Overview
Sequences
The following sequences are available for this feature:
Legend: exonfive_prime_UTRpolypeptideCDSthree_prime_UTR Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.AAAAATAAGGTGAATTAAAGTCCCTGCTCTTTACAATCGAAAAAGGGTCGCCTTCCCAAACAAACCAACCCCTGAAATGAAAGGGAGCGACAAAACCAAACGCCACGCCACCCAAGACCAGTCGCTGGACAAATTTCACCGAAAAGTAAAAATCTTTTGTGCAGAAATAGACATAACTGGTATGATCTGTTTTGCTATTTGCTCATTCTGTCCATTTCAGTTCACAATTTTAATTGGTAATTAATATCCCAAATTTCCATTTTTTATACTTATAATAGTTTAAGGTTGTTCACTTCGGCTATTTATAATGAAAACCCCATGATTGATTGGACTTTTATGGGTTTGTTTGGTCGCAATTTTGGTTTAGGAGCTTTGATTTTCATCCCAAATTTCTCATTTTCATTTAATTTGGATATGCAAATTGCTATTTTTTTGGGTGTTCCCTTTTATTTCTTAGTTTTAATTCTAATTTGTTTTGCGCAATTCGACTATTACGATTTGTTTGCTTCTATGTTTTGGATGGAATCCCTTTTTGTTGTTGTTGGAATCTAGCTATATACGAAGTATGTCTTTCTGAACTGGCTAAATCACGGTGATGGTGGTTTAGAGTTGCAACAATCCCACTTGCTTGCTGTTTATCAATCTCAAATTCGGGTTTCTAGTAAAATAATACGTAGTAATTATTATTTTTTGGATTTTTGCTGTAGGTTTTTGATGTTGACAAGAATGAGTTATGTTATGAAACTATGAATGATGAACTATATAGGATTAGTTGCTGATACTGCCTTAGACTGTTATAGATGTGGTTATGTTATTTACAAGGTACTCCTTGGAACCTTTACTGACTAACTTGCTTAGTTTTCACAACTCTTCACGGGCTGACCATCATCGTTGGCAGATATGGCGTTAGGCAGTTTATAATCGTTGTAATTAGTTTCATTACAATATACTTTTGCTGCTATAATAAGAAAAGGCTAGGTGGTTTTGGGACATTTAAAGAAGTCATGGAATGATGTACAAATTATTATGCTAGGAAAGCATAGGCAAGACAAAACTGGAAAGATCTAAAGTACGAAAAACAAAATTAATTAGGGTAACATTAAGTTTATGTGGAAAAATTCTCATTAAAAAGTAGGGATAAACTGCCTTTATATTTCCAATCTATGAACAGCTACTAGTAATATCATACAACCGGTAAAATCTCTGTAGATTGTGTCTTATATAATTCTTTTTTCTCAAACATGCTAACAAGCTTTTTAGTTCTTTGTATGATCTCAACGTTGTGGAGTACCAATGCCCTTTGACCCTTATTCTTGATTTACCATGCATAATCTAGAAATATTACGACCTTTATGAAACTAAGTGTTATATCTTTAAACAACTGCAATGAATAAGGAAGCAATAAACAGAGTACTAAGGATAATAAGCTATGAAATAGCAACTAAAAGCTGTATCAACGCCGCACAGTTGTGTCAAGCCTCCAGAAATCTATTTCTTCTATGCTTCACTTTGTGCCATTTCAAACAGACTCCTTGTTGGACTTGTACTCAATATGTACACAGATAGATCATCCTCTTATTGGTGACTTGAAAATGTTTTGTTTTTCCAAGGGTGTTGAAAAATTCATTAGTTGATGAAATTCAGTGTAATAAGAGAATAAGAGATGTAAGGGGGTTTAACCAAAAAAATAAAGACACAAACGGTTCGTCAGTAGTTAGATTGCACGTGGTGCATGCTGGCTGTGAATGCAAAATGTTTATCCTAAAACGAGTTTTGCAAAATCTCTAGCTGTGATGCATGCATACCCTGACGATCAACTTGGATGACCTCTTGAGAATGTGAAAAGTGTTATATCCTTTTCTCTTCCTTCGTGAAGCTTTGGTTCCCATTGATCAGCATACGGATTCAAATACCCTTCAATTGCTCATTTACAGATCTGTACATATGTTCTTTAAATTGAGGCAAATAACAAGGTGATGTGTTTTGGTGTGTCCTGATTGGTTGTAAAATGTTTCTCAGATTGTGTCTATTTGGGCTTGGGCCGCTTGGCCTCGTAGACATAATCTAGTTTTGCGCTTATTTGTTTAATTCAGTTATTACTTCTAGCAAAAAAATAACAAGGTGATATTATGTGTTTGTTTTTGCTGGATTGTGACTTGAGAGTTGCAGTTCTGATCTCTCTAGATTCTCTAGTTTGACCAAATCATATAATCTAACTGGAGTAATAATATGGCATCAAGAATCTGCTGCTTCTTTACTTCCCAGCGTTGCTCACGAATTAATTTCTGTCATTCTCCAAACTTGGCTTTTGTTCTGGTAGCCGAACCCATTTGTTATCTCTGATATTGTGATTCTTATAAATTACACTGTAGAAGATGTATCCTGAGGATGACAATGGGGACAATAACATTGTGAAAAACAGTTTTAAAGCAAATTGGATAGCAGAAACTGCAGAAGGAATTCAGCAGTACTGTCATGGTAAGCTAGAATTTGCTGGTTCATATCTTTTATTTTTGATGGTATCGCAGTTGTTTTTATCTTACTACCGATATGCTTGGTATAAGAAATCTAGGAATTTTCTGTTTTAAATGTTGGCCAAATTCGGCAATGGTATGGCTAAATTGTTAATTGTATTTGGGAGTTCCTACTCTTGTGCTTGAACCAAACCAGAAACTATAATATTTTATTAACGACTTAAACATAATTTTACAATAATAGTTCCATAACGACTGCGTCCCTCTTATTTCTTGTACCTCTTACAAAATAATGACCTGTTGTCTACTTTAAGGTGCTTTACTTCTTGATCCTCCAAAATCATCGCTGCTATAGAACACTTGGAGAAAACCACCTTTCCAAACAAAGGTTCTTGCATAGGGTCGGGTTGGTGCACATAAATCTTCTCAATGCAGTCCCCATATGTGCTGGTTACATGGGTAAAAAAGTTAGTCACACCATCATAGTTACATTTGTGAAATATAGGGGATTGACTTAACCATTCATAAGTAATTGCAATTCTGTGTAAGAAATTCTAAGAAAAATATCAAGATTGTTCAGCTAGTTAGATCTTCAAGCGGTGCACGCTTATGCGGAATATTTACCTAAAATAAATATGGCAAATGAAGGCATGTATGAACGCTTACCTTGCAAAAAAATTGATTATCTGATTTCCGGACAGGGGACGTCCTCTTGCAAAGGTGAAAAAAATGGTTCTATACTCGACTCTTTTTTTCTCAACCATTGGTTCCCATGGCTGAGCATTGGGATTCAATGCTCGAATTCTATCCATGTCTTAGAAAATTTTGTGATATATGGTGAAGGAAATGCGGAGTAAACCAAGAGATGAGAGAATTTTGTTTGTGGATTTGTGTTCTGCTGTTAAGCTGAGTTCTGCTGTTAAGCTGAGTTTATGAAGGAAGATGCTCAATGCAGTAATGAATATATATTGTTTTTTTGGGTGTAAAAAGAGCCGAAAAGGGCAGTGATGTAGACAGGATACGAACCCACATTTTTGGTACCATCCCCCAAGACTTTGACTAACTAAGCTTTTCTTTTTTATGACTAAGCTAGTTGGCATCGAATATTGAACTGATAAATGTAAATGGGAAGGCGATCATAGATTGATAGTTTAAGAGAGAATATCTACTTGGATGCTATCTATAATTGATTTATTACTTTTGTTGCTCAATTTTTTTTACTACCCTGTACTTTTTTTGCTCAATGGTACAAGGATTTTTTATTTTAGAAAAAAATTGATTATATCCCTTTGGAATTTTTTTTTTCCTAATATGACCAATACTATTCTATTAAATCCATTGTGATTTATAGCTAATTACATTGAAAAAAATTGATTATATCCCATTGAGCTGCATCCATGTTCGATGTAACTATCAGCCTGGAATTTCTTCATCTAGCTAATTACATTGATATGGCTGTACTTCATATTTTAAAATCTTAACTCAGAAAAGGCAATACAAATTATCTAGAGATTTTGTGAAATGGGAACCTGGGACCTTTGTATTTCATGTAGGATTGCCATTTGAGAGAACATTTTACAGAGGTAAAACCAAACAAACACGATGTAAAGAAAAGCAACTGATTTAACCAATTTAATTTTTTGAGTAATTAGTACTCCCTCCGTCCCAGAATAGTCGTTACACTTATATTTGCACAAAGTTTTAGGTGATAAGTGGTTGTTTGGTTATCAATTGTTATTTTATTCAAAAAGTAGATGTGATAGGAGTTAGTGGGGGTATTTTTTTAATTGAATGAGAGAGGGTGTGGGGACAAAAAAAAAATAGTGGGAAGAGAGAGACAATATAATAATTGTGGGGTCATTCCTAATTTAGAAGTGTAACAACTAATCTGGGACGGACGAAAAAGGAAAGTGTAACGACTAATCTGGGACGGAGGGAGTATTGAACAAACAGGCACTTTTTACAACTTATGTTTTAATATGATCAAGCAAACCAACCAGGTTGGACTCCTCACAAAACATGAGAATAAGACTAACAACTGTTGGACTCCTCACAACTGGTCCCTGGTCCCTGGTCGTCTAGCATTGCATTGCATGGACGACTAGAATGCAATGCAGGTTGAAAATGGTCAAATTTCTAGTCGTCTAGCATTTTCAACCAGGTTGGACTCCTCACAAACCAGCATCCTGCATTGCATTCTAGTCGTCTAGCATTTTCTAGTCGTCTAGCACTGTCAGCATCTGACTACTGATAATGAAGGAGAATGGGGGACATGGGAGGGAGTAAAGTTGTGACTCTTGTGAGACCTGTTAACTAGAAGTGGGACGACCTAGATGTTATAGACTGAATGGCGAAGCAGTTTGAGGTTTGACCGCTTAGACGGTTTTTGAAAGGATTGTTACGTACTAAGCTGTGTATCTTTACTTTCTTTCTTGTAGATAGCTATGCTATGGTTCTTCCATGCTTAAAATTTGGTTTTAGATTTTCCCTTTCATTTGAAGAATTTGGAACCGCAATCCCCCTCCCTTCCCCGGAGAACAGGACTGAATCCTATATTCATACTCAAGGGGTTAAAACCCTGGCCTGCCTTTCTGGGAGAAAAAATGACAGACTCGTCGCTGTATGCGTGCATTTGAGATGTTTTAAGTTGGTCTGTCCCTAATGCCTTTAAGAATAGATGGTGCCGAACCCGTAAATTTTGGACTGAAGGATTTCCATTGTGATTTCTTTCTTGAAACTTGAAAAGGTGAATTAACCTTGCTATTTTTCTTTTTGTGGGTGTTAGGGGGGGGGGTATTCTATAGGCCAAACCTGGTTTCTTGGTCAGAAGCTGAAGAACATATTGGTTGTTTCTGATCTACTTATTCTTGAAAGGCGTCAACGTTAATTACTAGTTTATTGAACGTCTTTCCATTTGATTGGTGCCATTGGTTATTTCTCTTATCAGCAATCTCCTTTTTTTCATAGGAAGTAGTCTTCCTCTAACTATGTATATGACTGTTTTCTTGCCTGGTCATTATCAGTAGTCAGATGCTGACAGTGAACCTTGTCATTCTCTGTCTCCATCAACCAGATGTTTGGATCCATGAAAATACCAAAGTTGAGTTTTACTCCTGCTTAACTGTCATGCGGCAAAATTAATTGAAGAAAATCCTAATCCTCGTCTGTTTGACTGTTTATTAATACTTTTCCAGTCCCAATCTCCTGGATTAGTAATCGTCAGTTGAATAGCCAATGAACATCACCAAGCCAGTGGTCAGTGTGTTTACCATGCCGATGCAAATGATATTTCTCTAACAGTGCATTTTCAGTCTTTCAGATTTCTTCTCATACCCAATAAGAGTTCTAATACCCAGATAGGGGAGAACTTAACTAACTACGGAGTCAATGAAGATGAATATTTTGGGGATACAGCAGTATGCCTCATCACTCCGACCTTTCAACATACGGCAAAGGTTGCTTCCCTAGCTGGAGGTTTTGTGAAACACTCGCTTGTTGAGGTAATTTCCGATTCTTTACCTCATGATGAGGTAGTTTTTTGCTTCACACTCTAGTTACTTAGAACAGGCAGTAGGAGTGTGTGGTTTGTAGAAAACATCTTCCAAGAAAAGTGGGTTTCCTATTTCTTTGTTTGGCTTGTGAAGTGTAGAAAATAGCTCTCCCAGGAACGGAGATGGTTTCCTTTGTGAGTAATGGTAGTCATATTTTCTCTATTTCTTACCAGATTCCTTTTTCTATCCTCCCCCTTCCATTCTCATTTTCCTTTTCCTAGCTTTTCTTGCATTGGAACAAAACAAAGGAAACCTAATACTCCGTTACAAATGTGTTTCCCCTTAGAAATGTTACCCGTCAAACTAAACAGAGCCGAAACAAAGAGTCTGAACTCTGAAGACACCTTTTTTCTGGGTAATGGATGTATTACATTTCTGTAGAAAGCTGTATGCTTCTTTCGCTTGATAATGTAGATTGTGAAATCTGTGTTCAAGTCCCTGAAACAGTGAGATAAACAATTGGTTTAATTTAGTGTAATATCCATGTGTTTATGTTTTCTGCTACAATTCGTCCATACTTGCCTTATGGGGGCTGCTTTTATGTAAATGTAATGCATCTTTTTTCAGCTTCTCCCTTGTTCTTCCAATATTCGAGTTTCGCCCTCCACTAACGTTTACTTATTGTAGGAATTCCAGATTTCTTTGTATTGCTGTGATCTCTGCTCGAGGAGCTTATCTCAAGCTGGCCAATTATCTGCACAAGGTCATATTGCAAGAATGCTAATACCAGAAGCTGAACCAAGACTAAGATTTAACTTCTGTATATACGAGGCAGTGAAACATGATCCTTGGATGCAAGAGTGAACAAGAGATTGCAGCAACCTCAACTTTGGCTGTGGATATTAGGAAATGCGGATCTTGTTTTTGACATTACAAGGCCCTGTTCAGTAAAACTAGCGGTAGCGGGTAGTGGTAGATAACTGTTAAAGTAGCGGGTAGTGCCTATCTCTTAAAATCCTGTTGTGATTCACTGAGTGGATGTGTGATACGAAGAACCAAACATAATTTATTACTGGCGGCGTGGCGTAAATTGATCATTGCTATATCAGATTCAATTAACACGGTTAATTCTTATTTAAATGTGGTGTACAATCTGTGAGCATATCCTGTTTGCGTTTATGCGTAATGGTTTCCTGTTGTGTATTTCACATATCAGCATATCCTATATTCGACATAAAGGGTTCA AAAAATAAGGTGAATTAAAGTCCCTGCTCTTTACAATCGAAAAAGGGTCGCCTTCCCAAACAAACCAACCCCTGAAATGAAAGGGAGCGACAAAACCAAACGCCACGCCACCCAAGACCAGTCGCTGGACAAATTTCACCGAAAAGTAAAAATCTTTTGTGCAGAAATAGACATAACTGAAGATGTATCCTGAGGATGACAATGGGGACAATAACATTGTGAAAAACAGTTTTAAAGCAAATTGGATAGCAGAAACTGCAGAAGGAATTCAGCAGTACTGTCATGTCTTTCAGATTTCTTCTCATACCCAATAAGAGTTCTAATACCCAGATAGGGGAGAACTTAACTAACTACGGAGTCAATGAAGATGAATATTTTGGGGATACAGCAGTATGCCTCATCACTCCGACCTTTCAACATACGGCAAAGGTTGCTTCCCTAGCTGGAGGTTTTGTGAAACACTCGCTTGTTGAGGAATTCCAGATTTCTTTGTATTGCTGTGATCTCTGCTCGAGGAGCTTATCTCAAGCTGGCCAATTATCTGCACAAGGTCATATTGCAAGAATGCTAATACCAGAAGCTGAACCAAGACTAAGATTTAACTTCTGTATATACGAGGCAGTGAAACATGATCCTTGGATGCAAGAGTGAACAAGAGATTGCAGCAACCTCAACTTTGGCTGTGGATATTAGGAAATGCGGATCTTGTTTTTGACATTACAAGGCCCTGTTCAGTAAAACTAGCGGTAGCGGGTAGTGGTAGATAACTGTTAAAGTAGCGGGTAGTGCCTATCTCTTAAAATCCTGTTGTGATTCACTGAGTGGATGTGTGATACGAAGAACCAAACATAATTTATTACTGGCGGCGTGGCGTAAATTGATCATTGCTATATCAGATTCAATTAACACGGTTAATTCTTATTTAAATGTGGTGTACAATCTGTGAGCATATCCTGTTTGCGTTTATGCGTAATGGTTTCCTGTTGTGTATTTCACATATCAGCATATCCTATATTCGACATAAAGGGTTCA