Overview
Sequences
The following sequences are available for this feature:
Legend: five_prime_UTRexonpolypeptideCDSthree_prime_UTR Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.AAAAAAAAAAAAAAAGCTAAACAAGCCTGGTTTTCTTCCTCCTCTCACACAGTCGAGCTGACGCTGACGAGCTCTCTTCTCCCTCTCTTCGAGTCTTCGTCTTCGTCTATCCGTGGCCTGGAAGCTTAACTGCAGCTTCTTGAAATCGCAGGTTTTCCACCGTCATCTCTATCATTGTTTGCCATAATTATTCTCTACTTATTTTCCCTAATTGAAAACGTTAGTAGGTATCATCGATGTTGCTCTCTTTAATTGATTTACAACTATTCAAACAACATAACCTGCAATTACACTTTTTCTTTNTTATCCTTTGTAGTTCATTCCCCAAAAAAAACGAATAGAATTTGATTACTCACGTGGTTTTCTCCAAATGAATTCATAAGAATTTGATTTACCATGTGAACCGCATATGATCATCAACACAAACTTAACGTGTATTATTAACATGTGAATATACCATGTGAGATGGACACGAAAATCACGTAAATTTACCATGTAAATCACATTATTGTACGTTGTACATGCATATGGTAATAGTGCATTTCAAAATTCGTATGGCATAGTAAGAACCTATATATTATTATATTTTATAAAACTCAATTTAAATTAAAATCAAGTTAACCTCTTTGTTATGAATTTGTTATTAATCACGAAAAATCTTTACATACCACATATTTGTATTAAGTACAAACCATATAACAATAACATTTGATTTTCCATAGAACACATCTTTACAAATTTTGAATCTTAATCACTAGTACTACTAGTCGGTCAAATAAAGTCAAATGTGTTAGTCGGTCAAATTGGTTATTCAATACGTTATTTTTAAAACCCTATACCATAAACTAAGTGGAACAAATTAACCATATATATAGCCGCTTTGTATTTATGTGATAGTGCATAGGCCGTAAATTAACGATGTCCAAGTGAAATGACCATGGATTTTGAACTTTAAAAATAATGGATGGACTTCGCGTCCCCAATCCCCTCTCTTATTGATCTCCTTGCATCACTATGAAAATTTTCCCACATTGATCAAGGTATTTTTTACCATTTGGGCCATCTGGAAAAAAAGAAATAAATAATTGCGTTTTCAAGAACACCCCTTTCAACCCTGTCAAAATCTACTTCACAACTCACTCGGTCTATTCATAATGGGTTTTCCGAAACGACATAGACAATCTCCAGCTAAAGGGCCCTCAAACCACTTCACCTACCACCACCACTCCACCCCCCACCACTACTATCTCCGTTCGTTGGCTGCCCCCACCGTATGACCACCTCAAGCTCAATTTTGACGGTTCTTGCAAAAACTCCTCTACAACAGCAGGTTTCATCATCAGAGATTACATGGGGCTGATTTGGTTGCCTCTGCTTTCAATCTCGGATCTTCTCAAGTTTACATGGCGGAGGCTACTTCCCTCCACAAAGGAATTCAAGAGGCAATTAAACTACAAGTACAACGCATCTATATAGAAGGAGACAACCTTTTGGTAATTAGTGCAGTTAAAGGTGTTTGGTCTACCCCATGGAAGTTAGACACGATCATCACAGACATAAAGAAACTTCTTCAGCACTTTGAGTTCTGGGATATCTCACATATTTACAGAGAAGCAAATCAAGCAGTTGATTGGATCACAAATGTGAAGGAAATAATGCCCTTGGTCCAAGTATGCATTCTATGTTAAGTCTAATAAATGCGGTTCAGTATTAATTAACAAGTTAATAATTCAGTGAGATCAAGTGAGCTGAATGCCTAGCTAGAGGCCGCTTCAGTTCAAGTGGAATTAATGATATTAATCCACAGCTTACTCTTGACTGAACCCGTAGGGTCACACAAATAGTACGTAAACGGATCAAGTATTTAATAGCATTAAATACTCCATCTATGAATATTCGGAACCGACGGATCTTGGTTTCAGTGGGAGCTGAGATCGTCACAGGCAAGAAATGAATACTCCGGAAACGATGATATTGCCGGAAACGGAAATATGGATCGTATCGGAAATATAAATATTATCCAAGTCGTAGATGTTGCCGGAAACGGAAACATGGTACGTGTCGGAAAATATTATCGGAAATGGAAATATTGCCAGAATCGGAAATATTCCCGGAAACGGAAATATTGTCAGAATCGGAAATATTACCGGAATCGGAAAATAATTCCGGAAACGGAAATATTAAATATTTGTTCGAAACGGAAATTAATTCCGGAATCGGAAATATTAAATATTGTTCGTATCGGAAATGAATTCCGGAATCGGAAAATTTAATCGGAAGCGCATCGTACGAATAAGCATCGGACGAGGCCTGCCGGACGAGGCCCAGCACGAAGCCAGGCCATCGCCCAGCAAGCCAAGCGCGCCGCACAAACAGCCACGCCAGGCCCAGCGCAAGGCCAGGCCCAGCAGGCTGCGCGCAGCGCGCAGCGCGCACAGCGCGCACAGCACGCGCAGCGCGCAGCGCGCGCGGGCGCTGAGTGGGCTGCTGCTCGCGCGCACGCATGGGGCCCATCGTGGCTGCCGTGCGTGTGTGTGCAAGTGTTTGTGTTCGTGCACGTTTCCTAAAACATGCAGAGTTCGGTTAATGATTAAATTCCTAATTCTATTTGATAAATTAATTAAATTAGAGTTCTTGTAGGATTCTAGGTTTAATTAATTTGTATCTGAATAGGATTTCGATTCCCTTTCCATACCGCTATAAATATGAGGCTAGGGCTCACAATTTATAACACAAGTTTCAAAGTATTCAAAGTGAGTTTTTGAGAGAAAAATTCAGTCACACATTTGCCTATAAAGTGCCGAAAATAATAGTACCTTAAGGGCGATTCTAGTTGGTCAATCTTAAGGCGGATCCGGACGTGCTGTGGACTATCTACGGAGGGACGACACTTGGAGTCCTAAAGACTTGTTCTTGTTCGGTTCGGGCACAGCTAGGGAAGGCACGCAACAAAGAGTATGCATCTAATCTATGCTAAATGATTATGTGTAAATAATATGTTTTCCTGGGTTTATGGTTTTTCCGCATGATTTATGAATTGTCATATGTATCATAACCTAACAAAATGTAGGTCACCTAGTTCCCAATAGCATGTATATTGACCCATGGTCAAGCCCTAGTTTACTATCGATTGTTTCAAACGATTATTTAGGAGTTACCCACGTGCGGAGTGCCTCCTAATATACTTTATTCTTACCTTTTTAAAAAATAAAAGTGAAATGACCATCACTAGCCATACGTACGTTGCTCACCTAAAACTTGATAAAATATTATTTAAGTCGAAAATTCACTTGGAAAAAAACATTAACTTGTATTACGTAAGTTTTTACGTGACACCTCTCATTCTCTTTGTTTTGTAAGGTAAAAATGCGCAAAAACTAATTTATTATGACCCATTTAAACTGATCTATAACAAGCTTAATATAATCTACCATAAAGATAATTTCTTTAAAAAATAAGTAACCATTAAAAATGAGTAATGCATAAACTCCATAACAAGATACAAAGTATTTTTGTTTTAATCATTTTATACAACTCCTTGACCATAAGTCCATAACAAGATTAAACAAAATGGTAGAAAATCAAACTACATAAATCATTTTTTTAAATATTTTTTTTGTATTGAGGATATCTTTAATCTAGACTAAAGTACTAGTGTAGCTCACGAGCCTGTTTAGAATTTTCGAACAACTTCTGGACTTAAATGTTTAAAGATGTAAAAGTTTTTGAAATATGACCCTTTTCCAACAAATTCTTAATCAAACGTTCACGTTAGGAAAGAAAACCTATCTTTTTTTTAACAATTCAACGTTACATGACGAACTAAATTAGCGATTTTGACCACTTAATCGCCAATTGCGTTGACGATGGAAGAGGCCCGAATCACCAATTCAAATGGCTATGTACTACTTTTTACTCGTGTTTAGTTAGTCAAAACTAGCAATGTACCTTGTAAAAACCGCCAATTAAAATGACGATGTCCTATGACAAAATCGACAATTGAAGTAGCAAGTTACCTGGTATAAATCGCTATTTTAATTGGCGACTTGGTGTGAATTTGGGTAATTACTTTTCTCTTTTAAACTAATGTCATAAACTATAGATCGAGAGTTAATCGAAAAAGTATGTATTAAGCATTTACAAATCGCTCAAAGTTTTCATAGAGCGACTTCCTTCGATATTTCTTAAAGATCCAATAATTCCCAAAAATATGTCACTTTTTAACTTATTTTCCTACATATCGTCCACGTCAGCATGAAAGAAATAAAAGTATTTTTTTCACGGTTCAGCACAAAACCGCCAACTCAAATGGCGGTTTTGTTTTAAAACTAACCGCCATTTAAATTGGCGGTTTAATGATATAAAACGCCAACTCAAATGACGGTTTGCTTTAAAACAAAACCACCATTTGAAAACCACAATTTGAGTTGGCGGTTTTGTATGCATCATATCTCAAAACCTATATACGTTTTGTCCCCCTTTTTTTGGGTAATATAAACCGCCAAGTGAAGTAAACCGCCATTTCAGTTGGCGATTTCCTACTGAACGATTAAAAAAATTGAACAGGATTACTTGCTAATGCGGACGGTAGAGTTTAACTAAACAAATGATGTATTTGGAAATTTACTAATCTTTGAGCATTATTGAAGGAAAAAAGTTCAAAAGGTCTTGTGCGCATAAGGTGTACAATAAATTTATTGTACACCAAGATAACTTTAACCCCTTTTTTTTTGTAACTTTAACCTAGTTTTGATTAACTTTTATATTAGTAAAAAAAATTTAATACATAAATATCTTAAAGGGTTAAATGATTAATTTTATACATTACGTAGTATTAGTTATTTTGAAAAAATAAGTGTTACTAAAATGAAAAATTTATCACTAAAAAATAGATAACTTTTACATGTATATGCTTAATTTTTAAGCATTTTGAGTTAACTTTTACTCCGGTGTACAATATTTATTGTACACCCATTGTAAATAAGAATTTGTGA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CTAACAACTAGATACTTGGATGATGTGATGCTCTAGTAAAAGAAGTTGTGAATTCTCCTTGATTTCTTCTTTGATGCATACTTGTATGTTGCTGCATAAAATTGTACATGATTATGCAAAGAAGTGACAAAGAAGTGACCAAAGTGTATGATTATCCTCTTGCTGGACCTAACAAGTGTTGCATATAGTTGAGCTGAAAGTAGGGCAATTTGGTACTTATAGCATGACCTGTGTAAGATTTGCAGCTGACACCGGCGAGGGCCTGTAACCTTACCTCTATATTAGCACGTTGCTCGTCTCAAATTCAGACCTGTAAGGGATAAATGAGGATTGTATCGAGCATTTAACCAAATTGGTAAACAAAGTGAATTTTGTGCGACAAATTGGTAAAATAGTGTAACAAGCGACAATTTGGTCACAACGGCGACAAATAAGTCACAAAACTAATCAGAATTGAGAAACTCAACCGCGTGAGTTGATGCTTCTAATACCGTGTTTTTTCAAAAAAAAAATCCTCATTTAATTTAACACCATTCTTGACTAATTTGACATTTGAAATGACAAAAGCAAGAAAAAGTACCTTCGAAATTCATCTTTACCCAAGTTAAATCATTGTGATAATGTTATTCTTCCCTTGTTTTTGTCGAGTAGACTCAGTAGCTATGCTTCATTGAACGAATCTTCAACAATGGTGTCAGGAGAAAAATGGAAGAGAAGGAGAAGAGGCCTAAGGGAGGAAATTAATTAGATTTTTGTTTTGACAATATTAATAAAGAAATTAAATTGGAGAAATGAGGAAAACAATTGGAAAAAACGATATTAAGAAC AAAAAAAAAAAAAAAGCTAAACAAGCCTGGTTTTCTTCCTCCTCTCACACAGTCGAGCTGACGCTGACGAGCTCTCTTCTCCCTCTCTTCGAGTCTTCGTCTTCGTCTATCCGTGGCCTGGAAGCTTAACTGCAGCTTCTTGAAATCGCAGATAATTGGGTTGACATTTCAGTGAAAGAGTTATTTTCTGTTCTTTGATTTTAGAATTATTGGCAGCTCTACTGTGCATGATGATTGAACTCTATTTGTCAAAACCTTTATGGGGTGATGCTACGAATGCTGACTCTGGTGACCTGAGAATGCCTCTGTACGACAAGCTGGAAAAGATTATTTGGGGACTTATTACCTCTGAAGGCCGGTCAGAGGCTAGATTGTGGCTTTGTGAGTCTATTTCAAGCTTAAGTTCAATTACACCACCTGAGCAGCGTGACCTATTCACGAGGTTATTGAAATCAAAGCCTCGTAAGTTGGATATCGCTGCTCAAGTCTTTCAAATGCTCTTTGAGAGAAGACCACAGAAAGCCGGGTTAATCTTGGCTAAGAAAAGTCGCAAGCTTAAAAGGTTCTTTGAAGGACATCCAAAACGGATCTTGCAATGGTTTTCAACCTTTTCTATTGCGGGTGATTCAGCACACGGAAAGGGTGCAAAGTCACTGGCTCAGTTTGCCTTTGTGAACAGGGACATATGTTGGGAAGAGCTCGAATGGAAAGGAAAACATGGACAATCACCAGCAGTTGTTGCTACAAAGCCTCATTATTTTCTCGATTTGGATGTTCAACTTACAGTGGAGAACTTTTTGGAGAATATACCTGAGTTCTGGTCGTCGGAGGAATTTTCTGAGTCCCTTAAAGGTGGTGAGATCTTATCGGTTGATAATAAGTTCTTTGTAGATTTCTTCCTTGAGTTACTGTACGAAGATAATCTGCAAGAAGTTTGGGAAGTTGTTGGTCAGTTTCTTACGGATGAATCTTTTGCTTATCTTTGTCAACATCTTCTAATCATTCTTGATGAACGGGATCTACGTACATTATTGCTAATGCTTCAAGATCTTCTTACTAGAAGAAAAAGATCTCTAAACTTTGATGATACATCTTATTGGCTGGAGATTGTGATTTGCAAGTGTGGTGACCAAGTATCTATTGATCAGTTGTTTCTGTTGAACGCACTGTATAACAAAGGAAGGCTACTTTTGCGGTTGGTACATAGTGAAGAAACCGAGGAGAAGGTTAAAATTGATGATTTAGTTTTAGGGATCTGTACACATACAAGTGAAGCCAAGAGTTTGGCCTCGATTTCCAACGAACTCTTGAAGTCAAAGACTATTGAAGTGATGAAATGGCTTGGTCTTCTTTCATGGAGCCTTCTTTACAGGTTGTCTAAGGAATGTCATACTTCTGAATCCTGGGAAGCTCTGTTTGTCAGTAACAACATTGGGTTCCGTAAATCTGATATATTTGGTACCGAACTTGATGGAACTTCAGAGAAGAGTGAACTGGACTTCGTTGAAAAAACAGTAACTAAAGGTAAACGTAAAAGGAGGCAAAACAAGAAAAATAAAAGGAGAAGGAATCGAGATTTTGATGAATTCAGTGATGAGGACTTGCTTCACCTTGATTATTCAGATGATAAATTCAATCTCCAATCTAGTTCTATTAGCTGGTTGCTTTCTAGTGATGGGTATTCGACTTCATGGAGCTTGCCATACAAGTCTTTCGCCATCTTAAGCGCCATCATACTGAAAATTATTTTAAATTGGGACACGGGACACAAGTATCATCAACTCAGTAAGCAGATATCTGACGCTACTGTAATCTATGTAGTGCTGAACTTTAATGTATCATTCACCAAAGTGCTAACAACTAGATACTTGGATGATGTGATGCTCTAGTAAAAGAAGTTGTGAATTCTCCTTGATTTCTTCTTTGATGCATACTTGTATGTTGCTGCATAAAATTGTACATGATTATGCAAAGAAGTGACAAAGAAGTGACCAAAGTGTATGATTATCCTCTTGCTGGACCTAACAAGTGTTGCATATAGTTGAGCTGAAAGTAGGGCAATTTGGTACTTATAGCATGACCTGTGTAAGATTTGCAGCTGACACCGGCGAGGGCCTGTAACCTTACCTCTATATTAGCACGTTGCTCGTCTCAAATTCAGACCTGTAAGGGATAAATGAGGATTGTATCGAGCATTTAACCAAATTGGTAAACAAAGTGAATTTTGTGCGACAAATTGGTAAAATAGTGTAACAAGCGACAATTTGGTCACAACGGCGACAAATAAGTCACAAAACTAATCAGAATTGAGAAACTCAACCGCGTGAGTTGATGCTTCTAATACCGTGTTTTTTCAAAAAAAAAATCCTCATTTAATTTAACACCATTCTTGACTAATTTGACATTTGAAATGACAAAAGCAAGAAAAAGTACCTTCGAAATTCATCTTTACCCAAGTTAAATCATTGTGATAATGTTATTCTTCCCTTGTTTTTGTCGAGTAGACTCAGTAGCTATGCTTCATTGAACGAATCTTCAACAATGGTGTCAGGAGAAAAATGGAAGAGAAGGAGAAGAGGCCTAAGGGAGGAAATTAATTAGATTTTTGTTTTGACAATATTAATAAAGAAATTAAATTGGAGAAATGAGGAAAACAATTGGAAAAAACGATATTAAGAAC 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MMIELYLSKPLWGDATNADSGDLRMPLYDKLEKIIWGLITSEGRSEARLWLCESISSLSSITPPEQRDLFTRLLKSKPRKLDIAAQVFQMLFERRPQKAGLILAKKSRKLKRFFEGHPKRILQWFSTFSIAGDSAHGKGAKSLAQFAFVNRDICWEELEWKGKHGQSPAVVATKPHYFLDLDVQLTVENFLENIPEFWSSEEFSESLKGGEILSVDNKFFVDFFLELLYEDNLQEVWEVVGQFLTDESFAYLCQHLLIILDERDLRTLLLMLQDLLTRRKRSLNFDDTSYWLEIVICKCGDQVSIDQLFLLNALYNKGRLLLRLVHSEETEEKVKIDDLVLGICTHTSEAKSLASISNELLKSKTIEVMKWLGLLSWSLLYRLSKECHTSESWEALFVSNNIGFRKSDIFGTELDGTSEKSELDFVEKTVTKGKRKRRQNKKNKRRRNRDFDEFSDEDLLHLDYSDDKFNLQSSSISWLLSSDGYSTSWSLPYKSFAILSAIILKIILNWDTGHKYHQLSKQISDATVIYVVLNFNVSFTKVLTTRYLDDVML Relationships
This mRNA is a part of the following gene feature(s):
The following polypeptide feature(s) derives from this mRNA:
The following five_prime_UTR feature(s) are a part of this mRNA:
The following CDS feature(s) are a part of this mRNA:
The following three_prime_UTR feature(s) are a part of this mRNA:
The following exon feature(s) are a part of this mRNA:
Homology
BLAST of Spo02178.1 vs. NCBI nr
Match: gi|902231008|gb|KNA22078.1| (hypothetical protein SOVF_037240 isoform A [Spinacia oleracea]) HSP 1 Score: 969.9 bits (2506), Expect = 1.800e-279 Identity = 490/491 (99.80%), Postives = 490/491 (99.80%), Query Frame = 1
BLAST of Spo02178.1 vs. NCBI nr
Match: gi|902231009|gb|KNA22079.1| (hypothetical protein SOVF_037240 isoform B [Spinacia oleracea]) HSP 1 Score: 884.8 bits (2285), Expect = 7.800e-254 Identity = 457/491 (93.08%), Postives = 459/491 (93.48%), Query Frame = 1
BLAST of Spo02178.1 vs. NCBI nr
Match: gi|731336004|ref|XP_010679024.1| (PREDICTED: uncharacterized protein LOC104894479 [Beta vulgaris subsp. vulgaris]) HSP 1 Score: 771.9 bits (1992), Expect = 7.400e-220 Identity = 392/492 (79.67%), Postives = 442/492 (89.84%), Query Frame = 1
BLAST of Spo02178.1 vs. NCBI nr
Match: gi|147860615|emb|CAN81861.1| (hypothetical protein VITISV_025557 [Vitis vinifera]) HSP 1 Score: 521.2 bits (1341), Expect = 2.300e-144 Identity = 266/491 (54.18%), Postives = 354/491 (72.10%), Query Frame = 1
BLAST of Spo02178.1 vs. NCBI nr
Match: gi|359495424|ref|XP_003634990.1| (PREDICTED: uncharacterized protein LOC100852824 [Vitis vinifera]) HSP 1 Score: 521.2 bits (1341), Expect = 2.300e-144 Identity = 266/491 (54.18%), Postives = 354/491 (72.10%), Query Frame = 1
BLAST of Spo02178.1 vs. UniProtKB/TrEMBL
Match: A0A0K9RRH1_SPIOL (Uncharacterized protein OS=Spinacia oleracea GN=SOVF_037240 PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 969.9 bits (2506), Expect = 1.300e-279 Identity = 490/491 (99.80%), Postives = 490/491 (99.80%), Query Frame = 1
