Overview
Sequences
The following sequences are available for this feature:
Legend: exonfive_prime_UTRpolypeptideCDSthree_prime_UTR Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.CTATTCCGTTTGTACTTGTATGGCAAACTTTGGTGTAATGGTGCTCTGGCCTGTGGTGCATGAAAATTCAGCAAAGATTGAATTTTCCGCCGCGAAAAACTAGACAGCCCAACAAAGAAGTCTTTTCTCACACGCGTATTTAAAAATGAATAAAACAATTTCTTACATTTGATAATTACACTATCATTCATCACCATAGTCACTTTACTTCTTCCCCAAATCTTTCTCAGATCTGCAACAAATCGATGACAATCATCTGAATCGGGGAGTCAGAGTACTAAACTCGGACGACTGAGTGACTCAGCCATGGCGGAGAAGCCGGACTCAGTGGTGTCGATCCGAGTCCCATACAAGAACCTCAGGCAAGATGCTGAGGTTGAAATGGTAGGCTTCGACGACGGTTTTCCGATTGTTTCTAGGGTTTCGAATGGCGTCGGTGACGGCGATTCGCCGGAAACTCACCGGCATTCGGTGGATTTGAGATCAGAGAAGTGTAGTTTGGTGAAATTGATTCTCAGTTGTACGGTCGCCGCTGGTGTTCAGTTCGGTTGGGCGCTTCAACTTTCACTTCTCACTCCTTACATCCAGGTTTCTTTTTATCTCTCTTAAATTTGTTGGAAAGCGAATGCCAATTCCTTATTATGTCATAGTTTAACGAGTTTTGACACGAATTGTGGGTTGTTGTTAAAGAGTTAGAAGACTTAGAACTGCATAATTGTGAAACTAGGTTGAAGATTGAAATTGTTTGGGTGAAATTAGGAATTGTTATGCATTTATATGAAGAGAATGCTGTCATTTTTAGCTTTATTGGATGAAGTTTGAGGAAAAAGTTGTTGAAGTGGAATGTGATTGCACTGATCACATGACTAGATCGAAAAGGTTGCCTCTAAATCATGGTAACTTGGCGGTTAGACGATCAATTATTTGTTTTTCCGCCTTATTATGTAATTTTTGTTTTTTGGTAAACAAAAGGAATTAGCTTTAAGAAAAAGAGATTAAATGCTGAATGGCTAGCTGCTTATGTGATGGAGAACTGCTCTGCAAGCATGTGACTTCGTGAAGAAAAAGTTGTAGGGAAAATCAGTTTGTCATTTATTTTTTTGCTGTACCACCCGGTTCACCCTTAGGGCTAATCCGGATTCGGGGCGAGTTCTGAGTGGATAGGTTCCAGTCCCCTCCCAATTGTTGTTGCGGGGATCGAACACGGGTCCTCCCTACAAAGTTCAGCCTCAATCACCACTGAACCAACACACAATTGGTTCAAAGGTGTGATTATTAGTGGATTTCTCCAATTGTTTCCAAAGATATTTCCTCCGGCAAACTCTCCAATTGTTTCCAAAGATATTTCCTCTGGAAAACTGTAAAAACTACATAGTAGGTTGATTATTTTGTTCCTAGTTTATGAAATTAAGAGGTTGAGTGAAAATGATGACTATTTTTAGGCCTTGTGGTAAATGGCATGTCTAACTTCTTGATTGACCTTTTGATTTTAGTTAATGTTTTGATTCGTAAATGGCTATTTGACACTAGAATTGACTACATCAGTTTATTAGTAAGCGAAAGTGATTGAAAAGGTGGTTAGAGATTTTGAAAGCTATATCCAAGTGGTTCAAACCAGGAAATCTTGTTGCGGGAGAATTTTGGATAAGTAATAGGGAATATGAAAACCAGGAAACAGGCATTGTGGTGGTCTTATAAGACTAGGGAAAGATAAAAATAAAAAAGGTGGCTTATGAAGGCTTTGTCCATAGTAGCACAGTAAAGGAACACTTATTAGCTAAGTCCAAGGCCATAAAAGAGCATCTTAGGCAGAATGGGGATATTAGAGCTTATATGAAAGAGAAATACCAAAGGAGAAAAGGATATATCCAAGCTGGCTAGAGTTACAAAGGGCTAAACAAGGTTTGGATCATAGGTGCATGGGGAGTGGTGGGGTAATACTTGAATATATGTTGACATCAAAAAGGGTGGTAACGTTACTTTTATAAGTTTTTCAATGAGACGAGGGAGTGAATATATGTTGACATCGAAAAGGGTGGTAACGGTACTTCTATAAGTTTTTCAATGAGACGAGGGATATGTTTAGGTGAACTTATTATGTGTGAGGATATCTGGAAAAAATTTTAGGTCGCGGTATTAATGGAAGTTTAACACATTGTTCGGGGCTTAGTACCTTCGTATCTGTATAAATCTGAAAGAGATTCTAAGTTGTACTTACTAATAAGTGGGGGATCAAGTTGCTTTGCCACACCCTGATTAGGCAATCATCTAGTTACCTCAAGAAATCTTTTTAATTTGTGCTTGAAAGGTTCCACAAAATTTTCTTACTTTCTTGTTCATGTAATGTCTCTACAAAGAAAAGAGATTTACATGTGATTTTATCCATTTGCAAAATGGTATATATGCTTGAGTTCCTAGATAAGTGTTGTGAGGTGCTTGTAGAATATGGTGCTTTAGGCCTATGTTTTGAGTTATTTATGATGTGGGTGGAGGAATTAAGACTAGGGTGAGGACCACAAGTGTTTAGGGGTGGATACAGTCGAGCCAAGTTGAATTCCAAGTTTCTATCATGGCTTGGCTTGGCTTGGTTTGGTTTAATTTTAACGAGCTTGAATTCAAGTTGTCTAGGGGTGGATACGAGCCGAGCCGAGCTGAGCTGAACTCTAACGTGGCTTAGTTTGGTTTAATTTTACCGAGGCCGAACTAGAGCTCGAACTCACCTTGAGCTTAAAAATCTTAAAAATCCTCACCGAGCTACATTTGATAAGAATTCTTCGAGCTTTCGAGCCTTGACTCGATAAACTGATGAAGCATATTCCAATAATTGGCACACTGCCATATAAATAAAAAATTTAATCAACGCTATAATAGTATTTTGTTTGGACAAGTTATGTAAAATATACCCCCTTTTTTGTCATTCAATTGATAGTTTAGGCATCTGTATTAAAGGATATACATTATTCTCATAAATATGCATTATTTTTCTTAAATAAGTTAACGAGCTCACGAGCTGAACACCATTGAGTTTGAGTTTGATTCATTTAGTTATCGAACTATAAATTTAAGCTCAAGTTTGTTTCATTAACAAACGAATCGAGCTTGAGCCGAACTTTTATCGAACCAATTCCAAACTGTTCACAAGTAGTTTAATGTGTCCACCCCTATAAGTGTGATGTGGCTGTGAACTATATCAGGTCATGCCAAACATATTTCTATCAATATCTAGCTGCATCATGTATAATCTTTGAGTTATTTCCTACTTGTAATAGTTGTGAGTGAGCTCACTGGCTCACTGCTACAATCCAAGGGGAATTATTTAGTGTATGTTATTTGCGGTTGATTTTGTTTCGGTGAATGACACAAAATTAGGCTATTTGTTCACTTGGACCAATTAAGAGGTGCCTTTTTATCGGAAAGTAGCTTTTTTCAATATATGAGACCTCATATATGTGAAGTTATAGTCGTTATGACTTGCAATTGATGACTCGTATTGGGTTTATACCCGGGTTGATATTATCTACTTCCCCTTTTCTCATAAATATTGCAACATTTACCATCAATGAAGTTTCACAAATTTTGTACATTTGCCTTTAAGGAAATCCAATGTTTCCTTTCCTTCCACATTGCAAATATTTAATAGCCCTGAATCCTGATTGATAGCTCCCATGTTCCTTACCCGTTTTGTGGGTAGTTCACATGGTTATTGTGGTCTCCTATCACTTTTTCTCCATTTTCTTGAAATTTGTGCACTTGTTGCAATATTTTCTGAAAAAAGTAAATAATTTAGCTGTACCCCGACCTTACTCGTCTAACCAAGCAATCAATTTAAGTCAACCACTTTGTTTTTTGAAATCCAACCCACCTATCCCGTTTAACTGCCGAACCAGTTTTCCAACTATAGTTCATGATCCAGTACAAACTATGACCATTGAATCTAGAGCTTCAAGTCAAATGACCAGGTTGGGTTCGGATCTAGACTTGATGGGCCGTGTCATGCCTGATTTCGGTAATGGTGGATCTATGTGTCCCAATAGATAAAATTGAGGTTCGGATTACTTTAATGGATAGTTCCCTGGCCAGGTTACTTTTTGACAGCTCCAGTTGAATTCAAATTAAAAAATTCACGAGTCCTAAACTCTTAACTTACATATTTTAAATGTAATTACGTCAAGCTCCTTCTTTTTTATTCCAAATACAAGTTATAGCAGATAATAATTAATCAAAAACATAAAACCATTAACTATTCAATGGTTAATACCTTAATACCTTCACTGCTTCAACAGACGATGAACATTTTTGGTTAATGCAACATTAGTATGTCCTGTACGAGGAAGAGGCATTGAACATAAACTTAAGACCACTTTTTCCAGGCGTTAAATAACTTGAATTTCAGTAACAATATGGGCAGTCCAGTGTATAAAAAGGTTCAAGGAGCACTGAGGCATTGAGGCGATAGCGGCCCTGAATTTAAAAATTTTGGAGTAAAAAGGACTGGCAAATAAAGGCGCTATCACCCAAACCATCACCCCTATCGCCTGCGCCCCAGCACCTAGAGCCAGAGGTGTGCCTTTTAATACAATGGGACAGTCAATGTTATGTATTTTCTAGAGACAGAATTGCACTCAGAACTTCAGACATTATGAATCTTATAGTAAACTATTGTATATATCTAAGTGATCTACGTATGTCAGGTTTTACGGTATTTTGTGAAAAGAATTTCCAATCGACACACAAACCAAAAAGCCTAAAGCAAAAACTGGAAACATTTCTCGATTTAATGGCTGCGTCACCGGGCAAACCCGACCCATCTAAATAAAGGGGTTATTTTTCTGGGGTTTGTGTTTGAGAGATTCAATCCTACACCAACCAAAAAATTAAATGGGGTTTTCATGCCAACCATATACTAGAGAGGGTTTATTTCACTGACCCAAACTTGCTAAATTTCTGCTGGGTTTGAGTCTAATTGTCAAGTCGTTTCAGTTTTTGTCAACTCT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ATGGCGGAGAAGCCGGACTCAGTGGTGTCGATCCGAGTCCCATACAAGAACCTCAGGCAAGATGCTGAGGTTGAAATGGTAGGCTTCGACGACGGTTTTCCGATTGTTTCTAGGGTTTCGAATGGCGTCGGTGACGGCGATTCGCCGGAAACTCACCGGCATTCGGTGGATTTGAGATCAGAGAAGTGTAGTTTGGTGAAATTGATTCTCAGTTGTACGGTCGCCGCTGGTGTTCAGTTCGGTTGGGCGCTTCAACTTTCACTTCTCACTCCTTACATCCAGACACTTGGAATAGGACATGCATTTTCTTCATTTATTTGGCTTTGTGGCCCTATCACAGGTCTTGTGGTTCAACCATGTGTAGGTATCTGGAGCGACAAATGCACTTCTAAATATGGCAGAAGACGGCCCTTTATTCTTGCCGGATCCCTCATGATCTCTGTTGCTGTGATAATAATAGGCTTTTCTGCAGACATTGGATATTTGTTAGGAGACACAAAGGAGCACTGCAGCACGTTCAAAGGTACTCGAACAAGGGCAACCATCACATTTGTGGTTGGCTTTTGGATGTTGGATCTTGCTAATAATACAGTGCAGGGCCCAGCTCGAGCTCTTTTGGCTGATTTATCAGGACCTGACCAACGGAATGCTGCAAATGCTGTGTTTGCATCTTGGATGGCTGTGGGTAACATCTTGGGGTTCTTATCTGGTGCTAGTGGAAATTGGCACACATGGTTCCCTTTCCTAACCAATCGAGCTTGTTGCGAGGCCTGCGGAAATTTGAAAGCAGCGTTTCTGATTGCAGTGGTTTTCTTGACGTTTTGTACTCTTGTAACTCTTTACTTTGCCAAGGAGGTACCCCTTGATGCAAGTCCATCTCAGAGGTTATCAGATTCGGCTCCATTACTACATGAACCTCAACGAATGTCAACCGACCTGTCTGATTCAAAGCCTCATGATAGTAATTCTCTGCCTTATACTGAGAATGGTCAGAGGAATGAAGATGATAATGATGAAAATTTCAATGATGGACCTGGAGCTGTTATGGTCAAGTTGTTGACCAGCTTAAGACATCTACCACCTGCTATGCATTCAGTGCTAATAGTAACAGCTCTCACCTGGGTTTCCTGGTTTCCCTTTTTGCTTTTTGATACTGATTGGATGGGAAGAGAAGTCTATCATGGGAATCCTACTGGAAGTGCCTCTGAAGTAAAAGCCTATGATCAAGGTGTCAGAGAAGGTGCTGTTGGATTGCTACTCAATTCAGTTGTCCTTGGTGTTGGCTCTTTTCTAATTGAACCCATGTGTCGGCAAATGGGGACTAAAGTTGTATGGGCTTTAAGCAATTTTATTGTATTTATCTGCATGGCAGGCATTGCAGTGATCAGTTTGGTTTCTCTCAAAAGTTATTCTCAAGGTGTCCAACATGTGATTGGAGAAAATTCATCAACCAAGATTGCGTCCCTGGTTATATTTGCCATTCTTGGATTTCCTCTTTCAATAACATACAGTGTACCCTATTCTGTCACTGCCTCTCTGACTGCCGATTCTGGAGGTGGTCAAGGATTGGCACTTGGAGTTCTGAATCTTGCAATTGTTGTACCCCAGATGATTGTATCGCTTGGTGCTGGGCCATGGGATGCTCTATTTGGCGGAGGAAATGTACCGGCTTTTGTTTTGGCTTCTGTAGCTGCATTTGCAGCTGGTATCTTTGCAACAATGAAGATGCCTAATATTTCTGGCAGCTTCAAATCATCTGGCATGCATGTTGGGTGA