Overview
Sequences
The following sequences are available for this feature:
Legend: polypeptideCDSexonthree_prime_UTR Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.ATGGGTAATGGGTATGCCATTTTTTTTCAAACAGAAATGTTTCCAGTCCCCTTTATTTGCCGATTCAGAGATGAGGTCAGCTAGATATTCCATGCATATAATGAAGATATAAGGGGATATAGGATCCCCTTGTCTAATGCCCCCAGAGGTTCTAAAGCTAGGAGAGGCTTTCCCATTCACAATGAAGAGGTGGATTGGGAGGCAACACAATTCATAATAAGGTCACAAGAGTTCTTATCAAAACCCTTTCTAGCCAGACACAATCTAATAAAATTCCATTCCAATATGTCATCCTCTTCTAGTTTTTCATTTTTTTATATATTCTCTTTCCTCTTTTTTTTAGCAGGTGTGGTTAAGCGGTCAATTAAAGTGTTGAACGAAGCTGTATTAAAAAACTTTGTACTTGTGGGAGATTGGTGTACGTTAATATTACTGTACACCTGTTTTGCGCAAGACCTATTGGTGTAATTAAATACGGAATAAGTAACAAGTGACAACCACTAGAGATTTGAGACTTGAGACTAGAGCCTAAATATAAAATCAGGCTGACTGGTTGCGAAGTTGAAACCCTAACAGAGGGAGAATAAACATGGCGGGTGACAACCCAAAATCATCCTCCGAACGCAAATCTCGCTGGCAATCCTCCTCTTCGGCCGCCACCCCCACCACCACAACCACTGCCAACGCCGCCGCAAACCCTCCCTCAGGAACCCCTTCCAAATCCTCGAATAAACCATCCACCACCAACACCACCACCGCACCAAGATCGTCTTCTGATAAACCCACCACCAAACGCGTCCCTAACCCAAGCCCATCTTCTCACCCACCATCCCAATTCTCCGAGCCATCGGTACGCCCTTCTTCTCTCGGCCCACCGCCCCCTCCGCCACCTCCGATATATGGGTTTCACATGCTTGATCGCCGCACTATTATCCTTGCCGATGGAAGTGTCCGATCCTACTTCGCTTTGCCCCCTGATTACCAAGATTTCAACCCTCCCCCTCGACCCCCAATGGGGCGCTTTGGGCCGCCTCATGAGCCAGGCCGGCTCCCCCCGGTTGGGCCGATGAGTCCTGATGGTTTTCACGGTAGGGAGGATCATCCGTTTGGGTCTAATTCAATGTCTATGAAGAGGAAGTTTGGGTTTGGTGAGGAGAGAGATAGAGATAGAGATGGGGATGAGTTTGCTAGGCAGAAGCAACAGCTTTTGCAGTATGGCAATGCAGGTGCGAACTTGGGATCGGGTACTAGTAGTCCCTTCAGGCGGGACGACGAGTATCGAAATTCTAAACACATGAGGGTTGGTGCTGGTGCTAATGTTGGTGGCAGTAGTAATAATATTAATTCGAGGCAGGATGTTCGAATTGATCCTGCTGTCATGAAGGCATATCTTCATTTAGTTAAGCTAATTTATGAGGATCCTAAACAGAGAAAGAACTACTTAGAGAATGGCAAGCATCTTCAGTGCCTCGTCTGTGGCAGGTTTGATAAAATTAACCCCTTTTGCTTTAATGTTTCTTTATTATATTGTTGTAATTCAGATGTTTACTGCTTCAATGATGTGAGCTTTATGTAAATGAGTGATACTCGCACCTCTTGAGCCGACTTGGCCATGTCTCAGACTCAGGAGCTCGGAAACTTTTTGGGAATTTGAGTGATACAATAGAATTTTGGGAATTAATAGGATGATAAGTGCTTTTAATTTAGACTTTCATTTAATTTTATAACATACGAAGTACTTTAAAGCTTTAATTTAGAATGGTTTGTACTTGTGTGTGTATCCATTTTAGTGTATCCTAGACCCTTTTTTAAAGATTATTACGTATTACAAAAGGTAATAAAGTGAGGGAATTTACCTTCAAGCATGTTAGTCTCATGTAAATTGTCAGGTTATCTTGAAGATTTGTTCTTTCTTTTAAAGTGCTATTATTGGTTAGTACATCTCTGGAGCTTTTTGTGGAATAAGTTAAGGTAGGTAGCAGTGTTACCTGGTTTGCTAGTATGAGATTGGGTACGGGTTCGCAGTTCGCTACCTAATTTGCTAAATTAGACCAAAATTATACCATTTGATGTTGTAATTCGCTTTTTCGGTTCGCGGTTCGTGGGCTGATTGGAGGATTAGGTAACACTGGTAGGTAGTCATTAAATTCAAATATTGTTGAATAATACCTAGAGAATTAGAGTTACTTGTTTACTAGCTGAGCTCTTAGTGTGTGCTGTTTGTTGGTTCTCTGTACTTATATCAGCTAATGTTGTAGGCTGAAAGTGGTTCATTTTATTGGATCTTTGATTGGTCATGATTTTGCCCTTCCACTTTCTTCTGAGGTGTGCTTTACATTGAACTACTTGTATCTTGAGATGGTGCTATTTATTTGACTTGCTCAAATATACCCTTTTAGAACATAGACTAATCTGAAACTGAAAACGTTGGCTTGTTTAATTGGGGTATACTGAACTTTTTGATTGCTCGAAAACCTGGCTGGCTTTGTACAAGCACTTGGTTTTGTTATTTGTTCAATTTAGACTAGTTTTATGACGTCTTAAGATCATCTTTAAGTGACATTCCTTGTAGTAAGATTTTTTTTGTTTCCCCTCCGTTCAAGCTTTTTTATAAATACTATCCAAAATAAAACAAAATTTGACCTATAGATATGTTAATCCAAAGGAGTTTTGGACTTTGGAGACCTTATCCTCTTGCCAAAACTTGATTATTGTTAAATAATTTGGTGAACTATCTATATTTGCCTAGTTGATGTCAGTATATATTATTTCTTTCAATATTTGCCCACCATATCTTATGTGCTACACCTTTGACCAAAATATTTTCCAAATTCTGTTGTTTACCCTTTGTTACTATTAATTTTTTCGATAATTAATGTATTCTGTTGACTTAAATGTTTAACTTTAATAGCTCAAATCTTGGACTCACTCAGTTTGTCTTATCTCTTAGTTAATAAGTATGTAGTCACTGGTTTCATATTTGCTATATAAGTGATTCCTGAAACCAATTGGATGAGATACCTCGGTAAATTGTTGTATGATGTCGAAAGTAAGAAAGACAGGTTCAATTACCTGGTTATCCAATGTAGTATTAATTTTGGGGCTCTAGAGGTTGCACCCGATTGGCTATCAATATATGGCCTATTGGTCTGTAACTTAATGAAATGCCTGGATTTTGGAAGAAATTTATTAGATGCTCATCTTTATAATACTCATACATGCCCTGACATAATGGAATTTTGTTGCTCTTTGTAGGCTCTAAAAGAACAAAAATGAACATGTGCTCCTAGAGCAAGATTCCTTAGGTTTTTACAGAGGTGACACTGAGGCTCCGTTTGGTAGGGCGTAAAACGTTTTCATGGAAAACCATTTTCACCTTTTCAATCATTTTACGTTGTTTGGTTGGGTAATGGATGAAAACAATTTTCCATGACTCCCTCAAAGGTGGAAAATCCTTTTCCATTTGAAAGGGAGGGAAACCACTTTTCCTTCTTTCCTCTTTACCTCCTCCTTTCTTCCCTTCAATCTTCACCATCTTCTCCCATTTTCCTTTAAGGGTACCAAACAAAGGAAAACTAGTTTGGAATTGTGTTTTCCCTTGAAAAATATTTTCCATGGAAAATCAGTTTACAATGAAAACGTTTTACGCCTTTCCAAACGGAGCCTGAATACACATGCATGCATATGAATTACCATGCTCCAATCAAAAGCTAAGCAAGTCAACTTGCTAGGTAGCTGGCTTTCATGGGTTTATTTTAGCTTTCTTTGGCGCATCTGTGTGATACTAAGTACAACGTAGAAAAGACACTATATTCCTTTTCTAGTTTTATCTTCCATCTTATGTACCTTCCTCAATGAAGCCCCTTGGCTTACCCTTAGCATGAACCAACTAGAATGGCAACACGAGGTGTTACTTAAGGTGATGACCTAGCTTAAAAGTGTGCTTGGGATGCACCTAGGCATACCCCCCCCCAAACCTAAAGCTCAATATTTTAGATCCACAAATTCTAAAAATGAAAGCTGCATATAATTGTATTATCTCTCTGTGGGTCTGGAATCATGTTTATTTCTCTCCCCGGGCCCCTTCTCTCTCTCTCTCTCTCCACTTTGCTTTAATTTTTCTTCTTCTTTGATTTTTCTTTCATTTGTTCTCTCTGTTGTTTTTTTTTTGGTTCTTCTTTGAGGAGAGCCTTGTTGCCGACTTCTTCAATTCTTTTTATTCCTCTCATTTGTTCTCTCTCTTGTTTTTGGTTCCTCTTGGAGGAGAGCCTTGTTGCCGACTTCTTCAATTTTTTTTGTTTAGATTAGGGGTTTTAGGTTTCATCGACGCAATTTTTCTCCTCCGAACTTATTGGCCCCTATTACCTGTACACATTTGAACCTATTTGTAGTTGTAAAATGAATATGATAGCCGTTCTAAGCTTATTGGTAAGTATTCGAAAGCATTTGTTTGGTGAAAAGGATAAGGCTTTTAGTGCTTTTAGTAGTTGTATTCTTTGTTGATTTTATTTGGTAACTTGGGTTATCAGTAAAAAAAAAAAAAAGGGACTAATTCTAAGTAATCAGCCATAAATAATAGAGGAGTTAATATTTTGATATCATGATGTAGGTAGTAGGTTTCTCATTTTCTGTAGGGAAATGGTTTTTCGATTGGACATTGTTTCTTTTCCTTTTTTCATTTTCCCTCCCTTTTCTTTACAAGTTCTATGCATCCTTTATAGAGAAGTGTGTGTTACTTCCTAGGCTCCTAGCTCTTTTTCTAATTAAAAGTAAAAGAGATTTCAGTTTAAGAAAATTAAAAAAGAAAAGATTTCAGCGTTCCATGTTGCGTGCAACCACTAATTTCACTTTGAAAGAGGTCAAAACACTTCTAGTGTTCCCCATTTTCAATCACTGATCTCAGTGTTGTCAAATCTACAAGTTGTTTGCAACCTTATGGGCTTATCCTTTGTGATGGACCTAAGGCCTAAGGGTATGTTCTATTCACCTTACTA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ATGGGTAATGGAGGGAGAATAAACATGGCGGGTGACAACCCAAAATCATCCTCCGAACGCAAATCTCGCTGGCAATCCTCCTCTTCGGCCGCCACCCCCACCACCACAACCACTGCCAACGCCGCCGCAAACCCTCCCTCAGGAACCCCTTCCAAATCCTCGAATAAACCATCCACCACCAACACCACCACCGCACCAAGATCGTCTTCTGATAAACCCACCACCAAACGCGTCCCTAACCCAAGCCCATCTTCTCACCCACCATCCCAATTCTCCGAGCCATCGGTACGCCCTTCTTCTCTCGGCCCACCGCCCCCTCCGCCACCTCCGATATATGGGTTTCACATGCTTGATCGCCGCACTATTATCCTTGCCGATGGAAGTGTCCGATCCTACTTCGCTTTGCCCCCTGATTACCAAGATTTCAACCCTCCCCCTCGACCCCCAATGGGGCGCTTTGGGCCGCCTCATGAGCCAGGCCGGCTCCCCCCGGTTGGGCCGATGAGTCCTGATGGTTTTCACGGTAGGGAGGATCATCCGTTTGGGTCTAATTCAATGTCTATGAAGAGGAAGTTTGGGTTTGGTGAGGAGAGAGATAGAGATAGAGATGGGGATGAGTTTGCTAGGCAGAAGCAACAGCTTTTGCAGTATGGCAATGCAGGTGCGAACTTGGGATCGGGTACTAGTAGTCCCTTCAGGCGGGACGACGAGTATCGAAATTCTAAACACATGAGGGTTGGTGCTGGTGCTAATGTTGGTGGCAGTAGTAATAATATTAATTCGAGGCAGGATGTTCGAATTGATCCTGCTGTCATGAAGGCATATCTTCATTTAGTTAAGCTAATTTATGAGGATCCTAAACAGAGAAAGAACTACTTAGAGAATGGCAAGCATCTTCAGTGCCTCGTCTGTGGCAGGTCTTCAAAAGATTTTCCAGATGTACATGCTCTTATTATGCATGCTTACAACTCAGATAATGCTGATTTGCGTGTGGATCACCTGGGCTTGCATAAAGCCCTTTGCGCCATAATGGGGTGGAGTTTTATGAGGCCTCCTGATTCCTCCAGGGCGTATCAACATATGCCTGCTGAAGAAGCGGCTGCATACCAGGATGACTTGGTCATGTGGCCACCCATGGTGATTATTAATAACACAAATACCGGCAAGGGTAAAGATGGCCGCATGGAAGGTTTGGGAAATAAGGCAATGGATAGTAAACTTAGAGATCTCGGATTCTCAGGGGGCAAGTCGAAGTCTTTGTACAGTAGAGAAGGCCATCTTGGCATTACGCTTATTAAGTTTTCTAGTGACCTATCAGGCCTGAAGGAGGCCATGCGATTGGCTGATCACTTTGAGAAGGATCACCATGGGCGTAGAGATTGGGCCCATGTACAATCGACTGCTACTGAGAAGAATGAAGAGAGCAATCCAAATCTTGTGATGGTGGATCAGAGGACAGGTGAAAGGAGGAGAATACTTTATGGATATCTTGCAACTGTCTCTGACCTAGACAAAGTGGATTTTGAAACACGAAAGAAGGTGGTCATTGAAAGCAAGTTTGAGAAACTCCAACTATCCAAGTGATTTTATTGCTTTGTGTCTGCTCTGGTTAATGAGATGAAGCAGGTGTCAAGTCTTCGGAAGCAGCATCTATTTACATCGTCAATGTCACAGTAACAGGTGAGGCGCGTCTTAGGTGGCCGTTGATGATGTCTAACTTGCAATTTGTGATGAATGCGGTAATCCTTGTTAACGAGGATGATTAATCTTCTTGATCAACTTGACGTTCTCATGATTATGTGGGAACGAGGGATTGGTCTCCTTGTTCCCCTTTGTTGTTTTTAGTTAATGCAAAATCCCTAAAGGGTATTATTAGATCACTGACCTCTGCTGTTCTTGTATGTTGATTGGAAATTATAAAATAGAATGAAAATTAGGCGTCAATTTTACTTATAAAATAGGTAAACCCTGTGAACGTTTACACAGGGCAGAGGGCTATCCTAGGACATGACCTTATTATGGCGATTAGATTGGCAGGCGTATTATGCACAGGCCCATTTGAGATGCAAAATGGTCATTTCTTAACAAGTTAGAGCTTCTTTTTCTTGCAAGCCGCCCTGATTTCTGAATTTGTGATAGACATTGTTGGCTAAGTTAGAGCTATTACTATTGCTGCAGATTCCAAAGAGTTGACTCCCATACCTTTCTTGACAACATTTTCGACTTCCCTTCCCACCATTTTAAATGCATTCTAATTCAAAATCTTCGAGTATTTTTTTTTATTAAAAAAAATGAATTGAAAGCCCAA ATGGGTAATGGAGGGAGAATAAACATGGCGGGTGACAACCCAAAATCATCCTCCGAACGCAAATCTCGCTGGCAATCCTCCTCTTCGGCCGCCACCCCCACCACCACAACCACTGCCAACGCCGCCGCAAACCCTCCCTCAGGAACCCCTTCCAAATCCTCGAATAAACCATCCACCACCAACACCACCACCGCACCAAGATCGTCTTCTGATAAACCCACCACCAAACGCGTCCCTAACCCAAGCCCATCTTCTCACCCACCATCCCAATTCTCCGAGCCATCGGTACGCCCTTCTTCTCTCGGCCCACCGCCCCCTCCGCCACCTCCGATATATGGGTTTCACATGCTTGATCGCCGCACTATTATCCTTGCCGATGGAAGTGTCCGATCCTACTTCGCTTTGCCCCCTGATTACCAAGATTTCAACCCTCCCCCTCGACCCCCAATGGGGCGCTTTGGGCCGCCTCATGAGCCAGGCCGGCTCCCCCCGGTTGGGCCGATGAGTCCTGATGGTTTTCACGGTAGGGAGGATCATCCGTTTGGGTCTAATTCAATGTCTATGAAGAGGAAGTTTGGGTTTGGTGAGGAGAGAGATAGAGATAGAGATGGGGATGAGTTTGCTAGGCAGAAGCAACAGCTTTTGCAGTATGGCAATGCAGGTGCGAACTTGGGATCGGGTACTAGTAGTCCCTTCAGGCGGGACGACGAGTATCGAAATTCTAAACACATGAGGGTTGGTGCTGGTGCTAATGTTGGTGGCAGTAGTAATAATATTAATTCGAGGCAGGATGTTCGAATTGATCCTGCTGTCATGAAGGCATATCTTCATTTAGTTAAGCTAATTTATGAGGATCCTAAACAGAGAAAGAACTACTTAGAGAATGGCAAGCATCTTCAGTGCCTCGTCTGTGGCAGGTCTTCAAAAGATTTTCCAGATGTACATGCTCTTATTATGCATGCTTACAACTCAGATAATGCTGATTTGCGTGTGGATCACCTGGGCTTGCATAAAGCCCTTTGCGCCATAATGGGGTGGAGTTTTATGAGGCCTCCTGATTCCTCCAGGGCGTATCAACATATGCCTGCTGAAGAAGCGGCTGCATACCAGGATGACTTGGTCATGTGGCCACCCATGGTGATTATTAATAACACAAATACCGGCAAGGGTAAAGATGGCCGCATGGAAGGTTTGGGAAATAAGGCAATGGATAGTAAACTTAGAGATCTCGGATTCTCAGGGGGCAAGTCGAAGTCTTTGTACAGTAGAGAAGGCCATCTTGGCATTACGCTTATTAAGTTTTCTAGTGACCTATCAGGCCTGAAGGAGGCCATGCGATTGGCTGATCACTTTGAGAAGGATCACCATGGGCGTAGAGATTGGGCCCATGTACAATCGACTGCTACTGAGAAGAATGAAGAGAGCAATCCAAATCTTGTGATGGTGGATCAGAGGACAGGTGAAAGGAGGAGAATACTTTATGGATATCTTGCAACTGTCTCTGACCTAGACAAAGTGGATTTTGAAACACGAAAGAAGGTGGTCATTGAAAGCAAGTTTGAGAAACTCCAACTATCCAAGTGA MGNGGRINMAGDNPKSSSERKSRWQSSSSAATPTTTTTANAAANPPSGTPSKSSNKPSTTNTTTAPRSSSDKPTTKRVPNPSPSSHPPSQFSEPSVRPSSLGPPPPPPPPIYGFHMLDRRTIILADGSVRSYFALPPDYQDFNPPPRPPMGRFGPPHEPGRLPPVGPMSPDGFHGREDHPFGSNSMSMKRKFGFGEERDRDRDGDEFARQKQQLLQYGNAGANLGSGTSSPFRRDDEYRNSKHMRVGAGANVGGSSNNINSRQDVRIDPAVMKAYLHLVKLIYEDPKQRKNYLENGKHLQCLVCGRSSKDFPDVHALIMHAYNSDNADLRVDHLGLHKALCAIMGWSFMRPPDSSRAYQHMPAEEAAAYQDDLVMWPPMVIINNTNTGKGKDGRMEGLGNKAMDSKLRDLGFSGGKSKSLYSREGHLGITLIKFSSDLSGLKEAMRLADHFEKDHHGRRDWAHVQSTATEKNEESNPNLVMVDQRTGERRRILYGYLATVSDLDKVDFETRKKVVIESKFEKLQLSK Relationships
The following mRNA feature(s) are a part of this gene:
Homology
BLAST of Spo21440.1 vs. NCBI nr
Match: gi|902236089|gb|KNA24199.1| (hypothetical protein SOVF_016600 [Spinacia oleracea]) HSP 1 Score: 1027.7 bits (2656), Expect = 7.100e-297 Identity = 519/519 (100.00%), Postives = 519/519 (100.00%), Query Frame = 1
BLAST of Spo21440.1 vs. NCBI nr
Match: gi|731366836|ref|XP_010695286.1| (PREDICTED: uncharacterized protein LOC104907954 [Beta vulgaris subsp. vulgaris]) HSP 1 Score: 749.6 bits (1934), Expect = 3.700e-213 Identity = 407/541 (75.23%), Postives = 444/541 (82.07%), Query Frame = 1
BLAST of Spo21440.1 vs. NCBI nr
Match: gi|225432664|ref|XP_002278494.1| (PREDICTED: uncharacterized protein LOC100259596 [Vitis vinifera]) HSP 1 Score: 513.5 bits (1321), Expect = 4.500e-142 Identity = 318/587 (54.17%), Postives = 381/587 (64.91%), Query Frame = 1
