Overview
Sequences
The following sequences are available for this feature:
Legend: exonfive_prime_UTRpolypeptideCDSthree_prime_UTR Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.CACCACTTTGAACCTCCTGGATTCTTGCCTTCTACTTTTCTTGACAGGATTGTGATTTCACCATTTAACAAAGGCAGATAACTACGGCTTGTGTTTTTCACCTCCTGTTGTGGTGGAGGCGTTACTTCATCCCCAGAATCATCATCTTCACTTTCGAATCCCATGGCATCATCATTGTAAAGTATGGGATATTGATCTTCTTCTTCTTCTACTGGTTGTTGACTGACTTTCTTTTTCCCAAAAGCCATGTTAATTTGTAGAATATATTACAGACTTATGTAATCTGTATTACAAAGAAAGAGGAATTAGGTAGAAGCGTCTATATTGGTGTGCCTATATTGTTTATGGTTGATTCATTATATACCGTGAGAGTTGTGTAGTTTCCTTAAACCTTTGGAGTGAAATCAGTCAATCCGATCACCGGGCTTTCTTTTTTTTCCAAATCTGCCGATGATAAGAGTCCTAATTTCTTCAACTGGTTGTTTATATTATGTAAAGATTTAGGTGCAAAGATTTATTCCTTCTTTTTGTCCCCTTATTATGCGTAANATTATGTAAAGATTTAGGTGCAAAGATTTATTCCTTCTTTTTGTCCCCTTATTATGCGTAACAATGGCTTATTATGCTTAACATACAAAATAGTAATGATTTTTCCCCCTTAGACTCTGACTCTGACTTGTTTATGGGATTTTGTTATACTAATATGCAATATGCGGTTAACTTGATTGCATATAATTTGCTTTTTAAAATGATTTGCATATAATTTTAATGATTTGCGTATTACTATATTATACTATAATAAACAAAAAAGATGTATGTATAATTTAATATTTAGTAACTTCGTACACATCGGTCAATCGATATCGGTCGGTCTAACATATAATCAATCGGTTAATATCTTATTACGTAACAATTAATATAATTTGCCATGTAACGTTTCTTTTAATTATTTTGTTTCCCTTTTGTTTAATTTGATAATTAGGAATGAATATCTTTAGTTTATATTCATCTTTGAATTTAAATATTTGTTCACAATCACATTATAAATTCAAGTATACGGGGGTGGTGGTTCTTGTCGTAAGTGAGGTTTTGGTTTATGTAATGGATCCTTGGGTTTATACATACGATTCTGATGTTGAAGAGGGTGAAGAATTTGTACCCAACACCCCCCCCGTCCCTGCTTCTCCTAAAACTCCATCTCGACCTATTGTCACTGCTTCTGATGATGAGGTATTTGGTTGGGCTTCCGCCTCCAGCTTTTCGCTGTTGACGCCGCCACCAGAGTTGGTGGTGCCGGAAACTCCAAAACACAAGAGGTCCACACCTCTATCTGAGATGATAAAGAGAAGCAGAAAGAAGGCTGGCTTGTTGAACAACTTTGGTAAAAAGAAAATTCAAGTGCCTTTCAAAGAGAAAGATGAAGAGCCGCGCAACAAATATTTCGTTCCTGATTCAGAAGAGGTTGAGTTTCCTCCGGGTTATGTTCCCGGTGATGGCCATGAGATGTTAAAGTTGTTAGTTCCCTCATATTTCGGCATTGTCCGTTATTGTGCTCCGTAGTTTAACGTATTTTTCGTATAATAATAACAATAACAATAACAATAACAATAACAATAACAATAACAATAACAATAACAATAACAATAACAATAATAATAATAATCAAAGTCAATTGCCAACCACAAAAATTGCCTGAACTCCCATCATCTTCATCGAGTTCTAGGTCTTTGTCGTCCATGGTGGTCTCTTTTCAGCAACATGAAAAAACAACAAAAACTTCAATTGACGGTGGAATTCAATGCGTATCGCCTTCACAATCAAAAGCCCCAACTATCTTGTATCCCTTTCCCGTACCTTCAATCGTTGAAACTAGGGTTTTTGGTTTGGTTCTCTAAAAATAGCGAATTGGTTCGCCGGCGAACCGCGAATCGGTACGGGCGAACCGGTTCGCGGTTCGCGGAGGTTAGGAGCGAACCAGGTAACTCTGCGAGGGGACCTACAGAAAGCGCGCGCCTCCGTGCGCCTCATATCGCTTTTGTTGAAGCGCAAGGCGGCCGCCTTTCAGAATTGGAGCGACAAGGAAGAGAAGATTAAGAAAAAAGCTTAAACAATATCGGAATTTCTTCAAATTAACATCTTAGGTGGCTACAGAATTAAGTGTTAAGTGTTTATTGGCAATTGACTTTGATTATTGCATGGATTTGCTTCAATTTCGACCCTAAATCAAAGACCAGAACCCTAATTTTATAGTGAGTCAAAATTGGAGGTCATCGGTCACTTGAACTGTGACAGAGATTAACCACGAGTACTTTGGTGCCTTTGTCGCCGATCATCTCACCGTCTTGGCCATTATCGGTCATGTTTTTAAGAAGCCGACAACCAGTTCGGCTAGAGCTCTTCCTCGGTTTCTCCTTCGGGTTTCCTTCCGTATTTTATGTTGACTATAAAGTACAACTTTTTTTTTGATTTTAAAAAATAGCTATAAAGTAGTAGAGTGCAGCTACCCGTTTTTTTCTTAAATTTTTGTATACTAATTTTTTTTGGACGGGACTAAAAAATAAATTTTTATTGCTGAGTTGTCACTATCCATTGACCAGTGGGCCTTTCGATTTGTTTGTATGTTTTATTATACAATATGCACTTGCAACGATCTAAACTTTTAATTTGTACAGGTATTTTAACAACAATATTAATTTTTCTGGGCTCTTTTATTTCAAAATATACACACAAAAATAAAATAAAATTATATGTACAATGCTGAGTAGAAACAAGACGGAATATATGGAGCGTAAGTTTGGAATCTCGGGTTTCTAGGCCGAGTAGAAACAAGACGGAATATATGGAGTGTAAGTTTAGTGGAGTCCAAGATAGAGAGACGGGGGCGATTACCTTAGATGGGAAAATTGTCCAAGGCTCTGAAATGTTCCGTTATTTAGGATCTATTATCCAAAAGGATGGAGAATTGGATGGCGATGTGGCCCATAGAATCAAAGCAGGTTGGTTGAAGTGGAAAGTTGCCACGGAGTTCCTATGTGATTTCAGGCATGCCTCAAAGATTGAAGGGAAAATTTTACCGCACGGCAATTCGACCGGCTTTGTTATACGGCACAGAATGCTGGGCAGTGAAACATTGCCACGTGCAGAAGATGAATGTGGCGGAGATGCGCATGTTACGTTGGATGTGTGGACATACAAGAAAGGATCGTTTGAGGAATGAGATTATTAGGAAGAACGTAGGGGTTGCACCGATTGAGTTTAAGATGATGGAAAATCGTTTAAGATGGTTTGGACATGTAAGCAGAAGATCAAGTGATGCCCCGGTTAGGAGGATAGAAGGGTGGCAAAGTGATAGAGTTGCAAGGGCTAGGGGAAGACCTAAGAAATCTTGGAGGAAGGTGATTGAGCACGATATGAGCTTTCTTGGGATTTAGGAAAATATGGCTTTGGATAGGACAGAGTGGAGGGAGAGAATATACATTAATGACTTCATTTGATTTATACAGCTTCAATATTTCTGATGATCTCTATTTTTATTTTTAAAATTCTTTCAAATTTTTAATTTTACTTGCTATTTTGAAATGTACTTATTTTACCTATTCATTTATTATAAACTTTACTTATTTTTTATTAGCTCTTACAATATTTTATATATATATATATATATATATATAATATATATATATATATATATATATATATACACATTTTCCTCTTATTTTACTTTCATTAATTCCACTTTCTCTTCCTTATTTTTCTTATTACATCTTGCTCCTTTCTGGTTTGATTGGTGAAAATGACGATCTCCTACGACGATTCATGTTAGCCGACCCCAAATCATTTTGGGACTAAGGCTTTGTTGTTGTTGTTGTTATATGTACAATGCGCGCGCCTTGCGCTTTACGCCTAGGCTATAGGGACCCTTTGCGCTTTGGTGCGCTTTGTGCTTTTAAAATCTAAGAATCAACCAAAGGGCTACCTTATGTTTTCTTTTTAAGCTCTCTATTTTTTTGTTTGATCAAAAAAGGAATTCCACTAAAAGAGGTTGAAGAAATACAAGGGTGATAAAAAGGAAAAATAAACTCAATCTTGCGTTCTATCTAAAAGGAGCACAAGGGATCAACCTATGCATGTGAGCCCAAAATCCCAAATAGAAGCTTCATACACCACAAAATCCTATAAAGAAAATAAAGAAATTAAAGAAAACCCTGCAGCAAGGAAAAACCCATTTATGTCTCTTCATTTAGCGCATCATTCGATTAGAAAGAAAAGCCGGTTGAAATACATGCGGATGATAAACGCAAATGAATTAGAAGAGGAAATAGGGAAAGAGTCGATGGGGAGCCCAATGAATCCCAAGCAAATTATATTGCCTCTGCTTAAGAGGTTAACAATGCAAACAACAATTGATTATTGGTCTCTCTAGTAGCAAGGTATAGAGTGCATATGTGAGGATAAAGTCTTGTTTGAGCTTCCCTAAAAATAGCACCTATATGAAAGCGTCCACCACTCGACCCTCTTTAGAACTTTAGCTTCTAAATTAGGTGTAGAAAGAGGGAGGAATGCAATATTGGCTTTTTTACCCTTGGTGGTTGAGCGACGCCGACCTATAAATGCACGTGTTTGGAAAGTTGGCAGTTGTGATTATGCCCATTATGGGGATTTCAGAAGAAAGCCAATGAGAACGAAGATGACTAGGACACAATGTCTAAAAACGGATATGAAGAAAATGGGTGTTAGAAATAGAGGTGTTCATGAGCGGGTATCATGCTTTTCGGGCAATGTATAAAAAGGCTAAAGGCGCAACAAGGCGTTTGGATTTTCCAAGGCGCGGTTCAGTGCGCCTCGGTGTGCCTCATTGAAGTGAGACGCACTTAATAAAAAGTAAAAGAATGTGAAAAAATAGTGTGTGCCTCGGGAGGTGTACCTCAAGGTGCGCCTTGGTGCTCCTTGTTGCGACTTAGGTGCGCCTCATTGAAATCGTCGCCCAGCCATAA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ATGAGCTATATGCCTCAAGACTTCCGTGGTACCTTGATTCGACAACAAAGGGAACGCTCAGAGAGGACTAAACAAGCTGAAATCGATGCTTTGGTCAAGTCTGGAGGCAGTATACATGATCGATATGCGTTGCTGTGGAAGCAACAGATGGAAAGGAGGCGACAGCTGGCACAGCTTGGATCTGCAACAGGTGTATATAAAACACTTGTGAAGTACCTAGTAGGAGTACCACAGGTATTGCTGGATTTTATTCGACAGATAAATGATGACGATGGGCCAATGGAAGAGCAAAGGCATCGGTATGGACCACCATTGTACAGCCTTACGAAGATGGTGCTCACTATACGGCTGTTTATTTTTCTTATGTGGACACGTTTTGATGCCAGAAAAATAACAGAAAAGGAATTAGCTACTTTGGAACAAGCTGTTAACACTTATACTACTGAATTTGAGAGTGAGGTTTTTGCAAATTCGCCCTTCTTTATATCAGCTGATGAAGTAGGCTCCATAGATTCAAGAAATGATGATTACAAAGAAATAAGCATTCCTGCTGGGAAACTCCATGAGGTGGTGTTGTCAGTGGATTCGATTAACTCATATATTGCTTGGGACTTCTCGTTGGAACAAAGTAAAATGAAATTGGTACGCTCTAGGACTTTTTAA MSYMPQDFRGTLIRQQRERSERTKQAEIDALVKSGGSIHDRYALLWKQQMERRRQLAQLGSATGVYKTLVKYLVGVPQVLLDFIRQINDDDGPMEEQRHRYGPPLYSLTKMVLTIRLFIFLMWTRFDARKITEKELATLEQAVNTYTTEFESEVFANSPFFISADEVGSIDSRNDDYKEISIPAGKLHEVVLSVDSINSYIAWDFSLEQSKMKLVRSRTF Relationships
The following mRNA feature(s) are a part of this gene:
Homology
BLAST of Spo23103.1 vs. NCBI nr
Match: gi|902169578|gb|KNA07678.1| (hypothetical protein SOVF_169670 isoform B, partial [Spinacia oleracea]) HSP 1 Score: 414.1 bits (1063), Expect = 1.600e-112 Identity = 213/220 (96.82%), Postives = 213/220 (96.82%), Query Frame = 1
BLAST of Spo23103.1 vs. NCBI nr
Match: gi|902169577|gb|KNA07677.1| (hypothetical protein SOVF_169670 isoform A, partial [Spinacia oleracea]) HSP 1 Score: 409.5 bits (1051), Expect = 3.800e-111 Identity = 213/221 (96.38%), Postives = 213/221 (96.38%), Query Frame = 1
BLAST of Spo23103.1 vs. NCBI nr
Match: gi|731325318|ref|XP_010673452.1| (PREDICTED: uncharacterized protein LOC104889827 [Beta vulgaris subsp. vulgaris]) HSP 1 Score: 370.5 bits (950), Expect = 2.000e-99 Identity = 191/220 (86.82%), Postives = 198/220 (90.00%), Query Frame = 1
BLAST of Spo23103.1 vs. NCBI nr
Match: gi|920719527|gb|KOM58724.1| (hypothetical protein LR48_Vigan11g175800 [Vigna angularis]) HSP 1 Score: 340.9 bits (873), Expect = 1.700e-90 Identity = 164/215 (76.28%), Postives = 192/215 (89.30%), Query Frame = 1
BLAST of Spo23103.1 vs. NCBI nr
Match: gi|359480951|ref|XP_002264842.2| (PREDICTED: uncharacterized protein LOC100243295 isoform X1 [Vitis vinifera]) HSP 1 Score: 340.1 bits (871), Expect = 2.900e-90 Identity = 172/221 (77.83%), Postives = 193/221 (87.33%), Query Frame = 1
BLAST of Spo23103.1 vs. UniProtKB/TrEMBL
