Overview
Sequences
The following sequences are available for this feature:
Legend: exonfive_prime_UTRpolypeptideCDSthree_prime_UTR Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.TCAATTTTATTTTTGTTATTTATTTATTTTTATTTCTGTAAAACATAAAGTAAAATTAAATCAAATAAAATCAATGGCGCTTCTGCTCCAGCAAACTCAACCTCTGTTGAAGATGCCGTAAATTTCACACATTATTATTACTCCTATTTTATTATCACATCACCTAATTGCAAATAAAATAAAATAAAATAAAATAAAATAAAAATTATTAATTAGTTTTCAGCTAAAGATTGTTATACGAAATTTAATTTCTTTTATATAAATTTCCAAAATTAGTTTGCTCATATTCTAGGGTTCTTTTACCCTTCCTCTCTCTCCCATATCTTCGTTTTCTTCGGAGATTTGGGAGTTTTTTTTTCGCAATTTGATCATTGTTTTGATCAAGAGAGATCTGCTGAATTCTGGATTTGAACCGATTCGAATTAAAAAAAGTTCTTCAATTTTGAAATCCGAATTGCGATTTTGCCGGTGCAGTTTGATCTGTTTAAGACGATTTCCTTGGGTGAAGCGGATCAGATTGAAGATCAAATTTGTGGACCCTCGGAATTTTTTATTGCGCTGTTTTTGGGTAGAAATTGAAGAGTTTTGAAGGAGGTTCGATTTTGAATGTGGGTTTGTATAATGCTGATTTAGGGGGGTGATTTTTGTTCTGGAAATGGCATCTGCTCAAGTTTTACCCAAGCCTGCGGTTTCATCCCGTAAAAAGAAGGATTTGGAAGCTGGTAAACGTTTGGTATGGCCTCGATTTCGGGTTTTAATTGTTTATTTTAAGCTCTTTTTCTTCTAGTTTATTCCTTTTGTTGATGTAAACGTATCATGTATGTATATGCAACTTGGGAAGAGTGATCCGACCTGGGAACTAATTTTAGTATGACCGCTTTGATCAATAGGCTAAGTTGGCGTTGGTAAGTGATGTGTACTTTGAATGATTTAGGTGGATCATGAATAATGCATAGGAAAGTTTTTGACTTGGTGAAGATACTTGATTGGTTTGAAATAGTTGGTGCTTTGATTTGTTTGAGCTCCAAGATGTTGCAGATAATGGTGGATTTTGTTTGTTTCAGAGTGTGCAGACTTTAGGATTTATTTACTCCGAGCTCCTAGTTAGAGTAGCTTCCCCTTCATTGTTCTTAGATGAAATGGTGTTAATTCTGATAATTGTGGTAGCAAACTTGCCGGTAATTGACGAATCATGCCAGGTGCTTAGTTGATTGCATATCTTGTGTCTGTTTGGATTTTGTTTTGTGCCCTTAATAGTTTTTGTTGTAGTGCATAATGAACCATGGATGGCAACTTGTCAAGGTTGGTTGCCTTCGGACTATGCCAGTCTACAACGAAGGAGGGAACCTGTACATTTTTGATGTTGATTTGTAATCTAAAAATCTGAAGCATGTGAGGCTTGAAATATAAAGCTTGCATAGATGATCGACGTCTAATGCCACAAATCTCTTTTTTTTTCTTCTTCTTTTTCTCTGGAGATTTGAGGTAGTTAGGTACTTAGGTGCCTGTTGTAGATTGTTTTCAATTATAACTACAACTCTGTTTTTCAGCTTCTATTAGGTTTCGTAATTAGATTCAAATTGACCTTTAATTCCCAAAATTCCTGAAAAATCAAAATGAGAATTAAATAATAGAATGGGTTTTTCTCTTCTTTTTTGGAATTTGAAGTCATATCTAAATGTGTTTTCTATCATAAAGTATAATTAAGTAAGTTGGTCCTATTGAAAGTCAATGGATTATAGGATGTTAGGGAGGATTAGATTTTTCTTCAGCTTTATTGCTGTTTTGCCTTTAGTTGTCGGTTGAGTCTATATTCTATTACATCTGCCCTACCCCTCATGTGTTGTATGGAGAGGCTGAGATGGATTCAGTATTATACTAGGAAGTGAAGACTTGCAGGTTGTTTTTATTACAACAACAAAACAACTGCTACAAGTATACACCACTGATTGTTAGTAATTTTTAGTTGTTTATGATAATATCAAAATACGCTCCTCATCAATTTATTGTGCGAAGAACCGACAATGGGGTATTCTAGACTTCTGGTCATGCTTTGCTCACAATTGTTTGTTTCTATCAATAGGTTGTAGTGCCCTGTTTCTCTTTTGCTTGGAATTGATCTAATCATAGTATATCTATTCATTGGCGTTGTAGTCAGGGATTGCTCACAGAGTGTATGGCTGGACAATAAGTCTTCGCTAATGGAAAACTGCCTAATCTGCACAGGAAATTAAGTTACAGCAGCTAATTCTTGGGCATTGGGTGGTGGTTGTATTACACTTGTCTAGTTGTCTTTAATTTGTTTCTTAATGGTGGATATGTCTTTCTCTTCTTTGAGTAAAAAGAGAGAATGGGGCAAGAAGAATGAGAGAGCTTTGTCATCCCAGAAATCCATTCCTTCAGTACAACATCTCCCAGTTTATAAGAACAATGGAGGACTTTTAGAGCACATACAATAGTGACCTTGGGTTGTTGGCCTAGTTGTTATGGATTTTATCTCTCCAACCTTCTTTCTCCTCCACATTACATCTTTTTACTTTGTTGAGGCACCATTGTGAAGTGGTGAGCTAGGGTTACAGGGGAGAGAGATTTTGTATCGGGTAAGGGGCACCATAGTCAATGCTAAATGATTGGGTACTGTTATAGTGTTGTGCTGAATTCAAACTATGTTCTTGTTGTTACTTCAAGTATTACATGCTAATCAGTCTCAACATGGCTTAAGGTTGTTCAACTTTATATATGTACTTGCTATTTGCAAAAATCAGAGGACCAATCTATTCCATTTTTTTTAATATACAAATGTGCTGTTTCTCTTAGCTGGAAGAGTTCAAAAAGAAGAGAGGAGCGGCCAAAAAGCAACCATCATCTAGCCAACCTCGTACTGATGATACTACACCATCTGAGAAACAAGCTGCAGGATATGGACAAGCATTGTCTGTCAATGCTCTTACTGATGATAGCTCTGACGCAGTGTCAGGAGCTTCTGTTTTTTCTAACCACACTGGCAAATCACATGTTTTCACTCATTATAATGGGTCTGAATCGGTTTCTCCTGCACACATCGATACCCAAATTGATAAGTTAAGCGGACCTGAGTTGCTTCAGAAATTACCTAATCAAGTGGGAAAGGGCCATGAGGATCCACTTTTAAACTACCAGTCAGGTTCTGACTTTCCACAATTAGCAGATGATATTAATGGTAAGTCTGGGAGTGATACAGGAAGAGGAAGATTTGCAGATGCAATATCGTCTAGTAGACCCAGTGCTTCTCAAGTTTATAGTAGTAGTGAGTCTCACTCAAATTCTTATGGATCTGATAAGTACTTTAGTTCTTCTGTAAGCTTTCCAAATGCAAATGGAGGCACCAATGATTTTGCTGCTAAAGTCTTTACCAAGGGACATGTCACCAATGTTTTAGATCAGGAGTCTGGTAAGTAGAGTTGTTTAAGCAGGTACTTAGTGTGACAGTTGAAAATCTATTATTGTGTCATGTAACATGTTCTGTCATGATTGCAGATTCAGTTCTCTCGCGTATGGATTTGCCAGCATCTTCGTCAGAGTTTGGTCATAGCCATCTGGAGTCGAAGAATCATTTAACATTTGGTTTGGAGGAAAGACAGCCTAGTAATGCAGTGGGGAATTTGACGGGTTTTGGAAGTCAATGGGCATCTGAATCACGTTCAACTGGTTTAAACTCTAACACGGGTGGTTTATTTAATGGTCCCTCACATTCAGTTGTTGCTGAACCATTTCCCAGAAGATCTCGTCCTTCTTTCCTTGATAACATTGTTAAAGATTCTTCTGTTTCTGGCCGCCCTTTTGTTGAGAAAGACAAGTTCACGAATGCAACACTTCCCGGCAGCAATGCTGCTGCATCGTCTGCAATTCATGATTCTTCTACAGCATATTCTCCCATCGAACCCCTTCCGACACCGGCTTATTTTAATCCAAGTGATGATTTCTTTAGCAATGCGTCAAGGGGACACACGTCATTTGAGCACAGCGTGGAGAACAAGTTGGAATTCACTTCACAGAAACAAAACGAAGATTTTGCCGCTTTGGAGCAGGTATCTCTTTTTCTCTAATGCGTACAATTGCCTTGGCACTGTTGCTCGGTCATGGTCCATGTTGCATGCATTTTTACCTTTTGTAACATCTCATGTTTTTTTCTTCTCCTCTCGATGCGAATCGTACTTCTTTTAGTTGGAAAAGATCTTTCCTCAGCTGCTCTATAGCATCCAAGAGCATTCCCTCCCTCAAGATATGTATTACACCTCTACAAAGTTGCATGAAACCATGTGATTATACCAGTTTGTAGAATATTCACCATTTATGTATTTTTCATAAAATCACATTATATCAAAGTATGTACTGTAGCACTTTTTTATTCTATAAACAAACTTATTTGAAATTTCACTTCATTTTTTTGTATCAAACTAGGCAAGTTTAGGGCTTGTTCGGTACCATTTTAAGTTTTGAGTTGTGAGTTTTATCAAAACCACCGATTTAAGTTTTGTTTTACCAAAATAAAAAAACAGATTTAAAAATATTAAAACAGCCTCCATTGGAACCCCACACTAAAGTCTAAAAGAGATGCTTCTCTTAAATTTAGGGAGTACAGTACTTCGTATTAGCCTATTTTACTGCACTCCATCCATTTCTCTCTCCTCTGGCTACTAACCCACCATTGACAAAGAGCTAAATACCAGATTCCATTGTTAATTTTCTATAATCTCATAAATTCTTTATTTAGTAGATCTTTAAGTTCTTTGGAAGGCATAAACCCCCAAATTCACTACTGTAGCAATCTTCTATAGATCATCACCACCAGTCCACCACCATCATCGCTGCCTATAATTGGTTATTTCTCTCTTCTTTTTACATACCTTTGCAAATCAAGTCCTCTAGTGAAATTTTGATTCAGAATTTCTGAGGCCTAATCATCAAGGTAAATTTTTTTTTTTTTGGAATTTCTAACGATTGAGTACCAAGAT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ATGGCATCTGCTCAAGTTTTACCCAAGCCTGCGGTTTCATCCCGTAAAAAGAAGGATTTGGAAGCTGGTAAACGTTTGCTGGAAGAGTTCAAAAAGAAGAGAGGAGCGGCCAAAAAGCAACCATCATCTAGCCAACCTCGTACTGATGATACTACACCATCTGAGAAACAAGCTGCAGGATATGGACAAGCATTGTCTGTCAATGCTCTTACTGATGATAGCTCTGACGCAGTGTCAGGAGCTTCTGTTTTTTCTAACCACACTGGCAAATCACATGTTTTCACTCATTATAATGGGTCTGAATCGGTTTCTCCTGCACACATCGATACCCAAATTGATAAGTTAAGCGGACCTGAGTTGCTTCAGAAATTACCTAATCAAGTGGGAAAGGGCCATGAGGATCCACTTTTAAACTACCAGTCAGGTTCTGACTTTCCACAATTAGCAGATGATATTAATGGTAAGTCTGGGAGTGATACAGGAAGAGGAAGATTTGCAGATGCAATATCGTCTAGTAGACCCAGTGCTTCTCAAGTTTATAGTAGTAGTGAGTCTCACTCAAATTCTTATGGATCTGATAAGTACTTTAGTTCTTCTGTAAGCTTTCCAAATGCAAATGGAGGCACCAATGATTTTGCTGCTAAAGTCTTTACCAAGGGACATGTCACCAATGTTTTAGATCAGGAGTCTGATTCAGTTCTCTCGCGTATGGATTTGCCAGCATCTTCGTCAGAGTTTGGTCATAGCCATCTGGAGTCGAAGAATCATTTAACATTTGGTTTGGAGGAAAGACAGCCTAGTAATGCAGTGGGGAATTTGACGGGTTTTGGAAGTCAATGGGCATCTGAATCACGTTCAACTGGTTTAAACTCTAACACGGGTGGTTTATTTAATGGTCCCTCACATTCAGTTGTTGCTGAACCATTTCCCAGAAGATCTCGTCCTTCTTTCCTTGATAACATTGTTAAAGATTCTTCTGTTTCTGGCCGCCCTTTTGTTGAGAAAGACAAGTTCACGAATGCAACACTTCCCGGCAGCAATGCTGCTGCATCGTCTGCAATTCATGATTCTTCTACAGCATATTCTCCCATCGAACCCCTTCCGACACCGGCTTATTTTAATCCAAGTGATGATTTCTTTAGCAATGCGTCAAGGGGACACACGTCATTTGAGCACAGCGTGGAGAACAAGTTGGAATTCACTTCACAGAAACAAAACGAAGATTTTGCCGCTTTGGAGCAGCACATTGAAGATTTGACGCAAGACAAGTTCTCTTTGCAACGCACATTGGAGGCCTCTAAAACTTTGACTGAGTCATTAGCTTCTGAGAATTCTTCCTTGACGGAGAGCTATAATCAGCAAGCAAGCATTGTGAGCCAGTTAAAGGCTGATATGGAAAGATTGCAGGATGAAATCAAGGCCCTTCTGGCTGAGCTTGAGGCTATCAAGGCTGAATATGTGAATGCACAGCTTGAGTGCAATGCAGCTGATGAGCGTGCAAAGCTCCTGGCTTCTGAAGTTATTAGCTTGGAAGAGAAGGCCCTTAGATTAAGATCTAATGAGCTGAAGTTGGAGAGGGAATTGGAAAACTCAAGTGCTGAAATTGCTTCCTACAAAAAGAAAATGTCTAGCCTTGACAAAGAGCGCCGAGATTTGCTGCAGACAATTGATGCTTTACAGGAAGAGAAAAAGTTGCTCCAGTCTAAATTAAGGACAGCTTCAGCTGGTGGAATTCCAATTGTTCCTAGCAAGGGACATGTGAAAAAAGATGCTTCAACTTCTACTAACGATTTAGGTCCAGATGAAACAAGAGATAGCTCTGAACAAGCTGCATCCAACATTCAAATGCTTGAAAATGTCGACAACTTGCTGCTTTTACAGAGTAATTCTGCTGGTCACGAAGATTTTGCTTTGAGTATTCCCCCGGACCAAGTGCAAACGATACAAAATATCAACTCACTAATTACCGAGATAATATCGGAAAAAGAGGAGTTGATGCAAGCTCTGATTACTGAAGTCTCAACAAGTACTAAGCTGAAGGAATTGAACAAGGAGCTATCTCAGAAACTTGAAGTTCAGACCCAAAGACTGGAGTTGTTGACAGCCCAAAGCATGGCAAGTGAGGGTATTGTTTCCAAGCAGCCTACTGCTTCTCATATTGTACGGGAAACCGTTGCATATGCAGATGAAGGCGATGAGGTGGTTGAGCGAGTGCTGGGATGGATAATGAAGTTATTTCCTGGAGGGCCGTCAAAGCGGAGGACCAGCAGACTCTAA