Overview
Sequences
The following sequences are available for this feature:
Legend: five_prime_UTRexonpolypeptideCDSthree_prime_UTR Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.CATTCTCACACACCGGTCAAAGAAAGGAAAAACGAGAATACCAGAAAGAAACGTGATATCCGATTATCCGGTAGCCCAAAAGCCGTCACCGCCTAATCCCCTGCAACTTTGCAATTGCGCCCTTTTATGCGGTTTATCACTTCACTATTCAGTTAGTACTATTCCCTCATTTTTCTCTCTCCTATTTTTTGTTTTCACCTTTTTTAGCAACTCACAAATCAAATAACCACCAATCAACTTCTTCTTCTCCAATCTTCAACCCATCTCTCATCCGCCATTTCCATTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCCTCATACCAGAAAATATGTTAGTCTTATCTTCCTCTGCTCCACCCGTTCTCGAGGTGTGCAAAGATAGGGTTTCTTCTTCGTTTTCTACTTCCTCGTCGTCTTCTTCGTCGGCGTTTTCTGCGGTGGTGTTTCGTCGGAGTTTTTTCACTCGGTTTAACTCGTCTCTAATATGCTGCTGCTCTTCCAAGCTCAAATTAATGGCGGACACTGCTCTTCCGTCCTCGTCTTCTTCGACGTCTGCTTCTGCTTCTTATTCTGCTGCTGCGAAGTCTGTTGAAGAGGAGAATCACGAGATTCCTGTTAAGAAAGAAGATGACAATCAACTTCTTCGTTCTCGCACTTATCGTAACGTTCGTTCTGCAGAAGGTTTTCTCTCTCTCTCTCTCTTTTCTCATTTTTTATTTTATTTTATTATGGAGTACTACATTGTCTTTAGTTTCATAATTATGCTGAATGCCTGAAATGTAGATGTATATTTGATTCGTAATCTGAGCATCTTTCATTGTTTTTCCTCTAATCAATTTATGTAGGAATTATCCGCTTATTTTTTTTATTTGATTTTGAAAATTTTGCGACAGAACAATTGATTTGTATCCATTTTCATGTTTCATCGCTTATGAAATAATCGGCGGCAAGTATATGTGGCAGTTTCTTGAATTCTTTTTCCGGTTTTTTACTACTATGCTGAAATGTGGATTTCTGCTCGACTGATAGCTGAACATTCGGTTTCATGAATTTTTGTTTTATTTTATCAATTATTTAGTTCTCTGCTTGTTTTAATTATCTGATTTTTGGTTGATGTACTTTAATGATTAGACAATATATAACAATATGGAATTTGAGAGAGAGCAGTCCCTTGTTGGTCATCTTTCTTAGAATGAAAGGTTTTTTAGTGACTGCTTACTGTTTGAGTCATGTGTGTTGTGATTCCTCCTTAAGCGCGTAAAAGATTTTGTGTATTTTCTTTAATTCATAAGTTTCTCGATTGTTGTCTATGGAATATGATTTAGAGTAGGTTCTTACATCCTAGGATAGTTCAGAAACAATGTCATATATTCTAATAACAATGTACTTTAGGTTTCCTAATGAAATGTAAAAAGATGAGTGTCATACTTCAAACATCCTTAGTTTGACTTGATTCTTTAAGTTGTGATATTTTTCAGAAGTGAGCGACCGTTGATTAGGAAGTATGAGTAAATTGAAAATTAGCTAGAGTGAGTTTGTGTAGGCAATTGCTGATAAATTCTTGTAATTTCACCTGTGACATATTGGCACCAAATAAGCGGAGAAAGGAAAAGATTGCCCTATATATGGCTATATACACTTTCTTAAAACATGCCTCTGTTTACTCCATGTTTTAGCTGGCTGCAGTGTAGCTTTGTGGTTAACTACACATCTACTACTACCTTGCACAGTGAGATTTTTCTTCCTTTATTTTAAAACCTATATCCAATTCAATAATGAACAGGGTCAGAAAAGTTGAATAGGTGTTTAATGGAACACTGTGTTTTGAGGGTGAGATGTCTTCTGTTGTCAGACTTGTCACATACAAGTTGTGAAAAAGTTGATTATCTAACTTTGAATCACAATTTTGGACAAGGAATCCTAGGTATGGGATGGATAACCTAGGACTTTGCATTTTGTTTTTCTTTAGGGTTCATGATGGTATAAAATAGTTTTAACAGTGAAAGGGAATTGGTGCATTAGCGTTACAGAATATACGATATTCTCTATCAGTAACAAATTAACTAACAAAACAATTATAAGGGAAAAGTTTCTTCTGGTATTGCTTTTAAGCTTTCCTCTTTGAGGATGTTGTATAGTTAGAGTGTTGGACCGGTGCAGTTGGAGCGACACTTAATTTTATGATATTGTGGTAGAAAATGAATTGATACATCCCTTACGTGCCTCCCCTCCCCGTTGATAGGTAGGTATTAGAGAGTGATATTAAAAGGATATTAACGGCGTGAAAACCATGTACAGATGGAGACTCCCTCTTGTTGTCTTGTTAATGTAATAGTTTATTACCTTAATTAGGTGGATAGTTCCTTTATGCCCTTAACGTTTTCTGCAGAAGCTAGATGGGTGAATAAGGCTTGCAACTTTGCATTCAAATGTATTTAGCCTTGACTTAGAATATTTGAGTATATGAGGAGTCACTGGGAGTTTTTCTAAGATCTCTTCTCTGATTATTTACTTATTGGGAATTGCATAGAATCGTGTACTAGAGTGCCGGAGGAATTCTCTATTTCACCAGCAGAGAGACTGTTCTTTACCTTGAAGTGAATTTAAGAGAAATAAGATTATAGATCTTAGCAAGACATCAATTTAGTACTGGCTATGTGGACATGGTAATTCAAATCTTTGCTGAATCAGATGTTGCATGTACTATAATATGCTGTTTCTGCTTTGGAGCAATATAATATGTTCTAGAAAGTATAATTTATCACTTACGCTATGCCTTGCGGCTTGCACTACGCTTGCAAACAGCAGGTCAACCAAATAAAAAGTATATGAAGTTATGGAAAGTTGTTGCAGCATTTTGTCTATAGCTTAACCTTGTGAAAATTCGTATTACAATAAAGCATACATCTATCTACGAAAGATAAATTTGAATTCTTCCCTTGCCCAGCTGTATAGTGAAGCAGCTTTTTACTTGTTCAGGAATGAAATCGTTTTTTCCTGGGATAATTAAAGATTACCGTTTATACACTGCGTATCTTGTGACACTGCTCTTTCTTATTCTGTTGTTCTTCCGGATATCTGTATAATTTTCCTTTTGTTTTCTTTCATGCTTGACAACCCTATGCAGTCAACCATGCTTGCTCTGTAATATGTAGTCGCTGTATCAATGCTACAGTTGAAGGGTTATTATTTTTGCTGAGTCAAGTGCTTGATCATTGTAAAGTCGCTGCAACTGTTCTATGTATTGACACATTAGTTTTGTTTACCATCTTGTATGGTTAGGTTGCAGCTAGACATTTTTCTTTGAGTATGAGAAAGAACATTCTTGCAATCTTCGATGCCCTTTCTATTTCAATAGTCTTATCTGCATACCTACATTCTGATTTCTTCCGTGAATTGATTTGTATTCTTTGCAGAGCTGATATCTGAAATAAAAAGGGAATCAGAAATTGGAAGGTTACCTAAAAGTGTTGCTTATGCTATGGAGGGACTTTTTCACTACTATCGCAATGCAGTAAGTTACATTATTGACCTATTCGTATCCTGGAATATTTCTGTCTGTACTTTGTAGTCTTTTCGAAAAATGGTTATTTTCTTCACACAAATGGGAAAATCCCATTGTTATGGTATTCTTTAATCCTTTTGGCTGTGAGCTCTGCATCACCCTTTTCCCATCATTCATCAGATAACATAAATACAGTTGCATGAAGTTTGACTCCTGGGATTGCATTTCGTTGTTTTCAATGTGTTTGACGAGTCCTAGAATACAAATGTTCTTCTCTTCTGTTACTTCCTCGCATATTTCTGGCAGACTTCAGTTTCCTTATCCATGCTATATTGCTATTTCACGACTAACCTAACTTAGTTTTCTGTTTCTCAACTTTGAAGTTGAAGTGCAAGTTTGTTTGAAATATAAGTAAAACGAGTTTTCCTTTTATTTTCTAACTTATTTGATTTTTCCTTTTGTTACTTTTTACCTGTTAGAGAAAGTTCTGCAGTTGGAGCTGCATGCCGTTTCTTGATTCTATGGATAGATAGATATGTGATTGTCTGAGGGCATGGTAATCTAGCCTTTTATATTGCTTTATCGAGGGAAGGGAATTGAAATATTAATCAAATTGCTGTTGAGACACAGATTGGATGTTGCCACAACAAGCTCTTCTGGTTTTATAATGGACAAGACTCAAGAAACATTAAATACAATTCACCTTTTCCTTAAATTGTAAAAAATTGAATATTGCAGAATAATTAAGCGTACATGGAGATAAAATGGCTCATTAACAGCCTGATATTCTTATTTGTCATGTGTTAGCTTACACTTGTTGCTAAGTATTTCATAACTGGATTAGCTAATTTAAGGGGCATTGAAAGCAGCCTCTCTGTTACCGCACGTGTTAGGTTGCGTATATCCGACCCCCTTGCCTTGCCCGACCAAAGATGGGAGATTTTATAGGGGCATTGGGGTAATGCGTTCTTTCTTTTAGAGGCAGAATAAACCTGTTGGATGAACTAAAGAAACTTTTGGATATCCTGCTTACGATTCTGATGATAGAGACTGTTATCCTGTTGCATGAGTGTTTTTTCTAGTGGTGATTGTGACATCTTTCAACTGATTGACTTTTCAGGTCCTTTCAAGTGGAATTTCTCATGCTGATGAAATAGTGTTGTCAAACATGAGTGTTATGCTTGATTTTGTTTTGTTGGATATTGAGGTATTTTTTGGTCAAATTTATTGTGCTCGTCGATATGTCTTATTCGTTTTACTACATTTCCACTTATGGTTGGTAGATGTTGGTTTGTTTTTTTATAGTCGTTCCAATTCTTCAAAATGGTTAATTGAATAAAAAGCTATAGAAAAAAAAAAAGCTACAGAACATTTTAATTATACGATGGGATTTATGCACCACTTAGCTACTTATGCGGTCTTAATAATATCTTACAGGACCCTTTTGTATTTCCACCGTTTCACAAAGCTATTCGAGAGCCTGCTGACTATTATTCCTTTGGTCAAGATTACATTCGGCCATTGGTAGATTTTGGGTGAGTCCAACCTCCTGTTTTGCTTCATGGTATCATAGTTTGTAGTAGTTTTTGACTTGTGACTTGAATTCTTGGGCTTTAATGAGCTGTATTTATTTCTGGTCGGTCTTATCTGAGAATCAATCGCCATAGAAGGACATTCGAAAAAGAATAGGGTGAAAATAATTATCAAGGGAAAAGGTGAAGCTTGATGTTCAGGAATTTAGCTAGCTGCTTATTCCTCTTTCTAGGACACAGCAACAAAAGCAACAAGAAATTCCTTAGAAAAAATCTTGTTGGCTGTAATTTTATGTTCAGTCCAAGTTTATTTAGTGTCCAAAAGAAGATGGTTTTAGCATTGTTTCTTGGATAGGATCTACATCTGGCCTGTCTTGCTTTCGTAGAATTGCCCAAGTGGTCATACTTTTGAGGTTTTCTCTTTGGTTCACTTTGACTTGTCTTGGCCATATTGATCACACAGGAGAGTTTATGCTTTTGGTTTTCTAATTTATTGGAACAAATGATGCACTTTGCTGTGCGAGAGTCTTCGTATCTAAACACATGCAATGACTGAGGTTTGTCTTCATAATTGTTGAAGTTAGAGTAAACTGACCTAGGTTAGGCAGACTCTGATCATCATAGCAGCTTGTCTCCGAAATATCTATTGCTGGCCTTCCACATAGGCAGTGTTTGCTAATTTGCAATTCTCACAACAGTTGTCCTCCAGGCCCCAAGTGGCTATTTTCATCCGTTTTAGGCTTTTCAGCACATAAACTCTAGCCATTGAGTGGGAAAAATATTTACCTACATATTTTATTTTTATTATTTAATAAACAAATTGCCAGGTAAAATGTTTTCCATCCCATTTTATGGATAGAGGAGATAGGAGGCATGTTGAATGGTAGATTCCGGAAATTCCCTCACTCTTAATTAATCCAACATTCCAACCTGGTGTAACCGTGCAATTTATTATGTTGAGCTTCTGCTATACTTTTGAGTTCTGAATCCTGATCTGTTCAATAGAAGGTCTTCCTTAATAAAGCAACAAGACAGTTGAAAAGCATGTTCCCATTTTAAATATTTGATTAATCAAGGAAGTATAAAAGTACATGGTTAGCTTCACTGTTGTCAGTTTTCATGTTGACTGTGGTTTCACTTTTTTCTACTCCCTCCGTATTTTATTAAATTATGCACTTTCCTAAAGAGGCCGTAATTTATTAAATGGTGGACTTTCCATTTTTGATATGCTCTTACATTTTAATAATATATCTCTCTCCTCTCATGATCCCCACTCTCACCTATTTTATTTATTTTTTCTTACCTTTTACATTCTTTGAATAATTCAACATCCCCATTAACTTTTATTACCATTGTTTTTATATCTTATTTTAATAAAATCAACTTACCCTCCTAAACTATGTGCCGGTCAAACTGCACAATTTAATAAAATACCGAGGGACTATCTCCCAAGTTCATTGCTTATGAATATGAGCAAGAACATTTGTTAATGTATAGCACTGGAGGAACTTACAGGCTATTTTTAATTCTCACATCTTGAATAAACCGTGTTTAACTGAAAGTACCATATTGACCATAATTTGGGTTGTAGACCTTTCAGTTGTGGTTGAAGAAACTGTCATTGTGTTGCTTAAGCAGCACCTAGCAGTAGTCACATGACACATCCATAGTTCTATGTCCTAATGTGAATGGACTTATTTGAAAATTTGACCTTGTTATAATATTTAAGTTATACGCGTATTTTGTTTAGTGTATGTAAAAATATACCTCAAGACTCCTCGCTTTCATTTTGCCTTGAGATAGGAGTTTTGACCAAATCAGAAACCCCCCTTACGTTGCTCATATGATTTCACCCTTTACCTCCTAGGCTCCTACTCCACTCCCTCCCCAACCCATCTCTCTCCTTGCTGTTTGTTGCCTTCATCTTTCTCCAACAGCCAGATTGCACAGGTTACTAATTCACCATTACCATTACCAGGGCTACCAAAGCTAAGATCTAGGTTCATCTTCATGGGAAAAGGAAATTGGGTGGCAGTGTTTTCTGTGAGGATTCAGTTCCTTTTTTTGGCTGAAGTAGACTAGTAAATAGGTAATTGGTGCGCTTATGAGTTTCGGTATTCGTAGTGATCATATTTTCGAGCGGGGGGAGGGGGGGGGGGGGGGNAAGAGGATTATCAGGGAGGGAACTTCGGGGTTCCATTTAGCAAAAGTGGAAAAAGGAATCGAAAAAAGAGTGAACCAGACACTAACTAAGGACAAGGAAAAGGGTTTCCTTTCAGTAGACTAACCCCAATGATTAAACGAATTGCGAATTTCCATTTACATCACATGCAATAAGGTTGGTAGGTCTAGGCGTCTAACTTCTTTAGCAATTAGCAGTGGTGCCTGTGAAGTTTAATGGGCGACACTATCACACAACAGCCATTGGATGTTGCAGCATGATTCTATTTACCACACCCAAGGGTGTCAAATCGGGTCATCGGTCGGTCACGGGTCGGTTATAATCGGTTCGGGTATAATCAGATAATGTAGTTGTCCGCGGTCATTATCATTATGCGGATTGAACGTATGATTTTTTTTTCCGGGTCACTTAGGTTTTTGTCAGAAATTGGTTGGATCGGGTCAGTTTTGACAGCCCTAACTCCACACCATTGAATGACCTATTTGATACAGAAATAACATGGCTTATACTTTTGTAGGATTTTTTTTTGTAGTGTTTGGCATACTTTCAGGTGCTGTTCTAGTCTGGATATTGTTTTGGAAGAAAACATAGCTTATACTTTTGTAGGAAATTCTTTTGTAGTGTTTGGCATACTATCAGGTGCTGTTCTAGTCGGTTTGATTCTCTGGGGGACATATTTGTTAAATTACTCAGCATAAGCATATCAAACTCTGGGATTTTAGGGCAAACCAAGGGTTATGTTGCCATCTTTTTGATCCTATAAATGTCATTGTTTTCATTTCAGAAATTCATATGTTGGTAACATCGCCATTTTCCAAGAAATGGAGGAGAAGCTTAAGCAGGTATCCATTCTTATGTTTTCACTTCTGCTTTCAAACATGGACTCAATAGAATATTCTGTTCTCTTTGGCAATCTCCTGGTGCAACATATATTCTCAAAGACCTGGACATATTATCAACATATTCTTTCTAATTGAGTGACAGTAATGCGTTATTGTCTTATTGATTGTCTAATTGATACTTCTGAAAGACCTGGAGTCTAAAAAGAATCTAAGTTGTGTATCTTCTAATGGCATTTAGTTATTTTTGAGCCAGTTTTACACTGTTAGACAGTGGGGATCCATTACGAAGGGTTTTGTTTCAACTAATTTCAGTCTTTTTCAAGCCCCGTCTGAGTGATATAGGCAGTAGATTGAAAGAATATGTTCAAATTATATGGCTACTGCTTGTTGAGGAACATTTTTTTGGATGGGTCTGAAAGGAATATATTAAGTGAAAGGATGAAGTAATGTGCTTCTTTTTATTAGTCAAGAATAATTATGTAGACATTTGATACCAGATTTTATTGTAGGAGACCCTTGGCAATATTGACATTCTCAACATACTTATAAACAAGATTGTGTATGTGCCCTGATAACGGAGAGATGTACTTTTACCTTCTAGTTTCATGTCTTTCAAAAAAAACGTTTTTTCATATAAAGGAGAGAAAGGAGGTCCGATTAACTACCTTTGTGCTTGCTGCATCTTCTACCAGCAACTTGTGCATTTGATAGATCCTGGGTAAAGGTTCCCCATTATGTTGCAACTTTAATATCCTGATTATAACGTACAGGGTGACAACATCATCTTAATGTCCAACCATCAAAGTGAAGCAGATCCCGCAGTGATTGCATTACTTCTGGAGAAGACAAATTCACTAATCGCAGAAAACTTGGTGACGTCAATCTGCTATTTGTCAATTGTGTAATTTGCACCATTTGTTGTGCTTTAATTTTTTAAAGCTTACATGGAAAAGGTGTAACTTTATGTGCTGCAGATCTACATAGCAGGTGATCGAGTTATAACAGATCCTCTTTGCAAGCCCTTTAGCATGGGAAGGTGATCTGATATGCTCTCATCTCTGAGTTTGTGGTTTTAATGATGAGTTGTCACTGTCTCAATGGTTTTCTATTTTGTTCCGACTCAGGAATCTTCTTTGTGTTTACTCTAAGAAGCACATGTATGATGATCCCGAGCTTGTTGATGTAAAGAAAAGAGCAAATACAAGGAGTTTGAAAGAGTTGGTCTTACTTTTAAGGTAGTTACGTTATTTTGGATTCCGCTTCATTGTTTGTGAAACTAGAATTGTTTTCCGTCTTCGTTTGATAACTGGATGTAGCTTTAAATTGAGCACTAGTCTTCGTCTTTTGCTTTTCAAAGTCTAGAATAGTTTTTGGTTGTGAAGGGAATACAAACTCCTATCCCACGTTCTGTATGTTTCCTTTTTTTCCTTGTTAAGGTTTCTTAATTTGTTTATAAGCCCAGGGACTTTTTTCTATGGTGAGGCAAATACGGTGAGATAAACTCGAGAAACTTGATTCCTCAACTATATGAAAATGTTTTATTCATGGGTCTGTTATCTGTTACCCTATTAGCACTTTGTATGTAAATAGAAAGGTCTTTGAACTTAAATTCCAGGTATATGATTGGAAGTCCGTAGAATGTTTGAACTTATATTGGAGCCCACGTGACAGGATTTTCATATGAAAGTGTGTGTTTGCCGACCTCTGTGTTTGTGACTGGGGATTCTTTTTTTTTGTTGTTTAATAGTGGTGGTGGCTTCCAATTCCCATGTTAGTCTTTTCTAGTAGTTCTGTTTTAAAAGATTCTTCTCCTTTCTTTTTCTCTTGCTGGATCTTCTAAATATGGGTTATCTATTTTTCCAGAGGTGGTTCAAAAATAATCTGGATTGCACCCAGTGGTGGAAGAGATCGTCCAGATGCTGTCACTGGTGAATGGTACCCGGTAAGTTTTTGTCCGTAACATTTGACAGCAAAATTTAAGACCTGTTGCCTTTTCTTCCGACATCTGCACTAGTGCACTTCTCATAATAACTTGTGCTGATTGCTATATCCTTGTTACTTGTATTATGGGAGATGTAATGCACTTCAAGATCAGTGCTGGGTTCGAGCCGGGCCGAAGCTTAAAAATCAGCCCATGTCTCGGGCCGTGCCAAAATCCGGGCCGGTTTTTCATGCCCAAATCTGTTATTTCGGGCCTAAAACATCGGGCCATTCAGGCCATGCCAAATTTATAACTAAAAATGTAGCTTTTACGTTCCCAAACCCGCCAAATTTTTTAAAATTCTGGGCCGTGCTGGGCCTGGAAATCGGGCCTAAAACCTGCCCAAACCCGCCAAATTTTGGGCCGGGGTCATGTTGATCAGGTCTAGGTTCTTGGATTTCTTTTCTGTGACCTTTGACTTGATTTCATTGTAAATTACCGTCTCAATTGGGTCTTTTTCCGGACATCTCTCTGCCCATTTTTCATGTAGGAGACATTATGTGTAGGTCATGTTTCTATTGCTTTCTGCAGTCATAGTTGATGATTTTGTTGCTATGATTTTCTTTCTGTGTGTTTGTATTCTATAGTCCCATTGTGCAAGTGAATCAATTACCTTTTTGGCCTTTTCTCTTTCTTGCATTTCTTTCCTGGGATTTTACTACATTGCCATTAATATTTAATATGATACTGATGGATAAACATCAGGGAACTTTTGATTTCGCTGCATTGGATAATATGAGAAGGCTTGTGGAACATGCTGGTAGACCTGGGCATATTTATCCATTAGCATTATTGTGCTATGACATTATGCCCCCTCCAGCACAGGTAACTTCCTACTGTTTTCTTTTAAGTAGCCTGTTTGATTGTGAATTTCTGTTTATTCAAGAACTCGCCCTTTCCCCTTCCCTGTGCAGGTTGAAAAGGAAATTGGGGAGAAAAGAGTAATGTCCTTTCACGGAGTTGGGGTATCTGTGGAACCAGAGATTAACTACAATGATGTTTCTCTTGGTTGCAAAAATGATGAAGAGGTTTGGTTATAGTTCAAAACTCTCTTGCACTAAATTAGCTCACATAAGAATATAAAGAGCGCATGGCAATCAATTGTATATGGTTTGCAAATAATCATGAAAGGATATTAAAATAATAAATAATTGAGTATATCTTTAATAAATATCTAATAAACTGTAGTATCACTATCTAAACGCAAATTGTTACATACACTCGATTTGTGATTCTTTTGGTGATTTTATTGCAGGCTAAGTCAGTTTATGGACAAGCGTTGTACAATTCTGTGAATGAACAATATAATGTCCTCAAAGCTGCTATACATGGAAAACAAGGCTCAGGTGCATCAACGCCGACTACTTCTCTGTCACAACCTTGGGCCAGTTGACATTAGTGTGCCCTTTTGCTTTCTTTTAAGGTAATGCCCAATCTTAGCTGGAGTTTTGAGGGGCTGAGGTTTTTCCTTCCTTCCTTCTGTTCTAGAGCTGATCAACATGAGACGACCGGCCCGACCCGAAAAATACCGGGGTTTGGGCAGAATATGTAGGCCCGATTTTCAGGCCCTGCCTGAACTTTAAAAAAAAGTTGGCGGGTTATGGGCAATGTAAAATTACGCTTTTAGTTATAAATTTGAGCGGCCCGAAAGCGCGCTATTTTTGGCCCAAAATACAGGGGTTTAGGCACACAAAACTGGCCTGAAGTTTGGCCCGGCCCGACTAATGGGATGATTTTTAAGGTCATGACCCGACTGAACCTGGCCCGATACAAAAGGTTTTTCTTAGAGATACTCCGTGCTTACTCCCTTTGTCCCTTGAAAAATGCAAAATCGGAAATTCACCCGGGGGCTATTTTTTGTACCATCTGATCAGTTTTAGAGCTCAAATGAAAATCACCTCTAACTCTATAAAGGCTATATGATACTATCAGTCTATCAGAGTATCAAGTGTATTTCGTCTGTACTATTACAATCTGTTTCACTGTTAATAAAACAGCTAATTGCGATTGCAGGTTGATATTTGCATACTTGTAGTCTTGTAGAGAACTCGATCATAGCTTACCGGGTTGCTGTCCTGTCATTTTTACACACACCTTCAAGTGAACAATTTTGAGTGCTCTATTGCTTGTTGAGGTAGCATGGGAAAATTCTTTTTTTTGGGGGGAGGAGATTGTAGCTATCTGATGTATTAAATTCCAATTTTTGCTAGGTTCTATTTTCTGAGATTTTGGTCTTTACAGGAAGAGGTTTAAGGGCTCTCTAGTGCTCATTGTATAGCTTTGTTCTTCCTTTTTACATGTATATTTCCAGATCGTTAATTGTCACTTTACTGAATTTTGATTTCAATTTTGTCTTTGGCTTTCATATGTAAATTTTAATGCGGGTTTATGCAGCTACAGTTTGTGATTAGAACGCGGAAGCCAATTAATGCGTGTCTATATTCCGACTTTCCAAGGAAGCAGAATAGCTGACGTTCAATTTTTAATAATAATTACAAGGAGCACGTATGAAGACCTTTTGAATCTTGTTAGATTTGTCCGATTCCAAGAATTAATAATCTTATACTTTCGTATAAATGTCGACATTACATACCCCTTGTGAAATACGTAAATTGATATGAAAATCAAAAATAACAGGAAAGGTAAATAATGCACAATATTTTTGGGGTTTCAATAATTGAGAATGTGATATGGATTCGTATGGATTTGGGATTTGTCATAAACTCATTGATTGGAACCATAATTCGTGTACAGATTGCGAAAGACTCTACTTGGAAAGATG CATTCTCACACACCGGTCAAAGAAAGGAAAAACGAGAATACCAGAAAGAAACGTGATATCCGATTATCCGGTAGCCCAAAAGCCGTCACCGCCTAATCCCCTGCAACTTTGCAATTGCGCCCTTTTATGCGGTTTATCACTTCACTATTCAGTTAGTACTATTCCCTCATTTTTCTCTCTCCTATTTTTTGTTTTCACCTTTTTTAGCAACTCACAAATCAAATAACCACCAATCAACTTCTTCTTCTCCAATCTTCAACCCATCTCTCATCCGCCATTTCCATTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCCTCATACCAGAAAATATGTTAGTCTTATCTTCCTCTGCTCCACCCGTTCTCGAGGTGTGCAAAGATAGGGTTTCTTCTTCGTTTTCTACTTCCTCGTCGTCTTCTTCGTCGGCGTTTTCTGCGGTGGTGTTTCGTCGGAGTTTTTTCACTCGGTTTAACTCGTCTCTAATATGCTGCTGCTCTTCCAAGCTCAAATTAATGGCGGACACTGCTCTTCCGTCCTCGTCTTCTTCGACGTCTGCTTCTGCTTCTTATTCTGCTGCTGCGAAGTCTGTTGAAGAGGAGAATCACGAGATTCCTGTTAAGAAAGAAGATGACAATCAACTTCTTCGTTCTCGCACTTATCGTAACGTTCGTTCTGCAGAAGAGCTGATATCTGAAATAAAAAGGGAATCAGAAATTGGAAGGTTACCTAAAAGTGTTGCTTATGCTATGGAGGGACTTTTTCACTACTATCGCAATGCAGTCCTTTCAAGTGGAATTTCTCATGCTGATGAAATAGTGTTGTCAAACATGAGTGTTATGCTTGATTTTGTTTTGTTGGATATTGAGGACCCTTTTGTATTTCCACCGTTTCACAAAGCTATTCGAGAGCCTGCTGACTATTATTCCTTTGGTCAAGATTACATTCGGCCATTGGTAGATTTTGGAAATTCATATGTTGGTAACATCGCCATTTTCCAAGAAATGGAGGAGAAGCTTAAGCAGGGTGACAACATCATCTTAATGTCCAACCATCAAAGTGAAGCAGATCCCGCAGTGATTGCATTACTTCTGGAGAAGACAAATTCACTAATCGCAGAAAACTTGATCTACATAGCAGGTGATCGAGTTATAACAGATCCTCTTTGCAAGCCCTTTAGCATGGGAAGGAATCTTCTTTGTGTTTACTCTAAGAAGCACATGTATGATGATCCCGAGCTTGTTGATGTAAAGAAAAGAGCAAATACAAGGAGTTTGAAAGAGTTGGTCTTACTTTTAAGAGGTGGTTCAAAAATAATCTGGATTGCACCCAGTGGTGGAAGAGATCGTCCAGATGCTGTCACTGGTGAATGGTACCCGGGAACTTTTGATTTCGCTGCATTGGATAATATGAGAAGGCTTGTGGAACATGCTGGTAGACCTGGGCATATTTATCCATTAGCATTATTGTGCTATGACATTATGCCCCCTCCAGCACAGGTTGAAAAGGAAATTGGGGAGAAAAGAGTAATGTCCTTTCACGGAGTTGGGGTATCTGTGGAACCAGAGATTAACTACAATGATGTTTCTCTTGGTTGCAAAAATGATGAAGAGGCTAAGTCAGTTTATGGACAAGCGTTGTACAATTCTGTGAATGAACAATATAATGTCCTCAAAGCTGCTATACATGGAAAACAAGGCTCAGGTGCATCAACGCCGACTACTTCTCTGTCACAACCTTGGGCCAGTTGACATTAGTGTGCCCTTTTGCTTTCTTTTAAGGTTGATATTTGCATACTTGTAGTCTTGTAGAGAACTCGATCATAGCTTACCGGGTTGCTGTCCTGTCATTTTTACACACACCTTCAAGTGAACAATTTTGAGTGCTCTATTGCTTGTTGAGGTAGCATGGGAAAATTCTTTTTTTTGGGGGGAGGAGATTGTAGCTATCTGATGTATTAAATTCCAATTTTTGCTAGGTTCTATTTTCTGAGATTTTGGTCTTTACAGGAAGAGGTTTAAGGGCTCTCTAGTGCTCATTGTATAGCTTTGTTCTTCCTTTTTACATGTATATTTCCAGATCGTTAATTGTCACTTTACTGAATTTTGATTTCAATTTTGTCTTTGGCTTTCATATGTAAATTTTAATGCGGGTTTATGCAGCTACAGTTTGTGATTAGAACGCGGAAGCCAATTAATGCGTGTCTATATTCCGACTTTCCAAGGAAGCAGAATAGCTGACGTTCAATTTTTAATAATAATTACAAGGAGCACGTATGAAGACCTTTTGAATCTTGTTAGATTTGTCCGATTCCAAGAATTAATAATCTTATACTTTCGTATAAATGTCGACATTACATACCCCTTGTGAAATACGTAAATTGATATGAAAATCAAAAATAACAGGAAAGGTAAATAATGCACAATATTTTTGGGGTTTCAATAATTGAGAATGTGATATGGATTCGTATGGATTTGGGATTTGTCATAAACTCATTGATTGGAACCATAATTCGTGTACAGATTGCGAAAGACTCTACTTGGAAAGATG ATGTTAGTCTTATCTTCCTCTGCTCCACCCGTTCTCGAGGTGTGCAAAGATAGGGTTTCTTCTTCGTTTTCTACTTCCTCGTCGTCTTCTTCGTCGGCGTTTTCTGCGGTGGTGTTTCGTCGGAGTTTTTTCACTCGGTTTAACTCGTCTCTAATATGCTGCTGCTCTTCCAAGCTCAAATTAATGGCGGACACTGCTCTTCCGTCCTCGTCTTCTTCGACGTCTGCTTCTGCTTCTTATTCTGCTGCTGCGAAGTCTGTTGAAGAGGAGAATCACGAGATTCCTGTTAAGAAAGAAGATGACAATCAACTTCTTCGTTCTCGCACTTATCGTAACGTTCGTTCTGCAGAAGAGCTGATATCTGAAATAAAAAGGGAATCAGAAATTGGAAGGTTACCTAAAAGTGTTGCTTATGCTATGGAGGGACTTTTTCACTACTATCGCAATGCAGTCCTTTCAAGTGGAATTTCTCATGCTGATGAAATAGTGTTGTCAAACATGAGTGTTATGCTTGATTTTGTTTTGTTGGATATTGAGGACCCTTTTGTATTTCCACCGTTTCACAAAGCTATTCGAGAGCCTGCTGACTATTATTCCTTTGGTCAAGATTACATTCGGCCATTGGTAGATTTTGGAAATTCATATGTTGGTAACATCGCCATTTTCCAAGAAATGGAGGAGAAGCTTAAGCAGGGTGACAACATCATCTTAATGTCCAACCATCAAAGTGAAGCAGATCCCGCAGTGATTGCATTACTTCTGGAGAAGACAAATTCACTAATCGCAGAAAACTTGATCTACATAGCAGGTGATCGAGTTATAACAGATCCTCTTTGCAAGCCCTTTAGCATGGGAAGGAATCTTCTTTGTGTTTACTCTAAGAAGCACATGTATGATGATCCCGAGCTTGTTGATGTAAAGAAAAGAGCAAATACAAGGAGTTTGAAAGAGTTGGTCTTACTTTTAAGAGGTGGTTCAAAAATAATCTGGATTGCACCCAGTGGTGGAAGAGATCGTCCAGATGCTGTCACTGGTGAATGGTACCCGGGAACTTTTGATTTCGCTGCATTGGATAATATGAGAAGGCTTGTGGAACATGCTGGTAGACCTGGGCATATTTATCCATTAGCATTATTGTGCTATGACATTATGCCCCCTCCAGCACAGGTTGAAAAGGAAATTGGGGAGAAAAGAGTAATGTCCTTTCACGGAGTTGGGGTATCTGTGGAACCAGAGATTAACTACAATGATGTTTCTCTTGGTTGCAAAAATGATGAAGAGGCTAAGTCAGTTTATGGACAAGCGTTGTACAATTCTGTGAATGAACAATATAATGTCCTCAAAGCTGCTATACATGGAAAACAAGGCTCAGGTGCATCAACGCCGACTACTTCTCTGTCACAACCTTGGGCCAGTTGA MLVLSSSAPPVLEVCKDRVSSSFSTSSSSSSSAFSAVVFRRSFFTRFNSSLICCCSSKLKLMADTALPSSSSSTSASASYSAAAKSVEEENHEIPVKKEDDNQLLRSRTYRNVRSAEELISEIKRESEIGRLPKSVAYAMEGLFHYYRNAVLSSGISHADEIVLSNMSVMLDFVLLDIEDPFVFPPFHKAIREPADYYSFGQDYIRPLVDFGNSYVGNIAIFQEMEEKLKQGDNIILMSNHQSEADPAVIALLLEKTNSLIAENLIYIAGDRVITDPLCKPFSMGRNLLCVYSKKHMYDDPELVDVKKRANTRSLKELVLLLRGGSKIIWIAPSGGRDRPDAVTGEWYPGTFDFAALDNMRRLVEHAGRPGHIYPLALLCYDIMPPPAQVEKEIGEKRVMSFHGVGVSVEPEINYNDVSLGCKNDEEAKSVYGQALYNSVNEQYNVLKAAIHGKQGSGASTPTTSLSQPWAS Relationships
