Spo18219 (gene)

Overview
NameSpo18219
Typegene
OrganismSpinacia oleracea (Spinach)
DescriptionUnknown protein
Locationchr4 : 121730397 .. 121737534 (-)
Sequences
The following sequences are available for this feature:

Gene sequence (with intron)

Legend: polypeptideCDSexon
Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.
ATGGTATTTTCCAGAATTGGGCCCACTAATTCGGCATCCGGGAGAAGGAGGCTGTGGACATGGGTTCGGGCAGGGTTACACTATATGCCAACCCAGTTACAAGCCGAATCAGACGAGTTCCAATCAACCCGTGACGTGTGGGGGACCTGTGAGATGAATGATTGGAGAGCTTGTTTGTCTTGAGTCGGCTCAGAAGTGGATCATTGACTTAGTATCAACACTGCCAGTACGGACACTAACACTAGCGCGACCACCCTCATTTTGGGTGGTTTTATAGAGAGGGAATACTTTATTTGAAAACAAACATAGAGTATAACTAATCAAATTAAATGGGTGGGTTCCTGGGTTTCTTTTGAGGAAGAAGAAAACCCATTTAGTAGTCCAGATTGGAGGAGGGGAGGTGGGGATTTGGGTGGCGTTCCGATTCAGGTTCAAATTTGGTTCCGATTTTCGTGATTCGGGTTCAGCAAGGAACAAAGTTGGGCTTGCGTTTATGGCGTTCAATGATGATGTCTTCAGGGGTGGAGAAAGAGAAGAGGTGGACGGAGATGGAACAAGGTGGTGGGGCACGGTGGTGATATGGGTGGTAGGAGAAAGACCCATGGGAAGGAGAAATAAAGAAAAGAATAAGGAAAAAAAAGAAAATAAATAAATTAAATTAGCGTTAAAGTTAACAGAAAAGTTAACGGAATGGACGGAAAATGCTCATTAAGGGCATTTTGTGTATTTTTACAAAATCTTGGGGTATTTGGTGCGTTCTGGAAAGTTTAGGGGTATTTGGTGCATTTAGTTAACCTCAGAGGCATTTGAGGGCAGAGAGGCCAATATCTGATATGTATTTCAAGATACATATCACACCACTAAACGACAAAATAGGGATAAGACAAACATTAAAACATATGCCATTTTTAAAAAACAGATGCCATTTTGGAAAAATGGATGCCATTTTTCAAAACCGGGTGCCATTTTAAAAAAAAATTGATTTTGTTCTTTAGCGTTTGTCTTTAGCCTATTTTATCGTTTAGTTGGGTGATATGTATCTTGAAATACATATCAGATATTGATTTATACTTCCTCGAGACATTTTATGAAAAACCGATTTGAGATTTGAAAATTTTCACCATTTAAACACTTGAATTACTCAATTGCATAATTCCAAATAAAATTCAAGTTACCAAATACATACACGGATACACCATACATAAAATCAAATTTTATACACAATGTGAGTTGAATGAGTCATGTCTCGTTTAAATTAAAGGAAAGGTTGAGACTGATAAGATAAAAAATGAGATACTCCTTGATATAATTTCATTTTAAAGAAGTTGGAAAATAATTATTCAGGCAGGTTCGCACGTGATTATAGATTAATGTCAGTATGTCACAATAATCGATGTTTAACAAAACTTATGATCAATTTTGTGAACTCAAAGTTGTTTTACCCACCAACTAGAAAAATTCTTAAATATTTTGGCGTGGTCATTCCTTAATTTTTGGATCACAAATTTTCTCAAATCCACATTTAATATCCATACCCATATCCATTTAGATCGAACTTGGGTAACCCACAAAAAAATTGAATCGCACCTCCCCACTTTCACTGACTACACCCCCTCTTCTCTTTCTCTCTCCTCCTCCTGTTGCTCCGCCGTCTACTCAGCCTTCTCCGTCGACCGTCTTCAACAATTTCGCTGGCCTCCATTGCTCCCGCTGTCAATAATTCCGTTGAGATCCTTCCGCTGGCGGAGGTTTGCCCTCTCTCCAATCTTCGTTTCTCCCTAATTCTTAATTAAAGGTTTTCTAGGTTTTATAAATCTGAATGATGACAGTTTTTAGGTTAATTAATAGCAATTTTTAGGGTTTGAATTGTATGGAATTATTCAATTAGTGTAATTTTGGTGGGGGTATGTAGGGGTTTGGAGGTCGAGGATGAGTAATTTTGATGTAGAACATTTGATTGATGAGCTTTTCTGAAAAAAAAGTGCAGTCATTTGGAATTAGTATTAGATTCCCTATGAATTCAGCCTGAAGTTACTAGATGAATCAATAAATCCCTCTCCCAACAACTGATAGAAATTCATCCGCAAGAAAAGAATAAGACTTTCTCATTGGTTCCACATGAGAAACCTGTACAAATATAACCTACATGTCTGATATCTGTGAACCAAGGAGTTTCTTCATCATTTTTCTCGTTGTCGAGGTAAAAAGTTCCTCAAGCCTTCTGTTTTGTTGGGGTATGGGCAGAGCTGGGATGGGAAGTATTTCGGGATGGAGAGGCTAATGTTAAGATTTAAATGTTGTGAGGAGGAGAGAGATTTTCTTGCATAGACAACCTCTCGAGTCTAAGCTAGTTATTGTAACCTTGTAGGCTCTATACGTCTTGATGTACCCTGCTAGTGGCTCTTCTTTATATTTACATACTCTTGTTCTTTGGATAAAGGCTTTGTTGTAGATTATCTAGTTAACTACTTTGGTTAGTGCATACCTTCTTTGGTAAAGATGACATAAAAAGGCTCTCAATTGTACTTAATGGTGGTAAATATTGACGTTAATCTAAATGCTTCTTTCATAAAGGTGTGTGTTGATCTATACCCTCCTTGAGAAACACTCCTTATTTTGAATATGGTTGTGCCGTTCGGATAGCTTATCCTTGTGTTGGTAACTTGGTATGGTTGCATGCTTGTTTTAACTAGAAAACAGTGCGTGGCACGGGTGATGCCCCGGTTTTTATTTAGAATAATTAAAGTTCAAGATTTTACTTCAGCTCAATATTTGACCAAAATACACGTAGTCCATAAAAGTGAATTTTTTTATTAAATTCATCGACTACACCTTTACACTACGTCATTTTTTATGCCAAGTAATTTTTTAATTAGATCATCTTACAATTATTTTAACTTATTTTCTAATGGAACTACGTGCTTCATATTAATAAACACCAAATTAGATTATGAAGGGTATTTCTATCGGTCATGCTCATGAGATTTATGATATCATGTTTAATTCATGGTTTCCTTAGTGCTTTAATTGTTATTTTTATCCCAATATGGTCCATATGAAATAAAATGTAACATAAAGATTTAGTTGTTTTAGACTTCATGTTAACATGTATTTATAAATTAATGTGCATGGATAAACAACAATTAGTGGTTGGTTAAGATGGTAATGAGAGTTATTCTCCAAACTTGAGGTCTTGTGTTCGAATCTTATTGTATTGATTTTTGGTTATCAATAACATCACATAACCTTGGTGAGTGGATGACGTGGTTTAACACGAGAGTTCTACGTGGCACATAAACTTTCTCCGCAACGCCTTATAAATTATAATATATTAGTATAGATAGGATAATTGGTATCTTTCTAAATGTCCGTTGGAGTGAGGCAGGTACTCAGGTAGCAAGAGTTTTAGACATGCGTTTTGACTTTTGAGATGTACAATTGTAAACATGTCCTTCAGCCTTCACATTATTTCATCAAGGAGTGTGTGGTTTATGGTTGGTTTTATCATTTGCAATTTACCTTATTTTTTCACTCCTGACCATTCTTCATGTCATCTTGTCTGGAAGGTGAATCGTATGTTCTTATGTAGAGGTACAAGGTTAATTCCATCAATTATTTTAAGTATTAATTTCTAGAATACCAGTTAAACTGTGACGTAAACATTTTCGCATCTCCGTTACAGGGGTTTTCCTTTCGCTGCAGAAAATGAGTTTGACGATGTTAGATGTTTCACATGATGGTTATCAATGGTGTCTGAGATTACATTCTTGTTTGACTATGTTGGTGAATTAATGACTTGTTTTATTTGATTTCTTCTATTTTTTGCCTTGATGAGTGTGATGATAATTATTTTGTACAAAATATGGGGCTAGTATGAAAATAGTTTCTTTGCAGTTGTCGGGTAAGTCTGAAAAAGGCTCTCTGTAGTTCTTTGAGTAAGGAATTCTACATCTGACCTCGCCCCTAGGCGTGAGCCTTGGCATATTGATATGATGTTAGTTTATATAGGCACCTAGTTTTGAAGCCCGGTCGTTGCCCGGGTTGTACAATAATATTTTATGCATTGGAAACATGAGAAATATAACCCAGCTATTGAGCCTATGTTTTTTCTTCCTCGATATTCTATCATCTTAGGATAAATACGCTATCTTCAATAAAAGGGGCTCAAGGTCCTATCCCAATAAACTCTCCAACCTGTCTAAAGCCCAAATTGAAAACGTGAAGGAAATTAGGGAATAATTATCTTATAGTTTTTCTGAGGCATTAAACCTTTGTTCTTTTTTTAATATTATTCAAAGGAGAATTACACTTACATCCTGCAAACAGAAAGGCAGAGGGATTAAACCTTTGTTCTTTTTTAATATTATTCAAAGGAGAATTACACTTACATCCTGCAAACAGAAAGGCAGAGGGATTAAACATGTGACCTTAGTAAAGAATTTTGTTTTACCACTATGTCTAGAAAAGATAGATATGAAGTGTTGGCGATTCATCATTCTTTACAGATTCAGCTTCTCTGTTAGACTGTTAGTTCTTCTGTTGTAGGAATAACAATGTAGGGAGTATTATTGAAGTTTGTTGACATTTATATAAGTAGTTTTGATGAATTTTAAGTCATTTTCTTTTTGTGTAATCTGGCTTTGCATAGTCAATTAAAGTGATTAATAATGCAATGTGAGATTGTTTTGGTCGATTTATAGCTCTATAGGTCCTTGTTTTTCTATATTAGTAATTCTTGTACATTACCTATGACTACTGTCTCTAAGCTAAAATCACAACTCCCTTGCAGAATGACTCGTTATAGTCGCATAGTCACGTAAACAAAACTTGTATAAGATCCTACACTTTATACTTCATACATTGGAGAAACCTTTAATCTGGTGTTTGGGAAATCTTTTGTTCACACCAATGTCAGTCAGTTACAAAGTCTGAAGTAACTAATCTTGTTTCGGAGGGTGGAACTGCAAAAGGGTGTAGAATGTCTAATTTTCTTACGACAA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mRNA sequence

