Spo19358 (gene)

Overview
NameSpo19358
Typegene
OrganismSpinacia oleracea (Spinach)
DescriptionUnknown protein
LocationSuper_scaffold_133 : 875995 .. 885741 (-)
Sequences
The following sequences are available for this feature:

Gene sequence (with intron)

Legend: polypeptideCDSexon
Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.
ATGGACGTCCCGTCCAACGTTTTGTTTATTGTCGGTTCGTGTCGTGCTAGAGGACTTCCTTGCTAATCTTAAGATTTTTTGTTAATTGCTTGAAAAATAAACGTGTCGGCACACGGACCAGCCTATTGTGCTCGTGCCAAAATTCTAAAATGATGTTCATGCAATCAAGCACAACCCATGGCCCAGCTCTATGCATCGTGTCGTATTTGGTATACAACAGGCTTGTGTCGTGTCGGACCAATTTTGTACCGGACTCAGGCAACGAGTGCGTTAGCCCGACCAATGTCCAACTCTATGCGTCTGTCTGACTATCTATCACCTTATCAAGAATAAATTCTGGAGCCAGAGCCAAGTAGCACAAAATTGGTCCGATGATCATTTCCTAAGTATGTTTTTAGCTTATCTTTTATCGTAGGTCCGTCCGGCACGATTCTCCGACTTTGGGCGTACCGAATCTCTGCCTTGTAATAGTTTGTATATTTTGGCCATGCCCATGGACTTGCCTTGACTAGCACCAAGTTATAGTTGATCATTATACATGTATACTTAGTTGATCATTATTATACATGTATACTTGGTGAGTTGGTAAGTAACGTGGGTCGAATTACTAGATAAGAGATTTGTCATATCGGTGTAAAAATAGCTATTGCGTTGTATTATTAAAGTAAAAACGACGATAAATACCCCTAATTGTTCACCAAAGTTTGTATATTTTCCATCTTAATCACAAAATTCCTTTCGCAACCATTGTACATAAACAAAATCACAAAATCAATTTATCTACTAACCCAAATTCATCAACACCCCTTTCTTCCATGCCATAGTCAGCATGGTGATGAACATTGAAGTTGGTTAATTAGTACTCCATAATCAAAAACTCCAGAAGCGCAAATAGTAAATGAAAAGTGTATGAGCAAAGATATAGTGAAGTATCTACACTTTTTATAATCCAAAACGTCTTGCGCGTATAAGGTGTACAATAAATTTATTGTACACCAAGATAACTTTTATGCAGTTTTTTGTAACTTTAATCTAGTTTTTTATAACTTTTATATTATTAAAAAAAAAGTTGACGGATAAACATTTTAAAGTGTTAAATGATTAATTTTATACATTATTAGTGATTTTGAAGATTTTTTTTTATTAAAATGAAAAATTGTATCACTAAAATATAGATAACTTTTACATATATAAATGTAACTTTTAAGCATTTTGAGTCAACGTTTACTCTGGTGTACAATATTTATTTTACACCCATTATAAATAAGAATTTGTGAATAAACTTACCTGTGTGTCTGAAAAACAAACTTATTTTTTCTGAACTTATATCATCTGAACTTAAGTTGAATCTGTTGAGTTCAATTTACAGTTAGATCAAGGTTAGGAGTCTAGGACGCCAGGACGGGTTAGCCGGTTAATCCAATGCCCACTTCTAACTCTAAATATGAAGGAGTCAAATCCATTAAAGATAGTTTGAGATAGTTTGGGCTAGCCCATAGCCCCACACAGTGATACACTCATACTAGACAGTAGACAATTAAACACCTACGGAACCTAAGATGGCCATTCACAAACTTTCACCTTCCAAATTTTCACTCTCTCTCTCTCCCCGCCATCGCCACCGGAGTCACCACTTCTCTGCCGTCGCCGCTGGAGTAACCACCTTCTCTGCCGTCGCCGCTGGAGGTTTAACTATCCTATGATAATTCCGTTTCTCTTTCATCATAAGGTTCGAGCCTCAAAGCTCGACTTTCTTCCCCATTTCCACGCTCTCTCCTCCTCTGTTGCAGGATCCCGTACCCATTTTTCCGAGGTAATACAAAACCCTCGTTTTCTTTTAATCCCATTGTTTGGATTTGCAATCGGATTATCCTGTTAGAGGTTCAATCCTTTCGATTGCGTTTGAAATCCCAATTCGGCATTTTTTGAGTTTAGTAAGGTGAATTTGAATTTGATTTTTACTTTTGGGACTTACAGTTTCATTTTGAGGACCATTTTCTTAAATGGGTCTTCATTGTTCTCCCAATTTGTTTATTTGCTGAAAACATTAGATTGAACAATTTCGATCATGTCCACAGAAAATAGTACTCAAACTAATATATACAGTATAAGAATAATGAGAGTAATCCAATATATTTTCCGAAGAATTTACCTTAGATTGAGCAATTTGTTTGGAATTCTTGTTTTGGCTGGATAATTTAAAAAAAACTAACTTCTAATCTTGGCTGTTCCGTCATAGATGATTGAATACTTGGGGTATAGTGTTAGAATTAAGGAGTGGAATGCACTAAGGCTCCGTTTGGTAGGGCGTAAAACGTTTTCATGGAAAATGATTTTCTCCTTTTTAATCATTTTACGTTGTTTGGTTGGGTAAGGGATGGAAAACAATTTTCCATTACTCTCTCAATGATGGAAAACCCTTTTCCATTTGAAAGGGAGGGAAACCACTTTTCCTTCTTTCCTCCTTACCTCCCTCTCCTTTTTTTCCACTCAATCTTCACCATCTTCTCCCATTTTCCTTTAAGTTACCAAACAAAGGAAAACTAATTTGAAATTGTATTTTCCCTTGAAAACTGTTTTCCATGGAAAATTGTTTTACAATGAAAACGTTTTACGCCTTACCAAACGGAGCCTAAATACAACCACATTGCATATAGATCGTTTTATCTTATGTTTGTAATTTTGTATAATTGTATCCAAATTTCGAAGTGCCGATTTACAGTAGTTCTGTGAAAAATTTAACAGTAAATCTGAAACCTAATGTTCCTATGAATCAGTTGATAATCGAAAGCAGCTCTTTCTTGAAAATAACGGTACCAAACACCATCTTTGATGATAATCTTACTATTGTAGGCATAATATAAGTATATGTTTAGTTTGAACTTTGGAAGTAGTAATGTTTATCATTGGTGTAAACAGAACAAGGAGAGAGAGGGAGAAAGGGAATAGGGCATAAAATGGGAATTAGTAGTAAAATAAAGTTGTGTTTAGTACCTTCCTTTAGCCTTAACCTTTGGCGGGATTGTCTTTTTATGTGATTTGGGGTGATCAATCCCGTTTGTATATTATACACCTGTTGGAAAAATAAGATGGAAGCATCATAGAAACTTCCACAATAAGCACTGATAGGGTAAGTGACGATATAAATGATGGAAAGTTGGGAACTGGGGGCTGTGGCTAAACTGACAATTGAAGTTGTTTATTAGATTGTTTACTTGCATCTTAATGGAATGATTTTCAGATTGTATTGTCTGGTGTTCTTCACTCAATGGATATTTTTTTTGGCATAGGTACTTGATGTATGTTTGCTTATGTATCATATAAAGAGGATCTGAACTTTGTAATTTCTTTTCTATACAGTAGCATCATTATTGCTTTTTTTTTTCAACAATTTAACCGGAACTTTACAAAATTTGAAATCCTACTTCTATCATCAGTCCTTGATAGGTTCTTGATCTTGAGAATATTAATGTCTAGCATGATGGTTGGTGGATGTAATTTCCTTATTTTAAGTGTTAGACGGTGACGACAAAAATCATATTAGTTTGTTGCGGAGTCTGAAGAGGCAAGGAGGGTGTTAAAAAACCATTTGAGGATGGATGCATGTTACATCTGTTGTTTTGGTTGATATGGCTTCTTAAAAAGTGTCAAACGCTGGCTTTAACTTGGATTATTAATTCTGGTAACCCGCACCACATACAAATAGTGTAGAACTTTTGAAAGTATTTGATTTTATTGAATAATACTGAACGCATCCATATACATACAAAGGTCTAACAACTAAAACCAACTAAGAGAATAAAAACAATTATAGAAAGACAATAGAGAAAATTTTGTTTGTGTAAGGAGGTTTGGTAACACAATTTTTTTTATTTTTTATAATTCATTAAACAGGCTAAGAGTATTAGGATTTTTGAAAAGAAACTGTGAAAATCATTTCAGTAATCATCTTACTACTGGAGTGGTCGGTAATAACACAAAAATTGGGATTATTTTCATTCTCATAATATATTATTTAATTCAGTATTAGAATATTATTTTAGATTCTTGCTATAATAAATTCCTAATGCGGTTGATTTTTATTCGTAGTTTATGTAATTTTTTCCTAATGTAGATTACTTTTATTCTTCTTTTATTATTTCCATGTAAGTATCGGTATCAAATATTGTAAATTAAAAACAACTCAGGAGTCATGACCAGGACATGATACATGTTGTTTATGGTACTTAAGTATATAGTAATTGATACTGAAGACAAAATACATCCTTATATATATACAAAGGTCTAACAACTAAAACCAACTAAAGAGAATATAGCATTATAGCTAACAAACCTTAGGACTAAGCAAAGCGTAAGTAATCGAAGCAAAGACTAAGTAACAAACTAAATGCAATGATTGATGAAATCTAACAAACTAACTAGTTTGACTTGGTACATTCCACAAATAGGCCCTATATGGATACGTTGCTACTTGTGTACAGAGTAGTTAACTTGTTCTCTTTGACAAAGGTTTGGCATTGTGGGACTAGTTTGGTTAAACGTATTTGTCTTTTTGGAGAATTTCGTACTCTATTCTAGAGCTGTTGAGCGGTTTGGGGCCTGTTAAGAGCCTGGAGTGGCCTGTTAATAATTTATCTCTCTTCTCCATGGTGAATTCTCTCTCCTCTCTGACTCTTTCTAACCTTGCAACTTCGATGAACCTAAATTCAAATAATTCATTGCTTTCGACTTCGACCCTTCGTTTTATTTCACCATTGATTTTTGATGTTGCTTTGATCAATTTCTTTCTCTTTCATCAATTTCTGTTTTCTGGTAATTTACTTCCTCTCTTTTATATTGAGCAGTTTTGGTTAGTTTTCATCATCAGTTTGAAATGAAATCAAAGGCAATTTGAAAAAACTTGTAAAATTTAAACTTAGATGTAGTCTTGTTTCTGATGAGAAATCGAAGAAAACCCGACTTACAAAAATGGAAAATATAGGTGGGAATTTGAGGATTAA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mRNA sequence