The following mRNA feature(s) are a part of this gene:
Homology
BLAST of Spo23244.1 vs. NCBI nr
Match: gi|3914377|sp|Q43869.1|PLSB_SPIOL (RecName: Full=Glycerol-3-phosphate acyltransferase, chloroplastic; Short=GPAT; Flags: Precursor) HSP 1 Score: 919.5 bits (2375), Expect = 2.400e-264 Identity = 472/472 (100.00%), Postives = 472/472 (100.00%), Query Frame = 1
BLAST of Spo23244.1 vs. NCBI nr
Match: gi|731332752|ref|XP_010677372.1| (PREDICTED: glycerol-3-phosphate acyltransferase, chloroplastic [Beta vulgaris subsp. vulgaris]) HSP 1 Score: 690.3 bits (1780), Expect = 2.400e-195 Identity = 355/473 (75.05%), Postives = 406/473 (85.84%), Query Frame = 1
BLAST of Spo23244.1 vs. NCBI nr
Match: gi|870860013|gb|KMT11376.1| (hypothetical protein BVRB_5g107070 [Beta vulgaris subsp. vulgaris]) HSP 1 Score: 564.7 bits (1454), Expect = 1.500e-157 Identity = 271/333 (81.38%), Postives = 302/333 (90.69%), Query Frame = 1
BLAST of Spo23244.1 vs. NCBI nr
Match: gi|1009116997|ref|XP_015875079.1| (PREDICTED: glycerol-3-phosphate acyltransferase, chloroplastic [Ziziphus jujuba]) HSP 1 Score: 560.5 bits (1443), Expect = 2.900e-156 Identity = 295/477 (61.84%), Postives = 363/477 (76.10%), Query Frame = 1
BLAST of Spo23244.1 vs. NCBI nr
Match: gi|595846374|ref|XP_007209119.1| (hypothetical protein PRUPE_ppa005442mg [Prunus persica]) HSP 1 Score: 548.5 bits (1412), Expect = 1.100e-152 Identity = 287/470 (61.06%), Postives = 353/470 (75.11%), Query Frame = 1
BLAST of Spo23244.1 vs. UniProtKB/TrEMBL
Match: A0A0K9QYV0_SPIOL (Uncharacterized protein OS=Spinacia oleracea GN=SOVF_131110 PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 919.5 bits (2375), Expect = 1.700e-264 Identity = 472/472 (100.00%), Postives = 472/472 (100.00%), Query Frame = 1
BLAST of Spo23244.1 vs. UniProtKB/TrEMBL
Match: A0A0J8F5Z8_BETVU (Uncharacterized protein OS=Beta vulgaris subsp. vulgaris GN=BVRB_5g107070 PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 564.7 bits (1454), Expect = 1.100e-157 Identity = 271/333 (81.38%), Postives = 302/333 (90.69%), Query Frame = 1
BLAST of Spo23244.1 vs. UniProtKB/TrEMBL
Match: M5WM27_PRUPE (Uncharacterized protein OS=Prunus persica GN=PRUPE_ppa005442mg PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 548.5 bits (1412), Expect = 7.900e-153 Identity = 287/470 (61.06%), Postives = 353/470 (75.11%), Query Frame = 1
BLAST of Spo23244.1 vs. UniProtKB/TrEMBL
Match: Q8W3L0_CITUN (Glycerol-3-phosphate acyltransferase OS=Citrus unshiu GN=Cit-GPAT PE=2 SV=1) HSP 1 Score: 544.7 bits (1402), Expect = 1.100e-151 Identity = 293/476 (61.55%), Postives = 357/476 (75.00%), Query Frame = 1
