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Sequences
The following sequences are available for this feature:
Legend: five_prime_UTRexonpolypeptideCDSthree_prime_UTR Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.TTAGTACATAACAACTATTTTGTTTTGCACAAAGAAATATAAACAATATGGTGTAACATGCATCACCAAAGTCTCCATCATCATCCTCCTTGACTCATCACACACATTCTCAACCCTATATTATGGCCACTATACACGGCACTCCCATCTTCAACTCCTATTCAAATTTCTAAATTATTCCCATCTTTTTAAATAATTTTCTCTAATAAACACCCAAAACGACACTAACTAACCCTTAAAACGACACCCTCCCTCAAATCTTCAATCCCCAAATTCCAAATTCCTCCGAAGTTTCCTACTACTATCACCATCATCATCTTCCTCTTCTTCAATCATCTCTCTTTAGAAATTCCCATTTCATCTCTCCAGAAAAACCCACCAAAACCAAGAAAGATAGTGGCGGGAAGAGAGATATTGAGAGAGTGATGGAGCAATCAGTATTGGATGACGTCATCCGACGTCTACTCGAAGTAAGAGGTCGACCAGGGAAGCAAGTTCAGCTTTCTGAGTCTGAGATCCGTCAATTGTGTTTAGTTTCTAAAGATGTCTTCATGAAACAGCCAAATCTTCTTGAACTTCAAGCACCCATCAAAATCTGCGGTAATTTTCATCAGGGTTTTGCTGATGTTTTTGCTTTGTTTTGGATTGTGGGTTGTGCTTTTTGAACCATTAATTTTGTAGGTGTTGCTTAACTTTCTGTAACTTTTTATGTATTTGATTGTAGATAGTGTTTTTCTAAATCGTTACTTTTTTTGGGTTGGGTTTTGCTTAATTTTCTGTATTGTTGATGCATTAGATTGTGTTGTGGTTAGTGTTTCTTTAATCATAATTTCATCTGGATATTGCTTCATTTTCTGCAACTTTTTGCTGAATTCGATTGCTGTTAGTGCTTTTTGAAATCATTTCGTTTCGGTTTTGCTAGATTTTCTGTATTTTGCTGTGTTGGATTGTGGGTAGCTAATCATTAGTTTATGTGGGTTCTTAAATTAGCTCTATTTGTTCTTAGTATTTGTGGGTGTTATGCTAATCATTAATCTTTTTCACCTGGTGACTCATGATTGATATTACTAATTTTATATGATAATATAGGTTATAGGTATGATGGAGGATTTTCTGTTCTAGATGTTGGGTTTAGAGATGCATGTCTATATTACTCCACCATTTACCAGTTGACCCTTTTACTTTTTTACTCTAATTAATTGAATTATTTTGGATTCCGTTGTAGTTGTTTGGTTATCATTGATGTTTAGTCAATGAGTTATATAAATCATGTAGATGGGTCGGTGATTTGATTTTGTTGCTGCGGAGAATCATTTCTGTTCTTTTGATTTGAAATGTAAGTGTAACACAATGGGGATGAATTAGATCTAGGTCTGAATTTCATTTTAGGTTCGATCTATTAATATAGTCGGTTAACTAATTAGAGAAAATAGTTATAATTCTTTAAGAGTGTGTTAGTTATTCTACGGTAAGAATGATAACGTCTTACCCTGTAATTTTGAGGTGTTCACAAGGTGTGCCGAATACAAAATTTGAAGTGGTTAAATTGAGCTAGGGAGCTGAAATGATTAGTTGGTATTACTTATTAAAATTCATATGTTGAAATGTTTCAGTTTCCAATAGTTCCCTTATCTAGAATTCATCATCATTATCATTATCATTACCCCATTGCCTCAAAGAGGCTCCCGCGAGAAGCGGGGTAAGGGGGGGTTGGGTGTACGCATCCTTACCCCTGCAATTGTAGAGAGGTTGTTTCCAATTGACCCAAAAGCGATAGCGGGACGACAACGGAATGACCATCTTCTACTTCATAGAAAGGAAGCGAAGATGTTTTAAGAGCCATTTTGATTTAGTCCATTACATTCCACAAAAGAACGAATGAATCTTTGGCTCCATCGGAAATAGACATCAATTGCAATAAACATGTCTAGAATTAGCTATCTAAAATCAATTGCAATAAACATGTCTTTCATTTTCATTAAAACTGTCCCGCTCTGTTAATTCCAGTGACATAAAATCACGATTATTACGTGGTAGCTCAGTAATTCCAATCACGATTAGTTGCTTGTAAAAAAAAAAAAAAAAAAGAAACGAAAAAGAAAGAAATTGGAAGACTTTATGTGCTGTTACTACAAGCAAGGTGGATGGTATTTTATCCGCAAAAGTATCTTAGCTTCAGATTTTCCAGTTTTCACAAGTTCTTTGATGAACAATGATTGGAAAAAAGTGAAAGGGAGTTTAGAAAATGGCGAGGAAACAAAGAAGAGAGAGAGAGGAATAATAAGGGCATTTGAATTTGAGATTCCTGTTTGTACCATTGTGCCTTCTGTATACCTTGGTATGGGCAACATGCTGAGTTTCCTGTTTTAGGCCTTGTATACTTGTTAGGGAATAGGGATGTCTTTTGCTGCTATCTTGAAAGAATAGTTATGCCTTCAGCATTTACAGAGAGACTATTTCTCATTGACACATGATCTGATATGTATTCCCCATCTGTTCTAATACAACACTTAAGAACTACCGACAATTTAATAAGCCATTCATCATTACCTAAAAGCCAAAAAAAAAATCTCCGATTCTTCCAGAAATGAACACCATATAGTTTCCATTTTGATTTATTGTGATTGCTAAAGTGTTGAATTTTCATGTCTGACTGCATATTTGCATGTGACTCGCAGGTGACATACATGGCCAATATTCTGATCTCCTAAGACTTTTTGAGTATGGTGGATTTCCTCCTCAAGCAAATTACTTATTTTTGGGTGATTATGTTGACAGAGGCAAACAAAGCCTGGAGACAATTTGCCTTCTTCTTGCATATAAGATTAAATACCCTGAAAATTTCTTCCTCTTGAGGGGAAACCACGAATGTGCTTCCATAAACCGTATCTATGGATTTTATGACGAATGCAAGAGAAGATTTAATGTTAGATTGTGGAAAGTCTTCACTGAAAGTTTTAACTGTATACCAGTTGCAGCCCTCATCGATGAGAAAATTCTATGCATGCATGGAGGTCTCTCACCTGATCTACACAATTTGGATCAGGTACGGAATATGCAGAGGCCTACTGATGTGCCTGATACGGGTTTACTGTGTGACCTTCTCTGGTCAGATCCTAGCAAAGACGTCCAAGGCTGGGGTATGAATGATAGGGGAGTTTCATATACATTTGGTGCTGACAAGGTTACCGAGTTCCTTCAGAAGCATGATTTAGACCTTGTCTGCCGTGCACATCAGGTCAGGCTGCCAAATTAATTGTTGTGATTTTAAGATTTTGTTTTGTTCAATAAGATTACTTTTATAGCAAAGATGTACGTAAACTAATTTTGAGATAAGGAGTAATTATTAGCAGCTGATGTGTTTCTTCCTTTCTATTGAGTTCTTGTGCATGCTATGGGTTTCTGTTCTTCATGTCCTGAGCATCGGATATAGTGTTCTTTTCTGAAGTTTTGCTTCTACCCCTCGTTTCTTGGAATTTATATGAATCCTGTTGATTTTTTATTCAGGTAGTGGAGGATGGGTACGAATTTTTTGCAGATCGGCAGCTTGTAACAATATTTTCTGCACCTAATTATTGCGGCGAGTTTGATAATGCTGGTGCTATGATGAGTGTAGATGAGTCTCTGATGTGCTCGTTTCAAATTCTGAAGCCTGCAGAAAAAAAGTCTAAGCTCAACTTTGGTAGCAGTACTACTACAGCTAAGCCTGGTAATGGAGTCAACTTTTTTGGGAGCACTACAACCATGAAATCTGGAACTTCTCTCCCTGGGGTCAAGGTAATATAGCTTCCATTTATAGTACAGTTGACAAATTAGAAAATTATGGAACTCCGGATTCAGTTTAAAGCTTCATATTTTGGCCTTTTGTTACACCCTCCTTGTCCTGGAACACCACTATTTTTCCTTTCTTTTGTTTCATTTGTGCATTCGTGTGTGTGTTCGTGTGTGTGTTCGTGTGTGTTTGTACGTTGTCTCCCTTTTAAGATTTCTACGGAACAAGATAGCTTATATTTGAAAAGACAAATTTAATATTCATCATTGTTTTCCCCTAAGCTCATATGATTACGCTTGAAGCTGCCTGCTCTTTTTGTTTATAATGTTTGCCCACTTCACCCTGGTTACAAATTATTATAAAATCCAACCAATGGAAAACATAAACCGTTATTGGAAATTACAATTCCACTTGCTTTTCTCTGTTTCTAAAGTTTCACACCATAACTTGCCTTGAACGTTATTGGTTAAAGAAGTTAGTGACCAACTATAACCAAGCATGATTGTGCTGTTATTGTTGATAATATGTGGTCCATTAGTATGGCTGACACTTGACAAGACCCACCCACAAAATGTGAGTTGATACAAATTTTTATATAAAAAAGGAGCCTGGATAATCTCTAGCATAGGAGTATTAAGCACACCTTTATAAGACCGTGACGCCTCGTTTGGTAGCCGGTAATAAATGGTGGGAATGGGAATAAACCTAAGTGTTATTTGGTAAGAAAAATAACGTCATAATGTCCATGGTAATGAAACCTTACCTCAAAGTTCATGTTTTTCTTCATAAACTTGCATTCCCGCCCATAACCACTCCCCAAATGGTAATGGATGGTAATGAAATCTATGAAGAAGGAATAGTTAATTTTGAGTGAACTAACATTACCATGGGAATGTTTCCTTACAAATTTACATATAAATTGATTCCCTCTGACACCAAATGAGCCGTGAATGATCTTCTAATCTCCGGCTATGTTTAAACAGGGTAGTCTCCTGAAGTAAACCTGTTTATTATTCCCTCTATCCCTAAGTAATAGGCACATTTGGTTGAAGGTTATTTTTAAGGAATTGGGTTGAAGTACCATAATTATCCACCTCGATGTAAATTTTACATCGTAATCATTCCAAAAGGCAGTCTTTCTTAAGGTAATATGCACAAATTGTAATTTTAAGAAACTAAATTATAAAGTGGACTATTATTTGGGGTAAATCCAAATAGAAAT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MEQSVLDDVIRRLLEVRGRPGKQVQLSESEIRQLCLVSKDVFMKQPNLLELQAPIKICGDIHGQYSDLLRLFEYGGFPPQANYLFLGDYVDRGKQSLETICLLLAYKIKYPENFFLLRGNHECASINRIYGFYDECKRRFNVRLWKVFTESFNCIPVAALIDEKILCMHGGLSPDLHNLDQVRNMQRPTDVPDTGLLCDLLWSDPSKDVQGWGMNDRGVSYTFGADKVTEFLQKHDLDLVCRAHQVVEDGYEFFADRQLVTIFSAPNYCGEFDNAGAMMSVDESLMCSFQILKPAEKKSKLNFGSSTTTAKPGNGVNFFGSTTTMKSGTSLPGVKTYGV Relationships
The following mRNA feature(s) are a part of this gene:
Homology
BLAST of Spo14016.1 vs. NCBI nr
Match: gi|731328441|ref|XP_010675054.1| (PREDICTED: serine/threonine-protein phosphatase PP1-like [Beta vulgaris subsp. vulgaris]) HSP 1 Score: 673.3 bits (1736), Expect = 2.200e-190 Identity = 314/337 (93.18%), Postives = 333/337 (98.81%), Query Frame = 1
BLAST of Spo14016.1 vs. NCBI nr
Match: gi|802758922|ref|XP_012089318.1| (PREDICTED: serine/threonine-protein phosphatase PP1-like isoform X2 [Jatropha curcas]) HSP 1 Score: 632.9 bits (1631), Expect = 3.300e-178 Identity = 297/337 (88.13%), Postives = 320/337 (94.96%), Query Frame = 1
BLAST of Spo14016.1 vs. NCBI nr
Match: gi|568868981|ref|XP_006487724.1| (PREDICTED: serine/threonine-protein phosphatase PP1-like [Citrus sinensis]) HSP 1 Score: 632.1 bits (1629), Expect = 5.600e-178 Identity = 296/337 (87.83%), Postives = 322/337 (95.55%), Query Frame = 1
BLAST of Spo14016.1 vs. NCBI nr
Match: gi|802758906|ref|XP_012089317.1| (PREDICTED: serine/threonine-protein phosphatase PP1-like isoform X1 [Jatropha curcas]) HSP 1 Score: 631.7 bits (1628), Expect = 7.300e-178 Identity = 297/335 (88.66%), Postives = 318/335 (94.93%), Query Frame = 1
BLAST of Spo14016.1 vs. NCBI nr
Match: gi|1000959226|ref|XP_015576564.1| (PREDICTED: serine/threonine-protein phosphatase PP1 [Ricinus communis]) HSP 1 Score: 631.7 bits (1628), Expect = 7.300e-178 Identity = 297/339 (87.61%), Postives = 324/339 (95.58%), Query Frame = 1
BLAST of Spo14016.1 vs. UniProtKB/TrEMBL
