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Sequences
The following sequences are available for this feature:
Legend: five_prime_UTRexonpolypeptideCDS Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.AATTCCAAAATAATATTAGTGGCAAAACCGTAATAAACTCAAAATGAAAGGGTAATATTGAACAATGAAACATTCACAATATAAGCACACGGACATCTCACACACATTCGAAATAGCTTCTTCTTTTTTCTTCTTCTGTTTTTTTTTTCTTCCTCTCCATTCATTTTCTCTCTATTCTTCTCTCTTTCTCCTCCTTATATTGCGCTTACTGGTGTATAAGCTTATACAAGACGTAACAAAAAAAACTAAATAAATTTATAAATCCAATAAAATAAAATTATTTTTATTAAAATAGAGAAGAAAAAATGACAGGAGGAACAACAACAACGAATAATAACCTCCTCCTCCTCCTTTATCTCTCTGTCTTAATCACCACCCTCTTCGCCGTCGTGTCTAACGCCGCGTTTAACCTCTCCACCATCACCTTCGACGACGGCTACACCCCTCTTTTCGCCGATTTCAACATCAAAAAGTCCGATGACGGCCGCGCCGCCAACCTCCACCTTAACAAATACGCCGGTACGTACTTTTCTTCCCCTTTTTCCGGTAACTAAAAAAACATAACAAAATTACATGATATCATTAAAATTGGAGTTCTGTATACGATAAGTCTCAAATTTTAATCATCGCTCTCCATTTTTAATAATTTATACAATTTTTTTTTTTTTCTGGCTCATTCGCGCAAAAAATTAAAAAATAAAGAAAATTTAACGGGTGTTATTGTTTTGTTTTTTTTTTGGTGTTAGCATCCGGTTTATCCTTAGGCTAATCCGGATTCGGGGCGAGTTCTGGGTGGTTAGGTTCCAGTCACCTCCCGATTGTTGTTGCGGGGGATCGAACACGGGTTCTCCCTACCAAGTTCAGCCCCAATCACCACTAAACCAACAAGCAATTGGTGGTGTTATTGTTTTGTACATGAGTTGTTAGGCATTTGTGTCATGTCATGTCGTGTTTGGTTTTGAATTTTATTTTCGTCCATAACTTTGTGTTAGTTTCGTGTTATGTTGTCTTACCAAACGTGATTTTTGTTATGTTCCGGCGGAACGACTAACCAATATTCGATTCTTGTTATTTGTTGTATTATTATTAATCATAATTTAATATTTTAATTTAATATTAACATGAATATTTTTGTTTATAATTTTCAGGGTCAGGATTCATTTCATCACAATACTACGATTATGGATTCTTCAGCTCAAAGATTAAGTTGCCCGGCGATTACACGGCCGGAGTTGTGGTTGCCTTTTATGTAAGTCCGTCATTAATAATTTATTTATTATCGTCTGCCAAACAGGTCATAAAAACAAATATACAATGGTCTTTTATACACGAGTTTGGATATATAAAGGTTAATTAAAGTACGGTTTAATTTTAAAATTATATTTATTATCGCCTACGAGGTTGTTATACATGAAGGTTAAGGTATTGTTTAATTTTGAAATTATATTTATTATCGCCTATCGAACAGGTCATGAAATAGTTCTTTTAATACACGAGGTTGTTATACATAAAGTTAAATGTATTGAAATTATGTTTATTATCGTCTACCAAACAGGTCATAAAATAGTTCTTTTAATACACGAGGTTGTTATATATAAACGTTAATGTATTGTTTAATTTTGAAATTATATTTATTATCGCCTGTGAGGCTGTTATACATAAAGGTTAAGGTATTGTTTAATTTTGAAATTATATTTATCGCGTACCGAACATGTCATAAAATAGTTCTTTTAATATACGAGGTTGTTATACACAAAGGTTAATTGAGGTATTGTTTAATTTTGAAATTATATTTATTATCGCCTACCAAACAGCCAAACAGGTCATACAATAGTTCTTTTAATACACGAGGTTGTTATGTATAAAAGTTAATTAATGTATTGTTTAATTTTGAAATTGTATATATTTACAGACATCTAATGGTGATGTGTGGGAGAAGACACACGACGAATTGGACATAGAATTCTTGGGAAACTTGAAGGGAAAGCCATGGAGATTTCAAACAAACATGTACGGAAATGGAAGTACAAGTAGAGGAAGGGAAGAAAGATATCGACTATGGTTTGATCCTACTAAGGATTTTCATCAATATAGCATTCTTTGGACTCGCAAAAATATCATGTATGTTTTTCTTCACCCTCTCTTTTTATTTTTATTTAATTTTATATTACTCGAAATCTAGTTAGTTACTCCCTCTGTCCGAAAAGATTGTCCCATTTAACTTTTCACGGTTTCCAACACGACTTTAAATATTGCAACGGAGCAATCTTTTAGGTGCGGAGTGAGTATAACATAAACATTTTTAATTATAAGGTAGCGTGTTCATTACTATTATAAACTATTTTCGTGTTATTCTCACTACTCGTGTTCGTTCATAATTCGTATATAAGTAACTACAAAAAGTTTTGTAAGGTGGTGCGTTTTTAGCTTGATATGTATTCGTATGACCGTATCCGTATCCTTATCAATTTGGGTGGGTTTTGAGTATAAGGTAGCGTGTTTGTTACTACTATAAACTATTTCCGTGTTATTATCACTACTCGTGTTCGTTCATACTTCGTATATAAGTAACTACAAAAAGTTTCATAATTAGGTGGCGCGTTTTTAGCTTGATATGTGTCTCGGTATCCGTATCTGTATCCGTATCCATAATAATTTGGGTGGGTTTTGAGACTTTTGGGTGACTTTTAGTAGCTGGGGGGTGGCTGGGATTTTGGCTTTTACCAGCCACTTTATCTAACGCGGAAGAAAAGGAGAGATTTGTGGTGGGTGATTATTATTGGTATGGAGGAGAGTGTCCCAACTCCCAACGCCAAATATTTTCTTTCCAAATCACTTTTGTTATTTTTTGACCATTTTTATTTTAGTATAATAAATTAATAAGCCTTTTTTCTCTATTGTTAGGTAAACTTTTCACATTGGCTATTATTCTAATATTAGTGATTTCATTTCCTACATCATTATTCTAAAAATAAATACACTTTTCTAACTTTAAAAAAAAAAAATATATATAGAATAATAGAAATAGTTTCTTACTTATTTTAGATTTAATATCGGAGAAATTTCCTACTTTTTAGGGAATACCTATATTTTTTCTTTAAATAATGCTAAAAATAATTATATTTTTCTAATTTTTTAATACAATAAAAGAATATTTTCTTACTTATTTTAGACTTATTATAAGAGAAATTTCCTATATTTGAGGGGAATTTAAAATGGATATTATATGGCACATAATTTACTTCTTTATTTTTATATTGTTGTTTGTTTTTATAATAAAAAAATCGCATCATAATCTACAAATCTTAACCATTAAGTTCTAGCTAACCGTTGCTAGGTGACAATATAAATTTGGACCTAATAATATTTGCTAGCTAAGCCTAAGATCATATTTCATTTGTATATGGAATCTTTGCCCCTTTATATTTCATAATTATTTTTTAAAATAAAAATCTTATTCAAAATTAAAGTACCAATGATTTGACATCTACTCAAAAAATTTATACGCGCCTTAATTATATGCTATAGGAAGTGGATAATTGGATGTCTCATGATGCCTCATATATTTGCTCATTAATAGGTGTAAAAGTGCTATATAGATACCATGGTCCATGGCACATTAATAGTTTAGTTCCCACTTGGCCATACGTTCATAATTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTATAATTGGTGCGAATAAGTTATAAGGGTAATACAAATTACAAATAGGAGTATGTGGGAGGATTCAAACCCGAGATATTCCTGCACAGACTCTTAGTCTTAATCACTAGGCCAGTACTGATTCCAAAATTTTCTTTTAATAGTTTGCATAATTGTAAGCCTTAGCTAGCTTGTTTAGGCGATCCATATTTGACCATAAGCAATCCATATTTTTAGGTAAACAATCATTCAACTTTTATGTTGGTTACTAAATATTTCTACTCAAAAAATTGCATTAATTTTGTAATTAATTACTAAGGTGAAATGTCAAAGTGATGATGATGTATCATTCATTTCTTTGCAATGACTAGAAAGTTATGAGAGTGCACGCTTCTTTGCCTTCAATCATTATTTATACATTTGTATCTAGTGTTTTGCAACAAATCATATTTTGTCATTTCTTTTTTGATTTTTTCTTCTTCTTAATTTTACTTTCTCCTTTTTTTTAATTTTTTTTTTTTTTTTTGAGGATGAGACATAGACACAAGGAGTATATAAATTATAAAAAAGAAAATGAGGGATTCGAACCTGTAAACTATTGTACAAAGATTCTTCGAACATGAGACCTCTTGTACAAAAGCCTTCAATCCTATACTCTTAGGTGCATAATTTTCATGTTTTTTTATATGAGTTGAAAACTTGTAGCGATAGTGTGTATATTGACGTGCTTTTGTAGAACATATACGATGTACCCAGGTGCACCATACACATTTTATGTTTTTATGTTTTTCACATAAAATACTCTTAGCTGCATAATTTTCATGTTTTTGTGTGCAGTACAAGTACTATTATGAAGTTAGAAAAAATTAATGCTTAAAAGTTAGAACTAATAATAGTATGTTACTAAACCATACACATATTTTCATGCAATGCAGATTTTACGTAGACAACGTCCCAATAAGAGAAATAGTCCGCAATGAAGCAATGGGCTCGGACTACCCATCCAAGCCCATGTCCCTCTACGCCACCATATGGGACGCCTCGAGTTGGGCCACCGCCGGTGGCAAATACAAGGTCAAGTACGAGTTCGAACCCTTCGTGTCCGAGTTCACCGACTTCGTCCTCGACGGGTGTCCGGTGGACCCCATCGAGCAAGTCGCCGGAACCACCAGCGCCTCCGACTGCACCGCCAAGAAAGACGAGATCGAAAACAAAGATTATTCCCAAATTACCCCTGGAGGACAAAAGGCCATGAAGTGGTTTAGGGAGAAGTACATGTACTACTCATATTGTTACGACACGGTCCGGTACCCGGTCCCACCACCGGAATGTGTAATCG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ATGACAGGAGGAACAACAACAACGAATAATAACCTCCTCCTCCTCCTTTATCTCTCTGTCTTAATCACCACCCTCTTCGCCGTCGTGTCTAACGCCGCGTTTAACCTCTCCACCATCACCTTCGACGACGGCTACACCCCTCTTTTCGCCGATTTCAACATCAAAAAGTCCGATGACGGCCGCGCCGCCAACCTCCACCTTAACAAATACGCCGGGTCAGGATTCATTTCATCACAATACTACGATTATGGATTCTTCAGCTCAAAGATTAAGTTGCCCGGCGATTACACGGCCGGAGTTGTGGTTGCCTTTTATACATCTAATGGTGATGTGTGGGAGAAGACACACGACGAATTGGACATAGAATTCTTGGGAAACTTGAAGGGAAAGCCATGGAGATTTCAAACAAACATGTACGGAAATGGAAGTACAAGTAGAGGAAGGGAAGAAAGATATCGACTATGGTTTGATCCTACTAAGGATTTTCATCAATATAGCATTCTTTGGACTCGCAAAAATATCATATTTTACGTAGACAACGTCCCAATAAGAGAAATAGTCCGCAATGAAGCAATGGGCTCGGACTACCCATCCAAGCCCATGTCCCTCTACGCCACCATATGGGACGCCTCGAGTTGGGCCACCGCCGGTGGCAAATACAAGGTCAAGTACGAGTTCGAACCCTTCGTGTCCGAGTTCACCGACTTCGTCCTCGACGGGTGTCCGGTGGACCCCATCGAGCAAGTCGCCGGAACCACCAGCGCCTCCGACTGCACCGCCAAGAAAGACGAGATCGAAAACAAAGATTATTCCCAAATTACCCCTGGAGGACAAAAGGCCATGAAGTGGTTTAGGGAGAAGTACATGTACTACTCATATTGTTACGACACGGTCCGGTACCCGGTCCCACCACCGGAATGTGTAATCGTGGCGTCGGAGCAGGAGAAGTTTAAGGAAACGGGCCGGCTTAAGTTCGGGTCGATTCCTAAGAGGCAGAGGAGGAGGAAGGGTCGTGGGAGGAGGCAAAGTAATAATGTTGTGGTGAAGGAATTACAAGCAAATATAGTCCCAGACCCGTTTGATGGCCCGTCCAAACTTGAGCAGCTTCAGATTTCAAAGTTTTGCCTTTCGCAAATTCGCATTTGGAGTGTGCGCAAATTCGCAGTCTCTCTCAAGTATCAACCTAACAGAAGGATCAAATCATCTTCACAATTGAATAATGCATCACTTATTCAAATTTTCACCAAGAATTACCCAATTTCCCACCCCATTTGTGTTCTTCTTCAAGAAACTATCTTTAATTCATATATTCAAGCCAAAATGGGTGAGGAGGCTTTGAGTTCCTTCACTGAGATGATTAATCAGGGTTCGGTACCGAGGTCGAATTTGTTTAATTCATTGTTGATTCTTCTTTTAGAAAGCAACAATCTTGAAAAGGCTTGGTGGGTTTTTAATGAATTTAGGAGTAAAGTTGAATTGGATGAATATAGTTTTGGGATTATGGTTAAGGGTTTTTGCCAAGGAAATGATTTGAAAAGAGCTTTTGATGTGTTGGGTGGATTAGAAGATGTGGGTATGTCTCCAAATGTTGTTATTTATACCACTTTGATTGATGGGTGTTGTAAAAATGGAGATATTTCTAAGGCAAAGGACTTGTTCCGCAAGATGGAGGAATTGGGATTAGTAGCTAATCAACATACTTACACTGTTTTGATGAATGGGTTATTTAAGAAAGGGCTTAAGAAAGAAGGGTTCCAACTCTATGAGAAGATGAAGGCTTGTGGGACCTTACCTAATATTTACACTTACAACAGTATGATGAGTGAGCATTGTAAAGATGGATTGTTAGGCCGAGCCCTCCTGTTGTTCGATGAAATGCTCGAGAGAGGTTTGGCGCGCAACATTGTTACCTACAACATATTGATTAGTGGCCTGTGCAAGGAGAAGGACCCTTTGGAGGCTGAGAAATTGGTGACACAGATGAAAAACTATGGCCTAAGTCCAAATTTGATCACCTATAATACCCTAATTGATGGGTTCTGTAACATTGGGAAGTTAGACAAGGCTTTGAGTTTGTTTGGTCAGATGAAGTTGGATGCTCAAATGCCATCTTTGGTGACATATAACACTCTTATTTCAGGTTTCTCTAAATCTGGAAATTCCAACAGGGCTACTAAATTACTCAGGGAGATGGAAGAGCGTGGTATCACCCCGTCTAAAGTGACATACACAATTCTAATCGATGCGATTGTTCGATCTGGTAACATGGAGAAGGCATTAGAGATGTATTATTCAATGGAAAAGGTTGGATTGGTACCAGATGCTTACACTATTGGTGCCTTGATAAATGGATGGTGTACCAAGGGTAGGATGTTAGAAGCATCGAAGTTGCTCAAATCAATGGAGATAATGCATTTACATCCAAGTGATGTGATTTATAATATGATGATTAATGGTTACTGCAAAGAGGGAAGTTCTTACAGGGCATTGCGGTCCCTTAGAGATATGAGGGAACACGGAATGGTTCCAAATGTTGGTAGCTATTGTTCAACTATACATGTCCTCTGCAAAGATGGGAAGTTAAAAGAAGGTGGAGAATTAGTTGAGGAGATGATCAAATTGAATTCAGCTGCAGTCGCATCTGCTGCAGGGCAATCCCAAAATCTCATGACTCAGTACTAG MTGGTTTTNNNLLLLLYLSVLITTLFAVVSNAAFNLSTITFDDGYTPLFADFNIKKSDDGRAANLHLNKYAGSGFISSQYYDYGFFSSKIKLPGDYTAGVVVAFYTSNGDVWEKTHDELDIEFLGNLKGKPWRFQTNMYGNGSTSRGREERYRLWFDPTKDFHQYSILWTRKNIIFYVDNVPIREIVRNEAMGSDYPSKPMSLYATIWDASSWATAGGKYKVKYEFEPFVSEFTDFVLDGCPVDPIEQVAGTTSASDCTAKKDEIENKDYSQITPGGQKAMKWFREKYMYYSYCYDTVRYPVPPPECVIVASEQEKFKETGRLKFGSIPKRQRRRKGRGRRQSNNVVVKELQANIVPDPFDGPSKLEQLQISKFCLSQIRIWSVRKFAVSLKYQPNRRIKSSSQLNNASLIQIFTKNYPISHPICVLLQETIFNSYIQAKMGEEALSSFTEMINQGSVPRSNLFNSLLILLLESNNLEKAWWVFNEFRSKVELDEYSFGIMVKGFCQGNDLKRAFDVLGGLEDVGMSPNVVIYTTLIDGCCKNGDISKAKDLFRKMEELGLVANQHTYTVLMNGLFKKGLKKEGFQLYEKMKACGTLPNIYTYNSMMSEHCKDGLLGRALLLFDEMLERGLARNIVTYNILISGLCKEKDPLEAEKLVTQMKNYGLSPNLITYNTLIDGFCNIGKLDKALSLFGQMKLDAQMPSLVTYNTLISGFSKSGNSNRATKLLREMEERGITPSKVTYTILIDAIVRSGNMEKALEMYYSMEKVGLVPDAYTIGALINGWCTKGRMLEASKLLKSMEIMHLHPSDVIYNMMINGYCKEGSSYRALRSLRDMREHGMVPNVGSYCSTIHVLCKDGKLKEGGELVEEMIKLNSAAVASAAGQSQNLMTQY Relationships
