), Expect = 0.000e+0 Identity = 821/821 (100.00%), Postives = 821/821 (100.00%), Query Frame = 1
BLAST of Spo10932.1 vs. UniProtKB/TrEMBL
Match: A0A0J8BLT6_BETVU (DNA ligase OS=Beta vulgaris subsp. vulgaris GN=BVRB_9g205840 PE=3 SV=1) HSP 1 Score: 1152.5 bits (2980), Expect = 0.000e+0 Identity = 606/794 (76.32%), Postives = 676/794 (85.14%), Query Frame = 1
BLAST of Spo10932.1 vs. UniProtKB/TrEMBL
Match: V4SB42_9ROSI (DNA ligase OS=Citrus clementina GN=CICLE_v10027871mg PE=3 SV=1) HSP 1 Score: 997.3 bits (2577), Expect = 1.200e-287 Identity = 527/787 (66.96%), Postives = 623/787 (79.16%), Query Frame = 1
BLAST of Spo10932.1 vs. UniProtKB/TrEMBL
Match: A0A059AA31_EUCGR (DNA ligase OS=Eucalyptus grandis GN=EUGRSUZ_J00386 PE=3 SV=1) HSP 1 Score: 977.2 bits (2525), Expect = 1.200e-281 Identity = 517/786 (65.78%), Postives = 617/786 (78.50%), Query Frame = 1
BLAST of Spo10932.1 vs. UniProtKB/TrEMBL
Match: A0A0D2RMQ3_GOSRA (DNA ligase OS=Gossypium raimondii GN=B456_003G146000 PE=3 SV=1) HSP 1 Score: 973.0 bits (2514), Expect = 2.300e-280 Identity = 524/811 (64.61%), Postives = 625/811 (77.07%), Query Frame = 1
BLAST of Spo10932.1 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: DNLI1_ARATH (DNA ligase 1 OS=Arabidopsis thaliana GN=LIG1 PE=2 SV=2) HSP 1 Score: 922.9 bits (2384), Expect = 2.500e-267 Identity = 507/828 (61.23%), Postives = 621/828 (75.00%), Query Frame = 1
BLAST of Spo10932.1 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: DNLI1_DICDI (DNA ligase 1 OS=Dictyostelium discoideum GN=lig1 PE=3 SV=1) HSP 1 Score: 641.7 bits (1654), Expect = 1.100e-182 Identity = 353/787 (44.85%), Postives = 505/787 (64.17%), Query Frame = 1
BLAST of Spo10932.1 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: DNLI1_MOUSE (DNA ligase 1 OS=Mus musculus GN=Lig1 PE=1 SV=2) HSP 1 Score: 609.0 bits (1569), Expect = 7.900e-173 Identity = 341/778 (43.83%), Postives = 481/778 (61.83%), Query Frame = 1
BLAST of Spo10932.1 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: DNLI1_HUMAN (DNA ligase 1 OS=Homo sapiens GN=LIG1 PE=1 SV=1) HSP 1 Score: 605.1 bits (1559), Expect = 1.100e-171 Identity = 352/823 (42.77%), Postives = 506/823 (61.48%), Query Frame = 1
BLAST of Spo10932.1 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: DNLI1_XENLA (DNA ligase 1 OS=Xenopus laevis GN=lig1 PE=2 SV=1) HSP 1 Score: 604.4 bits (1557), Expect = 2.000e-171 Identity = 335/776 (43.17%), Postives = 484/776 (62.37%), Query Frame = 1
BLAST of Spo10932.1 vs. TAIR (Arabidopsis)
Match: AT1G08130.1 (DNA ligase 1) HSP 1 Score: 922.9 bits (2384), Expect = 1.400e-268 Identity = 507/828 (61.23%), Postives = 621/828 (75.00%), Query Frame = 1
BLAST of Spo10932.1 vs. TAIR (Arabidopsis)
Match: AT1G49250.1 (ATP-dependent DNA ligase) HSP 1 Score: 775.0 bits (2000), Expect = 4.700e-224 Identity = 391/603 (64.84%), Postives = 485/603 (80.43%), Query Frame = 1
BLAST of Spo10932.1 vs. TAIR (Arabidopsis)
Match: AT1G66730.1 (DNA LIGASE 6) HSP 1 Score: 513.8 bits (1322), Expect = 2.000e-145 Identity = 274/693 (39.54%), Postives = 423/693 (61.04%), Query Frame = 1
BLAST of Spo10932.1 vs. TAIR (Arabidopsis)
Match: AT5G57160.1 (DNA ligase IV) HSP 1 Score: 108.2 bits (269), Expect = 2.500e-23 Identity = 144/608 (23.68%), Postives = 249/608 (40.95%), Query Frame = 1
The following BLAST results are available for this feature:
BLAST of Spo10932.1 vs. NCBI nr
Analysis Date: 2018-06-29 (blastp Spinacia oleracea peptides vs. NCBI nr) Total hits: 5
BLAST of Spo10932.1 vs. UniProtKB/TrEMBL
Analysis Date: 2018-06-29 (blastp Spinacia oleracea peptides vs. UniprotKB/TrEMBL) Total hits: 5
BLAST of Spo10932.1 vs. ExPASy Swiss-Prot
Analysis Date: 2018-06-29 (blastp Spinacia oleracea peptides vs. ExPASy SwissProt) Total hits: 5
BLAST of Spo10932.1 vs. TAIR (Arabidopsis)
Analysis Date: 2018-06-29 (blastp Spinacia oleracea peptides vs. TAIR) Total hits: 4
InterPro
Analysis Name: InterPro Annotations of S. oleracea
Date Performed: 2018-06-29
GO Annotation
GO Assignments
This gene is annotated with the following GO terms.
RNA-Seq Expression
Co-expression
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