MASAQVLPKPAVSSRKKKDLEAGKRLLEEFKKKRGAAKKQPSSSQPRTDDTTPSEKQAAGYGQALSVNALTDDSSDAVSGASVFSNHTGKSHVFTHYNGSESVSPAHIDTQIDKLSGPELLQKLPNQVGKGHEDPLLNYQSGSDFPQLADDINGKSGSDTGRGRFADAISSSRPSASQVYSSSESHSNSYGSDKYFSSSVSFPNANGGTNDFAAKVFTKGHVTNVLDQESDSVLSRMDLPASSSEFGHSHLESKNHLTFGLEERQPSNAVGNLTGFGSQWASESRSTGLNSNTGGLFNGPSHSVVAEPFPRRSRPSFLDNIVKDSSVSGRPFVEKDKFTNATLPGSNAAASSAIHDSSTAYSPIEPLPTPAYFNPSDDFFSNASRGHTSFEHSVENKLEFTSQKQNEDFAALEQHIEDLTQDKFSLQRTLEASKTLTESLASENSSLTESYNQQASIVSQLKADMERLQDEIKALLAELEAIKAEYVNAQLECNAADERAKLLASEVISLEEKALRLRSNELKLERELENSSAEIASYKKKMSSLDKERRDLLQTIDALQEEKKLLQSKLRTASAGGIPIVPSKGHVKKDASTSTNDLGPDETRDSSEQAASNIQMLENVDNLLLLQSNSAGHEDFALSIPPDQVQTIQNINSLITEIISEKEELMQALITEVSTSTKLKELNKELSQKLEVQTQRLELLTAQSMASEGIVSKQPTASHIVRETVAYADEGDEVVERVLGWIMKLFPGGPSKRRTSRL Relationships
The following mRNA feature(s) are a part of this gene:
Homology
BLAST of Spo25219.1 vs. NCBI nr
Match: gi|902146620|gb|KNA05083.1| (hypothetical protein SOVF_193660 [Spinacia oleracea]) HSP 1 Score: 1400.6 bits (3624), Expect = 0.000e+0 Identity = 758/758 (100.00%), Postives = 758/758 (100.00%), Query Frame = 1
BLAST of Spo25219.1 vs. NCBI nr
Match: gi|731366923|ref|XP_010695332.1| (PREDICTED: uncharacterized protein LOC104907992 [Beta vulgaris subsp. vulgaris]) HSP 1 Score: 911.4 bits (2354), Expect = 1.100e-261 Identity = 535/762 (70.21%), Postives = 606/762 (79.53%), Query Frame = 1
BLAST of Spo25219.1 vs. NCBI nr
Match: gi|225433351|ref|XP_002282738.1| (PREDICTED: uncharacterized protein LOC100251145 [Vitis vinifera]) HSP 1 Score: 451.4 bits (1160), Expect = 3.000e-123 Identity = 376/825 (45.58%), Postives = 480/825 (58.18%), Query Frame = 1
BLAST of Spo25219.1 vs. NCBI nr
Match: gi|764569135|ref|XP_011462404.1| (PREDICTED: uncharacterized protein LOC101305650 [Fragaria vesca subsp. vesca]) HSP 1 Score: 449.5 bits (1155), Expect = 1.200e-122 Identity = 349/799 (43.68%), Postives = 466/799 (58.32%), Query Frame = 1
BLAST of Spo25219.1 vs. NCBI nr
Match: gi|720085784|ref|XP_010243629.1| (PREDICTED: uncharacterized protein LOC104587635 [Nelumbo nucifera]) HSP 1 Score: 442.2 bits (1136), Expect = 1.800e-120 Identity = 365/828 (44.08%), Postives = 468/828 (56.52%), Query Frame = 1
BLAST of Spo25219.1 vs. UniProtKB/TrEMBL
