Spo26051 (gene) | SpinachBase

Overview


Name	Spo26051
Type	gene
Organism	Spinacia oleracea (Spinach)
Description	Syntaxin-81 protein
Location	SpoScf_01117 : 38862 .. 71390 (+)

Sequences

The following sequences are available for this feature:

Gene sequence (with intron)

Legend: exonfive_prime_UTRpolypeptideCDS

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mRNA sequence

TCCGCCTCCCCTCTACAACTCTCTCTCTCTCTCATATTCTTCTTTTCCGATCCCCATTGTTGAAACTCCTACACTTCTATGTCTCTCATTCAACATCGAGCTTGCCCTTCAAAGTCTCCTCTCACCAAACCATCCCAATTTGTCAATTTTCTTTGAAAATTCAAGCTATGCGAATATGGCATTAAGCAAAACTCTAGGTTCCAGCGGCGCGGCGAAGTGTTAAATTCATCCAATAACACTAACAATAACAAGAATTACTGATCAGAAAACACCCAAGGCGTCGTTCAGGGAGCTGTCTCTCTTCTCTACTCGCTCTCTCTTTAGCGCTGCTCCATTTTCTGATTTCCGCAGCATCACCTGGTGTATTATCCGAAAATGGCCAAAATTATGGATAGAACTGAGGATTTCAAGGAGGCTGTTCGCCGTGAAGCTGTTTCTTTGGAGTATAATGAGTCTAAAGTGGCTGCTATAATGGCATCATTTATCATTCACAAGCCTCGTGAAAGGACTCCTTTCATGAAATCTTCTTTGAAAACACTTGAGAGCATTGGAGAATTGGGACAGTATTTGATGAAACATAAGCGCGATTATGTTGATATGCATCGGACAACCGAACATGAGAGAGATAGCATTGAGCAAGAAGTCAGCAACAAGAAATTAAAGCAGAATAAATATCAATGGGTTTTGTCGTGTTTCGAGTGGGTATGTTATGCTTTCGGAGGTGTTGTTGGGGTTTCAAACGGTCATGGTAGGTTTTTGGAGGTTGAGCTTGCGTTTCCGGTAGATGGGCTGGCGTTGCTAGCGGCTGGGGATCGGTTGCTGATTACTAATTTGGTGGTCATTGTTTGCCTCCTCGACTTCAAGAATGAAAATTTGAGCAGAACCGAAGTTACTTCTTTCGTTAAATTGTGTCAAAAGCAGATAGAGGTTCTAAAAGCTAGTATAAGTGACGAAGAAGCAAATTCGAAGGGCTGGCTTGGTATGAGGACAGATGGTTCTAATGCTGATACAATTGCACATAAACATGGAGTGTGGTGGCGGCGCAATGTCGGCGGTAATTTATGTGGTGGTGGTTGGTCGTTGGTGGTTGGTCGTTGTGATTTAGTTTTGATATTGAGCGAAAAGCTTCATACAGTTACATCAGAATTTGATCGACTAAGAGCTGTACGGTTCCAAGATGCTTTGAATAGAACAATGCCCAGAAGAAAACGTAGCCGTATCTCCGACCAAACTGCAATAGATAATTTGAAATCAAAGCTTCCAGAGGTTAAGGAACATGATGAAGTAGAACCCAGTCCCCAAAGAGTCCAAGAACAGCTTTTGGATGATGATACTCGTGCACTTCAGGTGGAGCTGAGTAATCTCCTTGATGCTGCTCAAGAAACTGAAACTAAAATGGTGGAGATGTCTGCACTGAATCACCTCTTGGCTACACATGTTCTCCAGCAAGTCCAACAGATTGAATACTTGTACGATCAGGCAGTTGAAGCAACCAAAAATGTGGAGCTTGGCAACAAAGAGCTGACGCAGGCCATACAGCGAAATAGCAGTAGCAGAATATTTAATAGGTTTCAACAATCAACAGCTGCAAGCTTATTAGTCATCACTAAAGAAGATGGTCCTTGTTTATTTTTCCATGAAACTGGGGTTCCAAGATTTGGAGAACATCCATACGACACCCGGGCTTAA

Coding sequence (CDS)

