Overview
Sequences
The following sequences are available for this feature:
Legend: exonfive_prime_UTRpolypeptideCDSthree_prime_UTR Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.AAATGACACGTGATTTGCTCTATGATTACATTTCCGTTTGAATCCGTTCCAAATCACGTGTTGTTTTTTCGAGTCGCTTCCACTTACCATTAGCACAGGCGCACTGTAAGCAGCAGCCATGGATGAAGCAGTTCAAGCCGAAGAATACTTTGATGTTCTTACCAAAACTGGCCAGAAAACCGGCATTCGCAAAACCAGGTCTCCATTAATTATTTGTTGCCTGTAATTCGTATTCTAATAATTAACTCAATGTTTAATTTATACATATGAAAAACCTGATCTTTCGTTCACTTTTCTCAATTTCAATTTAGATTTGATCGACACCCGATTAATTTTTCATATTTGATTCCCACCCACCTAATTTTTCTCAACTTTAATTCTGACCCACTTAATTACTTCGGATGATTTATCGTTACATTTTTAATTTTATTTTATGTCAGTGCTGAATTGTGTACGATCATTTTTATGTTGTTCTGTTTAATTTGATTAGTTTTTGTTGTTGTTGTTGTTGTTGTTGTTGTTGTTGTAAATGATCGGTTATGAGGAGTGGATTATTTTTTTTAGAAAAAAACAAATTATTCCGACAAAATTTCTTCAGAATTTTGTTTCATGAAAATTGTATAATAACACAAACCAATACAATGTGAAAAAGTAAATTTTAGCGTAACTTGGTTAAATTTGTTTGTCATACTCATAACTAATCAATGGGATTCTACACGAAGCATAGAATGCCTTTTGAAGGTTTTGAGGTGATGCATCTGGCATTACCTTAAACAACCATAGTAGTTTTCTTTAGAATCGAAAATTACCCACCCAACAAAACTTTAGTGGGTTTCAAAAGTCTGGGACTCTATTTTATTTGGTTGCCACATGAATGTGCAATATTTGTAATGTTCGTTGCAATCTTTGTAATGTTCGTTGCTTCTAAAGCTTTTGTAATATTATGGGATGGCTTGGTGTTAAGAGATTTGAAAACGGTTAACCCTTTTTACTAAGAATGTTCTTATATGTTGGTGGATATTACCCCGGTGATTAATTTCTAAGAACTTGTGTAGAGGGCATGTTCATAGAGATGGGGATTACCATCGTGCTGTTCACGTGTGGATTTATTCTGAAAGCACAAACGAGCTTCTGCTTCAGAAACGTGCTGAATTCAAAGATTCCTGGCCAGGCCAGTGGGATATCTCCAGTGCAGGTCATATATCTGCTGGTGACTCTTCCCTCATAACAGCAAGGTAAATTGTGTCAATTTGTTAAATGTTGATCAGTCCTGTACTTCGTTACAATTCTAAGATTCAAAGTATTGGTCATGTCATGTGCTTTCTTATATTTGGGTTTTCACTGTCCATTTAAGTAAGCCATTGTATTTTATTTCATTTTCATGTTGTGATGGATAATTTGGTTGTTGTCGTATTGCAAGTGTCCTGTATTTTACATTCACTCTAAATTCTTGCAGAAGGGAACTTCAGGAAGAGCTAGGTGTCAATCTTCCAGAGGATGCATTTGAACTGTTGTTTGTTTTTCTTCAAGAGTGGTATGTACTTGATGTTGCTTCTATTCATCTTGATTGTGGTTGCTTTTGTGACTACGCTATTATTTACATATACATAGAAAGAAGTTGTGTATAAGATCATTCATGCGGTAAGTTGGTATGCCTTTAATTGTGTATGCCGATTGTTCTCCAAATATGCGACATGATTACTGAAGTTTAGAATGAATGAATTCCTTCGTCTTGCATGCATCAGGTACTTTTATTGTGTACCCACCCTTGCCTAAGTTACTCTTTTATGTTGATTAGTGACCATTTTACGTAAACATGGATGTGTCCATGTTAGAGTTACCTTTTAATGTATTTAGGTGACTCTTATGCTCGAAGCATTAAAAAACATTTATAACAAAGAGGATACCTTTTTCAAAGTTGGGCTTGCAGCCTGATAAGAATTTTCATAAAATCAATCAATGCGGTACATCAATCTTGTTAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGGCTTTCACAATGTCTCTATAAAATGCAGCTTTTGATATGATTGAAGATTCTAACCAAATTGTTAGCCTCTGTTTTCTGAACTTTTTATTTTTTGAACTTATTTTATTTATTGGAACTTATTTAAACTTATTGCATCTGTAAAAAGTTTTCAATCAAGGATGGACTGAGATTTTTAGTGTCGTAAAATACCATCCAGTTTTACATCTTTCTGAGTAATTCGGTTAATCTGTTGTAATGTTAGGGACTGAAATACTATATTTTGCTTTAGTTTGGTTAGATTTTTATTTCCCTAGCTGGTGTCTTTATGTTCGGGTTTTATTGTAATTCCTTTCTTGATGTAATGCCATCTACCTCTTCAGTTTTAACAGAAGAGAAGAGCCGGACAATTGGATCCTACAAATGATGTGTTGATTTGCCTAATTTTTCATGTCATTCTGCTTTCTGAACAAACCAACTTTGTTTTTTGATGCAGCGTCACTAATGATGGAAAATTTATCAATAATGAATTTAATGACGTGTATTTGGTGACCACCATAGCACCTATTCCTCTAGAGGCATTTTCACTTCAGGTAAAAGTGGTAAAAGTTACATTTACCATTCATAATATTTCACTCAGCTTAAATTGTTGAGCAATATTAAATTTGACCTCTGTTTTTCATAAAGTAGGAATTTATTAATACCAAAAGGCGTTTAGGAACAGACTAAAACAAACTACAAGCCAAAAGCCAGCAGGCTAGGCAAACAATCTGACTTCTTTTGTTTAAGTTTCAAATATACCACTCCCTCCTTCTTGAATTGACCCTTTCAAATATCACAGAATTAATTCCAGGATGGGCTGGTGTTTAGTCGGACTATATATTACTATATATCATGCTTTTACATTGACTCACTACTCACTAGAGTCAGCTTGGCAATTAATCATACAAATTCGATAAAGTAACTAAATAACTAATTGAGAAAAATGTTTAACTAACGTAAAATGCTAACTAAAAGTTCAAAAATTATAACTTATGGCAAAAACTGCTTGCTTTTTTTTTTTTTTGTTAGTTACCTAATTTGTTTTCTTAATGTTGTGATTTAATACGATAAAAGAATAATGTTGCAACAATAACATAATTACAATATAATTATAATAAACTTATCTCAATATCGTGATGAACGAGGTGAACGATTTAGAACGATTGTCGTGCCATGGCCGAACCACTGCTCTAAAAGACAATTCCGCACTACCTTAGTGCAGTAGAACGTTTGTGATTGTTCTCAAGGGCTAACACGACATCAAGACTCGTGTGCACTCACAAGACTCAATTGGAGATCAGAATATTTCCCCAAAACGAAAGAGATTTTAGAGAGAGGAGATGAACGCTTTTGTGTGTTTTTGAGATACTCTGTTGTCCCCTTGTCGGTTAACACGACATCACGACTTGTGTGCACTCACAAGACTCGATTGGAGATCAGAATATTTGCCCAAAAACAGAAGAGATTTTAGAGAGAGAAGATGAACGTTTTTGTGTGTTTTTGAGATACTATGTAACTGATCAAGTCTTGATTATATATTTATGTAACCAAGAAGATGGGAAATTCAATAGTAAAAAAGGTGGTTATATAGAGGTTATAAGGAGATAATGAAGGAGAAATTAACTCCCAACGGTTACGGAATAAATGGTGTAACAACCATAAGCTTCCTAATAACAATGATTGAACAAAATAAATAGGTAGGCCCACGACCCACCCACACATGACCCAAGGCCCAAGTTTGACCAAGTCAACGTGCGTGTGCGAGTGTGTCCACCAAGACCTCTTTTCCACCTTCTCAAACAGGTAGTATTAGAGCATCCACATTCATTAACCTCCTATTAATTTCTCTCCCCTCACCTAATTGGTCCACATCACTTTCCACTAACTTTATCACATAACCTTCCCATTTCACAATTTCATACCTACATTCATTAACCTCCCCATTTACCTTCTCTCTCGTACTTTTCCATACCCCACCACCTTTTCTCCCTCCTCTCCATACTCCACCAATATTAATAAAAATTATTTGATTCATCACATTAATTTTAGATAATATTAATTAAATCAAAGTTTGGTAATTATAATTAAATAATTACCTTTTAATTAATTAATCGGATTAATTGTAGTACGTTAAAAAAGCGTTATTTTTAATTACACTAGTTTAATCGTTAATTGTTATTTACACTAATTTACTCGATTAATGTTATTAATCGCGCTGACATTGATGACAATTTTTATTACAACAAATAAATACTTAATAAAACAACATAAATTCACTAACGAAACATAGATGAATTAGACATGAAACCATACAATTTATCTTTTTTAAAAGATTGCAATAATTTAGATGATCAGTTGTCATCGGTAGACGGGCCACAATGTTGCCAAATATGTTGAGCCTGGTTTTTTTGTAAGGCGTTGTGAACATTTCTATCCCATGCGTCAGTTTTCCTTTGCATATATTAGTTCAGTCCAATACCATTTAATCAACCAAGTTGCACAGAATAGTTTTTACGAGTTGATCTGAAAATCGCTGTCCTGTTTTCTTGCTCAAATTCCGACATGTCATGATAATTTTGGTATGTATCTCGCTCATCCTCAACAATCATATTATGAAGAATTATACAAGCCAACATTATCTCCCACAACAAGTGTTCGTCCCATACAAGAGCTGGTTTTTGTATTATTGCGAAACGGGATTGAAGAATGCCAAAGGCACGCTCCACATCTTTTCGGACCGATTCTTGGCGCTGACAACTCATCCACGGGATTCATTGGCAGTCGAATAGTTGGGATGAACACTGGCCACTTAGGGTATATCCCATCAGTTAGATAGTACCCTTTGGTATATATGTTCCCATTGACTGTAATGTTCACTTCAGGAGTTTTACCTTGATATAATTCATCCAACACTGGAGATCGTTGCAACACGTTGAATTGCAAGTTCCACGTGTTCCGAAAAATGCGTGC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ATGGATGAAGCAGTTCAAGCCGAAGAATACTTTGATGTTCTTACCAAAACTGGCCAGAAAACCGGCATTCGCAAAACCAGAGGGCATGTTCATAGAGATGGGGATTACCATCGTGCTGTTCACGTGTGGATTTATTCTGAAAGCACAAACGAGCTTCTGCTTCAGAAACGTGCTGAATTCAAAGATTCCTGGCCAGGCCAGTGGGATATCTCCAGTGCAGGTCATATATCTGCTGGTGACTCTTCCCTCATAACAGCAAGAAGGGAACTTCAGGAAGAGCTAGGTGTCAATCTTCCAGAGGATGCATTTGAACTGTTGTTTGTTTTTCTTCAAGAGTGCGTCACTAATGATGGAAAATTTATCAATAATGAATTTAATGACGTGTATTTGGTGACCACCATAGCACCTATTCCTCTAGAGGCATTTTCACTTCAGGAATCAGAAGTCTCAGCTGTTAAGTATATTTCTTGTGAGGAATACAAAAGTTTGCTGCAGAAGGAAGATCCTGACTATGTCCCTTATGATGTAAACGGGCAATATGGTGAACTTTTGAACTTAATTGCACAAAGGTACAAAGAGAACGTTGAGGAACGAAGTTTATCTCTTCAAAGGCAACTCAATCGCTATGCACCTATTCCCCTTACTGCAGAGCTTGGCGGGATTAGTGACGTTGATAAAGAAGCTCTTAAGTTTGTTCTTAAAGCTGCGATGATAATGGATGATATATTTCACCAGCAGGTTTGTCTTAGCAATCCAGCTTTGAGAGATTGGTTGAAGGAGCATGCTGATACTTCCCCCTTGAATAAGTTGAAATGGAAATATTTCTCTATTAACAAAAGTCCATGGTCTTGCCTAGATGAAAACCTTGCATTTTTAAGTACGGCTGATTCTGCAATTAAATTGCATTTGCATGCCACAAAACCAGTATCTGGCTGGAAGGGCCTTGAGTATAAAGCTGCGTTTCCTCTATCGAAACAACCTGGTGCAAATTTCTATCCTTCAGATATGGACAAACTGGAATTTGAATTGTGGAAAAATAGTCTGTCTGAGGATGAAAGACAAGAAGCGATGGGCTTTTTTAATGTCATAAAAAGATTCAACGGAGTCAATTTAGATACTCAAACTGATGAGGGCGTCGCTGACCTGTCTATCCGTGATCTCTATTGTGTCCCATTCTCTCAAGAGTATAGTTCTTACCTCACAAAAGCTTCAGAGTTGCTGTATAAAGCAGGGGAACTGACTAGCTTTCCCAGTTTGAAGAAGCTGCTGCACACTAAGGCCAATGCATTCCTCTCCAATGATTATTATGACTCTGACATAGCCTGGATGGAATTGGATTCAAAACTAGATATCACCATTGGCCCTTATGAAACCTATGAAGATTCGCTTTTCGGATACAAGGCTACTTTTGAGGCATTTATTGGAATTCGAGACGATGATGCTACAGCCAAACTTAAACTATTTGGCGATAATTTATTGGTTTTGGAGCAAAACCTTCCAATGGATGACACATTCAAGTCTAAAGATGTCACAGCTGCTCCAATTCGTGTCATCCAACTTCTTTACAATGCTGGGGATGTGAAGGGACCTCAAACTGTTGCATTTAATTTACCAAACGATGAACGCATTGTGAGAGATCGTGGTACTTCAATGGTAATGCTGAAAAATGTCTCTGAGGCGAAGTTCAAACATATTCTTCTTCCTATAGCCGAGGCATGCATATCAAAAGAACAACAGGAGCTTGTTGACTTTGATTCCTTCTTCACTCATACAATTTGTCATGAATGCTGCCATGGTATTGGTCCTCATAGCATAGTGCTTCCAGATGGTCGGAAGTCAACAGTAAGATTGGAGCTACAAGAACTACACTCTGCTTTGGAAGAAGCAAAAGCTGATATAGTTGGTCTTTGGGCTCTCAAATTTTTCATTAATCAGAATTTACTTCCGTCAAGTTTGTGCAAATCTATGTATGTTTCCTTTCTTGCGGGATGTTTTCGCTCCGTACGTTTTGGGCTAGATGAAGCTCATGGAAAGGGACAAGCGTTGCAGTTTAATTGGTTATTTGAGAAAGAAGCATTTATTATGCATCCTGATGGGAGATTTAGCGTTAATTTTGACAAGGTTGAAGATGCTGTTGAAAGCTTGAGTAGAAAAATATTAACCATACAAGCTACTGGTGACAAAAATAAAGCCAGTTCTCTTCTTGAGGAGTACTGCAAAATGACCAATCCATTGCGACTTGCATTAGACAAGTTAGAAAGTGCTGAGGTACCAGTTGACATAACTCCAGCATTTCCTGTCGCTGACCAAATATTGCATGGAAGACCCTGA MDEAVQAEEYFDVLTKTGQKTGIRKTRGHVHRDGDYHRAVHVWIYSESTNELLLQKRAEFKDSWPGQWDISSAGHISAGDSSLITARRELQEELGVNLPEDAFELLFVFLQECVTNDGKFINNEFNDVYLVTTIAPIPLEAFSLQESEVSAVKYISCEEYKSLLQKEDPDYVPYDVNGQYGELLNLIAQRYKENVEERSLSLQRQLNRYAPIPLTAELGGISDVDKEALKFVLKAAMIMDDIFHQQVCLSNPALRDWLKEHADTSPLNKLKWKYFSINKSPWSCLDENLAFLSTADSAIKLHLHATKPVSGWKGLEYKAAFPLSKQPGANFYPSDMDKLEFELWKNSLSEDERQEAMGFFNVIKRFNGVNLDTQTDEGVADLSIRDLYCVPFSQEYSSYLTKASELLYKAGELTSFPSLKKLLHTKANAFLSNDYYDSDIAWMELDSKLDITIGPYETYEDSLFGYKATFEAFIGIRDDDATAKLKLFGDNLLVLEQNLPMDDTFKSKDVTAAPIRVIQLLYNAGDVKGPQTVAFNLPNDERIVRDRGTSMVMLKNVSEAKFKHILLPIAEACISKEQQELVDFDSFFTHTICHECCHGIGPHSIVLPDGRKSTVRLELQELHSALEEAKADIVGLWALKFFINQNLLPSSLCKSMYVSFLAGCFRSVRFGLDEAHGKGQALQFNWLFEKEAFIMHPDGRFSVNFDKVEDAVESLSRKILTIQATGDKNKASSLLEEYCKMTNPLRLALDKLESAEVPVDITPAFPVADQILHGRP Relationships
The following mRNA feature(s) are a part of this gene:
Homology
BLAST of Spo13536.1 vs. NCBI nr
Match: gi|902184738|gb|KNA10354.1| (hypothetical protein SOVF_145120 [Spinacia oleracea]) HSP 1 Score: 1572.0 bits (4069), Expect = 0.000e+0 Identity = 776/776 (100.00%), Postives = 776/776 (100.00%), Query Frame = 1
BLAST of Spo13536.1 vs. NCBI nr
Match: gi|731352006|ref|XP_010687318.1| (PREDICTED: nudix hydrolase 3 [Beta vulgaris subsp. vulgaris]) HSP 1 Score: 1360.9 bits (3521), Expect = 0.000e+0 Identity = 672/774 (86.82%), Postives = 715/774 (92.38%), Query Frame = 1
BLAST of Spo13536.1 vs. NCBI nr
Match: gi|731403637|ref|XP_002271902.2| (PREDICTED: nudix hydrolase 3 [Vitis vinifera]) HSP 1 Score: 1222.6 bits (3162), Expect = 0.000e+0 Identity = 597/778 (76.74%), Postives = 683/778 (87.79%), Query Frame = 1
BLAST of Spo13536.1 vs. NCBI nr
