Overview
Sequences
The following sequences are available for this feature:
Legend: exonfive_prime_UTRpolypeptideCDSthree_prime_UTR Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.TTATACTTTTTAACGATGACATGTGCATTCTTATGCGTATGACGGTTTTATAAGAGACTTCTAAATCTTGAAGGGACTATAAATATTTGGCATAGTCTTTCCCCATGCTCACAGATCACAATTAAGAACACTGATGTACAAAATCTCAGAGAAAGTCTAAGAGAGAAAAATAAAAGAAACTTCACAAAAATGGTTGTGTCAATTGTGTTTGCAACCACATTCAACATTACCCCAATACCAACAACGAAAATAACTGTTTATTTCAAGGAGAGCTTTATCAATAGACATCACTCCTCAAATACAGTAAGTTATTCATATACTTCCTATACAAATTTCTTTACTATAATTATTAAGCCGGACTTGACTCACTTAATTAGTATTCGGTAATTAAGGTCCTAACCTAATATCCCAAAGGTACGAGGTTCAAATCTTGTGAAGTTAGGGTGTCATACCCCCCCCCCTCCTCCTCCTCCTCCTTAGTGCTTGGCTCGAAATACTCGATTGAAAAACAGTGGCGGGTCTAGATATTAGATAGAGTGGGATCACTATTTAAAAATTAATGCTAAATTAGTTACATTTATAAAGTATTTTTTGGAAAATTTATGAAAAATTAACTAAATTATATTTTTCCTTTTTGCCAAGTGGGGTCAAGTGAGTGAAGCGATCCCCTTCCTCTATGTTGGATCCGCCAATGCCGAAAAATAGGTTGTTAAAAGTTTTATACTTAAGAAACTTTTTTTTTGATAGAAAAGGGCTGCAATTAAATTACGTTAATAAAATGAATTACAAGAGTTTCCAATATAGGATAGTTAGACGAATTAAATCACTTACGGATTTTGGTTATGTTATATATATGCATCAGAAGGAATACCGGCTTGAGCATGGAGTGCGGAAGATTAGGGGAATAATGACAAGCAAAACAAGGGGATATGGTAAGTTATTCTAAATGTTTTACTAGCTTTTTAATATAAATAAATCCATTGCTTTTATATGACTAGCTTGTTTGATGATTTTTTTTGGTTTTTTATGTGCTATGTTGGCTTGAAAAAAAAAAGGAACCTGGAAGTAGGGATGGTAATGGGTCCAATACCCGATCCAGATTCGGTTGGACCCGGTCCATTTATAAGGGTCTGGGTCCAAAAAAAATAGACCCAGTGGATCTAGGACGGATCTGGATCTTTGTTGAATGGGGCGGGTTTGGGTCTGGGTCCAAGAATCAAAGATCTAGATCCGGTCCAGATCCTACCCACAGACCCATATATATAATTTTTTAAAAAAATTATTAAAATTTAAATATGATTCAATCTTTACGTGTTAATCTTTATTCAGTTCTTATGATGTTAGACTTTTTAAATATTGTTTGACGTGACAAATAAATAATAATATTAGAAATTTTAAATACTTATTGTATTACAAGGCTAATATGATTTTTTTTCCTAAACAAAATTGACGAATATTCCATATTTAGTGGTTTTATTAAAGCAACATTACGTTTACATAAAAAATGGGCGAAATTTTTTCGTAATATAAGAAAAATGAGAAACAAATTTTTATTGAAAATAAATACGCTTAGACCCATTTAGGACCCAAATCCGACCGTAGACCCATTAGACCCAGTGGATCTGGGTCTGGATCTGGTTTTTTAGATCCAACGGATCTAGATCCACCTCTTAAAAAGCGGGTATGGGTCAGGATCCTATCGGACCCGGTCCAGATCCGACCCATTGTCATCCCTACCTGGAAGTTCCCCTAATTTTAATTTTTTTTAATTTTATCATTTAACTGTCCAGCCTGATTCCTTTCCGCTCGAATTGCAAAGAATTCCTCTTTCATGACCAAAGATCACATCCCTATCTTTTGACCCCCAATGACATTCAAATCGGTTCACTTCCCTATCTTACGGCCCCAATCACATGCAAATTTGGCCTACATCCCTATCTTTCGGCCCCCAATGACATGCAAATGTGGCCAGATTTAATCTAACATGTCCCTGTTCATGTCTAACATGAGTTGTACAAGTAACTATTAAAGAACGAAAAGAGTATAGGTTGATATTCTCTGGTGAGAAAATTAAGTACGTTAGGTTTATATTTCAAAATATAAGTGTGTGGAGAAGAAATGATGAAAAAAATTGTACTTTGGTATTGATTAGACAAATATGCACCACAAACACTGTCTAACAAATAAGAAGGCCGGCATAGCACACATGTTTAAAACTCTAAATGTCTAAATCATTGTCTCGGTCGATAATATGAACTCAACTAAGAATAAGACAACTTACACTATGGACGAGAAGAACTTAATTTATAACCACTAATCATAAATCATAATGTGTCTGAATTGAATCACCTACGTACGTTGTTTAGGTACATACGAAGTAATCTAACAAAATCTAAATAAGAGGCTTAAATTAACATCAACAATAGGTCGGGTCACCATTTTATTAGAGGTTTTTAGAGTTTGGTCTGGTCTGGACTAGGGGTGTGCACAGATTCAAATCCGGATCGGAACCGGTTGGACAGGTAGACCGAAATTTTTAATTTTCTTGGATCGAAGACCGGACCGGAATCATTCGGTTCGGTCCGGTTCAAAATCGGATTTTTAAGTCCGGTCCAGGTCTGGACCGGTTTGAACCTTTTTATAATTTCTTTTGGCATTTGCGAGTATAACGTGCAACTTTGCTCTTTTTATGACGATTTTTAATTGGTATGATGTACAACCTGGAATATAAATTAATCTTTTAGTCACATAATAATTTCAAATAAAAGTATATCTGAAGGTTAGTCATATAAATTTAAAAGCTTAATTTATTAATTAGTGAAAATTAAGTGGCGTATGCAAAAGAAAGTAATGAATTTAAACAAGAAAAGTGAAAAGAAAGAACTTCAACATCTGCTTATCAACAATCCACCATCAATATCATTGCATAAATACTAAACGAAAAAAAAAAAACGAGTAGTACTCGATGAATTACACATTTTGATTTTAATAAGAATTAGTACGTACTTCGTACAATCGTACATAAATAGGAACAAGGGAGATGAAAGAACAACTTCATTTATTTTTATAATGCCAAGAAATATGTTAAATTTTAGACTATAATATATTATTTTTATAAATGAACCGGGTCACCTGTCCGGACCGGAATTTTTCGGGTTTTACCCAGACCGGTTTTACCGAAAACCGAAATTGATGCTTTTCAAGGACCGAGGACCGGACCAGAATCCTTTTATTAGAGGTCGGGTTACCATTTTATTAGAGGTTTTTAGAATTTGGTCTGGTGTGGACTGCGCCACACATGAGAGTTAAATTAACAACGGTAGGGTCACATCATACCATTTAAAATAGTAGTATACCAGAGAGATAACTTAACTAGTGTCATCAACAATAGGGTCACCGTTTAACATACCGTAAAGGTAACTTAATTAGTAACATCGACAATAGGGTGACCGTTGTAAAGATAACTTGATTAGTAACATCGACAATAGGGTGACCGTTGTAAAGGTAATTTAATTAGTAACATCAACCATAGGTCGGGTCACCGTTTAATGTGCATACAGCAAAGGCCGGTAAGTTAGAGTGACTGTTGTAAAGGTAACCTAATTGTAACATCAACCATAAGTCGGGTCACCGTTTAACGTACATACTGCAAAGGTAACTTAAATTAGTAACAGGAGGAGGAAGAGGAGAGTCTTGTCCACAAAATTTCCACACTAAAACCACTAGACAATAGTGGGTGTAATTCCTCAAGGTTACAAATTCCTATTTTCTCTCAATTTTTCTCCAATTTGGGACACGTAATATTGAGTTCGAAAATGATAAAGGTCGCAACATGCGACCTTTAAGCCGTGTCACAATGATGCCATGGGATGCTTATGTGTCATTATTTAAATTGGAAATTAAAATATGTAACTTATGTAACTTATTATACATGTTAAAAAAACGGATTTTTCATGAAATACCCTTGAGTTTTTGCGAAATTCACCGAATGCCCCTCGACTTTCAGAAATTCACCAAATGCCCTCCACTTTTTAACAAATACACTATATACCTTTAATGAGCATTTTCTGTCAACTCCGTTAGATTTCCATCAATTTTACCCTTAATTACCTCTATTAATGTGTACTTATCTAATTATCCTAATTAAATTAAAAAATAGAAAATAAAATTAAAAACTTTATTTTCCTTTATTTTTCCCCTTGTGTTTTTCTCTCTTCATCTTTCTTTCTTTTTCCCAGACGAAAACCATGACAGCCATGGTCATCCCCTTTCTCTCTCCTCCTCCCCTTCACTATCCCTATCCCTCTCTCCTCTTATCTTCTCTAACATTAGCTCGTTAAGTAAACATCTCTTTTTTTGGCCCAAAGGTCCGGTGTCTTGAAACCACCGCCTTGCATAATCCATGACCACTTCCGACAAGGGCACCCGAACCGACTCTCTGTGCTTGTGTTGTCCATCATCGACCCGATTTGCGCCGAGTCCACTCGGGGTTGCGTAGCTGCTGACTGTACAACTGAGACAGAAGCTTTGTTGTTTGATGATGTTGGTTTGAATTTGTTTTGAGGGGTGATTCTTTCTGATGAGATGATTCGAGCAAAGTTCTTTACACTTGGTGTTGAAGATAGTGATTTACCCATTTTGAGGAGAGAGAAAATGATAAATTAGGGGGCAGATTAATGGTGGGCTTAATTAATATTTTTGTGGTTGAATTATTGAAGCCTTTGTCATCTGGTTTTCAAGTCGGAAAGATTGGAGCTCTATTAGTTAAAGCAGCCCAACTGCACTCCTCCTCTCCAATTGCATTTATGGTTGATTTAATTTCCATAATTTTGGTTCTTTCTCCGTATTATGAGGGTTTATTTAATTTTGATTTTCGAATTGGTAATGGAGAGAGGAGAGGAAGCTAGGGAAATCTGAGAAGTAGCGGAGGCCGACACATACGAGGTAGGAGACAGCAGTAAGCATATGGATCGATGGTGTGGTAGAGATTAGGC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TATTAATTAATTAGGGTGGAAAACACCGGAACACCAAAACCATCTCACTAAGTGAGATCAAGTTCTGAAGATAAAGCAAAAGCCAACCCTAAATCTATATTAACACATACAACCCCATCAAACTCGCAAAACTTGTCCAAATGGGGGAGAATTATGAGCCATTAATACGCCCTATGCATCCCCTTAAAATCTGGTTAGTTAAAACTACATAGTTACTTATATGTACAACTAAAACTTGATGAAGTTGACGCCCTGCTTGAACTTGAGAATCATGCGTCTTCCAAAAAATAGTCATCATCACGATCCAGGGCCGGTGGAGGCCCTGTGCATCCTGGTCTACTGCACAGGGGCCCCCCAAAATATAAGGGTCTAATATTTGAAGCCCAGCCTTTTATAAAAAAAAAAAACCTTGTTGCTTCGTAACTATCTCTCCCATTATTACTAACGTTTAACTTTCAACCAGTAATTACTGTAGACTGTCTAATTATTTTCCGTGTCTTGCAATCTTTCAATCCCCATAAGGCAATAACTGTTTTCAATCTTCCATATTCCATTCAACTCTAATTTATAATTAATTTTCTTGTTTATATCAAATTTTCCATTAATCCCTCCCAATTACTCCGTATTCAACAAAACGGTTACTCTCAATCCTTGAGTTTTTTCAATGGAGAAATTAATTCCAATATCTACCCTTTCATTTAAAAATATTCAACCACTGCAGTTTTTTAAAGGCAAAAAATCAGATTTAGATATCATAGGATTTCCTATTCTACCATTCTCCAATTCAATGTTTAATTCACGTTTCTGGTGTATTGGTTGCTGGTAATTGGGAAGTGGGAGCCGACTGTCGAATGATTGAAGAACAACCAGGTTCATTGTTGTGGTTTTCTTTAAAAACGATTTATCTTATTTAATGAGGATGAGTTTATTATCTATATTTTTTTTAGTCTGAGAGTATTATTTGTTAATTTCATGTTTTTTTTTGAGGGAATTGTTAATTTCGTATTTGTAAATTACTACAATTGACTAGCTATTATTAATTTAAAGCTAGAAAAAAGGGTATTGTAAATCAATTTCAATTGATAGTTGACTAATTTTAGCAGTGAGTTTTAATTTGAAGTGGTATAATTGGGATGCTATTTACGGTGTTGTTTGAGACTTTGAGTTCTTTGTGCTTTTTAAGTTATTTGGGCTTCAAAAAAATAATGTATTCACGGAGTGTGATTATATTTTGAAATAATCTTAATTATTATACTTCTGCCAAACAAAAAAAATTATTAAAAACCACAGTTTTTGAAGTTGTACTCGACACTACGTGCAAGGGGGCCAATTTCTAAGATTAGAACAGGGCCTCCAAAACGTCTAAGACGGCCCTGTCACGATCATGCGTCATGCTTTAATATTTGGTTGTTTTATTTTACAAAAGATTCATTCAACGAAAAGCAATTACTACCCGTAAACTAAAGTAAACTACATTACATGAAACAAATCAGAGATAGCCGATGAACGTACTTGAGGAAAAAGTCTTGATTTAATATTGTTGGAAGTTAGTGAGAATACAAAAGAAAATGATTGGGGAAAAGTGGGAATGTGAAAATTAAGTCTCACATGGGAAAAACACCAAATACATTTATTATTTATATTTGGGGACTTGGGGGAATCATTTGTTTAAGGAAGCATGAGAGTGACATGCATGAGTGAACACACAAAACGCGTGCGCGCGGGTCGGGTCGTGGGCATTGGGACTTGGTAGGTACTTGGTACTTGCGGTTAGAAAGTGGTTTTGATTAATTCAAACGGTCAGAATTAATTAACCCACTAATGATGTTGTAACTGCCCCATTAATCAACCAGTAAATCATGGTAACCACCCACTCATTCCACTTCTAGCCGTTTATGACTGTTACAGGCTCCCTATAAATACTTGTTCTTCTGTTTTTAAAACACACACTCACATAAACTATTCTCTGTATTCTCTCTCAAACTCTCAAACACTATTCCGTTTATAGGCAAATACTCTGGTCTCCAACCGAGGCTTGTGAGTGCACACAAGTCTTGGTGTGGTGTGAACCCTGGAGATTCTTTATGCGGAATTGTCTTTTAAAGCAGTGGTTCGACCACGGCGCGGCAACTTGTTCAGTTCGTATATACGTAATATCCAACTAAGTTGTTCTAATTATTATTTTAGCCAACAAATATTTGGATGCATTTCATTAGAAATGGTAAACGAAATTTGCTAAATTTTCAATCTTTGAGGTTTTTAGAAAATACTTAATTTTGGTAAATTTTTAAATAACAATCCAGCTATGCATAATTTCTAAATCTGGCATTGTGTTGTCGCTTGTCACGTTGCAGTGGACCGAACAATGCAACGCATACCTTATTGAATCGAAATGGAGAGTTTCAAAATACTCACCTAGCCCAAAGGAGTATCTAAACAACGGGATAGTTAGTTCCGGAACCCATGTGGTTTTGGCGCACGCATATTTTCTTATGGGTCAAGGAATCAACAACAAGAGTCTTCAACACTTGAATAGCCTTCCTCCCATTATATCTTCCACAGCTACAATTCTTCGTCTTTGGAATGATGCAGGAATTCATACGGTACGTACCTTTACTTCTTTAACTAGTGCGACGTAGTTTACTAACTGTCAGATAGTCGTATATACTACCTCTGTTTCAAAAATATCTTTACACTTAATATTTGCACGGACTCCGCTGCAATGTCTGGCCGTGAAATATATCATATTCAATATTGCAAAAAATTATAAAAAGTTGATATTTATAAACATACATTTTGAAACGAATTTAACAAGATATCTCATGATAGTTTTTGATAGATATAATAGTGAGAATTTATGGTCAGAGTTTTGATTGTTGGACACAGTTTTCAAAGCGTAAAGAACTTAATGAAACAGAGGTAGTATGCAACAATTATTTATGTTATTTCATATTAAGAAAATTGATTTTTATCACCTAAGAAAACTGACAAAATGTATTTAACCACCTCAAAAATAGAAATATATTTTACCACCAAAAAATAAATAAATTTAATTTTACCACCTGTTAACGGCAAGTTAGATGGTAAGTTAAGTGGGGCCTATGTCAACGGCTATATATTTTGGATTTCCTTATCTTTTCCCACGATTTCCATGTACATAAGCTATAATAATCCTAGCTTGCTTTCCATTAATTCACTTAATTTGGTAAAATTTATCAAATTGATAGAGACTTAATTTGAGGAATTGAATGGGAGTAAAGAGACCGGGTGAGGGAATTCAATCGCAGAGGTGAGTGTCAAAATTTGGAGGGAAGTTGAATTAACGTGACCTGCTTAACTTTCTGTCCAACTTACCATTAACAGGTGTGGTAAAACACAATCCTTGTTCTTTTTAAGAGTCAATTTAGAGGAAGTCTTTGTCACAAGTGACTTGTGTCCATATTGGACACAAGTGAGTACCAATACAGAATTTGGAGTACCAATACAGAATATGTTAGTACCAATACAAATTATGTGAATACCAATAATAACACATATGACTTATATTGGTGGTATTTCTAAGCAATTTTGCATTTTGGTACTGACATATTATGTATTGGTACTCAAGATGATTGTATTTGGATCACTTGTGTCCAAGTCACTTGAGGTTTAGAAACCCTCGTCAATTTAACCTTAAAGTTACAACTTTTGCAGGATAAGACTCCTGAAGGAAATGATGGTTCCTACGTAGATTGGTACATGAAAGAACACAACCTTAGTTTATCCGATTCCGATAGGGTGAGACGACACGTAAATCGGATGATTTCAGGTGCATGGAAGTGTCTGAATAAGGAGTATATGTCTCCTACATCTCCATTCTCGAAAGAATTCAAGGTGGCCTGCCTTAATTTAGCTAGGATGGTTCCCATTATGTATAGCCAAGATGAGAGTCATCATCTTCGATTGTTTTTTGGTGGAACACTGGATTTTGTGGATAGATGAGAATCAAATTTGAACATGAAAGAACAAATTGAGCTATTATTCGATCTACATCTTATTAATTTGATTCAATTAAACCAAATTAAACTACTACACCGTACAAAAATCTAATTAGATACATCATGTATGGGCGGATTTAGGGGGTTACAAGGGGTACCGTTGCCCCCCATTCTCTAGATTCGCGAAAAAATATATAACAGTAACATGTATTTTGAATATATTTAAAATTCCCTATTAGGTATCACATAAATGAGTTTGTCTCAGTTGGTTGAGTATGTAGCCTCATTTTGTTAAAGCAAAGAGATACAGGGTTCGAGTCTTGATAAATCTTATTTTTCATTTTAATAGTTTTCTC