Overview
Sequences
The following sequences are available for this feature:
Legend: exonfive_prime_UTRpolypeptideCDSthree_prime_UTR Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.CAACGCGTGATACTCTGCCTTTTTTCAAGTAACGAAAACTTCAAGCGTTTCTTTCCCTTTTTTTTTTTTCCTTTTAAATTTTAACTCGGACTTCTTCTTCCCCAATCTCCACTTTTTCTTCTCTCTCCTCTTGCTTTTATAATCCTCATCATCATATACATATAAATACTGCAAACCCCAAAAAACTTGGCGGTGACACCTCCCATATTTTCTCATTTCTGATTGAATTATAGCGTCCGAAGAGAGAGAAACTTGGTCAGAGAGATAGAGAAATGGCGGTGGGTTCGTCGCCGAAGGTGGATAATGGCGGCGGCGCCGGTGGCGAAGATGTGGATTGGAAGATTAAACTTGGTGTTTGTGTGATGGAAAAGAAGGTGAAATGTGATTTTGAGGTTGTTTCTGCTTTGTTTTTCCAGTCCCTCCCCTTGCCAGAATCATAATCACATTTTTTGCAATATTTTTTTTTGTTAATTGTTTCAAAAATCGCGTTCGTCTAATTGTTGAACATTTGATTTTTGGAAAAAAATATTTGAAAAAATAATAATCTGTAGGCATCTTCGGCTCCGATGAAGCAAATACTGGAGAGATTGGACGCATTTGGCGAATTTGAGGTATTTTTGGAACATTTGTTTTTGTGAATTTACGCATATTCATTGATTACGATTACATGGAGTACAGTTTTTTTTTTTTTTTTTAATAGTTTAATCCGTATTTATTTGCTCTGTTTCTAGGTAATACTTTTTGGCGACAAAGTAATACTTGAAGATCCAATTGAGAGGTACATATCACACCTTTTCTGGTAGAATCCAGTAATATTCTGAAAAGTGCGACTATATTGTTTAGCTGTTTGCTTTTAGGTTCATTTACTATGAGCTTTTTGCTTTTGATTGAGTTTCTTTTTTCTTTTTGAGGGTAAAGAATAGAAAAAGGGGAATATTGAATCGGTGGCCGTTATTATTTGTTAATCGTAGCTACTCCGTATTTGAAGTTGACCTGGGAAAATAACAGTTGGTGTAGTTGATACATGAATATTACGTGGTTGACTGGTTTGTAAATTATTGTTAAATAGTAGTCAAATATCGAGTGTGGATGTACTATTAGTGAGCATGATAGCTATCGAGCATCGTCCAACTCTGTACTAACAGCAGGTAACTTTTTGTACCATTTTATATTTGTGCATGAGATGGAAGAATATACTACTCCGTCCGTCCTTAAATGAATTTTACACTGGGTGTTATGCAGTAGGCGATTACGAATATTTTGCACCGGGTTGTTATGCACTAGTAGTCAAATATTGGGTGTCGATGTACATGATAGTTCAGTAGGAACACTTGACAAGAGGGGGGGTGAATTGTTTCTTGGGAACTTGAGTAAGTTTCTTGCGGAATTTAAACAATAAAGAGACTGAGAACAATGAGCGAAGAAAGATATAAAACGGAGGAACCTTCTTGACCCTAATCAAGAAGAACCTCACTACTCTTTTGTATTAATGCAATAACTCTATTACAAATACACTCTTTAACTCGAGTTCCTCTCGAACACGAGTTCCCCACAGCAATCCCCTTCGATTACTGTGCTACTCTTTCTCTCTCTTAACTCTAAGTCGCTCCTTTTCTCTTTGACTTAACTCTAAGTCACAGTTTTTCTCTTTGACTAAACTCTTAGTCGCTCTTTCTCTCTTTGACTTAACTCTAAGTCACTCAAGGATCACTCAATCCTTAAACCCAAAATACAATATGATAGATAGATTCTAGTACGTAATAAAGCTCAAAGTAATAAGGAACTCAAGGGACACTCTTTTGAAAACTGATTCTCTTTTAAAACGTTTAAGCTCTTAAGATATATTTTACAAAGATCAGTTGTGTGTTTTGAAAAGCTAAAACTCTTCTCCTTTTATAGGAGAGTTTATTTAGGGTTGGGTACCCATGTTCTCCTCAACTTCCCACTAATAGTTACTGCTCAGTAACATGGGCATAGTTGGAGAGAAACAAGGGAGACCAAATCAAAACACTAAATGTACGTTAAACAGAAATACGTGGGGAGAGTTTCAAGGAACATGGAAAATCTTTTACTTGAGAAACAAGGAGAATAAATCAGAATCCTATGTTTCATTTATTAATTAAATTCATTTTATTTATTAAAAAGATTTTCCAAGTTAAAACTCTTTTATAATTACAGTTAACATATTTCATTTAAAACGTACCAAAATACTATGTCCCTTTCATACCAAATTACTTATAAACCTTATTAAATACTTACATAAATCCTAAAACATAAACTCATATGTTGTAGTCTTCATGTTGCACCTTTAGAAGCTTCACTCGAAGACTTCCCAATTTGTTCCTTCTCTGGAACGTCGAGGATCCACATAATATATGAGGATCTCGCCTTAGGAACTCGCCTAAGGATCTCGCCTTGCTTAATGATTATTTCTTCAATGTAGTGTCTGACATGGATCAATTACTTGCTTATATTCCACGTTGCTTAGTTTATCCAACCCAAGATCTCCTTAACTTAGCATTATCCCTCTAAGGATCTCGGAACCTATTATGCAACATAACTTAACCAATTGTCAGGAGTTTGCTTTGTCATCATCAAAACTTTAGGGTCAACAGTACAAGTAATTGAACTCGGTACTCTTAGTGAGCATGATAGCTATCGAGCATCGTCTGAGTTTGTACTTACAAGATCTAAATTGTTGAACCATTGTACATATATTGTACATCAGATAGAGGAATATATACTACTCCCTTTCTGTCAGTCCCTAAATGAATTTTACATTGGGGTGGGTTTGAAGATTTAAAAGTATTTATAGATGCAGAATAAAAAAAAATTTAAGGTCGATAAGAAAATAAAGTAAGAGAAAGCATTCAGATGAACCGATGAAGACTGAATAATGATTTCTAGCTCGAAATAGAAGGGTGGAAACTTTTTGGGACTAAAAAGAAAGACAAAAATATACTGAGATTAAGGTCTGGAGGGAGCGCACTTTATGCACCATTGATTTTTTTATTTTATTTTATTGCATAAGTATTTCTGGTTCACATACTTTCATTGGCTAGTGATACACCGATGCTAAGTAGAGATGTTATGATTAGTAATTTAGTACTAATTTCTGATGTGTTTACAGTTTATTTCTAGTTTTAAAAATGTTTTGGGAGTATTTTTAAGACTATTTGGCAGTGGAGTTAATGTTTTCCTTGGGTCATACGGAGTAGTTTTGGAAGAGGTAATACGTGCATTAAAGATTGAATATTTTTGGTAAGGATTTATTTTATCCTTCTACGATATCAACCCCCCCCTCTAAAATTTAAAAATCTTGTTCATTTTAGTTTGCTGGGTACTTACCGTTTTCCTACATTATTGTAGCAACATAAATAAGGAGAACTCTGATGAAAATTCGCCAACATAATTACTTCTTACTTAGTTATCTCTTTAATATTTCTATGAACAGCAACACTTACCTGTATGCCGTATTTTTTGTAAATGGTACGGAAAATGAATGCGATCCAAAAAAATTGTTGAATTGTTTGCATTTTTAGAAAAAGATAATAGGAAATCCTCCAGATTGGCAATGCCTGTTATGGTCGTTCCATGGCCTCTTGGATTTGATTAACGATTGCTATTAGTTCACATATGGCCTTTTCATTCTCAAATATATTTCTGTTTGTATCTTGCAATAATTAATTTTACTAATCTCATTATCTCTAGCATCTATAGCACCACTATTACGAAGTTTATTATTTTTATCTTATTTTATCACTGATGTATATTCTTATGCAGTTGGCCTCTGTGCGACTGTCTTATAGCTTTCTATTCGACTGGCTATCCTCTTGAAAAGGTTGAGTCTTATGCAGCTTTAAGAAAGTAAGTTCCTAACTTTCCATGATCTCTTTCCTTCGTCTCTCATCATTGCGAACTGTTTAGTTAACTATTTCATGGATGCCTTGCGTTTTGTGTTAAGATAAACTGTTATTGTTTGTAATGATCGTTCTGTTATAGCTGACTAGATTTGATGGCTTATGATAATGAGTTAGGGGAATGCTCTTGTTTTTTGGGTGGAATTTGGCATGAAATGTCCCATATGGATGTTTTTTTACTTAGTTTTCGCTCCCACTACAGTAACCTCATTAATTAAGACACTTGTTTTCAAGTAGAGAAGCACTACCTTTGACGACCATGTGGGACCTTTCATGCCAAAATTTGCGTTAAGATCCCTACATTCTATAACCTCATAGCATTCCTTATGCGAGTATGGGTAGGTGCAGTAGTTGCATTATATTGTGGTTAGAGTATATTTAATTGCTAAGAGCATGCTTATTTTTGCTAATTAATCTTTCATGCATTCAAACAATTTCTTCTCTTGTCTTGTATATAGGATGTAGTATATATGCTTTTGTTCTGAGAGTTTTTATTGTGTTTTAGGCCCTTTTTGATCAACGAACTGGAGCCACAACACTTGCTGCACGACAGAAGGAAGGTGTATGATGTATGTATTACAATGTTAAATAAGCCATCATATGTTGTTAATGGAGACGGAAAATATATTAACATTCACACTGTCTGTTTTTATGGATTTTTTGGTATTCATTTCTATGCTAAAAACTAAAACTTAAGAATAAATCAAAAGCAGTGCAGGTGTCATTTGCACTAGGATCAGTTAGGCTTATTGCTGTGGATTGATGCTGTCTTTCCTTGTTTTGCATATGTTAGCGTCTGGAGATGTTTGGTATTCCTGTTCCTAGATATGCTCTTGTGAATAGAGAATTTCCATTTCAAGAAGTGGATTATTTTTCTGAAGATGATGATTTTGTAGAAGTCCATGGTGAGCGTTTCTCGAAGCCGTTTGTGGAGAAACCTGTTGATGGTAAGCCAGTTAATTGTTTGTGTACTTTGGCGTGTAGGGGTTCTTTTTCTTTTGTTCATAGTTGGACTCTTTTTTTTTTTTTTCTTCAAGTCAATAGAATATTATAGTTTTCATAATTATTTTTCTT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MAVGSSPKVDNGGGAGGEDVDWKIKLGVCVMEKKASSAPMKQILERLDAFGEFEVILFGDKVILEDPIESWPLCDCLIAFYSTGYPLEKVESYAALRKPFLINELEPQHLLHDRRKVYDRLEMFGIPVPRYALVNREFPFQEVDYFSEDDDFVEVHGERFSKPFVEKPVDGDNHSVMIYYPSSAGGGMKELFRKVGNRSSEFHPDVRNVRRDSSYIYEEFMHTGGTDVKVYTVGPDYAHAEARKSPVVDGVVMRNPDGKEVRYPVLLTPGEKQMAREVCIAFRQGVCGFDLLRCGGRSYVCDVNGWSFVKNSHKYYDDAACVLRKMFLDAKAPHLSTTIPPTLPWKVHEPVNASEGLTRQGSGIIGTFGQSEELRCVIAVLRHGDRTPKQKVKLKVTEEKLLNLMLKYNGGRPRAETKLKSAVQLQDLLDATRALVPRSRPDRESDSEAEDIEHAEKLRQVKAVLEEGGHFSGIYRKVQLKPLKWEKVHKNNGESEEERPVEALMVLKYGGVLTHAGRKQAEELGRYFRNNMYPGEGTGLLRLHSTYRHDLKIYSSDEGRVQMSAAAFAKGLLDLEGQLTPILVSLVSKDSSMLDGLDNASIEMEQAKARLNEIITSGAPTSHNNGSPECPWMVDGAGLSPNASEYLPKLVELTKKVTEQVRLLAKDEDEKLAEKSSYDVFPPYDQAKALGKTNIDVDRIAAGLPCGNEGFLLMYARWRKLERDLYNVRKARYDITQIPDVYDSCKYDLLHNAHLNLEDLGELFNVGKLLADGVIPNEYGINPKQKLKIGSKIARRLLGKILIDLRNTREEAINVAELKSNDTQLTKSGKKEDSNIRSSNDTQHTKSGKKEDTNTRSKTHSKNEDTRRSSATDISIDHEDDDEKETEYRLDPKYANVRTPERHVKTRLYFTSESHIHSLMNVLRYCNLDESLQGEEGLVCLSALERLFKTKELDYMSYIVLRMFENIEVAQDDPKRFRMELTFSRGADLSPLENKDSEANWLHQEHTLPIMGPERLQEVGSCLTFDKMEDMLCPFAMPAEDFPPPITPIGFTGYFSKSSAVLERLVNFWPFNKHSHGNGK Relationships
The following mRNA feature(s) are a part of this gene:
Homology
BLAST of Spo19580.1 vs. NCBI nr
Match: gi|902158103|gb|KNA06193.1| (hypothetical protein SOVF_183320 [Spinacia oleracea]) HSP 1 Score: 2087.0 bits (5406), Expect = 0.000e+0 Identity = 1043/1080 (96.57%), Postives = 1046/1080 (96.85%), Query Frame = 1
BLAST of Spo19580.1 vs. NCBI nr
Match: gi|731319546|ref|XP_010670329.1| (PREDICTED: inositol hexakisphosphate and diphosphoinositol-pentakisphosphate kinase 2-like isoform X2 [Beta vulgaris subsp. vulgaris]) HSP 1 Score: 2001.1 bits (5183), Expect = 0.000e+0 Identity = 999/1080 (92.50%), Postives = 1023/1080 (94.72%), Query Frame = 1
BLAST of Spo19580.1 vs. NCBI nr
Match: gi|731319544|ref|XP_010670328.1| (PREDICTED: inositol hexakisphosphate and diphosphoinositol-pentakisphosphate kinase 2-like isoform X1 [Beta vulgaris subsp. vulgaris]) HSP 1 Score: 1994.5 bits (5166), Expect = 0.000e+0 Identity = 999/1086 (91.99%), Postives = 1023/1086 (94.20%), Query Frame = 1
BLAST of Spo19580.1 vs. NCBI nr
