Spo11610 (gene) | SpinachBase

Overview


Name	Spo11610
Type	gene
Organism	Spinacia oleracea (Spinach)
Description	Unknown protein
Location	chr6 : 39793083 .. 39819144 (+)

Sequences

The following sequences are available for this feature:

Gene sequence (with intron)

Legend: exonfive_prime_UTRpolypeptideCDSthree_prime_UTR

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CCTAAGTTTTATTGAGAGTGCTTTTTATTTGAGCTTCTTGTTGAAGTATTTGTAGTTCGGTTTATTTGATGTCTTATATTGAAATCTTCTTTGGAGTAAATTCGTGAAGGCTTGATAAATTTAGCTAATTTTGGGACTTGTCTTAGGAATATTGTTCAACATGATTTTATGGGCAGTGTTGTGTTTGATTTTTGGGTCTTGATGATGAGAGTTGAAAACTTGTGGGGTTGTTCAGCTGAGAACCAGTTACTAGAGAATATTTTACTTTATTTTGATTTATAAAATTAGTTATAGAGTCCTTGAAACCGATTTTTTTAAAGAACGGGGATGTTTTTACTAATGATTTCTTATCCAACTGTTTGAAATTTGTTTTGACAATTTTTTTTAATAGTGAATAGCTATTTTTCCGGGCCTAGAGACTGTTATCATGTGCTTTATGGAAAGTTCTTTTGGAAGCTTTGGAGAAAAGTCTTGAATGTTTCAGGTGGTTATTATTGGGAGGAACGGTGTTTACTGACTAAGGTAAGTGATTTTGACAGTGTCGTGCTCATAGGAAATTTGATGGTGCCTAAAGTTATGAGTGAAGGGAAAGTCTTTTATTGTAAGCGTACTTCGGAGTTAATTTGTGTAGGCCTAGTTTCATTTAAACAGTATTTGGAGTAATATAAGGAACCAAGTTCACTGTGCTTTGGTGGTTCTTGTGTTTGATGTATGGGTCTTTCTTATTAAAGGAGTTGTCTCGATGCTGGATTAGTCAATTAAAATTTAAAATGTGATTGCTGAATTTTTTTTCTACCTCTTGATGGTTATAGGTAGGCAACTAGGTATATAAGTATGTAAAATTTAGTCTATCCTTTAGTTCGTAAAACTAAATTTACTGATAAACTATTTTTTTCTATAGTATGTGTTACTTTCTTTTAGTGCATAAGACTTGGTTTGACTGAATACTTCTTTAAGCATAACTACATTTGAGGTCCTAGCGATTATGTTGATCACGTGGTTTTTGGACAGTCATATTCTTGAAGCTTAGTGAGAGTGATCTTGAATGTTCTCGTGGTTATTACTTGGATGACCGATGTTGACCTGTAGAGGAAAGTGATTTTGATTTGTAGAGGAAGGTAATTTCGACAACCGAGTGCTTTTTATTTGAGCTTCTTGTGGAAGTATTTGTAATTTGGTTTATTTGAAGTCTTATATTGAAAGCATCCTTGGAGTAAATTCGTGAAGGCTTGATAAATTTAGCTACCTTGGGAGTTGTTTTAGGAACCAAGTTCACCTTTTTTTTATGGGCATTGTGTTTGATTTTTAGGTCTTGATAATGAGAGTTGTTAACTACAAGTGGAATAATTCAGTTGAGAACCTGCTATTAGGGAATATTTTGCTTTGTTTTGATGTATTAAAGTTAGTTATAGAGACCTTAATCCCAAGTTTTTAAGAACGGGATGTTTTTACTAAAGGTTTCTTATCTAACTGTTTGGCATTTGGTTTGACTTATTTTAAAGAAAAAATAGTGAATAGCTATTTTTCCGGCCCTAGGGACAGTATTTATCATGTGGTTTATGGAAAGTTCTTCTGGAAGCTTAGGAGAAAAGTCTTGAATGTTTAGATGATTATTATTAAGAGGAATGGTGTTTACTGATTACGTTAAGTGATTTTGACATCAGTGTCGTCTCGAAAGAAATTTGATGATGCCTAAAGTTTTGAGTGAAGAACAGAGTGTGTTTGATTTTGAGGTTTTTGTGGTTGTATTATCACGCGGTTTATAGGAAGTCTTATATTGAAAGGACTCTTGGAGTAAGTTTGTGAAGGCCTAGTGCTCCTTATAATTTAAGCAACAGTATGCGGAACCAACTCATTGTGGGATTGTTTAGAATATCCTATGATTAGGTAACATTTGACTTCCTTTTGTTGGATTGAAGTTACTTATAGAGTCCTCTAAAACTGATTTTCTAAGAAAATTAGTTTTTTCACTAATGGTTTCTCCAATTGTTTCAAATTTGTTATAAATTTTCTTCGTAAGGCACCTATTTGAGGTCCTATAGTAGTGTTTATTTTGTGGTTTATGAAAAGTTCTATTTTGGAAGCTTATTGAGAATCTTAAATGTTCTGATGGTTTTATTTTAAAGAGGAACAATGTATACTGGTCGAGGTAAGTGACTTTGACAACAGTGATGTTACAAAGTTTTTGATTACTAAATATTTCTAGTAAAAAGAAGAGAGGTGTAGTGTATGATTTGGAGGTTTTAGGTGTTGTATGCACTTTATGGATAGTCTTACATTGAAAGCGAAAAGCGTGTTTTGAATAAATTTGTGAAGGCGTAGTTTAATTTAAGCTTTCTTCATTAAAGAAGGTTCAATTTAGGGAAAGGTCACAATGCTTTGATGGTTCTCGTTGTGTTTGATTTATGGGTCCTAGTCTTACTGATTAAAGGAGTTGACTCAATGCTGGATTGTTTTGAGAATTGAACTGTGATTGGAGAATATTTGACTGCCTATTTAATGTTTATTGATAGGTATATAAATATGAACGATTAGGTCTTACTTATAGTTCATAAAACTGACTTTACTAATAAACTGATTTTTTATATAATTATCTGAATGTTTATAACTTGTTGTGACCTGACTGAAGATTTTTTCAAGTGAAACTAGTATTAAGGTCCTAGAGAATAGAGTTTGTGTCGAAGGTTTATGAAAAGTTATATTTTGGTAGCTTAGTGAGGATATTCTTGAATGTTCTGATTTTTTATTATTGAAAGGATTGATGTTGACTTGTAGAGGAAAATGATATTGACAACCAAGTGTAGTGTGGAGTTTTTGATGCCTAAGTTGTCTTAGTGAAGAATAGAGTGTCTTATATTTGAGGTTTTAGTGGTCGTACTTGTTATTGGGTTTGTTGTAAGTTTTTTTTATTGAAACCTACTAGGAGTAAATCCGTGAAGGCTTTATGCCTTTATTTAAGAATTTCTTTAGGAACAAAGTTCATTATTTTTTATTGTTATCATCGTCTTTTACTTGTGGGTCTTGATGATGAGAGGTGTTTACTTAATGTAGGATCTATTTGTTGAGGGGTTAACTATGATTAGGTAATATTTGACTCCTTGTATGGATTAAATTTAGCTATAGAGATTTGTACTATTATATCTGATTTTTAGTTTTTACTTTTTAGTTTTCCAAAATGGTTTCCTATCTAACTGTTAGAAACTTGGTTCGACGGTAGATATTTTATAAGTCAATTGCTTATATTGAGGTTCTAGTGATAGTTTTTATTATGTGCTTTTTGAAAAGTTCTGTTTTGGAAGAGTAGTGGGAGTATTTTTAATGTTCCGGTGGTTATTATTAAGAGGTTCGATGTTGCCGGACGGAGGAAAGTGATTTTGACAACATAGGGTGGTAGGGGAGTTTTTGATGCCTTGGTTTTCTTAGTGAGTAGAAGAGCTGTTTTATTTTTTGGATAGAGAGGTTGTATTTATTATGCAGTTTATGGTGAATCTTACATGGAAAGCATACTTGGAGGTAGTTTGTGAAGGCTTAGTTTGAATTCGGGGAATATTACAAGGATCCTATTTCACTATGTTTAGATGGTTATCGTGGTGTTTGATTTGCGGGTCTTAATGATTAACTCAATGGGGAATTGTTCTGTTGAGAAATAAACTGTGACTGGGGAATGTTAAACTACTTTTTAATGGATTTAAATTAGTTATAGTGCGTTCTACAATTAAATCTGATTTTAAGTTCTTCAAAACAATTTGCCTAATAGTGATATTTTACTAATGATTTTTTATGTAACTGTTTGAAACATGTTTTGATTGAATAGTACTAGTACATATTTAGCTGTTTTTGAGGTCCTGAAGATGTGTTCATTATTTGGTTTATTGAAAGTTCTATTTTGTATTCCTAACGAGAGGAATCTTGAATGTGTCCTGATGGTTTTTATTAAGAGGATTGATATTTTCTGTCACAGGAAAGTGATTTTTACAATAATGTGTGTCGGGAGTTTTTGAAGCCATGTTTCTTAGTGAAGAGAAGAGAGTGTTTTATTTTTGCGGTTCTATGGTTGTATTTATGTATGCGGTTTATGGTAGTCTTATAAATGAAAGCATACTTGAAGTAAATTTGAGAAGGCTTAGTCTAAATTAAGTGTTTTTTGGAGTAATACAAAGAACCAACTTATATATCAATATATGTTTCAAATGTTATCATGGTATTTGATTTTATGGTCTTAGTGATGAGAGTTGTTAACTCATGTGGGATTGTTCTGTTTTGAATAACCTGTGGTTAGGGAATATTTGACTTCATTTTGATGGCTTAAAGTTTGTTATTGTGTCCTTAGACCTGATTTTACTTAGAAAAGGATTTTATACTAATGCTTTCTTATCCAACTGTTTTGGGGGTGGAAAAAAGTTAAACTACAGAACCTATTTAAGTGAATAACTATTTTTGCTGGCCTAGAGATGGTATTTATTATGTGGTTTATGGAAAGTTCTATTTTGGAAGCTTAGTGAGAGTAATCTTGAATGGTCCGTTGGTTATTGAGAGCACAAATGTTGACTAACGGAGGAAGTGATTTTGACAACATAGAGCTGTAGTGGAGTTTTTTATGCCTAAGTTTTCTGAGTGAAGAGAAATAAGTGTTATATTTTGAGGTTTTAGTGTTTGTGTTTATTATGTGATTTACGGAAAGTCCTATATTAAAAGCATGCCTGGATAAGGAGCTAAGTTCAGTATGTTTTGATGGTTTATGGTTATCCTTGTGTTTGATTTTTAGGTCTTAATGACAATATATGTTACTCAATGTGGAGATTGTTCTGTTGAGAATAAACTGCTGATTATTGAAGTGTTCAACTTCATTGTTATGGATTTAAGTTAGTTAAAAATATTTGTACAATAATCTGATTCTTAGTCCATAAAACTGGTTTTACTAAAGAGAGGATTCTTTACTAATGGTTTCTTATCTATCTGTTTGAATCTTGGGGCTAGCTAGTTTTGAAGGCCTAGAGATATGTGGTGTATGGAAAGCTCTATTTAAAAGATCAATGATAATGGAGGATAGTAATTTTGACAACAAAGTGTGGTAGCGAGTTTTTTATGGCTAAATTTTCTTATTGAAGAGAAGATACCGGTTTTTTTTTTGAGGTTCTAGTGGTTGTGTTTATTTTGTGTTTAAGGAAAGTGTTATGAAAGCATACTTTGAATGAATTTATGAAGACTTGGTTTATAGTAATCAACTTTTGGGGTTAATATAATTAACCAAGTTCATTATGTTGTGATGGTTATACTTGTGTTTAATTTGTGGGTCCTAATGATGAGAGGTGTTGACTCAATGCGATATTGTTTAATTGAGAATTAAACTGTGATTGGGGAATATTTGACTGCCTTTTAATGTTTCAAAAGGCAGACATGGAAATTTGTACAATGAAATCTGACCTTTAATTCTTGGATTGATTTTATTAACAAATTGGGTTTACTGATGGTTTCTTGTCTTACTGTTTGAAACTTGATTTAACTGGAGATTTTTTCTGTAGTGAATAGCTACTTTTGAGGTCTTAGAGATAGTGATGAGTATGTAGTTCATGGAAAGTTCTATTTTTGAAGCGTAGTGGGAGTAATCTTAAATCTTCTATGGTTATAATTTTAGAAGATCGATGTTAAGTAATGAAGGAAAGCTATGTTACCCTGACACTCTGGTTGAAGGAGGGTGTCGGTGTCAACACGACCCGACTCGGGGGAAGTGTCGAAACCGGTGTCGGAAAAGAATCCGAAATCAAGTATCGAGGTCACAAATTTGAAACCCTAGCTCTAGCAATTGAAGGTGCGGGAAAGCGAAAGAAGAAAAAATATGTTGGGGCTTTTGTTGTAGAAGAAAAAACGAGATGAAAGCACTTATCAATTCTTGTTTTCATTGATTAATGCTTCAGATTCAGCCGTGGCTGTTGCGTCGTCCTGCTTTCTCCTTCCATTAACGCGTTTATGTTTGCTGCCTTTTGCTGGTGGGCCTTTGATTTTTCTTTTATTTTTTTAAAAATAAGTAGGGTGGAAATCAGGAAAGGGAAACAAATCCACGT

