Spo23264 (gene)

Overview
NameSpo23264
Typegene
OrganismSpinacia oleracea (Spinach)
DescriptionUnknown protein
Locationchr6 : 44295408 .. 44300693 (-)
Sequences
The following sequences are available for this feature:

Gene sequence (with intron)

Legend: polypeptideCDSexonthree_prime_UTR
Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.
ATGTCAACTAGCTTAGTTGGTAAAGCTCCTGAGGAAATGGTACTCAAGACCTGGGATCAAATCCCTCTACATCATTTATTGTCTTGCGTTTTGTGGTTACTTCTCTATCCAAAAACAAAACCCACAATGTTAACTTAAGCGTATTATCAACTTGAACAATAACTCGACAAAGGTCACATATTTGAGTCATTTGACTTCTTGGTCAGTTGGTTGCCTTGAGCTAATGCCTGGTTGAGTGATTGGGGGGAATTTGCAAAGCTTAATTACATGCTTCTAATTTTGTGTGGGTTGGGCAAAACGAATGTGAAATATGTTATTGACCATTAGTGCTATTTTAATTATTTTGCCTATCCAGTTTAATTAATGGTTATTTATGTTCATTGTATGATAATAGTATTTAAACGTGACGTTCATCGTCTCATTTACTTCTTCATCTCGTTCTACTTGTTTCATTGGACCAATTTTGTGAGAGTTTTTTTAGCTAAAATATGGATTAGAATAACAATAATGTCAACTAATAATAAGATCGTTAAACCTTTTTTTTTGTTGCAATTATCGATATTATGTCTCAATAATAAAATCTAGTAGTGGTTAAAAAATTTAAATTATTAATCGTGTATGAGAAAGAATTTGATGTAGGATTTATGTAAAAACGAGGGGAGATATTTTGGGTCAAGATTGTGGAAGAAAAATAATGGGTTAAAGTAAGAGGTATGTCAAGTTAGTAGGAAATGAAGTGGAAAAAAATGAAACGATGAAGCATGAGAGAGAAACTTTTTACATTTGACCACAAGTCAAGGTCGCTTGTGGTCTTACAGTGTACGGAGTAATATTTTTCAGGCAATTGAGCTATTGTTTTGAAGGTGTCAAATTACATGGAACGACTTATAGGTAAATAATCTTTCTTTTTAGTTTTTTGATGCAAAGTAATGGATTGAAGTTAAACAATCTTTAGCTTAATGGTTATAGAAGCAAGTGCACCCAAAATAGATTTATATGAAAAAGATACCATTAAATTGCTTAGAAAATCACCTCATTACACCAAATAAATTCTTAAATCTTAAAAGTCTATAATATTTTTAGTGCAAATGAGTTATAAAAGGCAATATAAGTTACAAATGGGAGTGGAAGATTCGAACCTGAGACATGTTGTATACAAACTCTTAATCTTGACCATTAGACCAAAACATCTAAGCAAGACGAGTACACGAAGAAAATTTTCATTTCAAAGCTGGTCTATATAATTAGGAATCGGCTCCAAAACTATGGCACCGGTTACAAAATTGGTTTAGAAAATAATTCATGGTCCTTTCTACTTCAAAACAATATGTTAATAAATAAATGTTATTATTTTTACATATAAAAATTAGTTATTATAAAATGACATTATTTCCCATCAAATATATAGTACAAAAACAATTTCATTGAGTAACCATCATTTGTGGATAGAGGGTCCAATTAAATGGGAATTGAAGTTGGTTCTTACCAGTTCGAAAACTTTAAGTCTAAATTGCCCCAAGGGTTTTAGATCCAAGACCAAACCCGATATTTTTTTCATTTCTAGATATGATTGGTGTACACTTGTATGGTCAACTTTTGTCAACTCTAAATAAAACATTCTATAATAACAATTTCCACTACTATAATTATTTATCTATAAATGCAAATTGCAAACTTTACACTATTTAACATATCATCAAATCACTTAAAAATAGAAATAAAAGAAATGAAAAAGGTGCAAGAAAATAATAATGTTCAACCTGGATCTGGATCTGAGTATTAAATTGGTACCCGGCAGATCACTCTAACAAACCTCACTTTATCGTCTGACTGTTGTCGCGCTTCTTCCCTCGCAGTGGTGGCCGGCGTTTGCTGTACTTTTTCATCCCTCTTTTTGCTAACCCTAATTTTAAAGGTATCGCTTCTTTCTCTATCTGATCTTCGAATTGTCTGAAACCCTAGCCTTTTCGTCCTTAATTTTGTTTGTCGTAATTTGATGTATGCGAAGTGTGTTTGTCTGATTGGTTAAGATCATTGTTTTTTTTGGGTGTTACTCTGTTGTGAATTTCGAATTCTAGCGGCGGATTTTCATTCACTGATTTCGTTTACTTTACTTTTTGGATTAATAGAATTACTATTGTGATACTTCGTTTTTGATTAGATGCTTGATTTTGGTAGATAGTTGTAGTTCTAGTATGGAGGAGGAAAATTGCTTTGGGAAAAAAATAGAACTGTGATTTGAATTGCTGAAAATTAACGAGCTGTAAATTAATCCGATTTAATTTGGTGATATGTCGGAAATTTGGAGCGTGTCCGGAATTAGTTGCTAGGTTGAAGGTGTAATTTGAACCAGTAATTTGATAATTATGTATGTCCGCACAGTGTTGGAACTGATATTTTGGTAGAATTTGGAGTAGGAGAAGGATTGTTATGTGTAGTTTGATCTTATAAGCTCTATTAGTTTGTCTTCTGCATCCTTTTCGTGTTGAGATAATGTTGATTGTAGAAATGGTGAATTTTTGTTTGCACAACCATAATTTTCATTTGCAATGTACTAAATCTCGGGAACAACATTGTTCATATTGTATGATCACCAAAGTTTGATTGTTAGATGTTAGTGTTATTATGGCCTAACCAAGACACAAAGGCCCTGTTCTGCTCACCTTATTTCCACTAATTTCCGGAAAAATAAGTTAAGATAAGTTCAGTTGAGATAAGTTCAAATAAAACAAGGGTTGACCAAGTATGATTTATAACTAAAATAAGTTTTAATAAGTTCTCATAAGTTCAGTTAAGATAAGATAAGTTCAGAAAAAATAAGTGAAAATCAGGTGAATAGAACACACCCAAAAACTAGTTGAATAATTCTCCCCATGTTCCTTCTTTAGTTGCCTTGAAACTTCTATTGAAATGAATACCAGAATTCGTTATCTGTTTTTCTTTTGACGTTGAGTGAGTTGAGGAACCAGGGGAATGAGGTAATGAAAGTAGCTGGCAAGTTAAAGAACAGGGACCAGGTTTTGCTGTTTTGAGTTTTTGGCATGGTGTTGTTAGATTTGGTTGTCTTAGGCCATACAATCACAGTAAGATTGAACTTGTTGCACATGATGATGCCCATTTGGTTTGATTTGATTTCGGTGAATGGGTTTGTTAGTCTAGTCTGACTTTTTGTTGGCTGTCTAATTCTCATTAAGATTTCTTACTTTTCTATGCTGTGATTTGTGAACCGTCAAACCATTGTCACCAAATCCTCGAAATTAATTTATTAACCGCTTGAATTTTGCATTTTACTTTGCTGCTGCTTATTGTCTTACCCTGTTGTGTGAACCTAGGTTACGTTTGGTTTGGTGTAAAACGTTTTCATTAACCGCTTGAATTTTGCATTTTACTTTGCTGCTGCGTATTGTCTTACCCTGTTTGTGTGAACCTAGGCCACGTTTGGTTTGGTGTAAAACGTTTTCAGAGCAAAATAATTTTCCATGGAAAACATTTTCAAGGGGAAAACACAATTCCAAACTAGTTTTCGTTTGTTTGATATCTTAAAAGAAAATGGGAGAAGATGGTGAAGATTGAAGGGAAGAAGGGAGAGGGAGGTAAGGAGAGCAAAGGTGGAAAAATGATTTCCCTCCCTTTCAAATGGAAAAGGTTTTTCCACCTGTGAGGGAGTTAGGAGAAATTGTTTTTCATCCCTTGTCAAACCAAACAACGTAAAATGATTGAAAAGGGAAAATTGTTTTCCATGAAAACCGTTTTACACCCTACCAAACGGAGCCCTAATGGACTTTGCCATGTAAATTTCATAATTTCATCAAATCTCAATTTTCATCTATGTACCATAATAACTTGCAAATATGTTGCTACATCTGTTCTCTGATCTTTACTGCATATCATATCATGAACATCTGACTGAACATATATTGTGATATGCGTAAGCAGATTGAAAAAAAGGCGTCGTCCCATCAACCATGGCTCTTGATAATGTCATATCTTCTCCTCATAGACGATCTCAAACTCAGGGTGCTTTTGCTTCCTCTCCGCGCCACAAAAAATCTGCATTGAGTGACATAAGCTTCTCTGCACTTATCCAGCGGCACCGCTTCCTTCTAGTAGCTCTTGTTCTTTTGATCATTCTGTGCACTGTATATCTTTATTTTGCAGTCACTTTGGGGTCAGAATCGTGTTCGGGTTTACTGGGAACAGAGAGAGAGTTGTGTCTTGAGAACCATGGCAAAGAGACTTTCACCAAAGGAAAATTGAAATTGTTCTGATTATGGGACAGTAAAAACTGGTAGTGTGAAGTTTGTGTTCATTTGCCAATTATTTGTTAGTGATATACACACACTAGTTAGTTAGTCCTTGGGTTGTGCTATTTATTCGAAAATTGCATTGTATACATGAACTGAGGATATAATTTCTTCAAGAAAATTGTAATTGTAACTCACTGATGACCTCAAAAGGACTGGGTATAGGCTTTTTTCCTTTTCATCTACTGATGATTTATGAGGAAATGGTTGTTGGCATTCCTTATTTACACCGTTGACTATTGGTCAAGAAATGCGCACACACAAAAAAAAAAAAAACTCTTGCCGCCCTTTTCTTCCTCCACCTCATTTTCTACTAACTGGTCCTGCCTTTGCTTCAAAGTTCAAACCTTCAACCCGAGTTCAGATCCTTTGTCTTATTTTTGTCTTATAGTCGAGTATTATTCCCTATTTCAGTTCATCTTGGTCCATCCCATTAATTTGTAAATATCTTCTTTCATTATTAATCTATTTTAATTGGTACAATGGGAGAGGGAATGAGACTTAATTGTGGGACACATGATTCAAACCGGTTCAACCATAATTTACCCCTCGTTCTCCTTATTATCTTCCCTACTTTTTATACATATCTCACTTCAAATTCCCTCTCTTACACTACACATATAGCATTGAGTAAATTGTTAATATGTGACAACCTCACCCCACCAAAGCCTTCCCAGGGTGATAACATATCACCCGTGCCGCTCTTGTACAATACGGTAACATGCTCTCAAAGCGCTTGGGCAACGATTAGCTTTATGCTACCGTAACGAATCCCACTCCTTAGCACTAAAATGCGTCCTCTTCAACCCTCGCTTATTGCACGCATTTGCCCGATCGCTCTACACGTCCCCTACAATACTAGTTTTTACATGTAGCAATGACTAACCTATCTCTCACTCTCATTGAGAGACGCTCTTCCGCCTAGCTCACTCGCCTACTCCTATGGTTAGAGCACCCCCCCTCGTTCCATTCATGCCCACCA