Match: gi|255552826|ref|XP_002517456.1| (PREDICTED: inositol hexakisphosphate and diphosphoinositol-pentakisphosphate kinase 2 isoform X2 [Ricinus communis]) HSP 1 Score: 1809.3 bits (4685), Expect = 0.000e+0 Identity = 900/1067 (84.35%), Postives = 968/1067 (90.72%), Query Frame = 1
BLAST of Spo19580.1 vs. NCBI nr
Match: gi|1000970055|ref|XP_015573658.1| (PREDICTED: inositol hexakisphosphate and diphosphoinositol-pentakisphosphate kinase 2 isoform X1 [Ricinus communis]) HSP 1 Score: 1803.5 bits (4670), Expect = 0.000e+0 Identity = 900/1073 (83.88%), Postives = 968/1073 (90.21%), Query Frame = 1
BLAST of Spo19580.1 vs. UniProtKB/TrEMBL
Match: A0A0K9QHN4_SPIOL (Uncharacterized protein OS=Spinacia oleracea GN=SOVF_183320 PE=3 SV=1) HSP 1 Score: 2087.0 bits (5406), Expect = 0.000e+0 Identity = 1043/1080 (96.57%), Postives = 1046/1080 (96.85%), Query Frame = 1
BLAST of Spo19580.1 vs. UniProtKB/TrEMBL
Match: A0A0J8CU48_BETVU (Uncharacterized protein OS=Beta vulgaris subsp. vulgaris GN=BVRB_2g040500 PE=3 SV=1) HSP 1 Score: 2001.1 bits (5183), Expect = 0.000e+0 Identity = 999/1080 (92.50%), Postives = 1023/1080 (94.72%), Query Frame = 1
BLAST of Spo19580.1 vs. UniProtKB/TrEMBL
Match: A0A0J8CZ01_BETVU (Uncharacterized protein OS=Beta vulgaris subsp. vulgaris GN=BVRB_2g040500 PE=3 SV=1) HSP 1 Score: 1994.5 bits (5166), Expect = 0.000e+0 Identity = 999/1086 (91.99%), Postives = 1023/1086 (94.20%), Query Frame = 1
BLAST of Spo19580.1 vs. UniProtKB/TrEMBL
Match: B9RUL1_RICCO (Acid phosphatase, putative OS=Ricinus communis GN=RCOM_0854040 PE=3 SV=1) HSP 1 Score: 1809.3 bits (4685), Expect = 0.000e+0 Identity = 900/1067 (84.35%), Postives = 968/1067 (90.72%), Query Frame = 1
BLAST of Spo19580.1 vs. UniProtKB/TrEMBL
Match: F6HV78_VITVI (Putative uncharacterized protein OS=Vitis vinifera GN=VIT_14s0066g02540 PE=3 SV=1) HSP 1 Score: 1797.3 bits (4654), Expect = 0.000e+0 Identity = 898/1070 (83.93%), Postives = 969/1070 (90.56%), Query Frame = 1
BLAST of Spo19580.1 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: VIP2_MOUSE (Inositol hexakisphosphate and diphosphoinositol-pentakisphosphate kinase 2 OS=Mus musculus GN=Ppip5k2 PE=1 SV=3) HSP 1 Score: 670.2 bits (1728), Expect = 3.700e-191 Identity = 390/808 (48.27%), Postives = 511/808 (63.24%), Query Frame = 1