MAEKPDSVVSIRVPYKNLRQDAEVEMVGFDDGFPIVSRVSNGVGDGDSPETHRHSVDLRSEKCSLVKLILSCTVAAGVQFGWALQLSLLTPYIQTLGIGHAFSSFIWLCGPITGLVVQPCVGIWSDKCTSKYGRRRPFILAGSLMISVAVIIIGFSADIGYLLGDTKEHCSTFKGTRTRATITFVVGFWMLDLANNTVQGPARALLADLSGPDQRNAANAVFASWMAVGNILGFLSGASGNWHTWFPFLTNRACCEACGNLKAAFLIAVVFLTFCTLVTLYFAKEVPLDASPSQRLSDSAPLLHEPQRMSTDLSDSKPHDSNSLPYTENGQRNEDDNDENFNDGPGAVMVKLLTSLRHLPPAMHSVLIVTALTWVSWFPFLLFDTDWMGREVYHGNPTGSASEVKAYDQGVREGAVGLLLNSVVLGVGSFLIEPMCRQMGTKVVWALSNFIVFICMAGIAVISLVSLKSYSQGVQHVIGENSSTKIASLVIFAILGFPLSITYSVPYSVTASLTADSGGGQGLALGVLNLAIVVPQMIVSLGAGPWDALFGGGNVPAFVLASVAAFAAGIFATMKMPNISGSFKSSGMHVG Relationships
The following mRNA feature(s) are a part of this gene:
Homology
BLAST of Spo25718.1 vs. NCBI nr
Match: gi|902195716|gb|KNA12930.1| (hypothetical protein SOVF_121770 [Spinacia oleracea]) HSP 1 Score: 1171.0 bits (3028), Expect = 0.000e+0 Identity = 591/591 (100.00%), Postives = 591/591 (100.00%), Query Frame = 1
BLAST of Spo25718.1 vs. NCBI nr
Match: gi|731344093|ref|XP_010683228.1| (PREDICTED: sucrose transport protein SUC3 [Beta vulgaris subsp. vulgaris]) HSP 1 Score: 1052.0 bits (2719), Expect = 3.900e-304 Identity = 534/592 (90.20%), Postives = 551/592 (93.07%), Query Frame = 1
BLAST of Spo25718.1 vs. NCBI nr
Match: gi|575460976|gb|AHG94616.1| (sucrose transporter [Camellia sinensis]) HSP 1 Score: 862.1 bits (2226), Expect = 5.800e-247 Identity = 440/606 (72.61%), Postives = 499/606 (82.34%), Query Frame = 1
BLAST of Spo25718.1 vs. NCBI nr
Match: gi|596127555|ref|XP_007222035.1| (hypothetical protein PRUPE_ppa003041mg [Prunus persica]) HSP 1 Score: 857.1 bits (2213), Expect = 1.900e-245 Identity = 442/619 (71.41%), Postives = 505/619 (81.58%), Query Frame = 1
BLAST of Spo25718.1 vs. NCBI nr
Match: gi|321531556|gb|ADW94618.1| (sucrose transporter 5 [Populus tremula x Populus alba]) HSP 1 Score: 856.7 bits (2212), Expect = 2.400e-245 Identity = 429/599 (71.62%), Postives = 496/599 (82.80%), Query Frame = 1
BLAST of Spo25718.1 vs. UniProtKB/TrEMBL
Match: A0A0K9R084_SPIOL (Uncharacterized protein OS=Spinacia oleracea GN=SOVF_121770 PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 1171.0 bits (3028), Expect = 0.000e+0 Identity = 591/591 (100.00%), Postives = 591/591 (100.00%), Query Frame = 1