Match: A0A0K9QEG6_SPIOL (Uncharacterized protein OS=Spinacia oleracea GN=SOVF_193660 PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 1400.6 bits (3624), Expect = 0.000e+0 Identity = 758/758 (100.00%), Postives = 758/758 (100.00%), Query Frame = 1
BLAST of Spo25219.1 vs. UniProtKB/TrEMBL
Match: A0A0J8E3Q9_BETVU (Uncharacterized protein OS=Beta vulgaris subsp. vulgaris GN=BVRB_5g124300 PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 911.4 bits (2354), Expect = 7.400e-262 Identity = 535/762 (70.21%), Postives = 606/762 (79.53%), Query Frame = 1
BLAST of Spo25219.1 vs. UniProtKB/TrEMBL
Match: D7TS43_VITVI (Putative uncharacterized protein OS=Vitis vinifera GN=VIT_05s0051g00090 PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 451.4 bits (1160), Expect = 2.100e-123 Identity = 376/825 (45.58%), Postives = 480/825 (58.18%), Query Frame = 1
BLAST of Spo25219.1 vs. UniProtKB/TrEMBL
Match: A0A0S3STP3_PHAAN (Uncharacterized protein OS=Vigna angularis var. angularis GN=Vigan.08G310400 PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 440.3 bits (1131), Expect = 4.900e-120 Identity = 340/780 (43.59%), Postives = 468/780 (60.00%), Query Frame = 1
BLAST of Spo25219.1 vs. UniProtKB/TrEMBL
Match: A0A067KAX0_JATCU (Uncharacterized protein OS=Jatropha curcas GN=JCGZ_12915 PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 438.3 bits (1126), Expect = 1.800e-119 Identity = 350/806 (43.42%), Postives = 463/806 (57.44%), Query Frame = 1
BLAST of Spo25219.1 vs. TAIR (Arabidopsis)
Match: AT3G23980.1 (BLISTER) HSP 1 Score: 384.4 bits (986), Expect = 1.600e-106 Identity = 245/473 (51.80%), Postives = 328/473 (69.34%), Query Frame = 1
The following BLAST results are available for this feature:
BLAST of Spo25219.1 vs. NCBI nr
Analysis Date: 2018-06-29 (blastp Spinacia oleracea peptides vs. NCBI nr) Total hits: 5
BLAST of Spo25219.1 vs. UniProtKB/TrEMBL
Analysis Date: 2018-06-29 (blastp Spinacia oleracea peptides vs. UniprotKB/TrEMBL) Total hits: 5
BLAST of Spo25219.1 vs. ExPASy Swiss-Prot
Analysis Date: 2018-06-29 (blastp Spinacia oleracea peptides vs. ExPASy SwissProt) Total hits: 0
BLAST of Spo25219.1 vs. TAIR (Arabidopsis)
Analysis Date: 2018-06-29 (blastp Spinacia oleracea peptides vs. TAIR) Total hits: 1
InterPro
Analysis Name: InterPro Annotations of S. oleracea
Date Performed: 2018-06-29
GO Annotation
GO Assignments
This gene is annotated with the following GO terms.
RNA-Seq Expression
Co-expression
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