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Sequences
The following sequences are available for this feature:
Legend: polypeptideexonCDSthree_prime_UTR Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.ATGGGGTATACTTTTATATATTGAAAAAATGTTATTTAATTGGCTTTTCACTTCTTAAGATTTAATATTACTCTATATCTAATTAAACTCGGAAAGAAAATTTAACTCGATCAAAATAATATTAAGGCTTGAACACTTTTGACCTCATGCTATAAATCATGAATTATATTTTAATATTTCACACATTTATCATCACGTTAACATAAGACAATGTCTATAACAACATGACGTATCCAATCTTAATTCAGTTATTTTTCTAAATCTTAAATTAAATAAGAAGTGTGATTAGATTAATAAAAGAAAAAGAAAATAGTAGGATTGTACATGATTCTCTTTTTTGGTGTTCATCTGGATTTATATTGGATACTAAAAAAGAAAACAAAGATTAAAAAAAACTACAGAAAACGTGAAAAAACAAAAGAAAAAAAAAAAAGCTTAAATTAGAGAATGTTGACAGTGCTGGGAATCGAACCTGGTTGGCAAGTTGTTTGGGACGCTAACCATAGCACCAAGCTATGTTACTTAATGTGTATGTATTTGCACGGGAAAATATTTGTTCTTATTATAGTTGACATAAGAGATATTGGGCCTTTTCCCTGGGCCCAGGGCGGCGGCTCCTTATGCCCTGCCCCAGGGACGGGCCTGGGGTGGGGGATTGTTTACAGGGTTTACACAGCTGTGTAAAGGGCTTGCAGTGGTGCTTGTCGGTGGCCACATTGTAGTTCAGCTTTTACCTCTGGCCGTCACTTATCTCGCTCTTATTCCTGCAAGGTACACTACATTGTGCTTGATTTGATGGGTTGTTTTTGTTGCTTTTTAGTACGGAGTACTTCGTATATCTTTTTGAGCGTTTGTGTGTGTTTTTTATATTAGTGGAACTGATAAATTTATTTTGTCTACTAAGCATATGTGATGTAGAAAGCAACATGCCAACATCCAGGGCGATGTTTTCACTTGTCATGAATGGGTGTATAGATTATTCAAAGCATTACAAGTTTTATATGTGTATATGGCACTTGCAGCATTCCCTTTAAAACAGTACCTTATATCCTGCTTAAATAACTAGAAGATTTATTGTAGAGTGAAAGGGATGTGGATTAGAACTGAAGGAATTAAGTCCTAGGAGCTCGTTTTAACAACATAACTTTCTTTTATGGGTAGTAAGTACTAAAAGCTAAGCAAGAATGTGATTTTGTGGTGTTAACATCCTTCAACTTGATTGGTGACAATGACGATCTCCTACGACGATTCATGTTAGCCGACCCCAAATCATTTTGGGACTAAGGCTTTGTTGTTGTTGTAACATCCTTCAACTTGACACAACTTGAGAGTTGAGACCATAATCTCCATTAATACAAGGAAGACTTACCCCACTCAAAGCATCTATCATAAGTATGATAACATTTCCGGAAGGAGTAATCAGAAGAAATTATATATATGATCCACATAGCATTCATCTTTTCAGCTCTTTCTGGTCATTAGGGAGTCTAGACAATCATGGACCCCTTGAGAACTGATCATTGAGGAAATATGTATGATGTGTGTGTTGAGTTTCATTGCTGCATGTGTTGGAAATGGAAAACAAGGTTTGGAGTTAAATGTGGTTGTTCTCACCAAAGTTCAAAGATTAAAGTTGAAGTTCACAAAAATTTTGAATGTTGATGATGGAAGTATGGAAGAGGAATAAGGAAGTGAAGGTATAGATTCAATTTGTGTAAGTACGAATCAAACAGAAATTGGAGACTAACTGCTATTATCTAACACTAAGCAAGTGATTGTTGAACCAAAATAGTAATCAGGGTTCATTATTCAACCCCAAAGATTAATATTTTCACCGAGGAGAGGGGTTTATAGATTATTATTTATATAAAGTAAATCCTTGCCATCCGGCATAGGGTTTCAACTCGTAGTTATGGGAAAACTTGTTTCATTACATTTACTTGAAATCACTTTTTGTATTGTAAATTGGGAGTGGGGCATTTGGACTTGGTGGTTTGAATTTACCTTAAATCTAAATGCAATGGATATGATTAATACTAGAATTAAGATATTTTAGTTCTTATTGAAACTGAATTTGGACTAAGGAAAAATCCATCCAAAATATATTTGCCAGCCTACTTGTTTTCTACAAGCATTATAAGCTTGTTTGAGGCATTTTTTTCAACGAAGAGTCTTAGTGCATCCAGCAATTTGGGAGAGATGAGCGAAAGAGTGACTAAAAGGAAGTGAGGACTAAGCCATTTTTCGCTCTGAAGAAGGGGATAATACTTGTAGTTTTAGTAATGCAAGTGATATTTGGGTTTTGGCTATCTAGTTTCACGCTATAAAGTGCTTATAGGCTAGCAAGTAAGGAGAATTTTAATTTTATTGCATCCAGCGCCTTAGATTTCCAAATTTTAACAGAAGTAGAATTTTTTTTGAAATGTTGAATGTGAGTTTAAATTAAATTAGAAAAGACCTATTCAAACCACGAATTTGGTGTGGACTTAGTCCAAAAATCCAAAAACTTATATTCCTTTATTCTATCAATATCTCATGCTGCTTTTATTATTCTTTACTAAGGACTGGTGTATTTATACAGTTAATTCACTTTATACATATTTTTATTATCGCTTATAATATTTTTTTTCTGTAATATATATATATATATATATGTATATATATATATACACATTTTCCTCTTATCTTACTTTCATTAATTCCACTTTCTCCCTCTTGTTTATTTTTTAACTTCCTGCTCCTTTCTGGTTTGGTTTGTTTGGTGACAATGACGATCTCCTACGACGATTCATGTTAGCCGACCTCAAAACATTTTGGGACTAAGGCTTTGTTGTTGTTGTTGTTGTAATTCACTTTATACATAAGTTCAAACTTGTCTTATTGTCACTAAAATATTCCCTCGATTTTCTTGAATTCTACTCACTTTTTGTTCTAATCAGTTTTTTTGAGTTCTACTGACGTTTACTTTATTTCCTTGTGACAACCTTTTATTCATATCCTATCGTCACCTACCCCACCTTATGGAACCTATTTTATTTAATAAAACCCTTACTCTCTATCTCTCTCCTCCTAAAAGTAATAATTCCCACATATGTTGTCCGTCTTTTGATTTCTCCTTGGTCTTGTTGGTTTAGTAACTGAACTCAGGAAAACAGAGGGAGTAAATTTTATAACCTTTTTTAACAAGTTAAGGTTCTAAAAGTAGAGTCTCAAGTATCAACTTTCAAGTATAATATATATAAAAAATGTGTTCTTGATATCTTCAATTATAGTGATGTGAAAATTTCCTGTTCTTCAATACTCAGTTTTATGTTCTTGCGCACATGTACAGGCTGACCATGATTTTCTCCCTATGACTCACAATTATTATACAAAAAAGCATAAGTCTCCAACTGAGTACATTTGGACAACTCCTCCTTTTCTAGTTAGTAGTGGCTGGTATATAGGGAAAGTAAGTTTTCTCAAGATGCACAACATAGGTATAAATTCAATTCGCACTGAATATGTATGGTCAAGAGGCTTTGTACAATTCTTCTAAATAAAGAGGCTTTTTATAATATCATGAAACAAAAATGAGTATAGGTGTGGATGATATTGGCAAGAATCCACACCAAAATCCACATGCATGACTGATCTGAACTGGACAACGACCTGATGATGTTGAAATCTGGCCTGTGCCTTTCTGCCTTGTTCTTCTGGATGATTCCCAGGACCGCGTGGATTTTCATACCTGTCTGTGGTAACCTTTATTAGGTTGCATTGTTTTTGTGCTCCATTTGTTTTTCAATGCCATGATCTATTTTTTTAGTACATCTTGAGAGTGTATTCTTTTTACCCTGTATTGGGCTTCAAATGAGGGAAAAGAAGGTCATCGGGATATAGGAACCCTTCGGACCACCTCGAAAATACCTTTTGAGTACTTTAAGGCAAAACAACACTTCCATAAATGTTCCTAACTTTCAGAAAATAATTAAAATTTCACACTGAAGATAATTTGTTGGCGAACCTACAACATTATCAACAAGCAGCAGAAATCCCTCCTTAAATGCTAGAGCAGCTTAGGCAGCTTCAACCATTTTCTGAAATTGAGGGCAATGCTAAACAGGGATTTAGTTACCTTAAATCTAAAAGCCTCACTTGCATATTGGGATCACCTTCAACAGAAAATTATTGGGGGCCATGATAGTAAGCAACTATGCATATTACATACACTGACGGAAGAGGTAAAATACACCAACACACTCTGATTGGGTTTTTAGTTAGAGCCAGGTCATTTAGATATTTTTAAAGATCTTCAAGTGTATGAATTTTAGGGGGTATCTCATTCAGTATCTCTGTAGCTGCTAGGGTGTTTGAACAGGATGTTTGATGTATAAATCTCACATTGAATTTTTTACGGAGGAAGGTATTTGACATTTTCTTAAAACCTAAGCGGCTGAGTGAGAAATACCCCTTCTTCCTCTAACTAACCCTTCTTTTCTCTTTGTCGTATGATATAAGATGTTGCTTGTGCTTGAACTTTATATATTCATATGTAAATGGATCTATAATCCTATAATGTTTGATTGGTAGGACAATTCCTTTTGCGTGGAATCTCCTAACAGCTGGTTACATTGAACAGACAACATATGGGGTAACTGAACAGTTCATTTCTATCTCAAACTTCCTTGATGCTGTTTTATCAGTGCTTTTATATTATGGATGACTTCACTAATCTTGATATTTTTTTTTTTTATTTGAAATCTCCAGGCGGCGATTAGTATATTTGCTCTACTTTTCATTGGAAAGCTGCTTGAACCCATTTGGGGTTCTAAGGAATTTGTGAAGTTCATCCTTGTTGTCAACTTTCTTACTTACGTCTGTGTCTTCATCACGGCAATTGCTTTTTACTATGCAACAAGGCTGGAAATTTACCTGTAAGTGCTGTAGAGTTGTCAAATTACTGGGGCAGTCTTGTCTTTGCGTTGTTCGGTATCGTTTTGCATATTGTGTAA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ATGGGGGCGGCGGCTCCTTATGCCCTGCCCCAGGGACGGGCCTGGGGTGGGGGATTGTTTACAGGGTTTACACAGCTGTGTAAAGGGCTTGCAGTGGTGCTTGTCGGTGGCCACATTGTAGTTCAGCTTTTACCTCTGGCCGTCACTTATCTCGCTCTTATTCCTGCAAGGACAATTCCTTTTGCGTGGAATCTCCTAACAGCTGGTTACATTGAACAGACAACATATGGGGCGGCGATTAGTATATTTGCTCTACTTTTCATTGGAAAGCTGCTTGAACCCATTTGGGGTTCTAAGGAATTTGTGAAGTTCATCCTTGTTGTCAACTTTCTTACTTACGTCTGTGTCTTCATCACGGCAATTGCTTTTTACTATGCAACAAGGCTGGAAATTTACCTCTATATGCCAATCTCTGGCTTCCATGGAGTGCTTTCAGGGTTTCTGGTTGGTATCAAGCAAATCATCCCCGATCAGGAGCTTTCTGTATTTGGAATTGCAAAAATTAAAGCTAAGAGAAGATCAGAAACTAACTTCAGGGGTGACCCAAGTGATGAGTTTGCATTTGCCACTTTCTTCCCAGAATTTTTAAGACCAGTGGTTAATCCTATTTCAACAATTTTCCATCGGATGTTCTGTGGAAGGTCTGATATTTCTAATGAGGGAAATGGTTATGATCTGGGAGGGATCCCACTTCCAGGCTCTGATTCGATTGAGGCTTCAAGACGAAGAGAAAGAGGTGCTCGGGCTCTCGAGGAAAGGTTAGCAACAGAAAGGTTGGTTGGTGCAACAACCGTAGATGGACAACATATAGATGCCTCTGAGGAAGTCTGAATCTTAACTCTGCTACAGCGCTTAACCTACTGTTGGTCTATTAAGCGGCATGTAGCAAGCCTTTCATATCATCTTCTTCTTCTCCTAATCTGGACTGAGCCATCGACCACCATGTGGAATGATAATGCATCCTTGCTCAAGACATTAAACCACCTGCGATCGCAGTTCACAACACGAAACTTCCGCCACGCAGGCCGCAATCGGCCCACCAGCCACCGGCCCACCAGCCACCGGCCCACCACTCCACCAGGTCATCCGAGTTCCG ATGGGGGCGGCGGCTCCTTATGCCCTGCCCCAGGGACGGGCCTGGGGTGGGGGATTGTTTACAGGGTTTACACAGCTGTGTAAAGGGCTTGCAGTGGTGCTTGTCGGTGGCCACATTGTAGTTCAGCTTTTACCTCTGGCCGTCACTTATCTCGCTCTTATTCCTGCAAGGACAATTCCTTTTGCGTGGAATCTCCTAACAGCTGGTTACATTGAACAGACAACATATGGGGCGGCGATTAGTATATTTGCTCTACTTTTCATTGGAAAGCTGCTTGAACCCATTTGGGGTTCTAAGGAATTTGTGAAGTTCATCCTTGTTGTCAACTTTCTTACTTACGTCTGTGTCTTCATCACGGCAATTGCTTTTTACTATGCAACAAGGCTGGAAATTTACCTCTATATGCCAATCTCTGGCTTCCATGGAGTGCTTTCAGGGTTTCTGGTTGGTATCAAGCAAATCATCCCCGATCAGGAGCTTTCTGTATTTGGAATTGCAAAAATTAAAGCTAAGAGAAGATCAGAAACTAACTTCAGGGGTGACCCAAGTGATGAGTTTGCATTTGCCACTTTCTTCCCAGAATTTTTAAGACCAGTGGTTAATCCTATTTCAACAATTTTCCATCGGATGTTCTGTGGAAGGTCTGATATTTCTAATGAGGGAAATGGTTATGATCTGGGAGGGATCCCACTTCCAGGCTCTGATTCGATTGAGGCTTCAAGACGAAGAGAAAGAGGTGCTCGGGCTCTCGAGGAAAGGTTAGCAACAGAAAGGTTGGTTGGTGCAACAACCGTAGATGGACAACATATAGATGCCTCTGAGGAAGTCTGA MGAAAPYALPQGRAWGGGLFTGFTQLCKGLAVVLVGGHIVVQLLPLAVTYLALIPARTIPFAWNLLTAGYIEQTTYGAAISIFALLFIGKLLEPIWGSKEFVKFILVVNFLTYVCVFITAIAFYYATRLEIYLYMPISGFHGVLSGFLVGIKQIIPDQELSVFGIAKIKAKRRSETNFRGDPSDEFAFATFFPEFLRPVVNPISTIFHRMFCGRSDISNEGNGYDLGGIPLPGSDSIEASRRRERGARALEERLATERLVGATTVDGQHIDASEEV Relationships
