Overview
Sequences
The following sequences are available for this feature:
Legend: five_prime_UTRexonpolypeptideCDSthree_prime_UTR Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.CTAAAACCATATTTTTATTTTTATTTTAGTTCAATTCCTTCCAATTCATTTCTACCGAACAAAGCTTTAGGAGTTAAAACAAATAAAACTAGGTTACCCAATAATTACATTAATATCTTTCAACAATTTTTGCCAAAATTTCCTCATACATTCTTCCTCCTCTCGTTCATAGAAATCATCAACTTCAGTTGCAATTAACATGTCGTTTCAAGGCAAGAAACTCATCAACGATTCCAATGGTTAGTTTAATCTTGCTCCATCATCCAATTTTCTTGCATTTTCCCTAATGTTAAGTTGTTTAACAGTTTAATTCTGTTCCTTTTCTTAAAATTAAACTTCAATAATTCATCATTTTGAAAAATGCAATTGCTATTTACAGATGAATTAGTTTTTTTGGTTCATTGCATGTTAGTCTGGGTTACAATCAGGTTGCTAATATGTTTAACAGGTGCAGAAGACAATAGAAAATTGTAAAATTTTTTGTTGTAATTTTTATAGCTTGTTTGAAACAGTGTTATGCTTGCACTATAACATATTCCTAATCGATACTCGGGGCTATGTTTTGTCGACGGACCTTCCGTTTTCGAAGTATTTGGGCGTATTTTGACATGTATAATATCGAGATTATCATATGTTTTCGCACAATATATGTTACAAGGATTTAAGGTGTTTAGCATGTCTAAATCTGCAAGTCCTCTTGTATGGGGTTGATGTTACATGCATTTTTTTGGGATATCATGTGTCAATTATTGGCTTAAAACAAGCAGCTGCTAAGGAAGTAAGGAGTCCCATGGAATATTTAAGAACTGAAATCAATGTCCTCTATCCACTATTAATTGTCATATTGTCTCAACGGCACTTATCTTAACTAAAGATTCATCAAAATTGTTAGCGTGTTACTTTTATGATGTGGTTTCGACAATCTTATAGTTGAGTATATTCTTAATGAAATGAAGGTATTGACATTTTTTTTTCTCATAGCTGTGGTGACTGAATTCATTGAGGGTTTGGTGGAGACTTATCCGGGATTGCAGTATTTAGATGGTTTCCCAGAGGTGATTATTCAAGATTTAACACTTTATAGAACTACTTTTTTCTGGTTTTTGACTTACTATCTTAACATTGTTTGTTTTTATATTTGTATAGGTCAAGGTTGTTTTGCGTGCTGATGTGTTAAGCTCAACTTATGATTACGTTTCTGTTATATCAGGTTGTGAATCTTGTTTCATTGCTAAATTTTAGGCTGTGATCCCAATTTTTCGGGGATAAAAAGCCAATTATAACCTTTCTATTTATTTTAAATTTGGAGATGATGAGAGCAAAAAGACTTAGAGTTGGACTTCACTTATATTTATACTGAAGTTGAGTAATCTCACATAAAACTTTTCAGTGTGTGTTCAATTGGATGGTGACTGTGAGTAGGTTCACTGATTAGTTTCCTTAAAGAATAAGAATATGTAGGTTCAATGAGGAAAGATGAGGGAAGATCTTTGTGACTTTTAAGAGAAAAAAAGAATAGGAAGTGTAAATGGGGATTCTGTCGAGGATAGCTAAGGAATTTCCTCAATTTCGTTTCACAAGTTGGAAAATATTGCTAGTGGTTTTGCTAGATTTTATGTAGTTTCTATTTTCTAGTGGCATCGACCATTGAGCCTTTAACTTATATAGTTATATAGCTCGAAGCTACTTTCATAGCTAATAGGGTGTGCCTTTTGGGTGGTAATTGTTCCTGTCTTCTTTACTAAACCATGTTTAATAGAACTCTAAAGCTAGGGTTGGAGACTTGAGATTGGTTATTTGCAATTACATCCCTTCCTATTTTTCTCTACAATATCATCAAGTTTTCTTTTATTATTTTGTGGTTCCGAATTTTGTTTCTTTTTATTTATTTATTCAGGGGAGGGGGATGGGGGTGATGAGGCGAGATATTTAGGAGTTGGAAGGTAGTTAGGAGATTGTTTGAAATATTTGGTTGCTGAAACAAGTGGCTGGTTTGTGTCTTGGCCATATAGTTCATATGAAGCTTTTTAATTTCAGGGATGAATTAGATGCTGATCTTTGCAGTTTTTATGGCCTTGGCAACACAATGCTTAGTAATGGAAAACTTATGTAGGTTTATTCGTCTGTTTAATTTATTCTTATCAATGGTCCAATTCCATCTTAAAGAGAAATAGCCTCATAGGTGTTATGTTGCGCTTTGCGGCTGTTGGAGCGTGAAGTGACAATTATAGATGTCCACTGTCAGCATTGTAAATCAAGAACATCTTTTCTGGATCATAGAAATTTTTCTGTAGAGCATTATTAAATTATTTTATGCAAAAACCAGAAGTTTCAAATATTTATTTTGATTAGTCTATGCATGTAAAATTCTCTTCTATATTGTTGAATCCTATCAGTATGTTTAAACTCTTTAATAACAGATTACAATGGTAGATGTGGTAAAATAAATGGTTTATGATGGATGATGCAGCCTGTTTTTAAAACACACATTACAAACAACATTTCATAGATTGGCAAGTTGAAAATGTGTTCTAGAATGGCCATTACATAACATATGGCCTTTATTTAATGGAAAATTTGGTAATATTAATCCAACCTTTGCCGATTTTCTTTTATTAAGCCCACGTATGACATTTTTTTTATTATTAATCCCACAATTACAACCTAACTGCTTTTATTGGGCCTAACAGGTCACAAACTTGTTGTAGGCGGTGATATGTCCTACGTGGCATTTTACCATTGTAATATTAATTTTTTTCTTTATACTTCGTCCTTTCTTTCTCTTTCCTTAATTTTTCGCGATTTCTTTCTTCTCCTCAGCACTCTTCTCCCTTCCACCATTTTCTTCAACTTCTTCTCCACCATTGTTGCTCCCTCACACCTCTCACCCTTACCCAAAAATTTTGAGCAGTCCATAAGCGAGAAATTCTCATTCTGAAGATCAAAACTAGCAATGAACTTACCCGATGAACCCAATTCTCCGGAATTCACTATGTAATGCAAGGCCTCATTAACAAGAACACCATGACAAACAACATAAATGAGATATAATGAGATACCTTCAATGGATTTCCTCTAATTGTTGTTCAGAGAATACAATTTGGCTTCACTGTAGAAAATCTTGTCATTTGTAAACCCCTGAATTAGCCTCAAACCTTGTAATCATCGTTCTTGCTGTCGTACCCAAACCCAAAACAACACATAACCAATATCAGAGTTAAGAATTTGATTGATGGGGAGCTTACGATGTGTTTTGATTAGCGGGTTAAACAAGAAGATGTCGGTTTTGGAGGGGTCGGCGATGCAAATGATGCCATTGCAGGAACCAAACAAGCGAACTTGCAGAGGTGATAGAGGGTGGTGGAGCTTCGAGAAAGAGATGCGGTCATGGTGGATGTCGAGTTCAGCAGAGTAAAGAAAGGGGTAATAGAGGAAGATATGACGATCGGGGTTGGAAATTAGGGTTTGATTGAGGTGAAGTTTGATATAATTGGGGGTTTTGATTAACGAATTCCAGGCTTTGTAGACACATAAAATTGGGCAATTTTGAGAGAACTTCGGCGATAATTTCAAAGGTCTGACCTTCAATTCAGTTGAAGCTTCAGTAATGGAGGAGAGAGGAAGTGCGGGAGAGTGAGAGCAAACAGGATAGATGAGAGGTTCAAAAGTTTTAGGGTTTTTTTTTTATAAAATAGGAAATCTTGGGTAGTTGGCAATTAATGAATGACATGGCAAACAATTTAGGAGAGAAGCCAAGTTTTGGTTGTCAACATTAGAAACGTTGACTTCTTTGCGGTAACCAGTCACTTAGGCCCACAACTAGTTAGGTCGTAATGGATTATTTAAAAAAAATGTCATAGGCGGGCTTAATAAAAGAAAATCGGCCAAAGGTTGGATTAATATTACCAATTTTTCCTTATTTAATTCGATGGTTAATATTGCGTTTGTCATCCAATTTTGATATAAATTCTTCAATGGATAATCTGAGATTTTAAATTTTGATATTGGGAAAGTTCTTATAGAATTCACTTATTGAAGTAGCACTGGTTTGAATTAAGAATGTCTATTTAACTGCTTGGTTTTCTCCTATCAAAAGGTTTTGGGACATTATTGTACTTGTGTTTTTCCCTGTCAGCTAGTCCTTCTCTTTGTTATTCATCTGCTCCATGAAATTTATTCTTCCTTCAACAAAGTAAAAATGGGAGAAAAAGGGTTTTGTGCAATCTAATATTGGATGGATCTTTGCCGACGCCCCCACTTTTCATGGCTTTGGCTATGTTGCCGGTGTTTTACATAGTACTAGGCTTCCTCTTAGTTCCTCTTCATGGGTTTCCCTAGGGATATTCTTCTTCGTGACTTTGTAGCTGAGAATGTATAAAAGGTTAGATGGTTAGGGAAATGCTCTAGAACTTATGGATTTTCGAAAATATTGGCAAGCATACATTATGGAGATGTGCTCTCCTTGCATTTCTCTTGTTTTGAGGTTTGAAAGAAAAGATAGGACTTACAGAACTCAATGGTCAAGTATTTGATCTGGAGCAGGTAGTGCCTTTGACATTTTTTTCGCCATAGTATCAGAGCATTGGTTTGGCTTATAAAATTAGATTTAGGACATTACGTGCGTTTTAATTATTTCTGTTAAATGGTGTAAATGTTTTTCTCTGCTCTATTTTTTCTTATGCTGTGCTATTAATGCAATAGTCTTTAATTTTTTTGATATAGATAAAAATGCAAGTCTCTAATTCCAAACAAAAGATAACCTTAGATGCAACTTAATCTCTTGTAGTCTTTTTGGAACTTTGGTTGTTTACAGCTTTGTTATTTGTTTAGAGTTTCCTTGTTATTAAAATATGTGTGATTTTAATGTAAATATATGTTTCTTTCAGGAGGTGGCAGTGGTCATGAGCCTGCTCATGCTGGATTTGTGGGTGAAGGAATGCTTACTGCAGCTATTTGTGGGGACATTTTTGCCTCTCCACCAGTTGATTCAATTC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MSFQGKKLINDSNAVVTEFIEGLVETYPGLQYLDGFPEVKVVLRADVLSSTYDYVSVISGGGSGHEPAHAGFVGEGMLTAAICGDIFASPPVDSILAGIRAVTGPKGCLLIVKNYTGDRLNFGLAAEQAKSEGYKVEMVIVGDDCALRPRGIAGRRGLAGTILVHKIAGAAAAAGCSLVEVTDEARRASEMVGTMGVALSVCTLPGQVTSDRLGPGKMELGLGIHGEPGAAVADLQPVDVVVAHVLMQILSAEINYVPIERGNNVVLMVNGLGATPVMELMIAAGKAIPRLQLEHGLAVDRVYTGNFMTSLDMAGLSITVMKVDEGILQRLDAPTKAPAWPVGVDGKRPPAKIPVPVPQSPNLQCNELSTRPQELSEQGHILEVAIEAAASELINMRDALNDWDSKVGDGDCGSTMFRGASAILEDMKKYYPLNDVTETIKEIGSSIRRVMGGTSGIIYDILFKASYAELKSTNQSTVTSKEWASALQAAIAAVSKYGGAIAGYRTLLDALIPALEVLQERLNTGDDPVDAFVISSEAALSGAESTKHMHAQAGRSTYISSDILASVPDPGAMAAASWYRASALAVKKFHQTS Relationships
The following mRNA feature(s) are a part of this gene:
Homology
BLAST of Spo13328.1 vs. NCBI nr
Match: gi|902138752|gb|KNA04524.1| (hypothetical protein SOVF_198930 isoform A [Spinacia oleracea]) HSP 1 Score: 1149.4 bits (2972), Expect = 0.000e+0 Identity = 593/593 (100.00%), Postives = 593/593 (100.00%), Query Frame = 1
BLAST of Spo13328.1 vs. NCBI nr
Match: gi|731351841|ref|XP_010687238.1| (PREDICTED: putative 3,4-dihydroxy-2-butanone kinase isoform X1 [Beta vulgaris subsp. vulgaris]) HSP 1 Score: 1024.2 bits (2647), Expect = 8.800e-296 Identity = 529/593 (89.21%), Postives = 554/593 (93.42%), Query Frame = 1
BLAST of Spo13328.1 vs. NCBI nr
Match: gi|720094189|ref|XP_010246282.1| (PREDICTED: putative 3,4-dihydroxy-2-butanone kinase isoform X1 [Nelumbo nucifera]) HSP 1 Score: 949.5 bits (2453), Expect = 2.800e-273 Identity = 485/594 (81.65%), Postives = 533/594 (89.73%), Query Frame = 1
BLAST of Spo13328.1 vs. NCBI nr
