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Sequences
The following sequences are available for this feature:
Legend: five_prime_UTRexonpolypeptideCDSthree_prime_UTR Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.CTTCTCTCTCCGACAAAGTGCCTTCTAGTCACCGGCCTCACTTCATTGACTCAAAATTAGTCTACGTTACAACAGAGTTTATCCAATGTGGACCTTTCTCCCAAACTACTCTTAGAACTCGATTCTTGAATCAAAATTAGGTTATTTTCCCAAAATAAATCATGGACAACTCCAGGATTTCAAGAGGATCTTCCGATCTCCAATCCCAATTCGTGAAGAGCACATCATTCAACTACAATTCGCAGCAAACTCCACATTCATCAGATCGGAGGTACGCATATCATCGTCAGTCTTCATTACAACAATTTCCCGACCCGCGAACTCCGACGACGGTAATCTCCAACAACAACAACTCACAGACGCCAGCGTTTTCCCGGAGTATTTCGAGCATTGATATTCCTCCAGGATTTCATCCCGGAAATGAGATTGATTACAGCCTGTGGAAAGATTCTCCTAAATCGGAGGGGAAATTATCGTCGACTGAGCTGATTTCATCGGTTTTTCGAGCTTTGAGGACTGGTAATCGGCCTATGAAGAGGTTATTTTTGTTGATTTCGCTTAATGTGGCGTATTCGACTGCCGAGCTATTCATCGGGCTTCTCTCGGGTCGTGTTGGTAAGAATTCTGAGCTTTTTTTTTTATAAATGTTATGTGGAAAGTTGTACTGTTAGTTTGTGCGTTTATCATTTCTGTATTGACGATTTTCTGTGGTTTTTCTGTTATATAAGGGGGATGTTCATAAAACATGTTTACGTCCAAGATTAGTTGTGTAATGTATACTCCAGTTATCAAGCTTTAAATTCCAGTTTGATGATAAAATGTACTCCGTAGTATTTGTAAGGAGTTTTGAAATACGTGCCTAGACTGGAGGAGGTTCTACCTTAAAAACAACAAGACATTAGGTGGTTCTGCCTTAAAACACATAGACAATAAGACGAGTAACTTCTTAGCCTTATTAAGTGATTATCTCTCTTTTAAGTTCAGCCACGGGTGATATTTTGTGGCCTGGAGCTCGTGGGCTGGAGCACATTTATCGACACTCCCCCTCACACGTGCCATTTTCAATTTGGCTCAGAGTATTAACGGTCCAAGGTCCAAGTCGTGGGCCCAACAATGTTAAAAGTATTTAGGGATTCAATTGCTTGATTTTTTTTATTGACCTCTTGGCTGTATATGTTATATGAGTAACGCTTAATTTAACTTAGATACATTCACATGAATTTAGGATATCATAAGTGATTATAATCAATCACAATTAATCACCAACAATATAACTCATAAAATATAACTCCTAAAATATAACTCCTAAAACAATTCATCCCAAATTTATGGACTAAAACAAGCTCCTAGGCGTTGGTTTGAGAAGCTTGTCACGACTTTGAAAGGGTACGACTTTCTGCTACCCTATTCTGATTGTTCCCTGTTTACCTTCACTAAAATTACTAAAATTACTAAATCGTAAAGACAAATGGTTCTCCAAAGTAACGATTCAAATGAATGTGCTTGTGTAAGTTGATGATCTTATTGTTTCTATAAATGATTCCGCTACTTTACGGGCATTTAAGGCCTATTTGGGTGATTGCTTCAAAATAAAGGATCTTGGTTCATTGAAATATTTTCTAGGTATCGAGGTTGTGCATAGCTCCTCGGGTTTATTTTTGTGTCAAAGAAAGTATACTTTGTACATTATTTTTGAAGCGTGTTTATTGGGTGCAAAACCAACTGTGATTTCCAATTGAACAAAATCATAGGCTCGGCCTTGCTATACACTAACCATTGGGGCATATCACCGACTAGTTGGGCGCCTCATCTATTTGGCGGTCACACAACCCGACTTGCATACACTATTCATATTCTATCTCAGTTATGCAGGAGCCTCATATTGAACATTGGGAAGCCGCATTATGTGTTATTCGTTATTTGAAAGGAACTCCTAGTCAGGGTATCTTATTACGAGTAGAGAGTGAACTTACTTTAAGGGGATGGTGTGACTTGGATTGGGCAGCATGCCCCGTCACAAGACGCACCCTTAGTGGTTGTCCCGTTTTCTTGGTTAGTCTCCTATTTCATGGAAAACAAATAAGCAACATTTCTTGGTTGACTGCCACTTTGTTCGTGATGCAATGATAGATGGTTTAATTGCTCCTTCCTACGTTCCTACAACGACACAATTGGCGGGCTTCTTTACTAAGGAAATCTTGGATCTATATGCTCCAACTTGAAGGGGGTGTTAGGATATATTTTAGGAGTTACTCCCTCCGTCCCTGATTAGTTTTTACACTTTTCATTTCATCGTTCCAAATTAGTTTTTACACTTCTATTTTAGGAAAGACCCCACAGTTATTTTAATATCTCTCTCTTTCCACTACCAATAAGTTAGGCCCCACACTCTCTCACATTCAATTAAAAAAAGTACTATACTATCTTCTATCACATCTACTTTTTCAATAAAATAGTATTTGATAACCAAACAAAAATTTATCTCCTAAACTTTGTGTCATGAATCATGATAAGTGTAAACACTAATTTGTGACAGAGGGAGTATATTTTTAGGAGTTATATTCTTAGGATTTATATTGTTGGTGATTAATTGTAATCAATTGTGATTTCCTAAATCCATGCAAATATATCTAAGTTAAATTAAGCGTTACTCATGTAATATATATACAACCATGAGGTCAACAAAGTCAAGCAATTGCATCCCTAATTACTTCTACAAGTTTAGCTTTAGTGAGTTGAATGTTGTATTTGAACCCCAATATGAATTTTGGCTGGATACTCGATACATGACTCTCAATCTTAGAAAGGATGATACTTTCTATAACCTCCAAAGTTAACCTTGGTTTGTGGCTTTTGCTCAACTGAGTGTGGATCGGCTCAAAAGGTTCTAGGATTACATAAAAGTTTAAGTGTAGTATGAAATGCTTTTGGCTGGTATAGAACTCTCTCCATTTTATATTACATGATTGCTTAACTAACTTTCACTTAATACATCAATAGATGATTACTTTTCAATTTAGAATGCCAATGCAATATGATTTGTGAGTACTATGGAGTAATTAACAACTCCTTCCATGTGTTTATTTTTAAAAGACAATTATAATGGAACGGAAAATATTGCAATATTTTTTCTTTCGTGAATAACATAGAAAACTCTCAAACAGTACATTGTTACTGTTGTGCGGTCGAGAAAGTATCTTGTTACGGAATTCTAGAATGGAACTGGAAGGTTCCTTTTGGGTCTGTGTATCAGGAAAGATGTTGGCTCTAAATGAATCGACATTCGTTCTCTGATGGCTCTCTTGTCGCAAAGGATTGCAGTATTATATATTTCTTTTTTTAATAACTATGAAGTTCTTATATATTATGAAAGATCCAAACAAAGGAGGCTTTGATATCAAGAGGCTTTTGAGATAGCTTACTTTATAGATCTTGGGCCTTAGTGCTAACATTTCTGTTTTTATACTAGCAATAATGTGATAGTTTTACCATAAAAAACATACTGGTATTTAAAGTTTTAAACATACATCTTCCGTGAAGTGTAGTTTCTCTACCCCTATCATATCTTTCGATATTTGCGTAGAGTGCGCCTTATGTTTTGTCATTCTCCATGAAGGAATGTAATGATTTTCCTACTGTAATGTTATCAACTGAATAGTTCCTTTGTTGCGATGAATTGATTCTATCGTGTGTTTCTTCTGCCCTACCAGGTCTGATATCTGATGCATTTCATTTGACTTTTGGATGTGGCCTTTTGACGTTTTCATTATTTGCAATGACTGCATCTAGGAGAAAGCCAGACCGAGCCTACACTTATGGGTAAGATGCATCTCCAACTTCCTTGGCAGATGAATTGTTATGACTTTCAGTTCTTGAAAACTGATGAGAGTATCATCCTTAATAAAATACAAAAGTATATGTGTCTTGTAATCTTGTGTTCCTTTATCTTTCTACATTTCCATTTCTTATGTTCTGGGGTTATTGGGTCTGCTTGCCACTTGGCAGTGGAGAAATAGTTGGCCTGGTGGCCCTGGTCTGGAAATCTGGAATGTGGATACTTCTCTTTAATGGCATTTGAATAGAACTTGGGAGTTTGTATATTTGCTTTGTTCCTTGTGACAAACTAAACACTCAAGTACAAAACGAGACAGCCTTCTGAGTTGACCTGTTGCTGCAAAAGTGACAAAAGGACCACTTAACCCCACTATTCCGTTGTTCACTCTGGATTCTGGAAATGACAGAAGGAAAGAAAGATAAAGGTTTTGGCTTCTCCAACTTCTATTTAACAAATGGAACTGAATTTGATGACAAAGGAAGCTTCTGAAATATTATATGGCTTTTTTTTAAACCCTCATGTGGAACTGAGCATGTGGCTCTCTGTTTATAGAGCACTCAACTTGAAAGGAAGACATGGGTTAAATATGTGATAGTCCAGGTTACATAGAGTACTTGTTTCATCCTAAGAGCATGTTTGGTTTAGAGTTTTTAAGTGATGGAAATGGAATCACTTAACTATTTTCATTACCTAATGTTTGGTATGCGAGATGTGGTAATGCAATCCATTTCATAAGGGAACACTACCACCATTTATTACCTCTCCCAACTCATGGTAACAAATTTTTTACCCTCCTCAATCCCACTTTGATACAAGTGATTCATTTCTTAAGTTATACCAAACAACTGATATTGGTAATAAACTAATAATTAACATTACCATTTCCCCTTCTTATTTGTTTCCTTTACATTCCCTTTCCAAAATTTATACCAAACATGCGCCAAGTATCCGTGTCTAATATTTTATACCCTGACATGTATATAGACATCTTGAGACTTGAAATAAGGTTAAAACCGTTTTGTACTTATTATAATACTTCTTCCGTTCCATATTTATTGCATCATGTGTGTTAGGCACTAGATTTTTTGTAGTGGAAACAGAAAGAAAGACAAAGACAAAAATACAAATTTTCCCATGTGATTGAACTATTAACTAAATC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ATGGACAACTCCAGGATTTCAAGAGGATCTTCCGATCTCCAATCCCAATTCGTGAAGAGCACATCATTCAACTACAATTCGCAGCAAACTCCACATTCATCAGATCGGAGGTACGCATATCATCGTCAGTCTTCATTACAACAATTTCCCGACCCGCGAACTCCGACGACGGTAATCTCCAACAACAACAACTCACAGACGCCAGCGTTTTCCCGGAGTATTTCGAGCATTGATATTCCTCCAGGATTTCATCCCGGAAATGAGATTGATTACAGCCTGTGGAAAGATTCTCCTAAATCGGAGGGGAAATTATCGTCGACTGAGCTGATTTCATCGGTTTTTCGAGCTTTGAGGACTGGTAATCGGCCTATGAAGAGGTTATTTTTGTTGATTTCGCTTAATGTGGCGTATTCGACTGCCGAGCTATTCATCGGGCTTCTCTCGGGTCGTGTTGGTCTGATATCTGATGCATTTCATTTGACTTTTGGATGTGGCCTTTTGACGTTTTCATTATTTGCAATGACTGCATCTAGGAGAAAGCCAGACCGAGCCTACACTTATGGGTATAAGAGGCTTGAAGTTTTGTCTGCCTTCACAAATGCTCTGTTTCTTCTCTTTTTGTCTTTTTCTTTGGCTGTGGAAGCGCTTCACGCATACATACAAGACGAGTCAGAGCATAAGCATTATCTCATTGTTTCAGCAGTGACAAATTTGTTGGTGAATCTTGTTGGTGTTTGGTTCTTTAGGAACTATGCTCGAAGAAATCTTGCCTACAGAAATGCAGAAGATATGAATTATCACTCGGTGTGCCTCCATGTGATTGCTGATTCAATTCGCAGTGCAGGTTTGATTCTGGCGTCTTGGCTTTTGTCTATGGGGATTCAGAATGCTGAAGTTTTGTGTATGGGACTAGTTTCAGTTACAGTCTTTATGCTTGTAATGCCACTATTTAAGGCAACAGGTGGAATTTTGCTGCAAATGTCCCCACCTAGCATTTCATCTTCAGCAATTACCAAATGTTCTAGACAGATTGCTGCTCTTGAAGATGTGACAGAAGTTTATGCAGCACGTTTCTGGGAATTGGTACCTGGGTATCTTGTTGGTTCACTCTCCCTGCAGTTAAAGAAGGGGGCTGATGACCGATCGATTCTGCAGTTTGTGCATGGATTATACCATGATCTTGGTGTCCAGGACTTGACATTACAGACTGATTATGTCTGA MDNSRISRGSSDLQSQFVKSTSFNYNSQQTPHSSDRRYAYHRQSSLQQFPDPRTPTTVISNNNNSQTPAFSRSISSIDIPPGFHPGNEIDYSLWKDSPKSEGKLSSTELISSVFRALRTGNRPMKRLFLLISLNVAYSTAELFIGLLSGRVGLISDAFHLTFGCGLLTFSLFAMTASRRKPDRAYTYGYKRLEVLSAFTNALFLLFLSFSLAVEALHAYIQDESEHKHYLIVSAVTNLLVNLVGVWFFRNYARRNLAYRNAEDMNYHSVCLHVIADSIRSAGLILASWLLSMGIQNAEVLCMGLVSVTVFMLVMPLFKATGGILLQMSPPSISSSAITKCSRQIAALEDVTEVYAARFWELVPGYLVGSLSLQLKKGADDRSILQFVHGLYHDLGVQDLTLQTDYV Relationships
The following mRNA feature(s) are a part of this gene:
Homology
BLAST of Spo25518.1 vs. NCBI nr
Match: gi|902235537|gb|KNA23957.1| (hypothetical protein SOVF_020430 [Spinacia oleracea]) HSP 1 Score: 783.1 bits (2021), Expect = 2.400e-223 Identity = 406/406 (100.00%), Postives = 406/406 (100.00%), Query Frame = 1
BLAST of Spo25518.1 vs. NCBI nr
Match: gi|731323830|ref|XP_010672644.1| (PREDICTED: metal tolerance protein C2 [Beta vulgaris subsp. vulgaris]) HSP 1 Score: 650.2 bits (1676), Expect = 2.400e-183 Identity = 345/396 (87.12%), Postives = 362/396 (91.41%), Query Frame = 1
BLAST of Spo25518.1 vs. NCBI nr
