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Sequences
The following sequences are available for this feature:
Legend: polypeptideCDSexonthree_prime_UTR Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.ATGGGAATGACTCAACGGATAAGGTCAAGCCTCCCTCTCTTTCGTAGACTCACTTCCCAGAAATCAAATCTTCAAACCACGCTTTTCTCCTCCCACAGAAGCTTTGCTACTTCTTCTGCTCCTCTCCCCAAGAATTACAATCTCAAGGTTTTTATTTACTTTTCTTTTTAGTTTTTATTATTTCAATTGGTTGATTTTTATTAATACGAGCATGCCTTAGTTTTAATTTCTTTATGTTTTCAGTACTCGATATTTAAATTACTAGCTCTGTCCGGATTTATTTGTTGTCACATTGCTAGTTCGAATTATGATATAAGAAGTAGACTTGATTATTAATTCCAAGTAGAAGTGTTTTTTCTCAATGTATGATAATGTTGATTACTGTATTCCAAATTGTTTTCCTATATAGCGTTCTTGAGAAAGATGTGGTGATTATTCGTCAAAGCATAATGTTTACATTCAGGGAGCTATCAATTTAGTATATTGGCAAGTTAATTCATTGGTTGACGAGAAAGAGAGAGTTGTACAAGCATACCTTTCTCAACTTGATACCCTTCTTAGGGTCCGTTGGTTTCAACTAATTTAACTTATTTTGTTATATTTCAGAAAAAATAAGTTCAAAAAAGTAAATTCATTGATGAACTTGGTGTTGTCCCCTCTGTCAAAGGATCAATAATTGTTGTTCCCTTTGTCAAAGGATCAATAATGCTATGTTGTGATAATAGTAAGTGTTTTTTTTCCAGACAATTTAACACACAAATAAGTTTTTCTTTTTCCCATACAAAACGAGGAAAACTAAGTTCATATAAGTTAGTTTCAGTCAAATCAGGTGAACCAACCCCTAGTGGTGTTAATTTGTGCAAGTGTAGCAGTTGATGGTGTCAATAAGGGTTTGTAGTGGCTGTCTTAACTTACTCAATTTAAAGAATCGTTTTCTGGAATCACGAATGCATTAATTTTTTTTGCCAGTGTTGTTGGAAGGGACTATGCATGTATTTACATGTAGGATACGCGTAACAATATTTCCGGCACAACTTATGCTACAAATATTTCCTTGTATCTTTACAACACTGTTTTTTACTACTCTACATTGTCATATCTTGGATTCTTGGGTTTAGGGTTGCTTACATCTCCACGATGCCAGTCATATTGTGGGTGGGTTTAGGAAACATATATTATTATTTTGAATTTATTATGATACAGATAACAGATCTGAGTATAGAAATTCAGATTATTATGTGTTTGATGTGGAGAAACGTGAACAAGTTATAAAAGTAACCGGATAGTACTAAAAAGTCTCGGTTTTGAGGGCACACAACTCTCGATTTTAATTCCTAAACCCTAAATAACAAAGCTCATCCGAAGAAAAAACAATTCTCAAAAAACTCTATGAATTTTATTGAACATAAACATGCCTTTATATAGGTTACAAAATAGACCTAAACTTGGAATCCCTATTAGCTTAGGAAACCCTGAAAACCAGAATTTAAAACAGCAAAGCTAAAGCAAGTTAAAATTGTTATTGTCTCGATCATTAACTCAAAAGGTTTCACTTCATTAATTACTACTTTAGATTTCTTGTACTCAATGCACACCTTTTAAACAAACTCTCTACATCTTAATACACATTTGTTACACTCTAATATCATGTACTCAATGTACACCTTCTAAGCATTTCAAGACTCTTCATATGTTTATTGCTTAATTAGATTTTGCTCATGAGTTTTTGGTCTCACTTGGACGGTTTTCTCATTTTGGGTGTAGTTTAAACTTCAGTTTGTTTTATGTTAGATTAAATAATTCGATTAGGATTAGGAGTTGGTTTCCTAGCCCTATTAGGATTCGGTTTTAGCTTGTGTTTCGTGATTTTCAATTCGTAGTTTGTTTAGGATTTTTTTTTCAATTTACTAGTTCCTAAGTAAGGTAGAATTTGCTTTTCTATTCCTAGTTGATTTAGGAATTGTTTTCCAATTCTAATTAGGTTTGGAGTCAAACCTGAATATCATGAAGAAAAAGAAGAAAAATTATTATTGTTGCTTCTTTGCTATGTGTTAGTTAGTTTGGATGTGTTGGGCTAAGGTTTTCATTGAAAGATTGGGAGCTGATTTTGAACACATATTGAATATTGTTGAAAGAGAAGAAAAATTGTTAATGTCAATCTTTGCACTTTCTGCTATGATTTTTTTTTTTAATTTTATAATTTGGTGTTTGAGGGGCAGTTTCATGTTTTTTATTAGTTTTAAAGAACTAATGATATAAAACAGGCTTCATTTTGCATCGTTTTAGAATATTAAAATTATCAAAAATGCAAAAGTAAATGGAGTCCTGTTTATGCATTGTATGTCTGTCTAGTACTTTCTGGATTGCTTTCGTTCGCTGCTAAAATATATTTTTTTGATGCTCCTTGGGAATATATAACAAATAATTCAACAGCTGTGTTTTTAGAAAAACTCCTTTGAAGGTTAAATTTTTTGTAACTGGAATCCTAGATTTGCTTGTATACTCCATTGGAAGGGTATATGGTTTAGTTTGTTTTCAGATATTTCTCATTCAGTTTTCCTGGAAAAAATTGTTACATTTGTAAGTGTGTAAACAAAATTTTAATTTTGGGACTAAGGCTTTGTTGTTGTTGTTGTAAACAAAATTTTAAAAGTGAAGTGAACGAAGAGCTGAGAAAACAAACCAAGGATCTGGGTGCGTGGCCCCCATTTTTTACCTTTTAGGTTATTAACAGGAGCAGTGTTAGGCTTTATTCATTTTACAGTTCAGTAATTGCTAATAGGTCTATAATCATATGATTTCCTGGAGAAATTGGAAATGATCCACTGCAATATGTAGCCGGCTATAAGGAGCTCATAAGTTATCTTAGATAAACTTAAGAATATTTAGCTTACATGTTTATCTATTATAGTAAGTCATCTGTAACCTATGCACTTCCTTGAGAGGTAAAAGTATTATGAGGCCCAAAACAGTACCAATTGGATTTTTGTTTCTCTAGGTTAAGGATAATAAGAGAAAAACTGAGCCTAGATGTAAATTATTACCACAACTTGGTTTTGCATTGAATTTGATTGTTCATTCTAAAAACATCCACCTTCCTATGGTTGTGTCTTATTGTGCTCTATGTCTGTCTGTTGATGTATAGGGAAGATTATTGACAGGAGCAACAATTGGCTTAATTATAGCTGGAGGAGCTTATGTCAGTACAGTAGATGAAGCAACATTCTGGTATTTCTTTGGTTCATCATTTTATCAGTGATACTTTTACCTGGTATCTTTCTGGTCATTTTTTGTTTGATAGATCTTTAGTATCTGCTAATAAGCAATCTACCCTGTCTGTTTGTAGCATGAAAGGAACGGCAAACGAGAAAAAAGAACCGCAGGATTTTGGGTGGCAAAACATAGTCTTTTTTTAAATTTTTGGTCAAAATTTCTGCCCCCAGTTTTAATGGTATAAACCTTCACAATTCAAGTAGTGATAAGAAACTCTAGTATTATGTTATCCCAACTAAAAGACCTGTCTAGTAACTCTAGTTCCTTGGAAATGTGAGCATCCTTCTTGCCATAAGTTGCAATAGGTGGCGTTTAGAAGTTTGATTATTTGACAAGAGAACTGAATTGACTCATTGAGGCAACCCAAAGTGTAATATATAGTTAGATTGTCTTGTGTTTATGATAATGCGTGAAAGCTGTAAGTTCGATGATCATGCTGGAGAAGAGAGGTTCGATCGATTAGATTGATAGTGAAAATTCTTTACCGTTGATGCAAAGCTACCCGAACAACAATGTTCAGAGCAGCCAATCCTACTTAGGTTAACAGTCCATGCCACTCACCTAAAAGAGTGACTAAGGTAGTCAAAGCAGGACAAGCAGAGTTGACGAAAGCCAGTGAGACATGCTTATGAGTCATGACATGGCAAAATCACGTGTGATTCTATGAAGGCTACTTGAGAAGTGGGATCTATGTTATTGCTGCTCTTGAATAAAATTAGGAATCTCGACCTTCAACAAAAGTGACAAGACACATTGTTTTAAGCTATGTTACTTGAGTCTTGACACTCCTGTTGACGAAGGGTGTCTGGTGTCGACACGAAGCGCGAAAGTATTGGAAGTCAAGTGTCGGGATCCCTAGCTGAAAATATTTTCCTTGAGATATGCTATCGGTTGAGTCCCTAGCTAGATATCCTTTCCATGAAGTAGAAGATGGTTGTCCCGTTATCGCTTTTGAGTCAATTGGAAACAACCTCTCTGCAATTGCAGGGGTAAGGTTGCATACACCCGACCCCCCTTTACCCCGCTTCTTGCGGGAGCCTCTTTGCTTCAATGGGGTAATGATAATGATGCTATCGGACTGAGTCGAATAGTCGAGTATAGGGTTGGAAACTTTTTCGTCTCTGATGTTCACCTCACGACTCTGGTCGACGACCTTTTTTCCGGTCGTTGTAGATGTGAAAAATGGACCTTTTTTTAAACGAAAAATTCATTGGGAATTTGAAAGGTTACTATACTCTTCCCGAGTCTTGGGAAAAAGACAAAGCACATTCCCACGTGAATGTGTACATTTACTCTTTCTCACACTTTACTTTAGGTTTTATTAATCAAAAATACTTTTTGAATACTGAAAAGCACAAAGAAATAGTGAAAAGAGGACTCTTTACTTTATGTTTTATTTTTTGTTGTCACAAATACATGTTTTTATTCGTATTTTGAATTTCTTCGTTTTTTATTTTACCACCTATTTTTTTTTTTCATTTCTTAATTAAACATGTATATTTTTTTCCTGACATTTTTATATAATAGCCGTGTCTAACGGACTACTCAAGACACTCCTTTGACCGTGTCCTCATACCATCAAAATTTTGGATTGAAGTCTTGGATCCTCCAATCCCTTATCGGACATGACACCTAACTCCAAGTCTCACAAGTCACAACATAGGTTTTAAGAGATAAAGGAGGAATCATAGTAAACTCACACAAAATGACAAAGATGCTAA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MGMTQRIRSFATSSAPLPKNYNLKGRLLTGATIGLIIAGGAYVSTVDEATFCGWLFSATKLVNPFFALLDPEVAHRLAVSAAARGWVPREKRPDPSILGLEVWGRKFSNPIGLAAGFDKNAEAVDGLLGLGYGFVEVGSVTPVPQDGNPKPRIFRLREELAIINRCGFNSEGIQAVAKRLGAQHGKRKLDETSSTSSTANDGGKPGGKAGPGILGVNLGKNKTSEDAANDYVQGVHTLSQYADYLVINVSSPNTPGLRQLQGRKQLKDLVKKVQAARDEMQWGDEGPPPLLVKIAPDLSKQDLEDIAAVALALQVDGLIISNTTISRPDSVGQNALSQEVGGLSGKPLFNMSTSVLKEMYILTRGKIPLIGCGGIGSGEEAYKKIRAGATLVQLYTAFAYGGPALIPRIKAELAECLERDGYKSVNEAVGADCI Relationships
The following mRNA feature(s) are a part of this gene:
Homology
BLAST of Spo19799.1 vs. NCBI nr
Match: gi|902189601|gb|KNA11417.1| (hypothetical protein SOVF_135410 [Spinacia oleracea]) HSP 1 Score: 848.6 bits (2191), Expect = 4.900e-243 Identity = 427/427 (100.00%), Postives = 427/427 (100.00%), Query Frame = 1
BLAST of Spo19799.1 vs. NCBI nr
Match: gi|731368826|ref|XP_010696360.1| (PREDICTED: dihydroorotate dehydrogenase (quinone), mitochondrial isoform X1 [Beta vulgaris subsp. vulgaris]) HSP 1 Score: 787.3 bits (2032), Expect = 1.300e-224 Identity = 398/427 (93.21%), Postives = 414/427 (96.96%), Query Frame = 1
BLAST of Spo19799.1 vs. NCBI nr
Match: gi|731368828|ref|XP_010696361.1| (PREDICTED: dihydroorotate dehydrogenase (quinone), mitochondrial isoform X2 [Beta vulgaris subsp. vulgaris]) HSP 1 Score: 781.9 bits (2018), Expect = 5.600e-223 Identity = 396/427 (92.74%), Postives = 411/427 (96.25%), Query Frame = 1
BLAST of Spo19799.1 vs. NCBI nr