ATGGCCAAAATTATGGATAGAACTGAGGATTTCAAGGAGGCTGTTCGCCGTGAAGCTGTTTCTTTGGAGTATAATGAGTCTAAAGTGGCTGCTATAATGGCATCATTTATCATTCACAAGCCTCGTGAAAGGACTCCTTTCATGAAATCTTCTTTGAAAACACTTGAGAGCATTGGAGAATTGGGACAGTATTTGATGAAACATAAGCGCGATTATGTTGATATGCATCGGACAACCGAACATGAGAGAGATAGCATTGAGCAAGAAGTCAGCAACAAGAAATTAAAGCAGAATAAATATCAATGGGTTTTGTCGTGTTTCGAGTGGGTATGTTATGCTTTCGGAGGTGTTGTTGGGGTTTCAAACGGTCATGGTAGGTTTTTGGAGGTTGAGCTTGCGTTTCCGGTAGATGGGCTGGCGTTGCTAGCGGCTGGGGATCGGTTGCTGATTACTAATTTGGTGGTCATTGTTTGCCTCCTCGACTTCAAGAATGAAAATTTGAGCAGAACCGAAGTTACTTCTTTCGTTAAATTGTGTCAAAAGCAGATAGAGGTTCTAAAAGCTAGTATAAGTGACGAAGAAGCAAATTCGAAGGGCTGGCTTGGTATGAGGACAGATGGTTCTAATGCTGATACAATTGCACATAAACATGGAGTGTGGTGGCGGCGCAATGTCGGCGGTAATTTATGTGGTGGTGGTTGGTCGTTGGTGGTTGGTCGTTGTGATTTAGTTTTGATATTGAGCGAAAAGCTTCATACAGTTACATCAGAATTTGATCGACTAAGAGCTGTACGGTTCCAAGATGCTTTGAATAGAACAATGCCCAGAAGAAAACGTAGCCGTATCTCCGACCAAACTGCAATAGATAATTTGAAATCAAAGCTTCCAGAGGTTAAGGAACATGATGAAGTAGAACCCAGTCCCCAAAGAGTCCAAGAACAGCTTTTGGATGATGATACTCGTGCACTTCAGGTGGAGCTGAGTAATCTCCTTGATGCTGCTCAAGAAACTGAAACTAAAATGGTGGAGATGTCTGCACTGAATCACCTCTTGGCTACACATGTTCTCCAGCAAGTCCAACAGATTGAATACTTGTACGATCAGGCAGTTGAAGCAACCAAAAATGTGGAGCTTGGCAACAAAGAGCTGACGCAGGCCATACAGCGAAATAGCAGTAGCAGAATATTTAATAGGTTTCAACAATCAACAGCTGCAAGCTTATTAGTCATCACTAAAGAAGATGGTCCTTGTTTATTTTTCCATGAAACTGGGGTTCCAAGATTTGGAGAACATCCATACGACACCCGGGCTTAA

Protein sequence

MAKIMDRTEDFKEAVRREAVSLEYNESKVAAIMASFIIHKPRERTPFMKSSLKTLESIGELGQYLMKHKRDYVDMHRTTEHERDSIEQEVSNKKLKQNKYQWVLSCFEWVCYAFGGVVGVSNGHGRFLEVELAFPVDGLALLAAGDRLLITNLVVIVCLLDFKNENLSRTEVTSFVKLCQKQIEVLKASISDEEANSKGWLGMRTDGSNADTIAHKHGVWWRRNVGGNLCGGGWSLVVGRCDLVLILSEKLHTVTSEFDRLRAVRFQDALNRTMPRRKRSRISDQTAIDNLKSKLPEVKEHDEVEPSPQRVQEQLLDDDTRALQVELSNLLDAAQETETKMVEMSALNHLLATHVLQQVQQIEYLYDQAVEATKNVELGNKELTQAIQRNSSSRIFNRFQQSTAASLLVITKEDGPCLFFHETGVPRFGEHPYDTRA

Relationships

The following mRNA feature(s) are a part of this gene:


Feature Name	Unique Name	Type
Spo26051.1	Spo26051.1	mRNA

Homology

[Close]

BLAST of Spo26051.1 vs. NCBI nr
Match: gi|902100028|gb|KNA03499.1| (hypothetical protein SOVF_208630, partial [Spinacia oleracea])

HSP 1 Score: 355.9 bits (912), Expect = 1.000e-94
Identity = 198/227 (87.22%), Postives = 199/227 (87.67%), Query Frame = 1


		  
Query: 171 EVTSFVKLCQKQIEVLKASISDEEANSKGWLGMRTDGSNADTIAHKHGVWWRRNVGGNLC 230
           EVTSFVKLCQKQIEVLKASISDEEANSK WLG RTDGSNADTIAHKHGV           
Sbjct: 89  EVTSFVKLCQKQIEVLKASISDEEANSKSWLGTRTDGSNADTIAHKHGV----------- 148

Query: 231 GGGWSLVVGRCDLVLILSEKLHTVTSEFDRLRAVRFQDALNRTMPRRKRSRISDQTAIDN 290
                        VLILSEKLH+VTSEFDRLRAVRFQDALNRTMPRRKRSRISDQ AIDN
Sbjct: 149 -------------VLILSEKLHSVTSEFDRLRAVRFQDALNRTMPRRKRSRISDQNAIDN 208

Query: 291 LKSKLPEVKEHDEVEPSPQRVQEQLLDDDTRALQVELSNLLDAAQETETKMVEMSALNHL 350
           LKSKLPEVKEHDEVEPSPQRVQEQLLDDDTRALQVELSNLLDAAQETETKMVEMSALNHL
Sbjct: 209 LKSKLPEVKEHDEVEPSPQRVQEQLLDDDTRALQVELSNLLDAAQETETKMVEMSALNHL 268

