Overview
Sequences
The following sequences are available for this feature:
Legend: polypeptideexonCDS Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.ATGACTGAAAGTTAGTATTTTTGTTTTTATGATTGTTTGGTATGCTTTGAAATGTGTTTATTATTTTTGTAGGGTCCAACTTGATTAGAGCTTAGCTATTAGCCTATTACCTAACCGAGTGGATAATTAGTACTATTGGCTAGAATGTGCTATAAGGGTTTAATGTATTACTTTTAGATGCCTCATCTGGAGGATCATATATAACTCTTGAGGTTGATATTGGATATAGTAATTTTTGTTATAACAAGTACCTGTGTTTGGATTAATGGTGGGTTGATCATCCTGTGTTTTTTGTTATCTATTTCATCCTCTTTAGGATAGAGTTCTGTCTCGAATTTCTTATGTCACTCTTGCTTTCAAAAAAGGAGAAGGCTTTGTCTCAGCACTGGTCATTTGAATGACATTTATTTTGGGATAGTGACATAGTGTTTCAGCATTGTGTTGAGAAGTTATTAATGGATTTCCTAAGGTAAATGTCACCTGGTGGGAAATGAGGAAAGTAGATTCTGCTCTAAAGCAGACATGAAATGGATGCAAGTAGCATCTACCTGGCTGAGAGCTTATAACTCGAATGTGCAACAGTTTTTATAGCACTCTTCACGGACCATTTTTTGTTTTGTCCTTAACGTCTGATTTTGCTGGTTTAGAAGAGCAGAATGTTTGCAATTTTTTTTTTTTAAAATTGACTGAGTTTTGATTATTTTTGTTTTATGATTGTTGTTGGCTTTGAAATGTGTTGATTTCTGTAGGGCTTGATTTTTTTATGGTTCAACCTAATTGAGTCAATAATTAGTATTCATTAGCTATTCATTATATGATCATCAGCGCGTTGCATTTGTTCCTTTGGTTTAGTAATCCAAAGAGTTACTAAATTACAGCTTGCCTGTCGTTTCCATTGGCGTGGGGCATAGCTCGTATGACAAAGCATCTGTAATTTAGTAACTCTTTGGATTTTTTACATTTGGAAAGTGTATTGAGTGCAAATCAGGATCAAGTAGCTGATAGACTAATAAGTATGTTCTGCATAGGAATTAGAAGCAAAGCAGAGAAATGAAAGTAAGTTGAGGGGTAAGAGTGTAAGACGCACAATCTATGTACAATTATCTGCCAAGCCACTGAATATCTGGTGGCTATTGTATTTGGAATAATGTATTCCAGTTCATTACTATGTATCAACTATTGTGACTACATAGTTTTGCTGCAGCAGCTCACATATAATTCTCCAAGTGACTATAGTTCCTGGCCTTTATATACTTAATGTCAATTATGTCTTTTTATACTGAATAACACATAATACACAAACAAAATGAGAATACAAAAAAATGAAAATTTAATTGAATCTATGGGTGGGAGTTGTGTATCTTTTATTCTTTATGTCTGGAAATGTTGCTGACATGTAATCCAGCAAAAGAAATAGTTGACAAAAGAAATACTGCCATAAAACTCCCTCACTGTATGATAGTGCTGGGCTTGGGTGCATGCTCTTCTATGTGTGTATTTCTGTATGTCATGTTCCCAGTTAAAATCTTATAAAAGTCTATTTTAAATTCATGTTTACTTGTCTATTTTTCAGAATTACTTTAAGGAGAAAAAAGCTACAAACTCTCTAATCTCTATACGAGAGTGAGAATCAAAAGACAGAGGACGAGTTGTTCCTCGAGGCCACAGGTAGATGGACTGACAAGGGAAGAGTATTTGGTATGGGAGCATCAACAGACTCATACTATGAGAGACCAGGAGTTTAAGAGAGGAACGCAAAAATAGTATAGAGGGTTCTTCAATACATTGATGAGAAAGCTACGTGCAAGGGGCACTACTGGTATGCAATTTTCTGGTTTTTAGTCCTATCTTTTTAGGATGAGTCCGAAAATTCAGCTCGTATCTTTTAGTTTCCGTCTTTTATTAGGTATATGCCGCTACAGCCTCTAGTGTCGGTCTATGTAAGCACATTTAATTTAAGGCTCATTGGGTCGTTATAGGTCATATTTATGAATAACTTCCTTTGATTTATAGCTAACCTAAATAATGCTTTTATGGTCTCCATTTACGGTGCGACATTTAGCGAGCATCAAAGCGAACTAATTCTCAAACAAGTAATCATAACTACTTAGGTTTTGAGGAATAAGTTTCAATCAAGAATGATTTATGAGATGACTTTAATATCTTGAAATGTTCTCATGGTCACCCCGTAACACCCCAGTATTTTTCTAAAATAATGTTTTGTAAAGAAATTGGTTTATATTACTACTCAACTTTTATTTAACTTTATATCTATTCAAAGGGAAAGTTTATTCTTATATCCGATTATTTTACAGCTTGATTTTCTAATTACTTCCATTTAAATACTAATCAAAAGTCGTTACTATCATATTTATTCCCCAAATAAAAGAAACAACTTTATTCCTCTTAATTGTACTAATTAACCGTGCATAGTGGAGCTTTACTTCTTTGATTCTTATTCTTATTAGATTTATAACCTCCATTGACTCTCCATTTCATAACACCCAAAGTGAGCTTAGACTTTTCATTTCTTATTCCCCTTCCTGCTTTTCTCAACCGTGAGTCCTACCCCTTTCCCTTCTGTTTTTGTTTCTCCTTCACCAAAAAAAATATCAAACAACATAAAGTACTCTTACTCTTCTTGCGGGTCATAATAGTTTTGTAAGTGTTGCTTGTCCAAACGATCGATTTACAAGGTTGGTTTTACCCATTGGTTTGTCTATAAGGAGAAGAGCGTGACGGTTCCGAGGCGTGATTTCGGTATTCTAGCACTTCTCTCGTTGGTCGAGGTAACTAGTCGTACTCCTCGTTTACGTTAGATTAGGGAATTAAAATTAGTAATTTTAATTAGTCTAAGTTAGGGATATCAAGTGATTAGCATCCAAATACGTTTTGTAGATTATATTCTTAATATTTAAAGCATGCTCGGAAATTGTTTTGAGTTTCATACAATCATGACTTTATGTAGTAGGTGTCGTTAAGGTAAGGTTATATGTGTGTTGTTGTAGCGTTGTCAACGATTTTATACTCGGAGGAGTGTAGCTTGTGAGAGTTTCACTGTCTTTAGTACAATTTTGTCAAGCTTTACGCACCGTGTGTACTGTGAGTATCTTTCCTACTTACAGTAAGCCTTGTGCGCGTGCGCAGATGACGAGTAGTCGAGTTGGTTGCTTGGCCTTGTATTGCGTTGTGTGTGAATGAGGCTAATGCCATGCGATACTGTTGTTGGGTTCGATGGGCAAGAGTACATTTAAATTGTTAATGTATGCAAACAATAGTAGAAAAAATGTCATTTACAACCCACCATTCGCAACACGCGTGATAAGTGATAGTTGCGAAATGTCTCTAGTCAACGCGGGTCAAAAAATTAATGAGATTTTAGCAACTTTTATGGGTTCTAAACGCAGCGAATCAACGGCAAAAAATAAAATAAAAAATTCTCGCAGCGCAGGAAGAGTGGAAGTTGCGAATAATCCTTTTCTACCCTCGTCTATCGAACTCTCCGCCCTTCCCTCATTCCCCCCCTCAAACCCCCCCCCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCATTCCATCAAATGCACACTTCGTTAAGGTTGGAATTCTTCGTTTTCACCGGCGTTCGTAGGAAAGTCTTCGTTACTATCAGGNTAAGGTTGGAATTCTTCGTTTTCACCGGCGTTCGTAGGAAAGTCTTCGTTACTATCAGGGTTGAGCAAAATTCGGTGCCGATTTACGCTCTTACCAAAAATTCCAGAAATTTGGTCATCGTTTAGTGTTTTCCCACTAGATTTTGGAGCATTAAGGTTGGATGTCCTCGTTATTATCAAGTATTTTATGGTTTATTTTATCATCAGATCTGTGATTTTTGCTACCAATTTTACTCTACCAGATTTTCTTGATTTTACACAAAAATCTCAAACGAAGGAGAACAAGAACTCGTCGCTCTTTACCAGGACGAGTTTCCAAATTCCGACGCTTTCGATGCCGCTGCTATTGATATGTGTGTTTTATATAGAGTTTTTACCCCCGTCCCTTAGTACTTTTCTGCATCAAATGGGCTCTTAGGAGTCGTTTTTAGTACTAATATGTGTTGTAATGTGCCTGGAGTTTCAGGATTTGTTCGATGAGAAATTAGCCTTTTTAGGCTCGTTTCGCAATGATATAGGCCACTACACGGACCCCGAGTAGGTTCGGGATGATTACGGTCGACCCTTGGGAGCCTAGGATGCCTATGTTCGAGCCTCGAGAGTTAGACTTGGTGCTTTGAGTGAAGGACGATGTATTCTGCGAATCGCCCTTTGAGTGGAGGGCGGAATGAGAAAACCGGGCGAAGAAAAAGACTTCTGAAAGTTTCAACACGCGCCGGATCGGGCGGAATTTCGCCCGATCGACCTGCTTGTCGAGCATAATGCCCGATCGGGCGGTCGTCTGCCCGATCGGGCGGCGCCAACCTCTATGCCTTTTTCGCGAGTTTTATTTCCGATTTTGAGTTGTATTTTGGGCAAACTATAAATACTAAGCCCTTTTATTTTTAGTGACATCTTATTCCTTAGTTTCAAACACTTAGTTTTATTCTCATAGCTTAGTTTATTCTCTCAATTTGTTGCAACACTTAGTTTTTAATTTCAATCAAAAATTCAAGCTTTCATTATTCATTGTTCTTCATTTAGGTATTAATTCTTACTTTGCTTTATTAGTTTGTTTTTAATCATGTTTTCAATAGTATTAATTGTTTTGTTTATTGTTAATATGAGTGAGTAGTCAATTTTCTAGGGTTTTGGGGATCCATGAATTAATATGAAGGGATGATTGAATGTTGTTGATTGTTGGTACAAGATTTTAGCCCGTGCGATGCACGGTTTCTATTAAATTGTTACGTTAAAATAAAACTTCTATATATATCAACTGCTATATTTATATTAGATTAGATTGATTATTTTTATTTTTGATTGAATATCATTTTAGATTTATTTTTTAATTATTA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TTATTTTTGTTTTGAATAAAATTGAAATAAATTCATAAAAAATATCCAGAATTTCCAATTAATTGCTGTTTTCGTTTTTTATATATTTGTTAATTTATTCAGTATGTTATTTTGTTTGTTTGGTTGATTAGTTAATTTATTTAGTATGTTGATTTAGTTTTCTTTGTTTGATCTGTGAATTGATTTACTGTTCTTCATATGATTCGTTAATTTGAAGTATATTTGGACGGTTTTGTTGATTGTGAGACTGATTCGGGTCATTTCAGGGTTTTTTTTGTATTTAGGTCGGTTTTGTTAAACTTCTGAATTGATTTATTGTTCTTAGTTTTATTTGTTAATTTGAAGTAATTTTGGAAGGTTTTGTTGATTGTTTGACTGATTCGGGTCATTTTGGGGTTTGATTTGTTGTTTTTTAATTGTATTTAGGTCGATTTTGTTAAACTTGTGGCCAAATTGGTCGATTCTTTTGACAAGGGTGGATTCTGGTGGTGTGATAGGTTGCGTGTTGGGTTGCCGAACCCACTACCCAACATTGGAGATGCACTTCAAGACTGGAAGGATAGAGTTAAAGTGTCTGCTGATATTCCACAAAGGGATATGGAGGATCAAGAAGAAGGTGAATTTGGGTTGACATCTGAACTTGATCAGGGAACAGCTCAGGCGTTAGGATCTGCAATGCCTTATCAGACGGAGCATAATATTGTCCATGACAAGCCTGATGGGGATGGAGCATAA ATGACTGAAAATGCCTCATCTGGAGGATCATATATAACTCTTGAGGATAGAGTTCTGTCTCGAATTTCTTATGTCACTCTTGCTTTCAAAAAAGGAGAAGGCTTTGTCTCAGCACTGGAGAAGAGCGTGACGGTTCCGAGGCGTGATTTCGGTATTCTAGCACTTCTCTCGTTGGTCGAGGTCGATTTTGTTAAACTTGTGGCCAAATTGGTCGATTCTTTTGACAAGGGTGGATTCTGGTGGTGTGATAGGTTGCGTGTTGGGTTGCCGAACCCACTACCCAACATTGGAGATGCACTTCAAGACTGGAAGGATAGAGTTAAAGTGTCTGCTGATATTCCACAAAGGGATATGGAGGATCAAGAAGAAGGTGAATTTGGGTTGACATCTGAACTTGATCAGGGAACAGCTCAGGCGTTAGGATCTGCAATGCCTTATCAGACGGAGCATAATATTGTCCATGACAAGCCTGATGGGGATGGAGCATAA