TTATACTTTTTAACGATGACATGTGCATTCTTATGCGTATGACGGTTTTATAAGAGACTTCTAAATCTTGAAGGGACTATAAATATTTGGCATAGTCTTTCCCCATGCTCACAGATCACAATTAAGAACACTGATGTACAAAATCTCAGAGAAAGTCTAAGAGAGAAAAATAAAAGAAACTTCACAAAAATGGTTGTGTCAATTGTGTTTGCAACCACATTCAACATTACCCCAATACCAACAACGAAAATAACTGTTTATTTCAAGGAGAGCTTTATCAATAGACATCACTCCTCAAATACAAAGGAATACCGGCTTGAGCATGGAGTGCGGAAGATTAGGGGAATAATGACAAGCAAAACAAGGGGATATGATATTTTTAACAACTTGAAGGACAAAGATGGGCAATTGAAGCAAGAACTTTACAAGGAGGATGTGAAAGGATTGTTGAGTGTATGCGAGTGTTCTATACTAGGTGAAACTAATGATATTAGTGAGCAACTCCTAAGAACTTTCTTAAACAACATGGAAGAACAATCGAAGGCTAGCATAACTATTGACAACACATTACGATATCCTTATCATAAGAACTTATCAAGACTTATGGTTCAAAATGTCCTTGACGAATTTGACCATGTTTCTTTCAAGTTTCTTCACGAATCCAACAATGTGAAAGAATGGCTCAACGAGGTTCAAGAACTAGCAAGAGTTGATTTTGGCAATGCCCGAATGACTTACAGATATGAAGTACAACAGATTTCAATATGGAAAAACAAACATAATTTTGACAAGGAATTGAGCTTTGCAAGGATTGATCCATTCAAGTGGTGGATGTGGTCGTACGGAATTCTCCAAGGGCCAAATATGTCGGAAGACAGAATTGAACTTGCTAAAGCAATATCATTTATTTATATGATTGATGATATATTTGATGGTAATGGAACTTCGTACGACGAGCTCCTTCTATTCACAGAAGCTATCAATGGATGGGAGTACACTGATAGTATTAATCAACTACCTAACTGCATGAAAGTTTGCTTCAAGGCTCTCCTGGAGACGACAAATGATTTCAGCTCCAAAATTCTAACGAAGCATGGGTGGAACCCTGAACAATGTTTACGTAAATTGTGGACCGAACAATGCAACGCATACCTTATTGAATCGAAATGGAGAGTTTCAAAATACTCACCTAGCCCAAAGGAGTATCTAAACAACGGGATAGTTAGTTCCGGAACCCATGTGGTTTTGGCGCACGCATATTTTCTTATGGGTCAAGGAATCAACAACAAGAGTCTTCAACACTTGAATAGCCTTCCTCCCATTATATCTTCCACAGCTACAATTCTTCGTCTTTGGAATGATGCAGGAATTCATACGGATAAGACTCCTGAAGGAAATGATGGTTCCTACGTAGATTGGTACATGAAAGAACACAACCTTAGTTTATCCGATTCCGATAGGGTGAGACGACACGTAAATCGGATGATTTCAGGTGCATGGAAGTGTCTGAATAAGGAGTATATGTCTCCTACATCTCCATTCTCGAAAGAATTCAAGGTGGCCTGCCTTAATTTAGCTAGGATGGTTCCCATTATGTATAGCCAAGATGAGAGTCATCATCTTCGATTGTTTTTTGGTGGAACACTGGATTTTGTGGATAGATGAGAATCAAATTTGAACATGAAAGAACAAATTGAGCTATTATTCGATCTACATCTTATTAATTTGATTCAATTAAACCAAATTAAACTACTACACCGTACAAAAATCTAATTAGATACATCATGTATGGGCGGATTTAGGGGGTTACAAGGGGTACCGTTGCCCCCCATTCTCTAGATTCGCGAAAAAATATATAACAGTAACATGTATTTTGAATATATTTAAAATTCCCTATTAGGTATCACATAAATGAGTTTGTCTCAGTTGGTTGAGTATGTAGCCTCATTTTGTTAAAGCAAAGAGATACAGGGTTCGAGTCTTGATAAATCTTATTTTTCATTTTAATAGTTTTCTC ATGGTTGTGTCAATTGTGTTTGCAACCACATTCAACATTACCCCAATACCAACAACGAAAATAACTGTTTATTTCAAGGAGAGCTTTATCAATAGACATCACTCCTCAAATACAAAGGAATACCGGCTTGAGCATGGAGTGCGGAAGATTAGGGGAATAATGACAAGCAAAACAAGGGGATATGATATTTTTAACAACTTGAAGGACAAAGATGGGCAATTGAAGCAAGAACTTTACAAGGAGGATGTGAAAGGATTGTTGAGTGTATGCGAGTGTTCTATACTAGGTGAAACTAATGATATTAGTGAGCAACTCCTAAGAACTTTCTTAAACAACATGGAAGAACAATCGAAGGCTAGCATAACTATTGACAACACATTACGATATCCTTATCATAAGAACTTATCAAGACTTATGGTTCAAAATGTCCTTGACGAATTTGACCATGTTTCTTTCAAGTTTCTTCACGAATCCAACAATGTGAAAGAATGGCTCAACGAGGTTCAAGAACTAGCAAGAGTTGATTTTGGCAATGCCCGAATGACTTACAGATATGAAGTACAACAGATTTCAATATGGAAAAACAAACATAATTTTGACAAGGAATTGAGCTTTGCAAGGATTGATCCATTCAAGTGGTGGATGTGGTCGTACGGAATTCTCCAAGGGCCAAATATGTCGGAAGACAGAATTGAACTTGCTAAAGCAATATCATTTATTTATATGATTGATGATATATTTGATGGTAATGGAACTTCGTACGACGAGCTCCTTCTATTCACAGAAGCTATCAATGGATGGGAGTACACTGATAGTATTAATCAACTACCTAACTGCATGAAAGTTTGCTTCAAGGCTCTCCTGGAGACGACAAATGATTTCAGCTCCAAAATTCTAACGAAGCATGGGTGGAACCCTGAACAATGTTTACGTAAATTGTGGACCGAACAATGCAACGCATACCTTATTGAATCGAAATGGAGAGTTTCAAAATACTCACCTAGCCCAAAGGAGTATCTAAACAACGGGATAGTTAGTTCCGGAACCCATGTGGTTTTGGCGCACGCATATTTTCTTATGGGTCAAGGAATCAACAACAAGAGTCTTCAACACTTGAATAGCCTTCCTCCCATTATATCTTCCACAGCTACAATTCTTCGTCTTTGGAATGATGCAGGAATTCATACGGATAAGACTCCTGAAGGAAATGATGGTTCCTACGTAGATTGGTACATGAAAGAACACAACCTTAGTTTATCCGATTCCGATAGGGTGAGACGACACGTAAATCGGATGATTTCAGGTGCATGGAAGTGTCTGAATAAGGAGTATATGTCTCCTACATCTCCATTCTCGAAAGAATTCAAGGTGGCCTGCCTTAATTTAGCTAGGATGGTTCCCATTATGTATAGCCAAGATGAGAGTCATCATCTTCGATTGTTTTTTGGTGGAACACTGGATTTTGTGGATAGATGA MVVSIVFATTFNITPIPTTKITVYFKESFINRHHSSNTKEYRLEHGVRKIRGIMTSKTRGYDIFNNLKDKDGQLKQELYKEDVKGLLSVCECSILGETNDISEQLLRTFLNNMEEQSKASITIDNTLRYPYHKNLSRLMVQNVLDEFDHVSFKFLHESNNVKEWLNEVQELARVDFGNARMTYRYEVQQISIWKNKHNFDKELSFARIDPFKWWMWSYGILQGPNMSEDRIELAKAISFIYMIDDIFDGNGTSYDELLLFTEAINGWEYTDSINQLPNCMKVCFKALLETTNDFSSKILTKHGWNPEQCLRKLWTEQCNAYLIESKWRVSKYSPSPKEYLNNGIVSSGTHVVLAHAYFLMGQGINNKSLQHLNSLPPIISSTATILRLWNDAGIHTDKTPEGNDGSYVDWYMKEHNLSLSDSDRVRRHVNRMISGAWKCLNKEYMSPTSPFSKEFKVACLNLARMVPIMYSQDESHHLRLFFGGTLDFVDR Relationships
The following mRNA feature(s) are a part of this gene:
Homology
BLAST of Spo19708.1 vs. NCBI nr
Match: gi|902219916|gb|KNA18453.1| (hypothetical protein SOVF_070640 [Spinacia oleracea]) HSP 1 Score: 636.3 bits (1640), Expect = 4.300e-179 Identity = 310/313 (99.04%), Postives = 311/313 (99.36%), Query Frame = 1
BLAST of Spo19708.1 vs. NCBI nr
Match: gi|731351208|ref|XP_010686917.1| (PREDICTED: (3S,6E)-nerolidol synthase 1-like isoform X1 [Beta vulgaris subsp. vulgaris]) HSP 1 Score: 520.4 bits (1339), Expect = 3.400e-144 Identity = 270/420 (64.29%), Postives = 319/420 (75.95%), Query Frame = 1
BLAST of Spo19708.1 vs. NCBI nr
Match: gi|870852110|gb|KMT04064.1| (hypothetical protein BVRB_8g186610 [Beta vulgaris subsp. vulgaris]) HSP 1 Score: 520.4 bits (1339), Expect = 3.400e-144 Identity = 270/420 (64.29%), Postives = 319/420 (75.95%), Query Frame = 1
BLAST of Spo19708.1 vs. NCBI nr
Match: gi|731351210|ref|XP_010686918.1| (PREDICTED: (3S,6E)-nerolidol synthase 1-like isoform X2 [Beta vulgaris subsp. vulgaris]) HSP 1 Score: 502.3 bits (1292), Expect = 9.700e-139 Identity = 263/420 (62.62%), Postives = 312/420 (74.29%), Query Frame = 1
BLAST of Spo19708.1 vs. NCBI nr