Match: A0A0K9QLX3_SPIOL (Uncharacterized protein (Fragment) OS=Spinacia oleracea GN=SOVF_169670 PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 414.1 bits (1063), Expect = 1.100e-112 Identity = 213/220 (96.82%), Postives = 213/220 (96.82%), Query Frame = 1
BLAST of Spo23103.1 vs. UniProtKB/TrEMBL
Match: A0A0K9QKA7_SPIOL (Uncharacterized protein (Fragment) OS=Spinacia oleracea GN=SOVF_169670 PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 409.5 bits (1051), Expect = 2.700e-111 Identity = 213/221 (96.38%), Postives = 213/221 (96.38%), Query Frame = 1
BLAST of Spo23103.1 vs. UniProtKB/TrEMBL
Match: A0A0J8CLC7_BETVU (Uncharacterized protein OS=Beta vulgaris subsp. vulgaris GN=BVRB_4g070820 PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 370.5 bits (950), Expect = 1.400e-99 Identity = 191/220 (86.82%), Postives = 198/220 (90.00%), Query Frame = 1
BLAST of Spo23103.1 vs. UniProtKB/TrEMBL
Match: A0A0L9VV90_PHAAN (Uncharacterized protein OS=Phaseolus angularis GN=LR48_Vigan11g175800 PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 340.9 bits (873), Expect = 1.200e-90 Identity = 164/215 (76.28%), Postives = 192/215 (89.30%), Query Frame = 1
BLAST of Spo23103.1 vs. UniProtKB/TrEMBL
Match: D7TKV8_VITVI (Putative uncharacterized protein OS=Vitis vinifera GN=VIT_08s0056g00110 PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 340.1 bits (871), Expect = 2.000e-90 Identity = 172/221 (77.83%), Postives = 193/221 (87.33%), Query Frame = 1
BLAST of Spo23103.1 vs. TAIR (Arabidopsis)
Match: AT5G01010.2 (EXPRESSED IN: 23 plant structures) HSP 1 Score: 311.6 bits (797), Expect = 3.800e-85 Identity = 158/222 (71.17%), Postives = 185/222 (83.33%), Query Frame = 1
The following BLAST results are available for this feature:
BLAST of Spo23103.1 vs. NCBI nr
Analysis Date: 2018-06-29 (blastp Spinacia oleracea peptides vs. NCBI nr) Total hits: 5
BLAST of Spo23103.1 vs. UniProtKB/TrEMBL
Analysis Date: 2018-06-29 (blastp Spinacia oleracea peptides vs. UniprotKB/TrEMBL) Total hits: 5
BLAST of Spo23103.1 vs. ExPASy Swiss-Prot
Analysis Date: 2018-06-29 (blastp Spinacia oleracea peptides vs. ExPASy SwissProt) Total hits: 0
BLAST of Spo23103.1 vs. TAIR (Arabidopsis)
Analysis Date: 2018-06-29 (blastp Spinacia oleracea peptides vs. TAIR) Total hits: 1
InterPro
Analysis Name: InterPro Annotations of S. oleracea
Date Performed: 2018-06-29
GO Annotation
GO Assignments
This gene is annotated with the following GO terms.
RNA-Seq Expression
Co-expression
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