ATGGACGTCCCGTCCAACGTTTTGTTTATTGTCGATGGCCATTCACAAACTTTCACCTTCCAAATTTTCACTCTCTCTCTCTCCCCGCCATCGCCACCGGAGTCACCACTTCTCTGCCGTCGCCGCTGGAGTAACCACCTTCTCTGCCGTCGCCGCTGGAGGTTTAACTATCCTATGATAATTCCGTTTCTCTTTCATCATAAGGTTCGAGCCTCAAAGCTCGACTTTCTTCCCCATTTCCACGCTCTCTCCTCCTCTGTTGCAGGATCCCGTACCCATTTTTCCGAGATCTGA

Coding sequence (CDS)

ATGGACGTCCCGTCCAACGTTTTGTTTATTGTCGATGGCCATTCACAAACTTTCACCTTCCAAATTTTCACTCTCTCTCTCTCCCCGCCATCGCCACCGGAGTCACCACTTCTCTGCCGTCGCCGCTGGAGTAACCACCTTCTCTGCCGTCGCCGCTGGAGGTTTAACTATCCTATGATAATTCCGTTTCTCTTTCATCATAAGGTTCGAGCCTCAAAGCTCGACTTTCTTCCCCATTTCCACGCTCTCTCCTCCTCTGTTGCAGGATCCCGTACCCATTTTTCCGAGATCTGA

Protein sequence

MDVPSNVLFIVDGHSQTFTFQIFTLSLSPPSPPESPLLCRRRWSNHLLCRRRWRFNYPMIIPFLFHHKVRASKLDFLPHFHALSSSVAGSRTHFSEI
Relationships

The following mRNA feature(s) are a part of this gene:

Feature NameUnique NameType
Spo19358.1Spo19358.1mRNA


Homology
The following BLAST results are available for this feature:
BLAST of Spo19358.1 vs. NCBI nr
Analysis Date: 2018-06-29 (blastp Spinacia oleracea peptides vs. NCBI nr)
Total hits: 0
Match NameE-valueIdentityDescription
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BLAST of Spo19358.1 vs. UniProtKB/TrEMBL
Analysis Date: 2018-06-29 (blastp Spinacia oleracea peptides vs. UniprotKB/TrEMBL)
Total hits: 0
Match NameE-valueIdentityDescription
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BLAST of Spo19358.1 vs. ExPASy Swiss-Prot
Analysis Date: 2018-06-29 (blastp Spinacia oleracea peptides vs. ExPASy SwissProt)
Total hits: 0
Match NameE-valueIdentityDescription
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BLAST of Spo19358.1 vs. TAIR (Arabidopsis)
Analysis Date: 2018-06-29 (blastp Spinacia oleracea peptides vs. TAIR)
Total hits: 0
Match NameE-valueIdentityDescription
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GO Annotation
GO Assignments
This gene is annotated with the following GO terms.
Category Term Accession Term Name
biological_process GO:0045892 negative regulation of transcription, DNA-templated
biological_process GO:0055114 oxidation-reduction process
biological_process GO:0016311 dephosphorylation
biological_process GO:0019497 hexachlorocyclohexane metabolic process
biological_process GO:0006771 riboflavin metabolic process
cellular_component GO:0016021 integral component of membrane
cellular_component GO:0005886 plasma membrane
cellular_component GO:0005737 cytoplasm
molecular_function GO:0010181 FMN binding
molecular_function GO:0016491 oxidoreductase activity
molecular_function GO:0003993 acid phosphatase activity
RNA-Seq Expression