Overview
Sequences
The following sequences are available for this feature:
Legend: polypeptideexonCDSthree_prime_UTR Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.ATGTCTGTATTGTGGAGGTATGCTTCTTTGTTCGACAAGGGTCCTCACTTCTTTGGTGATTTTTTCCTTTCTTTTTTTCCCTGGGAGAACTGTCAAGCTAGCTTGGCGACCTCTTGACAAGTTCAGTAAAAAGAAATCCCCTTTTCTGGCGTTAATTTTTTGTTTTTGTTTCTTTTTTAGTGTGAAGCAGGAACCTGTGGTTAATTTTCGCACTTGTCTTTTTTTGTGAATTGTAGCACTGTAGGCTGTAGCAGTACCTTCATAAGTCATAGTTTTAGTGGATCTCTTTACTTCATACATATTTGATATTTCCTTTAACGATGGCCTATCTAGCACTGCATATTTTTGTTTGAGGGGCCTTGAAAATAAACGAATAGAAATCTGGAGGTAAGAATTTCATTTCCAGAATAGAACAATAAGGAAGGGTCTGAACTCTGAAGGTTCTCGTTGGACATTACTACTCATTTACGACTATTAAGAGTACTTTCTTTCATTGAATAGCGAGCATCGTTTAGGCTCCGTTTGGTAGGGCGTAAAACGTTTTCATGGAAAACGATTTTTCCCCTTTCAATCAATTTACGTTGTTTGGTTGGGTAAAGGATGTAAAACAATTTTTCATGACTCTCTCAAAGGTGAAAAACCTTTTTCCATTTGAAAGGAAGGAAAATCACTTTTCCTTCTTTCCTCCTTACCTCCCTCTCCTTTCTTCCCCTCAATCCTCACCATCTTCTCCCATTTTCCTTTAAGTTACCAAACAAAGGAAAACTAGTTTGGAATTGTGTTTTCCCTTGAAAAATGTTTTCCATGGAAAATCATTTTACAATAAAAACGTTTTACGCCCTACCAAACGGAGCCTTATTATAAACATGTCTCAGATTTGTTGTAAATGCCCTCGCTCGGGTATACTTATCAAAGAGCTTTGGCCCCATGGACTCCTTTCTCTGAGTTCACAGAAACGGAACACGGTTGCACTAAGAATATCAGTAGGAAGTGGGACTAGAAGAGTGATGCCTTTTTCTCCTATATTTTCAAGTTCTAACAGGTTTTTAGGCCCGGCCATTAGGAAGTCTATATAGACCTATTATGTTGTCCACACGATGCACATCCGGGTAGGCTCTTTAAGACAAAATTCCAATATGACCTTGTCTACTCTGACCGGAGCCTACAAGGAAGTGACGATATATTTGGTACCTCGGCACTCAGCTTGACCCTTCACTCTTGTAGAGACTTACATAAAATTATATGCGCATAATTATCATGTTCCATGCTAAATGTTAGTTTCGTGTAGAAAAATATGTGCTATCAACCAACCAACATATAGTTTTGTTGGGAATTAATGCTAATCTAATTAACATGCGGAAACATTCACCATAACCAAGATCTCATGCAAAAGTATAGATTAAATGTAACATACATTTGTAATGTGTACTCCCACTAGCCTCAGAAGCATGATAAAAAGCACCACGTGTAGTTCCTCTATAATCGTCCACCGACACATTCGGATCCACCTTGATTCCATTAGCTTAGAACTTTCTCAAAGGTGTTTGGCTTTTTTGGAATACTCACTCTTGGAGGCACACAACGAATTAGGGTTTTTAGTGTGTGTTAGGGTTGGGAAAACAACTTAGGGTTATGAAATAATCCCTTGGGGAATAAGTATGCTAACTGACCAAAGCACAAGGCTTTTGCCGGCCAGCTCCTCACACGCAAGCCCTTAGGCTGTGCTGTGCATTCGTGATGTTGCTGCTTTGTGCATGCTCACCTGCGCAAGCCCAACAATGGCCATGGGCAACTCTGTAGCGCCCATGGGCCTTGTGCGCTTGGCTTGTGGGCCCCAGCGTTGCTCGTCCCTCTTCGTATTTGCATCTAAGGCCTTACGATCATTTTATCGTATAGTACTTAACGATATAGATCCAATGTGGTACGTTATGATTATTCATACGGCCCAACCTACGAATATATGCATTACGATATACAATTACGATCCAACAAATTATCGTATACTTATATTTTTCAAACTAAATTCCCAATAAGCCATTAAATGGATTTCCGATTCATTAAATCCGGTGATCTGTAATATGTCATTGGTATGACCTTGTAGGTTCAGTCAAGAATAAGTTGTGAGCCTAATAAGGATTATAACTCACTAATCGGATACATTGCTCCAGCTAGATGTTCCGATCACTTAATCTTACTAAATTAATTATTCTGTAATTAATCTGCACCTTTGTATTAGACTAATGCACTTTGGGTGAATGACACATTTCCTTCAAGTTTAGGGTCAACAGTTGTCAAAACAAAAAAGCTTAAAACGTCAAGGATAAAAAAATCGAAATGAATAGAACGGAAAACTACCGTGCTACGAAAACCTGCAGGCGCCAGAAAAGTATAGCGCTTGACAGGAAGGGGTGAAATTTCCAAAACTTCCCCCTTGCCGTAAGAAATTTGTAGCGCAAGCATGCCTATTGGAAGTCAACTCTGCCTCGAACTTACAAAATGGACGAAAGCTTGTAGGAGCCAGAAAAATCCAGCGCCTGCCTGTAACACCCTAATAATTCCTTGCCCTTATAAAACCGTTTTCCAACTTAAAATAAAAGAATTAGTAAAGTATTATCGCCACCGTGATAACAGTTAAGGCTAGTACCAGAATTACGCAGCAGAAATATAACTAACATTTAAACAATAAATAATAGTTAATGGCCCCCCTACAAATTAGAACCATAACGGCCCAAAACCAACTACGTTAGATAAATCCATTAACTAAATAATTCGAATAGTCTAGACTAACAAAAATAGTAGAGTTTATAAATGCAAGAGAAAATCATCGCTCAACCATTTCCCCATGCTAGATAACTTCTTCAGTAAGTTATCTCTACAAACCTGTTTATTTAAATCTACTCCCCAACAACGCAAATGCAATGATGGATCATCATAGGGTCATTAAGGCGAAGGCCATGACCAAAGAGACATAAAGCACGTAGTCAGCGAAAGCTGAGTACAAACAAGCTAGAATGAAATCCTAATATTAACATAAATCACTCAACAATAAAATAATCCACATGAAAAAGCCATTTAATAAACAATTAATCATGAAGACAAGATTCGATTCTCGACACGACTCTTGACTCATATATTAATTTAGAATAAGCTTCGAATGTGCCTAAAAAGAAATGTCCATTAGACAGGTGTTGGGAGCCCACCAAACACCAAAATAATAATAATAAGAGTAACCCAGTTATAGGACCATACCGACGGAATTCCAGCGCATAAAGGAATGAAACAACGTCTTGTATCATTAATAGAAGTACAAACCCCTTGGTAAGATACTCCCCCCATTGTTCATACGCAAGGTATATACGTTCCAAGAGTTTTGAAGCTTGTTCAGGTTGCACTTTACGTTTATTAATATTTTATTCACAAGGTGAACTCAAGACACAAACAAAATTTACTTTTTTTAGGCGAAGAACCAAACAATACTTCTTTTATAAATCGTTAGGACTTGAGATCAAACATTCAAGACTCAAGTGATATTACTCCATGGTTCCCTCTCAACATACAGTTGAGTCCCCAACATGCCTGTTAGGTTGTGCACTAGGCACGAATAATCCTAGTTCAATTCACTTGACTTCCCAAACATACCCTACATATGCGGTGGCTTACATGAGCATACCTTCACATGTGGTAAAATAAATAGTGCAACGACGTACGAATAACTTGGCTCAAATATGCTAGACATTACGTACAATAACATAAGAATAATCCCTTGCATGCGAAATAAATCATACATGCATAAAATACTGGAACAACATGCTTGATATTAAATTCAACAATCATAAATAATCTCAACATGCTTGTTCACTTAAAATCCACAATTCAATAATAATCCAAACATATTCGTTCACACCATCAAACATGAATCCATAATAATCCAAGTAACATGAATCACAATAATAAAACATCACATGAATCCTCATGAAAATAAGGTGGTCGCCCTAGACATGTACGTACCTTGTATATCTAATTGCGGGGGCCACAATGTGATCCAAGCTCTAGGTTAGAAATCTCCTCCTATCATTAAAATAATGAAATTCAATTATTATTCATGTTCATTAAATTTCCAGCAACTTTATTTAGTTTTAAAACACTTGAATTAATTAGAAATTAATCGCTTGTTAATATAATAATAGTCTCAATTGAACAACTAAAGCCCTAGCATGAAAATAATTTATTTTCATACTAAAACCATTAACAATTGACACTTTAGGTCTTTAAAACAAATATGAAAATTATAATTGATTATCAAAATTAAAATTGTCATCTAATTATGCTAATCAATTAGTCATATGATTTGAACTAAAACCCTAACCCTAATTCACCATTAAAATCAATTTAAACCTTAAAACTCAAAGCTTTATTTAATAATTCAAATCCAAAAATTATTAAACTCCAAATAAAAATGCTCCTCAATAATCTAAACACATAAGTCCTCAAGTTTGGTGTTCATAACCAATCCCAGCATAATAATCAATCATAATCCAATGTTAATCATAAAAATCCATAATTTAAAACATAATTTAAATAGAGAAGATTAGGAAGAAGAGGAATTATACAAAGTCTGGCTATAGCACGGCACAATCACGAATTAATGTGACCGGACGCAAAAGAAACGGACCAACAAGAGGAAGGAAGCACGACAACACAACAGTGGTGCTGTTGTTGCGTGCGAGTGTGTGGGCAGCAGGGGAGCGAGCACAAGACAGGGGCAGCGAGCAGGGGCAGCGAGGCAGGGGCACTGGGCGTCGAGTGAGCAGGAGCCCTGGGCGCTGGGGGTCAAGGCAGACAACACGCAGCAGCAGCAGCGAGGGCACGCGAGAGGGAGATGGGGCAGCGAGCACTGGCTCGCGTGGCTAAGCAGGGCGGTACGCAGCAGCAGCGAGGCACGCGTGTGGTGCGGTGCTCGGCTGGGCGCACGATGGGAAGGGAAGGAAGGAGAG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ATGTCTGTATTGTGGAGTGTGAAGCAGGAACCTGTGATTGGTCCAGAAGACATGCCTTTATCGAAGCAATATCGGTGTATGCATTCAGCGAGTTGTGCCTGTACAAAAGGGCATCTAACAGAGGACGTGATTCTCCTTGTTTTCCAGCAATTAAATTGGAACCCTAAGTTGATTGCGGCTTTCTCCTGTGCTTGTAAATGGTTTGATGATTTTGCAAAGAGAGTTTTGTGGAAAGAGTTTTGTAAGACAAGAGCTCCTAAGATGATGATTGATCTGCATTCTAGTGGTAGTCATAGTGTTGATGGGAGCTGGAGGGCACTTGGAAAATTGCTTATCTATTGTTCAGGTTGTACCAAAGGAGGCTTGTTCAATAACATTCACATCCCTGGTCATTTTGTATATAGAACCCGATTCTCAAGAACATCAGGAAAGAGTTTTCTTTTGCCACAGTGCAGATCAGATGTTCTGTATGTCTCGGATCCTTGTGAACATCTTGACCAAGGGGAAGATGGAGATATTGGATTTTTCAGGGGTATGTTCAAGTCTTTTTCAATGTCCAAGGTTCGCAAGTTGCTGATCAAAAGAAAAGCAGAACTTCACCCTACAGAGGCGTGCCCTTATTGTAAGGCAAAATTGTGGAGTATGCAAGAAGCAAAAATGATACCACAGAGTGCCAGTTGCAGGTTGGGAGCTTATGAAGATTGCATTGAGTATTATGTTTGTCTTAATGGTCACATGCTTGGGCTCTGCACTCTTTTGCCCTTGTCTGAATCCGAGGAAGCATCTGAATTGGAGTAA MSVLWSVKQEPVIGPEDMPLSKQYRCMHSASCACTKGHLTEDVILLVFQQLNWNPKLIAAFSCACKWFDDFAKRVLWKEFCKTRAPKMMIDLHSSGSHSVDGSWRALGKLLIYCSGCTKGGLFNNIHIPGHFVYRTRFSRTSGKSFLLPQCRSDVLYVSDPCEHLDQGEDGDIGFFRGMFKSFSMSKVRKLLIKRKAELHPTEACPYCKAKLWSMQEAKMIPQSASCRLGAYEDCIEYYVCLNGHMLGLCTLLPLSESEEASELE Relationships
The following mRNA feature(s) are a part of this gene:
Homology
BLAST of Spo21323.1 vs. NCBI nr
Match: gi|902228662|gb|KNA21211.1| (hypothetical protein SOVF_045430 [Spinacia oleracea]) HSP 1 Score: 533.5 bits (1373), Expect = 2.100e-148 Identity = 248/248 (100.00%), Postives = 248/248 (100.00%), Query Frame = 1
BLAST of Spo21323.1 vs. NCBI nr
Match: gi|731319310|ref|XP_010670190.1| (PREDICTED: EID1-like F-box protein 2 [Beta vulgaris subsp. vulgaris]) HSP 1 Score: 517.7 bits (1332), Expect = 1.200e-143 Identity = 239/248 (96.37%), Postives = 245/248 (98.79%), Query Frame = 1
BLAST of Spo21323.1 vs. NCBI nr