Query: 351 LATHVLQQVQQIEYLYDQAVEATKNVELGNKELTQAIQRNSSSRIFN 398
           LATHVLQQVQQIEYLYDQAVEATKNV LGNKELTQAIQRNSSSRIFN
Sbjct: 269 LATHVLQQVQQIEYLYDQAVEATKNVVLGNKELTQAIQRNSSSRIFN 291

[Close]

BLAST of Spo26051.1 vs. NCBI nr
Match: gi|902133806|gb|KNA04369.1| (hypothetical protein SOVF_200390, partial [Spinacia oleracea])

HSP 1 Score: 312.8 bits (800), Expect = 9.700e-82
Identity = 173/197 (87.82%), Postives = 173/197 (87.82%), Query Frame = 1


		  
Query: 172 VTSFVKLCQKQIEVLKASISDEEANSKGWLGMRTDGSNADTIAHKHGVWWRRNVGGNLCG 231
           VTSFVKLCQKQIEVLKASISDEEANSKGWLGMRTDGSNADTIAHKHGV            
Sbjct: 1   VTSFVKLCQKQIEVLKASISDEEANSKGWLGMRTDGSNADTIAHKHGV------------ 60

Query: 232 GGWSLVVGRCDLVLILSEKLHTVTSEFDRLRAVRFQDALNRTMPRRKRSRISDQTAIDNL 291
                       VLILSEKLHTVTSEFDRLRAVRFQDALNRTMPRRKRSRISDQTAIDNL
Sbjct: 61  ------------VLILSEKLHTVTSEFDRLRAVRFQDALNRTMPRRKRSRISDQTAIDNL 120

Query: 292 KSKLPEVKEHDEVEPSPQRVQEQLLDDDTRALQVELSNLLDAAQETETKMVEMSALNHLL 351
           KSKLPEVKEHDEVEPSPQRVQEQLLDDDTRALQVELSNLLDAAQETETKMVEMSALNHLL
Sbjct: 121 KSKLPEVKEHDEVEPSPQRVQEQLLDDDTRALQVELSNLLDAAQETETKMVEMSALNHLL 173

Query: 352 ATHVLQQVQQIEYLYDQ 369
           ATHVLQQVQQIEYLYDQ
Sbjct: 181 ATHVLQQVQQIEYLYDQ 173

[Close]

BLAST of Spo26051.1 vs. NCBI nr
Match: gi|731315198|ref|XP_010690321.1| (PREDICTED: syntaxin-81 [Beta vulgaris subsp. vulgaris])

HSP 1 Score: 301.6 bits (771), Expect = 2.200e-78
Identity = 170/226 (75.22%), Postives = 186/226 (82.30%), Query Frame = 1


		  
Query: 171 EVTSFVKLCQKQIEVLKASISDEEANSKGWLGMRTDGSNADTIAHKHGVWWRRNVGGNLC 230
           EVTSFVKLCQKQI+VLKASI+DEEANSKGWLG+R   SNADTIAHKHGV           
Sbjct: 89  EVTSFVKLCQKQIDVLKASINDEEANSKGWLGIRM-ASNADTIAHKHGV----------- 148

Query: 231 GGGWSLVVGRCDLVLILSEKLHTVTSEFDRLRAVRFQDALNRTMPRRKRSRISDQTAIDN 290
                        VLILSEKLH+VTSEFDRLRA+RFQD LNR  PRRKR+RI + +A D+
Sbjct: 149 -------------VLILSEKLHSVTSEFDRLRAIRFQDVLNRATPRRKRNRIPESSATDH 208

Query: 291 LKSKLPEVKEHDEVEPSPQRVQEQLLDDDTRALQVELSNLLDAAQETETKMVEMSALNHL 350
           LKSK  E KE DEVEPSPQRVQEQLLDDDTRALQVELSNLLDAAQ+TETKMVEMSALNHL
Sbjct: 209 LKSKHLENKEPDEVEPSPQRVQEQLLDDDTRALQVELSNLLDAAQQTETKMVEMSALNHL 268

Query: 351 LATHVLQQVQQIEYLYDQAVEATKNVELGNKELTQAIQRNSSSRIF 397
           ++THVLQQ QQIE+LY+QAVEAT+NVELGNKEL+QAIQRNS SR F
Sbjct: 269 MSTHVLQQAQQIEHLYEQAVEATQNVELGNKELSQAIQRNSGSRTF 289

[Close]

BLAST of Spo26051.1 vs. NCBI nr
Match: gi|596013895|ref|XP_007218719.1| (hypothetical protein PRUPE_ppa009021mg [Prunus persica])

HSP 1 Score: 266.9 bits (681), Expect = 6.100e-68
Identity = 145/226 (64.16%), Postives = 176/226 (77.88%), Query Frame = 1