Match: gi|356536427|ref|XP_003536739.1| (PREDICTED: dihydroorotate dehydrogenase (quinone), mitochondrial-like [Glycine max]) HSP 1 Score: 744.6 bits (1921), Expect = 9.900e-212 Identity = 372/428 (86.92%), Postives = 396/428 (92.52%), Query Frame = 1
BLAST of Spo19799.1 vs. NCBI nr
Match: gi|645237609|ref|XP_008225285.1| (PREDICTED: dihydroorotate dehydrogenase (quinone), mitochondrial-like [Prunus mume]) HSP 1 Score: 743.4 bits (1918), Expect = 2.200e-211 Identity = 365/425 (85.88%), Postives = 399/425 (93.88%), Query Frame = 1
BLAST of Spo19799.1 vs. UniProtKB/TrEMBL
Match: A0A0K9QVV7_SPIOL (Dihydroorotate dehydrogenase (quinone), mitochondrial OS=Spinacia oleracea GN=SOVF_135410 PE=3 SV=1) HSP 1 Score: 848.6 bits (2191), Expect = 3.400e-243 Identity = 427/427 (100.00%), Postives = 427/427 (100.00%), Query Frame = 1
BLAST of Spo19799.1 vs. UniProtKB/TrEMBL
Match: A0A0J8BAN2_BETVU (Dihydroorotate dehydrogenase (quinone), mitochondrial OS=Beta vulgaris subsp. vulgaris GN=BVRB_7g179560 PE=3 SV=1) HSP 1 Score: 787.3 bits (2032), Expect = 9.300e-225 Identity = 398/427 (93.21%), Postives = 414/427 (96.96%), Query Frame = 1
BLAST of Spo19799.1 vs. UniProtKB/TrEMBL
Match: A0A0J8BAQ1_BETVU (Dihydroorotate dehydrogenase (quinone), mitochondrial OS=Beta vulgaris subsp. vulgaris GN=BVRB_7g179560 PE=3 SV=1) HSP 1 Score: 781.9 bits (2018), Expect = 3.900e-223 Identity = 396/427 (92.74%), Postives = 411/427 (96.25%), Query Frame = 1
BLAST of Spo19799.1 vs. UniProtKB/TrEMBL
Match: I1LF90_SOYBN (Dihydroorotate dehydrogenase (quinone), mitochondrial OS=Glycine max GN=GLYMA_10G286200 PE=3 SV=1) HSP 1 Score: 744.6 bits (1921), Expect = 6.900e-212 Identity = 372/428 (86.92%), Postives = 396/428 (92.52%), Query Frame = 1
BLAST of Spo19799.1 vs. UniProtKB/TrEMBL
Match: A0A0B2RWE3_GLYSO (Dihydroorotate dehydrogenase (quinone), mitochondrial OS=Glycine soja GN=glysoja_013580 PE=3 SV=1) HSP 1 Score: 744.6 bits (1921), Expect = 6.900e-212 Identity = 372/428 (86.92%), Postives = 396/428 (92.52%), Query Frame = 1
BLAST of Spo19799.1 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: PYRD_ARATH (Dihydroorotate dehydrogenase (quinone), mitochondrial OS=Arabidopsis thaliana GN=PYRD PE=1 SV=2) HSP 1 Score: 708.0 bits (1826), Expect = 6.400e-203 Identity = 350/433 (80.83%), Postives = 390/433 (90.07%), Query Frame = 1
