Overview
Sequences
The following sequences are available for this feature:
Legend: five_prime_UTRexonpolypeptideCDSthree_prime_UTR Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.CTAGCTCGAACAGCCAAATACTCGGCTCGGCTCGGCTCGTTGACCTCCTACATAAAAGAGGCTGAAGCTAAAATTGAAACAGAAAATGNGCTCGGCTCGGCTCGTTGACCTCCTACATAAAAGAGGCTGAAGCTAAAATTGAAACAGAAAATGACGAACATCCCTTCAACACCTCTGCATCAGTCCACCGTTTGTTGTTCATCGGCGACCAAAAGTACCGACGCAAAAACAATGACACAGGATTGCGGTGCAAAAACTCAAGCTTCAGTCTCCAAAATAAGGTATCGTCTTCCCACAAAAAATCCCTAATTTCCAACTTTTCATCAATTCTTATTACTTGTCATTCGTTATTTCTTATCCAATTGGGATTTGAATTTAATATTTTAAAAATAATTATTTGTGATTCTCAGCATTTTTTTTTATGCGGTATAAGTAGTTCTTGATTGTTCTTTAATTTTTTATTTTATTCGTTAGTAAATTTTGTGGTTGAACTGACTCCGACTCTTCCAATTGTGAGCTTGACCGTGGGATAATTTTTTTTTTTTTTTAAATATTGTTAATTAAGGTATTTATATGGNCTTGACCGTGGGATAATTTTTTTTTTTTTTTAAATATTGTTAATTAAGGTATTTATATGGAGCTCGTTTATATGTAAATTAAGTATGAAATTGTGTAAAATGAAACAAAAGGGTGCGTTTCTTGCTCGGTGAGCGAAATCAGAAGGTTTATGAGAACAAAATAACTCCGAATGCTGTGGTTATTGAGAGATTGAACAGACACGTTAGTGACCACGGCAAATATGCCGGCTAAATTGTGTAGCCATGAAGGTTGTCGAGTCCGAAAACATAGAAATCACCGCTCGGTTGAAGGTTGGGTGGGGCTTGGAGTAGTGGCGAGGAATCACACTAGTGAAGTGGTGTTGCAGCAACAAGAAGGATGAAAGCACATTTGGTTACCAGAAATTGCTGAAGCTACGGCAGCAAAGCTAGGGAAGAGATACGGCGTGGAAGAAGCAAATGTAGAATCTGGCTCAACTACTCATAAACCACCTTTGGAAGGGTGCTATTTTCTATCCGATATTGACTCTTTGTTGGGTGATATTTTGTCTTTGTGTCTTTGTTTCAAGTCAATGAGTTGGTCTCATGTTCGAAGGGATGTCAATTTTGTTTTTCATCACGTTTCGGGGCTAGTTCCTTAATCATTGTCCCCAAGAAATCTTTCCTTATTTACTCTTGGACACGTCCTTAAATTAATATACCACTCGGTAGCTAATATTTCCTTTCAAAACAAAAAATTGTAGTTCTTGTGAAGGATTGTTTCCTTGAAAACTTGGTTAAAAGAGCTATTACGTTTATTGGGGCATAAATTTTATTATTTATTATTTATAGATGTACTTTTTAAATTAGAAAAAATAAATAAAATGGAACTGCATAATGGGGTTAATTGTAGTTCTTGTGATGGATTGTTTCCTCAAAAACTTGGTTAAAAGAGCTATTACGTTTATAATTTTATTGTTTGTACATGTACCTTTTAAATTAGAAAAAAATAGATTCAGATGATTAAGTAACAATGTAATCTTTGATATTCAAACTGGTGTATGGATTTTGTCTATGGGTACATATCTACTATTCGCCTAACCATGGCTTAGAAATTACTTCCTCCGTATTTTATTAAGTGGTGCACTTCCCATAATTGGCTGTATTTTATTAAATAGTGCACTTTCTATTTATGGAAAATTTTCCTCTTCTTTTCCCATGGACCCCACTAGTCATATTTTTTACTCCCGCTAGTCATATTTAATATTTCCACTATCTTTTACTCCAATTGTTTAATATATACTTACTCCACCTGTTTCTTTGTTTCATATAATCAAACCACCTTCGTTAAACTCCGTGCCGATCAAAGTGCACCACTTATTAAAATGCGGAGGGAGTAGAGTTGAGTACAGGAATACGTCATCTGAAATTGTTGGTTGCACCCTAGTTTTTATTTATGTGTTTAGGAAGAGGCATTTGGAGAGAGTGAGGGATTCTTCCTTAGTTTTAATTTGACTTGGGGGAGGGGAGGGAAGGGAAGGGAATGGATTCGATGGGATTTCTTTTCTGCTTATGGTAAACCAATTCTTCCAATGTTAAAAATGCAACTCACTCCTTCCCTCCCATAGAAAAAAAAACGCGGATGCGGTCGCATTCGCAGTAACGGTCACGTTGTCACGGAAACCGCTTGTAACGGAAGAATAGAACGGATTGCGGCTGACGCGGTGTGGATTTTTTGGAAAATACCACATAACATGTCTAAGCCTAATTATTGCATTTTGAGTCTAAAAAGTATTTTATCAACACAATATAACCAAATCTATCATAATACGAGTGAATATTATATTCTGTAAACAAATAAGCACTCGAAATATCATGTTTTATAAACTACATAACTAATTAGAATAATATTTTTGACGAACTTATGTAAAAGAACGGTGTAACGGAGAAAAAAACGTCTAACGCGGCGAGTCACCGTTACGTAATGGACAACGCGGAGAGAAAGACGTGATTTTTGTCAAACCGTAACGTAATGGGTTTTCGCGGAACGGCAAATCAAAAATAGGTTACTTAACGGCCGTTACGTAATGGAACGGCCGAGTTTTAATTCCATGTCCCTCCCCTCTCTTTTCTTCCATGAAGCTATCCAAACATACTGCTAGAGTATTTAAATATAAAAACATAGTCTAAAGGCTGATTATTTTTACGAGGAAAATAAAGGACCAGAACCAGTTAAAGGATCATTTTGGTACAGCCTTTTAGATGTTCACATGAAACATTAGCCAATGAGAAGAGAGAGGAAAATACCGCCTCTTCCTGATCCACGTGGGTGGTTTGCACTCATCTAATCTAGTCCTCTTTCTCTAGCATTTCAATATCTTTTATTTTCACTTGTTACTCATTGCGCTTTAATTGTCCAATACTCCAATCTCAAGGTCGTTATGGACATACCCATATACTTGTCGTATGACTCGTATCGTGTTAGCACTGATGTGAGAAGAATAAATAGATAATGATCTGAAACTTGAGAGGTGTTGAAGAGTGACAAGAGCCACCTAAGAAGTTACACTTCTTTAGGTGACCTTTTATTAGTAACTTGATGGGGTAGTATTTACAAAATTTAATCACAGTGTTTGGTAGTTGCGAAAAATCTGTTCTATTCTTCCGTGGATTAATTCCTTATCACAAGGGTATTCATCGTACTATGAAAATGTAGGAAGCAAATTAATTTTCAAGATACATAACAAAGAAGTGTCAATTTCCGATGGAGCCAAAGATTCATTTGTTCTTTTGGCTGTGAGATGTAATTGACTAAATCAAAATGGCTCTTAATACTTCTTCGCTTCCTTTCCATGAAGTAGAAGATGGTCGTCCCGTTGTCGTCTCATTATCGCTTTTGGGTCAATTGGAAACAACCTCTCTGCAATTGCAGGGGTAAGGTTGCGTACGTCCGATCCCCCCTTACCCCGCTTCTTGCGGGAGCCTCTTGAGGCAATGGGGTAATGATAATGAATGATACATAACAAGGAAGGAGTCAATTTTTGCACCGGTGAATTTGAGAACTCCTTACGAGTACTTGCCTCTATTCAGTGAAAAAAGATGCCACTGCAATCTATGTACTCATGAATTATACTTCATAAGAATCATAAGAAGTAGATAAAGAACAAAGGGCTGCCTTAACTTTGCTCTATGGAAAGAATCAAAGAACAGGTGAATCAGGATGGTGGAATGAATTAAGGTTTTTATGTTATGTAAAGATTACTCTTTCTAGGATTTTGAACTTGTCATTCTGCAAAAGTCGTTTTACAACATCTGTTATGTGATGAATTACCCTGCGATTCTCTTGTGTCACTATATATTATAGTTGTTATTAAGGCAAATACATGTACAGATACTCTTTAAGTTTACATATAGGAAAAGTTTGAACTCATATTTTGGTCATTGCAAATGTTTTGAACCTCCTTTTACCCGCCATCATACAATAACACGATAAAGGTGTTTGAAAGTATATTATCATGTATGATTTATAAAATATGCTCAAGACCTTGGAATTACAACGATTAAGTACAATTAATACTTTTATGGCTGCAAAGCCTGGTATAACACTCTATGAGGTGCCGTTGGGTGGCCGTTACTGCATTCACATCTTTTCCCCTATGCTTAAGATATGTAGTTAGGTTTATCAGTGTAAAATTTACATGCTTATAATTGTTGATTAGTTTTCCTTTGCTCTTTCACCTAGTTACTTAAATTGCAGCCCATATCTGTAATTTTTTTTTTGGATTGTTGATTCTTTAATATTTTTTTTGTTTTGTTGTCGCAATAATGCTTAGCTATTATTGCAGAAAGAAGAGGAGGTGGGATCAACCTGACGAGTCTTTAGTCTCTTGCGGAGCTGTTTTATCTGGAATGCTACCTATGAGCACTGTAGGATGCTCTGGTATTTCTCTACCAGGGGCAGTTTCAGGTTCTTGTACTCCTTCAACAAGCTCCATGAAAGTTGGCTGTGTCAATATCCAGGCCTCAGTAGTGCAGCACCACGCTGCTGCACTGGTCCATAGACTAACTCAGGTTAACTATATAGTTGTCTTGCTCAATAATTACCCTTTTACATATATAAGTTAATGTTAACTCTATCTTTAAGGTATAAGGGTGAATCCCCTTATTACAACTCTTTTATCATTTACTAAAAGTAATCCTTTATTGTTTGAGTGAAAGTCATTGTAAGAGTACCAACAACAACAACAGTTTATCTATCTTTTCTGCTAAATGGTGATGGTCTCTTTTGGTGTAAAAAAAAGAAAGAAATATGTGTTATGGGATATGCCAGTATGGAACAGTGAAACTTAAGAGGAATGTGTTTGTTCAAACATTTGTATCTTCATGAAACTGCTTCTCTTTCTCTTTTGGATGCCACATCAAACTAATGAGTCATACTATAAAACTTTGGGAGCGGAT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MTNIPSTPLHQSTVCCSSATKSTDAKTMTQDCGAKTQASVSKIRKKRRWDQPDESLVSCGAVLSGMLPMSTVGCSGISLPGAVSGSCTPSTSSMKVGCVNIQASVVQHHAAALVHRLTQPKIQEDLRIAREIVINDADSAMRYKLTKRQTQEEIQKSSGAVVITRGKYRPTNAVPDGEKPLYLHISAGAHLKETAERILAVDRAAAMVEDMLKQVSQPLSTCIYLGFDADPSLNIVARIRGPNDQYINHIMNETGATIVLHGRGSGHLGVIQDEEGQQPLYLLLSSNNQKSLDDAKLLAENLLDTISRECGANRVSSCKVYGAVPPPQQLLVGVQSPGTEMHANLSSAASMACSAATSIPDGLVASVVGPVVPTTFSYGQVIQPGLLLPPGPAQKNGLHYSQPSLTACTSYSAYAGIYPQATCSQQVALALRQSSPVSSTVHPATSATMVMPKSSFESEKRKRKFQESPAAFKGVAVSQQESDLRDPCMEKKKKDTTMPPPSLKNMLPPPPPRNNSTISLNSRSMPHPPKSMLPSPSPSKSIHPLPPSSNSMHPPLPKFDSSVSVNRGNDRDNIAKRSSLPTVSDTLVKLMEYGDDDDDVEESENEISNNSANRVATSKPFWAV Relationships
The following mRNA feature(s) are a part of this gene:
Homology
BLAST of Spo26073.1 vs. NCBI nr
Match: gi|902176604|gb|KNA08795.1| (hypothetical protein SOVF_159480 isoform A [Spinacia oleracea]) HSP 1 Score: 832.8 bits (2150), Expect = 4.000e-238 Identity = 433/434 (99.77%), Postives = 434/434 (100.00%), Query Frame = 1
BLAST of Spo26073.1 vs. NCBI nr
Match: gi|902176605|gb|KNA08796.1| (hypothetical protein SOVF_159480 isoform B [Spinacia oleracea]) HSP 1 Score: 827.4 bits (2136), Expect = 1.700e-236 Identity = 433/437 (99.08%), Postives = 434/437 (99.31%), Query Frame = 1
BLAST of Spo26073.1 vs. NCBI nr
Match: gi|731319269|ref|XP_010670170.1| (PREDICTED: protein RIK isoform X2 [Beta vulgaris subsp. vulgaris]) HSP 1 Score: 790.4 bits (2040), Expect = 2.300e-225 Identity = 450/637 (70.64%), Postives = 500/637 (78.49%), Query Frame = 1