		  
Query: 171 EVTSFVKLCQKQIEVLKASISDEEANSKGWLGMRTDGSNADTIAHKHGVWWRRNVGGNLC 230
           EV++F+K CQ+QI+VLK SI+D+EANSKGWLG+RTD SNADTIAHKHGV           
Sbjct: 89  EVSAFIKACQEQIDVLKNSINDDEANSKGWLGIRTDYSNADTIAHKHGV----------- 148

Query: 231 GGGWSLVVGRCDLVLILSEKLHTVTSEFDRLRAVRFQDALNRTMPRRKRSRISDQTAIDN 290
                        VLILSE+LH+VTS+FD+LRA+RFQD +NR  PRRK  RI++    D 
Sbjct: 149 -------------VLILSERLHSVTSQFDKLRAIRFQDTINRATPRRKLKRIANSEPADA 208

Query: 291 LKSKLPEVKEHDEVEPSPQRVQEQLLDDDTRALQVELSNLLDAAQETETKMVEMSALNHL 350
             S   E++E +E++P P  VQ+QLLDD+TRALQVEL+NLLDA Q+TETKMVEMSALNHL
Sbjct: 209 SNSNNLELREPNELQPEPLTVQQQLLDDETRALQVELTNLLDAVQQTETKMVEMSALNHL 268

Query: 351 LATHVLQQVQQIEYLYDQAVEATKNVELGNKELTQAIQRNSSSRIF 397
           ++THVLQQ QQIE LYDQAVEATKNVELGNKE+++AIQRN+SSR F
Sbjct: 269 MSTHVLQQAQQIEQLYDQAVEATKNVELGNKEISKAIQRNNSSRTF 290

[Close]

BLAST of Spo26051.1 vs. NCBI nr
Match: gi|645254028|ref|XP_008232848.1| (PREDICTED: syntaxin-81 isoform X2 [Prunus mume])

HSP 1 Score: 266.5 bits (680), Expect = 8.000e-68
Identity = 145/226 (64.16%), Postives = 175/226 (77.43%), Query Frame = 1


		  
Query: 171 EVTSFVKLCQKQIEVLKASISDEEANSKGWLGMRTDGSNADTIAHKHGVWWRRNVGGNLC 230
           EV++F+K CQ+QI+VLK SI+D+EANSKGWLG+RTD SNADTIAHKHGV           
Sbjct: 57  EVSAFIKACQEQIDVLKNSINDDEANSKGWLGIRTDYSNADTIAHKHGV----------- 116

Query: 231 GGGWSLVVGRCDLVLILSEKLHTVTSEFDRLRAVRFQDALNRTMPRRKRSRISDQTAIDN 290
                        VLILSE+LH+VTS+FD+LRA+RFQD +NR  PRRK  RI++    D 
Sbjct: 117 -------------VLILSERLHSVTSQFDKLRAIRFQDTINRATPRRKLKRIANSEPADA 176

Query: 291 LKSKLPEVKEHDEVEPSPQRVQEQLLDDDTRALQVELSNLLDAAQETETKMVEMSALNHL 350
             S   E++E +E++P P  VQ+QLLDD+TRALQVEL+NLLDA Q+TETKMVEMSALNHL
Sbjct: 177 SNSNNLELREPNELQPEPLTVQQQLLDDETRALQVELTNLLDAVQQTETKMVEMSALNHL 236

Query: 351 LATHVLQQVQQIEYLYDQAVEATKNVELGNKELTQAIQRNSSSRIF 397
           ++THVLQQ QQIE LYDQAVEATKNVELGNKE+++AIQRNS SR F
Sbjct: 237 MSTHVLQQAQQIEQLYDQAVEATKNVELGNKEISKAIQRNSGSRTF 258

[Close]

BLAST of Spo26051.1 vs. UniProtKB/TrEMBL
Match: A0A0K9Q8C4_SPIOL (Uncharacterized protein (Fragment) OS=Spinacia oleracea GN=SOVF_208630 PE=4 SV=1)

HSP 1 Score: 355.9 bits (912), Expect = 7.000e-95
Identity = 198/227 (87.22%), Postives = 199/227 (87.67%), Query Frame = 1


		  
Query: 171 EVTSFVKLCQKQIEVLKASISDEEANSKGWLGMRTDGSNADTIAHKHGVWWRRNVGGNLC 230
           EVTSFVKLCQKQIEVLKASISDEEANSK WLG RTDGSNADTIAHKHGV           
Sbjct: 89  EVTSFVKLCQKQIEVLKASISDEEANSKSWLGTRTDGSNADTIAHKHGV----------- 148

Query: 231 GGGWSLVVGRCDLVLILSEKLHTVTSEFDRLRAVRFQDALNRTMPRRKRSRISDQTAIDN 290
                        VLILSEKLH+VTSEFDRLRAVRFQDALNRTMPRRKRSRISDQ AIDN
Sbjct: 149 -------------VLILSEKLHSVTSEFDRLRAVRFQDALNRTMPRRKRSRISDQNAIDN 208