The following mRNA feature(s) are a part of this gene:
Homology
BLAST of Spo14142.1 vs. NCBI nr
Match: gi|586761535|ref|XP_006854488.1| (PREDICTED: transmembrane protein 115 [Amborella trichopoda]) HSP 1 Score: 321.2 bits (822), Expect = 1.700e-84 Identity = 174/307 (56.68%), Postives = 209/307 (68.08%), Query Frame = 1
BLAST of Spo14142.1 vs. NCBI nr
Match: gi|731361665|ref|XP_010692485.1| (PREDICTED: transmembrane protein 115 [Beta vulgaris subsp. vulgaris]) HSP 1 Score: 274.6 bits (701), Expect = 1.800e-70 Identity = 140/156 (89.74%), Postives = 147/156 (94.23%), Query Frame = 1
BLAST of Spo14142.1 vs. NCBI nr
Match: gi|720027861|ref|XP_010264708.1| (PREDICTED: transmembrane protein 115-like [Nelumbo nucifera]) HSP 1 Score: 244.6 bits (623), Expect = 2.000e-61 Identity = 152/304 (50.00%), Postives = 178/304 (58.55%), Query Frame = 1
BLAST of Spo14142.1 vs. NCBI nr
Match: gi|225449084|ref|XP_002275709.1| (PREDICTED: transmembrane protein 115 [Vitis vinifera]) HSP 1 Score: 239.6 bits (610), Expect = 6.600e-60 Identity = 120/156 (76.92%), Postives = 136/156 (87.18%), Query Frame = 1
BLAST of Spo14142.1 vs. NCBI nr
Match: gi|470143468|ref|XP_004307397.1| (PREDICTED: transmembrane protein 115 [Fragaria vesca subsp. vesca]) HSP 1 Score: 235.0 bits (598), Expect = 1.600e-58 Identity = 121/158 (76.58%), Postives = 137/158 (86.71%), Query Frame = 1
BLAST of Spo14142.1 vs. UniProtKB/TrEMBL
Match: U5D127_AMBTC (Uncharacterized protein OS=Amborella trichopoda GN=AMTR_s00175p00034290 PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 321.2 bits (822), Expect = 1.200e-84 Identity = 174/307 (56.68%), Postives = 209/307 (68.08%), Query Frame = 1
BLAST of Spo14142.1 vs. UniProtKB/TrEMBL
Match: A0A0J8BIH5_BETVU (Uncharacterized protein OS=Beta vulgaris subsp. vulgaris GN=BVRB_1g020510 PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 274.6 bits (701), Expect = 1.300e-70 Identity = 140/156 (89.74%), Postives = 147/156 (94.23%), Query Frame = 1
BLAST of Spo14142.1 vs. UniProtKB/TrEMBL
Match: D7TMB0_VITVI (Putative uncharacterized protein OS=Vitis vinifera GN=VIT_13s0019g04120 PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 239.6 bits (610), Expect = 4.600e-60 Identity = 120/156 (76.92%), Postives = 136/156 (87.18%), Query Frame = 1
BLAST of Spo14142.1 vs. UniProtKB/TrEMBL
Match: V7C390_PHAVU (Uncharacterized protein OS=Phaseolus vulgaris GN=PHAVU_004G071600g PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 233.8 bits (595), Expect = 2.500e-58 Identity = 122/156 (78.21%), Postives = 131/156 (83.97%), Query Frame = 1