Match: gi|470134791|ref|XP_004303220.1| (PREDICTED: nudix hydrolase 3 [Fragaria vesca subsp. vesca]) HSP 1 Score: 1214.5 bits (3141), Expect = 0.000e+0 Identity = 592/771 (76.78%), Postives = 681/771 (88.33%), Query Frame = 1
BLAST of Spo13536.1 vs. NCBI nr
Match: gi|595963740|ref|XP_007217029.1| (hypothetical protein PRUPE_ppa001658mg [Prunus persica]) HSP 1 Score: 1208.0 bits (3124), Expect = 0.000e+0 Identity = 589/781 (75.42%), Postives = 680/781 (87.07%), Query Frame = 1
BLAST of Spo13536.1 vs. UniProtKB/TrEMBL
Match: A0A0K9QSW1_SPIOL (Uncharacterized protein OS=Spinacia oleracea GN=SOVF_145120 PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 1572.0 bits (4069), Expect = 0.000e+0 Identity = 776/776 (100.00%), Postives = 776/776 (100.00%), Query Frame = 1
BLAST of Spo13536.1 vs. UniProtKB/TrEMBL
Match: A0A0J8BUX0_BETVU (Uncharacterized protein OS=Beta vulgaris subsp. vulgaris GN=BVRB_8g189340 PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 1360.9 bits (3521), Expect = 0.000e+0 Identity = 672/774 (86.82%), Postives = 715/774 (92.38%), Query Frame = 1
BLAST of Spo13536.1 vs. UniProtKB/TrEMBL
Match: F6HBY3_VITVI (Putative uncharacterized protein OS=Vitis vinifera GN=VIT_09s0018g01600 PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 1222.6 bits (3162), Expect = 0.000e+0 Identity = 597/778 (76.74%), Postives = 683/778 (87.79%), Query Frame = 1
BLAST of Spo13536.1 vs. UniProtKB/TrEMBL
Match: M5X9N8_PRUPE (Uncharacterized protein OS=Prunus persica GN=PRUPE_ppa001658mg PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 1208.0 bits (3124), Expect = 0.000e+0 Identity = 589/781 (75.42%), Postives = 680/781 (87.07%), Query Frame = 1
BLAST of Spo13536.1 vs. UniProtKB/TrEMBL
Match: V4SJV1_9ROSI (Uncharacterized protein OS=Citrus clementina GN=CICLE_v10024933mg PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 1196.8 bits (3095), Expect = 0.000e+0 Identity = 581/778 (74.68%), Postives = 672/778 (86.38%), Query Frame = 1
BLAST of Spo13536.1 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: NUDT3_ARATH (Nudix hydrolase 3 OS=Arabidopsis thaliana GN=NUDT3 PE=1 SV=1) HSP 1 Score: 1122.8 bits (2903), Expect = 0.000e+0 Identity = 540/771 (70.04%), Postives = 646/771 (83.79%), Query Frame = 1