Query: 291 LKSKLPEVKEHDEVEPSPQRVQEQLLDDDTRALQVELSNLLDAAQETETKMVEMSALNHL 350
           LKSKLPEVKEHDEVEPSPQRVQEQLLDDDTRALQVELSNLLDAAQETETKMVEMSALNHL
Sbjct: 209 LKSKLPEVKEHDEVEPSPQRVQEQLLDDDTRALQVELSNLLDAAQETETKMVEMSALNHL 268

Query: 351 LATHVLQQVQQIEYLYDQAVEATKNVELGNKELTQAIQRNSSSRIFN 398
           LATHVLQQVQQIEYLYDQAVEATKNV LGNKELTQAIQRNSSSRIFN
Sbjct: 269 LATHVLQQVQQIEYLYDQAVEATKNVVLGNKELTQAIQRNSSSRIFN 291

[Close]

BLAST of Spo26051.1 vs. UniProtKB/TrEMBL
Match: A0A0K9QAS4_SPIOL (Uncharacterized protein (Fragment) OS=Spinacia oleracea GN=SOVF_200390 PE=4 SV=1)

HSP 1 Score: 312.8 bits (800), Expect = 6.700e-82
Identity = 173/197 (87.82%), Postives = 173/197 (87.82%), Query Frame = 1


		  
Query: 172 VTSFVKLCQKQIEVLKASISDEEANSKGWLGMRTDGSNADTIAHKHGVWWRRNVGGNLCG 231
           VTSFVKLCQKQIEVLKASISDEEANSKGWLGMRTDGSNADTIAHKHGV            
Sbjct: 1   VTSFVKLCQKQIEVLKASISDEEANSKGWLGMRTDGSNADTIAHKHGV------------ 60

Query: 232 GGWSLVVGRCDLVLILSEKLHTVTSEFDRLRAVRFQDALNRTMPRRKRSRISDQTAIDNL 291
                       VLILSEKLHTVTSEFDRLRAVRFQDALNRTMPRRKRSRISDQTAIDNL
Sbjct: 61  ------------VLILSEKLHTVTSEFDRLRAVRFQDALNRTMPRRKRSRISDQTAIDNL 120

Query: 292 KSKLPEVKEHDEVEPSPQRVQEQLLDDDTRALQVELSNLLDAAQETETKMVEMSALNHLL 351
           KSKLPEVKEHDEVEPSPQRVQEQLLDDDTRALQVELSNLLDAAQETETKMVEMSALNHLL
Sbjct: 121 KSKLPEVKEHDEVEPSPQRVQEQLLDDDTRALQVELSNLLDAAQETETKMVEMSALNHLL 173

Query: 352 ATHVLQQVQQIEYLYDQ 369
           ATHVLQQVQQIEYLYDQ
Sbjct: 181 ATHVLQQVQQIEYLYDQ 173

[Close]

BLAST of Spo26051.1 vs. UniProtKB/TrEMBL
Match: A0A0J8D279_BETVU (Uncharacterized protein OS=Beta vulgaris subsp. vulgaris GN=BVRB_2g024510 PE=4 SV=1)

HSP 1 Score: 301.6 bits (771), Expect = 1.600e-78
Identity = 170/226 (75.22%), Postives = 186/226 (82.30%), Query Frame = 1


		  
Query: 171 EVTSFVKLCQKQIEVLKASISDEEANSKGWLGMRTDGSNADTIAHKHGVWWRRNVGGNLC 230
           EVTSFVKLCQKQI+VLKASI+DEEANSKGWLG+R   SNADTIAHKHGV           
Sbjct: 89  EVTSFVKLCQKQIDVLKASINDEEANSKGWLGIRM-ASNADTIAHKHGV----------- 148

Query: 231 GGGWSLVVGRCDLVLILSEKLHTVTSEFDRLRAVRFQDALNRTMPRRKRSRISDQTAIDN 290
                        VLILSEKLH+VTSEFDRLRA+RFQD LNR  PRRKR+RI + +A D+
Sbjct: 149 -------------VLILSEKLHSVTSEFDRLRAIRFQDVLNRATPRRKRNRIPESSATDH 208

Query: 291 LKSKLPEVKEHDEVEPSPQRVQEQLLDDDTRALQVELSNLLDAAQETETKMVEMSALNHL 350
           LKSK  E KE DEVEPSPQRVQEQLLDDDTRALQVELSNLLDAAQ+TETKMVEMSALNHL
Sbjct: 209 LKSKHLENKEPDEVEPSPQRVQEQLLDDDTRALQVELSNLLDAAQQTETKMVEMSALNHL 268

Query: 351 LATHVLQQVQQIEYLYDQAVEATKNVELGNKELTQAIQRNSSSRIF 397
           ++THVLQQ QQIE+LY+QAVEAT+NVELGNKEL+QAIQRNS SR F
Sbjct: 269 MSTHVLQQAQQIEHLYEQAVEATQNVELGNKELSQAIQRNSGSRTF 289