BLAST of Spo14142.1 vs. UniProtKB/TrEMBL
Match: A0A0V0HSN5_SOLCH (Putative transmembrane protein-like OS=Solanum chacoense PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 233.0 bits (593), Expect = 4.300e-58 Identity = 120/153 (78.43%), Postives = 136/153 (88.89%), Query Frame = 1
BLAST of Spo14142.1 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: RBL19_ARATH (Rhomboid-like protein 19 OS=Arabidopsis thaliana GN=RBL19 PE=2 SV=1) HSP 1 Score: 217.2 bits (552), Expect = 2.200e-55 Identity = 109/156 (69.87%), Postives = 128/156 (82.05%), Query Frame = 1
BLAST of Spo14142.1 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: TM115_HUMAN (Transmembrane protein 115 OS=Homo sapiens GN=TMEM115 PE=1 SV=1) HSP 1 Score: 94.4 bits (233), Expect = 2.100e-18 Identity = 90/296 (30.41%), Postives = 129/296 (43.58%), Query Frame = 1
BLAST of Spo14142.1 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: TM115_BOVIN (Transmembrane protein 115 OS=Bos taurus GN=TMEM115 PE=2 SV=1) HSP 1 Score: 94.4 bits (233), Expect = 2.100e-18 Identity = 90/296 (30.41%), Postives = 130/296 (43.92%), Query Frame = 1
BLAST of Spo14142.1 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: TM115_MOUSE (Transmembrane protein 115 OS=Mus musculus GN=Tmem115 PE=1 SV=1) HSP 1 Score: 63.9 bits (154), Expect = 3.100e-9 Identity = 35/81 (43.21%), Postives = 46/81 (56.79%), Query Frame = 1
BLAST of Spo14142.1 vs. TAIR (Arabidopsis)
Match: AT3G07950.1 (rhomboid protein-related) HSP 1 Score: 217.2 bits (552), Expect = 1.200e-56 Identity = 109/156 (69.87%), Postives = 128/156 (82.05%), Query Frame = 1
The following BLAST results are available for this feature:
BLAST of Spo14142.1 vs. NCBI nr
Analysis Date: 2018-06-29 (blastp Spinacia oleracea peptides vs. NCBI nr) Total hits: 5
BLAST of Spo14142.1 vs. UniProtKB/TrEMBL
Analysis Date: 2018-06-29 (blastp Spinacia oleracea peptides vs. UniprotKB/TrEMBL) Total hits: 5
BLAST of Spo14142.1 vs. ExPASy Swiss-Prot
Analysis Date: 2018-06-29 (blastp Spinacia oleracea peptides vs. ExPASy SwissProt) Total hits: 4
BLAST of Spo14142.1 vs. TAIR (Arabidopsis)
Analysis Date: 2018-06-29 (blastp Spinacia oleracea peptides vs. TAIR) Total hits: 1
InterPro
Analysis Name: InterPro Annotations of S. oleracea
Date Performed: 2018-06-29
GO Annotation
GO Assignments
This gene is annotated with the following GO terms.
RNA-Seq Expression
Co-expression
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