Match: gi|223534569|gb|EEF36266.1| (conserved hypothetical protein [Ricinus communis]) HSP 1 Score: 489.6 bits (1259), Expect = 3.500e-135 Identity = 219/264 (82.95%), Postives = 245/264 (92.80%), Query Frame = 1
BLAST of Spo21323.1 vs. NCBI nr
Match: gi|224080173|ref|XP_002306041.1| (circadian clock coupling factor family protein [Populus trichocarpa]) HSP 1 Score: 487.6 bits (1254), Expect = 1.300e-134 Identity = 218/248 (87.90%), Postives = 238/248 (95.97%), Query Frame = 1
BLAST of Spo21323.1 vs. NCBI nr
Match: gi|1000952080|ref|XP_015579028.1| (PREDICTED: EID1-like F-box protein 2 [Ricinus communis]) HSP 1 Score: 484.2 bits (1245), Expect = 1.500e-133 Identity = 215/248 (86.69%), Postives = 237/248 (95.56%), Query Frame = 1
BLAST of Spo21323.1 vs. UniProtKB/TrEMBL
Match: A0A0K9RNW1_SPIOL (Uncharacterized protein OS=Spinacia oleracea GN=SOVF_045430 PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 533.5 bits (1373), Expect = 1.500e-148 Identity = 248/248 (100.00%), Postives = 248/248 (100.00%), Query Frame = 1
BLAST of Spo21323.1 vs. UniProtKB/TrEMBL
Match: A0A0J8CU46_BETVU (Uncharacterized protein OS=Beta vulgaris subsp. vulgaris GN=BVRB_2g039800 PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 517.7 bits (1332), Expect = 8.400e-144 Identity = 239/248 (96.37%), Postives = 245/248 (98.79%), Query Frame = 1
BLAST of Spo21323.1 vs. UniProtKB/TrEMBL
Match: B9SJA3_RICCO (Putative uncharacterized protein OS=Ricinus communis GN=RCOM_0524300 PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 489.6 bits (1259), Expect = 2.400e-135 Identity = 219/264 (82.95%), Postives = 245/264 (92.80%), Query Frame = 1
BLAST of Spo21323.1 vs. UniProtKB/TrEMBL
Match: A9P8I0_POPTR (Circadian clock coupling factor family protein OS=Populus trichocarpa GN=POPTR_0004s12380g PE=2 SV=1) HSP 1 Score: 487.6 bits (1254), Expect = 9.300e-135 Identity = 218/248 (87.90%), Postives = 238/248 (95.97%), Query Frame = 1
BLAST of Spo21323.1 vs. UniProtKB/TrEMBL
Match: B9IK42_POPTR (Uncharacterized protein OS=Populus trichocarpa GN=POPTR_0017s12610g PE=4 SV=2) HSP 1 Score: 481.9 bits (1239), Expect = 5.100e-133 Identity = 214/250 (85.60%), Postives = 235/250 (94.00%), Query Frame = 1