BLAST of Spo02178.1 vs. UniProtKB/TrEMBL
Match: A0A0K9RT28_SPIOL (Uncharacterized protein OS=Spinacia oleracea GN=SOVF_037240 PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 884.8 bits (2285), Expect = 5.400e-254 Identity = 457/491 (93.08%), Postives = 459/491 (93.48%), Query Frame = 1
BLAST of Spo02178.1 vs. UniProtKB/TrEMBL
Match: A0A0J8CD53_BETVU (Uncharacterized protein OS=Beta vulgaris subsp. vulgaris GN=BVRB_5g119100 PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 771.9 bits (1992), Expect = 5.100e-220 Identity = 392/492 (79.67%), Postives = 442/492 (89.84%), Query Frame = 1
BLAST of Spo02178.1 vs. UniProtKB/TrEMBL
Match: A5C5R7_VITVI (Putative uncharacterized protein OS=Vitis vinifera GN=VITISV_025557 PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 521.2 bits (1341), Expect = 1.600e-144 Identity = 266/491 (54.18%), Postives = 354/491 (72.10%), Query Frame = 1
BLAST of Spo02178.1 vs. UniProtKB/TrEMBL
Match: D7U6C7_VITVI (Putative uncharacterized protein OS=Vitis vinifera GN=VIT_00s0174g00290 PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 521.2 bits (1341), Expect = 1.600e-144 Identity = 266/491 (54.18%), Postives = 354/491 (72.10%), Query Frame = 1
BLAST of Spo02178.1 vs. TAIR (Arabidopsis)
Match: AT5G48340.1 (unknown protein) HSP 1 Score: 456.1 bits (1172), Expect = 3.200e-128 Identity = 241/492 (48.98%), Postives = 336/492 (68.29%), Query Frame = 1
The following BLAST results are available for this feature:
BLAST of Spo02178.1 vs. NCBI nr
Analysis Date: 2018-06-29 (blastp Spinacia oleracea peptides vs. NCBI nr) Total hits: 5
BLAST of Spo02178.1 vs. UniProtKB/TrEMBL
Analysis Date: 2018-06-29 (blastp Spinacia oleracea peptides vs. UniprotKB/TrEMBL) Total hits: 5
BLAST of Spo02178.1 vs. ExPASy Swiss-Prot
Analysis Date: 2018-06-29 (blastp Spinacia oleracea peptides vs. ExPASy SwissProt) Total hits: 0
BLAST of Spo02178.1 vs. TAIR (Arabidopsis)
Analysis Date: 2018-06-29 (blastp Spinacia oleracea peptides vs. TAIR) Total hits: 1
InterPro
Analysis Name: InterPro Annotations of S. oleracea
Date Performed: 2018-06-29
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