mRNA sequence

ATGTCAACTAGCTTAGTTGGTAAAGCTCCTGAGGAAATGATCACTCTAACAAACCTCACTTTATCGTCTGACTGTTGTCGCGCTTCTTCCCTCGCAGTGGTGGCCGGCGTTTGCTGTACTTTTTCATCCCTCTTTTTGCTAACCCTAATTTTAAAGATTGAAAAAAAGGCGTCGTCCCATCAACCATGGCTCTTGATAATGTCATATCTTCTCCTCATAGACGATCTCAAACTCAGGGTGCTTTTGCTTCCTCTCCGCGCCACAAAAAATCTGCATTGAGTGACATAAGCTTCTCTGCACTTATCCAGCGGCACCGCTTCCTTCTAGTAGCTCTTGTTCTTTTGATCATTCTGTGCACTGTATATCTTTATTTTGCAGTCACTTTGGGGTCAGAATCGTGTTCGGGTTTACTGGGAACAGAGAGAGAGTTGTGTCTTGAGAACCATGGCAAAGAGACTTTCACCAAAGGAAAATTGAAATTGTTCTGATTATGGGACAGTAAAAACTGGTAGTGTGAAGTTTGTGTTCATTTGCCAATTATTTGTTAGTGATATACACACACTAGTTAGTTAGTCCTTGGGTTGTGCTATTTATTCGAAAATTGCATTGTATACATGAACTGAGGATATAATTTCTTCAAGAAAATTGTAATTGTAACTCACTGATGACCTCAAAAGGACTGGGTATAGGCTTTTTTCCTTTTCATCTACTGATGATTTATGAGGAAATGGTTGTTGGCATTCCTTATTTACACCGTTGACTATTGGTCAAGAAATGCGCACACACAAAAAAAAAAAAAACTCTTGCCGCCCTTTTCTTCCTCCACCTCATTTTCTACTAACTGGTCCTGCCTTTGCTTCAAAGTTCAAACCTTCAACCCGAGTTCAGATCCTTTGTCTTATTTTTGTCTTATAGTCGAGTATTATTCCCTATTTCAGTTCATCTTGGTCCATCCCATTAATTTGTAAATATCTTCTTTCATTATTAATCTATTTTAATTGGTACAATGGGAGAGGGAATGAGACTTAATTGTGGGACACATGATTCAAACCGGTTCAACCATAATTTACCCCTCGTTCTCCTTATTATCTTCCCTACTTTTTATACATATCTCACTTCAAATTCCCTCTCTTACACTACACATATAGCATTGAGTAAATTGTTAATATGTGACAACCTCACCCCACCAAAGCCTTCCCAGGGTGATAACATATCACCCGTGCCGCTCTTGTACAATACGGTAACATGCTCTCAAAGCGCTTGGGCAACGATTAGCTTTATGCTACCGTAACGAATCCCACTCCTTAGCACTAAAATGCGTCCTCTTCAACCCTCGCTTATTGCACGCATTTGCCCGATCGCTCTACACGTCCCCTACAATACTAGTTTTTACATGTAGCAATGACTAACCTATCTCTCACTCTCATTGAGAGACGCTCTTCCGCCTAGCTCACTCGCCTACTCCTATGGTTAGAGCACCCCCCCTCGTTCCATTCATGCCCACCA