BLAST of Spo19580.1 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: VIP1_MOUSE (Inositol hexakisphosphate and diphosphoinositol-pentakisphosphate kinase 1 OS=Mus musculus GN=Ppip5k1 PE=1 SV=1) HSP 1 Score: 669.8 bits (1727), Expect = 4.800e-191 Identity = 390/812 (48.03%), Postives = 509/812 (62.68%), Query Frame = 1
BLAST of Spo19580.1 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: VIP2_HUMAN (Inositol hexakisphosphate and diphosphoinositol-pentakisphosphate kinase 2 OS=Homo sapiens GN=PPIP5K2 PE=1 SV=3) HSP 1 Score: 669.8 bits (1727), Expect = 4.800e-191 Identity = 390/808 (48.27%), Postives = 512/808 (63.37%), Query Frame = 1
BLAST of Spo19580.1 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: VIP1_BOVIN (Inositol hexakisphosphate and diphosphoinositol-pentakisphosphate kinase 1 OS=Bos taurus GN=PPIP5K1 PE=2 SV=1) HSP 1 Score: 667.5 bits (1721), Expect = 2.400e-190 Identity = 389/812 (47.91%), Postives = 511/812 (62.93%), Query Frame = 1
BLAST of Spo19580.1 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: VIP2_PONAB (Inositol hexakisphosphate and diphosphoinositol-pentakisphosphate kinase 2 OS=Pongo abelii GN=PPIP5K2 PE=2 SV=1) HSP 1 Score: 664.8 bits (1714), Expect = 1.600e-189 Identity = 390/809 (48.21%), Postives = 512/809 (63.29%), Query Frame = 1
BLAST of Spo19580.1 vs. TAIR (Arabidopsis)
Match: AT5G15070.2 (Phosphoglycerate mutase-like family protein) HSP 1 Score: 1701.8 bits (4406), Expect = 0.000e+0 Identity = 851/1074 (79.24%), Postives = 951/1074 (88.55%), Query Frame = 1
BLAST of Spo19580.1 vs. TAIR (Arabidopsis)
Match: AT3G01310.1 (Phosphoglycerate mutase-like family protein) HSP 1 Score: 1675.6 bits (4338), Expect = 0.000e+0 Identity = 842/1073 (78.47%), Postives = 935/1073 (87.14%), Query Frame = 1
The following BLAST results are available for this feature:
BLAST of Spo19580.1 vs. NCBI nr
Analysis Date: 2018-06-29 (blastp Spinacia oleracea peptides vs. NCBI nr) Total hits: 5
BLAST of Spo19580.1 vs. UniProtKB/TrEMBL
Analysis Date: 2018-06-29 (blastp Spinacia oleracea peptides vs. UniprotKB/TrEMBL) Total hits: 5
BLAST of Spo19580.1 vs. ExPASy Swiss-Prot
Analysis Date: 2018-06-29 (blastp Spinacia oleracea peptides vs. ExPASy SwissProt) Total hits: 5
BLAST of Spo19580.1 vs. TAIR (Arabidopsis)
Analysis Date: 2018-06-29 (blastp Spinacia oleracea peptides vs. TAIR) Total hits: 2
InterPro
Analysis Name: InterPro Annotations of S. oleracea
Date Performed: 2018-06-29
GO Annotation
GO Assignments
This gene is annotated with the following GO terms.
RNA-Seq Expression
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