[Close]

BLAST of Spo26051.1 vs. UniProtKB/TrEMBL
Match: M5XEH6_PRUPE (Uncharacterized protein OS=Prunus persica GN=PRUPE_ppa009021mg PE=4 SV=1)

HSP 1 Score: 266.9 bits (681), Expect = 4.200e-68
Identity = 145/226 (64.16%), Postives = 176/226 (77.88%), Query Frame = 1


		  
Query: 171 EVTSFVKLCQKQIEVLKASISDEEANSKGWLGMRTDGSNADTIAHKHGVWWRRNVGGNLC 230
           EV++F+K CQ+QI+VLK SI+D+EANSKGWLG+RTD SNADTIAHKHGV           
Sbjct: 89  EVSAFIKACQEQIDVLKNSINDDEANSKGWLGIRTDYSNADTIAHKHGV----------- 148

Query: 231 GGGWSLVVGRCDLVLILSEKLHTVTSEFDRLRAVRFQDALNRTMPRRKRSRISDQTAIDN 290
                        VLILSE+LH+VTS+FD+LRA+RFQD +NR  PRRK  RI++    D 
Sbjct: 149 -------------VLILSERLHSVTSQFDKLRAIRFQDTINRATPRRKLKRIANSEPADA 208

Query: 291 LKSKLPEVKEHDEVEPSPQRVQEQLLDDDTRALQVELSNLLDAAQETETKMVEMSALNHL 350
             S   E++E +E++P P  VQ+QLLDD+TRALQVEL+NLLDA Q+TETKMVEMSALNHL
Sbjct: 209 SNSNNLELREPNELQPEPLTVQQQLLDDETRALQVELTNLLDAVQQTETKMVEMSALNHL 268

Query: 351 LATHVLQQVQQIEYLYDQAVEATKNVELGNKELTQAIQRNSSSRIF 397
           ++THVLQQ QQIE LYDQAVEATKNVELGNKE+++AIQRN+SSR F
Sbjct: 269 MSTHVLQQAQQIEQLYDQAVEATKNVELGNKEISKAIQRNNSSRTF 290

[Close]

BLAST of Spo26051.1 vs. UniProtKB/TrEMBL
Match: A0A072UC59_MEDTR (Syntaxin-81 protein OS=Medicago truncatula GN=MTR_6g084580 PE=4 SV=1)

HSP 1 Score: 262.7 bits (670), Expect = 8.000e-67
Identity = 145/226 (64.16%), Postives = 176/226 (77.88%), Query Frame = 1


		  
Query: 171 EVTSFVKLCQKQIEVLKASISDEEANSKGWLGMRTDGSNADTIAHKHGVWWRRNVGGNLC 230
           EV++F+K CQ+QI+VLK SI++EE NSKGWLG+ T  +NADTIAHKHGV           
Sbjct: 89  EVSAFIKTCQEQIDVLKNSINNEEENSKGWLGITTAKANADTIAHKHGV----------- 148

Query: 231 GGGWSLVVGRCDLVLILSEKLHTVTSEFDRLRAVRFQDALNRTMPRRKRSRISDQTAIDN 290
                        VLILSE+LH+VT++FD+LRA+RFQDA+NR +PRRK +RI+ + + + 
Sbjct: 149 -------------VLILSERLHSVTAQFDQLRAIRFQDAINRAIPRRKLNRITKKDSTET 208

Query: 291 LKSKLPEVKEHDEVEPSPQRVQEQLLDDDTRALQVELSNLLDAAQETETKMVEMSALNHL 350
             S   E++E DE+   P RVQ+QLLDD+TRALQVELS+LLD  QETETKMVEMSALNHL
Sbjct: 209 SNSGDVELREPDELRSEPIRVQQQLLDDETRALQVELSSLLDTVQETETKMVEMSALNHL 268

Query: 351 LATHVLQQVQQIEYLYDQAVEATKNVELGNKELTQAIQRNSSSRIF 397
           +ATHVLQQ QQIE+LYDQAVEATKNVELGNKEL+QAIQRNSSSR F
Sbjct: 269 MATHVLQQAQQIEHLYDQAVEATKNVELGNKELSQAIQRNSSSRTF 290

[Close]

BLAST of Spo26051.1 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: SYP81_ARATH (Syntaxin-81 OS=Arabidopsis thaliana GN=SYP81 PE=1 SV=2)

HSP 1 Score: 247.7 bits (631), Expect = 2.400e-64
Identity = 140/227 (61.67%), Postives = 168/227 (74.01%), Query Frame = 1


		  
Query: 171 EVTSFVKLCQKQIEVLKASISDEEANSKGWLGMRTDGSNADTIAHKHGVWWRRNVGGNLC 230
           EV +F+K C++QI++L  SI +EEANSKGWLG+  D  NAD+IAHKHGV           
Sbjct: 89  EVAAFIKACKEQIDILINSIRNEEANSKGWLGLPADNFNADSIAHKHGV----------- 148