mRNA sequence

ATGTATGGAGATGAAAGAAGAAGCACTCCTCGACTCCTCGACCCTCGTTGCCGTCACGGTGATAATTCCGACCTAGTACTCCATCCTTCTTTTTTCTCTCTCCAAACCACCCTGTATAAAACTAACAATCCGATCAAAACCCTAAGCCTAGATAATGTTTTTTCTTTCTTCTGTTCTTAGGTTTCGGAGGCGATTCCGGTATTCACGTGTTTCAGGCAACGAAACAGTGAAAATTACACAGAGACAGTAATGCTAGGGTTTCATCGGGGGTCATTCGGCACATTACCGTCTTCTATGGCATCGAATTCAGTCATCCCACGGTGTAAGCATTTACTGAGCTATTCGAGAGATTATGGATGCAAGAGGTCAAACATAGCTTCTTTTTCGCGGTCCTTTGTCATAACTCTCTGCTGCTTATTAAAAGAGGTCCAACTGCCCACGCGCCAAGGAACTGGTTTAGCAGATAGCTAAAGAATCCCGCTTTCCACCAGATGGCTGAGCAATTGCAGCAAACCCTTCAAGACTATCTGGAACCACAATAACCCTTCAGGACTATCTGGAACCACAATTTGATCCTCAGCAGTATTCTTGCACTTGCAGCAAGCCAACACATGATAGAGAATCCTCCTTATATGAACGTCTTGGTAGGGCTTCGAGGCAGAAGATCGATGTTAAGTAATGAAGGAAAGCTATGTTACCCTGACACTCTGGTTGAAGGAGGGTGTCGGTGTCAACACGACCCGACTCGGGGGAAGTGTCGAAACCGGTGTCGGAAAAGAATCCGAAATCAAGTATCGAGGTCACAAATTTGAAACCCTAGCTCTAGCAATTGAAGGTGCGGGAAAGCGAAAGAAGAAAAAATATGTTGGGGCTTTTGTTGTAGAAGAAAAAACGAGATGAAAGCACTTATCAATTCTTGTTTTCATTGATTAATGCTTCAGATTCAGCCGTGGCTGTTGCGTCGTCCTGCTTTCTCCTTCCATTAACGCGTTTATGTTTGCTGCCTTTTGCTGGTGGGCCTTTGATTTTTCTTTTATTTTTTTAAAAATAAGTAGGGTGGAAATCAGGAAAGGGAAACAAATCCACGT