Match: gi|568880735|ref|XP_006493264.1| (PREDICTED: putative 3,4-dihydroxy-2-butanone kinase isoform X2 [Citrus sinensis]) HSP 1 Score: 945.3 bits (2442), Expect = 5.200e-272 Identity = 480/594 (80.81%), Postives = 537/594 (90.40%), Query Frame = 1
BLAST of Spo13328.1 vs. NCBI nr
Match: gi|802557775|ref|XP_012065731.1| (PREDICTED: putative 3,4-dihydroxy-2-butanone kinase [Jatropha curcas]) HSP 1 Score: 941.4 bits (2432), Expect = 7.500e-271 Identity = 481/594 (80.98%), Postives = 532/594 (89.56%), Query Frame = 1
BLAST of Spo13328.1 vs. UniProtKB/TrEMBL
Match: A0A0K9QB84_SPIOL (Uncharacterized protein OS=Spinacia oleracea GN=SOVF_198930 PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 1149.4 bits (2972), Expect = 0.000e+0 Identity = 593/593 (100.00%), Postives = 593/593 (100.00%), Query Frame = 1
BLAST of Spo13328.1 vs. UniProtKB/TrEMBL
Match: A0A0J8EL70_BETVU (Uncharacterized protein OS=Beta vulgaris subsp. vulgaris GN=BVRB_8g188620 PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 1024.2 bits (2647), Expect = 6.200e-296 Identity = 529/593 (89.21%), Postives = 554/593 (93.42%), Query Frame = 1
BLAST of Spo13328.1 vs. UniProtKB/TrEMBL
Match: A0A067L4R7_JATCU (Uncharacterized protein OS=Jatropha curcas GN=JCGZ_26536 PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 941.4 bits (2432), Expect = 5.300e-271 Identity = 481/594 (80.98%), Postives = 532/594 (89.56%), Query Frame = 1
BLAST of Spo13328.1 vs. UniProtKB/TrEMBL
Match: M1CK90_SOLTU (Uncharacterized protein OS=Solanum tuberosum GN=PGSC0003DMG400026957 PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 938.7 bits (2425), Expect = 3.400e-270 Identity = 474/594 (79.80%), Postives = 528/594 (88.89%), Query Frame = 1
BLAST of Spo13328.1 vs. UniProtKB/TrEMBL
Match: K4C8V8_SOLLC (Uncharacterized protein OS=Solanum lycopersicum PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 937.6 bits (2422), Expect = 7.600e-270 Identity = 474/594 (79.80%), Postives = 526/594 (88.55%), Query Frame = 1
BLAST of Spo13328.1 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: DHBK_SOLLC (Putative 3,4-dihydroxy-2-butanone kinase OS=Solanum lycopersicum GN=DHBK PE=2 SV=1) HSP 1 Score: 935.3 bits (2416), Expect = 3.400e-271 Identity = 473/594 (79.63%), Postives = 525/594 (88.38%), Query Frame = 1