BLAST of Spo26073.1 vs. NCBI nr
Match: gi|731319267|ref|XP_010670169.1| (PREDICTED: protein RIK isoform X1 [Beta vulgaris subsp. vulgaris]) HSP 1 Score: 774.2 bits (1998), Expect = 1.700e-220 Identity = 450/668 (67.37%), Postives = 500/668 (74.85%), Query Frame = 1
BLAST of Spo26073.1 vs. NCBI nr
Match: gi|731319271|ref|XP_010670171.1| (PREDICTED: protein RIK isoform X3 [Beta vulgaris subsp. vulgaris]) HSP 1 Score: 649.8 bits (1675), Expect = 4.800e-183 Identity = 365/518 (70.46%), Postives = 403/518 (77.80%), Query Frame = 1
BLAST of Spo26073.1 vs. UniProtKB/TrEMBL
Match: A0A0K9QNH4_SPIOL (Uncharacterized protein OS=Spinacia oleracea GN=SOVF_159480 PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 832.8 bits (2150), Expect = 2.800e-238 Identity = 433/434 (99.77%), Postives = 434/434 (100.00%), Query Frame = 1
BLAST of Spo26073.1 vs. UniProtKB/TrEMBL
Match: A0A0K9QQI0_SPIOL (Uncharacterized protein OS=Spinacia oleracea GN=SOVF_159480 PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 827.4 bits (2136), Expect = 1.200e-236 Identity = 433/437 (99.08%), Postives = 434/437 (99.31%), Query Frame = 1
BLAST of Spo26073.1 vs. UniProtKB/TrEMBL
Match: D7SVA6_VITVI (Putative uncharacterized protein OS=Vitis vinifera GN=VIT_14s0068g00240 PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 533.1 bits (1372), Expect = 4.500e-148 Identity = 339/622 (54.50%), Postives = 407/622 (65.43%), Query Frame = 1
BLAST of Spo26073.1 vs. UniProtKB/TrEMBL
Match: A0A061EFL8_THECC (RIK, putative OS=Theobroma cacao GN=TCM_018761 PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 521.9 bits (1343), Expect = 1.000e-144 Identity = 338/640 (52.81%), Postives = 408/640 (63.75%), Query Frame = 1
BLAST of Spo26073.1 vs. UniProtKB/TrEMBL
Match: A0A067JTH5_JATCU (Uncharacterized protein OS=Jatropha curcas GN=JCGZ_19940 PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 511.1 bits (1315), Expect = 1.800e-141 Identity = 342/660 (51.82%), Postives = 418/660 (63.33%), Query Frame = 1
BLAST of Spo26073.1 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: RIK_ARATH (Protein RIK OS=Arabidopsis thaliana GN=RIK PE=1 SV=2) HSP 1 Score: 432.2 bits (1110), Expect = 9.800e-120 Identity = 294/613 (47.96%), Postives = 380/613 (61.99%), Query Frame = 1