ATGACTGAAAATGCCTCATCTGGAGGATCATATATAACTCTTGAGGATAGAGTTCTGTCTCGAATTTCTTATGTCACTCTTGCTTTCAAAAAAGGAGAAGGCTTTGTCTCAGCACTGGAGAAGAGCGTGACGGTTCCGAGGCGTGATTTCGGTATTCTAGCACTTCTCTCGTTGGTCGAGGTCGATTTTGTTAAACTTGTGGCCAAATTGGTCGATTCTTTTGACAAGGGTGGATTCTGGTGGTGTGATAGGTTGCGTGTTGGGTTGCCGAACCCACTACCCAACATTGGAGATGCACTTCAAGACTGGAAGGATAGAGTTAAAGTGTCTGCTGATATTCCACAAAGGGATATGGAGGATCAAGAAGAAGGTGAATTTGGGTTGACATCTGAACTTGATCAGGGAACAGCTCAGGCGTTAGGATCTGCAATGCCTTATCAGACGGAGCATAATATTGTCCATGACAAGCCTGATGGGGATGGAGCATAA MTENASSGGSYITLEDRVLSRISYVTLAFKKGEGFVSALEKSVTVPRRDFGILALLSLVEVDFVKLVAKLVDSFDKGGFWWCDRLRVGLPNPLPNIGDALQDWKDRVKVSADIPQRDMEDQEEGEFGLTSELDQGTAQALGSAMPYQTEHNIVHDKPDGDGA Relationships
The following mRNA feature(s) are a part of this gene:
Homology
BLAST of Spo17822.1 vs. NCBI nr
Match: gi|902185707|gb|KNA10543.1| (hypothetical protein SOVF_143350 isoform A [Spinacia oleracea]) HSP 1 Score: 135.6 bits (340), Expect = 7.900e-29 Identity = 68/83 (81.93%), Postives = 70/83 (84.34%), Query Frame = 1
BLAST of Spo17822.1 vs. NCBI nr
Match: gi|902185708|gb|KNA10544.1| (hypothetical protein SOVF_143350 isoform B [Spinacia oleracea]) HSP 1 Score: 135.6 bits (340), Expect = 7.900e-29 Identity = 68/83 (81.93%), Postives = 70/83 (84.34%), Query Frame = 1
BLAST of Spo17822.1 vs. NCBI nr
Match: gi|731348138|ref|XP_010685342.1| (PREDICTED: midasin isoform X1 [Beta vulgaris subsp. vulgaris]) HSP 1 Score: 105.5 bits (262), Expect = 8.700e-20 Identity = 56/77 (72.73%), Postives = 59/77 (76.62%), Query Frame = 1
BLAST of Spo17822.1 vs. NCBI nr
Match: gi|731348140|ref|XP_010685343.1| (PREDICTED: midasin isoform X2 [Beta vulgaris subsp. vulgaris]) HSP 1 Score: 105.5 bits (262), Expect = 8.700e-20 Identity = 56/77 (72.73%), Postives = 59/77 (76.62%), Query Frame = 1
BLAST of Spo17822.1 vs. NCBI nr
Match: gi|1009111803|ref|XP_015902684.1| (PREDICTED: midasin-like [Ziziphus jujuba]) HSP 1 Score: 75.1 bits (183), Expect = 1.300e-10 Identity = 38/84 (45.24%), Postives = 52/84 (61.90%), Query Frame = 1
BLAST of Spo17822.1 vs. UniProtKB/TrEMBL