Coding sequence (CDS)

ATGCTAGGGTTTCATCGGGGGTCATTCGGCACATTACCGTCTTCTATGGCATCGAATTCAGTCATCCCACGGTGTAAGCATTTACTGAGCTATTCGAGAGATTATGGATGCAAGAGGTCAAACATAGCTTCTTTTTCGCGGTCCTTTGTCATAACTCTCTGCTGCTTATTAAAAGAGGTCCAACTGCCCACGCGCCAAGGAACTGGTTTAGCAGATAGCTAA

Protein sequence

MLGFHRGSFGTLPSSMASNSVIPRCKHLLSYSRDYGCKRSNIASFSRSFVITLCCLLKEVQLPTRQGTGLADS

Relationships

The following mRNA feature(s) are a part of this gene:


Feature Name	Unique Name	Type
Spo11610.1	Spo11610.1	mRNA

Homology

The following BLAST results are available for this feature:

BLAST of Spo11610.1 vs. NCBI nr
BLAST of Spo11610.1 vs. UniProtKB/TrEMBL
BLAST of Spo11610.1 vs. ExPASy Swiss-Prot
BLAST of Spo11610.1 vs. TAIR (Arabidopsis)

BLAST of Spo11610.1 vs. NCBI nr
Analysis Date: 2018-06-29 (blastp Spinacia oleracea peptides vs. NCBI nr)
Total hits: 0

Position :

Zoom :

x 1


Match Name	E-value	Identity	Description

BLAST of Spo11610.1 vs. UniProtKB/TrEMBL
Analysis Date: 2018-06-29 (blastp Spinacia oleracea peptides vs. UniprotKB/TrEMBL)
Total hits: 0

Position :

Zoom :

x 1


Match Name	E-value	Identity	Description

BLAST of Spo11610.1 vs. ExPASy Swiss-Prot
Analysis Date: 2018-06-29 (blastp Spinacia oleracea peptides vs. ExPASy SwissProt)
Total hits: 0

Position :

Zoom :

x 1


Match Name	E-value	Identity	Description

BLAST of Spo11610.1 vs. TAIR (Arabidopsis)
Analysis Date: 2018-06-29 (blastp Spinacia oleracea peptides vs. TAIR)
Total hits: 0

Position :

Zoom :

x 1


Match Name	E-value	Identity	Description

GO Annotation

GO Assignments

This gene is annotated with the following GO terms.

Category	Term Accession	Term Name
biological_process	GO:0016567	protein ubiquitination
biological_process	GO:0009113	purine nucleobase biosynthetic process
biological_process	GO:0045892	negative regulation of transcription, DNA-templated
biological_process	GO:0007389	pattern specification process
biological_process	GO:0009886	post-embryonic animal morphogenesis
biological_process	GO:0035194	posttranscriptional gene silencing by RNA
biological_process	GO:0050896	response to stimulus
biological_process	GO:0010016	shoot system morphogenesis
biological_process	GO:0006189	'de novo' IMP biosynthetic process
biological_process	GO:0050790	regulation of catalytic activity
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RNA-Seq Expression

Co-expression


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