Match: gi|902219914|gb|KNA18451.1| (hypothetical protein SOVF_070620 [Spinacia oleracea]) HSP 1 Score: 385.6 bits (989), Expect = 1.300e-103 Identity = 212/472 (44.92%), Postives = 296/472 (62.71%), Query Frame = 1
BLAST of Spo19708.1 vs. UniProtKB/TrEMBL
Match: A0A0K9RG38_SPIOL (Uncharacterized protein OS=Spinacia oleracea GN=SOVF_070640 PE=3 SV=1) HSP 1 Score: 636.3 bits (1640), Expect = 3.000e-179 Identity = 310/313 (99.04%), Postives = 311/313 (99.36%), Query Frame = 1
BLAST of Spo19708.1 vs. UniProtKB/TrEMBL
Match: A0A0J8BVQ6_BETVU (Uncharacterized protein OS=Beta vulgaris subsp. vulgaris GN=BVRB_8g186610 PE=3 SV=1) HSP 1 Score: 520.4 bits (1339), Expect = 2.400e-144 Identity = 270/420 (64.29%), Postives = 319/420 (75.95%), Query Frame = 1
BLAST of Spo19708.1 vs. UniProtKB/TrEMBL
Match: A0A0K9RG31_SPIOL (Uncharacterized protein OS=Spinacia oleracea GN=SOVF_070620 PE=3 SV=1) HSP 1 Score: 385.6 bits (989), Expect = 9.200e-104 Identity = 212/472 (44.92%), Postives = 296/472 (62.71%), Query Frame = 1
BLAST of Spo19708.1 vs. UniProtKB/TrEMBL
Match: E5GAH6_VITVI ((3S)-linalool/(E)-nerolidol /(E,E)-geranyl linalool synthase OS=Vitis vinifera PE=2 SV=1) HSP 1 Score: 373.6 bits (958), Expect = 3.600e-100 Identity = 200/450 (44.44%), Postives = 276/450 (61.33%), Query Frame = 1
BLAST of Spo19708.1 vs. UniProtKB/TrEMBL
Match: E5GAH7_VITVI ((3S)-linalool/(E)-nerolidol /(E,E)-geranyl linalool synthase OS=Vitis vinifera PE=2 SV=1) HSP 1 Score: 373.6 bits (958), Expect = 3.600e-100 Identity = 201/450 (44.67%), Postives = 276/450 (61.33%), Query Frame = 1
BLAST of Spo19708.1 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: NES1_FRAAN ((3S,6E)-nerolidol synthase 1 OS=Fragaria ananassa PE=1 SV=1) HSP 1 Score: 374.4 bits (960), Expect = 1.900e-102 Identity = 199/420 (47.38%), Postives = 262/420 (62.38%), Query Frame = 1
BLAST of Spo19708.1 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: TPS13_RICCO (Probable terpene synthase 13 OS=Ricinus communis GN=TPS13 PE=3 SV=1) HSP 1 Score: 370.2 bits (949), Expect = 3.600e-101 Identity = 189/425 (44.47%), Postives = 271/425 (63.76%), Query Frame = 1
BLAST of Spo19708.1 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: NES2_FRAAN ((3S,6E)-nerolidol synthase 2, chloroplastic/mitochondrial OS=Fragaria ananassa PE=1 SV=1) HSP 1 Score: 366.3 bits (939), Expect = 5.200e-100 Identity = 194/420 (46.19%), Postives = 259/420 (61.67%), Query Frame = 1