BLAST of Spo25718.1 vs. UniProtKB/TrEMBL
Match: A0A0J8C4Z6_BETVU (Uncharacterized protein OS=Beta vulgaris subsp. vulgaris GN=BVRB_6g154300 PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 1052.0 bits (2719), Expect = 2.800e-304 Identity = 534/592 (90.20%), Postives = 551/592 (93.07%), Query Frame = 1
BLAST of Spo25718.1 vs. UniProtKB/TrEMBL
Match: G5DW92_SILLA (Sucrose transport protein (Fragment) OS=Silene latifolia PE=2 SV=1) HSP 1 Score: 887.5 bits (2292), Expect = 9.000e-255 Identity = 457/582 (78.52%), Postives = 508/582 (87.29%), Query Frame = 1
BLAST of Spo25718.1 vs. UniProtKB/TrEMBL
Match: G5DW93_SILLA (Sucrose transport protein (Fragment) OS=Silene latifolia PE=2 SV=1) HSP 1 Score: 886.3 bits (2289), Expect = 2.000e-254 Identity = 456/582 (78.35%), Postives = 508/582 (87.29%), Query Frame = 1
BLAST of Spo25718.1 vs. UniProtKB/TrEMBL
Match: W5RYK8_CAMSI (Sucrose transporter OS=Camellia sinensis GN=SUT2 PE=2 SV=1) HSP 1 Score: 862.1 bits (2226), Expect = 4.000e-247 Identity = 440/606 (72.61%), Postives = 499/606 (82.34%), Query Frame = 1
BLAST of Spo25718.1 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: SUC3_ARATH (Sucrose transport protein SUC3 OS=Arabidopsis thaliana GN=SUC3 PE=1 SV=1) HSP 1 Score: 824.7 bits (2129), Expect = 6.400e-238 Identity = 413/597 (69.18%), Postives = 481/597 (80.57%), Query Frame = 1
BLAST of Spo25718.1 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: SUT4_ORYSJ (Sucrose transport protein SUT4 OS=Oryza sativa subsp. japonica GN=SUT4 PE=2 SV=1) HSP 1 Score: 773.1 bits (1995), Expect = 2.200e-222 Identity = 385/591 (65.14%), Postives = 467/591 (79.02%), Query Frame = 1
BLAST of Spo25718.1 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: SUT4_ORYSI (Sucrose transport protein SUT4 OS=Oryza sativa subsp. indica GN=SUT4 PE=3 SV=1) HSP 1 Score: 773.1 bits (1995), Expect = 2.200e-222 Identity = 385/591 (65.14%), Postives = 467/591 (79.02%), Query Frame = 1
BLAST of Spo25718.1 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: SUT1_ORYSJ (Sucrose transport protein SUT1 OS=Oryza sativa subsp. japonica GN=SUT1 PE=1 SV=1) HSP 1 Score: 563.5 bits (1451), Expect = 2.700e-159 Identity = 287/529 (54.25%), Postives = 367/529 (69.38%), Query Frame = 1