BLAST of Spo13328.1 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: TKFC_PIG (Triokinase/FMN cyclase OS=Sus scrofa GN=TKFC PE=1 SV=2) HSP 1 Score: 403.3 bits (1035), Expect = 4.600e-111 Identity = 253/587 (43.10%), Postives = 352/587 (59.97%), Query Frame = 1
BLAST of Spo13328.1 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: TKFC_MOUSE (Triokinase/FMN cyclase OS=Mus musculus GN=Tkfc PE=1 SV=1) HSP 1 Score: 401.7 bits (1031), Expect = 1.300e-110 Identity = 249/583 (42.71%), Postives = 344/583 (59.01%), Query Frame = 1
BLAST of Spo13328.1 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: TKFC_RAT (Triokinase/FMN cyclase OS=Rattus norvegicus GN=Tkfc PE=1 SV=1) HSP 1 Score: 400.2 bits (1027), Expect = 3.900e-110 Identity = 251/583 (43.05%), Postives = 348/583 (59.69%), Query Frame = 1
BLAST of Spo13328.1 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: TKFC_BOVIN (Triokinase/FMN cyclase OS=Bos taurus GN=TKFC PE=2 SV=1) HSP 1 Score: 396.7 bits (1018), Expect = 4.300e-109 Identity = 248/583 (42.54%), Postives = 349/583 (59.86%), Query Frame = 1
BLAST of Spo13328.1 vs. TAIR (Arabidopsis)
Match: AT3G17770.1 (Dihydroxyacetone kinase) HSP 1 Score: 891.3 bits (2302), Expect = 3.200e-259 Identity = 451/594 (75.93%), Postives = 517/594 (87.04%), Query Frame = 1
BLAST of Spo13328.1 vs. TAIR (Arabidopsis)
Match: AT1G48430.1 (Dihydroxyacetone kinase) HSP 1 Score: 889.4 bits (2297), Expect = 1.200e-258 Identity = 447/587 (76.15%), Postives = 518/587 (88.25%), Query Frame = 1
The following BLAST results are available for this feature:
BLAST of Spo13328.1 vs. NCBI nr
Analysis Date: 2018-06-29 (blastp Spinacia oleracea peptides vs. NCBI nr) Total hits: 5
BLAST of Spo13328.1 vs. UniProtKB/TrEMBL
Analysis Date: 2018-06-29 (blastp Spinacia oleracea peptides vs. UniprotKB/TrEMBL) Total hits: 5
BLAST of Spo13328.1 vs. ExPASy Swiss-Prot
Analysis Date: 2018-06-29 (blastp Spinacia oleracea peptides vs. ExPASy SwissProt) Total hits: 5
BLAST of Spo13328.1 vs. TAIR (Arabidopsis)
Analysis Date: 2018-06-29 (blastp Spinacia oleracea peptides vs. TAIR) Total hits: 2
InterPro
Analysis Name: InterPro Annotations of S. oleracea
Date Performed: 2018-06-29
GO Annotation
GO Assignments
This gene is annotated with the following GO terms.
RNA-Seq Expression
Co-expression
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