The following mRNA feature(s) are a part of this gene:
Homology
BLAST of Spo23238.1 vs. NCBI nr
Match: gi|902233392|gb|KNA23028.1| (hypothetical protein SOVF_028450 [Spinacia oleracea]) HSP 1 Score: 876.7 bits (2264), Expect = 3.400e-251 Identity = 432/434 (99.54%), Postives = 433/434 (99.77%), Query Frame = 1
BLAST of Spo23238.1 vs. NCBI nr
Match: gi|731332767|ref|XP_010677381.1| (PREDICTED: pentatricopeptide repeat-containing protein At4g11690 [Beta vulgaris subsp. vulgaris]) HSP 1 Score: 816.2 bits (2107), Expect = 5.500e-233 Identity = 396/477 (83.02%), Postives = 432/477 (90.57%), Query Frame = 1
BLAST of Spo23238.1 vs. NCBI nr
Match: gi|902233393|gb|KNA23029.1| (hypothetical protein SOVF_028460 [Spinacia oleracea]) HSP 1 Score: 724.5 bits (1869), Expect = 2.200e-205 Identity = 354/355 (99.72%), Postives = 355/355 (100.00%), Query Frame = 1
BLAST of Spo23238.1 vs. NCBI nr
Match: gi|731332769|ref|XP_010677382.1| (PREDICTED: probable xyloglucan endotransglucosylase/hydrolase protein 30 [Beta vulgaris subsp. vulgaris]) HSP 1 Score: 641.3 bits (1653), Expect = 2.400e-180 Identity = 306/355 (86.20%), Postives = 333/355 (93.80%), Query Frame = 1
BLAST of Spo23238.1 vs. NCBI nr
Match: gi|645216993|ref|XP_008223610.1| (PREDICTED: pentatricopeptide repeat-containing protein At4g11690 [Prunus mume]) HSP 1 Score: 587.8 bits (1514), Expect = 3.200e-164 Identity = 282/473 (59.62%), Postives = 370/473 (78.22%), Query Frame = 1
BLAST of Spo23238.1 vs. UniProtKB/TrEMBL
Match: A0A0K9RU88_SPIOL (Uncharacterized protein OS=Spinacia oleracea GN=SOVF_028450 PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 876.7 bits (2264), Expect = 2.400e-251 Identity = 432/434 (99.54%), Postives = 433/434 (99.77%), Query Frame = 1
BLAST of Spo23238.1 vs. UniProtKB/TrEMBL
Match: A0A0J8CH52_BETVU (Uncharacterized protein OS=Beta vulgaris subsp. vulgaris GN=BVRB_5g107140 PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 816.2 bits (2107), Expect = 3.800e-233 Identity = 396/477 (83.02%), Postives = 432/477 (90.57%), Query Frame = 1
BLAST of Spo23238.1 vs. UniProtKB/TrEMBL