BLAST of Spo23244.1 vs. UniProtKB/TrEMBL
Match: S5W1E8_CAMSI (Glycerol-3-phosphate acyltransferase OS=Camellia sinensis PE=2 SV=1) HSP 1 Score: 544.7 bits (1402), Expect = 1.100e-151 Identity = 286/470 (60.85%), Postives = 348/470 (74.04%), Query Frame = 1
BLAST of Spo23244.1 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: PLSB_SPIOL (Glycerol-3-phosphate acyltransferase, chloroplastic OS=Spinacia oleracea GN=GAT PE=1 SV=1) HSP 1 Score: 919.5 bits (2375), Expect = 1.500e-266 Identity = 472/472 (100.00%), Postives = 472/472 (100.00%), Query Frame = 1
BLAST of Spo23244.1 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: PLSB_CUCMO (Glycerol-3-phosphate acyltransferase, chloroplastic OS=Cucurbita moschata PE=1 SV=1) HSP 1 Score: 518.5 bits (1334), Expect = 7.900e-146 Identity = 251/397 (63.22%), Postives = 319/397 (80.35%), Query Frame = 1
BLAST of Spo23244.1 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: PLSB_CUCSA (Glycerol-3-phosphate acyltransferase, chloroplastic OS=Cucumis sativus PE=2 SV=1) HSP 1 Score: 511.5 bits (1316), Expect = 9.600e-144 Identity = 273/467 (58.46%), Postives = 344/467 (73.66%), Query Frame = 1
BLAST of Spo23244.1 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: PLSB_CARTI (Glycerol-3-phosphate acyltransferase, chloroplastic OS=Carthamus tinctorius PE=2 SV=1) HSP 1 Score: 503.1 bits (1294), Expect = 3.400e-141 Identity = 252/403 (62.53%), Postives = 311/403 (77.17%), Query Frame = 1
BLAST of Spo23244.1 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: PLSB_ARATH (Glycerol-3-phosphate acyltransferase, chloroplastic OS=Arabidopsis thaliana GN=ATS1 PE=2 SV=2) HSP 1 Score: 501.1 bits (1289), Expect = 1.300e-140 Identity = 263/470 (55.96%), Postives = 335/470 (71.28%), Query Frame = 1
BLAST of Spo23244.1 vs. TAIR (Arabidopsis)
Match: AT1G32200.1 (phospholipid/glycerol acyltransferase family protein) HSP 1 Score: 501.1 bits (1289), Expect = 7.300e-142 Identity = 263/470 (55.96%), Postives = 335/470 (71.28%), Query Frame = 1
The following BLAST results are available for this feature:
BLAST of Spo23244.1 vs. NCBI nr
Analysis Date: 2018-06-29 (blastp Spinacia oleracea peptides vs. NCBI nr) Total hits: 5
BLAST of Spo23244.1 vs. UniProtKB/TrEMBL
Analysis Date: 2018-06-29 (blastp Spinacia oleracea peptides vs. UniprotKB/TrEMBL) Total hits: 5
BLAST of Spo23244.1 vs. ExPASy Swiss-Prot
Analysis Date: 2018-06-29 (blastp Spinacia oleracea peptides vs. ExPASy SwissProt) Total hits: 5
BLAST of Spo23244.1 vs. TAIR (Arabidopsis)
Analysis Date: 2018-06-29 (blastp Spinacia oleracea peptides vs. TAIR) Total hits: 1
InterPro
Analysis Name: InterPro Annotations of S. oleracea
Date Performed: 2018-06-29
GO Annotation
GO Assignments
This gene is annotated with the following GO terms.
RNA-Seq Expression
Co-expression
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