BLAST of Spo25718.1 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: SUT1_ORYSI (Sucrose transport protein SUT1 OS=Oryza sativa subsp. indica GN=SUT1 PE=3 SV=1) HSP 1 Score: 563.5 bits (1451), Expect = 2.700e-159 Identity = 287/529 (54.25%), Postives = 367/529 (69.38%), Query Frame = 1
BLAST of Spo25718.1 vs. TAIR (Arabidopsis)
Match: AT2G02860.1 (sucrose transporter 2) HSP 1 Score: 824.7 bits (2129), Expect = 3.600e-239 Identity = 413/597 (69.18%), Postives = 481/597 (80.57%), Query Frame = 1
BLAST of Spo25718.1 vs. TAIR (Arabidopsis)
Match: AT1G09960.1 (sucrose transporter 4) HSP 1 Score: 417.5 bits (1072), Expect = 1.300e-116 Identity = 242/532 (45.49%), Postives = 320/532 (60.15%), Query Frame = 1
BLAST of Spo25718.1 vs. TAIR (Arabidopsis)
Match: AT5G06170.1 (sucrose-proton symporter 9) HSP 1 Score: 248.4 bits (633), Expect = 1.100e-65 Identity = 119/233 (51.07%), Postives = 168/233 (72.10%), Query Frame = 1
BLAST of Spo25718.1 vs. TAIR (Arabidopsis)
Match: AT1G71890.1 (Major facilitator superfamily protein) HSP 1 Score: 243.0 bits (619), Expect = 4.500e-64 Identity = 122/238 (51.26%), Postives = 163/238 (68.49%), Query Frame = 1
BLAST of Spo25718.1 vs. TAIR (Arabidopsis)
Match: AT2G14670.1 (sucrose-proton symporter 8) HSP 1 Score: 242.3 bits (617), Expect = 7.700e-64 Identity = 112/223 (50.22%), Postives = 163/223 (73.09%), Query Frame = 1
The following BLAST results are available for this feature:
BLAST of Spo25718.1 vs. NCBI nr
Analysis Date: 2018-06-29 (blastp Spinacia oleracea peptides vs. NCBI nr) Total hits: 5
BLAST of Spo25718.1 vs. UniProtKB/TrEMBL
Analysis Date: 2018-06-29 (blastp Spinacia oleracea peptides vs. UniprotKB/TrEMBL) Total hits: 5
BLAST of Spo25718.1 vs. ExPASy Swiss-Prot
Analysis Date: 2018-06-29 (blastp Spinacia oleracea peptides vs. ExPASy SwissProt) Total hits: 5
BLAST of Spo25718.1 vs. TAIR (Arabidopsis)
Analysis Date: 2018-06-29 (blastp Spinacia oleracea peptides vs. TAIR) Total hits: 5
InterPro
Analysis Name: InterPro Annotations of S. oleracea
Date Performed: 2018-06-29
GO Annotation
GO Assignments
This gene is annotated with the following GO terms.
RNA-Seq Expression
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