Match: A0A0K9RVS5_SPIOL (Xyloglucan endotransglucosylase/hydrolase OS=Spinacia oleracea GN=SOVF_028460 PE=3 SV=1) HSP 1 Score: 724.5 bits (1869), Expect = 1.500e-205 Identity = 354/355 (99.72%), Postives = 355/355 (100.00%), Query Frame = 1
BLAST of Spo23238.1 vs. UniProtKB/TrEMBL
Match: A0A0J8CH06_BETVU (Xyloglucan endotransglucosylase/hydrolase OS=Beta vulgaris subsp. vulgaris GN=BVRB_5g107150 PE=3 SV=1) HSP 1 Score: 641.3 bits (1653), Expect = 1.700e-180 Identity = 306/355 (86.20%), Postives = 333/355 (93.80%), Query Frame = 1
BLAST of Spo23238.1 vs. UniProtKB/TrEMBL
Match: D7SKF2_VITVI (Putative uncharacterized protein OS=Vitis vinifera GN=VIT_06s0004g04770 PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 582.0 bits (1499), Expect = 1.200e-162 Identity = 289/474 (60.97%), Postives = 360/474 (75.95%), Query Frame = 1
BLAST of Spo23238.1 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: PP306_ARATH (Pentatricopeptide repeat-containing protein At4g11690 OS=Arabidopsis thaliana GN=At4g11690 PE=2 SV=1) HSP 1 Score: 524.2 bits (1349), Expect = 2.700e-147 Identity = 261/464 (56.25%), Postives = 340/464 (73.28%), Query Frame = 1
BLAST of Spo23238.1 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: XTH30_ARATH (Probable xyloglucan endotransglucosylase/hydrolase protein 30 OS=Arabidopsis thaliana GN=XTH30 PE=2 SV=2) HSP 1 Score: 437.2 bits (1123), Expect = 4.400e-121 Identity = 207/326 (63.50%), Postives = 260/326 (79.75%), Query Frame = 1
BLAST of Spo23238.1 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: XTH29_ARATH (Probable xyloglucan endotransglucosylase/hydrolase protein 29 OS=Arabidopsis thaliana GN=XTH29 PE=2 SV=1) HSP 1 Score: 411.4 bits (1056), Expect = 2.600e-113 Identity = 208/349 (59.60%), Postives = 257/349 (73.64%), Query Frame = 1
BLAST of Spo23238.1 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: XTH28_ARATH (Probable xyloglucan endotransglucosylase/hydrolase protein 28 OS=Arabidopsis thaliana GN=XTH28 PE=2 SV=1) HSP 1 Score: 350.5 bits (898), Expect = 5.400e-95 Identity = 173/323 (53.56%), Postives = 226/323 (69.97%), Query Frame = 1
BLAST of Spo23238.1 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: XTH27_ARATH (Probable xyloglucan endotransglucosylase/hydrolase protein 27 OS=Arabidopsis thaliana GN=XTH27 PE=2 SV=2) HSP 1 Score: 349.4 bits (895), Expect = 1.200e-94 Identity = 174/327 (53.21%), Postives = 221/327 (67.58%), Query Frame = 1
