Overview
Sequences
The following sequences are available for this feature:
Legend: polypeptideexonCDSthree_prime_UTR Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.ATGTTTATACGCCATGTTTTGCCAGCAACCAACTTCCCAGTCAATAAAACGGCTTTACCCTTCAGGACAGCGCAGTTGCTCAGCTCATACCGCACTCCCCAGTCAATGAAACGGCTTTACTCTCAAGTCTCAACCACCTCTGGAGCTACAGCAATGGCGGAGGAGAGAGAAATTCAAACACCTCTTCTCCAGAATTCACCTTCCTCCTCAACTTCAGAGATTCAAAGACACATTGAAGACGAAATTCTTCCATTTTCACCTTCCGAAGTACCGGAATCAGAGCCTCATGATGTTATAACATCATCATCTTCAGTTGCTCGGAAGAACCAGCGGCTCGTTTCTCTTGATGTCTTTCGCGGTCTCACAATTGCCGTATGCTTTCTGCTGAATTTCATCATTTTCTTTTAATTAGAAATTCTTTGATGAGGTTTGTTTCTGATTTTTTGGATGCATGATGAATTAATTTGATGATTTGTGGAATTTTGATTCTCTGGCGTAGTGTGAAATGGTGAATTTTTGTGTTAGGTTTGGATTTTGTGAATTTTGAAATTTGATCAACTGATAATTTTGATGTGAATTGTACATGAATTTTGATTCTCTGGCGTAGTGGTGCTTGAGTGATTTCGGTAATTGCGATGAGCGTCTTTGCTTGATCAATTTTGCTACTCCGTTAAGGAGAGTAAAAAAAAAGACATACTAGAAATCTCAAATATGAAAATGATTGGTTAGTAATGTATTTCTTGATTTGGTCCAAGGAAGAAGGCGTGTTTCCGTTTTCAATCTTGTGGAATCTGTATCCGTCTTGTCCTAGTCATTGTCTACACAGTTGAATCGTTATTGATTTACTGGTATACTTGATCAGTATGTTTGTATAACATGTACACGGAATGTTGAGAAGGTAGCTTTAGAATAATGTCACATGCATTCAAAGTGAAATTAAATTATACTTTGTATAAGCTATGACTAGGTTTGGTACACGTTTCTTTGTTGACGAGCCAAGTCCTTGGGGCTGAATAAGTATGTAGCTTGAAAGTACAACTTGTGAATACATTATTGTGGAATGCTGCGAGTTCAAGTTAACAGATAGCCCTGGACTTCACTCTATTGGCAAGTGAATTGAGGACCTTGTTTAGGTCCTCGTTAGTTCGAAAGTATGTTATTCTGAGAAGTGATTATGATAGCATAATAGCAGTAATTACATTAATGCCTATAACCGTTTCGGTACTTGTACTATCAGAACTTAAATGGATCTACTCTAAGTCCTAATAATTTGTGTATCACATCTTAGTTACTTTACATTTATCTAGCAAGTGCATGAACTAGCACTGTTTATTCTGAAATGAACTTAGACATAAGGAAGAAAAAATTAACTTCGTTAATTGATTAGAATCATACTATAACAATCCTGCATAGTTTGTCTTTGCATATCTTATTATGGACTCATTATTAGAAGACTTAACTCAATCATTTGAAGAACTTCTAATTGGTTCATTATTAGTAACTAACAGCTCCTAAATCATGACATTGTATAAGAAAATATTGGCCAATTGCAATTAATTAAGTTAATGTACTTGTATTTGTGCGTTTGTTCACTATTGTTAGGGAATCTGATATTATTTTATTGAATCAGTTTTTATTCCGTATTTCTACATCTTCCCTCCACATTAATTTCTCTCTGTTTACAGCTTATGATTTTGGTTGATGATGCTGGAGGAGCTTTTCCATCTATAAACCATTCTCCTTGGTTTGGAGTGACGATAGCAGATTTTGTGATGCCTTTTTTCCTCTTCATTGTTGGATTTTCCGTTGGTCTGGTATTTAAGGTATAAACACGACATATGTAAGTAGGTTTGGGTGTAAAGTCCTTAAGGATTCAGTTAGCAATTATCTCCGCATCTGACAATTAGGCTCCGTTTGGTAGGGCGTAAAATGTTTTCATTGTAAAATGATTTTCCATGGAAAAAAATTTTCAAGGGAAAACACAATTCCAAACTACTTTTCCTTTGTTTGGTAACTTAAAGGAAAATGGGAGAAGATGGTGAAGATTGAGGGGAAGAAAGGAGAGGGAGGTAAGGAGGAAAGAAGGAAAAGTGCTTTCCCTCCCTTTCAAATGGAAAAAGGGTTTTCCACCTTTGAGGGAGTCATGGAAAATTGTTTTACATCCCTTACCCAACCAAACAACGTAAAATGATTGAAAAGAGGAAAATCGTTTTCCATGAAAACGTTTTACGCCCTACCAAACAGAGCCTTAATTCAGTTTCTCTTTCACTAGCCTTATTCACTTTTTTTTAACTTTAGAAATTCTTCCAAAGGAGATAAAAAAAGAATGAAATAATTCTTGAATTTTTATTTTAACGTCCAGTGAAATGTAAAATGCTACAATGTTTTCTCATATACGAAGTATATCTCAGCATTTCCTCTTCAAACCCTCTGGTATTGACTTCACTTTGTCCAAACCCAATCCTATATACCTCATTCTTTCCCAAGATCACCCCAAAAGGCACTAAGGAATTCAGATTACCCTAAAAAAAGATCGTTGTTAGTCAAATATTGACCTCCAAGAAGACCGAAATAGCAGTGTCTTTGAAGAAGTTTAATGGAAAAGCAGCAGATTAGGTGAATGGATTACATTGAACTTGAGAAAGTGCATTTAATTTACAATACTCAGTCCAAGTACCTATATCGGTTGGGAGTTTGGCACTTCATACTTCAAATCACCTGAAAATGATTGCCTTTTATTCAAATATCAACCACCAAGAAGACTACAACATTGATTTTGAACAATTCCATGGCAGGATGGCACAACAGCAGATTCGGTGTGTGGATTACATTGAACTTGCGAAGTGCATTTATTCTACATAATTCAGTCCGAGTTTCTATGAAAATTGGTCGAAAGAAAGAGGTCAATTGTGGGTGGCTTCGATAGGTTGACATAATATTCCGAGTAGTTTGGACAAACACATATATTCCATTGTTTTGAGTCTTGGTTTTCAATTGAACTCTTCTTTTCCTTCCTTTTGCACAATCTTCATTTTCTCTTGGTGTCATACTCAAGGTCTGTTTTTCGTTTGCAGTGTTCAGTAACATGTATCTTCGAAGATATGGGTATTGATTAGTTAAAGGTTGGTTTACAGAAGTCTTGAATAAAATTGGTTGAGTTCATTTTTATACATTTTAAGCAGATTCCTCTTTGTTTTATCAACTTGTTTCCTTCTTGTGCGGCGTGTATGTAAATGTGTTTGCATGTATATACATATCATATACTATGCAATGGAGGAGGGCTTAAATTAGCTTAATATATTGCCTGTTTTACTTTCAGAAAACTGACAGCAAGTCTACAGCAACAAAAAAAGTCATCATAAGGGTAATCAAGCTCTTCCTTTTGGGTATCTTCTTGCAAGGTGTGTGCTAAGGTGAAAAATTCTAATTAAGAATTTTTCACCTTCTGTATTCATATATTCTACTCTTATAGAATATTATTGTTCTTTCAAGCTCTGAGTTTGAGGAATGTTGTTGGCATTTTACTATGACACATATAGTTGTCGATTGTACTATCCATTTTTCTTATGAGTAAATGTATTCCTTCTTTGTGGCTTTAGCATTATTGAAGTAGATACTTTTAAAAACTCTGACTACCGTTTCTTAGGGATTGTAAATTTGTAAGTGTAGGTGGCTTTTTTCATGGAAGGAAAAAACTGACATACGGTGTAGACGTGAAGAAAATACGTTGGCTAGGTGTACTGCAGGTAGCTTTCTGAATTTATTATGTTCAATAATGTGCTATAAGTTTGCATGGTAAATTTTCTATATTTGATTTGGGTCAGAGTTCTCAGGATATGTAACACTGTATGTTTGTGCCTTCTTGTCCGTTGTTTGCTTCCTGACCTTGATGTTTGATGCTGGTGTACCAAACTGGAAATACAAACAAATAGAGCACAGGAATGTAGCTTTTACTTCTGTAACATTCCCTAACATTGGGATTTGGGCTATAGAGCATGTTGTACGCGTTCTTTTGAGCCATACTTATGATAGGGAGTTTAATTTCTGGATGGAACTAGAGCTTGTATCTTGAATATTAGTTTCTCTTGTGTAAGTATGTGCTGGAATTAGGACATAAGTAACCGTCATACGGAGTACATAAAAGACAAGGGAAGTTTCATGTCACAACAGGATACCTCAGTCGTTTGTAAAATTTTTGGACATACCTCCATCAGAAATGCAATTATATGAGTAACATCTTGGAAACTTCTTTGATATTTTGACATCTAACTTGATTCAGAGTAAAGGTATGCAAGTTTCTAATAGTGTTAATTTTCTTCTTAATTCCTCTCTCGTATTGTGGTGATAAGTCCTATCACTCTGTCTACATGTAAATCGGTACATGTACAAGGATGTACATTCTGTCAGTTGAATGTTTATTCATTTCCAATACTGTAATGTAGAATTGTTTGGGTTACCGTAAAGAAATTATGTGTGACTAGCCTGTGCACTGTTATTAGATATCTCTGATGTCTGTGGCATGGTGGATTTACGTTACTTATTTAATAACTCTGCTGTTTCACAAATAATGGCCACGCCTCATCCGCTTTCCCTCTGCCGTTGACTTAAATGTTGATTTGTGCCTAAGGAAATTACAGTTAATTTTATGATAGCATTGGTATTTTATATTCTTTTGGAAGGCAATAATGTAGGCATTGGGCAATGAGATTGATGGGATAGAGTATCTGTCTCCATTCTCTGCATAATGCGAGGTTCATACACGTCGTAAAAGTGAAAGTTCTAAAGGATTAATCAAAATGCTAAAGATTAATCCATAATCTCATATTATCTACTAACTATTAAGTTGTTACTTTTACCCATATAATTGACCCTCATCCATGCCAGAGTGAAATATTCTCCTGAAGTCATGAACATATCAAAAATATATGTGGCAAGAAGTTTAGGTCTTTAAACAACACCTAAAAATAAGTTGCTTTTTATCAAGAAATTAGAAA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MFIRHVLPATNFPVNKTALPFRTAQLLSSYRTPQSMKRLYSQVSTTSGATAMAEEREIQTPLLQNSPSSSTSEIQRHIEDEILPFSPSEVPESEPHDVITSSSSVARKNQRLVSLDVFRGLTIALMILVDDAGGAFPSINHSPWFGVTIADFVMPFFLFIVGFSVGLVFKKTDSKSTATKKVIIRVIKLFLLGIFLQGGFFHGRKKLTYGVDVKKIRWLGVLQRISIGYLLASVSEIWLANGLVVDSHLAFVRRYYIQWMVPVLLCITYICLLYGLNVPSWEFDLNGANSTLLPSDVQTVQCGVRGNLDPPCNSAGFIDRLLLGESHLYQRPVYRRVMECSVNSPDYGPLPPNSPGWCLAPFDPEGILSSLMAAVTCFVGLHFGQIIAHFKDHFQRMFLWSVSASLLLISGYVLQALGMPLSKPLYTVSYMCITAGASGLIFVIIFYLADVKRIRKPVILLQWMGMNALLIYALAACEIFPVVLQGFYWGSPENNLVDGTESFLQEVLSSKNWGTFAFVLLEIIFWGLVAGLLHMKRIYVKL Relationships
The following mRNA feature(s) are a part of this gene:
Homology
BLAST of Spo16362.1 vs. NCBI nr
Match: gi|902218443|gb|KNA18020.1| (hypothetical protein SOVF_074470 isoform A [Spinacia oleracea]) HSP 1 Score: 1006.5 bits (2601), Expect = 1.700e-290 Identity = 507/507 (100.00%), Postives = 507/507 (100.00%), Query Frame = 1
BLAST of Spo16362.1 vs. NCBI nr
Match: gi|902218444|gb|KNA18021.1| (hypothetical protein SOVF_074470 isoform B [Spinacia oleracea]) HSP 1 Score: 1001.5 bits (2588), Expect = 5.600e-289 Identity = 507/509 (99.61%), Postives = 507/509 (99.61%), Query Frame = 1
BLAST of Spo16362.1 vs. NCBI nr
Match: gi|902218445|gb|KNA18022.1| (hypothetical protein SOVF_074470 isoform C [Spinacia oleracea]) HSP 1 Score: 998.8 bits (2581), Expect = 3.600e-288 Identity = 505/507 (99.61%), Postives = 506/507 (99.80%), Query Frame = 1
BLAST of Spo16362.1 vs. NCBI nr
Match: gi|731346769|ref|XP_010684629.1| (PREDICTED: heparan-alpha-glucosaminide N-acetyltransferase-like [Beta vulgaris subsp. vulgaris]) HSP 1 Score: 808.5 bits (2087), Expect = 7.000e-231 Identity = 402/491 (81.87%), Postives = 434/491 (88.39%), Query Frame = 1
BLAST of Spo16362.1 vs. NCBI nr
Match: gi|802689337|ref|XP_012082852.1| (PREDICTED: heparan-alpha-glucosaminide N-acetyltransferase-like [Jatropha curcas]) HSP 1 Score: 690.3 bits (1780), Expect = 2.800e-195 Identity = 332/492 (67.48%), Postives = 395/492 (80.28%), Query Frame = 1
BLAST of Spo16362.1 vs. UniProtKB/TrEMBL
Match: A0A0K9REW9_SPIOL (Uncharacterized protein OS=Spinacia oleracea GN=SOVF_074470 PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 1006.5 bits (2601), Expect = 1.200e-290 Identity = 507/507 (100.00%), Postives = 507/507 (100.00%), Query Frame = 1
BLAST of Spo16362.1 vs. UniProtKB/TrEMBL
Match: A0A0K9REU9_SPIOL (Uncharacterized protein OS=Spinacia oleracea GN=SOVF_074470 PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 1001.5 bits (2588), Expect = 3.900e-289 Identity = 507/509 (99.61%), Postives = 507/509 (99.61%), Query Frame = 1
BLAST of Spo16362.1 vs. UniProtKB/TrEMBL