Query: 231 GGGWSLVVGRCDLVLILSEKLHTVTSEFDRLRAVRFQDALNRTMPRRKRSRISDQTAIDN 290
                        VLILSEKLH+VT++FD+LRA RFQD +NR MPRRK  R+  +    N
Sbjct: 149 -------------VLILSEKLHSVTAQFDQLRATRFQDIINRAMPRRKPKRVIKEATPIN 208

Query: 291 LKSKLPEVKEHDEVEPSPQRV-QEQLLDDDTRALQVELSNLLDAAQETETKMVEMSALNH 350
                 E  E DE++  P+R+ Q+QLLDD+T+ALQVELSNLLD A++TETKMVEMSALNH
Sbjct: 209 TTLGNSESIEPDEIQAQPRRLQQQQLLDDETQALQVELSNLLDGARQTETKMVEMSALNH 268

Query: 351 LLATHVLQQVQQIEYLYDQAVEATKNVELGNKELTQAIQRNSSSRIF 397
           L+ATHVLQQ QQIE+LYDQAVEATKNVELGNKEL+QAIQRNSSSR F
Sbjct: 269 LMATHVLQQAQQIEFLYDQAVEATKNVELGNKELSQAIQRNSSSRTF 291

[Close]

BLAST of Spo26051.1 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: STX18_DANRE (Syntaxin-18 OS=Danio rerio GN=stx18 PE=2 SV=1)

HSP 1 Score: 53.9 bits (128), Expect = 5.100e-6
Identity = 39/141 (27.66%), Postives = 75/141 (53.19%), Query Frame = 1


		  
Query: 259 DRLRAVRFQDALNRTMPRRKRSRISDQTAIDNLKSKLPEVKEHDEVEPSPQRVQEQLLDD 318
           D+ R  R +     T  R+     +D+   D       E +  D++ P     + Q+ + 
Sbjct: 161 DKKRLSRLEPEQINTEKRQSDGEENDKPVSDGNVDLWEENRVEDDLSPE----EIQMFEQ 220

Query: 319 DTRALQVELSNLLDAAQETETKMVEMSALNHLLATHVLQQVQQIEYLYDQAVEATKNVEL 378
           + + L  E+++LLD  ++ E K+VE+S L  + +  VLQQ  +I+ ++   V AT+NV+ 
Sbjct: 221 ENQRLVGEMNSLLDEVRQIEGKVVEISRLQEIFSEKVLQQETEIDSIHQLVVGATENVKE 280

Query: 379 GNKELTQAIQRNSSSRIFNRF 400
           GN+++ +AI+ N+  R++  F
Sbjct: 281 GNEDIREAIKNNAGFRVWILF 297

[Close]

BLAST of Spo26051.1 vs. TAIR (Arabidopsis)
Match: AT1G51740.1 (syntaxin of plants 81)

HSP 1 Score: 247.7 bits (631), Expect = 1.300e-65
Identity = 140/227 (61.67%), Postives = 168/227 (74.01%), Query Frame = 1


		  
Query: 171 EVTSFVKLCQKQIEVLKASISDEEANSKGWLGMRTDGSNADTIAHKHGVWWRRNVGGNLC 230
           EV +F+K C++QI++L  SI +EEANSKGWLG+  D  NAD+IAHKHGV           
Sbjct: 89  EVAAFIKACKEQIDILINSIRNEEANSKGWLGLPADNFNADSIAHKHGV----------- 148

Query: 231 GGGWSLVVGRCDLVLILSEKLHTVTSEFDRLRAVRFQDALNRTMPRRKRSRISDQTAIDN 290
                        VLILSEKLH+VT++FD+LRA RFQD +NR MPRRK  R+  +    N
Sbjct: 149 -------------VLILSEKLHSVTAQFDQLRATRFQDIINRAMPRRKPKRVIKEATPIN 208

Query: 291 LKSKLPEVKEHDEVEPSPQRV-QEQLLDDDTRALQVELSNLLDAAQETETKMVEMSALNH 350
                 E  E DE++  P+R+ Q+QLLDD+T+ALQVELSNLLD A++TETKMVEMSALNH
Sbjct: 209 TTLGNSESIEPDEIQAQPRRLQQQQLLDDETQALQVELSNLLDGARQTETKMVEMSALNH 268

Query: 351 LLATHVLQQVQQIEYLYDQAVEATKNVELGNKELTQAIQRNSSSRIF 397
           L+ATHVLQQ QQIE+LYDQAVEATKNVELGNKEL+QAIQRNSSSR F
Sbjct: 269 LMATHVLQQAQQIEFLYDQAVEATKNVELGNKELSQAIQRNSSSRTF 291

The following BLAST results are available for this feature:

BLAST of Spo26051.1 vs. NCBI nr
BLAST of Spo26051.1 vs. UniProtKB/TrEMBL
BLAST of Spo26051.1 vs. ExPASy Swiss-Prot
BLAST of Spo26051.1 vs. TAIR (Arabidopsis)