Match: gi|645271465|ref|XP_008240924.1| (PREDICTED: metal tolerance protein C2 [Prunus mume]) HSP 1 Score: 532.7 bits (1371), Expect = 5.500e-148 Identity = 277/374 (74.06%), Postives = 320/374 (85.56%), Query Frame = 1
BLAST of Spo25518.1 vs. NCBI nr
Match: gi|595803787|ref|XP_007202062.1| (hypothetical protein PRUPE_ppa006837mg [Prunus persica]) HSP 1 Score: 532.7 bits (1371), Expect = 5.500e-148 Identity = 277/374 (74.06%), Postives = 320/374 (85.56%), Query Frame = 1
BLAST of Spo25518.1 vs. NCBI nr
Match: gi|566208658|ref|XP_002323276.2| (hypothetical protein POPTR_0016s04430g [Populus trichocarpa]) HSP 1 Score: 526.9 bits (1356), Expect = 3.000e-146 Identity = 275/381 (72.18%), Postives = 324/381 (85.04%), Query Frame = 1
BLAST of Spo25518.1 vs. UniProtKB/TrEMBL
Match: A0A0K9RYL6_SPIOL (Uncharacterized protein OS=Spinacia oleracea GN=SOVF_020430 PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 783.1 bits (2021), Expect = 1.600e-223 Identity = 406/406 (100.00%), Postives = 406/406 (100.00%), Query Frame = 1
BLAST of Spo25518.1 vs. UniProtKB/TrEMBL
Match: A0A0J8CNG4_BETVU (Uncharacterized protein OS=Beta vulgaris subsp. vulgaris GN=BVRB_3g060140 PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 650.2 bits (1676), Expect = 1.700e-183 Identity = 345/396 (87.12%), Postives = 362/396 (91.41%), Query Frame = 1
BLAST of Spo25518.1 vs. UniProtKB/TrEMBL
Match: M5VQK2_PRUPE (Uncharacterized protein OS=Prunus persica GN=PRUPE_ppa006837mg PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 532.7 bits (1371), Expect = 3.900e-148 Identity = 277/374 (74.06%), Postives = 320/374 (85.56%), Query Frame = 1
BLAST of Spo25518.1 vs. UniProtKB/TrEMBL
Match: B9IHY3_POPTR (Uncharacterized protein OS=Populus trichocarpa GN=POPTR_0016s04430g PE=4 SV=2) HSP 1 Score: 526.9 bits (1356), Expect = 2.100e-146 Identity = 275/381 (72.18%), Postives = 324/381 (85.04%), Query Frame = 1
BLAST of Spo25518.1 vs. UniProtKB/TrEMBL
Match: A0A0B0MGW1_GOSAR (Metal tolerance C2-like protein OS=Gossypium arboreum GN=F383_22958 PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 516.5 bits (1329), Expect = 2.900e-143 Identity = 279/402 (69.40%), Postives = 324/402 (80.60%), Query Frame = 1
BLAST of Spo25518.1 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: MTPC2_ARATH (Metal tolerance protein C2 OS=Arabidopsis thaliana GN=MTPC2 PE=2 SV=1) HSP 1 Score: 505.0 bits (1299), Expect = 7.700e-142 Identity = 261/373 (69.97%), Postives = 305/373 (81.77%), Query Frame = 1
