Overview
Sequences
The following sequences are available for this feature:
Legend: exonfive_prime_UTRpolypeptideCDSthree_prime_UTR Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.TCAGAACTATTTAATTTTATTTTCCTCGTATATTCATTCTCCTCTCCTCCCAGTTGGTTGTTTTTATAAACAATTTGCTTGCCTTTTCATTCTTCATCATCACCACCTCCATATTCACAGACAAAATTGGCAATTATACCAAAATAACTAACATCTCAACCCCCTATTTATAGATGTTGATGATGAAATCAAAATCCCCAATTCTTCCCATAACCAATAATAATCACCCACCATCGTCATTTCTAAATTCCCCCACAATGTTCATTCAAAGATCTAATTACGAATTACCCACTTCCCATCTCCTTATTTCTCCAATCGATGATGATTATAATTGCAATTCAATTGAGAAAAAACCCCTTCTTTCAAGGGCTTTTAGCTTCGGTGGAGAACCACCCATTACAACCACCCAACAGCAGCGCCGCCGCCGCAGCGTAAGCGATGAAAATCTGCTTTCTAGCTCCAATAGCGAGGAGGGTGAGGGTGGGTCTATTGGTAATAGCGTTGAGCATGTCGCTGCTGAGACACTTTTGATCACTCGTTTTACTTTTAATCTTCTAGGTTATTTGGGGTAATTTCCTTAAATTTTCTATTCTTTTTTTTTTTTTTTTGCTTTTGAATTTTTGGGTAATGTTGATTTTAGTTGATAGTGCTATGTGTTTCTTCTTATTGTTGTTATCACAAGTGCATTTGATCTATTCAAAATTTTGCTAGAATTTTGGAAGATTGTAGAGTTTGGCCTTCATTAATCAAAATTTTACTAGATTCTGGATGATTTATTAGTTGAGTGTACTTGAGATGTATGTGATGACACTTCAATTTATGCCAAAAAGGATTTTTTTTTTTTTGGGGGGGGGGGGGTGTTGCAGGAGGAGAGTTCCCAACTGCTGATCAATAGAAGATAGGAAATAGAAGATGAATTTAGAGAAAGAGAAGAGAGAATCAGATATAGAACTAGAGAGAGAAGCAAGAGTTTTCTTATTTCTTTGAATGAATATTACAATCTGATATCCAGCTTATTTATACAACAACTAAACTAAACTAACTTTGCTAACAACCTATATAACCACTTTAGACTAACTGACTACAGAAGGATCTTAGTTAAGCTCCCCTAACATTCCTCCCTCCTTATGAAAGACTTTTCCTCAAGTCTGCATCAGGATGAAAGTTTACATGTCTTACCAAGCAAGCATTTCTGGTACACATTTGCAGTGATAACAAGCAAACATTTATGTAGCCTAAACTGAACCAAAGAGGTACACAAAACCACTGCTAATTACCACAAATAATATGTATAGTCTCCAAAGACAAGGCAACACAAGGCCAACAAACCCAAAAGATGAAACTGATAAGGTAGCCACCTCTGTATTTGCTTCACTGCAGTGCTGGGAACATCAATCATGACACATGTTTATAAAATCAACCCAACTGACATTTAAACTAGCAAGCTACCGTATTTATTCTGTGATTGTTGTTGCTGTCAGTTTCAAAACTTCTGTCCTATTCACTATTGAAGAAGATGTAGAGGAGGTGGCCAAGGAAGAGGCCTCATGTTGACTAGTACTTCAACTAATTCCAAAGAGATCATGTACTCAAAACACCTTCCATGAAGAGATAACACAGCAGCATCCTCAAAGAGTATGATAAACTGATCCTTAAACATCAATCTTGTAAGAGATGAAAGTTCCTCATGATTACACTTATGACCTAAATCACCTTGTTGACCACCATAGTAATGCAACCCTATTTCAGTTTGAAGACAAAATGAAACATCAACCACTTTTCCAAGACAACTTGGTTCACGTTTGGCCAAGATTACTTGTTGATTAACATGTGATGGTGTAGGTTGAAAGAATTGCTTAGGATTAGTGAGCATAGCATCAACTTTTACTAATTCCGGAGAAGGAATTGACACAGAGGATTGAGTACTCAGCATTGAACGACAATTCTTGGCTACTGTAGAACTTACTTCTTCTTGAACGACAGTTCTGCTTGACATTTTGTCGAACACCTTTGGTGCCTCCTTATTATTGAACTCCAATGCAATCACATAATCACCTTCTTCATCATATACTACAACAAATTCCCAATTATCACCACTATGGCTGCATTCATGTACTGGAAGTAATGGTTCATCACACCATTCACAAAATCCTTTATTCCAACTATCAAAACATTCACTCTTCAAAAGCTTCTTGAATGATTTTATTACCTTTTTCTGTTGAGCAGCTTCAAGTTGTGGAAGGATTGGTTCTTCTTGTTGAAGATTGTTGTAAAAATCGTCAAGCCCCATTTTGCAATGTGTTAGAACAAACTCCTTCAAGATTCTGGTTCAATTCTAATTGGAAAACGTCAGAATTCTGCAAGAATTATGCAGTTTCAAGAATTCTGGTTGGAAAAATATCAGAATTTTCTCCAAGATTTCTGGAGATTCAAGAAGTGAAGCTCAAAAATGGCGGAAGAATGGGTCGGCTCTGATACCAATGTTGCAGGAGGAGAGTTCCTCAACTGCTGATCAATAGAAGATAGGAAATAGAAGATGAATTTAGAGAAAGAGAAGAGAGAATCAGATATAGAACTAGAGAGAGAAGCAAGAGTTTTCTTATTTCTTTGAATGAATATTACAATCTGATATCCAGCTTATTTATACAACAACTAAACTAAACTAACTTTGCTAACAACCTATATAACCACTTTAGACTAACTGACTACAGAAGGATCTTAGCTAAGCTCCCCTAACAGGGGGGGTGGGCGGGAGGGGAAATGGCCTTCTTATAGTGTACACATCTTTTTGTATAAGTTGCTTGTACTCGAGTCCAAGTAACACACAGTATGGTATTAGGTGAACAATTAGCGTGTGGAAATATTTGGTCTTTGGAGGGGTGTCTTTAAGCAGCAATAAATAGGAAGCAAAGTGGATTTTTTTAAATACCATTTGGTGTTGTCGAGAGTTCGATTCACACTTTGTCAGGCAGCCTGGAGGATGGCAATCGAAGAAGTTCTTAATATGGATTTATTGGATTCCAAACTAAGGTGAACAGTTAGCGATTCAGTTTCTTGAGCTTTGTTGAATTGCCTTGTCTTCTTTGGAATAGAACTTGTGCCCTAGTCCAATTTTACTTATTTTTCTAGTTTTTTGTGATGTATTTACTAGTAAAATTGTTTCTATATATAGAGGTAGTAAAATAATATAATTGATCTCGTGCGCGAGATATTTTAGTTCTAAATTTTTCTTATTTCTTTCTGTATCTTTGTCATTGTAGACCTTAACTTTGGCCACAATAATTTCCAAAAAAGTTACTGTATAATGGTGAAGTACAGGCCTTATGTATGAGAAACTCATACTCCTGTATATTGTGTGTATTAAGTTTGGTTTGGCAAATTGGGGTTTGGAAAACATAATTCTGTTGATGATAGGTATCAAATATACGAAGTTTTTTGTTTTGCTTTACGTGTTAAAAGCAAGGGCATTGTTTGTAAGAGCATGTTTGTCAAACACCAATTTTTGGTGTTTAAGAGAGAGAACTGAATAAAAAATAATAAAATAGGTAGAGAGATGAGAGAGAAAGGAAGAGAGAGCGAAACCATTTAAGAATTGGTATTCATGAACACCAAATGGAAAACCAATCTCATGCATGAAAGACTTGACATGTGGTGTATGGGGGACCAAAGAATATTTTTTATTTTTTTAAATTGCAAAGTGACATTTTATAGATGGTGTTTTAATTGCAAAGTAACATTTTAGAGATGGTGTTTGATAAATGTTGTTAAATATTGTTGGTGTTGGGTTTGGTGTTTGGGAGAGAGAAAATATAAAATATTACTCCCACCGTCTCTTTTTGTCCTTTACGTTTGACATTTTACACGCGTTTTAACGACTAATTAACGTGCATTGAGATTCCTCTATTTTTTTTTATTTAATCAAGGCAAATTACGTTTATTTTTAATGTTTTCACTTTTATCAAAATTCTGATATTGGGAAAATGAGAAAAACTTAATGTGCTAATGAAAAAGTGTGAGAGATTAAATGATCTATGGAATTTAATTGGTTAAAATAATCATTGGACAATTTTTTTTATAAAATATTAAAGCATTTATGTGATAATATAAAGGAAATGTAAAGAACATTTTAAGACACCCAAAAAGGAAAACGTAAAGAACAAAAAGAGAAGGACGGAGTATATTTTATTGGATTGAAGTCCAAACTCTTGGTGTTTGATAAACATGCTCTATGAAATTTCTGGTAAAATTGCCTTTGGTGAGTGAAATTTATGTATTGGCATAACGCATTAGAATAACCAGGTGGCCTGACCCACCCGCTTTTTGTTGTCATTGCTTCAGCAGTGGTTGATTTAAATATTAACTAGATCTGTTCAGTGAGCAACTAAGGTGGTATCTAGGTAGGCGTTATAACTTAATTTTATTAGTGATTAATGATCAACTTTGCTATGTTGATCATAGATTTATTCTATTCGAAAAGAGAGGCCATCTATGACACAACTGGGAGTAATCTTAGAATGCGACATACAAGTAGCTAGCTTAAGTGTTTAGTCCATAAAATTTGCGCAAAGATTAGGGAAGTTATTTGTTAGAAGCCATGTGCTTAAATACTAGGTTTGCCTTCTGTGCTGAATGCAAATATTTCTTTCAGATAGGGAATAGAGAGTATGACAACTTTATGCTTTGAAAATGTTTGTTTGGTGTGATCAATGAAGGAAACTTTCATGAATCAATAGTTTCACTTGTGTGATGAGCCAGATTGCCCTAGTACACATGAATTTCTTCATACCTTTCTAAGGATGTCCCATTTCAGATAAAAAAGAATGTATGATCTAATTTTTTCCTTGGTAAGTTTTAGTGTGTGCATGCTTTTCATGAAACAATCTCCATTGTCCTTTTTAGGACCACATTTTTTCTAAATAATTTATTTTATAATTTTACGAACTAATGGCTTTTGAAGCAGTGAAATACATATTGGACAGAATTAAAATATAAAA