BLAST of Spo21323.1 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: EDL2_ARATH (EID1-like F-box protein 2 OS=Arabidopsis thaliana GN=EDL2 PE=2 SV=1) HSP 1 Score: 436.8 bits (1122), Expect = 1.700e-121 Identity = 197/249 (79.12%), Postives = 222/249 (89.16%), Query Frame = 1
BLAST of Spo21323.1 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: EDL1_ARATH (EID1-like F-box protein 1 OS=Arabidopsis thaliana GN=EDL1 PE=2 SV=1) HSP 1 Score: 422.2 bits (1084), Expect = 4.300e-117 Identity = 187/245 (76.33%), Postives = 212/245 (86.53%), Query Frame = 1
BLAST of Spo21323.1 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: EDL3_ARATH (EID1-like F-box protein 3 OS=Arabidopsis thaliana GN=EDL3 PE=2 SV=1) HSP 1 Score: 206.1 bits (523), Expect = 4.800e-52 Identity = 95/222 (42.79%), Postives = 138/222 (62.16%), Query Frame = 1
BLAST of Spo21323.1 vs. TAIR (Arabidopsis)
Match: AT5G39360.1 (EID1-like 2) HSP 1 Score: 436.8 bits (1122), Expect = 9.500e-123 Identity = 197/249 (79.12%), Postives = 222/249 (89.16%), Query Frame = 1
BLAST of Spo21323.1 vs. TAIR (Arabidopsis)
Match: AT5G15440.1 (EID1-like 1) HSP 1 Score: 422.2 bits (1084), Expect = 2.400e-118 Identity = 187/245 (76.33%), Postives = 212/245 (86.53%), Query Frame = 1
BLAST of Spo21323.1 vs. TAIR (Arabidopsis)
Match: AT3G63060.1 (EID1-like 3) HSP 1 Score: 206.1 bits (523), Expect = 2.700e-53 Identity = 95/222 (42.79%), Postives = 138/222 (62.16%), Query Frame = 1
The following BLAST results are available for this feature:
BLAST of Spo21323.1 vs. NCBI nr
Analysis Date: 2018-06-29 (blastp Spinacia oleracea peptides vs. NCBI nr) Total hits: 5 Position : 0 Zoom : x 1
BLAST of Spo21323.1 vs. UniProtKB/TrEMBL
Analysis Date: 2018-06-29 (blastp Spinacia oleracea peptides vs. UniprotKB/TrEMBL) Total hits: 5 Position : 0 Zoom : x 1
BLAST of Spo21323.1 vs. ExPASy Swiss-Prot
Analysis Date: 2018-06-29 (blastp Spinacia oleracea peptides vs. ExPASy SwissProt) Total hits: 3 Position : 0 Zoom : x 1
BLAST of Spo21323.1 vs. TAIR (Arabidopsis)
Analysis Date: 2018-06-29 (blastp Spinacia oleracea peptides vs. TAIR) Total hits: 3 Position : 0 Zoom : x 1
InterPro
Analysis Name: InterPro Annotations of S. oleracea
Date Performed: 2018-06-29 Position : 0 Zoom : x 1
GO Annotation
GO Assignments
This gene is annotated with the following GO terms.
RNA-Seq Expression
Co-expression
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