BLAST of Spo25518.1 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: Y9332_DICDI (Probable zinc transporter protein DDB_G0269332 OS=Dictyostelium discoideum GN=DDB_G0269332 PE=3 SV=1) HSP 1 Score: 139.0 bits (349), Expect = 1.100e-31 Identity = 99/348 (28.45%), Postives = 177/348 (50.86%), Query Frame = 1
BLAST of Spo25518.1 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: ZNT5_HUMAN (Zinc transporter 5 OS=Homo sapiens GN=SLC30A5 PE=1 SV=1) HSP 1 Score: 122.9 bits (307), Expect = 8.300e-27 Identity = 87/312 (27.88%), Postives = 151/312 (48.40%), Query Frame = 1
BLAST of Spo25518.1 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: ZNT5_MOUSE (Zinc transporter 5 OS=Mus musculus GN=Slc30a5 PE=1 SV=1) HSP 1 Score: 121.3 bits (303), Expect = 2.400e-26 Identity = 88/310 (28.39%), Postives = 153/310 (49.35%), Query Frame = 1
BLAST of Spo25518.1 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: MTP12_ARATH (Metal tolerance protein 12 OS=Arabidopsis thaliana GN=MTP12 PE=3 SV=1) HSP 1 Score: 120.2 bits (300), Expect = 5.400e-26 Identity = 88/307 (28.66%), Postives = 151/307 (49.19%), Query Frame = 1
BLAST of Spo25518.1 vs. TAIR (Arabidopsis)
Match: AT3G12100.1 (Cation efflux family protein) HSP 1 Score: 505.0 bits (1299), Expect = 4.400e-143 Identity = 261/373 (69.97%), Postives = 305/373 (81.77%), Query Frame = 1
BLAST of Spo25518.1 vs. TAIR (Arabidopsis)
Match: AT2G04620.1 (Cation efflux family protein) HSP 1 Score: 85.9 bits (211), Expect = 6.300e-17 Identity = 50/148 (33.78%), Postives = 81/148 (54.73%), Query Frame = 1
BLAST of Spo25518.1 vs. TAIR (Arabidopsis)
Match: AT3G58810.1 (metal tolerance protein A2) HSP 1 Score: 52.0 bits (123), Expect = 1.000e-6 Identity = 64/325 (19.69%), Postives = 136/325 (41.85%), Query Frame = 1
The following BLAST results are available for this feature:
BLAST of Spo25518.1 vs. NCBI nr
Analysis Date: 2018-06-29 (blastp Spinacia oleracea peptides vs. NCBI nr) Total hits: 5
BLAST of Spo25518.1 vs. UniProtKB/TrEMBL
Analysis Date: 2018-06-29 (blastp Spinacia oleracea peptides vs. UniprotKB/TrEMBL) Total hits: 5
BLAST of Spo25518.1 vs. ExPASy Swiss-Prot
Analysis Date: 2018-06-29 (blastp Spinacia oleracea peptides vs. ExPASy SwissProt) Total hits: 5
BLAST of Spo25518.1 vs. TAIR (Arabidopsis)
Analysis Date: 2018-06-29 (blastp Spinacia oleracea peptides vs. TAIR) Total hits: 3
InterPro
Analysis Name: InterPro Annotations of S. oleracea
Date Performed: 2018-06-29
GO Annotation
GO Assignments
This gene is annotated with the following GO terms.
RNA-Seq Expression
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