Overview
Sequences
The following sequences are available for this feature:
Legend: exonfive_prime_UTRpolypeptideCDSthree_prime_UTR Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.CTGACTTAGAAGTATGTCGATTAATGACTACTCCATCTTCTTGAACTACATCCGAGTCTTTACTAAATTGAACAAAAACAGAAATATAAATCGAAATTCTGGCAAATAAAAAAAAATCAAGATGTGAGTGCAATTATTAAGGTTTTTTTGGACGAATCATTCTAGAAATTAATTCTTACAGGTTTTTCTTGCTTTTAACCTTTATAAACTTTTAGAAAAGAATGTCTTACAGAAAAGACCGCCTTGTTGCGTCCAAGCTGTTATGCAGTACATAACGTCAGCATTTTAAAAATAAACGTGCTTCACATTTTTCATTTCTTCTTATTTTCAAAACCCTCATTTTTTCTCTCTCCTCAGAAACTTCCCTTCTCTCTCCTCTCTGCTCCAGCGGCGATGACGAAGAAGACGCCGGAGAAGACAACGGTGGTACTTCCTTGCCACCGTGGCCATCAACTACTCGCCCGACTCTCCTCCTTCCGTAGATCGAAGAGATGATGTCCATAGGTGAGAGTTTAGGTTGAGTTTGCTCGAATTTGATATGCTTCTCTCCCTTCTTTCTCTTAATTCACGGTAGTTGAATGATTCGTCATCTATTCACAGCAGTTGCGTCAGTATTCATCGCATAGATGACGAATCATTCAATTTCAAGGTTCCTTTTCGACTTTTTCCAGAAGTTTTAGAGAATGTTGCTGATTTTAAATTACTTTGAATTTTTCTTGTGAATACGTTGATTTTCTGCTGTTTTATGATGTATTTTACTTTGAATTAAAGGATAAGAAAGACGGAGATCTAAGTTTCAGCTTCGATCAAGTGCTATGAGGATTCTGCTCAAGCTAGTGTCTACGAAGTTTCTTTGCCGGTTGTTCAAGGTAAACATTAATCTTGTGAATTTTAAGTATGAATGAAGTTTAGGTTTAATTGATGGATGATTAAGAAGGAGAATTTCTTCCTAGGACAAGAACTTGTATATAATTGACAATCGGAAACAGAAAATGAACAACCAATTTCCGATTTAGGAGAAGGATAGTGTTGACTTGTGTAATGTGGTCATAAAAATGATGTTGAAATGTAAATTTACAGAGTCACAGAAATTTTGGTTATATTTTAGTTATGAAATGAAATTGGTCTTTCAGGTTGCTGGTGGTTGCGTCTTTCAGGTTGCTGGTGGCTCAATGCCTGGGCTGGTGCAATTGGTACAAGGTACAACCTGCCTGTGTTTTTGTTGTTGTTCGCGGAGGAGCAACGGTGCGGTAATCCCTGTTCATACCAAAACTTGCGGAATATATTTAATTTGTTTTACACTTTTAGTTACAATTAATATTGCTTTAGTTAATAATTATTTTGTTTTAGTTAAGAATAATTAACTTTTAGTGAAGAAATTTTCGACGATTCCACCCCCTAACTCTTCTTTAGCCCCGCTGGCGCAGCAGCTAAAGCAGGTTAGTGAAGACTAAACTTGTTTTAGCTAGTACTAATACTAAGAGACCTGAAGTCCGAACTAGGCTTTGTAGTCTTGTAGAGGTTCTTGCTTGCTTAAGGATGTGTTGCTACATTAATTTTCTGCAACTTTTGATGGAGACCTGGCTATTGATCTTGATGTGTTGGTTTGTGTTGACTATGTCGAGTGCTTTGTTGATGTTATAATTTGTGTTTTATTTTGGTTTGTGCTTTATAAATCAGTAAATATAGATGCATAACTTTATATTTATGTGCAACAGGATGTTTCTGGGAAATGGTAGAGTATTGAACAAAATTGACCTCCCAAGCAGAGGAGTCGAGGCACAGGCACAGGCACAGGGCCACATGGCAATTAGTGAAACTCCAACGTTTATCCCCGTTCCTCTACTCTGCTCTCGTCGTTGCTGCGTGTGGAGGGTTGGGGAATGCAGGTGGCGGAGCAGCAGAGGAGACGGTTGTGGAGTGGGATAGGGCGCTTGCTGTTGCTGGTTGGAGCATGCTGGCAAGGAAGATGGAGGATTGAGGTGGTACCTCTTGGTGTGGTGAAGGATAGGCTGGAAATGGGGTGTAGTTTAAGTCTCAAATGCTTGATGCGTGTTGTTTTGTGATGTACCGTTGTTGTAGACTTGTAGTTGTTCGTTTAATTAGTTTTAATTCAGAATAATTTTGTTTTAGTTGTTATTTATTTCGTTTTAGTTAATAATAATGTTTTTTTAGTTATGATTTATTTTGTTTAAGTTATAGTTAAGAATTTTTTTTTTAAGTTACACTTTTGTTATATTTAGTTATGAAATATAATGATTTAGTTAGAGCTG