Coding sequence (CDS)

ATGTCAACTAGCTTAGTTGGTAAAGCTCCTGAGGAAATGATCACTCTAACAAACCTCACTTTATCGTCTGACTGTTGTCGCGCTTCTTCCCTCGCAGTGGTGGCCGGCGTTTGCTGTACTTTTTCATCCCTCTTTTTGCTAACCCTAATTTTAAAGATTGAAAAAAAGGCGTCGTCCCATCAACCATGGCTCTTGATAATGTCATATCTTCTCCTCATAGACGATCTCAAACTCAGGGTGCTTTTGCTTCCTCTCCGCGCCACAAAAAATCTGCATTGA

Protein sequence

MSTSLVGKAPEEMITLTNLTLSSDCCRASSLAVVAGVCCTFSSLFLLTLILKIEKKASSHQPWLLIMSYLLLIDDLKLRVLLLPLRATKNLH
Relationships

The following mRNA feature(s) are a part of this gene:

Feature NameUnique NameType
Spo23264.1Spo23264.1mRNA


Homology
The following BLAST results are available for this feature:
BLAST of Spo23264.1 vs. NCBI nr
Analysis Date: 2018-06-29 (blastp Spinacia oleracea peptides vs. NCBI nr)
Total hits: 0
Match NameE-valueIdentityDescription
back to top
BLAST of Spo23264.1 vs. UniProtKB/TrEMBL
Analysis Date: 2018-06-29 (blastp Spinacia oleracea peptides vs. UniprotKB/TrEMBL)
Total hits: 0
Match NameE-valueIdentityDescription
back to top
BLAST of Spo23264.1 vs. ExPASy Swiss-Prot
Analysis Date: 2018-06-29 (blastp Spinacia oleracea peptides vs. ExPASy SwissProt)
Total hits: 0
Match NameE-valueIdentityDescription
back to top
BLAST of Spo23264.1 vs. TAIR (Arabidopsis)
Analysis Date: 2018-06-29 (blastp Spinacia oleracea peptides vs. TAIR)
Total hits: 0
Match NameE-valueIdentityDescription
back to top
GO Annotation
GO Assignments
This gene is annotated with the following GO terms.
Category Term Accession Term Name
biological_process GO:0005975 carbohydrate metabolic process
biological_process GO:0019243 methylglyoxal catabolic process to D-lactate via S-lactoyl-glutathione
cellular_component GO:0009507 chloroplast
cellular_component GO:0005576 extracellular region
cellular_component GO:0016021 integral component of membrane
molecular_function GO:0019146 arabinose-5-phosphate isomerase activity
molecular_function GO:0005524 ATP binding
molecular_function GO:0030246 carbohydrate binding
RNA-Seq Expression
   



Co-expression
Gener valueExpression
Spo122340.67Barchart | Table
Spo259180.67Barchart | Table
Spo059900.66Barchart | Table
Spo235880.65Barchart | Table