BLAST of Spo26073.1 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: RIK_MAIZE (Protein RIK OS=Zea mays PE=1 SV=1) HSP 1 Score: 367.5 bits (942), Expect = 3.000e-100 Identity = 265/605 (43.80%), Postives = 345/605 (57.02%), Query Frame = 1
BLAST of Spo26073.1 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: K0907_XENLA (UPF0469 protein KIAA0907 homolog OS=Xenopus laevis PE=2 SV=1) HSP 1 Score: 78.2 bits (191), Expect = 3.600e-13 Identity = 58/193 (30.05%), Postives = 88/193 (45.60%), Query Frame = 1
BLAST of Spo26073.1 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: K0907_XENTR (UPF0469 protein KIAA0907 homolog OS=Xenopus tropicalis PE=2 SV=1) HSP 1 Score: 76.6 bits (187), Expect = 1.000e-12 Identity = 108/440 (24.55%), Postives = 173/440 (39.32%), Query Frame = 1
BLAST of Spo26073.1 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: K0907_DANRE (UPF0469 protein KIAA0907 homolog OS=Danio rerio PE=2 SV=1) HSP 1 Score: 68.9 bits (167), Expect = 2.200e-10 Identity = 39/109 (35.78%), Postives = 58/109 (53.21%), Query Frame = 1
BLAST of Spo26073.1 vs. TAIR (Arabidopsis)
Match: AT3G29390.1 (RS2-interacting KH protein) HSP 1 Score: 432.2 bits (1110), Expect = 5.500e-121 Identity = 294/613 (47.96%), Postives = 380/613 (61.99%), Query Frame = 1
The following BLAST results are available for this feature:
BLAST of Spo26073.1 vs. NCBI nr
Analysis Date: 2018-06-29 (blastp Spinacia oleracea peptides vs. NCBI nr) Total hits: 5 Position : 0 Zoom : x 1
BLAST of Spo26073.1 vs. UniProtKB/TrEMBL
Analysis Date: 2018-06-29 (blastp Spinacia oleracea peptides vs. UniprotKB/TrEMBL) Total hits: 5 Position : 0 Zoom : x 1
BLAST of Spo26073.1 vs. ExPASy Swiss-Prot
Analysis Date: 2018-06-29 (blastp Spinacia oleracea peptides vs. ExPASy SwissProt) Total hits: 5 Position : 0 Zoom : x 1
BLAST of Spo26073.1 vs. TAIR (Arabidopsis)
Analysis Date: 2018-06-29 (blastp Spinacia oleracea peptides vs. TAIR) Total hits: 1 Position : 0 Zoom : x 1
InterPro
Analysis Name: InterPro Annotations of S. oleracea
Date Performed: 2018-06-29 Position : 0 Zoom : x 1
GO Annotation
GO Assignments
This gene is annotated with the following GO terms.
RNA-Seq Expression
Co-expression
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