ATGTCTTTCAGATTTCTTCTCATACCCAATAAGAGTTCTAATACCCAGATAGGGGAGAACTTAACTAACTACGGAGTCAATGAAGATGAATATTTTGGGGATACAGCAGTATGCCTCATCACTCCGACCTTTCAACATACGGCAAAGGTTGCTTCCCTAGCTGGAGGTTTTGTGAAACACTCGCTTGTTGAGGAATTCCAGATTTCTTTGTATTGCTGTGATCTCTGCTCGAGGAGCTTATCTCAAGCTGGCCAATTATCTGCACAAGGTCATATTGCAAGAATGCTAATACCAGAAGCTGAACCAAGACTAAGATTTAACTTCTGTATATACGAGGCAGTGAAACATGATCCTTGGATGCAAGAGTGA MSFRFLLIPNKSSNTQIGENLTNYGVNEDEYFGDTAVCLITPTFQHTAKVASLAGGFVKHSLVEEFQISLYCCDLCSRSLSQAGQLSAQGHIARMLIPEAEPRLRFNFCIYEAVKHDPWMQE Relationships
The following mRNA feature(s) are a part of this gene:
Homology
BLAST of Spo22022.1 vs. NCBI nr
Match: gi|902192597|gb|KNA12076.1| (hypothetical protein SOVF_128830 isoform B [Spinacia oleracea]) HSP 1 Score: 229.2 bits (583), Expect = 3.900e-57 Identity = 112/122 (91.80%), Postives = 113/122 (92.62%), Query Frame = 1
BLAST of Spo22022.1 vs. NCBI nr
Match: gi|902192596|gb|KNA12075.1| (hypothetical protein SOVF_128830 isoform A [Spinacia oleracea]) HSP 1 Score: 217.6 bits (553), Expect = 1.200e-53 Identity = 109/122 (89.34%), Postives = 110/122 (90.16%), Query Frame = 1
BLAST of Spo22022.1 vs. UniProtKB/TrEMBL
Match: A0A0K9QZW0_SPIOL (Uncharacterized protein OS=Spinacia oleracea GN=SOVF_128830 PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 229.2 bits (583), Expect = 2.700e-57 Identity = 112/122 (91.80%), Postives = 113/122 (92.62%), Query Frame = 1
BLAST of Spo22022.1 vs. UniProtKB/TrEMBL
Match: A0A0K9QXU5_SPIOL (Uncharacterized protein OS=Spinacia oleracea GN=SOVF_128830 PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 217.6 bits (553), Expect = 8.200e-54 Identity = 109/122 (89.34%), Postives = 110/122 (90.16%), Query Frame = 1
The following BLAST results are available for this feature:
BLAST of Spo22022.1 vs. NCBI nr
Analysis Date: 2018-06-29 (blastp Spinacia oleracea peptides vs. NCBI nr) Total hits: 2
BLAST of Spo22022.1 vs. UniProtKB/TrEMBL
Analysis Date: 2018-06-29 (blastp Spinacia oleracea peptides vs. UniprotKB/TrEMBL) Total hits: 2
BLAST of Spo22022.1 vs. ExPASy Swiss-Prot
Analysis Date: 2018-06-29 (blastp Spinacia oleracea peptides vs. ExPASy SwissProt) Total hits: 0
BLAST of Spo22022.1 vs. TAIR (Arabidopsis)
Analysis Date: 2018-06-29 (blastp Spinacia oleracea peptides vs. TAIR) Total hits: 0
RNA-Seq Expression
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