CTGACTTAGAAGTATGTCGATTAATGACTACTCCATCTTCTTGAACTACATCCGAGTCTTTACTAAATTGAACAAAAACAGAAATATAAATCGAAATTCTGGCAAATAAAAAAAAATCAAGATGTGAGTGCAATTATTAAGGTTTTTTTGGACGAATCATTCTAGAAATTAATTCTTACAGAAACTTCCCTTCTCTCTCCTCTCTGCTCCAGCGGCGATGACGAAGAAGACGCCGGAGAAGACAACGGTGGTACTTCCTTGCCACCGTGGCCATCAACTACTCGCCCGACTCTCCTCCTTCCGTAGATCGAAGAGATGATGTCCATAGGATAAGAAAGACGGAGATCTAAGTTTCAGCTTCGATCAAGTGCTATGAGGATTCTGCTCAAGCTAGTGTCTACGAAGTTTCTTTGCCGGTTGTTCAAGGTTGCTGGTGGCTCAATGCCTGGGCTGGTGCAATTGGTACAAGGTACAACCTGCCTGTGTTTTTGTTGTTGTTCGCGGAGGAGCAACGGTGCGGTAATCCCTGTTCATACCAAAACTTGCGGAATATATTTAATTTGTTTTACACTTTTAGTTACAATTAATATTGCTTTAGTTAATAATTATTTTGTTTTAGTTAAGAATAATTAACTTTTAGTGAAGAAATTTTCGACGATTCCACCCCCTAACTCTTCTTTAGCCCCGCTGGCGCAGCAGCTAAAGCAGGTTAGTGAAGACTAAACTTGTTTTAGCTAGTACTAATACTAAGAGACCTGAAGTCCGAACTAGGCTTTGTAGTCTTGTAGAGGTTCTTGCTTGCTTAAGGATGTGTTGCTACATTAATTTTCTGCAACTTTTGATGGAGACCTGGCTATTGATCTTGATGTGTTGGTTTGTGTTGACTATGTCGAGTGCTTTGTTGATGTTATAATTTGTGTTTTATTTTGGTTTGTGCTTTATAAATCAGTAAATATAGATGCATAACTTTATATTTATGTGCAACAGGATGTTTCTGGGAAATGGTAGAGTATTGAACAAAATTGACCTCCCAAGCAGAGGAGTCGAGGCACAGGCACAGGCACAGGGCCACATGGCAATTAGTGAAACTCCAACGTTTATCCCCGTTCCTCTACTCTGCTCTCGTCGTTGCTGCGTGTGGAGGGTTGGGGAATGCAGGTGGCGGAGCAGCAGAGGAGACGGTTGTGGAGTGGGATAGGGCGCTTGCTGTTGCTGGTTGGAGCATGCTGGCAAGGAAGATGGAGGATTGAGGTGGTACCTCTTGGTGTGGTGAAGGATAGGCTGGAAATGGGGTGTAGTTTAAGTCTCAAATGCTTGATGCGTGTTGTTTTGTGATGTACCGTTGTTGTAGACTTGTAGTTGTTCGTTTAATTAGTTTTAATTCAGAATAATTTTGTTTTAGTTGTTATTTATTTCGTTTTAGTTAATAATAATGTTTTTTTAGTTATGATTTATTTTGTTTAAGTTATAGTTAAGAATTTTTTTTTTAAGTTACACTTTTGTTATATTTAGTTATGAAATATAATGATTTAGTTAGAGCTG ATGAGGATTCTGCTCAAGCTAGTGTCTACGAAGTTTCTTTGCCGGTTGTTCAAGGTTGCTGGTGGCTCAATGCCTGGGCTGGTGCAATTGGTACAAGGTACAACCTGCCTGTGTTTTTGTTGTTGTTCGCGGAGGAGCAACGGTGCGGTAATCCCTGTTCATACCAAAACTTGCGGAATATATTTAATTTGTTTTACACTTTTAGTTACAATTAATATTGCTTTAGTTAATAATTATTTTGTTTTAGTTAAGAATAATTAA MRILLKLVSTKFLCRLFKVAGGSMPGLVQLVQGTTCLCFCCCSRRSNGAVIPVHTKTCGIYLICFTLLVTINIALVNNYFVLVKNN Relationships
The following mRNA feature(s) are a part of this gene:
Homology
BLAST of Spo24539.1 vs. NCBI nr
Match: gi|902238049|gb|KNA25021.1| (hypothetical protein SOVF_010190 isoform A [Spinacia oleracea]) HSP 1 Score: 64.3 bits (155), Expect = 1.200e-7 Identity = 32/32 (100.00%), Postives = 32/32 (100.00%), Query Frame = 1
BLAST of Spo24539.1 vs. UniProtKB/TrEMBL
Match: A0A0K9RZU7_SPIOL (Uncharacterized protein OS=Spinacia oleracea GN=SOVF_010190 PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 64.3 bits (155), Expect = 8.200e-8 Identity = 32/32 (100.00%), Postives = 32/32 (100.00%), Query Frame = 1
The following BLAST results are available for this feature:
BLAST of Spo24539.1 vs. NCBI nr
Analysis Date: 2018-06-29 (blastp Spinacia oleracea peptides vs. NCBI nr) Total hits: 1
BLAST of Spo24539.1 vs. UniProtKB/TrEMBL
Analysis Date: 2018-06-29 (blastp Spinacia oleracea peptides vs. UniprotKB/TrEMBL) Total hits: 1
BLAST of Spo24539.1 vs. ExPASy Swiss-Prot
Analysis Date: 2018-06-29 (blastp Spinacia oleracea peptides vs. ExPASy SwissProt) Total hits: 0
BLAST of Spo24539.1 vs. TAIR (Arabidopsis)
Analysis Date: 2018-06-29 (blastp Spinacia oleracea peptides vs. TAIR) Total hits: 0
GO Annotation
GO Assignments
This gene is annotated with the following GO terms.
RNA-Seq Expression
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