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ATGTTGATGATGAAATCAAAATCCCCAATTCTTCCCATAACCAATAATAATCACCCACCATCGTCATTTCTAAATTCCCCCACAATGTTCATTCAAAGATCTAATTACGAATTACCCACTTCCCATCTCCTTATTTCTCCAATCGATGATGATTATAATTGCAATTCAATTGAGAAAAAACCCCTTCTTTCAAGGGCTTTTAGCTTCGGTGGAGAACCACCCATTACAACCACCCAACAGCAGCGCCGCCGCCGCAGCGTAAGCGATGAAAATCTGCTTTCTAGCTCCAATAGCGAGGAGGGTGAGGGTGGGTCTATTGGTAATAGCGTTGAGCATGTCGCTGCTGAGACACTTTTGATCACTCGTTTTACTTTTAATCTTCTAGGTTATTTGGGGGTAGGCTACAGATGGATCATAAGATTCTTCGCTCTTGGTTGTTATGCCTTTTTTTTGATGCCTGGTTTTGTTCAAGTTGGATATAATTACTTCTTTTCAAGTCGTATCCATAGGGGTATAGTCTACGGGGATCAGCCTAGAAACAGGCTTGATCTATACTTGCCCAAGAATAACAATGGACCAAAGCCAGTTGTTGCATTTGTAACTGGGGGAGCTTGGATAATTGGTTACAAGGCATGGGGTTCTCTTCTTGGGCAACAATTATCCGATAGAGATATCATAGTTGCATGCATAGATTATAGAAATTTTCCTCAGGGTACAATGAAAGATATGATAGAAGATGCCTCCCGCGGAATTTCATTTATCTCCAAAAATATTGAAGAATATGGAGGTGATCCTAACAGATTATATTTGATGGGGCAGTCAGCTGGCGCACATATTTCTGCTTGTACTCTTGTTGAACAAGCTATCAAAGAGGCAGGTGGCGAGGGAGAGAGTGTTTCTTGGAGTGTCTCACAGATAAAAGCTTATTTTGGATTATCAGGAGGGTATAATTTGCTAAACCTAGTTGATCATTTCCACAGTAGGGGCTTATACCGTTCCATATTTTTGAGTATTATGGGTGGGGAGCATTCGTTGCGGCATTACTCGCCTGAAATCGTGGTGCAGGATCCAAACTTTAGAAGTGCACTTTCACTATTACCTCCAACGACCCTTTTCCACGGTACTGGGGATTATTCCATTCCATCAGATGCTAGCCTAAAATTTGCTGAAACACTGCAAGGACTTGGAGTAGAGGCGCATGCCATACTATATGAAGGGAAGACTCATACTGATGTTTTTCTCCAGGATCCAATGAGGGGTGGCAATGATCCGATGTTTGAAGATTTAGTTGCTATAATTCACGCCAAAGACGAGGAAGCACTTGCCAATGATGCAATGGCACCTCTGAGGAAACGTCTGGTGCCAGAAATCATGTTGAAATTGGCTCGTGCTGTTAGTCCCTTCTAA 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The following mRNA feature(s) are a part of this gene:
Homology
BLAST of Spo18605.1 vs. NCBI nr
Match: gi|902166349|gb|KNA07213.1| (hypothetical protein SOVF_173930 [Spinacia oleracea]) HSP 1 Score: 889.4 bits (2297), Expect = 2.700e-255 Identity = 440/440 (100.00%), Postives = 440/440 (100.00%), Query Frame = 1
BLAST of Spo18605.1 vs. NCBI nr
Match: gi|731340410|ref|XP_010681382.1| (PREDICTED: probable isoprenylcysteine alpha-carbonyl methylesterase ICMEL1 isoform X1 [Beta vulgaris subsp. vulgaris]) HSP 1 Score: 770.0 bits (1987), Expect = 2.400e-219 Identity = 392/472 (83.05%), Postives = 419/472 (88.77%), Query Frame = 1
BLAST of Spo18605.1 vs. NCBI nr
Match: gi|922336437|ref|XP_013446208.1| (isoprenylcysteine alpha-carbonyl methylesterase ICME protein [Medicago truncatula]) HSP 1 Score: 629.8 bits (1623), Expect = 3.800e-177 Identity = 323/472 (68.43%), Postives = 369/472 (78.18%), Query Frame = 1
BLAST of Spo18605.1 vs. NCBI nr
Match: gi|645276131|ref|XP_008243142.1| (PREDICTED: probable isoprenylcysteine alpha-carbonyl methylesterase ICMEL1 [Prunus mume]) HSP 1 Score: 624.0 bits (1608), Expect = 2.100e-175 Identity = 327/470 (69.57%), Postives = 371/470 (78.94%), Query Frame = 1