BLAST of Spo23238.1 vs. TAIR (Arabidopsis)
Match: AT4G11690.1 (Pentatricopeptide repeat (PPR-like) superfamily protein) HSP 1 Score: 524.2 bits (1349), Expect = 1.500e-148 Identity = 261/464 (56.25%), Postives = 340/464 (73.28%), Query Frame = 1
BLAST of Spo23238.1 vs. TAIR (Arabidopsis)
Match: AT1G32170.1 (xyloglucan endotransglucosylase/hydrolase 30) HSP 1 Score: 437.2 bits (1123), Expect = 2.500e-122 Identity = 207/326 (63.50%), Postives = 260/326 (79.75%), Query Frame = 1
BLAST of Spo23238.1 vs. TAIR (Arabidopsis)
Match: AT4G18990.1 (xyloglucan endotransglucosylase/hydrolase 29) HSP 1 Score: 411.4 bits (1056), Expect = 1.400e-114 Identity = 208/349 (59.60%), Postives = 257/349 (73.64%), Query Frame = 1
BLAST of Spo23238.1 vs. TAIR (Arabidopsis)
Match: AT1G14720.1 (xyloglucan endotransglucosylase/hydrolase 28) HSP 1 Score: 350.5 bits (898), Expect = 3.000e-96 Identity = 173/323 (53.56%), Postives = 226/323 (69.97%), Query Frame = 1
BLAST of Spo23238.1 vs. TAIR (Arabidopsis)
Match: AT2G01850.1 (endoxyloglucan transferase A3) HSP 1 Score: 349.4 bits (895), Expect = 6.700e-96 Identity = 174/327 (53.21%), Postives = 221/327 (67.58%), Query Frame = 1
The following BLAST results are available for this feature:
BLAST of Spo23238.1 vs. NCBI nr
Analysis Date: 2018-06-29 (blastp Spinacia oleracea peptides vs. NCBI nr) Total hits: 5 Position : 0 Zoom : x 1
BLAST of Spo23238.1 vs. UniProtKB/TrEMBL
Analysis Date: 2018-06-29 (blastp Spinacia oleracea peptides vs. UniprotKB/TrEMBL) Total hits: 5 Position : 0 Zoom : x 1
BLAST of Spo23238.1 vs. ExPASy Swiss-Prot
Analysis Date: 2018-06-29 (blastp Spinacia oleracea peptides vs. ExPASy SwissProt) Total hits: 5 Position : 0 Zoom : x 1
BLAST of Spo23238.1 vs. TAIR (Arabidopsis)
Analysis Date: 2018-06-29 (blastp Spinacia oleracea peptides vs. TAIR) Total hits: 5 Position : 0 Zoom : x 1
InterPro
Analysis Name: InterPro Annotations of S. oleracea
Date Performed: 2018-06-29 Position : 0 Zoom : x 1
GO Annotation
GO Assignments
This gene is annotated with the following GO terms.
RNA-Seq Expression
Co-expression
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