BLAST of Spo21440.1 vs. NCBI nr
Match: gi|659092627|ref|XP_008447151.1| (PREDICTED: uncharacterized protein LOC103489668 [Cucumis melo]) HSP 1 Score: 499.2 bits (1284), Expect = 8.800e-138 Identity = 300/569 (52.72%), Postives = 370/569 (65.03%), Query Frame = 1
BLAST of Spo21440.1 vs. NCBI nr
Match: gi|449444110|ref|XP_004139818.1| (PREDICTED: uncharacterized protein LOC101210911 [Cucumis sativus]) HSP 1 Score: 495.7 bits (1275), Expect = 9.700e-137 Identity = 295/570 (51.75%), Postives = 371/570 (65.09%), Query Frame = 1
BLAST of Spo21440.1 vs. UniProtKB/TrEMBL
Match: A0A0K9RZ47_SPIOL (Uncharacterized protein OS=Spinacia oleracea GN=SOVF_016600 PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 1027.7 bits (2656), Expect = 5.000e-297 Identity = 519/519 (100.00%), Postives = 519/519 (100.00%), Query Frame = 1
BLAST of Spo21440.1 vs. UniProtKB/TrEMBL
Match: A0A0J8BCF9_BETVU (Uncharacterized protein OS=Beta vulgaris subsp. vulgaris GN=BVRB_5g124010 PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 749.6 bits (1934), Expect = 2.600e-213 Identity = 407/541 (75.23%), Postives = 444/541 (82.07%), Query Frame = 1
BLAST of Spo21440.1 vs. UniProtKB/TrEMBL
Match: F6HDQ3_VITVI (Putative uncharacterized protein OS=Vitis vinifera GN=VIT_05s0020g03460 PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 513.5 bits (1321), Expect = 3.100e-142 Identity = 318/587 (54.17%), Postives = 381/587 (64.91%), Query Frame = 1
BLAST of Spo21440.1 vs. UniProtKB/TrEMBL
Match: B9RTR8_RICCO (Putative uncharacterized protein OS=Ricinus communis GN=RCOM_0912140 PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 476.1 bits (1224), Expect = 5.600e-131 Identity = 295/534 (55.24%), Postives = 356/534 (66.67%), Query Frame = 1
BLAST of Spo21440.1 vs. UniProtKB/TrEMBL
Match: M5XC26_PRUPE (Uncharacterized protein OS=Prunus persica GN=PRUPE_ppa003948mg PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 469.9 bits (1208), Expect = 4.000e-129 Identity = 290/539 (53.80%), Postives = 361/539 (66.98%), Query Frame = 1