Match: A0A0K9QTF5_SPIOL (Midasin OS=Spinacia oleracea GN=SOVF_143350 PE=3 SV=1) HSP 1 Score: 135.6 bits (340), Expect = 5.500e-29 Identity = 68/83 (81.93%), Postives = 70/83 (84.34%), Query Frame = 1
BLAST of Spo17822.1 vs. UniProtKB/TrEMBL
Match: A0A0K9QV03_SPIOL (Midasin OS=Spinacia oleracea GN=SOVF_143350 PE=3 SV=1) HSP 1 Score: 135.6 bits (340), Expect = 5.500e-29 Identity = 68/83 (81.93%), Postives = 70/83 (84.34%), Query Frame = 1
BLAST of Spo17822.1 vs. UniProtKB/TrEMBL
Match: A0A0J8BXX6_BETVU (Midasin OS=Beta vulgaris subsp. vulgaris GN=BVRB_7g170240 PE=3 SV=1) HSP 1 Score: 105.5 bits (262), Expect = 6.100e-20 Identity = 56/77 (72.73%), Postives = 59/77 (76.62%), Query Frame = 1
BLAST of Spo17822.1 vs. UniProtKB/TrEMBL
Match: A0A0J8BTH2_BETVU (Midasin OS=Beta vulgaris subsp. vulgaris GN=BVRB_7g170240 PE=3 SV=1) HSP 1 Score: 105.5 bits (262), Expect = 6.100e-20 Identity = 56/77 (72.73%), Postives = 59/77 (76.62%), Query Frame = 1
BLAST of Spo17822.1 vs. UniProtKB/TrEMBL
Match: R0I690_9BRAS (Midasin OS=Capsella rubella GN=CARUB_v10019643mg PE=3 SV=1) HSP 1 Score: 71.6 bits (174), Expect = 9.700e-10 Identity = 32/73 (43.84%), Postives = 50/73 (68.49%), Query Frame = 1
BLAST of Spo17822.1 vs. TAIR (Arabidopsis)
Match: AT1G67120.1 (ATPases;nucleotide binding;ATP binding;nucleoside-triphosphatases;transcription factor binding) HSP 1 Score: 66.6 bits (161), Expect = 1.600e-11 Identity = 29/62 (46.77%), Postives = 45/62 (72.58%), Query Frame = 1
The following BLAST results are available for this feature:
BLAST of Spo17822.1 vs. NCBI nr
Analysis Date: 2018-06-29 (blastp Spinacia oleracea peptides vs. NCBI nr) Total hits: 5
BLAST of Spo17822.1 vs. UniProtKB/TrEMBL
Analysis Date: 2018-06-29 (blastp Spinacia oleracea peptides vs. UniprotKB/TrEMBL) Total hits: 5
BLAST of Spo17822.1 vs. ExPASy Swiss-Prot
Analysis Date: 2018-06-29 (blastp Spinacia oleracea peptides vs. ExPASy SwissProt) Total hits: 0
BLAST of Spo17822.1 vs. TAIR (Arabidopsis)
Analysis Date: 2018-06-29 (blastp Spinacia oleracea peptides vs. TAIR) Total hits: 1
GO Annotation
GO Assignments
This gene is annotated with the following GO terms.
RNA-Seq Expression
Co-expression
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