BLAST of Spo19799.1 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: PYRD_ORYSJ (Dihydroorotate dehydrogenase (quinone), mitochondrial OS=Oryza sativa subsp. japonica GN=PYRD PE=2 SV=1) HSP 1 Score: 695.3 bits (1793), Expect = 4.300e-199 Identity = 343/409 (83.86%), Postives = 376/409 (91.93%), Query Frame = 1
BLAST of Spo19799.1 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: PYRD_RAT (Dihydroorotate dehydrogenase (quinone), mitochondrial OS=Rattus norvegicus GN=Dhodh PE=1 SV=1) HSP 1 Score: 384.0 bits (985), Expect = 2.100e-105 Identity = 210/398 (52.76%), Postives = 271/398 (68.09%), Query Frame = 1
BLAST of Spo19799.1 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: PYRD_MOUSE (Dihydroorotate dehydrogenase (quinone), mitochondrial OS=Mus musculus GN=Dhodh PE=1 SV=2) HSP 1 Score: 380.6 bits (976), Expect = 2.400e-104 Identity = 215/412 (52.18%), Postives = 275/412 (66.75%), Query Frame = 1
BLAST of Spo19799.1 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: PYRD_HUMAN (Dihydroorotate dehydrogenase (quinone), mitochondrial OS=Homo sapiens GN=DHODH PE=1 SV=3) HSP 1 Score: 377.5 bits (968), Expect = 2.000e-103 Identity = 198/377 (52.52%), Postives = 258/377 (68.44%), Query Frame = 1
BLAST of Spo19799.1 vs. TAIR (Arabidopsis)
Match: AT5G23300.1 (pyrimidine d) HSP 1 Score: 708.0 bits (1826), Expect = 3.600e-204 Identity = 350/433 (80.83%), Postives = 390/433 (90.07%), Query Frame = 1
The following BLAST results are available for this feature:
BLAST of Spo19799.1 vs. NCBI nr
Analysis Date: 2018-06-29 (blastp Spinacia oleracea peptides vs. NCBI nr) Total hits: 5
BLAST of Spo19799.1 vs. UniProtKB/TrEMBL
Analysis Date: 2018-06-29 (blastp Spinacia oleracea peptides vs. UniprotKB/TrEMBL) Total hits: 5
BLAST of Spo19799.1 vs. ExPASy Swiss-Prot
Analysis Date: 2018-06-29 (blastp Spinacia oleracea peptides vs. ExPASy SwissProt) Total hits: 5
BLAST of Spo19799.1 vs. TAIR (Arabidopsis)
Analysis Date: 2018-06-29 (blastp Spinacia oleracea peptides vs. TAIR) Total hits: 1
InterPro
Analysis Name: InterPro Annotations of S. oleracea
Date Performed: 2018-06-29
GO Annotation
GO Assignments
This gene is annotated with the following GO terms.
RNA-Seq Expression
Co-expression
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