BLAST of Spo18605.1 vs. NCBI nr
Match: gi|658009045|ref|XP_008339723.1| (PREDICTED: probable isoprenylcysteine alpha-carbonyl methylesterase ICMEL1 [Malus domestica]) HSP 1 Score: 620.9 bits (1600), Expect = 1.800e-174 Identity = 318/460 (69.13%), Postives = 364/460 (79.13%), Query Frame = 1
BLAST of Spo18605.1 vs. UniProtKB/TrEMBL
Match: A0A0K9QKJ3_SPIOL (Uncharacterized protein OS=Spinacia oleracea GN=SOVF_173930 PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 889.4 bits (2297), Expect = 1.900e-255 Identity = 440/440 (100.00%), Postives = 440/440 (100.00%), Query Frame = 1
BLAST of Spo18605.1 vs. UniProtKB/TrEMBL
Match: A0A0J8C835_BETVU (Uncharacterized protein OS=Beta vulgaris subsp. vulgaris GN=BVRB_6g141000 PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 770.0 bits (1987), Expect = 1.700e-219 Identity = 392/472 (83.05%), Postives = 419/472 (88.77%), Query Frame = 1
BLAST of Spo18605.1 vs. UniProtKB/TrEMBL
Match: A0A072U334_MEDTR (Isoprenylcysteine alpha-carbonyl methylesterase ICME protein OS=Medicago truncatula GN=MTR_8g070000 PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 629.8 bits (1623), Expect = 2.700e-177 Identity = 323/472 (68.43%), Postives = 369/472 (78.18%), Query Frame = 1
BLAST of Spo18605.1 vs. UniProtKB/TrEMBL
Match: M5XYA6_PRUPE (Uncharacterized protein OS=Prunus persica GN=PRUPE_ppa005357mg PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 619.8 bits (1597), Expect = 2.800e-174 Identity = 325/470 (69.15%), Postives = 370/470 (78.72%), Query Frame = 1
BLAST of Spo18605.1 vs. UniProtKB/TrEMBL
Match: D7T9D3_VITVI (Putative uncharacterized protein OS=Vitis vinifera GN=VIT_01s0011g02530 PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 617.5 bits (1591), Expect = 1.400e-173 Identity = 322/469 (68.66%), Postives = 363/469 (77.40%), Query Frame = 1
BLAST of Spo18605.1 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: ICML1_ARATH (Probable isoprenylcysteine alpha-carbonyl methylesterase ICMEL1 OS=Arabidopsis thaliana GN=ICMEL1 PE=2 SV=1) HSP 1 Score: 581.6 bits (1498), Expect = 7.500e-165 Identity = 310/481 (64.45%), Postives = 358/481 (74.43%), Query Frame = 1
BLAST of Spo18605.1 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: ICME_ARATH (Isoprenylcysteine alpha-carbonyl methylesterase ICME OS=Arabidopsis thaliana GN=ICME PE=2 SV=1) HSP 1 Score: 526.2 bits (1354), Expect = 3.700e-148 Identity = 251/385 (65.19%), Postives = 301/385 (78.18%), Query Frame = 1