BLAST of Spo13536.1 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: Y368_LISMO (Uncharacterized Nudix hydrolase lmo0368 OS=Listeria monocytogenes serovar 1/2a (strain ATCC BAA-679 / EGD-e) GN=lmo0368 PE=3 SV=1) HSP 1 Score: 87.4 bits (215), Expect = 7.400e-16 Identity = 53/177 (29.94%), Postives = 90/177 (50.85%), Query Frame = 1
BLAST of Spo13536.1 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: Y446_CLOAB (Uncharacterized Nudix hydrolase CA_C0446 OS=Clostridium acetobutylicum (strain ATCC 824 / DSM 792 / JCM 1419 / LMG 5710 / VKM B-1787) GN=CA_C0446 PE=3 SV=1) HSP 1 Score: 85.9 bits (211), Expect = 2.100e-15 Identity = 60/189 (31.75%), Postives = 100/189 (52.91%), Query Frame = 1
BLAST of Spo13536.1 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: Y387_LISIN (Uncharacterized Nudix hydrolase lin0387 OS=Listeria innocua serovar 6a (strain CLIP 11262) GN=lin0387 PE=3 SV=1) HSP 1 Score: 84.7 bits (208), Expect = 4.800e-15 Identity = 54/177 (30.51%), Postives = 90/177 (50.85%), Query Frame = 1
BLAST of Spo13536.1 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: IDI_CITFR (Isopentenyl-diphosphate Delta-isomerase OS=Citrobacter freundii GN=idi PE=3 SV=1) HSP 1 Score: 58.5 bits (140), Expect = 3.700e-7 Identity = 36/143 (25.17%), Postives = 64/143 (44.76%), Query Frame = 1
BLAST of Spo13536.1 vs. TAIR (Arabidopsis)
Match: AT1G79690.1 (nudix hydrolase homolog 3) HSP 1 Score: 1122.8 bits (2903), Expect = 0.000e+0 Identity = 540/771 (70.04%), Postives = 646/771 (83.79%), Query Frame = 1
The following BLAST results are available for this feature:
BLAST of Spo13536.1 vs. NCBI nr
Analysis Date: 2018-06-29 (blastp Spinacia oleracea peptides vs. NCBI nr) Total hits: 5
BLAST of Spo13536.1 vs. UniProtKB/TrEMBL
Analysis Date: 2018-06-29 (blastp Spinacia oleracea peptides vs. UniprotKB/TrEMBL) Total hits: 5
BLAST of Spo13536.1 vs. ExPASy Swiss-Prot
Analysis Date: 2018-06-29 (blastp Spinacia oleracea peptides vs. ExPASy SwissProt) Total hits: 5
BLAST of Spo13536.1 vs. TAIR (Arabidopsis)
Analysis Date: 2018-06-29 (blastp Spinacia oleracea peptides vs. TAIR) Total hits: 1
InterPro
Analysis Name: InterPro Annotations of S. oleracea
Date Performed: 2018-06-29
GO Annotation
GO Assignments
This gene is annotated with the following GO terms.
RNA-Seq Expression
Co-expression
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