BLAST of Spo21440.1 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: SGS3_SOLLC (Protein SUPPRESSOR OF GENE SILENCING 3 OS=Solanum lycopersicum GN=SGS3 PE=1 SV=1) HSP 1 Score: 63.9 bits (154), Expect = 5.900e-9 Identity = 43/153 (28.10%), Postives = 75/153 (49.02%), Query Frame = 1
BLAST of Spo21440.1 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: SGS3_ARATH (Protein SUPPRESSOR OF GENE SILENCING 3 OS=Arabidopsis thaliana GN=SGS3 PE=1 SV=1) HSP 1 Score: 55.8 bits (133), Expect = 1.600e-6 Identity = 56/240 (23.33%), Postives = 103/240 (42.92%), Query Frame = 1
BLAST of Spo21440.1 vs. TAIR (Arabidopsis)
Match: AT3G22430.1 (Domain of unknown function XS (InterPro:IPR005380)) HSP 1 Score: 411.8 bits (1057), Expect = 6.500e-115 Identity = 252/531 (47.46%), Postives = 330/531 (62.15%), Query Frame = 1
BLAST of Spo21440.1 vs. TAIR (Arabidopsis)
Match: AT5G23570.1 (XS domain-containing protein / XS zinc finger domain-containing protein-related) HSP 1 Score: 55.8 bits (133), Expect = 9.100e-8 Identity = 56/240 (23.33%), Postives = 103/240 (42.92%), Query Frame = 1
BLAST of Spo21440.1 vs. TAIR (Arabidopsis)
Match: AT1G78810.1 (unknown protein) HSP 1 Score: 51.2 bits (121), Expect = 2.200e-6 Identity = 30/106 (28.30%), Postives = 48/106 (45.28%), Query Frame = 1
The following BLAST results are available for this feature:
BLAST of Spo21440.1 vs. NCBI nr
Analysis Date: 2018-06-29 (blastp Spinacia oleracea peptides vs. NCBI nr) Total hits: 5
BLAST of Spo21440.1 vs. UniProtKB/TrEMBL
Analysis Date: 2018-06-29 (blastp Spinacia oleracea peptides vs. UniprotKB/TrEMBL) Total hits: 5
BLAST of Spo21440.1 vs. ExPASy Swiss-Prot
Analysis Date: 2018-06-29 (blastp Spinacia oleracea peptides vs. ExPASy SwissProt) Total hits: 2
BLAST of Spo21440.1 vs. TAIR (Arabidopsis)
Analysis Date: 2018-06-29 (blastp Spinacia oleracea peptides vs. TAIR) Total hits: 3
InterPro
Analysis Name: InterPro Annotations of S. oleracea
Date Performed: 2018-06-29
GO Annotation
GO Assignments
This gene is annotated with the following GO terms.
RNA-Seq Expression
Co-expression
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