BLAST of Spo26051.1 vs. NCBI nr
Analysis Date: 2018-06-29 (blastp Spinacia oleracea peptides vs. NCBI nr)
Total hits: 5


Match Name	E-value	Identity	Description
gi\|902100028\|gb\|KNA03499.1\|	1.0e-94	87.2	hypothetical protein SOVF_2086...	[more]
gi\|902133806\|gb\|KNA04369.1\|	9.7e-82	87.8	hypothetical protein SOVF_2003...	[more]
gi\|731315198\|ref\|XP_010690321.1\|	2.2e-78	75.2	PREDICTED: syntaxin-81 [Beta v...	[more]
gi\|596013895\|ref\|XP_007218719.1\|	6.1e-68	64.1	hypothetical protein PRUPE_ppa...	[more]
gi\|645254028\|ref\|XP_008232848.1\|	8.0e-68	64.1	PREDICTED: syntaxin-81 isoform...	[more]

BLAST of Spo26051.1 vs. UniProtKB/TrEMBL
Analysis Date: 2018-06-29 (blastp Spinacia oleracea peptides vs. UniprotKB/TrEMBL)
Total hits: 5


Match Name	E-value	Identity	Description
A0A0K9Q8C4_SPIOL	7.0e-95	87.2	Uncharacterized protein (Fragm...	[more]
A0A0K9QAS4_SPIOL	6.7e-82	87.8	Uncharacterized protein (Fragm...	[more]
A0A0J8D279_BETVU	1.6e-78	75.2	Uncharacterized protein OS=Bet...	[more]
M5XEH6_PRUPE	4.2e-68	64.1	Uncharacterized protein OS=Pru...	[more]
A0A072UC59_MEDTR	8.0e-67	64.1	Syntaxin-81 protein OS=Medicag...	[more]

BLAST of Spo26051.1 vs. ExPASy Swiss-Prot
Analysis Date: 2018-06-29 (blastp Spinacia oleracea peptides vs. ExPASy SwissProt)
Total hits: 2


Match Name	E-value	Identity	Description
SYP81_ARATH	2.4e-64	61.6	Syntaxin-81 OS=Arabidopsis tha...	[more]
STX18_DANRE	5.1e-6	27.6	Syntaxin-18 OS=Danio rerio GN=...	[more]

BLAST of Spo26051.1 vs. TAIR (Arabidopsis)
Analysis Date: 2018-06-29 (blastp Spinacia oleracea peptides vs. TAIR)
Total hits: 1


Match Name	E-value	Identity	Description
AT1G51740.1	1.3e-65	61.6	syntaxin of plants 81	[more]

InterPro

Analysis Name: InterPro Annotations of S. oleracea
Date Performed: 2018-06-29


IPR Term	IPR Description	Source	Source Term	Source Description	Alignment
IPR019529	SNARE-complex protein Syntaxin-18, N-terminal	PFAM	PF10496	Syntaxin-18_N	coord: 5..86 score: 9.9
None	No IPR available	PANTHER	PTHR15959	SYNTAXIN-18	coord: 244..396 score: 1.3E-62coord: 2..78 score: 1.3E-62coord: 152..219 score: 1.3

GO Annotation

GO Assignments

This gene is annotated with the following GO terms.

Category	Term Accession	Term Name
biological_process	GO:0016192	vesicle-mediated transport
biological_process	GO:0034645	cellular macromolecule biosynthetic process
biological_process	GO:0048868	pollen tube development
biological_process	GO:0048364	root development
biological_process	GO:0006491	N-glycan processing
biological_process	GO:0006888	ER to Golgi vesicle-mediated transport
biological_process	GO:0043090	amino acid import
biological_process	GO:0009987	cellular process
biological_process	GO:0009737	response to abscisic acid
biological_process	GO:0005975	carbohydrate metabolic process
biological_process	GO:0006810	transport
biological_process	GO:0016579	protein deubiquitination
biological_process	GO:0008152	metabolic process
cellular_component	GO:0016020	membrane
cellular_component	GO:0005768	endosome
cellular_component	GO:0016021	integral component of membrane
cellular_component	GO:0005802	trans-Golgi network
cellular_component	GO:0005794	Golgi apparatus
molecular_function	GO:0008233	peptidase activity
molecular_function	GO:0005515	protein binding
molecular_function	GO:0016874	ligase activity
molecular_function	GO:0005509	calcium ion binding
molecular_function	GO:0004571	mannosyl-oligosaccharide 1,2-alpha-mannosidase activity

RNA-Seq Expression

Co-expression


Gene	r value	Expression
Spo24369	0.69	Barchart \| Table
Spo05221	0.69	Barchart \| Table
Spo21823	0.68	Barchart \| Table
Spo08978	0.67	Barchart \| Table
Spo00091	0.66	Barchart \| Table
Spo03163	0.66	Barchart \| Table
Spo26527	0.65	Barchart \| Table
Spo13829	0.65	Barchart \| Table