Match: A0A0J8CN27_BETVU (Serine/threonine-protein phosphatase OS=Beta vulgaris subsp. vulgaris GN=BVRB_4g083490 PE=3 SV=1) HSP 1 Score: 673.3 bits (1736), Expect = 1.500e-190 Identity = 314/337 (93.18%), Postives = 333/337 (98.81%), Query Frame = 1
BLAST of Spo14016.1 vs. UniProtKB/TrEMBL
Match: A0A067JUR8_JATCU (Serine/threonine-protein phosphatase OS=Jatropha curcas GN=JCGZ_23538 PE=3 SV=1) HSP 1 Score: 631.7 bits (1628), Expect = 5.100e-178 Identity = 297/335 (88.66%), Postives = 318/335 (94.93%), Query Frame = 1
BLAST of Spo14016.1 vs. UniProtKB/TrEMBL
Match: W9RI08_9ROSA (Serine/threonine-protein phosphatase OS=Morus notabilis GN=L484_024520 PE=3 SV=1) HSP 1 Score: 630.6 bits (1625), Expect = 1.100e-177 Identity = 297/340 (87.35%), Postives = 322/340 (94.71%), Query Frame = 1
BLAST of Spo14016.1 vs. UniProtKB/TrEMBL
Match: B9S7J9_RICCO (Serine/threonine-protein phosphatase OS=Ricinus communis GN=RCOM_0608890 PE=3 SV=1) HSP 1 Score: 630.6 bits (1625), Expect = 1.100e-177 Identity = 297/337 (88.13%), Postives = 322/337 (95.55%), Query Frame = 1
BLAST of Spo14016.1 vs. UniProtKB/TrEMBL
Match: M5WIQ6_PRUPE (Serine/threonine-protein phosphatase OS=Prunus persica GN=PRUPE_ppa008194mg PE=3 SV=1) HSP 1 Score: 627.1 bits (1616), Expect = 1.300e-176 Identity = 299/339 (88.20%), Postives = 317/339 (93.51%), Query Frame = 1
BLAST of Spo14016.1 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: PP1_ORYSJ (Serine/threonine-protein phosphatase PP1 OS=Oryza sativa subsp. japonica GN=Os03g0268000 PE=2 SV=2) HSP 1 Score: 578.2 bits (1489), Expect = 6.000e-164 Identity = 267/301 (88.70%), Postives = 290/301 (96.35%), Query Frame = 1
BLAST of Spo14016.1 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: PP14_ARATH (Serine/threonine-protein phosphatase PP1 isozyme 4 OS=Arabidopsis thaliana GN=TOPP4 PE=1 SV=1) HSP 1 Score: 566.2 bits (1458), Expect = 2.400e-160 Identity = 260/301 (86.38%), Postives = 286/301 (95.02%), Query Frame = 1
BLAST of Spo14016.1 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: PP12_ARATH (Serine/threonine-protein phosphatase PP1 isozyme 2 OS=Arabidopsis thaliana GN=TOPP2 PE=1 SV=1) HSP 1 Score: 556.6 bits (1433), Expect = 1.900e-157 Identity = 256/302 (84.77%), Postives = 288/302 (95.36%), Query Frame = 1
BLAST of Spo14016.1 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: PP12_ACEPE (Serine/threonine-protein phosphatase PP1 isozyme 2 OS=Acetabularia peniculus PE=3 SV=1) HSP 1 Score: 555.1 bits (1429), Expect = 5.400e-157 Identity = 257/316 (81.33%), Postives = 285/316 (90.19%), Query Frame = 1
