Spo22352 (gene)

Overview
NameSpo22352
Typegene
OrganismSpinacia oleracea (Spinach)
DescriptionUnknown protein
Locationchr3 : 6747089 .. 6768211 (-)
Sequences
The following sequences are available for this feature:

Gene sequence (with intron)

Legend: polypeptideCDSexon
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mRNA sequence

ATGTTATTCGGTGCCAACGTGAATCGGGAGCTCAAATGTCAATACAAGGGTGGTGCCGACGTTATTGTGGTGGTGTTTATTTTGAGGTTTACTGAGAATCCATACTGTATCTTGAGGAGGTATCCTGCTTCAAATGGTTTCCTATGTAGGCTTCTTTATCTCTGGATCAAAATTACATCACTAAGTGAAATGGCCCCATTGATTGGTAGGGTGATGGCTTGGTTAGAAAGGAATGACGTGGGCTTTGAAATCAGTTTGATTTATGGTATAGGATTGAAATTTTCCGAGGCTCATTGTAATGACAGTTTGTCTCCTATCCTCACCAAAATAAATTTCTTCGAAATTGATAGGTTAATCTCCAAGATTTCGACAGACAAGGAATCTGCACAAAATTATTACGAGGTAGAGACTAGAAAGTGTCACTAG

Coding sequence (CDS)

ATGTTATTCGGTGCCAACGTGAATCGGGAGCTCAAATGTCAATACAAGGGTGGTGCCGACGTTATTGTGGTGGTGTTTATTTTGAGGTTTACTGAGAATCCATACTGTATCTTGAGGAGGTATCCTGCTTCAAATGGTTTCCTATGTAGGCTTCTTTATCTCTGGATCAAAATTACATCACTAAGTGAAATGGCCCCATTGATTGGTAGGGTGATGGCTTGGTTAGAAAGGAATGACGTGGGCTTTGAAATCAGTTTGATTTATGGTATAGGATTGAAATTTTCCGAGGCTCATTGTAATGACAGTTTGTCTCCTATCCTCACCAAAATAAATTTCTTCGAAATTGATAGGTTAATCTCCAAGATTTCGACAGACAAGGAATCTGCACAAAATTATTACGAGGTAGAGACTAGAAAGTGTCACTAG

Protein sequence

MLFGANVNRELKCQYKGGADVIVVVFILRFTENPYCILRRYPASNGFLCRLLYLWIKITSLSEMAPLIGRVMAWLERNDVGFEISLIYGIGLKFSEAHCNDSLSPILTKINFFEIDRLISKISTDKESAQNYYEVETRKCH
Relationships

The following mRNA feature(s) are a part of this gene:

Feature NameUnique NameType
Spo22352.1Spo22352.1mRNA


Homology
The following BLAST results are available for this feature:
BLAST of Spo22352.1 vs. NCBI nr
Analysis Date: 2018-06-29 (blastp Spinacia oleracea peptides vs. NCBI nr)
Total hits: 0
Match NameE-valueIdentityDescription
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BLAST of Spo22352.1 vs. UniProtKB/TrEMBL
Analysis Date: 2018-06-29 (blastp Spinacia oleracea peptides vs. UniprotKB/TrEMBL)
Total hits: 0
Match NameE-valueIdentityDescription
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BLAST of Spo22352.1 vs. ExPASy Swiss-Prot
Analysis Date: 2018-06-29 (blastp Spinacia oleracea peptides vs. ExPASy SwissProt)
Total hits: 0
Match NameE-valueIdentityDescription
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BLAST of Spo22352.1 vs. TAIR (Arabidopsis)
Analysis Date: 2018-06-29 (blastp Spinacia oleracea peptides vs. TAIR)
Total hits: 0
Match NameE-valueIdentityDescription
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GO Annotation
GO Assignments
This gene is annotated with the following GO terms.
Category Term Accession Term Name
biological_process GO:0001510 RNA methylation
biological_process GO:0006396 RNA processing
biological_process GO:0008152 metabolic process
cellular_component GO:0044464 cell part
molecular_function GO:1901363 heterocyclic compound binding
molecular_function GO:0016787 hydrolase activity
molecular_function GO:0097159 organic cyclic compound binding
molecular_function GO:0008171 O-methyltransferase activity
molecular_function GO:0008173 RNA methyltransferase activity
molecular_function GO:0043531 ADP binding
molecular_function GO:0005515 protein binding
molecular_function GO:0003676 nucleic acid binding
molecular_function GO:0046983 protein dimerization activity
molecular_function GO:0008233 peptidase activity
molecular_function GO:0008270 zinc ion binding
RNA-Seq Expression