BLAST of Spo18605.1 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: ICML2_ARATH (Probable isoprenylcysteine alpha-carbonyl methylesterase ICMEL2 OS=Arabidopsis thaliana GN=ICMEL2 PE=2 SV=1) HSP 1 Score: 523.9 bits (1348), Expect = 1.900e-147 Identity = 257/403 (63.77%), Postives = 311/403 (77.17%), Query Frame = 1
BLAST of Spo18605.1 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: IMCL1_ORYSJ (Probable isoprenylcysteine alpha-carbonyl methylesterase ICMEL1 OS=Oryza sativa subsp. japonica GN=IMCEL1 PE=2 SV=1) HSP 1 Score: 489.6 bits (1259), Expect = 3.900e-137 Identity = 240/386 (62.18%), Postives = 292/386 (75.65%), Query Frame = 1
BLAST of Spo18605.1 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: IMCE_ORYSJ (Probable isoprenylcysteine alpha-carbonyl methylesterase ICME OS=Oryza sativa subsp. japonica GN=IMCE PE=2 SV=1) HSP 1 Score: 477.6 bits (1228), Expect = 1.500e-133 Identity = 243/399 (60.90%), Postives = 295/399 (73.93%), Query Frame = 1
BLAST of Spo18605.1 vs. TAIR (Arabidopsis)
Match: AT1G26120.1 (alpha/beta-Hydrolases superfamily protein) HSP 1 Score: 581.6 bits (1498), Expect = 4.200e-166 Identity = 310/481 (64.45%), Postives = 358/481 (74.43%), Query Frame = 1
BLAST of Spo18605.1 vs. TAIR (Arabidopsis)
Match: AT5G15860.1 (prenylcysteine methylesterase) HSP 1 Score: 526.2 bits (1354), Expect = 2.100e-149 Identity = 251/385 (65.19%), Postives = 301/385 (78.18%), Query Frame = 1
BLAST of Spo18605.1 vs. TAIR (Arabidopsis)
Match: AT3G02410.1 (alpha/beta-Hydrolases superfamily protein) HSP 1 Score: 523.9 bits (1348), Expect = 1.000e-148 Identity = 257/403 (63.77%), Postives = 311/403 (77.17%), Query Frame = 1
The following BLAST results are available for this feature:
BLAST of Spo18605.1 vs. NCBI nr
Analysis Date: 2018-06-29 (blastp Spinacia oleracea peptides vs. NCBI nr) Total hits: 5 Position : 0 Zoom : x 1
BLAST of Spo18605.1 vs. UniProtKB/TrEMBL
Analysis Date: 2018-06-29 (blastp Spinacia oleracea peptides vs. UniprotKB/TrEMBL) Total hits: 5 Position : 0 Zoom : x 1
BLAST of Spo18605.1 vs. ExPASy Swiss-Prot
Analysis Date: 2018-06-29 (blastp Spinacia oleracea peptides vs. ExPASy SwissProt) Total hits: 5 Position : 0 Zoom : x 1
BLAST of Spo18605.1 vs. TAIR (Arabidopsis)
Analysis Date: 2018-06-29 (blastp Spinacia oleracea peptides vs. TAIR) Total hits: 3 Position : 0 Zoom : x 1
InterPro
Analysis Name: InterPro Annotations of S. oleracea
Date Performed: 2018-06-29 Position : 0 Zoom : x 1
GO Annotation
GO Assignments
This gene is annotated with the following GO terms.
RNA-Seq Expression
Co-expression
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