BLAST of Spo19708.1 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: NES1_FRAVE ((3S,6E)-nerolidol synthase 1, chloroplastic OS=Fragaria vesca PE=1 SV=1) HSP 1 Score: 364.8 bits (935), Expect = 1.500e-99 Identity = 198/425 (46.59%), Postives = 262/425 (61.65%), Query Frame = 1
BLAST of Spo19708.1 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: TPS4_RICCO (Probable terpene synthase 4 OS=Ricinus communis GN=TPS4 PE=3 SV=1) HSP 1 Score: 323.9 bits (829), Expect = 3.000e-87 Identity = 184/430 (42.79%), Postives = 256/430 (59.53%), Query Frame = 1
BLAST of Spo19708.1 vs. TAIR (Arabidopsis)
Match: AT1G61680.1 (terpene synthase 14) HSP 1 Score: 298.9 bits (764), Expect = 5.700e-81 Identity = 166/422 (39.34%), Postives = 237/422 (56.16%), Query Frame = 1
BLAST of Spo19708.1 vs. TAIR (Arabidopsis)
Match: AT4G16730.1 (terpene synthase 02) HSP 1 Score: 193.0 bits (489), Expect = 4.400e-49 Identity = 126/430 (29.30%), Postives = 205/430 (47.67%), Query Frame = 1
BLAST of Spo19708.1 vs. TAIR (Arabidopsis)
Match: AT4G16740.1 (terpene synthase 03) HSP 1 Score: 176.8 bits (447), Expect = 3.300e-44 Identity = 121/418 (28.95%), Postives = 203/418 (48.56%), Query Frame = 1
BLAST of Spo19708.1 vs. TAIR (Arabidopsis)
Match: AT3G25820.1 (terpene synthase-like sequence-1,8-cineole) HSP 1 Score: 172.9 bits (437), Expect = 4.700e-43 Identity = 123/439 (28.02%), Postives = 207/439 (47.15%), Query Frame = 1
BLAST of Spo19708.1 vs. TAIR (Arabidopsis)
Match: AT3G25830.1 (terpene synthase-like sequence-1,8-cineole) HSP 1 Score: 172.9 bits (437), Expect = 4.700e-43 Identity = 123/439 (28.02%), Postives = 207/439 (47.15%), Query Frame = 1
The following BLAST results are available for this feature:
BLAST of Spo19708.1 vs. NCBI nr
Analysis Date: 2018-06-29 (blastp Spinacia oleracea peptides vs. NCBI nr) Total hits: 5
BLAST of Spo19708.1 vs. UniProtKB/TrEMBL
Analysis Date: 2018-06-29 (blastp Spinacia oleracea peptides vs. UniprotKB/TrEMBL) Total hits: 5
BLAST of Spo19708.1 vs. ExPASy Swiss-Prot
Analysis Date: 2018-06-29 (blastp Spinacia oleracea peptides vs. ExPASy SwissProt) Total hits: 5
BLAST of Spo19708.1 vs. TAIR (Arabidopsis)
Analysis Date: 2018-06-29 (blastp Spinacia oleracea peptides vs. TAIR) Total hits: 5
InterPro
Analysis Name: InterPro Annotations of S. oleracea
Date Performed: 2018-06-29
GO Annotation
GO Assignments
This gene is annotated with the following GO terms.
RNA-Seq Expression
Co-expression
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