Spo00752.1 (mRNA)

Overview
NameSpo00752.1
TypemRNA
OrganismSpinacia oleracea (Spinach)
Description40S ribosomal protein S12
LocationSpoScf_01430 : 24836 .. 45636 (-)
Sequence length720
Sequences
The following sequences are available for this feature:

Gene sequence (with intron)

Legend: polypeptideCDSexonthree_prime_UTR
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ATTTAGATTATAAACCGGTGATGTCAAGAATTGTTCATGTATGTTTATTGTAAACTGTAAGAAGTGTTATGTTGCGACTTTTCTAGATTTCTCAAGTCTATACTGGTGTTGCTAGTTGAGTTTTATGGCTCTGGAACTGTTAGATTGAGTGAGCTAGAAAACAAATTCTCTTAAACGATTCATTATGGAAGCTAAATTTATTTTATATATATACTTCTGCAGCATGTGCAAGATTGATTCAACGGGGAAAGTAAGAAAAGTATTCGACTGCTCATTTTTGGTTGTGATCCTTCTGATGGTATATCCCTTCCATTATCCCTTCGATTATTGTTGTTGGTGCTTTAAGAGCAACAATTTTCTACTTGGATTGCTAAACCCTTTATTTGTTTGATGTTTTAGGACTTTGGTGAGGAGTCGAAAGAGCTCATTGTGGTTCAGCAGCACATCAAGTCTCACTAATATGCTCACGAGATTCTTATCTAACTAACTAAGTTAGGCCACCACATGTGCTCGTACCTGAATTTGCCAATAAGTATATCATCTAATCTTGTCAGTTTTCATAGTTATGTAAACTTTTGAGTTGTTATTTTTAGTTTTTTGAGATTATAGTTGATGTAAAGTAAGAAATATTTTTTTTGGTAATGGTATGAATTATTTTGGAATTATCATCTTTAGCTTTTGGAATTATCATGGTATGTATATCCCTTCCATTATGCTGATTTTTTTGGCTGATTTGGGTACAACGTTTATGTAGATTTTTTTTGTTTTTAATGCATTGGAAAGAGACCCGTTGGTTATAAA

mRNA sequence

ATGAACTCTCAAGCTCCTCTATCCGATCTCTCATCCTCTCAACCTTCTCTTTCCGATCTCTCATCCTCTCAACCTTCTCTTTCCGATCTCTCATCCTTTCAACCTCCTTCGAATTCTTCTCTCTCATCTTCACCCCTACCTCCTGGACACCTCCATTCATTGCCTCAGATCCCCACCTCGCTGGTGAATTTCTTCAAGTTGGAGAAGGAATCTAGTTCTGCATTGCTGGAACATATGGTAAGCATGTGCAAGATTGATTCAACGGGGAAAGTAAGAAAAGTATTCGACTGCTCATTTTTGGTTGTGATCCTTCTGATGGACTTTGGTGAGGAGTCGAAAGAGCTCATTGTGGTTCAGCAGCACATCAAGTCTCACTAATATGCTCACGAGATTCTTATCTAACTAACTAAGTTAGGCCACCACATGTGCTCGTACCTGAATTTGCCAATAAGTATATCATCTAATCTTGTCAGTTTTCATAGTTATGTAAACTTTTGAGTTGTTATTTTTAGTTTTTTGAGATTATAGTTGATGTAAAGTAAGAAATATTTTTTTTGGTAATGGTATGAATTATTTTGGAATTATCATCTTTAGCTTTTGGAATTATCATGGTATGTATATCCCTTCCATTATGCTGATTTTTTTGGCTGATTTGGGTACAACGTTTATGTAGATTTTTTTTGTTTTTAATGCATTGGAAAGAGACCCGTTGGTTATAAA

Coding sequence (CDS)

ATGAACTCTCAAGCTCCTCTATCCGATCTCTCATCCTCTCAACCTTCTCTTTCCGATCTCTCATCCTCTCAACCTTCTCTTTCCGATCTCTCATCCTTTCAACCTCCTTCGAATTCTTCTCTCTCATCTTCACCCCTACCTCCTGGACACCTCCATTCATTGCCTCAGATCCCCACCTCGCTGGTGAATTTCTTCAAGTTGGAGAAGGAATCTAGTTCTGCATTGCTGGAACATATGGTAAGCATGTGCAAGATTGATTCAACGGGGAAAGTAAGAAAAGTATTCGACTGCTCATTTTTGGTTGTGATCCTTCTGATGGACTTTGGTGAGGAGTCGAAAGAGCTCATTGTGGTTCAGCAGCACATCAAGTCTCACTAA

Protein sequence

MNSQAPLSDLSSSQPSLSDLSSSQPSLSDLSSFQPPSNSSLSSSPLPPGHLHSLPQIPTSLVNFFKLEKESSSALLEHMVSMCKIDSTGKVRKVFDCSFLVVILLMDFGEESKELIVVQQHIKSH
Relationships

This mRNA is a part of the following gene feature(s):

Feature NameUnique NameType
Spo00752Spo00752gene


The following polypeptide feature(s) derives from this mRNA:

Feature NameUnique NameType
Spo00752.1Spo00752.1-proteinpolypeptide


The following CDS feature(s) are a part of this mRNA:

Feature NameUnique NameType
Spo00752.1.CDS.4Spo00752.1.CDS.4CDS
Spo00752.1.CDS.3Spo00752.1.CDS.3CDS
Spo00752.1.CDS.2Spo00752.1.CDS.2CDS
Spo00752.1.CDS.1Spo00752.1.CDS.1CDS


The following three_prime_UTR feature(s) are a part of this mRNA:

Feature NameUnique NameType
Spo00752.1.utr3p.1Spo00752.1.utr3p.1three_prime_UTR


The following exon feature(s) are a part of this mRNA:

Feature NameUnique NameType
Spo00752.1.exon.4Spo00752.1.exon.4exon
Spo00752.1.exon.3Spo00752.1.exon.3exon
Spo00752.1.exon.2Spo00752.1.exon.2exon
Spo00752.1.exon.1Spo00752.1.exon.1exon


Homology
The following BLAST results are available for this feature:
BLAST of Spo00752.1 vs. NCBI nr
Analysis Date: 2018-06-29 (blastp Spinacia oleracea peptides vs. NCBI nr)
Total hits: 0
Match NameE-valueIdentityDescription
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BLAST of Spo00752.1 vs. UniProtKB/TrEMBL
Analysis Date: 2018-06-29 (blastp Spinacia oleracea peptides vs. UniprotKB/TrEMBL)
Total hits: 0
Match NameE-valueIdentityDescription
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BLAST of Spo00752.1 vs. ExPASy Swiss-Prot
Analysis Date: 2018-06-29 (blastp Spinacia oleracea peptides vs. ExPASy SwissProt)
Total hits: 0
Match NameE-valueIdentityDescription
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BLAST of Spo00752.1 vs. TAIR (Arabidopsis)
Analysis Date: 2018-06-29 (blastp Spinacia oleracea peptides vs. TAIR)
Total hits: 0
Match NameE-valueIdentityDescription
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GO Annotation
GO Assignments
This mRNA is annotated with the following GO terms.
Category Term Accession Term Name
cellular_component GO:0005622 intracellular