Match: A0A0K9RGN7_SPIOL (Uncharacterized protein OS=Spinacia oleracea GN=SOVF_074470 PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 998.8 bits (2581), Expect = 2.500e-288 Identity = 505/507 (99.61%), Postives = 506/507 (99.80%), Query Frame = 1
BLAST of Spo16362.1 vs. UniProtKB/TrEMBL
Match: A0A0J8BWA8_BETVU (Uncharacterized protein OS=Beta vulgaris subsp. vulgaris GN=BVRB_7g165220 PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 808.5 bits (2087), Expect = 4.900e-231 Identity = 402/491 (81.87%), Postives = 434/491 (88.39%), Query Frame = 1
BLAST of Spo16362.1 vs. UniProtKB/TrEMBL
Match: A0A067K8W8_JATCU (Uncharacterized protein OS=Jatropha curcas GN=JCGZ_13995 PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 690.3 bits (1780), Expect = 1.900e-195 Identity = 332/492 (67.48%), Postives = 395/492 (80.28%), Query Frame = 1
BLAST of Spo16362.1 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: HGNAT_MOUSE (Heparan-alpha-glucosaminide N-acetyltransferase OS=Mus musculus GN=Hgsnat PE=1 SV=2) HSP 1 Score: 124.8 bits (312), Expect = 2.900e-27 Identity = 129/487 (26.49%), Postives = 222/487 (45.59%), Query Frame = 1
BLAST of Spo16362.1 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: HGNAT_HUMAN (Heparan-alpha-glucosaminide N-acetyltransferase OS=Homo sapiens GN=HGSNAT PE=1 SV=2) HSP 1 Score: 124.0 bits (310), Expect = 5.000e-27 Identity = 131/483 (27.12%), Postives = 220/483 (45.55%), Query Frame = 1
BLAST of Spo16362.1 vs. TAIR (Arabidopsis)
Match: AT5G47900.1 (Protein of unknown function (DUF1624)) HSP 1 Score: 453.4 bits (1165), Expect = 2.000e-127 Identity = 215/401 (53.62%), Postives = 284/401 (70.82%), Query Frame = 1
BLAST of Spo16362.1 vs. TAIR (Arabidopsis)
Match: AT5G27730.1 (Protein of unknown function (DUF1624)) HSP 1 Score: 377.9 bits (969), Expect = 1.100e-104 Identity = 202/463 (43.63%), Postives = 283/463 (61.12%), Query Frame = 1
The following BLAST results are available for this feature:
BLAST of Spo16362.1 vs. NCBI nr
Analysis Date: 2018-06-29 (blastp Spinacia oleracea peptides vs. NCBI nr) Total hits: 5
BLAST of Spo16362.1 vs. UniProtKB/TrEMBL
Analysis Date: 2018-06-29 (blastp Spinacia oleracea peptides vs. UniprotKB/TrEMBL) Total hits: 5
BLAST of Spo16362.1 vs. ExPASy Swiss-Prot
Analysis Date: 2018-06-29 (blastp Spinacia oleracea peptides vs. ExPASy SwissProt) Total hits: 2
BLAST of Spo16362.1 vs. TAIR (Arabidopsis)
Analysis Date: 2018-06-29 (blastp Spinacia oleracea peptides vs. TAIR) Total hits: 2
InterPro
Analysis Name: InterPro Annotations of S. oleracea
Date Performed: 2018-06-29
GO Annotation
GO Assignments
This gene is annotated with the following GO terms.
RNA-Seq Expression
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