ATGGTATTTTCCAGAATTGGGCCCACTAATTCGGCATCCGGGAGAAGGAGGCTGTGGACATGGGTTCGGGCAGGGTTACACTATATGCCAACCCAGTTACAAGCCGAATCAGACGAGTTCCAATCAACCCGTGACGTGTGGGGGACCTATCGAACTTGGGTAACCCACAAAAAAATTGAATCGCACCTCCCCACTTTCACTGACTACACCCCCTCTTCTCTTTCTCTCTCCTCCTCCTGTTGCTCCGCCGTCTACTCAGCCTTCTCCGTCGACCGTCTTCAACAATTTCGCTGGCCTCCATTGCTCCCGCTGTCAATAATTCCGTTGAGATCCTTCCGCTGGCGGAGATATTAG

Coding sequence (CDS)

ATGGTATTTTCCAGAATTGGGCCCACTAATTCGGCATCCGGGAGAAGGAGGCTGTGGACATGGGTTCGGGCAGGGTTACACTATATGCCAACCCAGTTACAAGCCGAATCAGACGAGTTCCAATCAACCCGTGACGTGTGGGGGACCTATCGAACTTGGGTAACCCACAAAAAAATTGAATCGCACCTCCCCACTTTCACTGACTACACCCCCTCTTCTCTTTCTCTCTCCTCCTCCTGTTGCTCCGCCGTCTACTCAGCCTTCTCCGTCGACCGTCTTCAACAATTTCGCTGGCCTCCATTGCTCCCGCTGTCAATAATTCCGTTGAGATCCTTCCGCTGGCGGAGATATTAG

Protein sequence

MVFSRIGPTNSASGRRRLWTWVRAGLHYMPTQLQAESDEFQSTRDVWGTYRTWVTHKKIESHLPTFTDYTPSSLSLSSSCCSAVYSAFSVDRLQQFRWPPLLPLSIIPLRSFRWRRY
Relationships

The following mRNA feature(s) are a part of this gene:

Feature NameUnique NameType
Spo18219.1Spo18219.1mRNA


Homology
The following BLAST results are available for this feature:
BLAST of Spo18219.1 vs. NCBI nr
Analysis Date: 2018-06-29 (blastp Spinacia oleracea peptides vs. NCBI nr)
Total hits: 0
Match NameE-valueIdentityDescription
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BLAST of Spo18219.1 vs. UniProtKB/TrEMBL
Analysis Date: 2018-06-29 (blastp Spinacia oleracea peptides vs. UniprotKB/TrEMBL)
Total hits: 0
Match NameE-valueIdentityDescription
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BLAST of Spo18219.1 vs. ExPASy Swiss-Prot
Analysis Date: 2018-06-29 (blastp Spinacia oleracea peptides vs. ExPASy SwissProt)
Total hits: 0
Match NameE-valueIdentityDescription
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BLAST of Spo18219.1 vs. TAIR (Arabidopsis)
Analysis Date: 2018-06-29 (blastp Spinacia oleracea peptides vs. TAIR)
Total hits: 0
Match NameE-valueIdentityDescription
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GO Annotation
GO Assignments
This gene is annotated with the following GO terms.
Category Term Accession Term Name
biological_process GO:0007033 vacuole organization
cellular_component GO:0005576 extracellular region
cellular_component GO:0016021 integral component of membrane
cellular_component GO:0005886 plasma membrane
cellular_component GO:0009506 plasmodesma
RNA-Seq Expression
   



Co-expression
Gener valueExpression
Spo046470.70Barchart | Table
Spo064730.66Barchart | Table
Spo147770.66Barchart | Table
Spo270640.65Barchart | Table