BLAST of Spo14016.1 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: PP11_ACEPE (Serine/threonine-protein phosphatase PP1 isozyme 1 OS=Acetabularia peniculus PE=3 SV=1) HSP 1 Score: 553.5 bits (1425), Expect = 1.600e-156 Identity = 253/308 (82.14%), Postives = 284/308 (92.21%), Query Frame = 1
BLAST of Spo14016.1 vs. TAIR (Arabidopsis)
Match: AT2G39840.1 (type one serine/threonine protein phosphatase 4) HSP 1 Score: 566.2 bits (1458), Expect = 1.300e-161 Identity = 260/301 (86.38%), Postives = 286/301 (95.02%), Query Frame = 1
BLAST of Spo14016.1 vs. TAIR (Arabidopsis)
Match: AT5G59160.1 (type one serine/threonine protein phosphatase 2) HSP 1 Score: 556.6 bits (1433), Expect = 1.100e-158 Identity = 256/302 (84.77%), Postives = 288/302 (95.36%), Query Frame = 1
BLAST of Spo14016.1 vs. TAIR (Arabidopsis)
Match: AT2G29400.1 (type one protein phosphatase 1) HSP 1 Score: 550.8 bits (1418), Expect = 5.800e-157 Identity = 255/302 (84.44%), Postives = 285/302 (94.37%), Query Frame = 1
BLAST of Spo14016.1 vs. TAIR (Arabidopsis)
Match: AT3G46820.1 (type one serine/threonine protein phosphatase 5) HSP 1 Score: 546.6 bits (1407), Expect = 1.100e-155 Identity = 250/302 (82.78%), Postives = 283/302 (93.71%), Query Frame = 1
BLAST of Spo14016.1 vs. TAIR (Arabidopsis)
Match: AT1G64040.1 (type one serine/threonine protein phosphatase 3) HSP 1 Score: 532.3 bits (1370), Expect = 2.100e-151 Identity = 246/320 (76.88%), Postives = 281/320 (87.81%), Query Frame = 1
The following BLAST results are available for this feature:
BLAST of Spo14016.1 vs. NCBI nr
Analysis Date: 2018-06-29 (blastp Spinacia oleracea peptides vs. NCBI nr) Total hits: 5
BLAST of Spo14016.1 vs. UniProtKB/TrEMBL
Analysis Date: 2018-06-29 (blastp Spinacia oleracea peptides vs. UniprotKB/TrEMBL) Total hits: 5
BLAST of Spo14016.1 vs. ExPASy Swiss-Prot
Analysis Date: 2018-06-29 (blastp Spinacia oleracea peptides vs. ExPASy SwissProt) Total hits: 5
BLAST of Spo14016.1 vs. TAIR (Arabidopsis)
Analysis Date: 2018-06-29 (blastp Spinacia oleracea peptides vs. TAIR) Total hits: 5
InterPro
Analysis Name: InterPro Annotations of S. oleracea
Date Performed: 2018-06-29
GO Annotation
GO Assignments
This gene is annotated with the following GO terms.
RNA-Seq Expression
Co-expression
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